5IQYA

Structure of apo-dehydroascorbate reductase from pennisetum glaucum phased by iodide-sad method
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
211
structure length
211
Chain Sequence
b'VEVCVKAAVGAPDILGDCPFSQRVLLTLEEKKITYEMKLVDLSNKPEWFLKISPEGKVPVFNSGDGKWIADSDVITQVIEEKFPTPSLVTPPEYASVGSKIFPSFVKFLKSKDASDGSEKALLDELQALDEHLKAHGPYISGENVSAADLSLGPKLFHLQVALEHFKGWKIPENLTSVHAYTKALFSRESFVKTKPANQYLIAGWAPKVNA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Non-native ligands define the active site of Pennisetum glaucum (L.) R. Br dehydroascorbate reductase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dehydroascorbate reductase
source organism Pennisetum americanum
molecule tags Oxidoreductase
total genus 61
structure length 211
sequence length 211
ec nomenclature ec 1.8.5.1: Glutathione dehydrogenase (ascorbate).
pdb deposition date 2016-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5iqyA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5iqyA01
4AJ8A 1T1VA 2DLXA 2YP6A 1KTEA 4MPGA 4YAVA 6GSTA 2L57A 4Q5QA 4WR4A 4EL1A 1XPVA 3D21A 2NBSA 2VCWA 2OKAA 1BX9A 1ML6A 4WR5A 2TRXA 4IS0A 1SD9A 4PXOA 3DXBA 1AQXA 1XZOA 2GQLA 2LKUA 1SL0B 2YJHA 2VCVA 5J41A 2VOCA 3UARA 2HQTA 1J08A 4MZWA 2OADA 3TKQA 2YANA 1T4YA 3C8EA 1MTCA 1Z6NA 4XCSA 4HJMA 1K0MA 3WYWA 2PVQA 4L0UA 4ECCA 2I9HA 2I81A 2P0GA 3KTBA 3GL5A 4NV2A 3D6IA 5F0GA 1F9MA 3A5WA 3FKFA 5A4WA 4MJCA 2DJKA 4CHSA 4ZB9A 1Z7RA 2HRKB 2H1GA 2WFCA 3VWXA 4J57E 3BCIA 2KOKA 2HE3A 5DCGA 2VUPA 5DAKB 2LRCA 4YQMA 1GP1A 1S3AA 4KDXA 2YN1A 3EYTA 3KP9A 1BEDA 2HRAA 2IFQA 5E59A 4FYBA 2H76A 2H8LA 4DEJA 4Z7XA 1ON4A 3A2VA 4G19A 2C0FA 2HNLA 4ZL9A 2DJ3A 4IN0A 5J5NA 2ZNMA 3HJPA 5IMDA 4PURA 3L78A 1F3BA 3QAGA 3CRUA 5JCGA 1XVWA 2YV9A 1PX6A 1IYIA 2EIRA 1PKZA 3U5RE 1QUWA 3DEXA 2WCIA 8GSSA 2FA4A 3F3QA 1AQVA 3UAPA 3P7XA 3CSIA 1O85A 3TRXA 4I2TA 5JWOB 3WT1A 2V32A 2JL4A 3IAM2 1U88A 1FOVA 3RHBA 1SL1B 5DDLA 4TXVA 1ERVA 2JADA 4HU9A 4OO4A 5DQYA 2V6KA 5F06A 2J23A 3CRTA 2B5XA 3ZFBA 3I6AA 1GTUA 4TR1A 1ZYQB 2YZUA 4L0WA 3MDKA 3IE3A 5B8AA 3Q6OA 4OWYA 1OYJA 1NHYA 1EV9A 2X64A 5G2ZA 3D4TA 2QGVA 2IFQB 5IMZA 2GT5A 2F8FA 2H66A 4ZBDA 2O89A 1DE1A 2IN3A 5ECSA 3SBCA 3TRQA 1V58A 2FD3A 1SKWB 3DYRA 2MBSA 4O92A 5ECNB 1NHOA 5IIZA 1GLQA 4F9ZA 5ECPB 4KNDA 18GSA 1X5CA 3W8SA 2GTUA 2D2ZA 1QXHA 4KAEA 3LFLA 1YDKA 4ZL8A 1TJDA 1FB0A 1MDIA 4PQIA 4O32A 1GSEA 3WT2A 4BL7A 1YF0A 2DC5A 1THOA 2I1UA 2RIIA 1SL2B 3VURA 3TKPA 1TRVA 1KBNA 5L71A 3G7IA 2NVLA 5D9XA 2OBKA 4WXTA 2VM1A 1XVQA 1GNWA 1DE2A 3C1RA 1M9AA 1PSQA 1R5AA 4I5QA 1A0FA 4MH3A 2AHEA 1TI1A 3KP8A 2OA7A 2LNSA 2FA8A 1AQWA 2LJKA 4IP6A 2GLRA 3HVVA 3BBYA 5AIVA 2HRFA 4E8HA 2PMTA 5CRGA 2HLSA 3KD0A 3TCOA 1O8WA 1E6BA 3IC8A 3M9JA 4GQFA 4TW5A 3HVSA 2HSHA 2CAQA 1SK2A 1X5EA 2F8AA 2GDRA 2HRNA 4V1Ag 3VPQA 2IMDA 1HQOA 4JR6A 1A0RP 2TIRA 4CDOA 5F8BA 3D4MA 2LRTA 3CYNA 3ERGA 3DD3A 3F4SA 2WGRA 4BL7B 5ELAA 4IVFA 3LXTA 2KHPA 2PWJA 4K8MA 1GSYA 3MNGA 3FK8A 4OCFA 5LNKe 3FHKA 4D73A 3DRNA 3APSA 4XRAA 1ZOFA 1Z3EA 4KDYA 5FWGA 4K7OA 2CX3A 2JZSA 1Q4JA 4GSSA 5G1LA 3IRAA 3WD6A 5ENUA 4ZBAA 1SJZA 2RUFA 3F63A 3ZREA 2FHEA 1JHBA 2GZZA 4F03A 5CRWA 2LUSA 3BOAA 3L4NA 2L5OA 2IIYA 5JCUA 3D22A 1Y25A 2H30A 2O85A 3ERFA 2GZYA 3UJ1A 3DVXA 3V1WA 1S3DA 14GSA 3IA1A 4NPBA 3LQ7A 1GTAA 2GQKA 4I6XA 4MK3A 2C3QA 5HFGA 5HR3A 3KTLA 1FHEA 4RI7A 4WETA 2EIQA 4G10A 1ZL9A 2H0HA 2H72A 3L9VA 4POLA 3ZIJA 2PVOC 1T4ZA 3VWUA 4DSSB 3R3EA 5B7CA 3VFIA 1ILOA 4MLYA 1OKTA 1MDKA 4YQUA 1HNAA 1MD4A 2H19A 1YZXA 2KP2A 1M7TA 1GUMA 1XWCA 3VPTA 2A4VA 4GSNA 1SENA 3M1GA 3M9KA 4POKA 2O7KA 1C72A 2C4JA 4TR3A 2E2MA 3UBKA 1ZYEA 1U3IA 2QKEA 2JACA 1LU4A 2L6DA 5JWQB 1TI3A 2H70A 2LSTA 4MJEA 1TOFA 4ECIA 2VLUA 3QDNA 4DSQA 4LA1A 1W89A 4KH7A 3F4RA 2XBIA 3TKRA 4L8EA 4XS1A 1GULA 2XC2A 3BCKA 3TGZA 1TKDB 3EU4A 5IOXA 2YJ7A 4GCIA 5DCHA 3QAVA 1QFNA 1A23A 4HOJA 1SK1A 1WIKA 4KX4A 3VLNA 1K3OA 3P8WA 2KP1A 2LEGA 3EVIA 3LWAA 3TKSA 4EKZA 2AYTA 1TP9A 1G7OA 1GWCA 3QD9A 7GSSA 4EUYA 1TU8A 1GTBA 3IR4A 4OFNA 1K3YA 1PL1A 2FGXA 3OR5A 6GSWA 1LBKA 4PNFA 3W8JA 3F6DA 3DIEA 1LJRA 2OBIA 22GSA 5HR2A 1JZDA 4G2EA 5AN1A 2VL3A 4POMA 2OJLA 4F82A 6GSXA 1EEMA 2F9SA 3GRXA 3GKNA 4KA0A 2HI7A 5J9CA 4ZB6A 2H1DA 3L9SA 4AJ7A 1ABAA 2BTOT 3DWVA 1B4QA 2YZHA 2MMAA 4N10A 4ML1A 4HUAA 5ECOB 13GSA 3GKKA 4G9HA 4JEDA 3LXZA 2REMA 4RQRA 3HA9A 2DIYA 2M72A 2IMIA 2WJUA 1TRUA 2N5AA 4KCEA 4HQSA 3NZNA 4TXOA 3IOSA 3UMAA 4KF9A 1Z6MA 5IQYA 1AIUA 3Q74A 3FZ5A 2FWEA 5F05A 6GSUA 1V2AA 5DVBA 2JSZA 3QFAC 2A2SA 1YF1A 5DJLA 1R4WA 1GNEA 3C71A 3DMLA 4H86A 3FRCA 4EC0A 2DMLA 3L0HA 2YNXA 3GURA 1VF2A 5AIXA 4WEYA 2LV3A 5JCWA 1ST9A 3FY7A 3D0ZA 2CX4A 1AC1A 1EOHA 2AJQB 1FVJA 3ZYWA 3IAS2 2B6MA 4G0LA 2CV4A 1MEKA 2DJ2A 1F37A 3IBHA 1BG5A 1PN9A 1TDIA 3MAKA 2V41A 3GNJA 5D9WA 2L4CA 3HDCA 4K1FA 3KMOA 1SYRA 2BMXA 4MPFA 5J9BA 4WBJA 1G0TA 5DQSA 3UOMA 1O73A 2C3TA 4X1UA 4FIWA 4PUAA 4L5OA 1Z9HA 4MDCA 1F6MC 4KSMA 5IO0A 1GRXA 4MJAA 2GQMA 2I4AA 5A5KA 4GXZA 1XWAA 3U6VA 3TOUA 2CA8A 2AB6A 2VLVA 4TXOB 4TOPA 3G9BA 1XXUA 5KN3A 2HZFA 5KN2A 1ZCPA 3G7YA 2IWTA 2VCTA 5KEJA 1K0DA 5J4UA 5DBQA 4FYCA 3J7Yb 2B1LA 4IELA 3HJOA 1FAAA 3TB2A 1GSDA 12GSA 2ALBA 2V6OA 3VI5A 3FR9A 4ZB8A 3LYKA 19GSA 1HNBA 3IPZA 4GRFA 2H1BA 1X5DA 1B9YC 3GA4A 3GTUA 2P31A 5F07A 3L9UA 1XBSA 3LORA 3O3TA 2QSIA 4P3YB 20GSA 4QL9A 1F2EA 4QL7A 3CXGA 2V2GA 4CW9A 4G0KA 3ZVJD 3LSZA 1XOBA 5ABRA 3QMXA 5ECIB 4L5LA 2C8UA 4N0VA 1RW1A 3GIXA 1E2YA 1TW9A 2L5LA 4TRXA 3BD2A 2LJAA 3RBTA 2CVKA 2CVDA 1WJKA 3I9V2 5CP1A 4RI6A 2EIOA 3GH6A 4KCAA 1A8YA 3TDGA 1Z7PA 2G0FA 1S3CA 2VO4A 2JU5A 3ZITA 3RHCA 2O87A 2C1YA 3ME7A 2HT9A 5HQPA 1TU7A 4OFMA 4K7IA 4POBA 3G7JA 5G5FA 4OO5A 2E7PA 2RM5A 1V40A 3I43A 1M0UA 2FCHA 4KGIA 4JU5A 1YEPA 1VF4A 2LQQA 3QOUA 1R7HA 3HYPA 1NW2A 1X0RA 5GAND 1PKWA 2L6CA 4V1Ap 4TR1B 4Q5FA 5D9TA 1ACVA 1RK4A 1GLPA 4TKYA 1PX7A 4NWYA 2LQOA 2M46A 2LJRA 3CTGA 6GSSA 3UIWA 3BJ5A 3HHVA 2R4VA 2IPAA 2VL2A 3KM6A 2C3NA 3EMXA 1XIYA 2GT6A 9GSSA 2VCQA 4HEA2 6GSYA 3CMIA 3GX8A 1T3BA 1THXA 4FQUA 3P90A 3H93A 3HKRA 4N11A 2OE0A 4PQHA 2NTOA 3UL3A 3F0IA 2Z9SA 1SKSB 5IMCA 2HYXA 4ZXGA 2XPDA 1N2AA 4HZ4A 1EEJA 3KJYA 1QMVA 4V2MA 5CREA 2P5QA 2HSMA 3TJJA 3JCML 1Z5YE 3WGXA 4LLRA 3TJBA 1YQ1A 2MYGA 4NMUA 3RDWA 3ISOA 1GL8A 5CRDA 2PPTA 4TR4A 1XWKA 4MJBA 4I97A 2PN8A 4K2DA 2FWGA 1OVNA 4IJIA 1IYHA 4JE1A 3GKMA 2FLSA 3TKSC 1AXDA 3GSSA 2QC7A 2JSYA 1WRYA 1EV4A 3VK9A 2VIMA 1ERUA 1I5GA 1M99A 5HFIA 5H5RA 4HJ2A 2K6VA 1ZGNA 2ON7A 3QFBC 3GH9A 1T8EB 1K0AA 5CNWA 1URMA 3TJFA 1TK0B 1AUCA 4ID0A 1DUGA 3TOTA 2RM6A 2H74A 5E4WA 1GSUA 3DKSA 4K6XA 5COHA 4K7NA 5D73A 4XTSA 4EE0A 3TJGA 3UEMA 2DJJA 2CT6A 2EC4A 2B5YA 3HJMA 3NIVA 1B8XA 3KCMA 2IMEA 1DBYA 1KNGA 2VM2A 4LL1B 4ECJA 3D5JA 2K8SA 3Q19A 3LJRA 4IHUA 1XCCA 1N8JA 1BAYA 2DJ1A 3KH9A 4X43A 3S9FA 3GX0A 2H71A 2IJYA 3C7MA 1XW5A 3FR3A 1XW6A 2OACA 5HFKA 3PINA 3K8NA 3RPPA 4OCEA 2XBQA 1FO5A 5B6MA 3FYGA 4GLTA 1KEBA 4Q5RA 4BVXA 4USSA 4X0XA 4XS4A 6GSVA 4MMMA 3TRPA 5C04A 3N9JA 1OC9A 3EE2A 4F0BA 3P2AA 3Q18A 5LD0A 4MH2A 1EWXA 2ES7A 4YAPA 4D73B 4AGSA 3KXOA 1PRXA 2R2JA 1DSBA 1TK5B 2KLXA 3ZVJA 4BA7A 3E3EA 4NV5A 1EGRA 4MF7A 3RAZA 3M0FA 2K8VA 2LRNA 3GUSA 1R26A 4KDUA 2H0IA 3EC3A 4JR4A 3F4TA 2WRTA 1PL2A 5ECQB 2C0DA 2HSYA 2MMOA 1W4VA 1BJXA 1WWJA 2ON5A 1J0FA 3ZMKA 2PU9C 1O7UA 3F8UA 2DJ0A 4BVYA 2WULA 1ZZYA 2OE3A 3QAWA 4PX1A 1OC8A 4MA9A 2K18A 4LMWA 3R2QA 1UVZA 1UC7A 2MMZA 4QQ7A 16GSA 5EL8A 2CQ9A 3M3MA 4IP1A 1PMTA 2IMKA 3CSHA 4LMVA 4NAXA 2G2QA 1R5PA 5A4VA 2HRKA 5CRHA 4KE3A 1M2DA 4BVXB 4XS4B 1O81A 5DAKA 5J3RA 1OC9B 3ZFLA 1K0OA 4MABA 1A2LA 2MMNA 5IMAA 5G5EA 4BWSA 4IW9A 1F3AA 2VAFA 3ZMLA 2H0GA 4WF4A 2YV7A 3H79A 1TXXA 5IOWA 1OC3A 1A2MA 3IC4A 2X8HA 2NDOA 4ZL7A 4MZCA 1JZWA 3A2WA 1WP0A 4KW6A 3ZLPA 5AGYA 2VCZA 1EP7A 2H73A 2H6ZA 4JRRA 2DBCA 2A2RA 4MF6A 3UBLA 4GSTA 5H5QA 3EWLA 1PGTA 1YKCA 2PERA 3MWHA 2H1AA 5C00A 1PA3A 11GSA 3TJKA 1EOGA 3PGTA 3IK7A 4GF0A 1CQGA 1UA5A 3KEBA 1EZKA 2HSNB 1GSSA 1ERTA 2E2GA 2YPMA 4BVYB 1U87A 2MBTA 4RUVA 4AF2A 2AAWA 2GSQA 3FZAA 1H4OA 5G31A 5INYA 3J7Yk 2WDUA 2R37A 3O76A 1OE8A 4XHMA 3KH7A 2ZCTA 2BJXA 4PUFC 5G1KA 2H01A 1VF1A 10GSA 1AAZA 5ECHB 1JLWA 5GZZB 3ZZXA 4V2NA 2VD1A 4HI7A 4PQ1A 1X9MB 4PNGA 3H1NA 4V2LA 2IL3A 2H6YA 2KUCA 4J2FA 1I9DA 5HR0A 3HXSA 2CZ3A 3UVTA 1QGVA 2B3SA 1JZOA 4BPYA 4ZBBA 1JZRA 4O7HA 1YEXA 2VL2C 4WF5A 2L4QA 3F3RA 2GSRA 2X99A 3ZTLA 5D8IA 2K9FA 1VRSD 1WPIA 1HD2A 1NSWA 5HR1A 2UZ8A 1SKRB 4DSRA 1M9BA 5H5SA 4JZQA 5IM9A 5KN0A 1GTIA 1BQ7A 4YQVA 3A3TA 1GUHA 5EY6A 2B7JA 4EO3A 4IKHA 3UVHA 5ID2A 1SK0A 2GVPA 1TK8B 2FNOA 3N5OA 2B5EA 4EVMA 4KUNA 1SJ6A 3IV4A 3CSJA 1WMJA 1XW9A 5IMVA 5IPHA 1NM3A 1K0CA 1TTZA 3EU3A 2C0GA 5LCZA 4F2IA 2FUG2 2WS2A 4IQAA 4XS6A 2RUEA 2JZTA 5B8BA 3H4KA 4NHZA 4WBRD 5G30A 3LGCA 2GS3A 1FG4A 3FZ4A 3KZQA 5CAXA 3EURA 3APQA 2FWFA 3APOA 1K0NA 1JFUA 4ILFA 4XIHA 3GL3A 3LEFA 4EDZA 1CQHA 4N0ZA 3VWVA 1T7PB 1YY7A 4HDEA 4NXIA 1JLVA 3GFKA 2DMMA 4AJ6A 5FHIA 4TVEA 3PR8A 1XWBA 1U3AA 1V98A 1QQ2A 4FYUA 4F0CA 2H6XA 1SYXA 1VGLA 1M2AA 3FW2A 4PGTA 4GTUA 1HNCA 4OFTA 1QK8A 2XPEA 2YOIA 4K0GA 1O8XA 4HZ2A 3VI7A 2J9HA 1OKDA 2GGTA 5ID2B 1G6WA 3GN3A 4ZIJA 3O6TA 2OE1A 1X9WB 4K9ZA 2VD0A 2ZUPA 4FH8A 2WB9A 4OMVA 2P5RA 2E0QA 3GTUB 3F6FA 1FW1A 3RPNA 1SD8A 4ISDA 2X8CA 1PQNA 1O6JA 3VWWA 4TR0A 2LNTA 2V1MA 4KSOA 17GSA 4WKWA 2YWNA 4IGJA 1GUKA 4JBBA 3US3A 2B1KA 2L59A 4GWRA 4ECBA 1YKAA 4EXJA 2HZEA 3SWLA 3I69A 3M8NA 4LL4B 3HVXA 5IO2A 3PH9A 3QR6A 1Q98A 1MD3A 4ACSA 5A4UA 4MF5A 3GMFA 4MZBA 5GSSA 4PTSA 2PUKC 2VLTA 3NOFA 3LYPA 2FY6A 2RLIA 3ZIVA 5KN1A 3QPMA 5ECMB 4YH2A 2LTKA 4I8BA 1PD21 5EPFA 1MDJA 3ZL5A 3ME8A 5EVOA 2HXKA 3ED3A 2C80A 1B4PA 3GYKA 4XRDA 1A24A 3GSTA 3MSZA 2CZ2A 4DVCA 1K0BA 3HZ4A 1XWGA 1A8LA 4DSSA 4EF0A 3WGEA 3IXRA 3DGQA 2AV4A 4NHWA 2JZRA 3TKSE 3F9UA 3KMNA 2GZPA 5FT3A 2X8GA 3KIJA 4ULXA 1X9SB 4E8EA 2YWOA 1EP8A 4TN8A 1VF3A 3EMPA 3LG6A 1OAZA 3GHAA 2WZ9A 1FB6A 1GH2A 1ERWA 3CTFA 3IHQA 1A2JA 4HU7A 2B7KA 2HFDA 3AY8A 2VCXA 2DSAA 4HS1A 1WOUA 2FWHA 1G7EA 4I2UA 1SJIA 4RQXA 5ECLB 3IDVA 2HZEB 2LS5A 4N30A 3EINA 1UN2A 2AUVA 5CYYA 5DALA 5D96A 2MZCA 1XOAA 1G6YA 2DIZA 4BWQA 2CVBA 1M2BA 1TRWA 5AISA 5GAPD 3E9JB 2I3YA 3HD5A 3WGDA 2YWMA 4J56E 2H75A 2O8VB 2HSMB 4G0IA 3C1SA 1SU9A 1USBA 3GV1A 5ELGA 4ML6A 2R3XA 4O5RA 2GSSA 2C0EA 1WE0A 2TRCP 3HZ8A 5B6NA 3KGKA 5GSTA 2F3MA 4GQCA 5CO3A 1GSFA 3H8QA 4ZILA 3DVWA 5DJMA 1K3LA 2VL9A 1B48A 2IMFA 1EGOA 4MCUA 4IJ3A 1V57A 1ZMAA 3E0UA 5D9VA 2R6KA 1AW9A 3CBUA 1H75A 3W6GA 4EDYA 3FEUA 1TRSA 2R5GA 3PPUA 5BMUA 2PGTA 2N5FA 1YJ6A 1OE7A 4HQZA 1Y6EA 5ECKB 3TUEA 1V9WA 2PBJA 2NPBA 1J9BA 5ECRB 4MP4A 3ERWA 3FR6A 3HCZA 1B9XC 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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