5JTYA

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
283
structure length
262
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQEKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, receptor
total genus 66
structure length 262
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA02
1QKAA 3FUZA 3TODA 3H6WA 4JWOA 3CFZA 3K6WA 1LLSA 4ZECA 4LVQA 3T9XB 1M5CA 3K1MA 4H8JA 4H8IA 2HFBA 2Z8DA 3RT6B 1IEJA 4PQJA 1B1HA 4PFWA 5IKBA 4YAHX 1SVXB 1PB9A 1M5DA 1J1NA 1EU8A 2F7CA 2H9BA 3JZJA 1GTKA 3K6XA 3K1PA 3QUJA 4KQPA 4EF1A 2D21A 4DXCA 4OZ9A 1Z7ME 3FVKA 2A5TA 3K4UA 2XXXA 4U1OA 3KOTA 2ZYNA 4OQOA 1MQJA 1DSNA 2F36A 3JV9A 3MAMA 4FE8A 3IB2A 2UXAA 2ONKE 5I58B 3FXQA 3KJ7A 4KI0E 4JSOA 4KCDA 4WXJA 5K2YA 1EZOA 2VGQA 4I8CA 3KG2A 3FASA 1LSTA 3CG1A 1GV8A 3ILTB 1A99A 4GFRA 1IIWA 1IQ7A 2PMSA 4BDRA 3MJNA 1WVJA 4NF6A 2DXYA 4RA1A 1Y3QA 1LBBA 3PPNA 2ALUA 2QJEA 1XVXA 4ZEKA 3IK6B 1FQBA 3QYTA 2W7YA 1MY3A 5KCJA 1R1NA 4FAJA 5AA2A 5H8QB 3PMWA 5I59A 3FXRA 3IB0A 1B51A 3RUMA 1ZLQA 1MXVA 3G3JA 2RC9A 2E1SA 5FHOA 3PMXA 5DEXB 3MBPA 2P1SA 3QIMA 4GD5A 3MC2A 1NKXA 2Y7WA 3FXUA 4ZEBA 1XHYA 2NWJA 4ZEDA 1B6HA 1MXUA 2IA4A 1AH5A 3MVWA 2VD3A 4LQ5A 1SYIA 1FTOA 1O7TA 2H25A 3RQTA 2UYEA 1LCTA 1CE2A 1MQGA 4MF3A 1AL3A 3HSTA 4PETA 2PX1A 3MZ1A 2B3BA 4OWDA 3K01A 2P2AA 3K02A 4R9GA 3PMVA 2M8CA 1Y1ZA 2QMWA 1N0TA 3EN3A 3IOTA 4N13A 2ONSA 4E0XA 3KSJA 5CC2A 5KCJB 4G68A 1MH4A 3ECRA 4QSCA 4X9TA 1S7YA 4BDNA 4GXAA 5TPAA 4WKMA 1D9YA 3PUZE 1HSJA 3VVDA 4YB6A 3PPOA 3OD7A 3ZS6A 3G3GA 2G29A 4PE5B 1Y4TA 1Y9UA 1NNFA 1I6AA 1BP5A 3R6UA 4KPTA 4R72A 4DZ1A 2VD2A 1LFIA 3PD9A 3OSRA 3DM0A 1IXCA 4P0GA 5J1DA 4KHZE 2O1MA 1IZ1A 3VE1B 1LGBC 1A55A 3Q27A 1II5A 3IJXB 3RY3A 2V84A 2RC8A 4Q8RA 1DPPA 4O3CA 1EZPA 4ZS9A 3B6TA 3HN0A 4N6PA 3VV5A 1EZ9A 3L6GA 3G7WA 4ZEIA 4OETA 1MY0A 1R6ZA 2Q88A 2Z8EA 3IL1B 4XIGQ 5DVIA 3EHTA 3KFMA 3VFJA 4R6KA 2HQ0A 3H03A 1MDQA 1PB7A 1P1NA 3TQWA 4IO3A 4QFNA 5M2VA 4GIZA 2Q2CA 1PBQA 3S9EA 3CFLA 1S50A 2DWHA 1DTZA 3FVNA 4XKPA 3W9WA 3SKPA 1MH3A 1SQYA 1ZU0A 3TUSA 3TCGA 3T9HB 2R9JA 4YKPA 1QULA 3N5LA 2RKMA 3C31A 4F1UA 1EH3A 1OQHA 2OWTA 3E3KA 5HBCA 1GGGA 4XXUA 5DVJA 1B52A 1SW1A 4H67A 4YKKA 1XT8A 5TP9B 3C35A 1Y3NA 4F3PA 5IAIA 2PYYA 3H7MA 5HM4B 1N84A 2AL5A 3KOSA 3Q28A 4POXA 4GRKA 1OIBA 2QS3A 4U4SA 4XKQA 2ZXTA 4R9FA 2DWJA 3TCFA 3U1OA 4BDQA 4LUBA 3O6HA 2OZZA 3D4GA 4OESA 1B0HA 1FTMA 2GHAA 2DP8A 3FV1A 2XXTA 3VVFA 2OWSA 4IY6A 1UQWA 5CMBA 4OEVA 5F7VA 3MZ9A 2Z23A 2KLFA 2AL4A 2QSXA 3HO7A 3I6VA 3Q29A 4IB2A 4QFPA 1US4A 4GQOA 2F7AA 2H99A 2PT1A 3F11A 3UGWA 4G8HA 4QFLA 1NL5A 1BLFA 2YLNA 2QL3A 1Z7NE 1GR2A 4OENA 4OTEA 3VLWA 1UIUA 1QUJA 4KFQA 2RINA 2DE3A 2ZNSA 1FQFA 3RTFB 3S9MC 1FQDA 1TT1A 5F1QA 3V8XB 2F35A 1N04A 1A8FA 1RYOA 5B70A 4X48A 1JQFA 4H65A 4BDLA 2OBGA 3O66A 1B3LA 1S9TA 4KYDA 2E0SA 1R9QA 5CM6A 3BBRA 2XX9A 3UP9A 3Q25A 3C32A 5I58A 1A8EA 2I49A 1D4NA 1AMFA 4GXSB 1QUKA 1O63A 5HPQA 1ZMGA 5L8DA 3KJTA 5BUUA 4DLDA 4R2FA 2F6GA 4QSEA 1LFGA 2F6PA 5B7DA 3RT8A 3V5AA 3G3FA 4XTCQ 2DVCA 3H6TA 4ELPA 2FNCA 1XOCA 4U4XA 4F19A 3QUFA 4OFOA 4NWDA 3TQLA 3G3IA 3IJOB 5H8QA 4HS7A 4RPOA 1Q1KA 3TFLA 2GHBA 1TWYA 4C1TA 2I0CA 1O64A 4U2RA 1FQCA 2H4IA 5DEXA 5ICTA 2XX7A 4Z7EA 2OLBA 2O1LA 4TLMB 4FJPA 4N07A 4ND9A 1LFHA 2XXWA 3E9XA 4E0WA 2BJJX 3UN6A 1ANFA 1N76A 4RK2A 1YPNA 2HZLA 4G2ZA 1SW5A 5I84A 3TMGA 3JYRA 1B7ZA 2RCAA 1JW1A 2O7UA 1ZBMA 5JTYB 1FTKA 2UVHA 3H3GA 2O6AA 2O7IA 4O3BA 4FATA 2THIA 5JEIA 4RY1A 1RKMA 3LC8A 2B65A 3SEWA 3O9PA 3OO6A 4R73A 2QS2A 4GVOA 3WAFA 5I2KB 3EHUA 5H8SA 4GF8A 4U1ZA 3PD8A 3PU5A 1MQDA 2XXPA 3Q26A 4I1DA 1FW0A 2Z22A 4YB7A 4ZE9A 4PFTA 2OCUA 3O97A 1URDA 1MY4A 3C4MA 1LAFE 1QVSA 4NF8B 3RTWB 3D4CA 4F1VA 3TTRA 3OENA 1M5EA 3G3KA 1NFTA 4RK9A 1B46A 2F78A 1TFAA 4YMBA 4NTLA 3K1NA 4R2BA 2B3FA 4WEPA 5EYFA 4HW8A 3FIRA 1B0LA 3THIA 2DSFA 3T93B 4ZZAA 3U93A 5H8FB 3MUQA 1BKAA 1T0KA 1B3HA 3P7IA 2ZYKA 3LR1A 3K00A 1US5A 4YKIA 2DVZA 3M8UA 5EHSA 3T66A 4GOTA 4KD5A 4NF4B 1B5IA 1NNTA 1USYE 2ABHA 4IO5A 3UA8A 2ZNTA 1MY1A 4POWA 3HV1A 2NXOA 5I56B 3IB1A 1M5BA 2PT2A 3DP6A 4JDFA 5CMMA 3L6HA 3MPKA 1MPCA 3GBAA 4YU0A 1B7UA 2I4CA 1IITA 3T96B 2NVUB 1B32A 4ELQA 3FJMA 4EXKA 1MXYA 3OSQA 3RPWA 1IUDA 3GXAA 3M3FA 3A3CA 3HHFA 2O84X 2QPQA 3MPLA 4QRZA 3TZAA 5DYHA 5TP9A 2GFEA 1A54A 2PVUA 3KZGA 1CB6A 3FGSA 4H1XA 3PPQA 2LAOA 5CI5A 5ITOA 2ZMBA 4ZZEA 2I3WA 4YMAA 4OYVA 1MRPA 4GWOA 3C33A 4FECA 3VLVA 3K6VA 4UA8A 3TPAA 3OELA 3N6UA 4EQBA 2RC7A 2O69A 5FHNA 5FTHA 1BTJA 4DXBA 4LP2B 2I48A 3K0VA 1FTJA 4ESXA 3C36A 3CFXA 3T9UA 3TDJA 5EHMA 1QJMA 1P1UA 3AXFA 1PEBA 2ZNUA 4YKJA 4ESWA 4I9DA 2Q2AA 2Y84A 4FEDA 1ZKBA 4GLIA 1N3WA 3RGYA 1HSLA 3VXCA 2X7QA 4EXLA 4MFIA 4G8NA 3TELA 1M5FA 3S4UA 1VFEA 3I3VA 1MS7A 2Y7IA 2DQVA 4KR5A 4BDMA 1DTGA 1B4ZA 1ZJLA 1MM7A 3BFUA 4L17A 4R6YA 2H5YA 1ELJA 1UTBB 3E4RA 4X1DA 1SI0A 3IO4A 4F18A 3VDFA 4MLVA 4LQ2A 3U8QA 1P1QA 4U23A 3SEUA 2VHAA 3K6UA 1URGA 4XKNA 5DT6A 3U72A 4IO4A 4GL8A 1B5HA 2R71A 5CMKA 3RLFE 2F7BA 1I6QA 2I3VA 3O28A 2DYXA 1UIVA 4QFOA 1JVXA 2ZYMA 4G4PA 4U22A 1SBPA 5H8NB 4LZ5A 5A5XB 3KN8A 3HPIA 4OVJA 4P11A 1MY2A 4DCYA 5CBSA 4MLQA 2ZYOA 2ONRA 1FQEA 4F39A 3CIJA 5CBRA 5AA3A 1OVBA 2HEUA 2FA7A 3H06B 1MXWA 5ISUA 1JW5A 4AB5A 3PUVE 3N94A 3UORA 1PB8A 4IO2A 5AA4A 5L9MA 1PBPA 3IOVA 4H0WA 1VSOA 5KZTA 1QKBA 4ZE8A 3U92A 3IOWA 3LSXA 1VR5A 2RF1A 3T9VA 1Y4CA 3S2VA 2DXRA 1R9LA 4XKRA 3PPPA 2XXRA 2O68A 5L9OA 3CSGA 2YPNA 3FVOA 1FCKA 3SETA 2X7PA 3MP6A 4MBPA 1VE4A 2GH9A 1FTLA 1USYH 3LSLA 2OJTA 4HTGA 1DPEA 4DXUA 3TTMA 1JETA 2H98A 1B7HA 2XD3A 3SERA 3HCQA 2Q8JA 4FIMA 4AQ4A 4F31B 4NMYA 1MXXA 4K3FA 3LBSA 4UACA 3R26A 1UTHB 1SW2A 5JTYA 1VFDA 1JVYA 5DTBA 1OLCA 3C34A 3QXMA 3I5OA 2XD2A 1D3KA 1URSA 2F5XA 2HAUA 4QFKA 4DDDA 2RCBA 1IXHA 3LSWA 5AA2D 5JK4A 5AA4B 3O2AA 5I2KA 3OMBA 2Y7KA 2UVJA 1B3FA 3LUYA 4NF5B 3IAZA 3S9LC 2V3UA 4Q0CA 3KSXA 4NE4A 3OXNA 1IXGA 2O51A 1N7XA 1B4HA 3CR9A 4AB6A 1MPDA 5I57B 3FZVA 4IO7A 5I2NB 4FORA 2PBWA 3PUXE 4NF8A 3CRBA 2I0BA 3GBBA 3OEKA 2WKYA 2V3TA 3T22A 1MM6A 2V25A 1B3EA 3S9NC 1F9BA 4U21A 1H76A 5H8HA 3ILUB 5KDTB 1BIYA 2HAVA 1H44A 2QRYA 3H4ZA 1TFDA 2UVIA 4H5GA 2D3IA 1FQAA 1POY1 4X1BA 4NEDA 4F3SA 3TEPA 3PUYE 3DELB 4OFLA 3H6UA 2REJA 1Q35A 1MPBA 2HCAA 3G3HA 5AA1A 5H8FA 3N26A 3FV2A 3KGCA 4YB5A 4F3GA 4RXLA 1B05A 1OLAA 4EUOA 2DE4A 3O29A 4G68C 4LZ7A 4BDOA 2QMXA 4R6HA 2ESNA 3B7DA 4NF4A 1MDP1 3MW0A 3B6QA 3U94A 4M4GA 3MVXA 3CI8A 3OOAA 3QAXA 1AIVA 3PUWE 5LOMA 5I56A 2DE2A 2A5SA 3PV0E 4O3AA 1LB9A 3KN7A 3FJ7A 3O6IA 4OEUA 3V83A 4OXVA 4GL0A 1H43A 4M1VA 2A5TB 3SEVA 4JSDA 4IGTA 1NMUA 3R7XA 1Y3PA 1ZIUA 5ELVA 5H8HB 1I6BA 1NNKA 4ZDMA 3TAJA 1B2HA 3FATA 1POTA 3QK6A 1LBCA 1QW0A 3A3UA 1JEUA 4JBZA 2UYFA 1B40A 3E13X 4ZEFA 1YCJA 3TTNA 4EQ7A 4C0RA 3MQ9A 5DVFA 2I4BA 4NF6B 4JXIA 1XVYA 3CSBA 1SI1A 4THIA 3TYHA 1LB8A 3KN3A 1LAXA 3HHGA 4PFUA 1LAGE 2F8DA 3GLBA 5AA2B 2HZKA 4DIGA 4TLLB 4ELOA 5I59B 2QS4A 4PFYA 2XXHA 4ECFA 1NH8A 4NWCA 1P1WA 1TXFA 4IGRA 4HCYA 3EF7A 1XS5A 4LZ8A 4DE8A 2AIXA 4RYAA 1Y20A 1L5TA 3ZSFA 1XC1A 2XXIA 4MH5A 1WDNA 3V89B 2Y7RA 1ZTYA 3MP1A 3OO8A 2DOJA 1ATGA 4YZZA 1SD3A 1NH7A 4LONB 5BWJA 3MZBA 2R6GE 1P1OA 1UTBA 2Q89A 3EHSA 3IX1A 1P99A 2I58A 5TU0A 2DWAA 2Q9TA 2FYIA 4P0IA 1IXIA 3VVEA 1YAEA 2ANJA 3OO7A 4RJZA 3UIFA 1MXZA 3ODBA 1B5JA 2AYSA 2CMOA 4OERA 4F29A 4JWXA 3MVZA 3FJGA 5L9SA 4LATA 5CRYA 4G68B 2QS1A 2D5WA 3FD3A 3VXBA 4F2QA 5TPAB 5ICQA 1OMPA 3UK4A 2XX8A 5H8NA 4F2OA 5A5XA 2X26A 4H5FA 1B9JA 2IEEA 1H45A 1NNPA 3MWBA 1Y1MA 4IY5A 1GVCA 4Z0IA 2F34A 1B1XA 3WAEA 1MQHA 3H6VA 4G8MA 4F22A 3QSLA 4RPNA 2REGA 3M3KA 3DLNA 4FEBA 1WODA 1DOTA 4JB7A 4QHQA 2HXWA 2XXQA 1OVTA 4HCWA 3ZKLA 4TOZA 3TKDA 1MG1A 3IOUA 3KEIA 1JNFA 1PC3A 3W15C 4KYSA 3DP8A 3TCHA 3N6TA 4RNSA 4R74A 3GZGA 3SEYA 2V3QA 5FTIA 3FVGA 2G93A 1D9VA 3RN8A 3OO9A 4ISUA 5CMCA 4DCXA 1PDAA 4OHNA 3IO6A 1N3XA 2GRVA 2CZLA 1N7WA 3PGFA 3W9VA 2P0SA 2XXUA 3ONMA 1HSEA 2DS9A 3EQ1A 1KWHA 1B58A 2XXVA 1I69A 4QF9A 3MP8A 3OEMA 1JEVA 1YTVA 3MVYA 1SYHA 1A40A 3RNNA 4OFJA 4PP0A 3CVGA 2XXYA 1JW4A 4YICA 3BKIB 3C9HA 1UTHA 2VOZA 2DWIA 4KYEA 3M3LA 2XHDA 3LSFB 2UVGA 4OMBA 2YJPA 1A7LA 4TQUQ 3IORA 3K2DA 3PPRA 1LCFA 4EDPA 3SESA 5FHMA 2V93A 4QSDA 4LA9A 5AE4A 2F97A 1RYXA 4KCCA 4ONYA 5K2XA 4F3BA 2I6EA 5ITPA 4NF5A 4F1YA 4I62A 4Q5TA 1DMBA 3DP4A 1SDXA 3VLUA 2VP1A 3IR1A 4EF2A 2NUVA 2Z8FA 3SEXA 1MQIA 3KBRA 5I57A 5I2NA 2Y7PA 3BFTA 1H3DA 1B3GA 1QUIA 2NOOA 3TTLA 4WEDA 1SW4A 3USDA 4EQ9A 1OQGA 4JWYA 3SDFA 4H6DA 4G77A 4Q30B 1AOVA 4C1UA 3A09A 3CG3A 2OK2A 4ELRA 5KDTA 3O6GA 3EPEA 4IO6A 1LAHE 4BLAA 4R75A 3B6WA 3ZKKA 3TTKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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