5JTYB

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
279
structure length
276
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
total genus 79
structure length 276
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB02
1N7XA 4IO3A 3K1MA 2XXUA 3HHGA 2LAOA 3G3FA 4KCDA 1FTLA 2UVHA 3KOTA 2H98A 1QW0A 3RGYA 3MAMA 3KEIA 3H06B 4Z7EA 4PE5B 1MQIA 1QKBA 4PFTA 2RC9A 2VD2A 2V3QA 1M5BA 2F78A 1A8FA 3G3JA 2DE4A 3VLVA 4KYSA 2I48A 4NF6B 4H8JA 2H5YA 4JSDA 4ESXA 3W9VA 4F1YA 5JTYB 3VLUA 3SESA 2Y7RA 3DM0A 2B3BA 2YPNA 1MXZA 3UIFA 3VDFA 3FVNA 4U23A 1URSA 2YJPA 5FHNA 4NF5B 4TOZA 1ZU0A 3THIA 1XS5A 3MVWA 4EXLA 3S4UA 1A55A 4R74A 3IX1A 1IXIA 3TCHA 3R6UA 4OEVA 3HO7A 5DEXA 4UA8A 4ELOA 4U1ZA 4E0WA 3M8UA 4X9TA 1NNPA 5FTIA 3VXCA 3PPOA 3QK6A 3SEWA 1L5TA 5ITPA 3BBRA 2O51A 3IJOB 3UGWA 5BUUA 5EYFA 5H8QB 3T9VA 4BDOA 5I56B 4BDLA 4GL8A 3O6IA 2Q8JA 4OHNA 3UN6A 1PB8A 3S9NC 4IY5A 3FJMA 2DWIA 5I2NA 1FCKA 2RCBA 4ZZEA 3EHTA 3MZ9A 3TZAA 5B70A 1O64A 1Y1ZA 3TCFA 2NOOA 1QULA 4POXA 3MZ1A 3U93A 1AMFA 2XX9A 1F9BA 2X26A 3KJTA 1B3GA 1LGBC 4H65A 4JB7A 2V84A 2O69A 3TTNA 5I59A 2F7CA 1N84A 4LQ5A 2XXRA 2I0BA 4U4XA 4OQOA 4WEPA 2W7YA 1S50A 2WKYA 5CMCA 3ECRA 1XVYA 3TCGA 1JW1A 4HS7A 4BDRA 5H8FA 4YB6A 1MQDA 3ZKLA 1A7LA 4XTCQ 1FTKA 4OFLA 4GOTA 2HAUA 2NUVA 4YB7A 4ZEFA 2O1MA 3K6WA 5EHMA 3O66A 1B40A 3C31A 2HCAA 4MLVA 2NXOA 2R71A 4ZE8A 3KN3A 1J1NA 1QUKA 1MXUA 2X7PA 1D4NA 1EZOA 1QKAA 2DWHA 1VFDA 2D5WA 5KCJA 2RF1A 4GWOA 3VVEA 4LP2B 3FVKA 2XXYA 1OMPA 3OOAA 2Q9TA 1O63A 2V93A 4HW8A 3FGSA 4OENA 1AL3A 3KFMA 5CMKA 3IOTA 4YU0A 4JWOA 4EDPA 4YKJA 1A8EA 3RT8A 4O3CA 2OWTA 4U21A 1Q1KA 2PYYA 4H5FA 1MM7A 4P0GA 3ILTB 3TQWA 2Z8FA 2OLBA 3RN8A 5CBSA 5ITOA 1PB9A 3TPAA 1WDNA 3S9MC 3ONMA 1DOTA 3T96B 4XKPA 4GXAA 5DTBA 4DDDA 5H8NA 5IKBA 1B1HA 4FAJA 3VFJA 1FQFA 2Y7PA 1D9VA 4F31B 1GGGA 1B3FA 2FNCA 3LSFB 5TPAA 1XC1A 3E3KA 5CM6A 1FW0A 1I69A 1ATGA 1B7ZA 2HZKA 5DEXB 4YKPA 2QS1A 5AA2D 4POWA 3HPIA 1IXGA 1XVXA 4NTLA 3LSWA 3OEMA 1NH7A 3K6XA 3PPNA 2DP8A 1SI1A 3S2VA 1BP5A 2PVUA 4PFYA 2Z23A 4PFUA 4U2RA 4TLMB 3IOVA 2F34A 1LLSA 4KFQA 5TU0A 2ONSA 4ZS9A 4BLAA 1N3WA 3UORA 1TT1A 1YCJA 2H25A 3VE1B 3O97A 4KR5A 3MC2A 2OZZA 4E0XA 3USDA 4RPNA 3K0VA 3ZKKA 5I2NB 4NE4A 1JETA 4QFNA 1B2HA 5KZTA 1B4ZA 3HSTA 1ZLQA 1CE2A 3MUQA 3IAZA 2QSXA 4PETA 3PUXE 3MQ9A 3L6GA 4YAHX 3H6TA 1USYE 4Q30B 4C1TA 3AXFA 3I6VA 5H8HB 1SW2A 4GIZA 2Q88A 3ILUB 3SEYA 2QL3A 1B3EA 1H43A 5I59B 3O2AA 1Y9UA 2ONRA 4G68C 2Q2CA 3O6HA 3FXQA 5L9MA 4F3GA 1DTGA 3KGCA 4FIMA 3RLFE 3G3HA 4IGTA 2O7UA 1SW5A 1B7HA 4XKQA 2QRYA 1URDA 5H8FB 1EZPA 4DCXA 1P1UA 2DVCA 1AIVA 4XXUA 1LSTA 1B5JA 4IGRA 5L9SA 3E13X 3M3KA 3MPLA 3JV9A 2E0SA 5L8DA 4IB2A 2QS4A 4LZ7A 2I49A 1FTJA 3QXMA 4GQOA 3PGFA 4Z0IA 1IEJA 4AB5A 2E1SA 5HM4B 4U4SA 3RNNA 3UP9A 3O29A 4PQJA 4LA9A 5KCJB 1B9JA 2I58A 2QMWA 4R6YA 4DXBA 3QSLA 2G29A 4F1UA 1BIYA 2UVGA 1AH5A 3KJ7A 2OK2A 4HCYA 3TUSA 2R9JA 3C4MA 2PBWA 2O6AA 3R7XA 5DVFA 3F11A 1FTMA 4THIA 1MXVA 3A3UA 3TODA 3T9HB 3ZS6A 4RYAA 3VXBA 5A5XA 4ECFA 2REJA 4N6PA 4PP0A 3V5AA 4NF4A 3N6TA 5H8NB 1LCFA 2X7QA 1UIUA 3K02A 3PMXA 4G77A 2PT2A 3VV5A 5M2VA 5TPAB 1FQCA 1MY0A 5TP9A 1R9LA 1Y4TA 4DE8A 4F18A 3CVGA 3FXRA 3IOUA 3JYRA 2F97A 3H7MA 4X48A 3L6HA 3BFTA 1SDXA 4OZ9A 2PMSA 2Z22A 5BWJA 4H5GA 4YKKA 4OEUA 4DLDA 2UYFA 4EQBA 5EHSA 3LSLA 3T9XB 3H4ZA 1EU8A 4R9FA 3CR9A 2XX8A 3OD7A 3GBBA 3C32A 4FORA 1URGA 2GHBA 2DXYA 3HHFA 4QFOA 1TFDA 2I3WA 2A5SA 3KSJA 4PFWA 1OLAA 4R6KA 4DIGA 4EF2A 5F7VA 2OWSA 1MPDA 1MRPA 1ZKBA 4LZ5A 4R6HA 1DPEA 1BLFA 4LATA 3HN0A 1Y3PA 1PB7A 4KHZE 4WXJA 1US4A 4FECA 2PT1A 1I6QA 4KQPA 3CSBA 1QVSA 3I5OA 3SERA 1Y20A 1MPCA 3RPWA 3BFUA 2FYIA 4KPTA 4FATA 5B7DA 2XHDA 3PD9A 5DVJA 3K6VA 3IB1A 3ZSFA 4ELQA 2RC8A 3TFLA 2OCUA 3QIMA 1JEVA 3DLNA 1B3HA 1ZBMA 1OVBA 3SEXA 4OETA 2REGA 3IO4A 1GV8A 1NKXA 1B58A 1JVXA 1MH3A 1MH4A 1MQHA 4OYVA 1OIBA 5K2XA 1JEUA 1R9QA 3RY3A 2R6GE 1MQGA 2ZYMA 5DYHA 3BKIB 3K2DA 2GH9A 2GHAA 3V8XB 1Q35A 3D4GA 1PC3A 3E9XA 3CSGA 3SEUA 1ZIUA 3KN8A 5I57A 3G3IA 1YPNA 4JXIA 2Q2AA 1SW1A 3OO9A 3KSXA 3CIJA 2I4CA 1BTJA 1B3LA 4I62A 4F2QA 1MS7A 3DP4A 4EF1A 4JWXA 2NWJA 1PEBA 4EXKA 3C33A 5JEIA 2F8DA 4ZEDA 5A5XB 3A09A 3EN3A 4NF4B 1R6ZA 1Y1MA 1RYXA 4ZE9A 1N0TA 5I2KA 2Y84A 2BJJX 1B6HA 1BKAA 4GL0A 2O7IA 2F7BA 5TP9B 2H9BA 4BDMA 1B32A 1MY3A 3B6TA 1N04A 1GTKA 3V83A 1DPPA 2V25A 3KBRA 5I58A 4BDNA 3IK6B 1SW4A 3ODBA 3CRBA 1SBPA 1XHYA 3N26A 4WKMA 4G68A 3R26A 1IZ1A 1LBCA 3N6UA 1HSLA 3CI8A 3H3GA 2AIXA 4ND9A 3P7IA 4R72A 3RTFB 4GVOA 3WAFA 3TTLA 3PD8A 4O3AA 4F19A 3N94A 2QPQA 3MVZA 1YAEA 1MDQA 4ISUA 5ELVA 4RA1A 4Q5TA 4ZDMA 3A3CA 1DTZA 3FV2A 3TKDA 4GXSB 4ZEKA 4H1XA 5ICTA 3MPKA 3IR1A 1B4HA 2XXVA 4RJZA 4EUOA 2AYSA 1DSNA 3TTRA 3RTWB 3GZGA 4ZECA 5DVIA 4DXUA 1N7WA 4H6DA 1MY1A 3RQTA 4NWDA 1LFIA 4FE8A 1VE4A 4NEDA 1VR5A 2VD3A 4H8IA 3G3GA 4UACA 3Q27A 4JSOA 4ELRA 1VSOA 2F35A 3K01A 3H6UA 2HFBA 1LB8A 4AB6A 3SETA 4FEBA 5HPQA 2ZYOA 4L17A 3TMGA 2I6EA 2V3UA 4YZZA 5CBRA 2ZNUA 3TQLA 3SEVA 5CMMA 1PBPA 1OQGA 1WODA 2OJTA 3OO6A 3LBSA 3LUYA 4LVQA 3K1NA 4MF3A 3T93B 4RPOA 3Q25A 1JNFA 1JW4A 5CRYA 4ZEBA 1B0LA 2HEUA 2ANJA 1RYOA 1SD3A 3CG3A 4R9GA 4QHQA 3TTMA 1N3XA 3GXAA 1B46A 1S9TA 1UQWA 3M3LA 5I57B 2AL4A 3U72A 1ZTYA 3EQ1A 4QFPA 1MPBA 2HXWA 3SKPA 2ALUA 1MM6A 5DT6A 4N13A 3PPRA 2DVZA 3T66A 4GD5A 4M1VA 3FXUA 1IITA 3IJXB 3PUWE 1Y3QA 1DMBA 5CC2A 1SVXB 2ONKE 1OQHA 1SYIA 1EZ9A 3IOWA 4U22A 4F3SA 4MLQA 4G4PA 4KD5A 4XIGQ 3MJNA 3O9PA 4IO6A 5I2KB 2OBGA 2HZLA 2DSFA 2UXAA 3HV1A 3CFXA 4F2OA 2G93A 4QFKA 2H4IA 1QUIA 3OSRA 3B7DA 1MXYA 3IORA 2UVJA 4EQ9A 3Q26A 1D9YA 3Q29A 2UVIA 5IAIA 1B5IA 5I58B 1IXCA 3MP6A 2XD3A 3KZGA 1M5DA 1B52A 4G68B 2THIA 2V3TA 5AA2A 5AA4A 1S7YA 3VLWA 3TAJA 2F6GA 1ZJLA 1N76A 1MY4A 3QUFA 2DXRA 3TYHA 2UYEA 4GFRA 1Y3NA 3IL1B 3FVOA 5ISUA 1IXHA 3DP8A 3E4RA 2RKMA 3FZVA 3O28A 3K00A 2Y7KA 1OVTA 1LAGE 3UK4A 2VOZA 2P0SA 1Z7ME 4TLLB 3N5LA 3PUZE 3OO7A 1H3DA 4KCCA 1UTHA 4QRZA 3MWBA 2XXQA 3CFZA 3M3FA 2XX7A 4OESA 1USYH 3FASA 3PPQA 1HSJA 4RNSA 2DE3A 3B6QA 2DWJA 3FJGA 4OXVA 1QUJA 2QS3A 2QJEA 1B51A 5ICQA 1LBBA 1JW5A 4O3BA 2NVUB 1XT8A 4F39A 3FVGA 2VGQA 5AA1A 4X1BA 4LZ8A 1H76A 2M8CA 1IIWA 1AOVA 1WVJA 1B0HA 4OERA 4I1DA 2KLFA 4G8MA 2XXWA 4C1UA 3OMBA 4NF8A 3FATA 4XKRA 4QSDA 4EQ7A 2H99A 2QMXA 2ZYNA 2O84X 3QAXA 1US5A 1NNTA 2A5TA 4RK9A 1P1OA 2B65A 4ZZAA 4FEDA 4OWDA 4F3PA 4KYEA 5FHOA 4LONB 4GF8A 3OEKA 1P1WA 3U8QA 5HBCA 1I6BA 1FTOA 4GLIA 4KI0E 3MW0A 1LAFE 3HCQA 3TDJA 1Y4CA 3KN7A 4H67A 1GR2A 1GVCA 1PDAA 3KOSA 1IUDA 3G3KA 1RKMA 3IB0A 5H8HA 4YMAA 4AQ4A 4OTEA 4G2ZA 1HSEA 4X1DA 1T0KA 1MQJA 3IB2A 4BDQA 4OFJA 4NWCA 3MVXA 3FV1A 2GFEA 4QFLA 1P99A 2VHAA 2B3FA 4NMYA 3OELA 3WAEA 1FQBA 4F1VA 2F6PA 3PPPA 4IY6A 2IEEA 5J1DA 1POY1 4JWYA 2RCAA 4JDFA 3QUJA 1H44A 5FTHA 2P1SA 3G7WA 4KYDA 2RINA 1EH3A 4LQ2A 1LAXA 4FJPA 3T9UA 4F3BA 4YMBA 3DP6A 3FUZA 5K2YA 2O68A 1A54A 2P2AA 2CMOA 3PU5A 4IO4A 1P1QA 5AA2B 1B05A 5AA4B 2ZNSA 4RY1A 2XXTA 1P1NA 4IO5A 1CB6A 4YICA 1NL5A 3PMWA 3RT6B 2HAVA 3Q28A 3O6GA 1B5HA 3LSXA 4P0IA 5KDTA 4GRKA 1ELJA 3D4CA 3VVFA 2F36A 1M5FA 3GBAA 1H45A 2GRVA 3EHSA 4P11A 3U92A 4R2FA 1MXWA 2Z8DA 4MH5A 4H0WA 1UTHB 4MFIA 4RXLA 4N07A 4U1OA 2I4BA 3C9HA 3PUYE 4TQUQ 3EPEA 4OFOA 4Q8RA 1D3KA 4OMBA 3TELA 3FJ7A 1UTBA 2RC7A 3H03A 4I8CA 3H6WA 3CFLA 1ANFA 1NNKA 3V89B 3U94A 4F29A 2CZLA 3FIRA 3U1OA 3KG2A 3PUVE 1YTVA 3RUMA 3W15C 2ZNTA 3MVYA 3UA8A 1POTA 1I6AA 3S9EA 3MP8A 3OO8A 3PV0E 4NF8B 2PX1A 1II5A 2DQVA 4NF6A 2AL5A 3T22A 3GLBA 4DCYA 3IO6A 3H6VA 3SDFA 4ELPA 3MZBA 1TWYA 2IA4A 5JTYA 4DXCA 4DZ1A 2A5TB 1LFHA 1B1XA 2I3VA 4NF5A 4LUBA 2DE2A 3LC8A 2XXPA 5FHMA 1LB9A 4ZEIA 2HQ0A 1FQAA 2ABHA 2Y7IA 3K6UA 4QSEA 3CG1A 2Y7WA 2F7AA 1QJMA 2I0CA 4WEDA 5AE4A 1SI0A 3MBPA 1TXFA 1KWHA 2D21A 4IO2A 4JBZA 4Q0CA 3B6WA 3K1PA 2XXHA 2Q89A 1VFEA 4G8HA 5L9OA 5H8QA 5I56A 4R2BA 3C36A 3PMVA 4XKNA 1JQFA 2ZMBA 1NFTA 2ESNA 4ESWA 4K3FA 3JZJA 5LOMA 4R75A 2Z8EA 4G8NA 2DYXA 2QS2A 4RK2A 1TFAA 1R1NA 1M5CA 5CMBA 2DS9A 1SQYA 3K4UA 4IO7A 1UIVA 3W9WA 1A99A 4I9DA 4MBPA 3OENA 2XXIA 1Z7NE 3QYTA 1MXXA 1FQEA 5AA3A 1FQDA 2YLNA 2F5XA 4QSCA 3C34A 2XXXA 2FA7A 1LAHE 5CI5A 1NMUA 4YKIA 3EF7A 1NNFA 2O1LA 3LR1A 5KDTB 1MY2A 1MDP1 4QF9A 1PBQA 1SYHA 1JVYA 4YB5A 3OSQA 2DOJA 1LCTA 3FD3A 3EHUA 3VVDA 1MG1A 1OLCA 5I84A 4HTGA 5H8SA 1NH8A 4F22A 2VP1A 2DWAA 3OXNA 4R73A 1B7UA 1M5EA 4M4GA 2D3IA 3TEPA 2ZYKA 2ZXTA 2XD2A 3DELB 5F1QA 5JK4A 1IQ7A 4HCWA 4OVJA 3C35A 1UTBB 1XOCA 4C0RA 1ZMGA 1O7TA 4ONYA 3S9LC 3MP1A 3I3VA 1A40A 1LFGA 3TTKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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