5JTYB

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
279
structure length
276
Chain Sequence
b'DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, receptor
total genus 79
structure length 276
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB02
1R9QA 1M5EA 1MPCA 5HM4B 1M5DA 1DPPA 1UTHB 3MBPA 2VHAA 3VFJA 4RNSA 5DYHA 3VE1B 3HPIA 4GD5A 2H99A 3DP8A 3PUXE 5AA4A 4I9DA 4GXSB 3H3GA 5FTIA 1IXGA 4BDMA 1CB6A 1B58A 5H8SA 1VE4A 3ZS6A 4IGTA 3HHFA 3TQLA 3KBRA 1TFAA 4I8CA 4U22A 4PE5B 1DPEA 1L5TA 1JQFA 3KJ7A 1MQGA 2WKYA 2I48A 3VLUA 5KDTB 4NTLA 3VXCA 3C35A 2OBGA 1H43A 2GRVA 3SEYA 1OMPA 1MY4A 3KOTA 3MAMA 4R73A 3OO8A 2OWTA 4JWXA 1OQGA 3DM0A 2HQ0A 1Z7NE 2IEEA 4OERA 1Y3PA 4MLQA 3UP9A 4QFLA 4NEDA 5EHSA 1EZ9A 2W7YA 1N04A 2O51A 3QUFA 2RC8A 4EXLA 5L9OA 3H7MA 3KGCA 1N0TA 1MXYA 4YICA 1IQ7A 3G3KA 3TTNA 4QSDA 2I4BA 3RN8A 2Y7PA 4ZE9A 4LUBA 1B7UA 3TDJA 4N6PA 2XX9A 1B5JA 2PYYA 2LAOA 3FV1A 2F35A 4QF9A 4ZECA 4LZ5A 3EQ1A 4IGRA 3C9HA 2OLBA 3QIMA 1LAGE 2DOJA 1UTHA 3K2DA 3RQTA 3SEVA 2ANJA 4GFRA 5I2NB 1D9VA 4YMBA 2DVCA 3C34A 4R2BA 5HPQA 1UIVA 4ZEBA 3C33A 4KPTA 3RNNA 2OZZA 3O29A 5DVJA 5ICTA 1FTLA 1MQJA 3QSLA 3S4UA 4LONB 2FNCA 5TP9B 1VR5A 3VVEA 4OFLA 3FD3A 4F1UA 3PD8A 1B7ZA 1MXWA 3TQWA 3UN6A 2B3BA 4F19A 5KDTA 4BDLA 1IZ1A 5L8DA 2Y7KA 4GL0A 1DTGA 3EHSA 4THIA 4MF3A 1SQYA 1LAHE 3B6TA 3HV1A 4G8NA 3OO6A 4LZ8A 4X1BA 1B3FA 1LB9A 3U72A 2Q88A 4F1VA 5TPAA 3CG1A 1NH8A 4E0WA 2QMXA 4NF6B 3IOUA 1ELJA 1LAFE 4Z7EA 5JEIA 4NMYA 2UVHA 1MRPA 3IORA 2QS1A 1EZOA 3EF7A 3GXAA 2THIA 4QSCA 3V89B 4OETA 3IB2A 1BKAA 5CMBA 2V84A 2UXAA 4LVQA 3FVOA 1LGBC 1BP5A 4M4GA 5BUUA 1CE2A 5DVIA 1B2HA 2O69A 4ZDMA 2R9JA 2Y7IA 3K6XA 4U2RA 3FVNA 2FYIA 4F3BA 1JEVA 1HSEA 4C0RA 1MDQA 3IOTA 4ZZAA 4F29A 3TTKA 1R9LA 1P99A 2E1SA 3OEKA 3R26A 3T9UA 4LP2B 2CZLA 3T93B 4FEBA 1XHYA 1S7YA 3K1PA 5I2NA 3KSJA 4GLIA 1MXXA 2G29A 1VFEA 4KYEA 3FVKA 3UORA 2I6EA 3VVFA 4ZEKA 1ZU0A 3H6TA 4YU0A 2O7UA 3CI8A 3G7WA 2I3VA 3IK6B 2F34A 2IA4A 5TP9A 3B6WA 2A5TA 3K6UA 1IITA 4KYDA 3CIJA 3MVXA 3P7IA 4GL8A 1B4ZA 5IKBA 3CSBA 4XKQA 2GHAA 5H8NB 2ONRA 3KEIA 1EZPA 3U92A 3K00A 5CI5A 1SD3A 5I2KB 3TTMA 4Z0IA 1Y1MA 4FATA 3MZ9A 2I49A 1MXZA 3SDFA 4EQ9A 1MS7A 1TFDA 5L9SA 1R6ZA 2F6GA 4BLAA 2RC9A 4ELRA 2AL5A 1I6AA 4HCYA 2B3FA 4NF6A 1P1NA 4DLDA 3K01A 1B3GA 3FJGA 1URSA 4Q8RA 3LSLA 3FIRA 3TMGA 3O97A 3G3JA 2NXOA 3PPNA 4FIMA 3MP1A 4YMAA 4I1DA 3L6HA 1B32A 4ONYA 3VVDA 3S9MC 3MZ1A 3CFZA 3FXRA 1IIWA 2P2AA 2ZNSA 2I3WA 3IAZA 2DWJA 3AXFA 1QJMA 3HO7A 2YPNA 4G68B 3PGFA 4XTCQ 1ATGA 3MUQA 1MY0A 3IOWA 5EHMA 3B7DA 4U4SA 3LSFB 3D4GA 3I6VA 2Z8FA 3OOAA 3IO4A 4ESXA 3FXUA 1B6HA 3UK4A 5CC2A 1WVJA 1QW0A 3Q26A 2D21A 3GBAA 1N7XA 5B7DA 2DWAA 1N76A 3DP4A 4OHNA 3D4CA 2ZMBA 2E0SA 3FZVA 4IB2A 4XIGQ 2V3QA 2Q2AA 2DE3A 1A40A 1POY1 1FQCA 1GVCA 4ZZEA 1LAXA 3VXBA 3OXNA 5H8NA 4XKPA 4JB7A 2UVJA 4NWDA 2Y84A 3RTWB 5I2KA 1MXVA 4KQPA 3PD9A 4G2ZA 4R2FA 2D5WA 1P1WA 2VOZA 3M3FA 4Q5TA 4WEPA 4TLMB 4MBPA 3FVGA 3IJXB 2Q9TA 3N94A 3FATA 3HCQA 2I4CA 5CM6A 1IUDA 3PPOA 4F3SA 4IY6A 1B3EA 1PB9A 3PMVA 4LZ7A 1SBPA 1MY3A 1WODA 2I0BA 3SEXA 3A3UA 4PFWA 2I0CA 3H6WA 3O66A 4DXCA 3C32A 4MLVA 2XX8A 3PV0E 3SEUA 3S2VA 2RCAA 4AB5A 1N3XA 1Y9UA 3W15C 2RC7A 1O63A 4G68A 2OK2A 3VLWA 4IY5A 3EPEA 2ESNA 1SW5A 4MH5A 1LBCA 1XT8A 4K3FA 4F31B 3K1NA 1ZIUA 1QULA 3LSXA 4F39A 5TPAB 1M5FA 3IO6A 4NF5B 5A5XB 3ILTB 5IAIA 2DXRA 2O1MA 2PMSA 1ZMGA 1QKAA 2RKMA 4DZ1A 1OVBA 1FQEA 4P0IA 1PBPA 1LFHA 4R72A 4UACA 4G77A 1I69A 3KFMA 5H8FB 3K4UA 1JW5A 4OMBA 2A5SA 3MVWA 4H65A 1A54A 2RF1A 4XKNA 3CFLA 4H5FA 3IB0A 4RPNA 2NVUB 4GQOA 1SVXB 1GTKA 4DIGA 1ZTYA 4QFPA 3SETA 5H8HB 1XS5A 1USYH 3SKPA 1R1NA 1PB8A 1PC3A 4OFOA 4NE4A 3ILUB 4F2QA 1ANFA 2PX1A 4F3PA 1MQIA 3A09A 5K2XA 1DOTA 4F3GA 4C1UA 3PPPA 2F7BA 4OENA 2UYEA 2AYSA 4FE8A 4QSEA 3TFLA 3DELB 1AIVA 4U21A 1B46A 2RINA 4M1VA 1IXHA 3H4ZA 3MJNA 5CMMA 3TODA 2KLFA 1JW1A 4R75A 4LA9A 5B70A 3MP8A 1IXIA 2Y7RA 3SESA 2X26A 2HZKA 4PETA 4PFUA 1QUIA 1O7TA 3PPQA 2XX7A 2ZYMA 3IOVA 4U4XA 4EUOA 3H6VA 1VSOA 3K1MA 2CMOA 2A5TB 1US4A 1JW4A 2QRYA 3KOSA 3M8UA 1SW2A 2DSFA 3KG2A 3B6QA 4XKRA 3R7XA 1SW4A 3VV5A 1SI0A 3BKIB 4OFJA 5KCJB 4PFTA 2F8DA 3SEWA 1FCKA 3H06B 4FORA 4JSOA 4GVOA 3LSWA 1B51A 3TPAA 3TCHA 5K2YA 4NF5A 5A5XA 2V93A 4KR5A 2XHDA 3THIA 1T0KA 5ICQA 4YAHX 4BDRA 1B52A 5H8FA 2F6PA 1FTOA 2QS3A 1TWYA 3E4RA 4YZZA 1I6QA 3MPLA 3DLNA 4YKPA 2HZLA 5I58B 1Y4CA 3ODBA 1O64A 4EF1A 3Q27A 3BFUA 4FEDA 4R9FA 1Y1ZA 1B1XA 1UTBB 5DVFA 4TOZA 4X1DA 4QRZA 5H8HA 4P0GA 4MFIA 2DP8A 4GWOA 1FQBA 4HCWA 4DDDA 4RK2A 3PU5A 2ZNUA 1OLAA 2RCBA 5JTYB 2Z8EA 4H8JA 4R9GA 1LSTA 1IXCA 3T66A 1OIBA 5JK4A 3LC8A 2XXPA 1MY1A 4EQBA 3U93A 4GXAA 2GH9A 2ONKE 4RYAA 1B7HA 4H1XA 4ELOA 5FTHA 1RYXA 1LBBA 1Z7ME 4JDFA 3OENA 3O6HA 4ELQA 4PP0A 5I57B 1B9JA 1FTJA 1D9YA 3H03A 4P11A 1B3HA 1NFTA 3KN7A 3IL1B 1FTMA 1H44A 3RGYA 3N6UA 3PMWA 2F7AA 4POWA 3RT6B 1P1OA 3I5OA 5KCJA 2XD3A 4EDPA 1SW1A 4IO2A 4BDOA 3RUMA 3N5LA 2XXUA 4Q30B 2P1SA 5LOMA 4IO4A 1EU8A 4RXLA 3FV2A 2XXVA 3IR1A 4JBZA 5AA2D 3G3IA 1A7LA 3MPKA 1MDP1 5H8QA 1WDNA 2XXIA 3ZKKA 3V83A 1P1QA 2ZYKA 1MPDA 1USYE 4OTEA 3RY3A 4RK9A 3FJ7A 5I58A 2QMWA 1LFIA 1PEBA 2PVUA 4AB6A 1JNFA 4YKKA 2ABHA 4IO7A 1UTBA 1FTKA 3E9XA 3QXMA 2OJTA 3TKDA 3MQ9A 3H6UA 1POTA 1NH7A 3M3KA 3MVYA 3MZBA 4WEDA 1DTZA 2HEUA 4BDQA 5AA2B 4H8IA 2ZYOA 3KJTA 5I84A 5DT6A 5JTYA 4RY1A 1FQDA 1MM7A 3TAJA 3M3LA 3QK6A 5F1QA 3UA8A 2XXRA 3UIFA 1NNTA 4N07A 2GFEA 3O6IA 4KI0E 5KZTA 3FGSA 1FQFA 1J1NA 1Q35A 2M8CA 3VDFA 5AE4A 5FHNA 2NUVA 3RPWA 3G3GA 1A8FA 4QFOA 5I57A 2DE4A 4GF8A 3MC2A 2I58A 2V3TA 3T96B 3IB1A 4TLLB 5CRYA 3C36A 1I6BA 5I59B 4OWDA 4OQOA 3CFXA 3OO7A 4QFNA 3KN8A 3PUWE 3OO9A 1N3WA 4ZEIA 3OSRA 3TEPA 3UGWA 2NWJA 4POXA 2Q2CA 3I3VA 4KFQA 1A8EA 2REJA 3PUYE 3HHGA 4YB7A 4O3AA 1N84A 2DXYA 1H45A 1US5A 2ONSA 3RT8A 1NNPA 1SI1A 4LATA 3U94A 1MG1A 3IX1A 2F97A 4GIZA 3V5AA 3JZJA 3Q29A 1LCFA 4G4PA 5ITOA 4DXUA 1BLFA 2F5XA 4L17A 5CMKA 3EN3A 3CR9A 1MQHA 3C4MA 4ECFA 1B5IA 2DVZA 4FJPA 4E0XA 5AA2A 3MW0A 3S9LC 2HCAA 1FW0A 1OQHA 1B5HA 3QUJA 2F7CA 2QS2A 1MH3A 1B3LA 5EYFA 4H67A 4JSDA 5TU0A 1UQWA 1AMFA 4RPOA 3K6WA 4AQ4A 2PBWA 3E13X 1VFDA 1XVXA 2QPQA 1LB8A 4RJZA 3MVZA 2Z22A 3PMXA 1JVYA 4U1ZA 2QSXA 4ND9A 1P1UA 3RLFE 5L9MA 2Y7WA 3ZKLA 1AL3A 2QS4A 1QKBA 2VP1A 2PT2A 4ZEDA 1A99A 1SYIA 4X9TA 1PDAA 1D3KA 1JEUA 4OXVA 3HSTA 3N6TA 5I59A 2HXWA 3W9VA 4OESA 1ZLQA 4BDNA 1UIUA 4YKJA 5DTBA 3CSGA 1EH3A 3BBRA 2UYFA 2AL4A 4H6DA 3A3CA 4YB6A 3FUZA 5AA3A 3RTFB 5DEXB 1URGA 2XXHA 4G8HA 4F2OA 4R74A 1GR2A 3GLBA 2HFBA 4H5GA 5J1DA 2VD3A 5ITPA 2XXQA 3TYHA 1GV8A 4NF4B 4ELPA 3OEMA 2XXYA 3KZGA 2H9BA 4IO5A 3OMBA 1YCJA 5CMCA 4U1OA 1B05A 5BWJA 4R6HA 2UVGA 3BFTA 4OEVA 2ZYNA 1OLCA 1Q1KA 4R6YA 4KCCA 1NL5A 3ZSFA 1H3DA 3FASA 4PQJA 4QHQA 2Q89A 4QFKA 2X7PA 2O6AA 1QUKA 1LCTA 4F1YA 3PUZE 1IEJA 1PB7A 2V25A 3TCGA 4WXJA 3JV9A 3N26A 1GGGA 3G3HA 1NKXA 3TUSA 2ALUA 4HW8A 2UVIA 4KCDA 3T9XB 1DMBA 1B0HA 1AOVA 1MQDA 4OEUA 1M5BA 4UA8A 2NOOA 1B4HA 1PBQA 1ZBMA 3ECRA 1II5A 5H8QB 4DXBA 3C31A 3T9HB 2QL3A 3E3KA 1Y20A 1LFGA 4JXIA 4I62A 3OD7A 2ZNTA 4PFYA 3DP6A 1D4NA 1S9TA 3KSXA 1MY2A 3LUYA 3TTRA 2PT1A 2YJPA 1H76A 1DSNA 1Y3NA 4XXUA 1B40A 3QAXA 3ONMA 5DEXA 4N13A 1YPNA 3O9PA 3WAEA 4U23A 1S50A 1SYHA 4OYVA 2DQVA 2FA7A 3V8XB 4G68C 3SERA 4NF4A 2XXTA 3Q28A 1Y4TA 4GRKA 4EXKA 3EHTA 1XVYA 4R6KA 1HSLA 1F9BA 4ZS9A 4F22A 4ZEFA 5CBSA 2B65A 3FJMA 2BJJX 4EF2A 3JYRA 2OWSA 5CBRA 2O1LA 2REGA 1KWHA 1XOCA 3VLVA 1ZKBA 2G93A 4FECA 1NNKA 3GBBA 4O3CA 2VGQA 2H98A 4Q0CA 2HAVA 1FQAA 3L6GA 2H5YA 3OSQA 4G8MA 5M2VA 1TT1A 3U8QA 5I56B 1MM6A 3MWBA 4KD5A 5HBCA 4OVJA 3LR1A 1MPBA 4NF8B 3O28A 1RYOA 1YAEA 1HSJA 2P0SA 3CG3A 5FHMA 3GZGA 3PPRA 4H0WA 5FHOA 4ISUA 2DYXA 4DCYA 2F78A 1JETA 2Z8DA 2AIXA 1MXUA 2O7IA 1BTJA 2H4IA 3F11A 3MP6A 4KHZE 1NNFA 4X48A 4DCXA 3OELA 5AA4B 2YLNA 3O6GA 1A55A 2DS9A 4ESWA 3K6VA 4GOTA 4DE8A 2GHBA 3S9NC 2ZXTA 4O3BA 4RA1A 3KN3A 1B0LA 2HAUA 1AH5A 3W9WA 2F36A 4NWCA 1ZJLA 4YKIA 1YTVA 2Q8JA 4JWYA 3CVGA 2X7QA 4C1TA 1MH4A 1RKMA 4JWOA 3Q25A 1JVXA 2OCUA 4YB5A 2O84X 2Z23A 3CRBA 1LLSA 3T9VA 1TXFA 3S9EA 3TELA 3HN0A 3USDA 2XD2A 2QJEA 4LQ5A 2R6GE 3TTLA 1N7WA 3O2AA 4TQUQ 2DWIA 1B1HA 4LQ2A 3WAFA 4HS7A 2O68A 4IO6A 3TCFA 3T22A 3IJOB 1NMUA 1SDXA 4IO3A 4EQ7A 3U1OA 1QVSA 4OZ9A 1QUJA 1OVTA 3R6UA 3K0VA 4F18A 5F7VA 3TZAA 2D3IA 4FAJA 1URDA 1XC1A 1M5CA 5ISUA 5I56A 3FXQA 3K02A 2XXXA 5AA1A 1Y3QA 2XXWA 2VD2A 5ELVA 2DE2A 3PUVE 3QYTA 2DWHA 3LBSA 3G3FA 3EHUA 4WKMA 4NF8A 1BIYA 4KYSA 2H25A 2V3UA 2R71A 4HTGA 4ZE8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IZ3B 4NF0A 1R9QA 1M5EA 1MPCA 5HM4B 1M5DA 1DPPA 1UTHB 3MBPA 2VHAA 3VFJA 4RNSA 5DYHA 3VE1B 3HPIA 4GD5A 2H99A 3DP8A 3PUXE 5AA4A 4I9DA 4GXSB 3H3GA 5J16A 4NGUA 4GWWA 5FTIA 1LBVA 1IXGA 4BDMA 2XWIA 1CB6A 1B58A 5EQ7A 5H8SA 1VE4A 3ZS6A 4IGTA 3HHFA 3TQLA 3KBRA 1TFAA 4I8CA 4U22A 4PE5B 1DPEA 1L5TA 1JQFA 3KJ7A 4JVCA 4PAIA 3T0JA 1MQGA 2ZZVA 2WKYA 5IM2A 2I48A 3KBZA 3ROJA 2ZZXA 3VLUA 5KDTB 4NTLA 3VXCA 3C35A 2OBGA 1H43A 2GRVA 3SEYA 1NV0A 1KA0A 1OMPA 1MY4A 4QXDA 2Q8MA 3KOTA 3MAMA 4R73A 1NV6A 3OO8A 2OWTA 4JWXA 1OQGA 4HE1A 3DM0A 2HQ0A 2PFZA 1Z7NE 2IEEA 4OERA 1Y3PA 4MLQA 3UP9A 4QFLA 4MEVA 1FPLA 1EYJA 4NEDA 2CEYA 5EHSA 1EZ9A 2W7YA 1N04A 2O51A 4MNIA 3QUFA 2RC8A 4EXLA 5L9OA 3H7MA 2HHMA 3KGCA 1N0TA 1MXYA 4YICA 1IQ7A 3G3KA 3TTNA 4QSDA 2I4BA 3RN8A 2Y7PA 4ZE9A 4LUBA 1B7UA 3TDJA 4N6PA 2XX9A 1B5JA 2PYYA 2LAOA 3FV1A 5ESYA 2F35A 4GX4A 4QF9A 1FBGA 4ZECA 4LZ5A 4PFIA 5IZ3A 2FHYA 3EQ1A 4IGRA 4NHBA 3C9HA 2OLBA 3D1RA 3QIMA 1LAGE 2DOJA 4PC9A 1UTHA 5ET8A 3K2DA 1FJ9A 3RQTA 3SEVA 2ANJA 4GFRA 2Y5LA 5I2NB 2R8TA 1D9VA 4YMBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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