5JTYA

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
283
structure length
262
Chain Sequence
b'TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQEKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, receptor
total genus 66
structure length 262
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA02
4NWDA 2RCBA 3MQ9A 2ONRA 2ESNA 3B6QA 3UP9A 1B5IA 2XXYA 4POXA 3IORA 2ZNTA 2HEUA 2F34A 3K00A 1R1NA 1JQFA 3UN6A 3TTMA 3OD7A 2ANJA 5I57A 1I69A 4I62A 1NFTA 5KCJA 3T9XB 5I56A 1I6AA 4EUOA 3JZJA 1DPPA 4GL8A 3V89B 4XXUA 4JB7A 5AA3A 2ZYMA 3S9EA 1LAFE 4DXUA 4F22A 4U4SA 1SW1A 3PPOA 3QSLA 3ILUB 4EF2A 1FQEA 1QJMA 2THIA 2REJA 2XD3A 4DIGA 1CB6A 1XT8A 3PPRA 3G3HA 1O7TA 3VLWA 3M3FA 3DP4A 4R9FA 3ONMA 4DDDA 2AYSA 3TCFA 1ZKBA 4XKNA 1M5BA 3FGSA 2QS4A 2RCAA 3MP8A 3EHUA 3BKIB 1DPEA 1IQ7A 3H6TA 4IGTA 4N13A 2R71A 3TTLA 3K02A 5F7VA 3HSTA 4O3AA 1NNTA 2DVZA 4RPOA 2OWTA 3A3UA 4GOTA 3W9VA 4X9TA 1QVSA 1Y3PA 2GFEA 4DLDA 3SDFA 3IOTA 1A54A 1IXCA 3I5OA 2O7IA 4QSCA 3FASA 4U22A 1OLCA 3G3IA 1B1HA 1Y3NA 3RLFE 2UVIA 4ZEDA 3DP8A 4ESXA 2O69A 1GR2A 2F8DA 4U4XA 3ECRA 4GFRA 4DXBA 4NF6B 5AA4A 1UTBA 3SEYA 4ECFA 4NEDA 4G68C 3I3VA 1SI1A 3RTWB 4LVQA 3CRBA 1JEUA 1EH3A 3HPIA 4Z7EA 1EU8A 2R6GE 1B3HA 4G68B 2A5SA 2XXPA 3OO7A 4HW8A 1M5DA 3KSJA 4N07A 1S50A 4G8HA 4OEUA 4OMBA 1XHYA 4KD5A 4MFIA 3I6VA 4LQ2A 1OIBA 3Q29A 1MXXA 1SW2A 3E9XA 2PT1A 2ZYNA 4OTEA 3DM0A 3LSXA 1B4ZA 2Z23A 4ZZEA 3KEIA 1P99A 2I3WA 4KHZE 3CFLA 1WVJA 4YZZA 1SW4A 3RTFB 2AL5A 5ICQA 1LFHA 4G77A 1FTMA 3IR1A 1EZPA 3O6IA 1TT1A 3LUYA 4U21A 5I58B 1FTKA 1B2HA 2REGA 3RN8A 4IB2A 3RGYA 4QRZA 3TYHA 1OQGA 1SBPA 3TUSA 4KCDA 1B05A 3PD9A 1IUDA 3GBBA 3B6WA 2ZYOA 2OJTA 1B7HA 1M5EA 4LA9A 4PE5B 4C1TA 2H4IA 1Y3QA 2P0SA 5LOMA 3IB1A 4HCYA 3CR9A 5DVIA 1VR5A 5FTIA 2ALUA 4HCWA 4TLMB 2X26A 3GZGA 5HPQA 1URGA 2H5YA 5DYHA 3G3JA 3BFTA 2HFBA 5ELVA 1DTGA 1B7UA 1B46A 1M5FA 3QYTA 2HZKA 2RC8A 2OCUA 4KYDA 2F6GA 3T9VA 1Q1KA 2GRVA 1N84A 3B7DA 3SETA 1FTJA 1POY1 1MQGA 4EXLA 5I57B 4YU0A 3U1OA 1MG1A 4YB5A 5KCJB 3IOUA 5I56B 4GD5A 2QSXA 1B52A 2QS1A 3TFLA 4PFWA 1DMBA 1AL3A 4ZEKA 1MH3A 1MS7A 5CC2A 1CE2A 1MDQA 3OOAA 4ZEBA 1BIYA 2M8CA 4K3FA 4FE8A 3VV5A 1QUIA 3GBAA 4OFJA 1N7WA 1P1OA 4NF6A 1VE4A 1LFGA 4OFOA 1MQDA 4LUBA 4R73A 5ITOA 4F3GA 3OELA 3MC2A 1USYH 1SDXA 1MPBA 2Z8EA 2DWAA 1D3KA 2Z8DA 4GRKA 2F97A 1A8FA 4E0XA 2HXWA 5J1DA 3MJNA 4OZ9A 5TPAA 3S9MC 5K2YA 4POWA 2O68A 3ZKLA 3ILTB 4R6HA 3TKDA 3KFMA 1URSA 1IITA 3FJGA 1B3FA 1PB9A 3MVYA 1XS5A 1P1NA 3PMWA 1PB8A 2QRYA 3FIRA 1B5HA 4JBZA 3HHGA 2Y84A 4KPTA 2Q2AA 1EZOA 3FVNA 2F7CA 2Y7RA 1LB9A 3IJOB 4TLLB 4YB7A 3K6UA 1MQHA 4E0WA 1H43A 2VOZA 1B51A 2UVHA 2LAOA 3MW0A 5H8NA 5TP9A 5AA2D 4F2QA 5L9OA 2I0BA 1UTBB 4DZ1A 2UYEA 2G29A 2H99A 4NF5A 2O7UA 2X7PA 1WDNA 1ATGA 3IAZA 2CZLA 1YTVA 3FXUA 4H67A 3M3KA 2XXRA 1TFAA 4PP0A 1ZTYA 4GWOA 3GXAA 1O63A 3K1NA 4IGRA 4XIGQ 3RPWA 3EQ1A 4R74A 3S2VA 1N3WA 2D5WA 4LZ8A 3TZAA 3DELB 4QFOA 1R9QA 3IOVA 3G7WA 4MLQA 4H1XA 2DWIA 3O6GA 5I59A 3N94A 3G3GA 2DS9A 1UTHA 4RXLA 2PMSA 2I4BA 4DXCA 3OO6A 1SYIA 3F11A 1FTLA 1JVYA 5BUUA 2QL3A 1QW0A 2I58A 3PPNA 4PFYA 1A99A 1ZU0A 4IO5A 1LAXA 3KOSA 1FQFA 2I4CA 5H8FA 3UORA 2XXQA 1MXWA 3T93B 4MF3A 5DVJA 3FJ7A 4TQUQ 2O1MA 4JDFA 3TTKA 2XHDA 4ZE8A 1ZMGA 1JEVA 2O6AA 4LZ5A 2NVUB 1L5TA 2FNCA 1USYE 2DQVA 1SD3A 3T66A 4RJZA 3OXNA 1FTOA 4JXIA 4FORA 3IO4A 5HBCA 3G3KA 1QULA 3HCQA 1A8EA 1F9BA 3CVGA 4ZDMA 2PVUA 1ZLQA 3K1PA 3M8UA 4JWOA 1OMPA 5L9MA 1MXUA 3HV1A 3PUZE 3K6VA 2PT2A 4KCCA 3H6VA 1NMUA 1N76A 3C33A 3O97A 4IO3A 2VHAA 3IB0A 1II5A 4QHQA 1ELJA 1H44A 3Q27A 3VE1B 4F1YA 4R6KA 4I8CA 3OMBA 4EF1A 2D3IA 2Q9TA 5CM6A 2VP1A 1TWYA 2E1SA 3H4ZA 1N0TA 3QXMA 3OO9A 3TQLA 4U1ZA 3Q28A 4OQOA 4KI0E 3C4MA 2OBGA 4X48A 4ZZAA 3K0VA 1S7YA 3VLVA 5A5XA 3H6UA 1NH8A 1BLFA 3U93A 3TEPA 5EHMA 3EF7A 3TCGA 4YB6A 4ND9A 3VFJA 4UA8A 4ZEFA 2RC9A 1B0HA 1MM6A 3PUXE 1IXHA 3PPPA 2RC7A 2F7AA 4IO4A 1US5A 1B0LA 3MUQA 2OWSA 1GVCA 1SW5A 4YKKA 1H76A 2DYXA 2KLFA 1HSLA 1Y1ZA 2DE4A 4XKRA 3IL1B 4YMAA 5CI5A 1MPCA 2XXXA 2OZZA 5EHSA 2VGQA 4RY1A 1LBCA 4FEDA 3TTNA 5CRYA 3TPAA 1B5JA 1GGGA 4GVOA 2QMXA 2I48A 2YPNA 5TPAB 4WEDA 5CBSA 5DVFA 1VFEA 4GXAA 1VFDA 4FATA 4X1DA 1MQIA 4XKPA 4FIMA 3MVZA 1VSOA 2Q89A 2XXTA 1B40A 1QKAA 5JEIA 5KDTA 3N26A 1T0KA 1MQJA 2HQ0A 1B1XA 3VLUA 4M4GA 3N6UA 3ODBA 1R9LA 1NH7A 3W15C 1ZIUA 3PD8A 4WKMA 1MY1A 4JWYA 3T9UA 2ZMBA 2I49A 1SQYA 4RPNA 3SEVA 5H8NB 5TP9B 2D21A 1QKBA 3TDJA 2V3TA 1AIVA 2DP8A 2XXHA 3T9HB 4NF5B 2CMOA 3BFUA 3PMVA 3VDFA 3EPEA 5B7DA 3RQTA 3KBRA 4ZS9A 4FECA 4H5FA 1MRPA 2V93A 3KJTA 4KFQA 3QUFA 4NF8A 4N6PA 2A5TA 2Q8JA 1Y20A 1QUKA 5AA2A 3SEXA 2Y7KA 3H06B 1JW1A 3SEUA 5F1QA 4QFNA 5I59B 3FV1A 3SESA 1UTHB 2XXUA 3PUWE 3IK6B 1ZJLA 4F39A 3CG3A 1SYHA 2F5XA 4EDPA 4F1UA 5FHOA 4QSEA 4ELQA 4ELRA 3MVXA 2ZNSA 4GF8A 1LB8A 3RNNA 5H8FB 1IXIA 3LR1A 2E0SA 4H65A 4BLAA 3PU5A 1I6BA 2P2AA 2NUVA 3E3KA 5CBRA 5CMBA 2RF1A 3L6GA 3QIMA 4O3CA 1RKMA 4HS7A 3N6TA 3TODA 3LBSA 1AOVA 1GTKA 1JETA 4OETA 3U72A 2AIXA 1ZBMA 4YKJA 1XVYA 2PBWA 1TXFA 2DWJA 3JV9A 3P7IA 3PPQA 3H7MA 4EXKA 3TAJA 4OERA 1IXGA 3MZ9A 4U1OA 1OVTA 1Z7ME 3KSXA 3SEWA 4Q5TA 3R26A 4RK9A 2XXVA 1HSJA 4JSOA 2ZNUA 5AA1A 2B65A 3GLBA 3K01A 4G8NA 4NF4A 4LATA 3O29A 3LSWA 3TELA 4YICA 3A3CA 1Z7NE 3PUYE 3K6XA 1MY4A 3D4CA 1N3XA 4OWDA 4F3SA 3UK4A 1P1QA 2XX8A 1FCKA 5A5XB 4YAHX 3K4UA 3AXFA 4KR5A 1J1NA 3OSRA 5BWJA 2O51A 2W7YA 4F3BA 2FYIA 2H9BA 4QFKA 3CSBA 4LONB 3HN0A 5IAIA 1M5CA 3KOTA 3L6HA 4BDNA 3THIA 5KZTA 4RK2A 3ZKKA 4MBPA 1MXYA 4MLVA 4H6DA 3KN3A 3ZS6A 3MP6A 5B70A 3O9PA 4ISUA 4F18A 4BDOA 2NOOA 4Z0IA 1LBBA 1IZ1A 1B32A 4R72A 1Q35A 1IEJA 1MH4A 1FQAA 4ONYA 3K2DA 5H8HA 3V83A 1P1WA 4BDMA 2PX1A 3KJ7A 4RNSA 4ELPA 1YCJA 2QS2A 2GHAA 3UA8A 2UYFA 2VD3A 4F29A 2DOJA 3VVEA 2QPQA 5JK4A 3QK6A 5I2NB 5KDTB 3FXRA 3EN3A 3TMGA 1A55A 4R75A 2I0CA 4ESWA 4OYVA 3E13X 3G3FA 1FQDA 2G93A 3C31A 3RY3A 2ZXTA 3MPLA 5FTHA 4JWXA 2ZYKA 4P11A 3FUZA 1PC3A 3SERA 4H8IA 3IJXB 1XC1A 4KQPA 2XX7A 1OQHA 1B4HA 1QUJA 4GLIA 3H3GA 4QF9A 4H8JA 4ELOA 3VXCA 5K2XA 4YMBA 1A7LA 1MDP1 2IEEA 1B3LA 4LP2B 4C0RA 2V84A 4FEBA 5CMMA 3KG2A 1HSEA 3O66A 1B7ZA 3PMXA 1D4NA 1LFIA 4NF8B 1IIWA 2A5TB 1PBPA 5AA2B 3U8QA 3O6HA 1D9VA 4IY6A 3HO7A 3S4UA 2FA7A 4DE8A 1RYXA 1Y9UA 1UQWA 3QAXA 1LSTA 2WKYA 5JTYA 2OK2A 2Z22A 2HAUA 1H3DA 1Y4CA 5DEXA 4R2BA 2V3UA 3OSQA 2XXWA 3EHTA 3RT6B 5H8QA 1B9JA 2Z8FA 4AB6A 3PGFA 2ABHA 3O2AA 2PYYA 4ZECA 4U2RA 2VD2A 4I9DA 1EZ9A 2V3QA 4R6YA 1NNFA 3OEKA 1TFDA 2XD2A 3U92A 1OVBA 1I6QA 5ICTA 4F1VA 2QS3A 4P0IA 4GXSB 1FQBA 4EQBA 3QUJA 3D4GA 3EHSA 3MAMA 5FHMA 3MWBA 2UVJA 2HZLA 3UIFA 5CMKA 3CSGA 1YPNA 4TOZA 4ZEIA 3FXQA 3H03A 2Y7PA 4GQOA 1B3GA 5TU0A 1LGBC 5DTBA 4NE4A 2O84X 5I2KA 3R6UA 2F78A 1SVXB 5ITPA 2DVCA 3LC8A 5M2VA 3M3LA 3C35A 1PBQA 4PFTA 1UIVA 3MBPA 2ONSA 3FATA 4RA1A 4UACA 1BKAA 2QJEA 4NF4B 3Q26A 2YJPA 4R9GA 3DP6A 2R9JA 5EYFA 4LZ7A 4G8MA 3C9HA 3S9LC 1LLSA 3IO6A 3V5AA 3FD3A 3OEMA 3C32A 4QFLA 3FJMA 1URDA 2Y7WA 1MY0A 3MP1A 1FW0A 5I2NA 2H25A 3T22A 5CMCA 3IB2A 2P1SA 2Q2CA 3TTRA 1R6ZA 1DSNA 2GH9A 4U23A 3KZGA 4WEPA 1B3EA 4G2ZA 4GL0A 4F3PA 2F35A 1MXVA 3T96B 3IOWA 2F7BA 3S9NC 1WODA 4IY5A 3IX1A 4MH5A 4M1VA 3CFXA 2BJJX 4IO6A 1B6HA 1LCTA 5I84A 1LAGE 4O3BA 3A09A 2XXIA 4BDLA 4C1UA 1AH5A 1N7XA 4NTLA 3K1MA 2ONKE 3RUMA 2Q88A 1MM7A 3H6WA 4KYEA 4Q30B 1O64A 3V8XB 4OVJA 3TCHA 4OENA 5IKBA 4IO2A 3RT8A 1NNKA 1JVXA 4F19A 1YAEA 1DTZA 3MZ1A 3CFZA 1MXZA 3JYRA 4FJPA 2I3VA 3CI8A 5H8HB 1LAHE 3KN8A 2HCAA 3KN7A 4OESA 5AE4A 5H8SA 1US4A 4PETA 1GV8A 1H45A 2QMWA 3LSLA 4NMYA 4AB5A 1BP5A 4OXVA 3USDA 4GIZA 4NWCA 3WAFA 4Q0CA 3OO8A 3DLNA 4F31B 4L17A 1OLAA 4PFUA 4BDRA 4G4PA 3ZSFA 4QSDA 4ZE9A 2IA4A 2O1LA 1KWHA 2DXYA 1JW5A 2B3FA 1Y4TA 2OLBA 3K6WA 4AQ4A 2V25A 2H98A 1XVXA 4DCXA 2DXRA 1NL5A 5L9SA 1JNFA 1P1UA 1SI0A 4THIA 2DSFA 2YLNA 3CIJA 3N5LA 2RINA 1N04A 4QFPA 4P0GA 4OEVA 4FAJA 4OHNA 2I6EA 3VVDA 4RYAA 2RKMA 1XOCA 1S9TA 3U94A 3FZVA 1DOTA 2GHBA 3VVFA 4EQ9A 1MY3A 4G68A 1BTJA 1NKXA 3PV0E 5JTYB 3B6TA 5DEXB 1UIUA 3C36A 4JSDA 4KYSA 2DE2A 3FVGA 1MPDA 5H8QB 3FVOA 3PUVE 2XX9A 1A40A 1ANFA 2DE3A 3MZBA 4PQJA 5L8DA 3WAEA 3FV2A 1D9YA 1FQCA 1NNPA 3C34A 1POTA 4F2OA 3MVWA 4H0WA 4IO7A 3OENA 4BDQA 2NWJA 2UVGA 3SKPA 3TQWA 2NXOA 2Y7IA 5FHNA 5HM4B 5I58A 1B58A 1MY2A 3HHFA 4OFLA 2UXAA 3KGCA 4I1DA 1PDAA 4YKIA 1LCFA 3Q25A 3BBRA 4R2FA 4XTCQ 5AA4B 4DCYA 5I2KB 2HAVA 2DWHA 3E4RA 3FVKA 3O28A 3W9WA 1PB7A 5DT6A 4H5GA 2F36A 3CG1A 3VXBA 3LSFB 1PEBA 4YKPA 4XKQA 2B3BA 3MPKA 5ISUA 4EQ7A 4HTGA 2F6PA 3UGWA 4X1BA 2AL4A 3R7XA 4WXJA 4LQ5A 4Q8RA 1JW4A 2X7QA 1Y1MA 1RYOA 1AMFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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