5JTYB

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
279
structure length
276
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
total genus 79
structure length 276
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB02
1JNFA 2I58A 1P1UA 3HN0A 3M8UA 3W9WA 1HSLA 4DZ1A 4NWCA 4ELOA 4RPNA 1PBPA 4JSDA 3THIA 5B70A 2Q9TA 2F35A 4QF9A 1NL5A 2Z23A 3N94A 4ISUA 4M1VA 3FXQA 4OZ9A 4NF5A 2B65A 1LAGE 5H8NA 2E1SA 1SVXB 3LSXA 1YTVA 3MP6A 3G3IA 5DT6A 4NMYA 2Y7IA 3LR1A 4BDQA 1YCJA 1P1QA 5I59A 3LC8A 1SYHA 2DXRA 2A5TB 3FATA 2QSXA 1A40A 3QUFA 3JV9A 3VXCA 1EZOA 1LFGA 4IO4A 1B46A 2QRYA 1D3KA 4KYEA 4U22A 1UIVA 3PPRA 5DEXB 1Y4TA 4THIA 5I56B 4GL8A 3MBPA 5AA2B 5HM4B 1FTMA 5HPQA 4TQUQ 1JVYA 1JW5A 3M3LA 3OEKA 2OZZA 1QKBA 4GOTA 4OENA 2NVUB 3UIFA 3KN8A 2D5WA 3T9VA 3W15C 1OLCA 3O66A 3L6GA 2F97A 4ZEBA 2GHBA 1B7ZA 1N3WA 1NNPA 2F7CA 5L9SA 4LVQA 4OEUA 3RQTA 1MQGA 3TTKA 3MZ1A 2DWAA 4L17A 3TCHA 4YU0A 2XX9A 3VLWA 1PC3A 1XVXA 4FIMA 1B3GA 4FORA 3C34A 3CG1A 2HAVA 3CVGA 3ZKKA 4F3PA 3LBSA 5H8HA 2D21A 5CBRA 2I0CA 1AH5A 3IOUA 5I59B 3MVWA 5CM6A 5KCJB 1MM7A 1LAHE 3KSJA 1GGGA 2DQVA 4R9FA 1MS7A 4X1BA 3S4UA 3K2DA 4R2BA 4H5FA 2YJPA 1B3EA 3M3KA 3HV1A 1D9VA 1LSTA 2HQ0A 2P0SA 1ZU0A 2XXIA 3K6UA 3QIMA 4YICA 3UK4A 2UVJA 2XXVA 2XXUA 1P1WA 2XXPA 3VXBA 4FAJA 1M5BA 1OVTA 1IZ1A 1Y9UA 1PBQA 2DVCA 2PT2A 3TAJA 1A54A 2OCUA 5I57B 4LQ5A 1HSEA 1Q1KA 3B6WA 1UQWA 4ZEFA 1LBBA 1MPCA 2DE4A 3KBRA 2OBGA 3TTRA 4LP2B 2ZMBA 1FQFA 2NUVA 3RLFE 3SETA 3MAMA 3FV1A 4N13A 4NEDA 3TCFA 2O69A 1NKXA 2R9JA 3SEXA 1B32A 1R9LA 2CZLA 4PETA 3TTLA 1B1HA 4ZS9A 3FJ7A 4JDFA 5FHMA 4OMBA 5TP9B 4AB6A 3S9EA 2IEEA 2RCBA 2D3IA 2HEUA 4JB7A 4YZZA 4KPTA 4K3FA 3V5AA 4F1UA 2H4IA 2A5SA 4H67A 2NOOA 3TDJA 5AA4B 3D4GA 3T9HB 2LAOA 4G2ZA 1LB8A 4U23A 1LCTA 4I62A 1UIUA 4U4XA 4ZDMA 4OEVA 2NWJA 4LA9A 4QRZA 2Y84A 4F22A 1ZLQA 4R74A 3OO7A 2XX7A 3E9XA 2YPNA 1MXVA 2QS4A 4F3BA 1TFAA 2O51A 1S7YA 5KDTA 3TQWA 3U94A 5CI5A 2ZNUA 3ZS6A 1VFEA 3C35A 3VVDA 3R7XA 1N3XA 2R71A 3TKDA 1CE2A 3UGWA 3MQ9A 3G3GA 3G3KA 3WAFA 5DVIA 4PFTA 1H76A 1M5EA 2F6GA 1MG1A 1A7LA 3K1MA 3MWBA 5CMCA 4GLIA 3H3GA 4LONB 3U92A 3OXNA 3GBAA 1B3FA 5DVJA 4MLQA 3TTMA 3C4MA 3A3UA 2VHAA 5I2NA 1OVBA 2F36A 2ALUA 4GXSB 2P2AA 1SYIA 1MQJA 2I3WA 1PB8A 4DXUA 4EQ7A 3R26A 4N6PA 1VE4A 1B0LA 2OLBA 3H4ZA 3QYTA 5DEXA 2HZKA 5AA1A 4ELQA 1DSNA 1IXGA 1SBPA 4U1OA 3TEPA 4OETA 1N84A 1A8EA 1A55A 2RCAA 2GRVA 3CRBA 5J1DA 5KDTB 1B52A 1NMUA 2O68A 4UACA 3S2VA 3SEUA 4IO3A 3RT6B 1B5HA 2QPQA 3U72A 5CMBA 1R9QA 2G29A 3KOSA 5ICQA 2F78A 3EN3A 3LSFB 3OELA 3QSLA 3VFJA 3IAZA 4EQBA 2F34A 1JQFA 4FEDA 4M4GA 4FEBA 5I2NB 4RK9A 3VLUA 4DIGA 1AIVA 1B3LA 3GZGA 5LOMA 1UTHA 2XXQA 3PPPA 4DCYA 4GIZA 4XXUA 3SEYA 3Q27A 1NNTA 2I3VA 3RGYA 3SERA 4HW8A 3HCQA 2IA4A 2QS3A 2Y7RA 4I8CA 1VSOA 4HCWA 4ZEKA 2THIA 2UVGA 4NF5B 5M2VA 4F1VA 1TXFA 3MP8A 4H5GA 3H6TA 1S9TA 1S50A 5L8DA 4UA8A 4H0WA 2UXAA 1MXWA 4DLDA 4Q0CA 1QULA 4GXAA 2V3UA 5BUUA 4P0GA 3A09A 4Q30B 1OQHA 4GD5A 4KD5A 4PFUA 4XIGQ 4POXA 3KZGA 2REGA 4YB7A 3CFXA 3PPQA 1Z7ME 1N7WA 4XKRA 2VP1A 2Q8JA 2VGQA 3MZ9A 4LUBA 5TU0A 3T9XB 3TUSA 4OFJA 1ZKBA 2H98A 5L9OA 1WDNA 3G7WA 1DTZA 1EU8A 1JVXA 3IJOB 3QUJA 4OTEA 4F31B 5AA2A 2I6EA 1Y3PA 3FVKA 4WEDA 1DMBA 4PP0A 3FV2A 2P1SA 3BKIB 3IX1A 3OD7A 4G77A 1LBCA 4JXIA 3IJXB 4C0RA 4QFOA 1US5A 1N04A 2CMOA 3FVNA 3OO6A 3PD8A 3GXAA 2PBWA 4WEPA 3RNNA 3UN6A 2RF1A 2UYFA 3IORA 4MH5A 5H8SA 4DE8A 2RC9A 5AA4A 4IGRA 4R6KA 3S9LC 1B0HA 2XXYA 3O6IA 5JTYB 4E0WA 1QUJA 5KCJA 4C1UA 3KOTA 4NF4A 1EZPA 1MXXA 1FCKA 1NNKA 3RTFB 3CR9A 1D9YA 4MLVA 3O6HA 5AE4A 3H6VA 4DXCA 2ANJA 1URGA 3QK6A 3KN7A 1RYXA 1R6ZA 3K6VA 4BLAA 2I4CA 3UORA 2Y7PA 4X48A 1KWHA 3Q28A 1QW0A 1SQYA 2QS2A 3OMBA 5H8FB 3V8XB 1ELJA 4G8HA 3IB2A 1XS5A 3ILUB 2I0BA 3K0VA 3H06B 3O6GA 2X7PA 4GVOA 4XKNA 5H8QA 3EHSA 1P1NA 3M3FA 3VVEA 3IO6A 4PE5B 5I57A 4H65A 1AOVA 3MVXA 2DYXA 4P0IA 3O28A 4X9TA 4DXBA 4TLLB 2KLFA 1BIYA 5I58A 5DVFA 5I58B 4H8IA 3PPOA 4EXKA 1URSA 3RY3A 4LZ8A 2ONSA 1LFIA 4EDPA 3KJ7A 5JTYA 1I69A 1XT8A 1H45A 1AMFA 4RK2A 5H8NB 3PUZE 2H9BA 3H6UA 4IO5A 4JSOA 3I5OA 3MJNA 3PUWE 4R6HA 1O7TA 4RNSA 1LAXA 2ZYNA 4RYAA 1L5TA 2DE3A 4FJPA 4ELRA 2ZNTA 3K6WA 4OXVA 1POY1 1XVYA 1XC1A 1QUIA 1BLFA 3PV0E 3PUYE 2XHDA 3R6UA 2XXWA 1HSJA 3E3KA 4TLMB 3T9UA 2PX1A 4I9DA 2ZYKA 4IGTA 2RINA 1Y4CA 1Y1ZA 1FTLA 1YAEA 4XTCQ 4ZECA 3ECRA 3BFTA 3VV5A 3ZSFA 2DS9A 3FZVA 5K2XA 3DELB 2UVIA 3IK6B 4U2RA 1MPBA 4DCXA 1IXIA 2V25A 2ZXTA 3EF7A 3PMXA 3MPLA 4R2FA 3H6WA 1GR2A 2DE2A 2B3FA 2OWSA 3QAXA 3PU5A 1CB6A 1JW1A 1MQHA 1MH3A 2VOZA 4PFWA 5F1QA 5HBCA 1IUDA 3DM0A 1EH3A 2WKYA 5FHOA 1MY3A 3K4UA 4MBPA 2I48A 1MY1A 2ESNA 4G68A 2V93A 2PYYA 3MVYA 3EQ1A 4F2QA 4F3GA 3KFMA 3K01A 1M5CA 5FTHA 3DP6A 4GL0A 5I56A 1BP5A 1NNFA 4C1TA 2ZYOA 3S9NC 4BDNA 2I49A 2H25A 2HXWA 4IY6A 4XKQA 1LCFA 1VR5A 3B7DA 1QJMA 2O1MA 3PD9A 1R1NA 4IY5A 3HO7A 5BWJA 3SESA 1LAFE 1LLSA 1OMPA 1FTJA 3DP8A 1JEUA 2RKMA 3O2AA 3H7MA 1Y3QA 2F8DA 3MUQA 3T66A 2V3QA 1OQGA 3B6QA 3G3FA 3AXFA 3P7IA 4MFIA 4NF6B 2O84X 3CFLA 5TPAB 3BBRA 1SW5A 3TCGA 3HPIA 4RPOA 3VDFA 1B3HA 4X1DA 4KQPA 3V89B 4BDOA 2ONRA 1FQCA 1IITA 2O1LA 3CSGA 4O3AA 4R72A 2DVZA 5H8HB 2O7UA 3C9HA 4KR5A 1PDAA 1B5IA 1UTBB 1Z7NE 1QVSA 3EPEA 1MRPA 3LSWA 2GFEA 3C36A 1MY0A 2Q2CA 1SD3A 2QMXA 3I6VA 4Q5TA 4G68B 4QSEA 3PPNA 1ZBMA 3VLVA 3PGFA 2XX8A 1RKMA 3CSBA 1D4NA 4NE4A 3JZJA 1NH7A 4JBZA 1IEJA 1US4A 2Q89A 4YMBA 1LFHA 5CMMA 4OQOA 2AL4A 3KN3A 1MDP1 1H43A 2QJEA 4NTLA 4G8NA 1XOCA 5ELVA 1SW1A 1MY4A 4YKKA 3SDFA 5B7DA 3UA8A 4OVJA 1B51A 4QFLA 1SI1A 3MC2A 3OENA 4U21A 4BDMA 4I1DA 5A5XA 2ZNSA 3OEMA 3DP4A 4YB6A 5CRYA 3B6TA 2Y7WA 4QFNA 5DTBA 3LUYA 3OSQA 3I3VA 3UP9A 5JEIA 3D4CA 1TFDA 3FVGA 4POWA 2M8CA 1T0KA 3RTWB 3SKPA 1TT1A 2RC8A 1DOTA 3IOVA 3TPAA 1DPEA 3VE1B 3RN8A 4Z7EA 1JETA 4GRKA 4R75A 5JK4A 2AYSA 3O29A 2O6AA 4QFKA 3G3JA 3C31A 3IB0A 3Q26A 3W9VA 4EF2A 4ZE9A 1JEVA 2B3BA 2PT1A 2ZYMA 2UVHA 5EHSA 4IB2A 5K2YA 4RY1A 3RUMA 2Z8DA 1IXCA 1DTGA 3IB1A 4KFQA 4LZ7A 5AA2D 3TYHA 3ONMA 1MXYA 2H5YA 4F39A 4KI0E 4F18A 1GTKA 2DOJA 1IIWA 1OIBA 4QFPA 3L6HA 1B05A 1B58A 5CMKA 1B4ZA 1I6AA 3O9PA 3Q25A 4RA1A 2ABHA 3HHFA 2XXHA 3PUXE 3N5LA 3K00A 3PUVE 2REJA 1LB9A 3U8QA 3WAEA 1OLAA 1QKAA 1Y20A 2GH9A 2I4BA 2Y7KA 1XHYA 3TQLA 1FW0A 1NFTA 3K02A 4IO2A 3T93B 1GVCA 4YKPA 3IL1B 4YKJA 4NF4B 2F7AA 4HTGA 5EHMA 3GBBA 1PB9A 1F9BA 1SW4A 2Z8EA 4YMAA 2DWHA 3ILTB 4R6YA 2OJTA 4G8MA 4MF3A 4RXLA 1N76A 3FJGA 3KG2A 3E4RA 2FNCA 4R73A 4WXJA 1MH4A 5L9MA 2X7QA 4EF1A 2NXOA 2R6GE 1BTJA 2ONKE 5IKBA 4NWDA 3SEVA 4ESWA 5CBSA 3EHTA 3KJTA 1RYOA 3MPKA 4F1YA 1USYE 1I6BA 1O63A 3A3CA 3IOTA 1FQDA 2HZLA 1I6QA 2V84A 1TWYA 1MQDA 2XXRA 2Z22A 3K6XA 3N26A 3Q29A 2DP8A 4GWOA 2UYEA 4O3BA 1P99A 4AB5A 1N7XA 1B2HA 3ZKLA 1MY2A 3G3HA 4ZE8A 3SEWA 1EZ9A 1FTOA 4LQ2A 2O7IA 4TOZA 3VVFA 5I84A 3MVZA 2G93A 3DLNA 4HS7A 1N0TA 2A5TA 4YKIA 4EXLA 4ELPA 3FXUA 1A99A 3TELA 5I2KA 1ZMGA 4ONYA 4OWDA 3IOWA 1ZJLA 1MPDA 3CG3A 1A8FA 1GV8A 4F29A 4P11A 4HCYA 4QHQA 1PEBA 4JWXA 5ITOA 2F7BA 2V3TA 3FD3A 3RT8A 1Y3NA 2H99A 2PVUA 3K1NA 3TFLA 4ESXA 1B5JA 4Q8RA 3FUZA 2QL3A 1MQIA 4NF6A 3FXRA 1B1XA 2RC7A 1WVJA 3PMWA 4G4PA 4G68C 3FVOA 3IR1A 4KHZE 2E0SA 1B7HA 4H8JA 4KYSA 3USDA 1Q35A 3HHGA 4GFRA 1QUKA 1B40A 5F7VA 4BDRA 4E0XA 1AL3A 2XXXA 4KCCA 4WKMA 1SI0A 1B6HA 1UTBA 4ZEIA 4ECFA 3C32A 4ND9A 4Z0IA 3JYRA 3OO8A 4FE8A 4FECA 2VD2A 2XD3A 4IO7A 3ODBA 1ANFA 1P1OA 2F5XA 4H6DA 4O3CA 1POTA 1URDA 1H44A 2Z8FA 1FQBA 4QSCA 5EYFA 3MZBA 4NF8A 4OFOA 4YB5A 2FA7A 5FTIA 3KEIA 3OSRA 4PQJA 2XXTA 2DSFA 1VFDA 2F6PA 1BKAA 1M5FA 2XD2A 1LGBC 3C33A 3H03A 4OFLA 2QS1A 5DYHA 3TZAA 3U1OA 5I2KB 1Y1MA 2VD3A 3IO4A 3PMVA 1B9JA 2FYIA 2X26A 3FASA 3FJMA 4PFYA 4OHNA 5KZTA 2AL5A 1YPNA 1SDXA 4H1XA 4JWYA 3CFZA 2PMSA 3U93A 4ZZEA 1NH8A 3F11A 3EHUA 4N07A 1MDQA 4DDDA 1MXUA 1J1NA 2GHAA 1II5A 2AIXA 3KSXA 5FHNA 4U1ZA 4EQ9A 3QXMA 2DXYA 2W7YA 4GQOA 4ZZAA 5AA3A 5ICTA 3S9MC 1SW2A 1B4HA 4GF8A 4KYDA 4BDLA 2BJJX 3HSTA 1DPPA 1FTKA 4R9GA 4F19A 4QSDA 3OOAA 5TPAA 3KGCA 3TTNA 1IXHA 1PB7A 5ISUA 2HAUA 2HCAA 4OESA 2OK2A 3MW0A 4XKPA 4NF8B 3CIJA 5TP9A 2OWTA 3FIRA 4AQ4A 3TODA 3TMGA 1ATGA 1ZIUA 3E13X 1FQAA 1MXZA 1O64A 4EUOA 4YAHX 5IAIA 2QMWA 1MM6A 3OO9A 3FGSA 1FQEA 2YLNA 3GLBA 4IO6A 3T22A 4OYVA 1USYH 5CC2A 4RJZA 3BFUA 3V83A 1H3DA 4LATA 3T96B 5ITPA 3RPWA 1WODA 3K1PA 2Q88A 5H8FA 3CI8A 4U4SA 2Q2AA 4KCDA 4F3SA 3N6UA 2DWJA 4FATA 5A5XB 1IQ7A 1B7UA 5H8QB 1JW4A 3N6TA 4LZ5A 4F2OA 4ZEDA 1ZTYA 4JWOA 2DWIA 1UTHB 2HFBA 3LSLA 3MP1A 3O97A 1M5DA 4OERA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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