5JTYB

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
279
structure length
276
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, receptor
total genus 79
structure length 276
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB02
2VD3A 1EZ9A 2NOOA 2QJEA 4U4XA 1A55A 3FVOA 4YB7A 4AQ4A 4GD5A 3GXAA 5CRYA 1FQBA 1II5A 4F39A 1MXXA 3CSGA 3FUZA 4LUBA 1POTA 4ELRA 5H8NA 2RCAA 3SETA 3ZKLA 3K1NA 4R9FA 5KZTA 2FA7A 4YMAA 1XVXA 4FE8A 4YKKA 3DM0A 4NF6A 2A5TA 1IZ1A 3VXCA 1R6ZA 2XXYA 3PMWA 3O97A 1MQIA 1UIUA 1TWYA 4OEVA 1O63A 3C35A 3CIJA 3FJGA 4DLDA 3HV1A 4IGRA 4EUOA 1PC3A 1DSNA 5AA4B 3EPEA 2P1SA 2HEUA 4ZEDA 1LCTA 4BDRA 4GWOA 2B65A 4LONB 2DOJA 2DVZA 2Z8EA 2Q2CA 2Q2AA 1HSEA 3QK6A 1B58A 1Y1ZA 2I6EA 4WEDA 4H8IA 4M4GA 2Q89A 4IO7A 3MJNA 3MPLA 4LZ7A 1ZBMA 2GHAA 2O1LA 2D3IA 1MS7A 4NF4A 4GL8A 1MY0A 3EQ1A 1NNFA 2Y7PA 2XXQA 2G29A 4N6PA 4XKQA 5FHNA 3CR9A 2QPQA 3T93B 2F5XA 4X1DA 4L17A 1ATGA 4ZS9A 1P1WA 3PUXE 3ECRA 3MPKA 3DELB 5DYHA 3R26A 1UTBA 3Q29A 2O84X 4O3AA 1PBQA 1UTHB 2H99A 4M1VA 1SYIA 1B1HA 2I4CA 3P7IA 1GV8A 3VFJA 4JSOA 2DS9A 4WEPA 1I6QA 3OXNA 4ELQA 3PUWE 4POXA 1JVXA 4PFYA 4LZ8A 3QAXA 4KD5A 3FGSA 2HCAA 4H6DA 4X1BA 3N26A 1CB6A 3IX1A 4ZZEA 4NEDA 3BFTA 3H4ZA 3PUZE 5LOMA 2IEEA 4GLIA 4JBZA 2FNCA 3I6VA 5KCJB 3C34A 4OXVA 1B05A 4TQUQ 3RY3A 2XX7A 3HHGA 4YZZA 3UORA 3S9MC 1IIWA 5IKBA 5FHOA 5I59B 3DP8A 1AMFA 4RK2A 4N13A 1DMBA 1Y20A 4AB5A 3H6UA 1N76A 4OEUA 1TT1A 4QSDA 2NXOA 1N7WA 3HPIA 5IAIA 2LAOA 1JEVA 2ZYOA 3LC8A 2DSFA 2ZYMA 4XTCQ 2QS3A 1MXYA 2DXRA 1I69A 5CMBA 3H06B 2I4BA 3LSXA 1B3GA 1USYE 2V25A 2DP8A 4U1OA 2DE2A 3W15C 3C32A 4YMBA 1WODA 5I2KB 1FTMA 5H8SA 3JZJA 4OERA 1H44A 3TODA 1US5A 4GVOA 5L9SA 1NH7A 4ZDMA 4GQOA 1QVSA 5I84A 4JWYA 2KLFA 1A8FA 4LP2B 4XXUA 1S50A 4OQOA 3V8XB 3TAJA 3N6TA 5EHSA 2W7YA 3MVYA 4FECA 4R2BA 4RPNA 3LSWA 1LAGE 3G3HA 4F18A 3O2AA 4NF5B 3Q25A 3SDFA 3DP6A 3H7MA 4GL0A 1MM7A 2PYYA 3LUYA 1SBPA 4F3PA 1B0LA 3TEPA 5L9MA 1ZKBA 4IO6A 4LQ2A 4F3GA 3O28A 2H5YA 3K1MA 1IEJA 2XXXA 1QW0A 2RINA 2M8CA 3JV9A 4OTEA 3TCHA 2YLNA 2RF1A 3IO4A 1SW4A 2Y7IA 5B70A 5DTBA 4YKJA 1OMPA 1M5DA 4Q0CA 2HXWA 2NWJA 3LR1A 4R6HA 1TXFA 4OYVA 3G3JA 4R6YA 3HCQA 4DCXA 3G3FA 1LFIA 4G2ZA 3MZBA 4Q5TA 1WVJA 4MBPA 4UA8A 2ESNA 3MBPA 3IOUA 3KN7A 3W9WA 1KWHA 4KCCA 1XS5A 3FVNA 1JW5A 5ITPA 3PPQA 4ISUA 4GXSB 1B3LA 1MXUA 2Y7WA 2DWAA 4THIA 1MXWA 2DYXA 1D9VA 3IB0A 3RLFE 5CC2A 3UP9A 4MF3A 1VSOA 1FW0A 5I59A 4GXAA 3K0VA 2X7PA 1B3EA 5DVJA 3S9EA 2F7AA 1D4NA 3OSQA 5ICQA 1JNFA 3KOTA 1A54A 1URSA 3DP4A 3QXMA 4KPTA 4GRKA 4F22A 4YU0A 5KDTB 3KJ7A 3FV2A 3TKDA 3A3UA 3MWBA 1H3DA 4NMYA 4PFWA 4ZE9A 2YPNA 2DVCA 2QS4A 1OQHA 1M5BA 4DDDA 2ZNSA 1MQGA 2PX1A 4IGTA 2X7QA 2HAVA 2XD3A 2I49A 2XXPA 1FTLA 4BDOA 3KBRA 3M3KA 4Q30B 3MQ9A 2REJA 4GF8A 3MZ1A 1GTKA 4BDNA 3OO9A 2D21A 5I2KA 1RYOA 4E0XA 3T9UA 4YKIA 3DLNA 1DOTA 4IO3A 4U23A 3G3KA 3RPWA 3VLUA 2H4IA 4G8HA 3IK6B 2F7BA 4U4SA 2OCUA 2ONKE 4KQPA 2AYSA 2QS1A 2DWIA 3MC2A 2Z23A 2OJTA 3O66A 1P1QA 1MQHA 4RPOA 2RKMA 2RC9A 3EF7A 2ZMBA 2DWJA 1MPCA 3V89B 4NF5A 1B9JA 1LAXA 4NE4A 3RUMA 2QS2A 2V84A 3C9HA 3MP6A 3C31A 1QUIA 5TPAB 2R6GE 4LA9A 2GRVA 2B3FA 5CM6A 5I56B 4OFLA 2HAUA 4EXKA 2FYIA 3LSLA 3MVWA 4IY6A 4QFNA 5I57B 4WXJA 5M2VA 3TQWA 3ONMA 1ZLQA 4IO2A 5H8QA 1URDA 4ESXA 2O1MA 2UVIA 1Y3QA 2ZNUA 4YB5A 3OO8A 1SDXA 3PMVA 3CI8A 3CRBA 2Q88A 3QYTA 4POWA 4G8NA 1BKAA 1XHYA 4EDPA 3VVDA 3U72A 1RKMA 2Z22A 1FQEA 2AL5A 3SERA 4KI0E 2XXHA 3IOWA 3KJTA 4WKMA 3IL1B 5HPQA 1FQFA 3VXBA 1EZOA 5F7VA 1GR2A 3FATA 5ELVA 4OZ9A 5ICTA 4FORA 4U2RA 1NFTA 2ZNTA 3BBRA 1A7LA 1B3HA 2ZYNA 2Q8JA 1BTJA 5H8HB 1J1NA 1FCKA 4O3CA 2DWHA 1MQJA 3PMXA 2F36A 4F1VA 2R9JA 3PD9A 3PV0E 4XKPA 1AIVA 2HZKA 3OO7A 3HHFA 2ZXTA 2VD2A 2DE4A 3KGCA 4FIMA 5JTYB 4ZECA 1XC1A 4XKNA 1PBPA 1IITA 2XX9A 1SI0A 5KDTA 1IXCA 1BLFA 4MLVA 3VDFA 5FTIA 3RN8A 1AL3A 4G77A 3K6UA 3M8UA 1LFHA 5FTHA 3MP8A 2XD2A 4LVQA 1DPEA 4F3BA 2Y7RA 4QFLA 1H45A 2DXYA 3UN6A 3LBSA 2QL3A 1Y4CA 1LGBC 4QSEA 3T22A 3GLBA 2VHAA 1B6HA 4F19A 5AA3A 4I9DA 3UA8A 1LAFE 1QUKA 5L9OA 4G68C 1XOCA 4RA1A 4X48A 4YB6A 3QSLA 1MQDA 4Q8RA 2B3BA 2AIXA 1JW1A 2NUVA 4F1YA 3A09A 3RQTA 2O6AA 1PB9A 4TOZA 3H03A 1A99A 3U94A 1MH3A 4KCDA 1MY2A 3S4UA 4PE5B 2GFEA 5TPAA 1N04A 2PT1A 4R74A 3K01A 2H9BA 2XHDA 1MDP1 4U1ZA 4OHNA 2XXIA 1PB8A 2QMXA 5ISUA 3PPOA 1DTZA 3TDJA 4EF1A 3ILUB 3K1PA 1S7YA 4F29A 2UVGA 4OVJA 3AXFA 3HN0A 4QSCA 4TLMB 4XIGQ 2ALUA 3RGYA 4ESWA 4C1UA 3K6XA 3IB2A 5EHMA 4R73A 3PUVE 3EHTA 2O68A 1B5IA 4HW8A 3K4UA 4OENA 2DQVA 4HCWA 1MPBA 4OETA 2H25A 5DVIA 4FJPA 1B51A 5F1QA 5K2XA 1S9TA 3G7WA 5AA4A 1RYXA 3MUQA 1N0TA 1Y1MA 2ONSA 3Q28A 4DXBA 3UK4A 1TFAA 3D4CA 2O7UA 4JDFA 2ZYKA 4BLAA 2I0BA 2F34A 4F2QA 2YJPA 4GOTA 5TP9B 5JEIA 5JTYA 3O6IA 4OMBA 2Y7KA 1B7UA 4YAHX 1ZTYA 1LBBA 3I5OA 4PFUA 2V93A 4F2OA 3ZKKA 4ELPA 1WDNA 5B7DA 4R2FA 1IUDA 1EZPA 3THIA 2GH9A 4R72A 4K3FA 3T66A 4KR5A 3I3VA 3KSJA 1B5JA 3S9NC 3G3GA 3E13X 1HSLA 5K2YA 4XKRA 4BDMA 1MG1A 1B7HA 1PEBA 2Z8FA 2A5SA 1JVYA 3BKIB 4GIZA 1LB9A 3D4GA 1UTHA 5DT6A 1YPNA 5L8DA 3VVEA 3SEWA 4KYDA 3CFLA 1USYH 3CSBA 4DXCA 1JW4A 1B3FA 4TLLB 1N84A 1SW2A 5CBRA 4JWXA 1VR5A 1FQAA 3KFMA 3PPPA 2HFBA 4E0WA 2UYFA 3SEXA 1MY1A 3N6UA 4EQ9A 4DCYA 2V3QA 3FVKA 4N07A 1NNTA 4NF6B 4MFIA 1UQWA 1NMUA 4IY5A 1D9YA 1CE2A 1OVTA 3O6GA 2H98A 5KCJA 3CG3A 4F1UA 4RK9A 3GZGA 3KEIA 2UVJA 4I1DA 1LB8A 1AH5A 2OLBA 3V5AA 3IO6A 3TCFA 3OEMA 1FTJA 3ZS6A 1M5CA 1F9BA 3IR1A 2F6PA 4BDLA 1NL5A 3FV1A 4FATA 5ITOA 1MM6A 2OBGA 3HSTA 3ILTB 3H6VA 4UACA 3IJOB 1NKXA 3RT8A 1POY1 1OQGA 1SW5A 2F97A 1LFGA 4RXLA 4NF4B 3RT6B 3VVFA 4PFTA 4OESA 3TQLA 1M5EA 2I0CA 1PDAA 3VV5A 4EQ7A 4RY1A 3LSFB 4R9GA 4MH5A 3B7DA 5H8FB 2UXAA 1UTBB 2XXRA 2AL4A 1TFDA 4BDQA 2F7CA 5A5XB 3O9PA 1O7TA 3C33A 3U93A 3N94A 4HCYA 3TTRA 2PVUA 4YKPA 2ONRA 5CBSA 3ODBA 2XXWA 2Y84A 3K6WA 4YICA 1YTVA 1Z7ME 1H43A 1N7XA 4H8JA 3UGWA 3HO7A 3SEYA 3MVXA 4P11A 1Y3NA 1YAEA 3E3KA 1FTKA 1AOVA 3PGFA 4QFOA 2ABHA 1ZIUA 4JSDA 2VGQA 1SYHA 4QF9A 2HQ0A 3PUYE 3E9XA 4OWDA 1BP5A 2P0SA 3S2VA 3MP1A 1D3KA 4NF8B 2X26A 2NVUB 5I58B 4NWDA 2REGA 3K00A 4F3SA 2HZLA 3L6HA 1MXZA 4HTGA 2XXTA 3B6QA 1L5TA 3PPRA 1Z7NE 4LATA 1JETA 3T9VA 3TFLA 1QUJA 2F6GA 3N5LA 4IB2A 1GGGA 1SVXB 1Q1KA 1ZU0A 3KN8A 4JB7A 3IJXB 5CMMA 3C36A 4Z7EA 1B46A 3VLWA 4NWCA 2CZLA 1JEUA 1VFDA 5J1DA 1QJMA 4P0GA 2RCBA 2O51A 1OLAA 3FASA 1SW1A 3H6WA 2UYEA 1IQ7A 3FXQA 5CMKA 4FEDA 3IOVA 2XX8A 2OZZA 4FEBA 2PBWA 4RNSA 3TTLA 3TUSA 3RTFB 3TELA 3QUJA 4RYAA 1EU8A 1JQFA 4HS7A 3USDA 3EN3A 1DTGA 4G8MA 4OFJA 1XT8A 4X9TA 4ZEFA 1P99A 2QRYA 2F35A 1QKBA 5AA1A 1FQDA 3ZSFA 3QUFA 5EYFA 2O7IA 1N3WA 5DEXB 2V3TA 3RNNA 1I6AA 3Q26A 5H8FA 4KFQA 2XXVA 3VE1B 1P1NA 3IOTA 2I48A 3SKPA 5CI5A 4G68B 5A5XA 3UIFA 1R1NA 1R9QA 1LSTA 2I58A 2F8DA 3OD7A 3WAEA 4EF2A 3FVGA 4U21A 2E1SA 3O29A 1LCFA 1SD3A 3Q27A 3MAMA 1B2HA 4PP0A 5AA2B 4H0WA 3TCGA 1IXHA 5I56A 3FXUA 1M5FA 5HM4B 2Q9TA 4FAJA 3QIMA 2Z8DA 4ND9A 4I62A 5I57A 3CG1A 2UVHA 3FIRA 3TPAA 3W9VA 1ANFA 5I2NB 4H5FA 4QFKA 2I3VA 3TTNA 5AA2D 5CMCA 3TYHA 1P1OA 2GHBA 3K2DA 4H67A 3T9XB 4NF8A 2D5WA 1NNPA 2V3UA 5I58A 3E4RA 3G3IA 5DVFA 3PU5A 1DPPA 2PT2A 3H6TA 3B6WA 4H1XA 1ZJLA 1VFEA 1B40A 3SESA 4LQ5A 4ECFA 4ZEBA 1B4HA 4KYEA 3MW0A 3OENA 3U92A 2QSXA 2O69A 2OK2A 1MY4A 1B1XA 3SEUA 1Y4TA 3RTWB 1PB7A 5H8HA 4JWOA 1FTOA 3OMBA 3O6HA 1Q35A 3FZVA 1SQYA 4EXLA 1A8EA 3PPNA 4DIGA 2CMOA 3PD8A 4G4PA 3GBAA 4LZ5A 2VOZA 4ONYA 1NNKA 1R9LA 4U22A 4NTLA 1BIYA 5AE4A 3C4MA 1MRPA 3KSXA 1NH8A 2E0SA 3FXRA 4KYSA 5BWJA 2ANJA 1LLSA 3K6VA 3TMGA 5FHMA 3VLVA 4PETA 3R6UA 4R6KA 1T0KA 4I8CA 3OO6A 3OELA 1URGA 2XXUA 4DZ1A 3S9LC 1UIVA 2G93A 3CFXA 3U8QA 1FQCA 1MPDA 3MZ9A 5DEXA 3EHUA 3TTKA 3BFUA 2IA4A 4PQJA 3T9HB 2QMWA 3OEKA 2WKYA 5H8NB 2RC8A 3U1OA 3FJMA 3H3GA 3SEVA 4G68A 4GFRA 1B0HA 1US4A 5H8QB 5BUUA 1GVCA 1MDQA 1P1UA 2DE3A 3KN3A 2F78A 5TU0A 4ELOA 3OSRA 3F11A 3FD3A 4ZEKA 2A5TB 5AA2A 1OVBA 1H76A 1I6BA 2PMSA 3L6GA 4ZE8A 4MLQA 4C1TA 1ELJA 4QFPA 1QULA 1B32A 1OLCA 3KZGA 3M3FA 3KG2A 4QRZA 4RJZA 3IB1A 4ZZAA 5I2NA 3TTMA 2THIA 3TZAA 1B5HA 1YCJA 2BJJX 3K02A 1MY3A 4EQBA 3KOSA 2OWSA 4QHQA 1B4ZA 3IORA 4DE8A 1ZMGA 1LBCA 1VE4A 2RC7A 1Y9UA 4R75A 4H5GA 4P0IA 4IO4A 2I3WA 4IO5A 1SI1A 3GBBA 3JYRA 4F31B 3R7XA 3T96B 5HBCA 3EHSA 3CFZA 3B6TA 3CVGA 3OOAA 1B7ZA 1XVYA 1MXVA 5JK4A 2R71A 1IXIA 4O3BA 1Y3PA 4AB6A 3IAZA 1LAHE 3M3LA 2P2AA 1HSJA 1B52A 1EH3A 4H65A 3FJ7A 4Z0IA 3WAFA 4ZEIA 4DXUA 5TP9A 1QKAA 3V83A 4KHZE 4OFOA 4JXIA 1N3XA 3MVZA 1A40A 2VP1A 3A3CA 4C0RA 1MH4A 1IXGA 1OIBA 1O64A 2OWTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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