5JTYB

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
279
structure length
276
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
total genus 79
structure length 276
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB02
3N6UA 1DSNA 2O6AA 1L5TA 1BKAA 1GGGA 2ESNA 2Q88A 1B6HA 3KSJA 3MP1A 2R71A 2DWIA 1FTOA 2GHBA 2VGQA 1SI0A 4RJZA 3IR1A 1B4HA 2DP8A 2QPQA 4IO4A 4FAJA 3U94A 4NF5A 5I2KB 2UVJA 1MQHA 1B3HA 1N76A 4NMYA 1N7XA 4R6HA 4LVQA 4YB7A 5CMBA 5DEXA 3TQWA 3MVYA 3VLVA 4DLDA 3MP8A 2H25A 1SW4A 2PYYA 3EHUA 3K4UA 2DYXA 4BDOA 5EHSA 5AA2D 5IKBA 3BFTA 4R2FA 3ZSFA 3HSTA 5AA2B 1IEJA 3Q27A 2I3VA 1JW1A 3G3FA 1UQWA 2DS9A 4I8CA 1B7UA 2H4IA 3RT6B 3ZKLA 1MQIA 4ESWA 4FEBA 1P1NA 1LFGA 1PBPA 2Y7RA 3TUSA 1MXZA 4MFIA 4F3PA 5AE4A 3KJTA 2UYFA 3QUFA 3OEMA 1XC1A 2OWTA 2AL5A 1HSLA 5TP9A 1B7ZA 4FORA 4KR5A 1MG1A 5CMMA 4G68A 5FHMA 1R9LA 3MBPA 1JQFA 3Q29A 1RYXA 4XXUA 4NF5B 5I2KA 2I49A 3LC8A 2ONKE 2VD2A 3K1PA 4JSDA 1S9TA 1B5IA 1UTHB 3C32A 3I5OA 1JNFA 4OTEA 5I58B 2O69A 4H65A 3H6UA 1B3GA 4TLLB 1FQCA 5ITOA 2DOJA 2DWJA 3OXNA 1LCTA 2YJPA 3DP8A 1D3KA 3OO7A 3QUJA 3VLUA 3G3GA 5JK4A 3HPIA 4IO6A 3VE1B 4KYDA 1UIUA 1B46A 3KOTA 4N6PA 4QFOA 2RC8A 3O2AA 3S9NC 4THIA 4U21A 1D9YA 4U22A 4GOTA 2O51A 4ZZAA 4OEVA 3SKPA 1PEBA 3S9LC 1SYIA 3O97A 1AH5A 4ZECA 1MS7A 4ISUA 4JB7A 4IGTA 4MH5A 3QIMA 2OCUA 2ZNUA 1MM7A 2DVCA 1NL5A 3EN3A 3HN0A 4GXSB 3CFXA 1O7TA 1R1NA 4GWOA 2NUVA 5L9SA 2V3QA 2H99A 3CVGA 1ZIUA 4OVJA 3EPEA 2XX8A 1LFIA 2RCBA 1SQYA 2AYSA 1N3WA 1SW2A 3DM0A 4OXVA 4OEUA 1MY3A 4ELRA 5I56B 3SESA 4LQ5A 1JVXA 4PQJA 3KZGA 4OERA 3Q26A 3VVDA 1US4A 5BWJA 4ND9A 1EZPA 3VLWA 3FXUA 4C1TA 4ZDMA 3PPPA 4GD5A 1D9VA 2F8DA 4LZ7A 4F39A 2F35A 3OSRA 1TFAA 1XHYA 4PE5B 3W9WA 1LB9A 1LBBA 5B70A 1FTKA 5FHOA 1OQGA 1Q35A 2V25A 5AA2A 3CFLA 2QMWA 4YICA 2LAOA 3K1MA 3PPQA 1JETA 1XVYA 2D3IA 1IZ1A 2B65A 1MQDA 5K2XA 3T9UA 4X9TA 3PMVA 3MUQA 4GIZA 4F1VA 4DZ1A 3LR1A 1LBCA 1I6AA 3MZBA 2GH9A 3PU5A 2Q9TA 2D21A 3KN3A 4LUBA 1H43A 2XD3A 4QSDA 3OEKA 3OO9A 3RGYA 4OQOA 1II5A 2XXTA 3A3CA 5ISUA 3W15C 2KLFA 3G3HA 3MVZA 1MM6A 2YPNA 5H8FB 2V3TA 3TDJA 1ANFA 3PUWE 4RY1A 5AA4A 1VE4A 3KFMA 5DVIA 4QFKA 5IAIA 3M3FA 2O1MA 5B7DA 3T9XB 3O6HA 2VP1A 2Z22A 1XVXA 1RKMA 2Q2CA 3R26A 1IIWA 1NNTA 4LQ2A 1ZTYA 1UIVA 1NKXA 1GV8A 1OVTA 3TEPA 3PUVE 1B0HA 3KN7A 5H8NB 4K3FA 1AOVA 1PB8A 2Z23A 3RTFB 4L17A 2I3WA 4YB5A 3T93B 1XS5A 3V83A 2QMXA 4FEDA 5TP9B 3FATA 1FQFA 1OLAA 4NF4A 5AA4B 2RKMA 3O29A 1QW0A 4BDNA 4MLQA 3UN6A 1ZU0A 2RC9A 4EUOA 2O68A 1FQAA 2XX7A 1Y3NA 2XX9A 1XOCA 3IB1A 3TCFA 1IXCA 1Z7ME 3QXMA 4PP0A 3IX1A 3FXQA 3K0VA 3I6VA 1CE2A 1N84A 2QJEA 4M1VA 2OJTA 5EHMA 3TTLA 5CM6A 3LSFB 4U1OA 5DVFA 4ELQA 2I0BA 3OD7A 1H3DA 1SVXB 3I3VA 4OWDA 1P1OA 2PT1A 3C33A 4ZZEA 1LB8A 1URDA 3RY3A 1Q1KA 1DTZA 1URGA 3TQLA 4F18A 4OZ9A 4IB2A 1AMFA 1HSEA 2Q8JA 2RF1A 2F7CA 3OMBA 4TQUQ 3TPAA 1N04A 4FJPA 3FJ7A 3KG2A 4KYEA 5KCJB 1O63A 1POTA 3CG1A 1M5BA 4U4SA 2AL4A 5J1DA 3TTMA 5K2YA 4KQPA 1B32A 4U23A 1PB9A 3SETA 1QUKA 4R9GA 5I59B 1BP5A 1GVCA 5I56A 1LFHA 3N5LA 3A3UA 3MC2A 3OOAA 3PD8A 3RUMA 3FVKA 3VV5A 1R6ZA 1JEUA 3IL1B 2GRVA 2QS1A 5AA3A 3CRBA 2QRYA 4ECFA 3O66A 1MQGA 2F7BA 4LATA 4ONYA 2O7UA 5H8SA 3GBBA 3WAFA 3OSQA 2HFBA 3EF7A 4P0IA 3K6XA 3TYHA 3M3KA 3H7MA 3R7XA 1MPCA 5CBSA 1PB7A 3BKIB 4H8IA 3GZGA 1YPNA 2Y84A 2ZYNA 1SBPA 2FA7A 3G3KA 5HBCA 3RT8A 2ZYOA 1JW5A 3U8QA 1MDQA 3TTNA 3O6GA 1O64A 3IO4A 3S9MC 3CIJA 2BJJX 2Q89A 3SEUA 2F36A 1NFTA 1CB6A 4NF8A 4DIGA 2NXOA 3RQTA 2H98A 2REJA 1B7HA 4G68C 1QVSA 1FTMA 4R2BA 3TTKA 4FATA 3TFLA 1B58A 1MQJA 3OENA 4FECA 4R73A 5F1QA 1UTBB 4EF2A 3FV2A 2VOZA 4UACA 2I58A 4NWCA 2Y7IA 3MVXA 4YKPA 5DEXB 5KCJA 1MY2A 3N26A 3FZVA 4PETA 4R6KA 4X48A 3BFUA 3E9XA 1F9BA 4JBZA 4F31B 1MXUA 5I84A 4KPTA 4GFRA 4OFOA 4OESA 3ECRA 3O28A 1AIVA 3C36A 1Y4TA 3PMWA 3C31A 4GF8A 1N7WA 2THIA 5L9OA 4ZE8A 1B5HA 2DXYA 1A8FA 1B4ZA 4KCCA 1SYHA 3B6QA 1A99A 2HZLA 4YMBA 2ZXTA 1D4NA 3E3KA 5M2VA 3QK6A 1B05A 1HSJA 1SDXA 5DYHA 2NWJA 4Q5TA 5DVJA 4C1UA 3H4ZA 4RYAA 5I2NA 1MXWA 1Y9UA 3FVOA 2HAUA 3KEIA 2ABHA 3VVFA 4BDLA 4LZ8A 2F78A 5TU0A 1B40A 3TAJA 3DELB 3IB0A 4LZ5A 4WKMA 3IJXB 3PPRA 4DXUA 1YCJA 1ZMGA 4DDDA 1EH3A 4ESXA 3UIFA 1QJMA 2Y7KA 4F2QA 2Z8EA 1ZJLA 4AQ4A 1SI1A 3JYRA 1J1NA 1DMBA 2PVUA 5I59A 3SERA 2CZLA 3VFJA 1OMPA 1NMUA 2XXRA 3PPOA 2HXWA 1LAGE 3OO6A 4H6DA 4IO2A 1I69A 3IO6A 1M5CA 3RPWA 1QKAA 3THIA 5H8FA 5KDTA 4AB6A 3O6IA 4GVOA 4YAHX 3SEYA 4PFUA 3G3IA 2UVGA 4E0XA 1B5JA 1TT1A 2P2AA 4WXJA 4HCWA 1IXIA 4RNSA 3D4CA 4OFJA 4ZS9A 3LSLA 3O9PA 4M4GA 3B7DA 5H8HB 5TPAA 3SDFA 1P1QA 3FV1A 2OK2A 3S9EA 2DE4A 5JEIA 2G29A 3USDA 3G7WA 3N6TA 1B3EA 3M8UA 3MWBA 1NNKA 4YZZA 2XXUA 5H8QA 1MXVA 3HHGA 3SEWA 2HEUA 4O3BA 4OHNA 3UP9A 3IOWA 4NF8B 1A40A 1IQ7A 2PT2A 3HO7A 4YKKA 5AA1A 4GQOA 3RNNA 1ZLQA 1MXYA 4WEPA 1UTBA 1Y3QA 3U72A 1JW4A 2ANJA 1QUJA 2NOOA 1Z7NE 2B3BA 3FASA 1IITA 5DT6A 5H8HA 1B3FA 4F19A 4ZEDA 1TWYA 3MW0A 3ILTB 2O1LA 2XXVA 1B52A 1LLSA 1DPEA 1N3XA 3LSXA 1USYE 4G8MA 1MPDA 3ILUB 3FJGA 3FJMA 4H67A 5H8NA 5TPAB 4BDMA 1B1HA 2HQ0A 1POY1 1LSTA 2XXYA 3LSWA 4GRKA 5FTIA 1NNFA 4IGRA 4MF3A 1AL3A 3T9HB 2Y7WA 3Q25A 3IOVA 1BLFA 4I9DA 1I6BA 4OYVA 4Q8RA 4QSEA 3PV0E 1B9JA 1FTLA 3AXFA 3FUZA 4ZEBA 3UA8A 2D5WA 1QULA 2I48A 3VVEA 4F3GA 1Y4CA 1P1WA 2PBWA 2AIXA 3PUZE 3TODA 2ZMBA 4F29A 4F1UA 4ELOA 5JTYA 1FQEA 3V5AA 4ZEKA 3IK6B 1P1UA 4G77A 1S50A 4RA1A 4EQ7A 4HCYA 1QKBA 4O3CA 4ZEFA 3PUYE 2F6GA 2Z8FA 3JZJA 1WDNA 3LBSA 3PMXA 4H8JA 3E13X 4GL8A 3TKDA 2O84X 2ZYKA 2XXQA 1VFDA 3S2VA 1FQDA 2IA4A 3MZ1A 1JVYA 1BIYA 1SW5A 2V3UA 3U1OA 2DE3A 1TXFA 4OMBA 4NEDA 3K01A 3V8XB 4Q30B 3F11A 3RTWB 1OIBA 2CMOA 3HHFA 1N0TA 4G68B 1A55A 2E0SA 1LAFE 2Q2AA 1IUDA 1LAHE 2W7YA 4JXIA 2YLNA 4UA8A 5CMCA 4IO7A 2V93A 1Y20A 1UTHA 1S7YA 1FTJA 4JDFA 2XXXA 3C34A 3OELA 3PUXE 3H06B 3S4UA 3TTRA 4G4PA 1H44A 3R6UA 4G2ZA 4JSOA 1T0KA 4QRZA 1GR2A 1WODA 2OZZA 4EXKA 4MLVA 4OETA 4U1ZA 4XTCQ 1OVBA 3KOSA 2RC7A 2OLBA 3EHTA 1MH4A 4IY5A 3RLFE 3K6WA 2RINA 3UORA 2M8CA 4LP2B 3T66A 3H03A 4Q0CA 1Y1MA 5I57B 3OO8A 3B6WA 3HV1A 2B3FA 1YAEA 3KJ7A 4GXAA 4H1XA 4G8NA 4YB6A 1KWHA 1LAXA 2ONRA 2WKYA 3DP6A 4KI0E 4DXBA 3FXRA 2PX1A 1MXXA 3MQ9A 3GXAA 3H6WA 5HPQA 3C9HA 4JWYA 2F97A 4RPNA 4JWXA 4R6YA 4NTLA 1IXHA 1NH8A 3TCHA 4QFPA 4QF9A 2I4BA 4RK2A 2XXPA 4H5GA 4LA9A 4BDRA 3G3JA 2ZYMA 1ZBMA 3CG3A 4E0WA 4EQ9A 4PFYA 1OLCA 3KBRA 4QFLA 1FQBA 4JWOA 3VXBA 4NE4A 4XKNA 3TMGA 1US5A 1GTKA 3FIRA 3QAXA 4N07A 5JTYB 3L6GA 1NH7A 2G93A 3PGFA 4IO3A 1A8EA 1PBQA 1EZOA 4KHZE 4R74A 2DWAA 2F34A 3MZ9A 1XT8A 3LUYA 1NNPA 2DWHA 2IEEA 2Y7PA 4G8HA 4QFNA 3TELA 1PC3A 2XHDA 4Z0IA 2ALUA 2XD2A 3FD3A 3U93A 1OQHA 3CSBA 3KN8A 3N94A 5FTHA 3C35A 5ICTA 2H9BA 4QHQA 3MAMA 2DE2A 3EQ1A 3CSGA 3MVWA 4XKPA 3B6TA 2XXWA 3RN8A 3T96B 3V89B 3ZS6A 3KGCA 4C0RA 5DTBA 3H3GA 5HM4B 2X26A 1B1XA 1DTGA 2H5YA 1ATGA 3IOUA 3ODBA 4U2RA 2DSFA 4KCDA 3VDFA 2FNCA 3IOTA 3SEVA 5L8DA 5CI5A 1BTJA 4F2OA 3W9VA 3D4GA 1URSA 5LOMA 1MRPA 2A5TB 2ZNTA 1USYH 1YTVA 4POXA 1DOTA 1MDP1 2HCAA 4DXCA 4O3AA 2QS4A 1LCFA 2ZNSA 3GBAA 4POWA 2P0SA 4WEDA 1LGBC 3K00A 3IAZA 2I4CA 3SEXA 3FVNA 3K02A 3MJNA 4P11A 4NF6B 4FIMA 4KFQA 1H76A 2HAVA 3DLNA 3CR9A 4R75A 5L9MA 4R9FA 3A09A 3H6VA 4XKRA 1DPPA 1SW1A 1MY4A 1Y1ZA 2NVUB 3IB2A 4GL0A 4RK9A 4DE8A 4F3SA 2X7QA 4F22A 4HTGA 2QS3A 2Z8DA 4DCXA 3IJOB 1Y3PA 5I57A 2QS2A 3U92A 4BDQA 5KDTB 1VR5A 3EHSA 1ELJA 4R72A 4P0GA 3Q28A 5A5XB 3PD9A 3P7IA 4XKQA 3UK4A 2V84A 3K6VA 4XIGQ 1M5EA 2PMSA 2OBGA 4X1DA 1M5FA 1MH3A 1PDAA 3K2DA 4RPOA 1B2HA 4RXLA 3K6UA 4NF6A 3MP6A 4BLAA 4MBPA 2XXHA 2FYIA 4X1BA 2UVHA 4EQBA 4EDPA 5ITPA 2DVZA 1B51A 1IXGA 4I62A 1ZKBA 4AB5A 4H0WA 3FGSA 3ZKKA 5BUUA 4EXLA 1VFEA 3PPNA 2RCAA 4H5FA 4IO5A 4PFTA 5CBRA 1SD3A 4KD5A 1M5DA 2X7PA 4GLIA 1I6QA 4YKJA 1EZ9A 3E4RA 3IORA 1QUIA 3HCQA 4TLMB 5CMKA 5ICQA 4HS7A 3C4MA 4IY6A 2I0CA 2R6GE 3GLBA 3M3LA 3KSXA 3H6TA 1RYOA 2QSXA 1A54A 3L6HA 4I1DA 4TOZA 4OFLA 1FW0A 4YKIA 4F3BA 1MY0A 1A7LA 1VSOA 1MY1A 4ZE9A 4LONB 1WVJA 2O7IA 2VHAA 5F7VA 4ELPA 1P99A 4FE8A 4U4XA 5FHNA 1FCKA 1B3LA 2DXRA 3BBRA 1B0LA 2E1SA 4NWDA 4YU0A 4N13A 1H45A 2A5TA 3MPLA 2QL3A 4ZEIA 3TCGA 2ONSA 3DP4A 4F1YA 3QYTA 2F6PA 2UXAA 3JV9A 5H8QB 3T9VA 5KZTA 2UVIA 3QSLA 2OWSA 2I6EA 4QSCA 3UGWA 4EF1A 4YMAA 4NF4B 2R9JA 3K1NA 2DQVA 3ONMA 4Z7EA 2P1SA 2F7AA 3CFZA 2UYEA 3FVGA 5ELVA 4DCYA 5I2NB 2VD3A 2XXIA 5A5XA 4KYSA 3TZAA 4OENA 2A5SA 2GHAA 1JEVA 4HW8A 4PFWA 5EYFA 2REGA 5CRYA 1EU8A 3WAEA 1R9QA 5I58A 3CI8A 2F5XA 1TFDA 3VXCA 5CC2A 1MPBA 2GFEA 3MPKA 2HZKA 3T22A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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