5JTYB

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
279
structure length
276
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
total genus 79
structure length 276
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB02
3ZKKA 1B7ZA 2XXXA 3AXFA 2HCAA 4FAJA 3SERA 2Q88A 2Y84A 2ZXTA 1SYHA 5JK4A 1N3XA 4BDQA 1VFDA 4HTGA 1EZOA 3IOUA 2A5TA 3M8UA 3G3FA 4YICA 3MVXA 3T9VA 3E3KA 3EHTA 4OYVA 4P0GA 2HAUA 3T9XB 3MP8A 3MUQA 1WDNA 1Y1MA 1Z7ME 5DVJA 4YZZA 1USYH 3N6TA 3IB1A 4N13A 4X1DA 1L5TA 4FIMA 4PFWA 2O7UA 1JQFA 3I3VA 5CMCA 3TDJA 3TAJA 4RA1A 1BKAA 4K3FA 1QKAA 4U21A 1LFGA 2DVZA 2H5YA 3MVZA 3OEKA 5TP9A 3K6UA 4QRZA 2DXYA 3TTMA 4GFRA 5AE4A 3TCFA 1IIWA 2H99A 4GL0A 3BFTA 3UK4A 5H8FB 1LFIA 4QSCA 3P7IA 1IITA 1ZMGA 2GHBA 3IJXB 3U72A 4HCWA 4KYEA 4QSEA 2D5WA 1FQFA 3CI8A 3M3LA 3VE1B 2R71A 5TU0A 3H7MA 3PPQA 3KFMA 2OBGA 1US4A 1P99A 3VLUA 1MXZA 2AL4A 2G93A 1FQAA 3CSBA 2YJPA 2O6AA 5DVIA 3WAEA 5LOMA 2ABHA 3C35A 3S4UA 4WEPA 1I6BA 1FTLA 5J1DA 3TFLA 3IAZA 5FHMA 1RKMA 2NWJA 4HCYA 2G29A 2IEEA 3K2DA 2Q2AA 4MLVA 1FQDA 3M3KA 3MAMA 3O97A 4ELOA 4U22A 1M5BA 4I62A 1LGBC 3OEMA 2I4CA 3RTWB 2QMXA 2R9JA 2I58A 4U4SA 1Q35A 1NKXA 5AA2D 1Y3PA 3L6GA 3PUXE 5I58B 2O84X 4XKRA 4IB2A 1D3KA 2O7IA 3IOVA 4LP2B 1VE4A 2Z8EA 4FATA 1M5DA 3PPPA 4U4XA 3GLBA 4H1XA 4RYAA 2XX8A 4GVOA 5ISUA 1OQGA 2YPNA 3PMXA 3FVOA 2NVUB 3EF7A 4BLAA 3C33A 2HAVA 4ZDMA 4FE8A 1TT1A 2XX7A 2HXWA 4X48A 2QS4A 1P1QA 1UIVA 3CSGA 5AA4B 1SQYA 4RNSA 4ZEKA 1SW2A 1MM6A 2DQVA 2PYYA 1N3WA 3N5LA 1S7YA 4ESWA 1B5JA 4MFIA 3FXUA 1GV8A 1B4ZA 3SKPA 3UGWA 4POXA 3PMVA 4OXVA 4F3PA 2XXYA 1R9QA 2CZLA 2M8CA 1WODA 4XKQA 3IL1B 2Z8DA 3PPRA 1B0HA 1XOCA 5EYFA 4GL8A 3OSQA 2O51A 3SEUA 1USYE 3S9LC 4RPOA 2RCAA 1ZKBA 3OENA 1ZJLA 5CC2A 3U92A 1F9BA 3KSXA 3USDA 1II5A 2ZNSA 2DE2A 3V83A 4RY1A 2I48A 1I6QA 3B6TA 3JV9A 5M2VA 1POTA 3OO9A 4FEBA 4F3BA 1A8EA 4LQ5A 3GXAA 2ZNTA 3HCQA 4MH5A 5H8FA 1QJMA 2ONSA 4TOZA 4RJZA 1J1NA 5I2KB 4ZEDA 3S9EA 5JEIA 4QFKA 5K2YA 4O3CA 1MPDA 2B65A 5DEXB 2QPQA 4PFUA 1D9YA 4JWOA 2HZKA 2RINA 1JVXA 3PD8A 1AL3A 1B40A 1Y9UA 1MXUA 2ZYNA 2XXVA 3MQ9A 3O66A 3TZAA 5L9OA 4GWOA 2XD2A 3I5OA 1MDQA 1DPEA 2D3IA 3H6UA 4ZE8A 3FD3A 2NUVA 3VLVA 3O6GA 1TFAA 4YKIA 5H8NB 1NNKA 2UVJA 2OZZA 3FZVA 3RPWA 4F31B 3UP9A 3QYTA 1LSTA 4HS7A 3FVNA 4ZE9A 3T66A 4PE5B 3OELA 1B4HA 4IO7A 2F7AA 2V25A 4M4GA 3K6WA 4BDNA 3HO7A 4KPTA 5I58A 3C31A 2P1SA 1N7WA 1PEBA 3K1NA 1FQEA 3C9HA 3PUWE 2QMWA 3KOSA 2R6GE 3OO8A 3RTFB 3O2AA 2ESNA 1YPNA 3M3FA 3SEWA 2OLBA 4NF5B 4XXUA 2VHAA 4G2ZA 2Q9TA 3OOAA 1ANFA 3F11A 4GLIA 3KOTA 5DTBA 2F36A 4QF9A 5DYHA 1JNFA 3BFUA 3MC2A 4NF6B 3QUFA 2X26A 5AA4A 3FXRA 3K00A 2E1SA 2Q8JA 4ZECA 5CMBA 2DSFA 2GRVA 1D4NA 1A55A 4F39A 4R2BA 3IOWA 4DXCA 1O63A 2QL3A 5K2XA 2XD3A 1N7XA 3FUZA 3E9XA 4G8HA 4ZZAA 5HBCA 3VVDA 3G7WA 1IEJA 2WKYA 3IK6B 3TPAA 3G3KA 2H9BA 1Y4TA 4THIA 1TWYA 2V3QA 3LSFB 2V3UA 3TQLA 1ZTYA 4F3GA 1H76A 4DCXA 1B1XA 1FTMA 1B7UA 4DZ1A 3H6TA 5EHMA 1QKBA 4LUBA 3PPNA 1Y3QA 4I8CA 3QK6A 3H03A 1QUKA 4C1UA 2F97A 3RT8A 1FTJA 4EF1A 3GBAA 3KJTA 3UN6A 2DXRA 3KZGA 3IORA 5I2KA 1AOVA 1SW5A 1M5EA 4DXUA 2XXHA 3ZKLA 5DEXA 3E4RA 4R72A 1FQBA 4NF4B 1R6ZA 2HZLA 2ANJA 2ZYMA 1AMFA 2QS1A 1Y20A 5DT6A 2I49A 2H4IA 2DWHA 3LBSA 2RCBA 1PB9A 1P1WA 4G77A 2XXTA 2DE3A 1OVBA 3C32A 2NOOA 4TLLB 2HEUA 1UQWA 1FW0A 3PU5A 1MY3A 5H8NA 1B5IA 1QVSA 3D4CA 2PMSA 3CFLA 3MWBA 4R6YA 3FJGA 4PP0A 2GH9A 3IO6A 3RUMA 3FV2A 4ELPA 3Q27A 1MQDA 3EHUA 3FGSA 1QUIA 2DP8A 2VOZA 4OHNA 4ZEIA 1MQIA 3RT6B 3EPEA 5A5XB 4I9DA 1M5CA 3G3IA 3RNNA 4QFLA 1N0TA 5I59B 1TFDA 4OFLA 4OENA 1MRPA 3U8QA 3HHFA 4NF5A 3G3HA 2ALUA 4IO3A 4LVQA 3LSXA 4OQOA 1GVCA 3QXMA 3JZJA 4NWCA 3C34A 4NF6A 2PX1A 4XTCQ 3SEVA 3TKDA 4EQBA 4H0WA 2HFBA 4U23A 3VXCA 5CI5A 4O3AA 1QW0A 2DWAA 3EHSA 3PPOA 3SEYA 1NNPA 4MLQA 3QIMA 5KCJB 4OFJA 1IQ7A 4LZ7A 1BIYA 2X7PA 4OEUA 2ZYOA 3HSTA 1CB6A 2QS3A 3PMWA 4EXLA 3KJ7A 1P1UA 3IR1A 3HN0A 4C1TA 1PB7A 3H6WA 5AA3A 3FV1A 1MPCA 3N26A 4DDDA 3IB2A 1OQHA 5FHOA 3GZGA 1I69A 4ISUA 1N04A 4MF3A 4BDLA 2Y7RA 3MP6A 3A09A 1YTVA 4IO4A 3C36A 3H4ZA 4G8NA 4HW8A 4LONB 4O3BA 1UTBB 1JETA 2DE4A 3G3GA 3TCHA 1SDXA 4OESA 3CFZA 1HSJA 3K1MA 4ND9A 1GGGA 2Y7KA 2Y7PA 5CM6A 2RKMA 3QAXA 4H6DA 2ZNUA 3SESA 1DSNA 4NF4A 4OVJA 2O69A 5ITOA 1O7TA 3MBPA 3G3JA 4DIGA 4Q30B 2DYXA 1R1NA 5H8QB 2QSXA 2ZMBA 4F18A 1B3HA 3KEIA 3PUZE 3TQWA 1BLFA 4U1OA 4KI0E 2O68A 3TTRA 3LC8A 3VVFA 3SDFA 1B2HA 2QJEA 2I3VA 3MP1A 4BDRA 5CMKA 3FASA 2UYFA 4POWA 1MM7A 1NNTA 2RC8A 1XT8A 3R26A 4L17A 1NNFA 3RLFE 4G68B 3TTLA 3R6UA 2DWIA 3MZ1A 1A7LA 3K4UA 3GBBA 4R74A 2OWSA 5AA2B 3VDFA 4JXIA 3HPIA 2Z22A 1NFTA 1MQJA 1B3LA 3DP6A 5FHNA 4DE8A 5I56B 4LATA 1A99A 5BWJA 3PUVE 3A3CA 5I59A 4IO6A 3THIA 3KN3A 1ZIUA 4ZS9A 2PBWA 4F22A 3S9NC 3SEXA 3ODBA 1ELJA 3RY3A 4FECA 4EF2A 1PBQA 1RYOA 3IJOB 3ONMA 1EH3A 1Y3NA 5L9MA 1MY1A 2GFEA 4E0XA 1ATGA 5TPAB 2UVHA 3TMGA 2RC7A 2PVUA 4OWDA 4AB5A 2OWTA 4M1VA 5KCJA 4XIGQ 5F7VA 2FA7A 4Q0CA 2AYSA 1IUDA 4OETA 1MXXA 4H8JA 3IX1A 3KBRA 3MZBA 4KR5A 4QFPA 4U2RA 3CG3A 2XXQA 1P1OA 2BJJX 1ZBMA 1B3GA 4IO5A 4TQUQ 4DCYA 3FJMA 4EXKA 1P1NA 3DP4A 1UTBA 4PETA 3CVGA 5AA1A 4NE4A 1HSLA 1SVXB 1US5A 4ZEBA 4H5FA 2DS9A 4GRKA 1VR5A 4OTEA 2H98A 4RXLA 3WAFA 3ECRA 2P0SA 3QSLA 3Q25A 1LBBA 4F2OA 1O64A 4H8IA 4EUOA 2A5SA 3ZS6A 1FQCA 1LAHE 5FTHA 3U94A 3EN3A 4NF8B 3IB0A 5H8QA 4X9TA 2YLNA 1A8FA 2HQ0A 3K1PA 1URDA 2F35A 4F3SA 1UTHB 4GQOA 4KFQA 1B3EA 4R9FA 3N6UA 1B6HA 1B05A 1BTJA 1ZU0A 2VD2A 1JEUA 3U93A 2V3TA 4IO2A 4G68A 3JYRA 4YB5A 4F29A 4YMBA 5AA2A 2CMOA 1MQGA 2GHAA 4OZ9A 1XS5A 1PDAA 3OO7A 1BP5A 1MPBA 2XXWA 3B6QA 4XKPA 4YB7A 1NH7A 3FIRA 1MY0A 3FVGA 2ONKE 5I56A 4EDPA 1ZLQA 5F1QA 3LUYA 4IGRA 3L6HA 3UORA 3T93B 1LAXA 2F7BA 4H5GA 5FTIA 1MY2A 3MJNA 1JVYA 4JSOA 1JEVA 1EU8A 1B5HA 5ELVA 2Q89A 4JWXA 3RQTA 1IXIA 2F8DA 2XXPA 4BDMA 3VLWA 4JWYA 2W7YA 4JDFA 5JTYB 5I2NB 3IOTA 4X1BA 3CIJA 1SD3A 5H8HB 3TCGA 1MXVA 1VFEA 2I0BA 5TPAA 1LLSA 5EHSA 5L8DA 5DVFA 4OERA 1IXHA 2F7CA 2LAOA 3CR9A 1H3DA 3EQ1A 3W9WA 1B32A 1PBPA 1EZ9A 3O6IA 1MY4A 2PT1A 3H3GA 3VV5A 3V5AA 3U1OA 1GR2A 1OVTA 4LQ2A 1OIBA 5IAIA 4YKKA 5KDTB 2F78A 1LB9A 4I1DA 4KHZE 4PQJA 4JBZA 4PFTA 2ONRA 3LR1A 1SBPA 4KCCA 5I57B 2VP1A 1H43A 1JW4A 1JW1A 4JSDA 4Q8RA 1LFHA 2OJTA 1FTOA 3CG1A 4Z0IA 1QULA 1B9JA 1HSEA 4G68C 1XVXA 1I6AA 2VD3A 3ZSFA 3TTKA 4FJPA 3I6VA 4PFYA 3DELB 5KZTA 1IXGA 5HPQA 4ECFA 1A40A 4NF8A 4N6PA 5ICTA 3W15C 4F1UA 2OCUA 4R6KA 4YKJA 5CBSA 1CE2A 4P0IA 1TXFA 4F2QA 1UTHA 1DOTA 1SI1A 2DWJA 3DLNA 3MZ9A 2O1LA 3MW0A 1OMPA 5IKBA 4QHQA 5BUUA 3S2VA 1SW4A 4YAHX 4IY6A 4OMBA 3UA8A 2F34A 4JB7A 2O1MA 4UACA 1MDP1 1MQHA 3H06B 2Q2CA 3W9VA 1MH4A 1LBCA 1XHYA 2PT2A 3BBRA 2Y7WA 3O29A 3T9HB 1T0KA 1NMUA 4YKPA 3Q28A 2DOJA 3HV1A 4C0RA 5CRYA 1LCTA 4WKMA 2X7QA 1NL5A 3PD9A 1DMBA 4ESXA 5JTYA 4IY5A 1S50A 2VGQA 5I2NA 3T9UA 5H8HA 4EQ7A 3PV0E 3R7XA 4R75A 1B51A 4ZEFA 2F6PA 3KSJA 4GXSB 1POY1 1DTZA 3DP8A 4TLMB 5ICQA 1LAFE 2H25A 2Y7IA 3Q29A 3K01A 4F1YA 4H65A 4ZZEA 2Z23A 4R2FA 3K02A 4EQ9A 4NEDA 2F5XA 4QSDA 4P11A 3O6HA 4N07A 1MH3A 2V93A 3FXQA 4GOTA 4ELQA 5L9SA 3DM0A 3C4MA 5CMMA 3A3UA 3VXBA 2I6EA 1H44A 1KWHA 3OMBA 5KDTA 2B3FA 4YB6A 5H8SA 3IO4A 3KG2A 3CFXA 1Z7NE 3OO6A 5I57A 1YCJA 1LCFA 1RYXA 1URGA 3O28A 4BDOA 5A5XA 4MBPA 5I84A 1UIUA 1Y4CA 3V8XB 1LAGE 3Q26A 5B70A 1XC1A 1NH8A 3B7DA 4E0WA 3VFJA 4NTLA 1B58A 3UIFA 3E13X 3T96B 4GD5A 4RPNA 3O9PA 4Z7EA 3CRBA 3TYHA 4GIZA 3LSWA 4UA8A 1LB8A 3SETA 4R73A 1IZ1A 4F19A 1SW1A 4WEDA 2P2AA 3TODA 1XVYA 1AH5A 3RGYA 3B6WA 2RC9A 4KCDA 1B1HA 4FORA 3MPKA 4XKNA 4FEDA 3HHGA 3RN8A 2I0CA 2I4BA 5CBRA 2DVCA 3TEPA 1OLCA 2RF1A 3MVYA 1OLAA 4KD5A 4QFOA 2A5TB 1GTKA 3KGCA 1B46A 3PUYE 2XX9A 4KQPA 1QUJA 1AIVA 1VSOA 2REJA 1SI0A 2XXIA 1B3FA 1DTGA 1Q1KA 4R6HA 3N94A 2D21A 3PGFA 2IA4A 3OSRA 4KYSA 4GXAA 3FJ7A 3K6VA 1MXYA 2KLFA 2XXUA 4YMAA 4R9GA 2V84A 1S9TA 4YU0A 4F1VA 4WXJA 4AB6A 2NXOA 1YAEA 1N84A 5TP9B 3H6VA 1Y1ZA 3OD7A 1B7HA 4RK2A 2FYIA 2OK2A 3MPLA 1MS7A 3T22A 1FCKA 3FVKA 3FATA 1WVJA 2B3BA 4ELRA 1SYIA 4DXBA 1EZPA 1MXWA 4ONYA 5ITPA 1B52A 1M5FA 3BKIB 1H45A 2UXAA 1R9LA 4H67A 4LA9A 4G8MA 2XHDA 3TELA 2UVIA 3QUJA 2UYEA 3ILUB 2QS2A 3ILTB 4RK9A 2I3WA 2THIA 4G4PA 1PC3A 1N76A 3OXNA 1DPPA 3D4GA 1A54A 4Q5TA 3VVEA 4U1ZA 1IXCA 2UVGA 2F6GA 3K0VA 1D9VA 2AIXA 4NWDA 2AL5A 3TTNA 1JW5A 4OFOA 1URSA 3K6XA 5B7DA 3V89B 2Z8FA 4NMYA 4LZ5A 2REGA 1B0LA 4IGTA 4DLDA 1MG1A 2FNCA 3LSLA 4QFNA 3KN7A 3KN8A 3TUSA 2E0SA 4OEVA 1PB8A 5HM4B 4AQ4A 4KYDA 3S9MC 3MVWA 4LZ8A 1FTKA 2QRYA 4GF8A 2ZYKA 2XXRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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