5ISUA

2.2 angstrom crystal structure of abc transporter substrate binding protein ctap (lmo0135) from listeria monocytogenes.
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
488
structure length
488
Chain Sequence
KDGGSLIIGVTGDPEVINPNYASDRVTLTIQQAVYAPLFWEVDGKPALAKSLDISDDNLTYTVKLKDGLTWHDGKPLTADDVVFTVNSILDTKQNSPNRGNFVFDDKPVKVEAVDDTTVKFTLPTVAPAFENTIKTFFPIPKHIFEGVENIEKSDKNKNPIGSGPYKFVEYKTGEYVSLERFNDYFDGKPKLDKVTFRITKDQNAANLALQNGEINLKSIQPSDRNKVEKASAVNIITYPENRLSYATFNENQPALKSKELRQALSYALDREEIIDAAYGSDEYAKPASSFLTENTKYFTDKVETYDQDIAKAKKLVKESGFDTSQKLTVYYLNNSKSQESIALYLQQQYKEIGVTLDLKPTDPNALSNITLDRKNADYSIALNGYIMGNDPDAYKSLYLSDAPYNYSNYHNKDLDALWEKGAVTADDKERQEIYEKIQNTIADDAVIYPISYDNAVLALDSRYGGQKAATPQPVTMFRDLSKLYLTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Lmo0135 protein
publication title 2.2 Angstrom Crystal Structure of ABC Transporter Substrate Binding Protein CtaP (Lmo0135) from Listeria monocytogenes.
rcsb
source organism Listeria monocytogenes egd-e
molecule tags Transport protein
total genus 169
structure length 488
sequence length 488
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 5isuA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5isuA01
3.90.76.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Dipeptide-binding Protein; domain 1 Dipeptide-binding Protein; Domain 1 5isuA02
3DP8A 1Y3NA 2RC7A 3HCQA 3SEXA 4QFKA 4M4GA 2P2AA 4NF6A 3VLWA 4XKNA 4IGTA 3T22A 1GGGA 4OEVA 3RLFE 2DXRA 3OOAA 4GVOA 5CMBA 3LSFB 4GXSB 3GZGA 5JEIA 1B0HA 4O3BA 3S9NC 1B46A 4M1VA 2PBWA 3OSRA 2X7PA 3OELA 2E1SA 2UVGA 4FAJA 4H1XA 4F3BA 3E9XA 4F3SA 1OVBA 2HAUA 3FVGA 4MF3A 3UA8A 1B2HA 3TELA 5TU0A 2QRYA 5JTYA 1URDA 3PMXA 3K6UA 1EZ9A 2F34A 3KSXA 3IB1A 1UTBA 1Y4CA 4I62A 3UP9A 2ESNA 2IEEA 4EQ9A 3C36A 4PFYA 2H99A 4YB6A 1NNTA 1BP5A 2VHAA 2ANJA 3KN3A 5HM4B 4GRKA 4EDPA 2PMSA 3L6GA 4YKKA 4R6YA 5DVJA 3C9HA 2CMOA 5CM6A 3OD7A 1MQJA 4HTGA 2H98A 1GV8A 1VFDA 3MC2A 4IY6A 4WXJA 3K4UA 3N94A 3LSWA 1N76A 4F3GA 3Q26A 1NH7A 1PC3A 3C34A 4ZZAA 2REJA 4U1ZA 5CI5A 2I49A 4E0XA 3MBPA 2DVCA 1OMPA 3I5OA 4I1DA 5KDTA 3U92A 2XXQA 4OWDA 1MRPA 3MZ9A 1XVYA 2W7YA 1Y20A 3IJOB 1NL5A 1DOTA 1SD3A 1H45A 2R71A 3KJTA 2XXTA 2UVIA 4GXAA 3KFMA 2WOKA 1FQBA 2VOZA 4F31B 2O69A 1FW0A 2XXIA 3HN0A 3OO7A 2Z8FA 1MQDA 3K01A 2O68A 5AA2A 3VV5A 3H4ZA 4XXUA 3RQTA 2QPQA 1HSLA 4QFOA 4HW8A 3LUYA 4YICA 3MP1A 2KLFA 4HCYA 4YU0A 5I84A 3QSLA 1B0LA 2ZNTA 5EHMA 5I2NA 1JW4A 2B3FA 4OHNA 1R9LA 2G29A 4WEDA 4N07A 1URGA 1CB6A 3B6QA 2ZYOA 1SYHA 1SBPA 2I6EA 4HS7A 1TXFA 1UTHA 2XXUA 1IXCA 2V93A 1Y3PA 4G8HA 5DEXA 5EYFA 3R6UA 1Z7ME 1D3KA 3IOTA 5AA4A 2B4LA 5AA3A 3MP8A 4IB2A 4LQ2A 4RPNA 4EUOA 3IR1A 4OZ9A 1M5DA 1P1QA 1NNFA 1MXVA 4IO3A 4U2RA 3EF7A 3R7XA 2HXWA 5DVFA 1MY0A 1QUJA 4C1TA 2YLNA 3S9LC 1DTZA 3VVFA 2PT2A 3RUMA 3FTOA 3W9WA 4R73A 1MM7A 2I3VA 2F6PA 3ILTB 1LFGA 3H6WA 4GL8A 3SETA 1B32A 2RCAA 2UYEA 1A54A 1N0TA 5IKBA 2O6AA 1JEUA 3P7IA 1DPPA 1B3FA 3HHGA 1MQGA 4Q30B 4P11A 1FCKA 1N04A 5BWJA 4F22A 3C33A 1AH5A 2VGQA 5I57B 4IO6A 3TFLA 1SYIA 1MG1A 4WEPA 1XT8A 1MY4A 1MS7A 1IUDA 3VDFA 3THIA 1PB7A 4PP0A 3SDFA 4R6KA 4FJPA 4XKPA 4LZ5A 3UN6A 4C0RA 1Q35A 1Y1MA 2O7UA 4F29A 3CVGA 3MWBA 5DYHA 2RF1A 2F78A 1SVXB 1B6HA 2F97A 3H3GA 3IOWA 4TLMB 3TKDA 1B5JA 3HV1A 4TLLB 1EH3A 4RK2A 1NH8A 3RT8A 1PB9A 3SERA 1IITA 3MVXA 5I2KB 3DRFA 5L8DA 4DLDA 4JBZA 4LVQA 3T9VA 1US5A 4I9DA 4Q8RA 4F2OA 3KG2A 3DP6A 3TTRA 4H5GA 1YTVA 4G2ZA 3OXNA 5H8HB 3PV0E 4OESA 4NF8A 1JW5A 1JW1A 4X9TA 3PUYE 1FQEA 3QIMA 3A3UA 1ANFA 5F7VA 2ZYMA 4LZ7A 1B9JA 4G68B 2GHBA 4U21A 1FTLA 4QSDA 4JWOA 3ODBA 5HBCA 4ELPA 3DRGA 1IEJA 2HZLA 3IL1B 4ZE9A 5TP9A 1MPCA 3VXCA 3S9MC 3U94A 1JQFA 3D4CA 2F7CA 2FNCA 3E4RA 1TT1A 3IOVA 2ZMBA 2OBGA 5B70A 3G3HA 3RPWA 2OZZA 4ZZEA 4R2FA 3SESA 4EQBA 2XXVA 3KBRA 3USDA 4FE8A 4R75A 4EXKA 2OLBA 1MM6A 1T0KA 2ONSA 3TQWA 5BUUA 3GLBA 4BDQA 3QXMA 5ELVA 4F19A 3QAXA 4X48A 3EPEA 1OQHA 4RJZA 2BJJX 1Z7NE 1SW5A 4AB6A 3RTFB 3VLUA 1Y9UA 3I3VA 1XHYA 2DE2A 5ITOA 4NMYA 4MLVA 2QL3A 1EZPA 1US4A 1WVJA 3K6VA 5ICQA 2VD3A 1VE4A 4G8NA 4GD5A 1B7ZA 4P0GA 2ZXTA 1VSOA 4JSDA 3MJNA 3MP6A 4L17A 1OIBA 4O3CA 5K2YA 3VVEA 3F11A 3ZS6A 3IO6A 3V89B 1B3EA 4ZDMA 4XKRA 5AA2D 2RKMA 1GTKA 2ALUA 3FUZA 4ISUA 4PE5B 4H8IA 4OTEA 5ICTA 4FATA 3QUJA 3N6UA 4H6DA 3EN3A 2DE3A 1BTJA 4X1BA 3LSXA 2QS4A 4GIZA 2V3QA 3MPLA 3VXBA 5H8NB 4YB7A 1SDXA 3DRIA 3TUSA 3TTLA 3VLVA 3T9XB 1R6ZA 4ZEDA 1II5A 4U1OA 4BDNA 5KCJB 3O6IA 2I48A 2GFEA 2RCBA 3WAEA 3TCGA 3CHGA 3G7WA 3OO9A 4HCWA 3RT6B 1MY1A 4FECA 1MH3A 2NWJA 5J1DA 4GL0A 1NKXA 3SEUA 3QK6A 4LQ5A 1XOCA 3KEIA 3MZBA 4OYVA 4FEDA 1I69A 4IO5A 1DPEA 2Q88A 3FXUA 4F3PA 4R9GA 4ZS9A 4BDLA 2RC8A 2D5WA 4KHZE 2QS3A 4DXBA 5I59B 2O7IA 1I6AA 2F5XA 3ZKKA 3O2AA 4OETA 1B3GA 3G3JA 1B3HA 1LCFA 1FQFA 4POXA 1MXZA 1MDQA 3CG3A 1B4HA 1MY2A 4U4SA 3KGCA 4BLAA 3OEKA 3HO7A 4ZEFA 3M3LA 1ZTYA 1TWYA 2XX7A 4LP2B 4R72A 4ELOA 4R6HA 1IZ1A 3PPPA 1IQ7A 3EHUA 5A5XB 3TAJA 1FTMA 4OEUA 4C1UA 4NWCA 1AOVA 3PUWE 1RYXA 1IXIA 4OMBA 3E3KA 1FQCA 2P1SA 4FEBA 1IXHA 4PFWA 4FORA 4GWOA 1QKBA 1GR2A 5I56B 1LGBC 3JZJA 1CE2A 1LBBA 5EHSA 2F8DA 3FJGA 1ZLQA 4PQJA 5CRYA 1P1NA 5IAIA 1N84A 3K0VA 1B51A 3BKIB 5KZTA 1URSA 2AYSA 3TMGA 2F36A 2HZKA 2DS9A 3K00A 1B7UA 3FXRA 3H06B 4G77A 3RGYA 4JSOA 3N26A 1PDAA 3MAMA 5AA1A 3RY3A 1PB8A 4DE8A 2VD2A 3PPQA 2NOOA 1TFDA 2QS1A 5I57A 3H03A 1H44A 1A55A 1M5BA 3IOUA 3OO6A 4FIMA 1QVSA 2O84X 3M3KA 2H9BA 3T96B 3TEPA 1TFAA 3K1PA 2WOPA 2I0BA 2F7BA 3TTKA 1MXUA 3K6WA 4OFJA 5I58B 1MXYA 1YAEA 4KFQA 1JVXA 2QMWA 1NFTA 5FHMA 3PMVA 2XD3A 2DQVA 5FHNA 4OXVA 5H8QB 2DE4A 5LOMA 1VR5A 1A8FA 3DP4A 1D4NA 2QSXA 1MXWA 3FVKA 1FTKA 4UACA 3T9HB 3UIFA 3K6XA 1LB9A 4UA8A 1Y1ZA 3GBAA 4OENA 4OFLA 4R74A 1EU8A 3RN8A 1BIYA 1AIVA 4RXLA 5L9OA 3LSLA 1O64A 4MBPA 4ELRA 4N13A 2DWHA 1PBPA 4EXLA 4WKMA 3G3GA 3TYHA 4NF5B 2XXHA 2V3UA 2Y7IA 3PGFA 3LVUA 2QS2A 2Q2CA 1QULA 2DWAA 3TDJA 4G4PA 1AMFA 5H8HA 1LLSA 4XKQA 2HCAA 2D21A 2UVJA 1IIWA 4U23A 3IB2A 4EF2A 3LC8A 2UYFA 4QSEA 3TCHA 5CC2A 2OJTA 4G68A 5H8FB 3UGWA 4Z7EA 2Y84A 4JXIA 1QKAA 3T93B 4NF4B 4ZEKA 2DXYA 1QUIA 3C4MA 4P0IA 3KOSA 3A3CA 3D4GA 1D9VA 3IAZA 1PEBA 1FTJA 3FVOA 2O1MA 1ZBMA 4DZ1A 3V83A 2X26A 3U8QA 4LZ8A 1SW2A 2B3BA 4OQOA 4ND9A 2OCUA 4ZE8A 3C31A 3CIJA 4IO2A 4R9FA 1POTA 1RKMA 3Q25A 4QHQA 3FJMA 4N6PA 3PAMA 4LONB 3BBRA 3CFXA 3MPKA 2R6GE 2Z22A 3IB0A 3OENA 3T66A 1FTOA 1IXGA 4H0WA 4Q5TA 1JEVA 2HQ0A 1B7HA 3JV9A 3VE1B 3KN7A 4NTLA 4QRZA 4K3FA 3DELB 2GRVA 3C32A 3OMBA 3BFTA 1MY3A 3V8XB 4H5FA 2XX8A 4PETA 3SEWA 1VFEA 4H8JA 5B7DA 3S4UA 5K2XA 2DYXA 3K2DA 2F35A 4MH5A 3IX1A 5TP9B 2XXPA 4JWYA 3H6VA 4KD5A 2Z8DA 3CR9A 1POY1 3O29A 2UVHA 4EF1A 4POWA 1F9BA 1ELJA 1Y3QA 4YB5A 4RPOA 3M3FA 4XTCQ 2XXXA 3DRKA 3DM0A 4RYAA 2HFBA 2PT1A 5ITPA 3E13X 2H4IA 1NNPA 4IY5A 3HPIA 2NUVA 3FV2A 3FJ7A 3O6GA 3VVDA 4NEDA 3U93A 1R9QA 4GLIA 3O9PA 4BDOA 3TPAA 4G8MA 4YKJA 5H8NA 3TQLA 1OLCA 3O97A 2Q9TA 2A5TB 1LSTA 2M8CA 1DMBA 1RYOA 5KCJA 1B5IA 1P1WA 3PUXE 3O28A 2VP1A 4OVJA 5DTBA 4IGRA 3FD3A 3G3KA 1R1NA 1USYE 4KYEA 3OO8A 1B52A 1Q1KA 2RC9A 4ZEBA 4KYDA 3HHFA 5TPAB 1S50A 4TQUQ 5CBRA 3VFJA 2LAOA 2F6GA 4EQ7A 2I4BA 2AL4A 1A99A 3PUVE 1N7WA 3IO4A 3FGSA 2REGA 1LCTA 2R9JA 4G68C 2OK2A 4KCCA 2DSFA 1KWHA 3O6HA 3FATA 1USYH 3GXAA 1EZOA 2B4MA 3MQ9A 2V84A 3PUZE 1B05A 3IORA 2ZNUA 2DWJA 4R2BA 4NF6B 5I59A 2E0SA 2Y7KA 2X7QA 2D3IA 3RYAA 2GHAA 1B4ZA 1A7LA 3G3IA 5CBSA 1B1XA 4PFTA 2QMXA 4DCXA 1QW0A 1LBCA 4LA9A 1A8EA 4BDMA 1SQYA 2O51A 1MPDA 3FXQA 1FQDA 1M5FA 2Q2AA 3K1NA 2NVUB 3DRHA 4F1VA 1A40A 4NE4A 1I6QA 1LAFE 5FTHA 3A09A 3B7DA 5CMMA 3MUQA 2V25A 5A5XA 3MVWA 3EHSA 1QUKA 5JTYB 1MDP1 3ZSFA 4RK9A 1YPNA 4GF8A 2Z23A 3B6WA 3N5LA 1UTBB 3T9UA 3CFZA 1P1OA 3IK6B 4QFPA 3FVNA 5JK4A 3QUFA 1JETA 5I56A 4BDRA 3WAFA 3DLNA 2ZNSA 1SI1A 1ZIUA 4RY1A 4IO4A 3MZ1A 4F39A 2H25A 3FV1A 1WODA 2AL5A 2PVUA 1QJMA 2A5SA 2XHDA 3V5AA 4MFIA 3H6TA 4ECFA 1N7XA 2GH9A 3CSGA 4RA1A 1LFHA 3MVZA 3HSTA 1J1NA 1UIUA 3PPRA 1B3LA 4DXUA 1GVCA 3CSBA 4O3AA 5KDTB 3K02A 5FHOA 4ESXA 2WOLA 1B40A 1SW1A 3N6TA 2O1LA 2I58A 2QJEA 2DVZA 1SI0A 4ELQA 1ATGA 3TTMA 5F1QA 1ZKBA 1NMUA 3CG1A 3SKPA 1MQIA 3I6VA 4KI0E 5CMCA 3MW0A 2I0CA 2FA7A 5AA2B 3FIRA 1O63A 1OVTA 4RNSA 4OFOA 2YJPA 3Q28A 3PD8A 1I6BA 4QSCA 5I58A 4Z0IA 2ABHA 1H76A 5I2NB 2OWSA 3S2VA 4GFRA 1O7TA 3JYRA 4TOZA 3KOTA 3KJ7A 4AQ4A 3UORA 2XXYA 1SW4A 1LFIA 2DWIA 3LBSA 5H8QA 1MH4A 2ONKE 3H7MA 3CI8A 1UTHB 3TCFA 3R26A 4NWDA 2FYIA 5DEXB 3W9VA 3H6UA 2P0SA 3FZVA 3PMWA 3C35A 5AA4B 4H65A 4KQPA 1H43A 2XXWA 1AL3A 4NF5A 4XIGQ 1H3DA 2WKYA 1B1HA 4I8CA 3RNNA 3ONMA 4F1YA 4YMAA 1XVXA 4OERA 1LAXA 5ISUA 3EHTA 1ZJLA 3FASA 3KSJA 1HSEA 4PFUA 1XS5A 4F18A 1FQAA 3L6HA 5I2KA 3RYBA 4LUBA 5H8FA 4F1UA 2Y7WA 2ONRA 3QYTA 4DDDA 4IO7A 4NF4A 4ESWA 4X1DA 4YKIA 2F7AA 1BLFA 2ZYKA 4KYSA 2CZLA 2Y7PA 3LR1A 2UXAA 3Q27A 1B58A 3PU5A 1UIVA 2PX1A 1M5CA 5M2VA 1B5HA 1DSNA 3U1OA 3TTNA 2DP8A 1UQWA 3O6PA 3AXFA 4QF9A 3SEVA 3B6TA 3DRJA 3KZGA 4AB5A 5L9SA 4THIA 4YKPA 1LAHE 2AIXA 1N3XA 4U22A 4YAHX 3TODA 1MPBA 1XC1A 3O66A 4JB7A 2OWTA 1OLAA 3SEYA 5FTIA 5DT6A 1BKAA 2Q8JA 3ILUB 1D9YA 1JVYA 3BFUA 4LATA 3ZKLA 1LAGE 3TZAA 3PD9A 3EQ1A 1WDNA 3ECRA 1PBQA 3OSQA 5CMKA 4U4XA 2RINA 3CFLA 2XX9A 1ZMGA 4GOTA 3Q29A 4YMBA 4GQOA 4YZZA 1ZU0A 2I3WA 4NF8B 2Q89A 3IJXB 4F2QA 4KPTA 2NXOA 2H5YA 3U72A 2THIA 4ONYA 4JDFA 1JNFA 4ZECA 1OQGA 3W15C 4DCYA 5L9MA 2DOJA 3MVYA 2G93A 3K1MA 1P1UA 3RTWB 3PPNA 1NNKA 1S7YA 3G3FA 2IA4A 5H8SA 1HSJA 2ZYNA 2I4CA 1LB8A 4JWXA 1Y4TA 2XD2A 2A5TA 4KR5A 4DXCA 1DTGA 4MLQA 2YPNA 3UK4A 4E0WA 4ZEIA 4QFLA 3OEMA 2Y7RA 5TPAA 2HEUA 4DIGA 1MQHA 2PYYA 2V3TA 3PPOA 3GBBA 1N3WA 5HPQA 4KCDA 2XXRA 1S9TA 2HAVA 3CRBA 4Q0CA 5AE4A 2B65A 3KN8A 5DVIA 4QFNA 1MXXA 3M8UA 2Z8EA 1YCJA 4H67A 1M5EA 1P99A 1L5TA 3S9EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P3VA 3DP8A 1Y3NA 4GWXA 2RC7A 4OVQA 3HCQA 3SEXA 4QFKA 5IZZA 2VPOA 4M4GA 2P2AA 4NF6A 3VLWA 4XKNA 4IGTA 3T22A 1GGGA 4OEVA 3RLFE 2DXRA 4P8BA 3OOAA 4GVOA 1LBXA 3LSFB 4GXSB 5CMBA 3GZGA 4N17A 5JEIA 1B0HA 4O3BA 2ZZWA 3S9NC 1B46A 4M1VA 2PBWA 3OSRA 2X7PA 3OELA 2E1SA 2UVGA 4FAJA 4H1XA 4LN5A 4F3BA 3E9XA 3LUZA 4F3SA 1OVBA 2HAUA 3FVGA 4MF3A 3UA8A 1B2HA 3TELA 5TU0A 2QRYA 5JTYA 1URDA 3PMXA 3K6UA 1EZ9A 2F34A 1IMFA 3KSXA 3IB1A 1UTBA 3SZPA 1Y4CA 4I62A 3UP9A 2ESNA 2IEEA 4EQ9A 3C36A 4PFYA 2H99A 4YB6A 1NNTA 4NF0A 5EYGA 1BP5A 2VHAA 2Q74A 2ANJA 3KN3A 5HM4B 4GRKA 4EDPA 2PMSA 3L6GA 4YKKA 4R6YA 5DVJA 3C9HA 4AS5A 2CMOA 5CM6A 3OD7A 1MQJA 4HTGA 2H98A 2WBDA 1GV8A 1VFDA 3MC2A 4IY6A 4WXJA 3K4UA 3N94A 3LSWA 1N76A 4F3GA 3Q26A 1NH7A 1PC3A 3C34A 1LBVA 4ZZAA 2REJA 4N91A 4U1ZA 2F3DA 5CI5A 2I49A 4E0XA 3MBPA 2DVCA 1OMPA 3I5OA 4O7MA 4I1DA 5KDTA 5IZ3A 3U92A 2XXQA 4GWSA 4OWDA 1MRPA 3MZ9A 1XVYA 2W7YA 2R8TA 1Y20A 3NOHA 3IJOB 1NL5A 1DOTA 1SD3A 1H45A 2R71A 3KJTA 3E78A 2XXTA 2UVIA 4GXAA 2XXKA 3KFMA 2WOKA 1CNQA 1FQBA 2VOZA 4F31B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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