The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
68
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structure length |
68
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Chain Sequence |
EIQLNNKVARKVRALYDFEAVEDNELTFKHGEIIIVLDDSDANWWKGENHRGIGLFPSDFVTTNLNIE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
NMR Reveals the Interplay among the AMSH SH3 Binding Motif, STAM2, and Lys63-Linked Diubiquitin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Signal transducing adapter molecule 2
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| total genus |
10
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| structure length |
68
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| sequence length |
68
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-03-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
| A | PF02809 | UIM | Ubiquitin interaction motif |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1K1Z A; 1GFC A; 2DL5 A; 2A36 A; 1W6X A; 1PKS A; 1Y0M A; 2EPD A; 2KE9 A; 2GTO A; 2CSQ A; 1ZLM A; 1OV3 A; 2AK5 A; 1E6G A; 3I35 A; 4HVW A; 4RTV A; 3VS1 A; 1AWJ A; 3I9Q A; 2OJ2 A; 3EGU A; 1QKW A; 4RUG A; 1QWF A; 2EGE A; 3REA B; 2DF6 A; 2EYW A; 1WFW A; 4FSS A; 1Z9Q A; 2DE0 X; 1EFN A; 2DL4 A; 4JJC A; 2RMO A; 2GBQ A; 4HVU A; 5FWC A; 1UE9 A; 1RI9 A; 2DRM A; 1RLQ C; 1AZE A; 3IQL A; 1PRL C; 2LNH B; 2EW3 A; 3QWY A; 2V1R A; 2VWF A; 1IO6 A; 2GNC A; 2EGC A; 2RF0 A; 3EG0 A; 2LQW A; 2J6O A; 3VRY A; 3KFV A; 1HD3 A; 1YWO A; 2LX7 A; 2ESW A; 1JU5 C; 1T0J A; 1YP5 A; 2O88 A; 2LJ1 A; 2FRW A; 1G83 A; 4J9F A; 1KSW A; 2EVR A; 1QLY A; 1UDL A; 2PZ1 A; 1RUW A; 1YCS B; 2YT6 A; 3VS6 A; 1JXO A; 1WYX A; 1M3C A; 1CKB A; 2DLP A; 1ZSG A; 1AWX A; 3UF4 A; 2JW4 A; 4LN2 A; 1BB9 A; 1UTI A; 2ED0 A; 2BTT A; 2RQR A; 2DBK A; 2X3X D; 2EYX A; 2KBT A; 2M51 A; 4J9H A; 5FW9 A; 1UHF A; 1M8M A; 4JZ4 A; 3SEM A; 2FEI A; 1X2K A; 4OMP A; 2O9S A; 2L3Q A; 3UA7 A; 1VYU A; 4J9D A; 1GCP A; 2CRE A; 2RN8 A; 2CT4 A; 3PVL A; 1A0N B; 3VS0 A; 2HDA A; 1M27 C; 3A98 A; 2KNB B; 2ROL A; 1T3S A; 2KYB A; 4Z8A A; 4Z88 A; 1H3H A; 1ZUY A; 4AFZ C; 1SHG A; 1GL5 A; 1K0S A; 4A63 B; 4WCI A; 4J9E A; 1UHC A; 4CC4 B; 1AZG B; 1SRL A; 2I0N A; 2W10 A; 1AVZ C; 2ABL A; 2BZY A; 3ZL7 C; 2RQV A; 2J6F A; 3SHW A; 4D8K A; 5FWB A; 3R6N A; 1K76 A; 1MV0 B; 3I5S A; 1HSQ A; 1OPL A; 1ZUU A; 2IIM A; 2M0Y A; 2RQU A; 2FRY A; 1G2B A; 1I0C A; 4LUE A; 2BZ8 A; 2LMJ A; 2DIL A; 3U23 A; 2AKK A; 1ZX6 A; 3M0Q A; 2L3S A; 4LNP A; 1UFF A; 2HCK A; 2KRM A; 2HSP A; 1NEB A; 4Z89 A; 4OMQ A; 2MIO A; 4M4Z A; 2K7A A; 3M0R A; 2LP5 A; 2DM1 A; 1NM7 A; 4J9C A; 2EQI A; 1B3Q A; 2KRN A; 1WXB A; 4ESR A; 2B86 A; 5GJV B; 2FPF A; 1U5S A; 4QT7 A; 2HEQ A; 2L3P A; 2DVJ A; 2EBP A; 2J6K A; 2LJ0 A; 1K4U S; 4Y92 A; 1GBR A; 4ZNX A; 1TG0 A; 4JZ3 A; 1VYV A; 3EG2 A; 4IIO A; 1T3L A; 3VS4 A; 4OMO A; 1KIK A; 4DEX A; 2KT1 A; 1GFD A; 2PTK A; 2AKL A; 1AWO A; 2J7I A; 2KEA A; 3H0F A; 2K79 A; 3LH5 A; 4J9G A; 2DBM A; 2NWM A; 1J3T A; 2V1Q A; 1ARK A; 2XMF A; 1X6B A; 2A37 A; 2G6F X; 3NHN A; 1XOV A; 1ABQ A; 2YUP A; 1YNZ A; 2SEM A; 2GQI A; 1AEY A; 1B07 A; 2NUZ A; 1WXT A; 2EYZ A; 1W1F A; 1UJY A; 1GRI A; 1SRM A; 2VVK A; 2KXC A; 1OEB A; 4AG1 C; 2CDT A; 4F14 A; 4JJB A; 2FO0 A; 2CT3 A; 2A28 A; 1ZUK A; 2E5K A; 4CC2 A; 1H8K A; 2YUO A; 1GCQ C; 2DX1 A; 1Z9Z A; 2OAW A; 2DL8 A; 2DL3 A; 1VA7 A; 1CKA A; 4RTZ A; 3UA6 A; 2YDL A; 1SEM A; 4KRT A; 4LUD A; 2D0N A; 2DNU A; 1WIE A; 2C0T A; 2RQT A; 1WLP B; 1SHF A; 1FYN A; 1OOT A; 1JO8 A; 3PE0 A; 4K11 A; 3VRZ A; 2CH4 W; 5I22 A; 4RTY A; 3EHQ A; 2F2W A; 1WI7 A; 4LE9 A; 2MCN A; 1M3A A; 1AWW A; 1JQQ A; 2AZV A; 2ECZ A; 2K2M A; 3VS7 A; 2F2V A; 4F16 A; 1VYT A; 3C0C A; 3PVQ A; 2K9G A; 2VKN A; 1OPK A; 2A08 A; 3H0H A; 1UUE A; 2DJQ A; 4D8D A; 1QWE A; 3GBQ A; 2K6D A; 3EG3 A; 2D1X A; 2DL7 A; 5IHK A; 3UAT A; 2GTJ A; 4JPB W; 5EC7 A; 4CC3 A; 4RTU A; 2PNI A; 3VS5 A; 2D8J A; 2ED1 A; 1ZBJ A; 3EG1 A; 3TSZ A; 2ROT A; 1I07 A; 5IHN A; 2CUB A; 2LZ6 B; 4AFU C; 1QKX A; 2DYB A; 2JMC A; 4X1V A; 1AD5 A; 3M0U A; 2JM8 A; 2P4R A; 2DMO A; 1PHT A; 1H92 A; 1E6H A; 2O31 A; 5I11 A; 1UJ0 A; 5IXB A; 4RTT A; 1KFZ A; 4JJD A; 4DEY A; 4CC7 A; 1UG1 A; 2O9V A; 1V1C A; 3O5Z A; 2JS0 A; 3M0T A; 1AOJ A; 1RLP C; 1S1N A; 2O2O A; 2RQW A; 2JMA A; 2JS2 A; 1JEG A; 2JM9 A; 3RNJ A; 2JXB A; 3FJ5 A; 1YN8 A; 1NLP C; 2BZX A; 4ORZ A; 2CSI A; 1NYF A; 2X3W D; 3RBB B; 2F2X A; 2KT8 A; 1W70 A; 1LCK A; 3EHR A; 2AZS A; 3M0P A; 2J05 A; 2OI3 A; 1E7O A; 1UEC A; 4HXJ A; 1WXU A; 3JV3 A; 2RNA A; 1GBQ A; 4GLM A; 4RTX A; 2SRC A; 2K3B A; 3NPF A; 2EGA A; 1SPK A; 4HVV A; 1BU1 A; 2FG0 A; 1ABO A; 1K9A A; 1T0H A; 1N5Z A; 2DA9 A; 2C0O A; 1TUD A; 1WDX A; 2L2P A; 3NGP A; 1X43 A; 4R0K A; 4J9B A; 2FPD A; 4OMM A; 3CQT A; 2YSQ A; 2LQN A; 1WX6 A; 1GCQ A; 2ENM A; 2EKH A; 1SSH A; 2QDL A; 3M0S A; 2YUN A; 2CUD A; 3I5R A; 2CH4 A; 1X2Q A; 4OMN A; 1KJW A; 2FPE A; 1NLO C; 1M30 A; 2D8H A; 3ULR B; 1UGV A; 2JTE A; 1PRM C; 1U06 A; 4RTW A; 3TVT A; 3REB B; 5L23 A; 3VS3 A; 5IHI A; 2KRO A; 2YUQ A; 4IIM A; 1NG2 A; 1FMK A; 3VS2 A; 2H8H A; 2EYY A; 4E6R A; 3QWX X; 3TSW A; 2KYM A; 1X27 A; 4GBQ A; 4F17 A; 2LCS A; 2DRK A; 1NYG A; 2W0Z A; 2MOX A; 2GGR A; 2KRS A; 2J06 A; 4J9I A; 2KR3 A; 4OML A; 1PKT A; 2JT4 A; 2KXD A; 5HCK A; 1K0X A; 1I1J A; 1HJD A; 2HBW A; 4AFS C; 1BBZ A; 3NMZ C; 5IXF A; 1M3B A; 1Y57 A; 1NEG A; 2L0A A; 1PWT A; 1X69 A; 4HCK A; 2RPN A; 1QCF A; 1BK2 A; 3THK A; 2C0I A; 1TUC A; 1YWP A; 2LJ3 A; 1X6G A; 5IH2 A; 4AFQ C; 3H0I A; 5GJW B; 4AG2 C; 5ECA A; 2KGT A; 1JXM A; 3H41 A; 1PNJ A; 4EIK A; 1MV3 A; 1U3O A; 1MUZ A; 1CSK A; 1WA7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1GFC A; 1V76 A; 1OYX A; 4BY6 B; 1W6X A; 2E3H A; 1M1K U; 2GTO A; 3M53 A; 4N4I A; 1VQ5 T; 4O5V A; 4JRI A; 3BDU A; 1NZ9 A; 1YIJ T; 3EGD A; 1AWJ A; 1KC8 R; 1KQS P; 3I9Q A; 4PFP A; 3EGU A; 4CI0 C; 1WFW A; 4PNO A; 3MEV A; 5DLO A; 1VQ8 A; 3L42 A; 1SKU B; 1Y96 B; 2RI2 A; 1RI9 A; 2K5I A; 3J81 E; 3OYA A; 1RLQ C; 1AZE A; 3I56 Q; 3CCS Q; 1PRL C; 4M77 G; 3QWY A; 2VWF A; 1M1K C; 2XIC A; 4M7A D; 1PD1 A; 4OMF B; 4C5E A; 3VRY A; 3KFV A; 3NTK A; 1MMN A; 1HD3 A; 1YWO A; 1R77 A; 1ZA2 B; 2MWO A; 2LNV A; 1G3Y A; 4PJO D; 2LJ1 A; 5KYY A; 3V8J A; 3JCM P; 1B34 B; 2RHU A; 2EVR A; 4M75 C; 5GAM h; 3CC2 A; 4X9C A; 1RUW A; 4HCC A; 3OS1 A; 3OS5 A; 3PMT A; 2FZG B; 3OSV A; 1VQ7 T; 2EQM A; 1NPP A; 5KYX B; 3CPW P; 2DXT A; 4PJM A; 2JW4 A; 3CME A; 1WHH A; 2ED0 A; 2AT1 B; 3RR6 A; 3HP9 A; 2OAU A; 3QUI A; 5C6S A; 1M9S A; 3TRE A; 2X35 A; 2H3E B; 3DB3 A; 1WHK A; 1X2K A; 2FEI A; 4OMP A; 3M58 A; 2L3Q A; 3CC7 A; 2KAF A; 1RAC B; 2XHC A; 3CPW A; 4FCY A; 2GF7 A; 2OTJ A; 1HYO A; 2QA4 A; 2QTX A; 3RDV A; 2VXE A; 2HD0 A; 5GMK l; 2KNB B; 1QVP A; 4F7U B; 3DLM A; 3MO8 A; 4Z8A A; 4Z88 A; 1ZUY A; 4PFO A; 4R56 A; 1X01 A; 1K0S A; 4WCI A; 2OTL T; 2HKQ B; 4J9E A; 3EG9 B; 1UGP B; 2I0N A; 1YHQ T; 2ABL A; 2BZY A; 2FHD A; 4DBR A; 3OW2 P; 1ZHI A; 2J6F A; 4L59 A; 5FRN A; 3R6N A; 1LJO A; 1MV0 B; 1F1B B; 3UWN A; 1HSQ A; 1OPL A; 2XDB A; 3CC4 A; 1I0C A; 2CP2 A; 1TXQ A; 3G4S T; 4M7A G; 4MZP A; 2QAS A; 2LMJ A; 5CO7 A; 1X75 C; 1VQN A; 1IRX A; 4LDW A; 1VQ5 Q; 2L3S A; 4PJO G; 3LYI A; 4DQ2 A; 4LNP A; 1YIJ Q; 2WSE E; 2HNI A; 2XI9 A; 1NEB A; 2O01 E; 2XKO C; 4M7D C; 1TUG B; 1JB0 E; 4M4Z A; 5A2Q E; 3CPW S; 3OW2 A; 3M0R A; 4UC4 A; 2DM1 A; 3QJ6 A; 1NM7 A; 4J5Y A; 2KRN A; 4BAC A; 1RAE B; 2B86 A; 2K3X A; 3CCV A; 5LJ3 d; 5I2S A; 1R0B G; 1K8A R; 2RB6 A; 2NYS A; 2EBP A; 3MCA B; 2P84 A; 3QII A; 4BE1 A; 2NUT A; 1YI2 T; 4F04 B; 4D6W A; 1KIK A; 5CVI A; 2WSC E; 1RAB B; 2DER A; 1GFD A; 5CKH A; 2J7I A; 4C8Q B; 2K3Y A; 3INZ A; 2Z0W A; 1UGS B; 3OYH A; 1YJW T; 3M55 A; 1BIB A; 1BI1 A; 3H9N A; 2PVO B; 1VQ7 Q; 1YJ9 T; 2A3L A; 3RKW A; 3R6O A; 1X6B A; 2ZPH B; 2G6F X; 3NHN A; 1ABQ A; 4IUR A; 2NUZ A; 1WXT A; 1OZ2 A; 3OW2 S; 1OEB A; 3QDR B; 4F14 A; 1ZQ1 A; 4J83 A; 2PVG B; 9ATC B; 4CC2 A; 5GAN 3; 4YTL A; 2YUO A; 4WTO B; 1Z9Z A; 3N5B B; 2DZ9 A; 4A53 A; 1IZ6 A; 2EIF A; 1JBM A; 2K57 A; 1G5V A; 5L8R E; 1WIE A; 5KE2 A; 4EMG A; 1FYN A; 2FZK B; 3PFS A; 3VRZ A; 3SWN C; 4RTY A; 3EHQ A; 5CAI A; 2MCN A; 3HKS A; 1JJ2 P; 2OTL Q; 1WHM A; 3VS7 A; 5HK3 A; 2I2L A; 4F16 A; 3L2Q A; 3PVQ A; 2JTF A; 1YHQ Q; 2DIG A; 2K9G A; 5CKE A; 2XG8 D; 1OPK A; 3HPW A; 3MJX A; 1UUE A; 5CIU A; 1WPY A; 4D8D A; 2K6D A; 2E5Q A; 3SB2 A; 3C95 A; 2GTJ A; 4CC3 A; 4GLK A; 3PTA A; 3EG1 A; 1I07 A; 3OYG A; 2CUB A; 4FW2 A; 5CQY A; 4AFU C; 1AD5 A; 3F70 A; 2QG9 B; 2DMO A; 1PHT A; 3E9F A; 5IXB A; 3MEW A; 4JJD A; 4DEY A; 1VQ9 A; 2O9V A; 4BUG A; 5CKB A; 2JS0 A; 2ZPG B; 4PK4 A; 2MF2 A; 2RQW A; 3QKJ A; 1YI2 Q; 2JM9 A; 5KYU A; 5LJ5 f; 1LVK A; 2BZX A; 4C8Q D; 2CSI A; 3CBO A; 3QBY A; 2X3W D; 4C5G A; 1TOV A; 1ZA1 B; 2BE7 D; 3M0P A; 4C92 C; 4VUB A; 1E7O A; 1UEC A; 2SRC A; 4M78 F; 1YJW Q; 3NPF A; 2EGA A; 1YJ9 Q; 1ZSZ A; 3CXC P; 1ABO A; 4F7U G; 2RJF A; 2DA9 A; 2C0O A; 4JLI A; 3C4S A; 4B9X A; 3JCM h; 1X43 A; 2DK3 A; 2PUK B; 4OB2 B; 4QVZ A; 4J9B A; 3CQT A; 3JRZ A; 1YFN A; 3HFN A; 1WX6 A; 5GAN 4; 5GMK h; 4DOW A; 2CP3 A; 3GPL A; 2X4W A; 2F69 A; 2DXU A; 3JB9 D; 5LL6 S; 4OMN A; 2FPE A; 1NLO C; 4XU2 A; 2ZAE A; 4LD6 A; 3ULR B; 4JJN K; 3X28 B; 1U1S A; 2DFU A; 3TVT A; 4JS4 A; 4M78 A; 1C6V X; 5GAM d; 4ELZ C; 1VQL T; 2YUQ A; 2AHJ B; 1FMK A; 1NG2 A; 3QWX X; 3TSW A; 5IAY A; 3FB9 A; 1VQ6 A; 5CQX A; 4F17 A; 4NOY A; 4DBQ A; 3QYH B; 2W0Z A; 2KR3 A; 2JT4 A; 5HCK A; 2LQ8 A; 1TSF A; 4AFS C; 1BBZ A; 2FVU A; 3QJY A; 3HL8 A; 1VIF A; 1Y57 A; 1VQM A; 5GAO n; 4QVD A; 1XQH A; 3OYN A; 2L0A A; 1PWT A; 1MGQ A; 4C92 D; 4ZTJ A; 2EAY A; 3OQ5 A; 3CCU T; 4C8Q G; 2DTH A; 3THK A; 2C0I A; 4XU3 A; 4IUT A; 2LJ3 A; 3CCR T; 1X6G A; 4AFQ C; 2PVD B; 2KGT A; 3FRN A; 3L2U A; 4XTU A; 3X26 B; 2HZY A; 4XTV A; 3JCM V; 4EIK A; 1MV3 A; 3GLX A; 5CKF A; 4A4F A; 3FJP A; 4RMO A; 5HK0 A; 3GNF B; 1PKS A; 2KE9 A; 3RIR A; 1VQO T; 1YIT T; 3URG A; 3RKX A; 4QQG A; 2AK5 A; 2O4X B; 3I35 A; 4RTV A; 2QQA A; 1QKW A; 1KC8 U; 3PGG A; 4ME7 A; 1N9R A; 2DE0 X; 3BE3 A; 1EFN A; 2RMO A; 3JB9 G; 2GBQ A; 1UE9 A; 3H8Z A; 3I56 A; 5A0L A; 2A7Y A; 3IQL A; 2LNH B; 2V1R A; 1IO6 A; 2EGC A; 2RHI A; 2RF0 A; 3EG0 A; 2LQW A; 2RO0 A; 4C0D C; 2ESW A; 3VJP A; 2FRW A; 1G83 A; 3OYM A; 4J9F A; 3SD4 A; 3C12 A; 1KSW A; 2COZ A; 2DYI A; 3ASK A; 2X51 A; 5GAN 7; 1YCS B; 1LPL A; 3A8L B; 5GAN 8; 2V8K A; 2NUP A; 1EIF A; 1OQK A; 3OYI A; 2QYZ A; 1OZ3 A; 2DTO A; 3MHX A; 4RCC A; 1TS9 A; 1RAF B; 1UTI A; 3ZBD A; 2DBK A; 4J7I A; 4EMK C; 4J9H A; 1IGQ A; 1VQL Q; 2Y4Y A; 1UHF A; 2HKN A; 1D1C A; 3SEM A; 2WAC A; 4JRK A; 4QQ6 A; 1BI3 A; 4N4G A; 2XID A; 3PNW C; 4M7A C; 3HTR A; 1VYU A; 2KY9 A; 5GAN g; 1AHJ B; 2KI7 A; 1D3B B; 4PJO C; 1VQK A; 1MMD A; 1FWZ A; 4A4E A; 4E7I A; 1NPR A; 1VUB A; 3RES A; 1H3H A; 4M78 E; 4AFZ C; 3CCU Q; 1GL5 A; 3S3M A; 3CCR Q; 5GAM g; 1AZG B; 1SRL A; 3M56 A; 1VQ4 A; 3OYK A; 1MNE A; 3SHW A; 4FU6 A; 1W4S A; 5GAN 5; 3JSC A; 2XU8 A; 3E2U A; 3TQ7 P; 4M75 F; 2BZ8 A; 3OB9 A; 1VQ5 A; 3EGD B; 1TH7 A; 1VQO Q; 1ZX6 A; 1YIT Q; 2DD5 A; 3DKM A; 4AT1 B; 3ZEH A; 1C0M A; 2ZPB B; 2HCK A; 2HSP A; 2MIO A; 1EZZ B; 3CMA T; 2LP5 A; 2A0F B; 2K4Y A; 2EYQ A; 2M0O A; 4J9C A; 5IN1 A; 1BI2 A; 1B3Q A; 4HKE A; 1QQJ A; 4BE2 A; 3CCE A; 3VUB A; 1U5S A; 4QT7 A; 2HEQ A; 2LJ0 A; 1K8A U; 4Y92 A; 1GBR A; 4ZNX A; 1VYV A; 3EG2 A; 1DJ7 B; 4PL6 A; 5KYY B; 5J39 A; 1Q81 R; 1G8X A; 4M75 A; 5GAN 6; 1KQ1 A; 4BY6 C; 2C06 A; 2EJF A; 3QXE B; 2KEA A; 2LQK A; 3H0F A; 2L8D A; 4Z02 A; 5GAO p; 1VQ8 T; 2NWM A; 3MET A; 1OX8 A; 5LJ3 e; 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