5JTYA

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
283
structure length
262
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQEKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
total genus 66
structure length 262
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA02
3MP6A 4XIGQ 4THIA 2ZYOA 2R9JA 1UIVA 2XX8A 3FXQA 3MUQA 1URSA 2I4BA 2ONSA 2OCUA 4DXBA 2XXVA 4IGTA 3IO6A 1LBBA 1M5CA 4KD5A 2UVIA 1M5BA 2HAVA 3MPKA 4F2QA 4I9DA 1N7WA 2BJJX 5CI5A 4C0RA 3SEVA 4NF6B 4IO7A 3KJ7A 1SI0A 2XXHA 1FQCA 4R9GA 1WODA 3DP8A 2UVJA 1R9LA 2DWJA 3GBBA 2PMSA 3PUWE 1LLSA 1POTA 5AA4B 3M8UA 5K2YA 3KGCA 5I2NB 1B6HA 3OO8A 2DVZA 3G3KA 4ZEDA 2V25A 5BUUA 1FQFA 5ISUA 1LB9A 1N76A 1PDAA 3HN0A 4LQ5A 4OENA 3UN6A 1DOTA 3RN8A 1LFGA 1N3XA 1LFIA 3F11A 1B4HA 4NF5A 3IO4A 1UTBA 3A09A 3MPLA 4FEBA 3L6HA 2HQ0A 2IA4A 1B3EA 1NNPA 3DLNA 3PPQA 1IXHA 3IR1A 1XVYA 2DYXA 3IOTA 4R2FA 1FQEA 3TEPA 3O9PA 5DVIA 1H45A 3VXBA 1OQHA 2XXPA 3FZVA 1B5JA 5A5XA 4GL8A 3FATA 3GBAA 3OENA 5H8FB 3U92A 3O2AA 2W7YA 3PD9A 1VR5A 2Y7KA 1MDP1 1I69A 2ZNUA 3LC8A 3FD3A 3PPPA 3CG3A 1Y1ZA 4E0WA 1PC3A 1TXFA 1B1XA 3D4GA 3PMVA 5CMKA 5DTBA 4R6KA 4JB7A 3CI8A 2NOOA 3TCHA 1B58A 3KJTA 1NMUA 2V3QA 5HBCA 4PE5B 5L9MA 1SYHA 1KWHA 2RINA 2AL4A 3IJXB 3O6GA 3MZ1A 4HCWA 5K2XA 5I56B 4U2RA 2QMWA 1MM7A 3SDFA 3RY3A 4R6YA 2XXWA 1P1OA 4DCYA 1AMFA 3TTNA 5CMCA 2QRYA 2RKMA 1BIYA 2VD3A 3QUFA 3FV2A 2DVCA 3T93B 4NE4A 3S4UA 2HEUA 4OYVA 1PBPA 4U4XA 4XKRA 4BDOA 4OXVA 2RCAA 3B6TA 3BBRA 5KZTA 1MY0A 4OEVA 3TDJA 3DP4A 3R26A 3G3JA 4NWCA 5TU0A 3QK6A 3MZBA 1DTZA 3MVWA 4KHZE 1GVCA 1GV8A 3K2DA 4AB6A 1POY1 3H03A 4IY5A 1UQWA 3QSLA 2Z8DA 4R72A 4DLDA 3H4ZA 4PFUA 2Z8FA 5TP9B 1Y9UA 1NH8A 1P99A 3HO7A 4R75A 3KN8A 3T9VA 1LB8A 3TTKA 4OFJA 1MXZA 3KZGA 4R6HA 5AA1A 3IJOB 1OVTA 2ZXTA 1A99A 4YB6A 3G3IA 3CFZA 2OK2A 3LR1A 2Q88A 3MZ9A 1OIBA 2I4CA 2GFEA 1GR2A 1O64A 5IAIA 4HS7A 4OWDA 3EHSA 3C31A 4F39A 3CR9A 3K01A 4G4PA 4YB7A 2XD3A 1Y3PA 4JSDA 2NVUB 1NL5A 3QUJA 3MWBA 3N94A 1T0KA 3TUSA 2QL3A 5CRYA 1BTJA 1NNKA 1AIVA 2D21A 2DQVA 4HW8A 3K1MA 1I6BA 5H8QB 1H3DA 3OEKA 3SESA 2RC8A 4M4GA 2H5YA 3R7XA 5CM6A 3KOSA 2XXIA 2Y84A 1YPNA 4ZE9A 3SETA 4NTLA 1WDNA 1R9QA 1SDXA 5L9OA 3H6TA 3Q27A 4GFRA 3OO7A 4PFYA 3FJMA 3IX1A 2THIA 4GLIA 1IXCA 4WXJA 3RNNA 1LBCA 4O3AA 1FTJA 2FNCA 4P11A 1I6AA 4DXUA 1D3KA 4DIGA 1AOVA 4OTEA 2H4IA 4ELRA 4RPOA 3LUYA 2PBWA 1XS5A 2UXAA 3PUVE 4BDMA 1IITA 3TYHA 4U22A 3K4UA 4YZZA 3O29A 1NKXA 3FXRA 1OLCA 4F22A 3C34A 4F3SA 4XTCQ 4GXSB 3B7DA 3TMGA 3UORA 2F5XA 2O6AA 1US5A 4G77A 4F29A 1UTBB 2Q2AA 1QULA 3PUZE 4NF8A 1ZU0A 3MW0A 1N84A 3VVEA 4OFOA 4PP0A 4RJZA 4JSOA 4RXLA 4ZZAA 3M3LA 4BDNA 3RUMA 5AA2A 1LSTA 1QW0A 4NWDA 3ONMA 4U1ZA 3WAFA 4QFOA 2AIXA 3PMWA 5ITOA 1JEUA 3ILUB 2I3VA 1WVJA 4DDDA 3U1OA 3EN3A 4Q0CA 5DEXA 4EQBA 4Q5TA 2F6PA 5JTYB 1H44A 2ZYMA 3CRBA 1LGBC 4QF9A 1HSEA 3U72A 5H8HB 3K1NA 3TODA 1BLFA 2GHAA 2PT2A 4ND9A 5CMBA 3C4MA 2QS4A 1IXIA 2F8DA 1FCKA 4F1YA 1MM6A 3CFXA 1USYE 2QSXA 3EHTA 3CVGA 5L9SA 3R6UA 4H65A 5FHOA 1UTHB 3S2VA 1MQIA 3JZJA 3G3HA 1USYH 3VV5A 3VXCA 3SEXA 4G68A 4H67A 2O1LA 1P1QA 4HCYA 3Q25A 1IQ7A 2RC9A 3FVKA 3ZSFA 3KSJA 1OLAA 2P1SA 4DZ1A 3S9MC 1JEVA 3QXMA 4F31B 3O28A 1ZJLA 4ZEIA 1FW0A 1B7ZA 4RPNA 4LONB 4H5FA 1MDQA 2R71A 1TT1A 2QMXA 4EQ9A 4XKNA 1N7XA 1URDA 3PV0E 5DVJA 3RT6B 1MQJA 2DE3A 3CFLA 5H8NB 1EZ9A 1CE2A 3KEIA 1OQGA 2XD2A 1EU8A 2O51A 4ZDMA 1ZMGA 5TPAA 2RC7A 3H3GA 2A5TA 4PFTA 3E13X 3MVYA 3T9UA 4DXCA 3VVFA 2OWSA 4ECFA 3UIFA 2QS3A 1JETA 4E0XA 3LSXA 2REGA 4JBZA 4YMBA 1B3FA 3OSQA 4YAHX 3TTRA 2F7AA 3N6UA 1LCTA 3Q26A 3SKPA 2XXXA 1B4ZA 3K00A 4X9TA 2I3WA 1IXGA 3K6UA 3EF7A 2F34A 1B46A 3PMXA 3O6HA 4YKKA 3UK4A 4F3BA 3ZKKA 5I2KA 4G8MA 1XHYA 5I59B 1M5EA 4LUBA 3EPEA 2G93A 2V3UA 4R2BA 2DP8A 3MAMA 1J1NA 3SEUA 1FTOA 4RK9A 4Q30B 2VOZA 2Y7PA 2Z22A 4L17A 3M3KA 3TTLA 5JK4A 1O63A 1DSNA 2HAUA 3C33A 4LQ2A 1MPCA 4Z0IA 2XXTA 2H99A 3TFLA 5CBSA 3GXAA 2NXOA 2VP1A 3L6GA 5F1QA 2F7CA 5CC2A 4KYEA 4UA8A 3OD7A 2OBGA 1SW4A 1B0LA 2FA7A 1JQFA 3ECRA 3S9LC 3VVDA 4NF6A 1SD3A 2FYIA 2OWTA 5EYFA 3KFMA 1F9BA 3IB1A 1I6QA 4TLMB 4GOTA 2P2AA 1Z7NE 3BFUA 1H43A 3H6UA 1MXYA 1N3WA 3IORA 4C1TA 4IGRA 1IIWA 5I2NA 4ZEFA 2Q9TA 3MP1A 3BFTA 4QSDA 5JEIA 1M5DA 4KPTA 2ESNA 3TTMA 1AH5A 4KYSA 2PT1A 4N07A 5HM4B 5FHMA 4P0GA 4NF4B 3ZS6A 1IEJA 2DWAA 4QFNA 3PPOA 5B7DA 3TCFA 4FORA 1ZLQA 2B65A 3IOUA 4X1BA 5I58B 1A8FA 3S9EA 5H8SA 5LOMA 2ZNTA 1IUDA 1CB6A 2X26A 3ODBA 3DP6A 1XVXA 3SEYA 3T96B 2O68A 1Y3QA 4BDQA 3RQTA 1B3GA 2O1MA 2KLFA 3C35A 1B2HA 4WEDA 3TCGA 1MY3A 1VSOA 5AE4A 4IO2A 1MPDA 2QPQA 1QKAA 5H8FA 4YKIA 2XX9A 1EZPA 3W9VA 3FIRA 1B5HA 3TELA 4F3PA 4MLVA 3OO6A 1S9TA 1DPEA 3TQLA 4EDPA 3OOAA 3QAXA 3MJNA 3K6WA 4XKPA 3N6TA 3W15C 1B5IA 2ZYKA 4OFLA 1ZIUA 3RT8A 1ANFA 4R73A 4POXA 3IOWA 4MLQA 1MQDA 4G68B 3B6QA 4PQJA 4F19A 4AB5A 4P0IA 4QFPA 4LP2B 3FXUA 4EXLA 3ILTB 3A3UA 1JNFA 1MH4A 1GTKA 4X48A 3Q28A 3SEWA 4EQ7A 4ZS9A 2I58A 1B51A 2GH9A 3THIA 5B70A 1SW2A 1Z7ME 1SW5A 3D4CA 2H25A 3TZAA 2UYEA 3WAEA 1RYXA 2V84A 1JVXA 2VD2A 3M3FA 4O3CA 4UACA 1SI1A 3PPRA 1QUKA 3N5LA 5HPQA 4LZ7A 3V83A 4NF5B 1LCFA 4R9FA 2A5TB 1AL3A 4IB2A 3OO9A 1EZOA 3TKDA 3HCQA 1B1HA 1MQGA 2X7QA 3V89B 3MVXA 4ELPA 4GRKA 3PPNA 5DVFA 2DXYA 1JW4A 1FTLA 3HHGA 5A5XB 4TLLB 4I8CA 1RYOA 3K02A 1XC1A 1NNFA 3K1PA 1VE4A 4ISUA 4R74A 2D3IA 3E9XA 4H8JA 2VHAA 4IO3A 3T66A 1FTMA 1HSLA 4YKJA 2E0SA 2UVHA 4ELQA 4LATA 1Y4CA 2OJTA 3K6VA 3IB2A 3FASA 1D9YA 2P0SA 4ZE8A 4H1XA 3T9HB 1A8EA 2Y7RA 1N0TA 3LSFB 4BDLA 4EXKA 2YJPA 2XXQA 2V3TA 2XXUA 3C32A 1OMPA 2Z8EA 4JDFA 4JWOA 3H06B 4G2ZA 2UVGA 2O84X 3DM0A 5CMMA 4ZEKA 5ICTA 4IO6A 4KCCA 1R6ZA 4AQ4A 3RPWA 1PB9A 1JVYA 3UP9A 3FJ7A 5EHMA 2Y7WA 1YCJA 4FATA 5H8QA 3KN3A 1ATGA 4PETA 2HXWA 4I62A 1P1WA 1PEBA 3Q29A 1IZ1A 4FEDA 3FUZA 2D5WA 5I57A 4OMBA 1B0HA 2IEEA 1PBQA 1UIUA 1N04A 4LVQA 2I6EA 3GLBA 3FVNA 3N26A 3QIMA 1TFDA 4MH5A 1M5FA 1A54A 4F1VA 5F7VA 2G29A 4KR5A 1MY1A 2XXRA 1MXWA 3EQ1A 2GHBA 4QHQA 1US4A 3MBPA 1Y4TA 3TAJA 4G8NA 4YB5A 2LAOA 4QFLA 2Q89A 2DWIA 1MXXA 1MXVA 2OZZA 4GVOA 1MG1A 5AA2D 4N13A 4OHNA 1RKMA 1Q1KA 1TFAA 1NNTA 4JWXA 1HSJA 4YICA 1II5A 2NUVA 4F1UA 1ZBMA 5FTIA 2ONRA 3LBSA 4G8HA 2ABHA 3CSGA 1Y20A 1XOCA 3KG2A 1MQHA 3HHFA 4FAJA 3TQWA 1B32A 3G3GA 1P1NA 1Y3NA 2HFBA 3MP8A 2YPNA 2B3FA 1DTGA 3FVOA 3V5AA 1LAGE 4Q8RA 3KN7A 4H8IA 4GD5A 2AYSA 1NFTA 2O7IA 3HPIA 2B3BA 2H98A 4MFIA 2NWJA 1P1UA 3E4RA 3GZGA 5I84A 2XHDA 5KCJA 4ESWA 2ALUA 3QYTA 4GQOA 2QJEA 4FJPA 2H9BA 2V93A 3VLVA 4DE8A 1NH7A 3LSLA 4F2OA 3RLFE 3FVGA 4HTGA 3FGSA 3H6WA 4ONYA 3IOVA 4EUOA 2XXYA 2AL5A 1B40A 1DPPA 4MBPA 4H6DA 3UA8A 4RNSA 4DCXA 4BDRA 3PGFA 1FQAA 1BKAA 1SVXB 5JTYA 5FTHA 3MQ9A 3IL1B 2I0CA 2GRVA 4OETA 5KDTA 5H8HA 4H0WA 4LA9A 3O97A 4KYDA 1LAFE 2Q8JA 3DELB 5ITPA 4U4SA 4RY1A 2ANJA 1D4NA 1ELJA 3KSXA 1ZKBA 1SYIA 4YKPA 1SQYA 1GGGA 3AXFA 4OQOA 2A5SA 4Z7EA 3JYRA 1FQDA 3IB0A 3OELA 1UTHA 2PVUA 4GF8A 3VE1B 4K3FA 3FJGA 1URGA 4WKMA 3TPAA 5DYHA 2M8CA 1B7HA 5EHSA 4GIZA 3W9WA 5DT6A 2OLBA 2I48A 2ZYNA 4EF1A 4U23A 3U8QA 3V8XB 3KBRA 5AA4A 4NF8B 3UGWA 2R6GE 4OVJA 3LSWA 3VFJA 1B3HA 2O69A 3BKIB 3A3CA 1FQBA 3G3FA 4XKQA 1JW5A 5AA2B 2F7BA 1EH3A 3I3VA 4KQPA 2ZNSA 3K0VA 2YLNA 2DXRA 4O3BA 2REJA 1LAXA 1MPBA 4QSCA 3VDFA 5H8NA 4ZZEA 2ONKE 1VFEA 4IY6A 2HZKA 4FE8A 3T9XB 3P7IA 3E3KA 3CG1A 4TOZA 2F78A 4JWYA 1A40A 4MF3A 1MXUA 3T22A 5DEXB 2DSFA 3CSBA 4FIMA 4YMAA 5FHNA 2I0BA 4G68C 2DS9A 1B05A 3HV1A 1ZTYA 2DWHA 4OERA 3OMBA 1VFDA 4QFKA 3JV9A 2I49A 1LAHE 5BWJA 3OXNA 4RA1A 4IO4A 4GXAA 2HZLA 2Y7IA 2QS1A 1MS7A 3I6VA 2UYFA 3FV1A 3VLUA 3MC2A 4KFQA 3H6VA 3S9NC 1FTKA 3VLWA 1L5TA 3C9HA 2PX1A 3H7MA 2X7PA 3U94A 2Q2CA 4IO5A 3C36A 3PD8A 2E1SA 2F97A 4XXUA 2RF1A 3RGYA 2DOJA 5I57B 5I59A 1QUJA 4RK2A 3HSTA 2F36A 2Z23A 1SBPA 2DE4A 4ESXA 3RTWB 1B7UA 4ZECA 1O7TA 4QRZA 5I56A 1H76A 4N6PA 2RCBA 4EF2A 2QS2A 4F18A 4X1DA 1PB8A 4QSEA 5J1DA 1B52A 4U21A 3IAZA 3K6XA 1XT8A 4M1VA 4WEPA 1MY4A 1QKBA 3IK6B 3OSRA 4KI0E 3EHUA 4ZEBA 4FECA 4NMYA 1PB7A 3ZKLA 4JXIA 5TPAB 1B9JA 3KOTA 4RYAA 1MRPA 3I5OA 2F35A 1Y1MA 3U93A 1YAEA 1QJMA 1B3LA 4OEUA 4TQUQ 1R1NA 3RTFB 3MVZA 5IKBA 1S50A 3PUXE 1YTVA 1MY2A 3USDA 1S7YA 4LZ8A 4BLAA 3PU5A 2HCAA 5ELVA 4PFWA 3G7WA 2O7UA 4GL0A 3SERA 4OESA 1A55A 1A7LA 5TP9A 1SW1A 1MH3A 1Q35A 4YU0A 5KCJB 4NEDA 4NF4A 4F3GA 3OEMA 2PYYA 5CBRA 2ZMBA 4KCDA 5AA3A 1JW1A 1QUIA 5I2KB 2VGQA 1LFHA 2CZLA 4U1OA 3O6IA 5I58A 5M2VA 2CMOA 4OZ9A 2DE2A 1TWYA 4I1DA 5ICQA 2XX7A 4LZ5A 1BP5A 3B6WA 2WKYA 4ELOA 1D9VA 3PUYE 1DMBA 4GWOA 5L8DA 5KDTB 1OVBA 2F6GA 3CIJA 3O66A 4POWA 4C1UA 4H5GA 1QVSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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