5J3RA

Crystal structure of yeast monothiol glutaredoxin grx6 in complex with a glutathione-coordinated [2fe-2s] cluster
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
AFNVQKEYSLILDLSPIIIFSKSTCSYSKGMKELLENEYQFIPNYYIIELDKHGHGEELQEYIKLVTGRGTVPNLLVNGVSRGGNEEIKKLHTQGKLLESLQVWSDGKFSVEQR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of yeast monothiol glutaredoxin Grx6 in complex with a glutathione-coordinated [2Fe-2S] cluster
pubmed doi rcsb
molecule keywords Monothiol glutaredoxin-6
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces cerevisiae s288c
total genus 39
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5j3rA00
4JBBA 4TR4A 1YZXA 3H8QA 3L9UA 2RIIA 4PQ1A 5FT3A 1IYIA 3G7JA 3ZRDA 3IK9A 4NHWA 1X9WB 2FY6A 1U3AA 1SL1B 1Y25A 4DSQA 1JZDA 3IC4A 4EF0A 3W6GA 1THOA 3CRTA 3KCMA 2X8GA 2DIYA 5D9TA 4KCAA 1XBSA 5AIXA 2LRCA 3EWLA 1GP1A 3P8WA 2L4CA 4XCSA 2H74A 2FLSA 3HVSA 4HOJA 2ALBA 1ABAA 3F3QA 3C8EA 3BBYA 4IP6A 2E2MA 4PGTA 2JZSA 2XPEA 5G31A 4DEJA 1S3DA 1A0FA 4AJ7A 1F3AA 2YWIA 2C0DA 4HQZA 4ZBDA 2H72A 3GRXA 3QPMA 5JWOB 4LMVA 1Q4JA 4MK3A 3GX8A 4TKYA 1GULA 1NW2A 4ECBA 3EVIA 4I8BA 1GNEA 5CRDA 5IMAA 5DCHA 1A24A 2HI7A 4IS0A 5EPFA 1TRVA 3O76A 1EP8A 1PL1A 3LXZA 3CMIA 2FWHA 2NBSA 1GUKA 1TI3A 2VO4A 1SKWB 1X5CA 2C8UA 1SD9A 4ML1A 3EURA 2IIYA 5HR1A 2GZZA 4AJ6A 3Q6OA 5KN3A 2IMEA 3F63A 4KGIA 3PH9A 3IAM2 1XWBA 3FEUA 2OE3A 2PERA 1YF1A 5LNKe 1TOFA 1J08A 2WRTA 2V1MA 1UVZA 5CYYA 3LYKA 5A4UA 2IN3A 3HD5A 2WFCA 1V58A 4WETA 4KX4A 2RUFA 1HD2A 2YZUA 1AQWA 2VCZA 1PGTA 2KLXA 4BA7A 1TKDB 1J0FA 4MF7A 1OC8A 2OBKA 3APQA 3MNGA 5G5FA 4TR3A 4ZL9A 1MEKA 3IA1A 1EWXA 1ML6A 3ZFLA 1TJDA 2H0HA 4WBJA 1EGRA 4WXTA 1T00A 2JU5A 5HFIA 3WD6A 3D5JA 1T3BA 1QK8A 4K7IA 2TRCP 4V2LA 3WGXA 4EUYA 4PQIA 6GSSA 4HDEA 4GQCA 5IMFA 4GQFA 2H19A 1YJ6A 1TK5B 4XTSA 4TR0A 1T4ZA 3TJBA 4ZXGA 1PMTA 3K8NA 2OE0A 3BJ5A 4MZWA 1VF2A 2OBIA 1K0CA 1MDKA 1X9MB 2L59A 2LEGA 4K6XA 2LV3A 4PNGA 4POLA 4GRFA 2KP2A 7GSSA 3E0UA 4NAXA 2H1DA 2HZFA 1O6JA 3ZLPA 2AHEA 2LKUA 3HKRA 4F03A 1GLPA 3KZQA 4ILFA 1K0OA 2L57A 5B6NA 2HNLA 4O32A 4YQUA 2L6DA 2KP1A 4KW6A 4MPGA 1YEXA 1B4PA 3L9VA 5A4VA 11GSA 2X8HA 2GQLA 4HJMA 3KJYA 1FAAA 3LQ7A 5ABRA 5H5RA 3Q18A 3UBKA 5GSSA 5ECHB 2B6MA 4EDZA 1XOAA 3KP9A 2XPDA 4ZIJA 3LWAA 2VM1A 3L4NA 3JCML 2MZCA 4TR1B 9GSSA 4K8MA 1EGOA 3GTUA 1TRUA 2VD1A 3W8SA 1BQ7A 3TUEA 4G9HA 1FO5A 1X5DA 5ECRB 4HZ2A 3BOAA 1LBKA 2VCTA 2PWJA 5J5NA 1FHEA 2YJHA 5C04A 3KH7A 2BJXA 4JRRA 6GSXA 2DMMA 1ZYQB 10GSA 3IE3A 3NOFA 18GSA 4RQXA 1GTBA 3NIVA 2L5OA 1A2LA 5KN0A 1MTCA 1KBNA 4OFNA 3TKPA 1TK8B 4D73B 1PX6A 2HRFA 5DQSA 3UOMA 3FKFA 3D21A 16GSA 4EL1A 3TKSE 1SJIA 1R26A 2GSSA 2B7KA 2ON7A 1Z6MA 3A3TA 4CHSA 3L9SA 2H73A 2B1KA 3GKKA 4LL4B 4N0ZA 4DSSA 1WIKA 1ZMAA 4RQRA 1HNBA 1FB6A 4GSTA 3VWVA 1OVNA 5HFKA 3QR6A 3KD0A 4KB3A 2A4VA 1TU7A 1AXDA 3UVTA 5FWGA 3A2VA 1GSQA 4E8HA 1O8XA 2QSIA 2ZNMA 3DMLA 3RPPA 3TKSA 1N2AA 1XXUA 1ERVA 4K7NA 2VAFA 2PUKC 3QOUA 2CZ2A 2O87A 4IELA 3HVVA 4KSOA 1YEPA 5F05A 5DDLA 3V1WA 4JR6A 2VCXA 1SK0A 6GSTA 1WMJA 5DAKA 4ZB6A 4WF5A 3GKNA 2I9HA 3N9JA 2GS3A 1QXHA 3FRCA 2KHPA 3US3A 3D22A 3VURA 2ON5A 4I5QA 5DQYA 3PR8A 2VLUA 2YP6A 2LJKA 1YY7A 1S3CA 1A0RP 1BEDA 2L5LA 4TXOB 4HI7A 2F8FA 2X8CA 3MDKA 4WF4A 1VRSD 1ACVA 4KSMA 5IOXA 3UJ1A 3TOTA 2EIQA 1Z7RA 2LQQA 1KNGA 2VD0A 3F6FA 3LFLA 2C3TA 5G1LA 3QAWA 2I81A 3MWHA 1OC9B 1PX7A 3TRPA 5B8BA 1SKSB 1BYEA 1YDKA 1LJRA 2AAWA 1VF4A 3ZMLA 2MBSA 4TOPA 1N8JA 3I6AA 3ERFA 4V2MA 2LJAA 5AGYA 3DD3A 1QMVA 2V6KA 5KN2A 2IMDA 5G1KA 2WGRA 1SL2B 5E4WA 1URMA 4DVCA 3P90A 2NVLA 4PX1A 2YWOA 2CVDA 4QL7A 4MZBA 2LNSA 4I6XA 1TK0B 4HU9A 3QAGA 1JFUA 2V32A 4CW9A 5ECIB 1SL0B 4NV2A 1WP0A 3CSHA 3IAS2 2IFQA 1G0TA 4FIWA 2F51A 3ZREA 1ILOA 2R5GA 4ZB9A 5IO0A 2TIRA 1A2MA 4V1Ag 3KH9A 3WGEA 2HYXA 2GT5A 2B5YA 4GWRA 1HQOA 3FR6A 5L71A 4OWYA 1O7UA 4J56E 2NDOA 13GSA 4EVMA 3ZMKA 1CQHA 4L0WA 2L6CA 1Z9HA 4Z7XA 5IQYA 5IIZA 1FW1A 3TJGA 2IL3A 2VIMA 4L5OA 1NSWA 4J57E 1GL8A 2F3MA 3F4RA 4F9ZA 1Z3EA 2H75A 3RPNA 3D4MA 3GH6A 1Y6EA 4HUAA 1XWKA 3ZZXA 3H4KA 2FCHA 3O6TA 4ID0A 3TGZA 3DXBA 2CAIA 4KCEA 1O81A 4PQHA 3HVXA 1EZKA 1O85A 4XHMA 1V40A 1TRWA 3AY8A 12GSA 3DKSA 1U3IA 4YQVA 4MJAA 2R2JA 5J9CA 3TOUA 2YJ7A 3D4TA 1DE2A 3CTFA 2VL3A 1JZRA 2YZHA 2EIRA 3GA4A 1YKAA 4WBRD 1VF1A 1IYHA 3F6DA 5HR0A 3EMXA 3EYTA 4Q5FA 4ZBAA 2HZEA 4ZL8A 5CREA 4ZB8A 1NM3A 1U87A 2JL4A 4I2TA 1XWCA 3HZ4A 1GSDA 1FG4A 2H30A 1ZOFA 1NHOA 1DBYA 1ON4A 2YV7A 3CSJA 1ST9A 2H0GA 4NWYA 4ECCA 2K6VA 2VL2C 4O5RA 2PPTA 4PNFA 1PQNA 3WGDA 4F82A 3RBTA 3RHBA 1ZL9A 4LLRA 5JWQB 3IR4A 4PURA 3QDNA 2OA7A 3ISOA 4L0UA 3FR3A 4POMA 2H8LA 3GURA 2E7PA 3D6IA 1RW1A 1Z5YE 4OCFA 4PXOA 1AUCA 3SWLA 1B48A 4ZL7A 4WEYA 4XS1A 1WOUA 5G2ZA 1SJ6A 4GCIA 3APSA 4BVXA 3FW2A 2WULA 1YF0A 3CTGA 2HT9A 3GV1A 5HFGA 3M9JA 2DMLA 2WJUA 4JEDA 1R4WA 2LJRA 3A5WA 2VOCA 3GNJA 1OE7A 1XW9A 5KN1A 3ZL5A 3HJMA 2G0FA 3E9JB 3C71A 3Q19A 2WS2A 1T1VA 2GGTA 4IW9A 1K0NA 5F0GA 1Q98A 4MJBA 3ME7A 1QQ2A 4H86A 1M2DA 3GTUB 2B5XA 2GVPA 2JSYA 4IN0A 4XRDA 1KEBA 2GSQA 2H01A 5ECPB 2GSTA 5KEJA 5ID2B 2H70A 2FD3A 3DYRA 5F07A 1GSFA 2P5QA 5DCGA 4F0BA 3WT2A 1MD3A 4X1UA 5B7CA 5J4UA 2YN1A 1E2YA 3EMPA 3U5RE 2CZ3A 4AF2A 2VCVA 2OJLA 1XWAA 2DBCA 5DALB 2V41A 4TVEA 5FHIA 1ZCPA 3L78A 4YAVA 5ELAA 4EKZA 4G10A 2F8AA 5IOWA 1UC7A 2KUCA 5D9VA 4OFMA 2C1YA 4TW5A 1X9SB 3P7XA 3QAVA 4WR5A 3APOA 3LYPA 2RM6A 3M3MA 2DSAA 2R37A 2V6OA 3TCOA 2R6KA 3TJKA 4HS1A 2JZRA 5DBQA 2H76A 1JLVA 1ZYEA 1CQGA 2GQMA 5J3RA 3GSTA 3ZIVA 4PUAA 5ECMB 1V9WA 3L0HA 2JACA 2FWEA 3TDGA 1SKRB 2AB6A 1F3BA 1XIYA 1AIUA 2RM5A 2QGVA 5D9WA 5EVOA 3UAPA 2B5EA 3SBCA 1VF3A 3P2AA 4TR1A 4N10A 2FA8A 2A2RA 5GAND 1G6YA 2VCQA 2OADA 1PKZA 1GSUA 1GWCA 2F9SA 2OACA 4ULXA 1XZOA 4MF5A 5DVBA 4F0CA 4JE1A 2CX4A 3GUSA 2NPBA 4YAPA 2B7JA 2IPAA 5CO3A 3FZ5A 4BWSA 1C72A 5LD0A 2FWGA 1GUMA 1K0AA 2GQKA 1EV4A 5CRGA 2AYTA 3HJOA 2C4JA 2LTKA 3CYNA 4MCUA 4IKHA 5DAKB 3LGCA 5A4WA 4GLTA 5AISA 4MJCA 2IMKA 3IOSA 3DVWA 4EXJA 2C0FA 4HJ2A 4HEA2 2B1LA 1SYRA 1OE8A 4OCEA 2J9HA 1F37A 3GL3A 4ACSA 4QL9A 2WCIA 3F9UA 2HXKA 2VLVA 4G2EA 3HA9A 5AIVA 1V2AA 4IJIA 1TW9A 2Z9SA 2L4QA 1JLWA 3I43A 5CP1A 1K3YA 1BX9A 1K0BA 2YWMA 3LORA 1G7OA 1EP7A 1B9YC 4NPBA 3C1RA 2C80A 1U88A 1XVQA 2H1GA 2DIZA 1AQVA 1OKTA 1WRYA 2K8VA 3LSZA 2K9FA 5JCGA 4NV5A 1WWJA 5H5QA 1W89A 3GSSA 2EIOA 2XBIA 3G7YA 1I5GA 4O7HA 3UL3A 1QGVA 3IDVA 1YQ1A 3VWWA 3VWXA 4RI7A 2VL9A 4GTUA 1BG5A 2HFDA 3VI7A 19GSA 2O89A 3C7MA 4LMWA 2FHEA 2PVOC 3KTLA 3IV4A 1TDIA 1OYJA 4I97A 1XPVA 3GMFA 3S9FA 3FR9A 4N11A 2RLIA 3KXOA 5IPHA 5GZZB 1E6BA 4XRAA 1XW6A 3CSIA 5IMDA 2AJQB 3BCKA 14GSA 2RUEA 1A8LA 2PVQA 5ECOB 2O7KA 4X43A 3UVHA 1V57A 1GTUA 2LQOA 2HLSA 5B6MA 2IMIA 4FYCA 2DJKA 4MJEA 3ZVJA 4EDYA 3GYKA 2PGTA 3TJJA 1HNAA 4TRXA 2GZPA 4OD7A 4MABA 2YWNA 4L5LA 3UBLA 4TN8A 2R3XA 2LUSA 1EEMA 4MA9A 1K3OA 4TXOA 4E8EA 3FK8A 4YQMA 4ZBBA 1TU8A 1K0DA 3DGQA 2P0GA 4IJ3A 2YANA 2VUPA 2X99A 4CDOA 2REMA 5EY6A 1R5PA 1K0MA 3M0FA 1AW9A 1HYUA 1KTEA 1UA5A 5F8BA 2V2GA 2LNTA 2LRTA 2H66A 5DJMA 2WDUA 4P3YB 3HHVA 4POBA 4NMUA 4XS4A 2FNOA 3IPZA 1S3AA 3LG6A 1H75A 4YH2A 1OC9A 3DVXA 1WE0A 2JADA 3PINA 3F4SA 4IBPA 4EO3A 1T8EB 4BL7A 2H6XA 4N30A 1OAZA 4KDYA 1F6MC 3CXGA 4K0GA 2CVBA 3C1SA 3GFKA 3ZYWA 1GLQA 1RK4A 1TRSA 1HNCA 1WPIA 2O8VB 5EL8A 1J9BA 2C0EA 2A2SA 1XOBA 2DC5A 2D2ZA 1NHYA 4OMVA 4POKA 1T7PB 4MF6A 5D96A 4LL1B 5ECKB 1TI1A 2JZTA 2YOIA 1F2EA 3G7IA 2H71A 4RUVA 4MLYA 5IM9A 5ECNB 2XC2A 1PD21 2H0IA 1I9DA 4AJ8A 4V1Ap 2HZEB 1ZGNA 3FHKA 4KDXA 1GTIA 4MH3A 2N5BA 3OR5A 3UMAA 1FVKA 4MMMA 3CBUA 1M2AA 3QD9A 2I1UA 2K8SA 5IPGA 3KTBA 4BPYA 4GF0A 5F06A 1GRXA 1SYXA 3A2WA 4XIHA 4GXZA 3WYWA 2MMAA 3DRNA 3RHCA 3MAKA 3FZ9A 1AQXA 1YKCA 1ZZYA 4K7OA 5HQPA 3IHQA 1O73A 3GN3A 1XFLA 3ZITA 8GSSA 2YCDA 5DJLA 3M8NA 4GSNA 3VFIA 3GHAA 2I4AA 3ERWA 4OFTA 3M9KA 2YPMA 1MDJA 2YV9A 5CNWA 1M2BA 2YNXA 3BD2A 3HJPA 3WT1A 3CRUA 4MP4A 1GNWA 4RI6A 3EU3A 4AGSA 3LJRA 1XW5A 3HDCA 3U6VA 2K18A 2VL2A 4N0VA 5IMCA 2XBQA 1DSBA 4ECJA 2PN8A 2AUVA 2MMOA 3C73A 6GSUA 1Z6NA 4WKWA 1BJXA 1U6TA 5ELGA 2HRNA 2FUG2 1MD4A 4HZ4A 2R4VA 3EE2A 1JZWA 3UIWA 5HR3A 2HSYA 2PBJA 5GAPD 3F4TA 1BAYA 4IQAA 3UEMA 4I2UA 1FVJA 3IBHA 2LRNA 2ZUPA 5INYA 3F0IA 2AV4A 2GSRA 2DJ0A 3A2XA 3MSZA 3UARA 3TKQA 1GH2A 2P31A 5B8AA 3HXSA 5JCUA 2CA8A 3NZNA 4G19A 5ECQB 2OKAA 1GSEA 1EOGA 2B3SA 1AAZA 2CAQA 1PKWA 3FY7A 5D8IA 3VLNA 1FOVA 3TJFA 1B4QA 2CV4A 3FZ4A 1THXA 1A23A 4K9ZA 2VM2A 3ZTLA 22GSA 4JZQA 5LCZA 1OKDA 4HQSA 1GSSA 1OC3A 1M9AA 2EC4A 3TRQA 1PL2A 1M7TA 1WJKA 4IHUA 4XS6A 4ISDA 3IK7A 4ML6A 1RQMA 1PSQA 5ECLB 1XCCA 6GSVA 3QCPA 5IMVA 1QUWA 3ZFBA 2DJ3A 1ERWA 5IO2A 2E2GA 3BCIA 3W8JA 5ECSA 1GSYA 4WR4A 3ED3A 4PUFC 2C0GA 4KH7A 4JR4A 2QKEA 3N5OA 1LU4A 2CT6A 2QC7A 2MMNA 5IMZA 3DWVA 1TTZA 1XWGA 3GIXA 2H1BA 2ZCTA 2GDRA 2VCWA 4L8EA 4OO4A 1EV9A 2J23A 4KUNA 3VK9A 1XVWA 4KAEA 1SU9A 4ECIA 4ZILA 5D73A 2M46A 1JHBA 4K1FA 4FYBA 2GTUA 5J9BA 2LS5A 5CRWA 2MMZA 3EU4A 1EOHA 5ID2A 4MPFA 2HE3A 3F3RA 5JCWA 1SENA 2GZYA 4JU5A 3HZ8A 4KNDA 2M80A 1EEJA 4DSSB 1M99A 3VPQA 3IRAA 1DE1A 1FB0A 1A8YA 1AC1A 5DALA 2N5FA 5JWRB 3F8UA 2BMXA 1R7HA 4IQ1A 3DEXA 1PN9A 1X5EA 2M72A 2KOKA 5G30A 1VGLA 2H6ZA 3J7Yb 5CAXA 2GT6A 5D93A 3ZVJD 1DUGA 3RDWA 1V98A 1B8XA 3VWUA 2JSZA 4TXVA 3ZIJA 2WB9A 3H93A 1USBA 3DIEA 3TKRA 4BVYA 4O92A 3HYPA 4HU7A 3LEFA 3GL5A 4IP1A 4X0XA 4FO5A 5E59A 1H4OA 2C3QA 3IXRA 1W4VA 4Q5RA 5H5SA 2MBTA 4KE3A 3GX0A 4KDUA 3LXTA 1T4YA 3KEBA 4MH2A 3G9BA 5HR2A 1M9BA 1SK2A 1B9XC 4FYUA 3QFBC 4D73A 1ERUA 3O3TA 2TRXA 4LA1A 2IMFA 5C00A 3RAZA 3TKSC 1TXXA 3I69A 2H1AA 2X64A 4OO5A 2DJJA 4BWQA 2LSTA 2DLXA 2ES7A 2GLRA 1TP9A 1GTAA 3GH9A 2P5RA 2G2QA 3E3EA 1QFNA 3ME8A 2O85A 3GKXA 3TB2A 4EE0A 6GSWA 2BTOT 1JZOA 20GSA 1MDIA 1GUHA 4F2IA 1O8WA 4QQ7A 3FYGA 3J7Yk 1R5AA 2C3NA 3FZAA 2FGXA 1M0UA 2I3YA 2H6YA 5G5EA 1PA3A 3HCZA 3HY2A 2OE1A 1Z7PA 3KP8A 2FWFA 5GSTA 4KA0A 4GSSA 5COHA 4Q5NA 3VI5A 4FH8A 3PGTA 4NXIA 3H1NA 2VLTA 4J2FA 4XS4B 1SD8A 2FA4A 4K2DA 3TRXA 2IFQB 1SJZA 3EINA 2CX3A 2DJ2A 4IVFA 5J41A 3Q74A 3KIJA 1K3LA 4V2NA 2WZ9A 2E0QA 1X0RA 3R2QA 4DSRA 1ERTA 2IJYA 3KM6A 4EC0A 5A5KA 17GSA 3VPTA 5ENUA 2PU9C 1F9MA 3QFAC 2IWTA 5AN1A 3ERGA 1G7EA 3M1GA 4Q5QA 2DJ1A 2XHFA 3EC3A 5D9XA 3KMNA 2CVKA 6GSYA 1G6WA 4MDCA 5CRHA 2N5AA 3KMOA 4MZCA 1UN2A 1SK1A 1PRXA 3H79A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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