5J5RA

M. thermoresistible guab2 delta-cbs in complex with inhibitor vcc234718
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
356
structure length
332
Chain Sequence
PVPTGGDDPTKIAMLGLTFDDVLLLPAASDVLPANADTSSQLTKKIRLKVPLVSSAMDTVTEARMAIAMARAGGMGVLHRNLPVAEQAAQVETVKRSGGLLVGAAVGVGDDAWERAMALRDAGVDVLVVDTAHAHNRKVLDMVHRLKTTVGDEIEVVGGNVATRAAAAALVEAGADAVKVGVGPGSICTTRVVAGVGAPQITAILEAVAACAPHGVPVIADGGLQYSGDIAKALAAGASTAMLGSLLAGTAESPGELILVNGKQFKSYRGMGSLGAMQVPEGIEGRVPFRGPLSTVIHQLVGGLRAAMGYTGSATIEELQQAQFVQITAAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Inosine Monophosphate Dehydrogenase, GuaB2, Is a Vulnerable New Bactericidal Drug Target for Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase,Inosine-5'-monophosph
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium thermoresistibile atcc 19527
total genus 107
structure length 332
sequence length 356
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2016-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5j5rA00
4PC8A 4DO5A 1G7UA 3HPZA 2Z6IA 3NZRA 1IXPA 5EYWA 3STGA 1O5XA 2Y7GA 5D32A 3SZ8A 4CQ9A 3WK2A 4JTGA 1YDNA 3PWAA 3F1QA 2EF9A 4LRTA 2ZCGA 3NQCA 4JDBA 4CLMA 3M44A 4UTWA 4LU0A 3ANYA 2H90A 4QAIA 3CIWA 2NUXA 3NQ8A 1DQXA 3C61A 1OFBA 3A23A 1ADOA 2JKAA 4BFAA 3W88A 1A50A 3GAKA 3H54A 3T4CA 1SFLA 5DY2A 2EAWA 5TBOA 5I3KA 1TJPA 2VELA 3W2KA 1QPQA 3LLDA 2EPHA 4X22A 4L4LA 4UTUA 4IWWA 1X8FA 1FDJA 3LB0A 4MYAA 3EX1A 3NPWA 4N6EA 1PE1A 3B04A 1FXPA 2C0AA 2TYSA 4O12A 5T26A 1T0OA 1H51A 3U6WA 1QFEA 1GVFA 2A0NA 4XZ9A 2P0OA 3GK0A 3ZR4A 4LOCA 4IPJA 1SFJA 3DI0A 2ZZ7A 4LT9A 4NX0A 3W86A 1B9BA 3H53A 3PVFA 4IX0A 4ZMGA 3GDRA 1O95A 3C0JA 2GJLA 3M1ZA 4BI7A 1OX6A 1TTIA 4O1CA 4RZ5A 4O14A 4GUGA 1UUMA 3W71A 1UCWA 2PURA 2X1SA 2PRMA 2GJNA 4MPQA 2ZZ3A 3ABQA 3LX9A 3MBDA 4AF0B 2WQPA 1I2OA 1I45A 4GRSA 3VE7A 3W85A 5ABTA 3QFEA 4P2VA 1Q6OA 5D2VA 4A3UA 1R46A 2ZQ0A 4XKYB 1IXNA 1A5SA 1OF6A 4JTUA 3N9RA 1N7KA 2A85A 3IVTA 4FXRA 3C2RA 5AHLA 1C9DA 1TQXA 4I7VA 4J9JA 2FJKA 3WJWA 2WV8A 3CM4A 3KFTA 3G0XA 2R94A 1TTQA 4JYEA 3UXDA 1LM1A 1X1OA 3UWQA 4JYFA 4FX7A 4ZQPA 3CQ0A 5LHEA 3IIZA 2P10A 5D38A 8TIMA 3PG9A 1YTDA 4Z1AA 1F6KA 4ZVJA 1K8XA 3NQFA 4ZQNA 1SQ7A 5D30A 4MVAA 4MLJA 4CCDA 4ZL1A 4YCPA 5HR6A 2JK2A 4WJEA 1DBTA 5G5IA 1GG1A 1VRDA 3P84A 3U2OA 4OBTA 2H3BA 4RZ4A 3BK0A 3C2VA 1G4SA 1LLWA 5CSRA 4JIPA 1VH7A 1DORA 1J2WA 2QCEA 2E77A 4N6FA 3W7QA 4ICNA 1SO4A 4JY9A 4IX2A 2Y89A 4Z1BA 3TC7A 3BVJA 1Q6RA 1R2SA 1Y0EA 1WOBA 2R8WA 4NU7A 2DU2A 2Y7FA 3HG2A 4IMDA 4O1DA 5IM51 3MI2A 3NM3A 3STEA 1BWKA 5TIMA 5FF2A 5FI8A 1VLWA 5BRBA 3GX9A 2ZTJA 4WZHA 3LBMA 4XKYA 1P5BA 5D05A 1WYIA 2FLIA 2QDGA 4O13A 3Q37A 4LVDA 3GNNA 3PBYA 5F4WA 3W1MA 2Y70A 3E02A 1IXOA 5F4SA 2Q3OA 1LP6A 1LYXA 4NNBA 3W7RA 3H55A 3NQDA 4RX0A 3FYPA 4JTJA 1EUNA 1ICPA 1H7RA 4CNOA 4ML9A 4UTIA 3W23A 2B7NA 4K6AA 2EGZA 1KW1A 4C1LA 3AO0A 4QM1A 3NA8A 3P74A 4KFOA 4GFSA 3LCGA 1TPVA 1GG0A 3W1AA 4FNRA 2E6YA 2UV8G 4TMCA 3TJXA 1LBFA 3NPVA 2IQTA 2GPTA 3OEXA 4FNQA 1G69A 1KFEA 3B8DA 3NO5A 3DI1A 3NGJA 3T55A 4UFHA 4XQ6A 3O63A 3TQKA 2JKPA 1RQHA 1MXSA 4N9BA 1RQEA 4L4MA 4UR8A 2PCQA 4A2SA 5G4EA 2DZPA 3MHFA 1W5MA 2RDUA 3A24A 5F2LA 3DHFA 3KRUA 5K4XA 3CLMA 1GEQA 2V2DA 2FB3A 3O1NA 1W1ZA 4DELA 3TNOA 5C6MA 3DBPA 2J27A 3HGRA 1XBYA 5HQEA 2J9XA 1LCOA 4HNTA 3NEVA 3HGSA 2NX3A 2QCDB 3IVUA 3QEZA 1ZALA 3W2MA 1JRBA 1JUEA 2DORA 1LROA 3EKLA 1H7OA 2Y85A 4KFPA 2ISSA 4OGZA 3EWXA 1OABA 3M47A 3YPIA 1OK6A 2A2IA 4Q32A 5KZEA 1U5JA 3TK7A 2B4GA 4UR7A 5AC7A 3L67A 2DZSA 3PUEA 2V2HA 2FIQA 3N9SA 2WO5A 3DENA 1FY6A 3L0KA 3S5NA 4OWGA 2CLLA 3Q58A 1VCGA 3HQ1A 2DZWA 1TJRA 5LSMA 1OG0A 2QUVA 5G2IA 3W74A 4M6PA 3FFSA 3MP3A 3WK3A 1THFD 6TIMA 2C18A 2Z0IA 3M5VA 4TMBA 3F4NA 3JS3A 3T78A 4S2BA 3GZ3A 3GXNA 3W6YA 2FTPA 2YFOA 3DFPA 4LS0A 5LNWA 4EWND 2GUUA 3FKRA 2ZZ6A 5FEZA 4JIQA 4LUJA 1N8FA 4NNAA 3BLEA 3I7QA 4HNNA 3QF0A 5K9XA 1A5CA 3W70A 2WNZA 3QPYA 2NLIA 1QPRA 4JTHA 4OT7A 1LOSA 4AMAA 1JUBA 3TMQA 3BARA 2QCDA 3FJ6A 1H63A 2QR6A 4YCOA 3VFLA 5D2WA 1U83A 3NG3A 4N4QA 3WJZA 3SIZA 2VFFA 3HIJA 3UNDA 2RDTA 3WK0A 4ZQMA 5FF3A 1NFBA 1A5AA 3ZFHA 4UC5A 1FWWA 3R89A 1SSDA 1KM3A 4X2RA 2F7FA 4AH7A 1JUKA 3VI2A 3OBKA 3JRKA 5L6UA 1VCVA 4YLWA 3HG4A 2CLMA 3DAQA 4UTTA 5HUOA 4BK9A 2HMCA 1KTBA 2Y7DA 3P82A 3DKLA 3HOJA 1UJPA 1XDLA 3C52A 1HO1A 5EBUA 5G1YA 1XBXA 1SZNA 1VC4A 1WQ5A 3W2NA 3KVJA 4IMCA 2WNNA 3EXSA 2Y88A 5FESA 1GPWA 4GWEA 1LZOA 1JULA 3EX3A 5AYZA 2YX0A 4HN4A 3MMTA 3S42A 3V1PA 4WX2A 4O50A 4IXHA 1B3OA 1ZHAA 1JCMP 4O53A 3R5EA 4LTSA 3PS7A 4MY1A 3DU0A 2BZNA 3TC6A 5D04C 1KBIA 4QITA 4CNNA 2E6FA 2G96A 3QYQA 2GQ9A 4PFMA 4BWLA 2ZA2A 2GQ8A 5AN7A 1WOAA 4E38A 3B06A 3UWVA 3S8HA 3RU6A 1RVGA 3FKKA 3G24A 1TO3A 4YL2A 4RXFA 3TW7A 3W2LA 5CG7A 3TAOA 3NYZA 3LCFA 1ICSA 3FYOA 5E93A 2Y62A 4UTMA 4OQVA 2QDHA 4MUZA 4FIRA 2RFGA 2QF7A 4GE8A 4XBSA 4JS3A 1W5OA 3N2MA 1EP2A 4FIQA 4UMCA 3W1LA 1KFKA 1LOQA 4QNWA 4Y6GA 3NAVA 1OK4A 5AHIA 3UXAA 3HJZA 1OX5A 3KX6A 4AVFA 1TPUA 2OT1A 3O6YX 1KM6A 3P81A 5HWMA 4O1AA 1N55A 5DXYA 3PSVA 2A7PA 2X16A 2H8ZA 3STFA 2HSAA 1ZY9A 2HTMA 2H8XA 3R13A 3TE9A 3KAOA 4O0KA 5HUPA 2WOQA 1FXQA 4JTLA 3LHUA 4RZ6A 3BG3A 5C54A 3C6CA 2YYUA 5DN1A 4WY0F 2B0MA 4M19A 1OF8A 1QO5A 3S6DA 1NF0A 1WX0A 3OA3A 3IGSA 3GR8A 2A6NA 4DBEA 1IXQA 1GWJA 1H60A 1OFQA 1I2NA 1NF7A 2OT0A 1KTNA 4UUIA 4MFEA 4NXKA 3M5XA 3MI3A 4K7YA 2FPVA 3E12A 2WJZA 1SW7A 5TQLA 3FA5A 2E5DA 1MSSA 4A2RA 4MLRA 4PL1A 3LBCA 4OU1A 2TSYA 5FEWA 3C2FA 3LI1A 3OVPA 3SFKA 1J5TA 2RH9A 3MW7A 2QCHA 1RPXA 4JTKA 1PVNA 1AK5A 5FF7A 2CLOA 4FX6M 4MY9A 5IBXA 2ZDRA 5EMUA 3O07A 2YDAA 1W3IA 2DP3A 4QISA 3KRZA 4Y90A 3RK8A 1AL8A 3C2EA 3IIOA 1S5WA 4LY8A 4E0CA 1DQWA 3NNTA 4ADTA 2CLEA 1TYGA 1JCLA 3BG9A 3PM6A 1PCKA 3B0PA 3PBWA 3QQ1A 1KM4A 1YXYA 3N14A 4W9TA 4CCEA 2C6QA 3MYPA 6ALDA 3HO8A 3SW6A 1F5ZA 1PHWA 1LRQA 4N2YA 4RJEA 3DFTA 2VFIA 2QAFA 2Y7EA 1TIMA 4RLIA 1UUOA 4HIBA 3W1QA 2ZYFA 4HPJA 4FEZA 1GZGA 1KM5A 4BI6A 3W7NA 3RLUA 2O7SA 3IGUA 2E68A 4O10A 3MI6A 4K38A 1L2UA 3P61A 1K8YA 1FCVA 1A5BA 3PSWA 3W2UA 4NUWA 4AB4A 5GVJA 2NV1A 1GOXA 5K7JA 4QJ1A 1RD5A 4LWWA 3O6CA 1YDVA 3O6DA 5I3HA 5LNSA 5DBUA 3EX2A 3R2GA 3S5YA 2ZRWA 3N2XA 4MIMA 4HSOA 2YFNA 1DOSA 2CLIA 4UCGA 5C5YA 3SECA 1QOQA 1GJPA 4UFLA 5LNUA 3P5YA 3O06A 3I7SA 3L9CA 3PBVA 2VC6A 5DXXA 5G2HA 2CLKA 2VEKA 5HR7A 3MJYA 3LTYA 2C15A 3EWWA 1K7FA 1SZEA 2F84A 1DJQA 4O4VA 3LXAA 1RR2A 4EIVA 1PV8A 4NX5A 3R8RA 3G1DA 2H3DA 1TPDA 5D33A 3PB2A 2V81A 2EKCA 3ZWTA 1NSJA 2OMAA 3B0VC 2XN0A 4LS1A 3HG5A 4Y8FA 3KVKA 4Z1DA 4GUHA 1FWNA 4AXKA 1LTDA 3W87A 5E0KA 1VPXA 3LGEA 1P4CA 5EA9A 3OVQA 1TV5A 5I3IA 2QCFA 2A7RA 2CZFA 4FNSA 3Q2DA 1VQTA 3LV5A 3NOEA 4KFNA 1TB3A 4O8RA 2GQAA 1IIGA 3GDLA 1QCWA 2G97A 4WD0A 5KZDA 1SUXA 1W54A 5AHEA 4ZQOA 3BGJA 3M0ZA 3GNDA 3DGRA 4JXCA 4MZ8A 5BW6A 2C13A 1HUVA 3P8JA 1JCJA 4IMFA 1JCYA 1FUYA 1QWGA 2NX9A 4XTIA 3G1AA 3PBUA 1Z44A 5KSWA 1XCFA 4DF2A 3ABOA 2WKJA 1W56A 2C19A 1L6WA 3LCLA 1DJNA 3C2OA 3M16A 2OJPA 4YWIA 4UMAA 4GBUA 4OE7A 1Q6QA 4GNJA 3UY7A 3QZEA 1K7XA 1XI3A 3W1XA 2ZBTA 2QCMA 3NL5A 3GDMA 3HGJA 4C1KA 4RKAA 1JQVA 4AF0A 4H4IA 3U8GA 4IPIA 2X2GA 1R30A 4JN6A 1ZAJA 2DZXA 2ISVA 2J6XA 3G0UA 1G4PA 5I3GA 1ML1A 2W79A 3LHWA 5HULA 4DF0A 3IV3A 1D9EA 3G8RA 1L6SA 3B0UX 4R7JA 4LW7A 4UFJA 2Q3RA 1XBZA 4XTDA 4RV8A 2G5WA 2ZTKA 3UYCA 4FNPA 1QNVA 2B7OA 5AYYA 1HFBA 3TSDA 2G95A 4LV4A 3W1PA 4R53A 3IIPA 1HTIA 3N73A 5FF4A 3VE9A 4Z0SA 3TX9A 3INPA 1ZCOA 2YR1A 5EKYA 3DH7A 3G0SA 3C4UA 5K4ZA 2YZRA 3PG8A 4O19A 3TFCA 1M7PA 4JR5A 3OVRA 1KA9F 3W73A 3GAYA 3KVLA 3TXZA 1G67A 4BF9A 5U4NA 1YTKA 1KFCA 1Z41A 3M9YA 1SO3A 1F05A 5D2XA 1H7PA 1DL3A 2DJXA 4GUJA 1TSIA 3HMJG 3IRDA 5HNRA 4IMGA 4NJIA 3G1FA 4WOQA 3WK1A 1O60A 4PH6A 4M6QA 1H7NA 3AJXA 2ATSA 5I3JA 4LUIA 3BPWA 2RKXA 3M5YA 1OVDA 1HG3A 4KKXA 4I9AA 5LGXA 4TR9A 2V5BA 1SZGA 2CWNA 3P62A 3SI9A 3UPWA 1YPFA 3TROA 2FB2A 4DPPA 1EX5A 3MYOA 1GVOA 3C3NA 5LKYA 1H1YA 2B7QA 2QCGA 3IEBA 1TV8A 5F2GA 1GQNA 3GR7A 1XC4A 4IQLA 3SJ3A 1VCFA 3L5LA 4U28A 2ALDA 5J5RA 1LBLA 3O05A 3UQNA 2VEPA 4O17A 3W3OA 3T44A 1I4NA 3A5FA 2NXGA 5H91A 2B7PA 1JCXA 4WY0B 5AYXA 3PY2A 3W7HA 1JJKA 3TR2A 1EWDA 5F2IA 3W7IA 5AHFA 1PIIA 3NQ7A 5G1TA 3L65A 2YSWA 4MZ1A 3TH6A 2DZTA 1F76A 1EP1A 4Q33A 3UPBA 3EWZA 1VZWA 3T7VA 4N9DA 3DZ1A 3IIXA 3MWAA 2QJGA 3UD6A 4PCFA 1M6JA 4LVGA 4BR1A 2YGYA 1P1XA 3CC1A 3HG3A 1OFRA 5FEPA 4JTEA 4B5NA 5D2TA 4PL2A 3TIMA 2ZZ4A 3CHVA 4CNPA 1KM2A 1SW0A 2JBMA 3EWBX 1K03A 4TU1A 3ZS4A 5U7SA 2ABBA 4RXGA 2KZHA 1V5XA 1VYRA 2I1OA 1W8SA 2FFCA 3W7KA 1EWEA 1MEWA 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 4JTS A;  1ZAH A;  4NXS A;  3A21 A;  4ZZ9 A;  5C55 A;  3P7Y A;  4AHO A;  2ZZ2 A;  3DFO A;  3GLC A;  4S2C A;  5DEL A;  4AWS A;  5LGZ A;  3GKF A;  5HIN A;  1TRD A;  1SO6 A;  4ALD A;  1CW2 A;  3W7C A;  2PRH A;  1C8V A;  5LNV A;  1W3N A;  4UFI A;  1XXX A;  4A29 A;  1FCU A;  1K8Z A;  3MBF A;  1VYP X;  2V2C A;  2YW4 A;  4U4M A;  3LI0 A;  1MEH A;  2BWG A;  4EVZ A;  4XUG A;  3DKJ A;  4DPQ A;  5FEX A;  1XDM A;  2ZRX A;  4JTI A;  1F7B A;  4O18 A;  4JX5 A;  4AHP A;  4O4W A;  3W72 A;  3PUO A;  1BTM A;  5G4W A;  3LRM A;  1XFB A;  4LVB A;  5MHB A;  4Y96 A;  1EPX A;  1VS1 A;  3RF9 A;  3PB0 A;  3A9I A;  4FX8 A;  4JX6 A;  4WXZ A;  3THA A;  1YXC A;  4LVA A;  1GVQ A;  3DHD A;  1FQ0 A;  2R14 A;  3LXC A;  3O16 A;  4GUF A;  5KMY A;  1BEU A;  3E49 A;  4MJZ A;  1H1Z A;  4FO4 A;  5AC8 A;  1S5T A;  2JGQ A;  1PHQ A;  1TPE A;  2A7N A;  3QW4 B;  4S1F A;  2R91 A;  2D73 A;  1QO2 A;  3LCH A;  3W1N A;  2VFH A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4GC3 A;  4M24 A;  3BLK A;  6PTD A;  1IXP A;  3NSM A;  5EYW A;  3STG A;  3DDM A;  3VXG A;  1KRC C;  4KGJ A;  1RCX B;  4AZC B;  1YDN A;  1J79 A;  2ICS A;  4LRT A;  1TA3 A;  5HQL A;  1CCW B;  4UTW A;  3ANY A;  1OCN A;  2H90 A;  1XS2 A;  3VOC A;  2E8Y A;  4HZ8 A;  4JFV A;  2AMG A;  1GCY A;  4D6J A;  3IS4 A;  4KWS A;  3TW9 A;  1QWK A;  4XSM A;  4YVP A;  5M03 A;  1UWI A;  3GAK A;  1W1A 1;  1SFL A;  1PEZ A;  2OSX A;  4D6E A;  1C92 A;  3AHV A;  5I3K A;  3TVA A;  2E40 A;  1WP6 A;  8RUC A;  3BMX A;  4PUD A;  1HKV A;  4IWW A;  2DVT A;  3TWB A;  1UR2 A;  4L7Z A;  4JL1 A;  4MYA A;  3EX1 A;  3CAK A;  3B04 A;  1FXP A;  2C0A A;  2TYS A;  3U0H A;  2ZX6 A;  1V0L A;  1H51 A;  2V5C A;  3IJL A;  4C6I A;  3GK0 A;  3MMW A;  4Q4Q A;  4LOC A;  4IPJ A;  3URB A;  1SFJ A;  3DI0 A;  1V3J A;  3B9D A;  3PVF A;  2D22 A;  3CO8 A;  3UR7 A;  2Z00 A;  1J0J A;  2FHB A;  1EGZ A;  3QLD A;  4O1C A;  2GK1 B;  1E9Y B;  4DBU A;  3VMO A;  2VCB A;  3W71 A;  1LL7 A;  2PTW A;  5A8M A;  2X1S A;  2PRM A;  1KNW A;  2GJN A;  4OUE A;  2ZZ3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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