5JCUA

Crystal structure of hgsta1-1 with glutathione adduct of phenethyl isothiocyanate and cystein adduct of phenethyl isothiocyanate
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
221
structure length
220
Chain Sequence
AEKPKLHYFNARGRMESTRWLLAAAGVEFEEKFIKSAEDLDKLRNDGYLMFQQVPMVEIDGMKLVQTRAILNYIASKYNLYGKDIKERALIDMYIEGIADLGEMILLLPVPPEEKDAKLALIKEKIKNRYFPAFEKVLKSHGQDYLVGNKLSRADIHLVELLYYVEELDSSLISSFPLLKALKTRISNLPTVKKFLQPGSPRKPPMDEKSLEEARKIFRF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glutathione S-transferase A1
publication title Irreversible Inhibition of Glutathione S-Transferase by Phenethyl Isothiocyanate (PEITC), a Dietary Cancer Chemopreventive Phytochemical.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 81
structure length 220
sequence length 221
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2016-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5jcuA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5jcuA01
3SBCA 2TRCP 2V6KA 2HE3A 4KDXA 1R4WA 4BPYA 2H6ZA 5LNKe 3M8NA 4EL1A 2PBJA 5ID2B 2BMXA 4KF9A 1EWXA 3FY7A 3E0UA 4XIHA 2OJLA 3EYTA 4ID0A 1U3AA 5DQYA 5HQPA 1K0DA 1EEMA 5HFKA 4L5OA 1S3AA 2LJKA 3GKKA 1TK8B 1XVQA 3CXGA 2EIQA 2H72A 2JSZA 5J3RA 1AXDA 2V6OA 4MPFA 5ECLB 3D4MA 2YJHA 2VL9A 2K18A 2E2GA 3TJGA 3HXSA 1PX6A 2I1UA 2H01A 5ECIB 4LL1B 3IAS2 4IP1A 5C00A 3L9SA 2DJJA 2NPBA 2FNOA 1TU8A 4HEA2 1K0CA 3TJFA 1J9BA 1KBNA 4F82A 2J23A 2YJ7A 1M99A 5IOXA 2LRTA 1PL1A 5EL8A 3HJMA 2IJYA 2HNLA 2M80A 4IGJA 2HRKB 3EURA 3VWUA 1E6BA 5C04A 1XPVA 1XWGA 3IOSA 1GNWA 10GSA 4OMVA 1M9AA 1AQXA 2KUCA 1F3AA 4HZ4A 3LGCA 1NHOA 2I3YA 1ZCPA 3Q18A 1K0MA 4GWRA 2ALBA 3ZREA 2EC4A 3KZQA 1FG4A 2PVQA 4GLTA 2YOIA 4NMUA 2V32A 2HQTA 16GSA 2AUVA 1TK0B 1M2DA 1M7TA 4EUYA 4FO5A 1ERTA 1XZOA 5B6MA 1BYEA 2C80A 2XBQA 1I9DA 1OAZA 1B4QA 4GSTA 1VF3A 4GSSA 2R2JA 2MZCA 5D8IA 5A4VA 2VLUA 4J2FA 3UOMA 1H4OA 1UN2A 3CSIA 3FW2A 2YWIA 4AJ8A 2JZSA 1SD9A 4BA7A 4HS1A 3EMPA 3C7MA 4YQUA 3PH9A 1EZKA 3HZ4A 3TGZA 4PQHA 1WE0A 4BWSA 2LSTA 3BJ5A 2FY6A 1CQGA 1J0FA 3O6TA 4TRXA 3US3A 3D22A 4CDOA 2DSAA 2A2RA 1GNEA 1SYXA 3WD6A 3QFBC 5BMUA 2UZ8A 4ML1A 2H73A 4DEJA 1K0AA 1GP1A 2CZ2A 2H1GA 1QFNA 4IJ3A 2B7KA 19GSA 3BCKA 1ZYEA 1FW1A 3EU3A 1SKWB 4PNGA 4V2MA 4I6XA 5CRWA 3ME8A 1TP9A 4POLA 5E59A 4IELA 4JU5A 3F3QA 1TDIA 5IM9A 6GSXA 6GSVA 1O8WA 1SK0A 4WF4A 1Z7PA 4TXVA 2JL4A 5DALB 4WR4A 4YAPA 1Z5YE 2K8VA 2HLSA 3LYPA 2MMAA 3GURA 4LMWA 1MDJA 3F6FA 4MDCA 1XW9A 5G1KA 5JCGA 1S3DA 1EGOA 4MA9A 2C4JA 4DSRA 2XPDA 1KEBA 2ZNMA 1T4YA 14GSA 5D96A 1J08A 3MDKA 1S3CA 5GAND 1K3LA 5IIZA 3TOTA 3UVHA 17GSA 1G6WA 4DSQA 2H75A 3F9UA 3C8EA 5D73A 1VRSD 2O85A 2DJ1A 2HSYA 2HRFA 4F9ZA 3CSHA 1WPIA 4O7HA 3DWVA 3IE3A 5EVOA 2GT6A 3N5OA 2OE0A 2WB9A 2L4CA 4GXZA 3U5RE 2GT5A 1DUGA 2DLXA 1BX9A 2MMZA 3P8WA 5KN3A 1V2AA 1EP8A 2HT9A 2ES7A 2MMNA 5HR0A 2CX4A 5G31A 2GSSA 3H1NA 5FHIA 1JZDA 4NHZA 4ECIA 5A4WA 3GL3A 3MWHA 1V57A 2C0DA 1V58A 1O73A 2VLTA 2B5XA 3M9JA 3DMLA 4HQSA 1ZYQB 3GKXA 3QMXA 4J56E 4YQVA 2AYTA 2N5AA 4ACSA 5DBQA 2LRNA 2QC7A 1Z6MA 1W4VA 1NM3A 5ELAA 2HSMB 2C1YA 3V1WA 4JE1A 4JEDA 3IA1A 3PGTA 2DJ2A 1FB0A 2X8HA 4Q5FA 1LU4A 3ME7A 1BQ7A 1DE1A 2B1KA 4V1Ap 2AAWA 2IFQA 1AW9A 2P5QA 5J9BA 3L9UA 4XS1A 1OC3A 4N0VA 3ZIVA 4BL7A 4IQAA 3L4NA 4P3YB 4GQFA 1BG5A 4KSOA 3ZITA 4D73A 4BVXB 4IP6A 4AJ6A 3TRXA 1X9MB 3QPMA 3VLNA 1TRWA 4MLYA 2NDOA 5KN0A 4KW6A 2E7PA 6GSTA 4K0NA 5EY6A 4MK3A 4ILFA 4USSA 4MJEA 3ZVJD 1TU7A 1FO5A 4KUNA 4N30A 3DIEA 3LYKA 1SJZA 1TOFA 2YN1A 4OWYA 2O8VB 1ZGNA 1EEJA 3ZMLA 3DVWA 3R2QA 4GRFA 2QSIA 6GSSA 1WP0A 1RK4A 1WWJA 4PXOA 1ILOA 2DBCA 3DXBA 3LXZA 4KB3A 1X5CA 4E8HA 4K9ZA 3UMAA 3BBYA 2XBIA 2FGXA 4L0WA 2YZHA 3VFIA 3HKRA 1QUWA 2CVKA 3D21A 1W89A 3HYPA 3RDWA 4IQ1A 1BEDA 5D9XA 2VO4A 2FWFA 4QQ7A 3LJRA 2H70A 1XWBA 4MF5A 3F0IA 4BVYB 1RQMA 2HZEB 3ZFBA 2GZPA 5B6NA 3GIXA 5FT3A 1JHBA 2E0QA 3APOA 2YV9A 2H8LA 4AGSA 3RHCA 2YANA 3DVXA 5ECRB 3C73A 3IXRA 3L9VA 4Q5NA 4TR0A 4MABA 3F4TA 1M0UA 9GSSA 1SJ6A 3WYWA 3IC8A 4I97A 1TI1A 2GTUA 3KMNA 4K1FA 5J4UA 4TN8A 2G0FA 3TDGA 3F8UA 3D0ZA 2LV3A 4EDYA 1THOA 1R26A 3KM6A 4ULXA 1YEXA 1Y25A 4IKHA 3MSZA 4F03A 3A3TA 1JLVA 2TIRA 2PGTA 3FRCA 4BWQA 5ECQB 5IO0A 3HY2A 1HYUA 1OC9A 1AQWA 3I9V2 2P31A 4KSMA 4K2DA 2QGVA 5KN2A 5IQYA 2HXKA 4HQZA 1GWCA 3CTFA 4ZL7A 5B8BA 2B7JA 2CAIA 2L5LA 1YDKA 5IOWA 1F9MA 4POBA 1WMJA 5IMCA 1OVNA 2PMTA 3FK8A 5H5SA 2O7KA 1XVWA 4V1Ag 5CREA 4PURA 3R3EA 3GV1A 4FYUA 2L59A 4ECJA 4JZQA 3I6AA 4TXOB 1OKTA 2XPEA 5F06A 1GTIA 5D9VA 4MH3A 1OC8A 1Q4JA 2VCZA 3IAM2 1TK5B 12GSA 3W8SA 1X9WB 1Q98A 4IJIA 5H5QA 2H30A 3KH7A 1X0RA 1VGLA 1XWKA 5L71A 4KDYA 1JZRA 3TJJA 2KHPA 2VCQA 4ZB8A 5AISA 2REMA 1R7HA 2VUPA 2I81A 3WT1A 4J57E 1F3BA 4OD7A 4RQRA 3KMOA 5LCZA 5G1LA 1A2MA 3F63A 4XTSA 3W6GA 3HJPA 1TTZA 2JZTA 2F3MA 3IR4A 3VK9A 4JRRA 4G19A 2GLRA 2R5GA 5IO2A 3CTGA 1ZOFA 1HNBA 2QKEA 3P2AA 4IBPA 2LNSA 3ZZXA 4Q5QA 1O7UA 1SENA 5CO3A 2VCTA 1USBA 4PUAA 3NZNA 3H93A 4G2EA 2C8UA 1Z7RA 5D9TA 1MTCA 3ISOA 3IPZA 2OACA 1CQHA 3Q19A 2GGTA 1X5EA 1HNCA 2AJQB 3WGEA 3G7IA 3KP8A 3D5JA 1K0NA 5AIVA 2BTOT 2GZYA 1ON4A 1V40A 3G9BA 4XS6A 3IRAA 4EO3A 1FHEA 4PNFA 4EVMA 2V41A 3HVSA 3GH6A 3GSTA 4IVFA 4ZL8A 5ECHB 1VF4A 1XIYA 2CQ9A 3CMIA 20GSA 3CYNA 3KTLA 2M72A 3CSJA 2AB6A 2HI7A 1H75A 3PPUA 1V9WA 2H6XA 2P5RA 4KCEA 5GZZB 1A2JA 3ERFA 2MMOA 3TOUA 3VI5A 3WGXA 1M9BA 4JBBA 3Q74A 2WFCA 3RPNA 3QAVA 2WCIA 2HZFA 2R37A 2HSHA 1ZZYA 2K6VA 4WEYA 1SKRB 2L6DA 4KH7A 3GX0A 4RI6A 1TI3A 2RLIA 4KE3A 2L5OA 4RQXA 2GZZA 4XS4B 3H4KA 4NHWA 2DJKA 1SU9A 2XHFA 2Z9SA 1ERUA 1OYJA 3GTUA 3E3EA 4N10A 1JZOA 2LNTA 2M46A 2GDRA 1WJKA 3L78A 3TKSA 3TKQA 2DMLA 3KD0A 3A2VA 1SL1B 4EXJA 1QQ2A 2WRTA 1GL8A 4G0LA 2C3QA 4MZBA 2F51A 3DRNA 2B6MA 4EF0A 3PINA 4X0XA 2R3XA 1FVJA 1GSYA 3FZ4A 3ZTLA 1TRUA 2WS2A 2PN8A 4QL7A 2C0GA 2HRNA 5KN1A 1TKDB 5DJMA 3ZL5A 3HCZA 2VLVA 1U88A 3J7Yk 1QXHA 5J5NA 2CA8A 2H0GA 3U6VA 2YPMA 4EE0A 2MBSA 1AIUA 2OBIA 3KH9A 1MDKA 3KCMA 3EE2A 1A2LA 1A8YA 2KP2A 1EV4A 4MPGA 2LRCA 3MAKA 5JCWA 2IMEA 2IPAA 3UJ1A 4PQIA 3N9JA 5IMZA 3GMFA 1U87A 2L57A 5ID2A 5IMDA 1ERWA 5DDLA 1SK2A 2OBKA 2D2ZA 5E4WA 8GSSA 3MNGA 1T00A 1BJXA 6GSUA 2F9SA 2YZUA 3VWXA 4ZIJA 1UA5A 4V2NA 4HJ2A 3QOUA 4X43A 1A0RP 3BCIA 2VAFA 1OE8A 1YEPA 2X8CA 2H66A 3APQA 2ZCTA 2DJ3A 1Y6EA 4YH2A 2KOKA 2I9HA 2BJXA 1ZMAA 3GL5A 4FYCA 1UC7A 1XXUA 1VF2A 3OR5A 5COHA 3IBHA 2HSNB 3I43A 4I8BA 4O5RA 3TRQA 3GN3A 1EV9A 3QAWA 1YF1A 4GSNA 5HFIA 5EPFA 3F3RA 2YNXA 3H79A 2GVPA 4HU7A 2HRKA 2KP1A 3TKSC 5DAKB 4PTSA 2GSQA 1PD21 1KTEA 2LUSA 3LFLA 1AAZA 3TJKA 5B8AA 7GSSA 3LXTA 2V1MA 5IMVA 4MZCA 2PPTA 2NBSA 4OCFA 2R4VA 2HFDA 3A5WA 1X5DA 3LSZA 3LEFA 3C71A 3FYGA 1TRVA 2LEGA 1T3BA 1Z9HA 4FYBA 3J7Yb 3LQ7A 5HFGA 3HA9A 11GSA 4POMA 2GSTA 3PR8A 5IMAA 2WJUA 1K3YA 4ISDA 2NVLA 5CAXA 1Z6NA 2IMDA 1PL2A 2F8AA 2OADA 4E8EA 1PX7A 4O32A 1XW6A 4HZ2A 3EU4A 2LS5A 2FA8A 3F4RA 2H76A 4XRDA 2GQMA 2ZUPA 3KP9A 4PGTA 2OKAA 4CW9A 2G2QA 1GH2A 1GSQA 3G7YA 2VCWA 4N11A 2VCXA 2CVBA 2WZ9A 5CNWA 1IYHA 4JR4A 2GS3A 2DIZA 4L8EA 4GTUA 3F6DA 3TRPA 3O76A 2VL2A 4GQCA 2RUFA 3EMXA 4PUFC 4H86A 1TJDA 4KCAA 3ZVJA 2RIIA 4OFNA 2F8FA 4MH2A 2LTKA 1THXA 2LQQA 5CYYA 4GF0A 3TCOA 4RI7A 1SYRA 3GUSA 2AV4A 4HJMA 1PA3A 2A2SA 1ACVA 3K8NA 4K8MA 4NAXA 4K0GA 1K0OA 3KGKA 1O6JA 4ZILA 1DSBA 1EOGA 2L6CA 1N2AA 4OO4A 2OE1A 1ML6A 4KGIA 3CRTA 1GSUA 3HHVA 3BOAA 2AHEA 4LLRA 1A23A 2EIOA 4AF2A 1ZL9A 3GSSA 4TOPA 3VPQA 1LBKA 4CHSA 4F0CA 2IWTA 3UBKA 1YQ1A 4JR6A 5DALA 4HOJA 4IN0A 4KDUA 2IN3A 1GSSA 4OFTA 1XBSA 3UVTA 3KXOA 3KJYA 1N8JA 4X1UA 2RM6A 3BD2A 2H71A 2H0HA 3GX8A 1XWAA 3G7JA 13GSA 1URMA 3FR6A 4Q5RA 5ECSA 1FB6A 3TUEA 1HD2A 3O3TA 1VF1A 1NW2A 2FD3A 3ERGA 2N5BA 18GSA 4TKYA 2IMKA 3M9KA 4QL9A 3UEMA 3IV4A 3LG6A 5JWRB 4FQUA 2WULA 1I5GA 1GSDA 3IK9A 2LJRA 3JCML 2H74A 4ZB6A 1MEKA 1E2YA 1WIKA 4FIWA 4LL4B 22GSA 5JWQB 1OKDA 2KLXA 4KAEA 3FR9A 4MZWA 4ZB9A 1PGTA 2MYGA 2VL2C 5ECNB 4PQ1A 4K7NA 2A4VA 1O81A 3DGQA 2EIRA 4NV2A 5A4UA 2H1AA 4MF6A 2TRXA 4YQMA 2C0FA 5ECPB 4DVCA 1MD4A 3H8QA 4FH8A 5JWOB 3VWWA 1XOAA 3EVIA 4MF7A 1UVZA 2IFQB 1GULA 1SL0B 2DJ0A 4WF5A 3TB2A 1KNGA 2IMIA 2DMMA 2VOCA 4G0IA 4OFMA 2K8SA 3ZLPA 5DCGA 4BL7B 1YF0A 4D73B 3VPTA 1XOBA 4I5QA 1Z3EA 3FZ5A 3NIVA 3IHQA 2J9HA 5DQSA 1SL2B 4RUVA 2RM5A 2HSMA 4KA0A 3GRXA 4ML6A 5G30A 4XCSA 4ZBDA 3M0FA 1AUCA 5IPHA 1DBYA 3M3MA 3D4TA 1EP7A 3KTBA 4WR5A 3RBTA 2GQLA 2YWMA 5ABRA 1YY7A 1JZWA 4OO5A 4TVEA 3VI7A 1GSFA 1GTUA 5ECOB 2FHEA 1SJIA 4HDEA 5DJLA 4WKWA 4F2IA 5DAKA 3CRUA 3ZIJA 4BVXA 4F0BA 1YZXA 2PUKC 5AN1A 4NWYA 2X99A 4K6XA 1M2BA 3GKMA 3CBUA 1U6TA 2B1LA 1TXXA 3AY8A 4EKZA 4G0KA 3EC3A 5F0GA 2H0IA 4K7IA 2CX3A 3QCPA 1GSEA 2C3NA 5HR1A 3EWLA 1PSQA 1JLWA 3HJOA 5CRGA 2PERA 5J9CA 2XC2A 2PVOC 3IC4A 5F07A 4IW9A 2R6KA 3A2WA 2VM2A 1HNAA 4MJCA 1FOVA 1G6YA 1FAAA 4KX4A 1HQOA 1GTBA 5IMFA 1TRSA 1ST9A 2IIYA 3UBLA 3GFKA 1MDIA 4ZBAA 4HUAA 1K0BA 4MJAA 4HU9A 4WBJA 1R5PA 3GH9A 3M1GA 1T4ZA 5HR3A 5LD0A 2C0EA 1G7EA 2LKUA 1A24A 3UL3A 4TR1B 5ECKB 3TKSE 1F6MC 2FWGA 3KIJA 3FEUA 1JFUA 2I4AA 2ON5A 5CRHA 4BVYA 6GSYA 2V2GA 3QFAC 3ERWA 2X64A 1WRYA 2HZEA 4GCIA 4IS0A 3IDVA 5G5EA 1PKWA 3VURA 4DSSB 2YWNA 2H1BA 3TKPA 3C1RA 1AC1A 2O87A 3RPPA 1NHYA 3DYRA 1V98A 1QK8A 3HVXA 3ZMKA 4ECCA 1QMVA 1OC9B 4TW5A 5ECMB 5JCUA 2VIMA 3RHBA 2B5EA 5INYA 4PX1A 3W8JA 1EOHA 3QAGA 3NOFA 3D6IA 2JSYA 1F37A 5A5KA 2CAQA 3GYKA 3QDNA 2GSRA 1B9XC 1YJ6A 4EDZA 1K3OA 1NSWA 4IHUA 5ENUA 2DC5A 4HI7A 1BAYA 1XFLA 1IYIA 4XRAA 3S9FA 3GKNA 1PMTA 4YAVA 1T1VA 4MP4A 1ABAA 5CP1A 3QR6A 1X9SB 3GHAA 1M2AA 2YCDA 1GTAA 3IK7A 3A2XA 1XCCA 1YKAA 3DEXA 2WGRA 5GSTA 2VM1A 3ED3A 5GAPD 1O8XA 4WETA 4WXTA 3E9JB 3FKFA 4NXIA 4Z7XA 5H5RA 4TXOA 5AIXA 1XWCA 2CT6A 5GSSA 1ERVA 1RW1A 5B7CA 4N0ZA 1PN9A 3EINA 5IPGA 5FWGA 1SD8A 4MCUA 2YWOA 2FLSA 2YP6A 1MD3A 5AGYA 4ZBBA 1T8EB 1GUKA 3HVVA 2K9FA 2RUEA 4OCEA 2N5FA 1GRXA 4I2UA 4MJBA 4ZL9A 4TR3A 6GSWA 2FUG2 3L0HA 1SKSB 3P7XA 4K7OA 3QD9A 3GA4A 2CVDA 4NV5A 2JU5A 1R5AA 4EC0A 1QGVA 2DIYA 3GNJA 3HD5A 3RAZA 4TR4A 2X8GA 3FZ9A 2YV7A 4LA1A 5F05A 2VD1A 2H19A 3LWAA 2OA7A 3FR3A 4L5LA 5DVBA 4WBRD 1F2EA 3C1SA 5CRDA 5J41A 1GLQA 4O92A 2FCHA 5HR2A 2CZ3A 2HYXA 1U3IA 4POKA 1PKZA 2H6YA 2B5YA 2NTOA 2E2MA 5ELGA 4G10A 4G9HA 1EGRA 2LJAA 3ZRDA 1OE7A 2P0GA 3HZ8A 3FZAA 1FVKA 1G7OA 4KNDA 1AQVA 3SWLA 3WGDA 2MBTA 2JADA 1YKCA 3I69A 4MMMA 3TJBA 2WDUA 1B48A 1B9YC 3HDCA 1LJRA 3APSA 2PU9C 3VWVA 5D93A 3P90A 2H1DA 3LORA 1XW5A 2LQOA 3UIWA 2PWJA 3GTUB 1G0TA 5G5FA 2L4QA 5D9WA 3DD3A 4AJ7A 4NPBA 4V2LA 1B8XA 2B3SA 5G2ZA 2VL3A 2JZRA 5F8BA 5KEJA 3ZYWA 4LMVA 3KEBA 3DKSA 2IL3A 2FWEA 3WT2A 1A0FA 2VD0A 2FWHA 5DCHA 1GUHA 2JACA 1DE2A 3UAPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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