5ISUA

2.2 angstrom crystal structure of abc transporter substrate binding protein ctap (lmo0135) from listeria monocytogenes.
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
488
structure length
488
Chain Sequence
KDGGSLIIGVTGDPEVINPNYASDRVTLTIQQAVYAPLFWEVDGKPALAKSLDISDDNLTYTVKLKDGLTWHDGKPLTADDVVFTVNSILDTKQNSPNRGNFVFDDKPVKVEAVDDTTVKFTLPTVAPAFENTIKTFFPIPKHIFEGVENIEKSDKNKNPIGSGPYKFVEYKTGEYVSLERFNDYFDGKPKLDKVTFRITKDQNAANLALQNGEINLKSIQPSDRNKVEKASAVNIITYPENRLSYATFNENQPALKSKELRQALSYALDREEIIDAAYGSDEYAKPASSFLTENTKYFTDKVETYDQDIAKAKKLVKESGFDTSQKLTVYYLNNSKSQESIALYLQQQYKEIGVTLDLKPTDPNALSNITLDRKNADYSIALNGYIMGNDPDAYKSLYLSDAPYNYSNYHNKDLDALWEKGAVTADDKERQEIYEKIQNTIADDAVIYPISYDNAVLALDSRYGGQKAATPQPVTMFRDLSKLYLTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Lmo0135 protein
publication title 2.2 Angstrom Crystal Structure of ABC Transporter Substrate Binding Protein CtaP (Lmo0135) from Listeria monocytogenes.
rcsb
source organism Listeria monocytogenes egd-e
molecule tags Transport protein
total genus 169
structure length 488
sequence length 488
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 5isuA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5isuA01
3.90.76.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Dipeptide-binding Protein; domain 1 Dipeptide-binding Protein; Domain 1 5isuA02
5AA4A 2HZKA 2XX7A 1LSTA 1HSLA 3PUYE 5L8DA 5H8FB 2M8CA 4X1BA 3T9UA 2Q8JA 3RPWA 1FQAA 5KZTA 2V93A 3FTOA 3W15C 2DWIA 4QFPA 4OFOA 2VD2A 1DOTA 3LSWA 3UORA 2RC9A 1MXXA 5CMBA 3QK6A 2Z8DA 3CVGA 1VFDA 2HAUA 1LCFA 1NNPA 1WVJA 1H76A 4X9TA 4G4PA 2HAVA 1N3WA 4YU0A 4H65A 1A8EA 3T9HB 3R26A 4POXA 2AL5A 3D4GA 5ICTA 5KCJA 1QULA 3Q27A 4DLDA 1ZU0A 2VGQA 3H6UA 3K00A 1B4HA 4OVJA 4LQ5A 3S9EA 1ELJA 2GHAA 4RK9A 4QFKA 3DRIA 1LFGA 2DE4A 4ONYA 1P1UA 1LAXA 1Y3QA 4WXJA 3O66A 1N3XA 4I9DA 1NNTA 2G93A 4ZECA 1BIYA 1Y4TA 3K6VA 3PUVE 3A3CA 2DE2A 3MZ9A 3MJNA 1FQCA 2FA7A 3CFZA 3N94A 3HCQA 2NWJA 3VFJA 3KJ7A 2Z8EA 3LSFB 4ZE8A 1NL5A 1Y1MA 1RKMA 3U1OA 2Z23A 1Y4CA 2XX9A 4H5FA 2RF1A 1M5EA 3G3JA 4LONB 1LBCA 3RQTA 5A5XA 2YLNA 1US5A 3S4UA 1JETA 4YB7A 3LBSA 3QYTA 4KI0E 4R9GA 5FHOA 3D4CA 3O28A 1S7YA 5I2NB 1FTJA 3H7MA 2PT2A 4GRKA 4ND9A 2QMXA 2PYYA 4GD5A 2XX8A 3SETA 4PFUA 3USDA 1D9YA 3N5LA 4I1DA 4G68A 4WEDA 3TCFA 4BDOA 4NF4B 5TP9A 4LP2B 4Z7EA 1AMFA 5L9MA 3I3VA 2IA4A 3A09A 3U72A 1Z7NE 5ELVA 4NTLA 1US4A 1D9VA 5FHMA 3FXQA 1GVCA 3PPQA 1UTBA 1AIVA 4OERA 2ZNSA 3U94A 1USYE 3DRJA 2XXPA 4OQOA 3FD3A 4U4XA 1FQDA 4NF5A 4DCYA 2F7BA 1B1XA 3IOVA 3MP8A 2Q88A 2OJTA 3RY3A 2WKYA 2B4MA 2A5TB 2GRVA 3QAXA 2NOOA 4R6HA 1UIVA 3C32A 2Q89A 3FJMA 3HO7A 1Y1ZA 3PU5A 1LCTA 2QS3A 1UTHB 3KFMA 3T9XB 1N84A 3IOTA 3CSGA 3MVYA 1XVYA 2ZXTA 1SQYA 1QW0A 3TTMA 4QRZA 3MAMA 1LAHE 3CIJA 4I8CA 1Q35A 3IOWA 4GL8A 2V3QA 3BBRA 2XXXA 3F11A 1B7ZA 4P11A 3N6TA 4XKRA 4KYSA 1BP5A 5K2YA 3SEUA 2PX1A 5AE4A 4U22A 1URDA 2ZYNA 3VLWA 3T96B 1UIUA 4O3CA 3CHGA 3UGWA 4YKPA 5AA2B 4TQUQ 1M5DA 3TTRA 2I58A 3SEYA 3W9VA 2Z22A 5EHMA 5CM6A 3GXAA 2HZLA 3FJGA 4EQ7A 2P2AA 1XOCA 4YMAA 1N04A 2F97A 4BDQA 3RYAA 2Y7WA 3H03A 5H8NA 1YTVA 2GFEA 2CZLA 4H8IA 2E1SA 1A7LA 4M1VA 4OZ9A 2DOJA 4ELPA 5I56A 1T0KA 4LZ7A 4I62A 2H98A 5LOMA 2I4CA 2FNCA 3OO8A 1FTMA 3K1PA 2O7UA 5HM4B 3PV0E 4QFLA 3DRFA 2ESNA 3Q29A 1YCJA 2DE3A 1SW5A 2Q2CA 4YICA 4BLAA 3S2VA 1MQHA 3E3KA 4G8NA 1B46A 4ZE9A 3FIRA 3UA8A 4KQPA 2F36A 3L6GA 2XXVA 4IGRA 3GBAA 2O6AA 3MC2A 1MQIA 3ZKLA 5TU0A 4R9FA 1S50A 3UP9A 1TFAA 4G77A 5FTIA 2IEEA 1MY4A 4MF3A 5DEXB 2XXIA 3IB1A 3HSTA 3TTNA 5BUUA 3CR9A 5JK4A 4LZ5A 2O1MA 2XXHA 3MVWA 3CRBA 2YPNA 4NF6A 1SW4A 1QJMA 1B52A 5H8SA 1MRPA 1P1OA 4MLQA 1JW4A 4R2BA 2F6GA 1JQFA 4EXKA 1DTGA 3PPOA 3O9PA 4QSEA 4XIGQ 3TDJA 4PQJA 4JWXA 3M8UA 4ECFA 2OBGA 1R9QA 3K2DA 3KSXA 3FZVA 1EZ9A 4MFIA 2PT1A 4PETA 2V3UA 3G3KA 2I3VA 1XS5A 3M3LA 1FTLA 2BJJX 1NNFA 1PB8A 5H8FA 5ITPA 1SVXB 4LZ8A 4F2QA 1IXHA 2OK2A 1GGGA 1I6BA 3DELB 4PE5B 3FVKA 4KCDA 2DP8A 4F3BA 3C35A 1XVXA 4XTCQ 3MPKA 1IQ7A 1MY3A 3KN7A 5DVJA 4DXUA 4AB5A 1BLFA 2I4BA 1B4ZA 4IY5A 4F2OA 3W9WA 4Q0CA 4JWYA 4RY1A 1FTOA 3O29A 1O7TA 2O68A 4DIGA 1JEUA 4GXSB 1URGA 1QVSA 2VHAA 1EU8A 1MQGA 1OLAA 5JEIA 2REGA 2NVUB 3BFUA 4ZEFA 1L5TA 1LB9A 3OXNA 3B7DA 3B6TA 3EN3A 3DM0A 3N6UA 3H4ZA 3LR1A 3O6PA 2Q9TA 3M3FA 5JTYB 3MBPA 4OXVA 3K6WA 3VVFA 3RN8A 3B6QA 1UQWA 3DLNA 3FVNA 4NF8A 5ICQA 3GLBA 3JZJA 3PUWE 2XHDA 4QFNA 4THIA 1RYOA 2ZNTA 2LAOA 3LVUA 1NKXA 3EHSA 1MDQA 2UVJA 3QUFA 5ITOA 1J1NA 4KCCA 3VLUA 1VSOA 4XKQA 2WOKA 2DWAA 2CMOA 4OESA 5CBRA 2XXQA 1PB7A 2UXAA 1PDAA 3U8QA 1GR2A 1MG1A 1NFTA 1ZKBA 2ONKE 2DYXA 3PAMA 4NMYA 3UN6A 1Y9UA 4G8HA 4ZZAA 1EZOA 1TXFA 4N13A 4F39A 2I3WA 1A99A 2Y84A 1DPPA 1QKAA 1BTJA 3CG3A 1OMPA 3FATA 1B3GA 4U1ZA 3V83A 1IXIA 4JWOA 1PB9A 3ZSFA 4JDFA 4IY6A 4LATA 5I84A 1I69A 2OZZA 1NNKA 5ISUA 1ZMGA 4ELRA 3ODBA 4YAHX 3FXRA 5H8HB 1IEJA 4Z0IA 4NF4A 4C1UA 3MW0A 4OMBA 2O69A 1ZIUA 4FJPA 4ZDMA 3MVZA 2UYFA 5L9OA 1MXVA 1MXYA 1TFDA 2HQ0A 4IO4A 2PMSA 2F7CA 3R6UA 1M5FA 2I0CA 3FXUA 5FHNA 4JSDA 3G3IA 4R2FA 3FGSA 4F31B 4ZEDA 1OVTA 2O1LA 1VR5A 2HCAA 3TCHA 3RGYA 1MXWA 4ZEIA 1O64A 3EHUA 3PGFA 1XHYA 2HXWA 2VOZA 3U93A 5A5XB 2FYIA 2F78A 1MPDA 1UTHA 3MPLA 4F1VA 2QPQA 1F9BA 4LUBA 4YKKA 1BKAA 1B7UA 4NEDA 3EF7A 2NUVA 4R75A 4DE8A 3KEIA 4G68B 4KFQA 1ZJLA 1SDXA 2DVCA 5TP9B 1P99A 4ESWA 1B5IA 1I6QA 3QXMA 4TOZA 3VLVA 1B40A 1ZLQA 2OCUA 4HTGA 3OSQA 3OEKA 4F22A 3M3KA 3DP8A 5AA2A 4MH5A 4OETA 4GIZA 4HCWA 3HHFA 3G7WA 3IX1A 3K4UA 1Y3NA 3I5OA 2XXRA 1LLSA 1JW5A 1GV8A 5CBSA 3O6HA 1IXGA 2DQVA 4WKMA 4DCXA 3IO6A 2QJEA 2X26A 1IIWA 4DDDA 3V5AA 1URSA 3TYHA 3QIMA 4RNSA 1II5A 3PMXA 3KBRA 4GL0A 1MM7A 5AA2D 1B5JA 3O6GA 4U21A 5I57A 3HV1A 2OWTA 1MH3A 1MH4A 2AIXA 3C9HA 1LBBA 5TPAB 4RPNA 1VFEA 3SESA 4EXLA 5I58B 4Q30B 3LUYA 4FEBA 1MS7A 2VP1A 2I49A 1SI0A 2Y7IA 5I59B 1N7WA 4MBPA 1B3EA 1PBQA 2RCAA 2RKMA 5F1QA 5I2KA 2I0BA 3IAZA 4PP0A 2DXRA 1R1NA 3E4RA 3C34A 3SERA 4OTEA 3TFLA 1MPCA 3OEMA 4POWA 4JXIA 5L9SA 1VE4A 1NMUA 4EQ9A 2UYEA 3IR1A 2ZYMA 3SKPA 2H25A 4NWCA 3KN3A 4PFWA 3TZAA 3G3FA 3O2AA 5B70A 1MQDA 4NE4A 3VDFA 4H6DA 5DEXA 5DVFA 4JB7A 1OQGA 3SEVA 1PC3A 2ONSA 5KDTB 5CMMA 1B3FA 1MY0A 1P1QA 4ELQA 1FQEA 4IGTA 3EPEA 3KG2A 4AB6A 5B7DA 3TKDA 4LVQA 2X7QA 4IO3A 1MQJA 3OO7A 4GOTA 4FAJA 2XD3A 2QL3A 3G3GA 3E9XA 1NH7A 5FTHA 3PUXE 1WODA 4H0WA 1FCKA 1N0TA 4KHZE 1B0HA 2ONRA 4FE8A 4O3AA 2H5YA 1WDNA 3EHTA 3ZS6A 5H8QA 3TMGA 4IO5A 2WOLA 2P0SA 4JBZA 4H67A 1SYIA 4GQOA 1B3LA 5CRYA 3U92A 3PD9A 1A40A 1FQBA 4MLVA 3A3UA 4FORA 3LC8A 1B3HA 1JNFA 3DRHA 1P1NA 3RTWB 1MXUA 3KZGA 4TLLB 1TWYA 4U23A 3K01A 2O84X 1QUIA 2RC8A 2Y7RA 4BDLA 4EF1A 2UVGA 1FQFA 2QSXA 4YB5A 5IAIA 1QKBA 4FIMA 4NWDA 4KYEA 3K1NA 1LFIA 5F7VA 3TQLA 1IUDA 1QUKA 4OFLA 1FTKA 1B58A 1R6ZA 3PPRA 4R72A 5M2VA 5JTYA 3MQ9A 3IOUA 1NH8A 3CFXA 3UIFA 3FV1A 4EUOA 2PBWA 2V84A 3SEWA 3VE1B 4R74A 1XC1A 1H3DA 3UK4A 3CG1A 1LFHA 2ANJA 1CB6A 4P0IA 1JW1A 3VXCA 2F6PA 1LB8A 3ONMA 2HFBA 4JSOA 4LA9A 1Z7ME 3VVDA 4N6PA 2DSFA 3RT6B 2DWJA 2Z8FA 4QSDA 2Y7KA 4YKIA 4OEUA 3EQ1A 5EYFA 2H99A 4C1TA 3ECRA 4GF8A 1H44A 4RJZA 1DSNA 3S9NC 3OELA 4F1UA 3DRGA 1JEVA 5HPQA 4HW8A 1DMBA 1MDP1 1B0LA 4F29A 3KGCA 4GVOA 1SW2A 2F35A 2V25A 4UACA 2O7IA 4KYDA 4G68C 1P1WA 5AA4B 4OYVA 2G29A 2THIA 3O6IA 3OO6A 4KR5A 2F7AA 2RCBA 4X48A 4E0WA 2XXYA 1S9TA 5H8HA 1OVBA 1HSJA 2UVIA 4IO6A 3FVGA 3TPAA 4DZ1A 2DS9A 2Y7PA 2RC7A 4NF8B 3H06B 3DRKA 4G8MA 4X1DA 2B3BA 4ISUA 4YB6A 5I2NA 2D5WA 5KCJB 3BFTA 3Q28A 5CMKA 2QS1A 3VV5A 1LAGE 4F1YA 3RT8A 5CC2A 1Y20A 3CFLA 4OFJA 4EQBA 3OMBA 3RNNA 3DP6A 2VD3A 5IKBA 4L17A 4F18A 3RTFB 1M5CA 1KWHA 1AOVA 2ZMBA 1SYHA 4QFOA 1A54A 2ALUA 3L6HA 3P7IA 1ANFA 4IO2A 4U2RA 4BDNA 2Q2AA 4KPTA 4ZS9A 1POY1 3WAEA 2GH9A 1YAEA 1SD3A 2QS2A 3RYBA 2E0SA 4E0XA 3ILTB 4ZZEA 4BDRA 1POTA 3C36A 3IB0A 2O51A 3K6XA 2I48A 2XXWA 4O3BA 4HS7A 4R73A 4PFTA 3TODA 2ABHA 3G3HA 2A5TA 3TAJA 5BWJA 2KLFA 4H5GA 3B6WA 1ATGA 1LAFE 4QHQA 1N7XA 2XD2A 3RLFE 3Q26A 4XKPA 1B5HA 2P1SA 2GHBA 2R71A 4M4GA 4YZZA 1R9LA 3PMVA 2I6EA 1MM6A 2B65A 3HPIA 4Q5TA 3PUZE 1JVYA 3IK6B 3MUQA 3K1MA 3IORA 3H6VA 3T9VA 1HSEA 1EZPA 3S9LC 4R6YA 2XXTA 3TTKA 1AH5A 3CI8A 4YKJA 2QMWA 3MWBA 4RPOA 2V3TA 4XXUA 1GTKA 3S9MC 3OOAA 4UA8A 1FW0A 3MP1A 3IJXB 3MZ1A 2OWSA 3PMWA 1O63A 4EDPA 3V8XB 4F3PA 1SBPA 2HEUA 1UTBB 2ZYOA 4F19A 4P0GA 4HCYA 4U1OA 3H6TA 3KN8A 5DT6A 2X7PA 5TPAA 3KSJA 3N26A 4RXLA 5I58A 3LSXA 4F3SA 4NF5B 2QS4A 3T66A 4C0RA 1RYXA 3VXBA 5I59A 1B2HA 1YPNA 1SI1A 1D4NA 1Y3PA 1TT1A 4H1XA 2H9BA 4LQ2A 1Q1KA 1MPBA 3T22A 1B1HA 3SDFA 3H6WA 2R6GE 3KJTA 1IITA 3PPNA 1H43A 2ZNUA 3WAFA 1OLCA 3FASA 4F3GA 4G2ZA 1DPEA 2AYSA 4BDMA 4OWDA 1MY1A 1LGBC 3TUSA 1CE2A 4DXBA 1PEBA 3C4MA 3IO4A 5KDTA 5CMCA 4DXCA 5AA1A 4GWOA 2F8DA 4Q8RA 1MXZA 3MZBA 3Q25A 3IJOB 2QRYA 1A55A 3RUMA 1M5BA 2DWHA 2AL4A 4OEVA 2PVUA 1B9JA 3QSLA 5I57B 1B51A 1DTZA 3FJ7A 5DYHA 3DP4A 1AL3A 4QF9A 4XKNA 4AQ4A 2D3IA 4K3FA 4GXAA 5H8NB 3PD8A 3JYRA 2F34A 5I2KB 4ELOA 3FUZA 5DVIA 2H4IA 5I56B 4RA1A 3BKIB 1A8FA 2OLBA 3JV9A 3VVEA 4GLIA 3AXFA 5EHSA 3R7XA 2B3FA 3QUJA 2NXOA 3OENA 4ZEBA 3IL1B 1MY2A 1B32A 2RINA 1B05A 2A5SA 4WEPA 4IO7A 3K0VA 1B7HA 1IXCA 4H8JA 3ZKKA 2F5XA 3LSLA 2W7YA 3TTLA 3OD7A 1SW1A 4OENA 3TEPA 1XT8A 4KD5A 2UVHA 5K2XA 3TQWA 1QUJA 1H45A 3GBBA 3K02A 4RK2A 1USYH 4EF2A 3MP6A 4PFYA 3O97A 3T93B 2DVZA 3IB2A 2R9JA 3K6UA 5DTBA 4YMBA 1D3KA 3GZGA 4FEDA 3OO9A 2ZYKA 1ZBMA 5AA3A 1JVXA 3V89B 1B6HA 3PPPA 3I6VA 4ESXA 4GFRA 3KOTA 4TLMB 1PBPA 1IZ1A 3E13X 4NF6B 3THIA 4RYAA 5H8QB 4N07A 1OQHA 1EH3A 2D21A 3MVXA 3H3GA 4QSCA 1ZTYA 1N76A 2DXYA 2REJA 3HHGA 3KOSA 4FATA 3TCGA 3OSRA 1I6AA 5HBCA 4FECA 5CI5A 1OIBA 2WOPA 3FVOA 2B4LA 3SEXA 2YJPA 2XXUA 3CSBA 3ILUB 4IB2A 5J1DA 3FV2A 3HN0A 4ZEKA 3C33A 4OHNA 4U4SA 3C31A 4R6KA 3TELA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DBZA 1NUZA 5AA4A 2HZKA 2XX7A 1LSTA 1HSLA 3PUYE 5L8DA 5H8FB 2M8CA 4X1BA 4N17A 3T9UA 2Q8JA 3RPWA 1FQAA 5KZTA 2V93A 3FTOA 3W15C 2DWIA 4QFPA 4OFOA 2VD2A 1DOTA 3LSWA 3UORA 2RC9A 3FXBA 1MXXA 5CMBA 4NGUA 3B8BA 3QK6A 2Z8DA 4OANA 1SPIA 3CVGA 1VFDA 4PAKA 2HAUA 3EKIA 1LCFA 1NNPA 1WVJA 1H76A 4X9TA 4G4PA 2JJKA 2HAVA 1N3WA 4YU0A 3B50A 4H65A 4HE0A 1A8EA 3T9HB 3R26A 4POXA 2AL5A 3D4GA 5ICTA 5KCJA 1QULA 3Q27A 4DLDA 1ZU0A 2VGQA 3H6UA 3K00A 1B4HA 4OVJA 4LQ5A 3S9EA 1ELJA 2GHAA 5I7IA 4RK9A 4QFKA 3DRIA 1LFGA 2DE4A 4ONYA 1P1UA 1LAXA 3KBZA 1Y3QA 4WXJA 3O66A 1N3XA 4I9DA 1NNTA 5EYHA 2G93A 4ZECA 1BIYA 1Y4TA 3K6VA 3PUVE 3A3CA 2DE2A 3MZ9A 3MJNA 1FQCA 2FA7A 3CFZA 3N94A 3HCQA 2NWJA 3VFJA 4UABA 3KJ7A 1FPJA 2Z8EA 3LSFB 4ZE8A 2F3BA 1NL5A 1Y1MA 3ROJA 1RKMA 3U1OA 2Z23A 1Y4CA 2XX9A 4H5FA 2RF1A 1M5EA 3G3JA 4LONB 5LTCA 1LBCA 3RQTA 1NI9A 5T3JA 5A5XA 2YLNA 1US5A 3S4UA 1JETA 2FHYA 4YB7A 3LBSA 3QYTA 4KI0E 4R9GA 5FHOA 3D4CA 3O28A 1S7YA 5I2NB 1FTJA 3H7MA 2PT2A 1IMAA 4GRKA 4ND9A 2QMXA 2PYYA 4GD5A 1JP4A 2XX8A 2KQZA 3SETA 4PFUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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