5JWOB

Crystal structure of foldswitch-stabilized kaib in complex with the n-terminal ci domain of kaic from thermosynechococcus elongatus
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
88
structure length
88
Chain Sequence
TAVLKLYVAGNTPNSVRALKTLNNILEKEFKGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKILATPTLAKVLPPPVRRIIGDLSNREKVLIALRLLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription regulator
molecule keywords Circadian clock protein kinase KaiC
publication title Structural basis of the day-night transition in a bacterial circadian clock.
pubmed doi rcsb
source organism Thermosynechococcus elongatus
total genus 28
structure length 88
sequence length 88
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF07689 KaiB KaiB domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5jwoB00
3MSZA 5D8IA 5CRDA 1WOUA 5IO2A 4MA9A 1GSDA 3PGTA 3HDCA 3LSZA 1GTBA 2CX4A 4HJ2A 2H72A 10GSA 4MABA 2PBJA 3GL3A 4PQ1A 6GSWA 4GRFA 5D9VA 4PGTA 1GH2A 4ZL7A 1K3YA 2IMEA 6GSVA 5HR2A 4IN0A 4TR1A 3QFAC 4BVYA 22GSA 3EWLA 2F8AA 2PPTA 3D4MA 3MWHA 2DMLA 4OO4A 1XW5A 5IMCA 1TU7A 1TRWA 2CV4A 3QAGA 3CYNA 3APOA 3UJ1A 2CVBA 2F8FA 4OFNA 4WEYA 4WKWA 1I9DA 2I9HA 4RI6A 3R2QA 3TJFA 3HA9A 5IIZA 4J57E 3DIEA 5ECIB 2C0EA 1O73A 1ERWA 4LL1B 4LMWA 1NHYA 2NPBA 2CAIA 3EVIA 20GSA 2OBKA 3GRXA 1PL1A 3TRPA 1ZZYA 4FIWA 1NHOA 3ZZXA 5DCGA 3W6GA 4OMVA 5FWGA 1GLPA 1GL8A 1VRSD 1TRSA 2GDRA 2B5XA 1TKDB 3ME8A 3QAVA 4GQFA 3DWVA 3F6DA 3FW2A 2H01A 2KP2A 4I6XA 3FZ9A 2O7KA 2EIRA 2MYGA 2XHFA 3C8EA 3I69A 1T3BA 2H19A 3HZ8A 4G9HA 5CO3A 2HZFA 2WRTA 3TB2A 3LJRA 2GT6A 1GSYA 5ELAA 5DAKA 1PRXA 1H75A 1J0FA 4GCIA 4GXZA 1UA5A 3U5RE 2VLVA 3GKXA 1TI3A 1W89A 3ZMLA 1EOHA 1A24A 1ZOFA 1ZL9A 5HFIA 1FB0A 1X0RA 4MZCA 2WJUA 5G30A 2DJ2A 4MP4A 1YY7A 2FA4A 4IS0A 3GSTA 4IKHA 5DBQA 2VCVA 3FY7A 3HXSA 5HR0A 2C3QA 3CSHA 3QD9A 2LQOA 1R7HA 2O85A 3KP9A 2PN8A 1XXUA 2LRTA 1FG4A 2R6KA 2FWGA 1R5PA 1Q98A 4H86A 1T1VA 1YKAA 2OE3A 2K6VA 3KJYA 4MJCA 2MMNA 1WE0A 1TXXA 3KH9A 1B9YC 1FAAA 3FKFA 5AGYA 5DVBA 4KCEA 1EGRA 1GNEA 4TR1B 3J7Yk 5GZZB 5LD0A 3TJGA 4HZ2A 4L0WA 1FHEA 5D93A 1MDKA 4FH8A 3GUSA 1UN2A 4MF7A 1G7OA 3HJPA 5J9BA 1XWKA 2VD0A 4ECJA 2HXKA 3IA1A 1FB6A 2JL4A 4ULXA 4WBJA 4ZBBA 3H1NA 1IYHA 1EOGA 2PERA 1FO5A 4NWYA 3RBTA 1AIUA 2H70A 2YJHA 1M0UA 1Y6EA 4L0UA 1GLQA 1JZRA 4EVMA 2NVLA 3KTLA 1G6WA 2YV9A 4OD7A 1YQ1A 5KN2A 4IJ3A 4NAXA 4KGIA 1EV9A 3DEXA 1M9AA 3TRQA 3TGZA 3GKNA 5CNWA 1GTIA 3N5OA 2JACA 3IAS2 3IPZA 4KDUA 1TRVA 4KUNA 2V6OA 3A2WA 2X8CA 3AY8A 5GAND 3VWXA 3ED3A 4ZB6A 4V1Ap 2GSQA 3F6FA 2LRCA 1QGVA 4YAVA 1KEBA 1SK2A 2OACA 3C71A 5C00A 1JZOA 1SYXA 2ALBA 3A3TA 2REMA 1THXA 1S3CA 1OKTA 3L9SA 4GSSA 4FYCA 1RK4A 2R5GA 3UOMA 1MDJA 2WULA 2H6XA 5DJMA 2F51A 1GP1A 3ZITA 4DVCA 1V57A 5IPGA 2BMXA 2VCTA 4AJ7A 4MMMA 4JU5A 3FK8A 4ZIJA 2YWIA 5DJLA 3EURA 1PGTA 1VF1A 1XBSA 3HD5A 6GSUA 4TVEA 3TOUA 3GSSA 2C0GA 1U88A 5EY6A 2PVOC 3GV1A 4K7OA 4ZBAA 2GLRA 1A0FA 1K0DA 1O85A 2XPEA 2YN1A 1PSQA 4RQRA 2FUG2 3UBLA 3Q6OA 3ZIJA 5KN1A 2P31A 4YAPA 4F03A 3DMLA 2LEGA 2ON7A 2FA8A 4ISDA 3GFKA 5ECOB 5JWOB 2YZHA 5KN0A 3TKQA 3VLNA 3ZL5A 3GYKA 3DD3A 4POKA 2GSSA 2H0HA 2RM5A 2H30A 2V2GA 2L5OA 5J4UA 4V2NA 1EWXA 5AIVA 4RI7A 2AYTA 4WF4A 2H1DA 1V40A 4L5LA 3A2VA 3RHCA 4N11A 2IN3A 1X5DA 2DMMA 5IPHA 3MDKA 2YWMA 3HJMA 1PX7A 2I4AA 2FWFA 5D9WA 5EPFA 3WGXA 2IMIA 4ZXGA 2CZ2A 3P2AA 2VUPA 3CXGA 1XVWA 3N9JA 5DALA 1NSWA 2CX3A 1Y25A 2NDOA 5G5FA 1B9XC 3D5JA 1JZWA 3L9UA 4G10A 4XRDA 7GSSA 4IP1A 2B6MA 1F3BA 4LA1A 2EIOA 3L0HA 3FR9A 3IR4A 2LNSA 1G7EA 4D73A 2GTUA 2NBSA 3UMAA 3S9FA 1TOFA 2P5QA 2QGVA 4GSNA 1X9SB 3Q74A 1DE1A 1LBKA 1PKZA 4YQUA 1XIYA 4OFTA 1YDKA 3LG6A 5ELGA 3APQA 1QXHA 5FHIA 1DSBA 4ZB9A 3IHQA 4I2UA 1ILOA 2X8GA 4RQXA 1EEJA 1URMA 3ERWA 2L4CA 2D2ZA 3G9BA 2I1UA 1C72A 2DBCA 4G2EA 4WBRD 1PKWA 4L8EA 2OA7A 3ZRDA 3C1SA 1YF0A 3IV4A 4NHWA 3H93A 4NV2A 4MZBA 5H5QA 3GMFA 5IMVA 3TUEA 1UC7A 1K0MA 4EL1A 2HLSA 2M72A 4MH2A 4PQIA 4TR0A 3QOUA 2O87A 4OCFA 3KIJA 4P3YB 2HSYA 4J56E 3M8NA 5F07A 3G7IA 5ENUA 5C04A 1M2AA 4AJ6A 4EF0A 3NOFA 2WFCA 3ZREA 2LSTA 3GTUB 2VCXA 3FZ5A 3KZQA 2G0FA 3WT2A 4XTSA 2JZSA 2R2JA 2YP6A 1HQOA 2OE1A 2A2SA 2EC4A 2C0FA 2GGTA 4YQMA 2A4VA 8GSSA 1U3IA 5G2ZA 3ERGA 4Q5NA 1S3DA 5CREA 4LMVA 4PQHA 5EVOA 1HD2A 5IO0A 2JU5A 2LTKA 3HJOA 4JBBA 5IMFA 5ECPB 2K8VA 2NTOA 1SD9A 3D22A 4IQ1A 3G7YA 1Z3EA 2LNTA 5JWQB 4KX4A 3L78A 3LFLA 3FR6A 3CSIA 2H76A 3A2XA 5D9XA 1M7TA 3D4TA 4HI7A 3H4KA 3IE3A 3ISOA 3VWUA 5JCWA 2OE0A 2WGRA 4MF6A 1A2JA 3TCOA 5DALB 4O32A 4HU7A 1PQNA 4L5OA 2AUVA 3EE2A 2OADA 1T4YA 2H74A 4K9ZA 2RM6A 4ECCA 3L9VA 4BWSA 1USBA 4V2MA 4D73B 2YWOA 1OC3A 2B3SA 1SJIA 3EYTA 1XPVA 2GZZA 1WMJA 4I97A 2LUSA 2KHPA 1BX9A 2WZ9A 4PNFA 4ECBA 5JCGA 1WPIA 3DVWA 1SJZA 4WXTA 2GQKA 2MMZA 3TKRA 1TU8A 2R37A 2FHEA 2F9SA 5F0GA 2Z9SA 4EO3A 2E7PA 1THOA 4TXVA 3H79A 2KLXA 1HYUA 2GT5A 1A0RP 2VCQA 4KDYA 2CZ3A 4NPBA 1OKDA 3WD6A 2G2QA 5IM9A 1TW9A 5HR1A 1TK8B 3PINA 4WF5A 1WP0A 2LS5A 2ZCTA 4NHZA 3DKSA 3LYPA 1ERUA 2V41A 3GH6A 4CHSA 4KDXA 1XW6A 3LGCA 4KSMA 3KP8A 4DEJA 2C8UA 2XC2A 2AHEA 14GSA 5B8AA 3O3TA 3KD0A 4ACSA 3CTGA 4IGJA 4J2FA 4EKZA 2L6DA 4K0NA 1O7UA 4BVXA 2XPDA 1UVZA 3F8UA 3DRNA 2GSTA 1YKCA 1F37A 1OC8A 4MJAA 3W8SA 1N2AA 3F0IA 4OFMA 3U6VA 3F3QA 3PH9A 4GQCA 1GUMA 2B1KA 1EV4A 3LXZA 1G6YA 3RHBA 4IJIA 3P90A 3G7JA 3D21A 5DDLA 2K8SA 3RPNA 1SL2B 2M46A 2VIMA 4TRXA 1U6TA 1GSEA 2H8LA 1OVNA 1A2MA 4AF2A 1GRXA 2C3NA 2DIZA 3PR8A 1SU9A 2E2GA 2N5BA 3ME7A 3DGQA 2PMTA 1K0NA 4Q5RA 2H75A 4BA7A 3EC3A 2GSRA 2K18A 2KP1A 2GVPA 3LXTA 3UL3A 3QMXA 5H5RA 4EDZA 2DJKA 4TOPA 1S3AA 4I2TA 2HNLA 2HT9A 1XWCA 4TR3A 4TW5A 2CVKA 3I9V2 1VGLA 3FRCA 4TXOB 4QL9A 4DSQA 3GN3A 4I8BA 2O8VB 4IVFA 3QR6A 1JLVA 3D0ZA 4TR4A 5JCUA 2FNOA 3DVXA 5B6MA 5AN1A 1MTCA 1YEXA 3GKKA 3ZVJA 2F3MA 1PA3A 1XFLA 1OE7A 4WR5A 3VI5A 1EGOA 1Z9HA 1BEDA 2LQQA 2FD3A 1PL2A 2XBQA 4BL7A 2LRNA 2LJAA 1K0BA 4K7IA 2CAQA 13GSA 1Z5YE 2FGXA 1NM3A 1GSQA 2K9FA 5EL8A 5KN3A 2KOKA 3ZFLA 4XS6A 3GKMA 2X64A 3KXOA 1T8EB 3C1RA 5D9TA 3WGEA 4GF0A 4PXOA 2JZTA 4YQVA 2TIRA 2VD1A 3CRUA 4BPYA 3EMPA 3LYKA 1AAZA 2IIYA 4PX1A 2VCZA 2DJ0A 5H5SA 2VL3A 4F0BA 3C7MA 4KAEA 1XWAA 3P8WA 2QKEA 3F4RA 3KCMA 6GSTA 5J5NA 4K8MA 2BJXA 5KEJA 4LL4B 2IJYA 4GWRA 3NIVA 1F6MC 2GS3A 2PU9C 2HFDA 3BD2A 4IP6A 5AIXA 5DQSA 1KBNA 4N10A 5HFGA 3TKSA 4EE0A 5B6NA 3H8QA 2CA8A 1X9WB 2CVDA 2WCIA 3HVSA 3I6AA 4KH7A 2JSZA 3GTUA 3TKSE 4EXJA 2ES7A 1QUWA 1XOBA 5DQYA 1DBYA 1KTEA 2OBIA 1WWJA 2JSYA 3LEFA 1MEKA 1V2AA 3ZTLA 3VPTA 1BG5A 1SL0B 3GX0A 3F63A 4G19A 5ECSA 2DJ1A 4XIHA 3HY2A 11GSA 1H4OA 2I81A 4N30A 6GSXA 2YV7A 4I5QA 1SL1B 5AISA 3WT1A 2EIQA 4KNDA 3RAZA 3BJ5A 1XZOA 2PUKC 2P0GA 5IOWA 4K6XA 4F2IA 3F9UA 4HZ4A 3QCPA 2B5EA 1CQGA 4LLRA 4V1Ag 2V1MA 3TDGA 2IFQA 4JEDA 1HNBA 3O76A 19GSA 2R3XA 3CSJA 3UIWA 1BYEA 2C4JA 2LJRA 1U3AA 3HKRA 4ML6A 5F05A 3IC4A 2PGTA 1RQMA 3TJJA 3APSA 3VI7A 1SKSB 4IHUA 2ON5A 2YCDA 3DXBA 2RUEA 3HVVA 4N0ZA 1M99A 2LKUA 3A5WA 4K0GA 1A23A 5J9CA 3IK7A 2ZNMA 1WRYA 5B8BA 2A2RA 2GZYA 2E2MA 4FYBA 18GSA 2MMAA 5IMZA 4ZILA 2MBSA 2VCWA 1V9WA 2AB6A 4XS4A 2B5YA 1K0AA 1VF4A 4IELA 2HYXA 2P5RA 6GSYA 1SKRB 2TRCP 1V58A 1SK0A 4Q5FA 2H71A 3UARA 1GSFA 2MZCA 1YJ6A 4NXIA 4K2DA 4WR4A 1F2EA 4ILFA 2FY6A 4CDOA 3KGKA 1AQVA 1A8LA 1M2BA 1DUGA 2C0DA 3I43A 4MPFA 3ZVJD 1R5AA 5ECLB 5J41A 2WDUA 1KNGA 1E2YA 1OC9B 1O8XA 1TJDA 3F4TA 4HEA2 1B4QA 4AGSA 4ZL8A 3MNGA 4O7HA 2GQMA 1FW1A 4HU9A 3KM6A 3BCIA 5JWRB 3Q19A 4XHMA 3TRXA 3GIXA 4PNGA 1GTAA 1SKWB 1R4WA 2HI7A 1JLWA 5E59A 5F8BA 2B7JA 3LWAA 1XWGA 1O8WA 4KW6A 1IYIA 4DSRA 1T00A 1O6JA 3DYRA 2IFQB 3KMNA 2H73A 2LV3A 3JCML 5LNKe 2MBTA 2YZUA 2DC5A 1K0OA 2HRFA 4K1FA 2O89A 3ZIVA 4ZB8A 1GTUA 5IOXA 3ERFA 5ECKB 2YNXA 2N5FA 12GSA 1J9BA 2R4VA 2WB9A 1EEMA 2RUFA 2H0GA 4TXOA 1SK1A 3NZNA 2DSAA 1WIKA 5A5KA 4NMUA 1QK8A 4QQ7A 3M1GA 4POLA 4O5RA 3VPQA 1JHBA 1FVKA 3ZYWA 1ZCPA 1I5GA 2V6KA 3HYPA 1XOAA 4EC0A 1LU4A 1GUKA 2YPMA 5IMAA 4ZBDA 5F06A 4XS4B 17GSA 1Z7RA 4HS1A 3FZAA 1OE8A 2BTOT 3IOSA 1FOVA 2GQLA 5CRWA 2VAFA 1F9MA 4ZL9A 1T7PB 1PMTA 1QFNA 4MK3A 3CTFA 3RPPA 2H1AA 2RIIA 5ABRA 4MCUA 5ID2A 1ABAA 3IXRA 3HCZA 4OCEA 1YF1A 4X0XA 4GSTA 4HDEA 5IQYA 3IBHA 3BCKA 5HFKA 1A2LA 5ECMB 5D96A 1HNAA 2IMDA 3VK9A 1SJ6A 2IMKA 5B7CA 1SENA 2L59A 1EP7A 4ECIA 3O6TA 1ZYEA 3OR5A 4K7NA 3VWWA 3V1WA 1M9BA 4JE1A 1NW2A 2MMOA 3E3EA 4AJ8A 1MDIA 4YH2A 2HZEA 3TKSC 3ZMKA 3M9KA 2VL2A 3UBKA 2DIYA 1E6BA 1TK0B 2L6CA 3BOAA 4MLYA 4JR6A 3TOTA 3GURA 5IMDA 2YANA 2RLIA 3E9JB 3HHVA 2DLXA 4IBPA 2TRXA 2VLTA 3HZ4A 4KE3A 4E8EA 3VWVA 3US3A 2AJQB 4JR4A 2YJ7A 2YWNA 2ZUPA 3GX8A 4MJBA 4DSSA 4GTUA 3KEBA 4F82A 2H6YA 2OKAA 2L4QA 1GNWA 4WETA 2DJ3A 3KTBA 5L71A 3UVTA 3KH7A 3GA4A 3Q18A 4CW9A 4FO5A 5CYYA 2HE3A 4Q5QA 3TJBA 3SWLA 1ON4A 3FR3A 4X43A 1RW1A 1HNCA 4RUVA 1XWBA 3RDWA 1BAYA 4HJMA 3M9JA 1GWCA 4MJEA 2X8HA 2J9HA 1K3LA 4V2LA 2IMFA 2L57A 1R26A 2JADA 1SYRA 4IQAA 1Q4JA 2X99A 3M0FA 3QDNA 4HQZA 1B4PA 1JFUA 3FHKA 4MF5A 4F0CA 5GAPD 1AUCA 3CRTA 3UAPA 3F3RA 3TKPA 6GSSA 5ID2B 2YOIA 2H1GA 3ZLPA 3WYWA 1ERTA 1MD4A 3SBCA 3IK9A 1J08A 1O81A 1TDIA 2E0QA 3QAWA 3UVHA 1SD8A 2JZRA 2HSHA 2C1YA 3EMXA 5CP1A 1JZDA 4OO5A 4KB3A 3FEUA 2QC7A 5GSTA 2HZEB 5DAKB 3IDVA 2KUCA 4EUYA 1XW9A 2H66A 2VM2A 3P7XA 1VF3A 3K8NA 4MDCA 4BWQA 5ECHB 3VFIA 1N8JA 1Z7PA 1ZMAA 1TTZA 2I3YA 3GL5A 5A4UA 2C3TA 1T4ZA 4POMA 5HR3A 2B7KA 1TK5B 1X5CA 2IL3A 1W4VA 1TRUA 2N5AA 2FCHA 3WGDA 1QMVA 1BJXA 2IWTA 1DE2A 4DSSB 1YZXA 1ERVA 1X5EA 5COHA 1F3AA 1YEPA 5E4WA 1OC9A 5D73A 3FZ4A 4NV5A 1XVQA 4MPGA 4MZWA 4TN8A 1FVJA 4ML1A 2HRNA 1LJRA 5HQPA 4PUAA 2B1LA 2WS2A 1AC1A 1M2DA 3CBUA 1ZYQB 4N0VA 1GSSA 3C73A 3J7Yb 1G0TA 2FWHA 3EU3A 3QPMA 4E8HA 3LORA 1MD3A 5G1KA 5DCHA 2GZPA 3GHAA 3LQ7A 2VM1A 1B8XA 5G1LA 3CMIA 1WJKA 4POBA 2C80A 2H0IA 1PX6A 4KSOA 3W8JA 2CT6A 5GSSA 5ECNB 5CAXA 4IW9A 4TKYA 5CRHA 3D6IA 5A4WA 4FYUA 1OYJA 2V32A 4EDYA 2XBIA 5CRGA 3TJKA 3IAM2 5A4VA 5ECRB 3EU4A 4PUFC 4F9ZA 4GLTA 4X1UA 1TI1A 1VF2A 1ACVA 3QFBC 4XCSA 1K3OA 5LCZA 2QSIA 3ZFBA 4Z7XA 4HQSA 2VO4A 1Z6MA 4JZQA 1AW9A 3GNJA 5G5EA 3GH9A 1GUHA 5G31A 2OJLA 3F4SA 4KCAA 3IRAA 1TP9A 4OWYA 1AQWA 1OAZA 3M3MA 1CQHA 2L5LA 1PN9A 2FWEA 3UEMA 3E0UA 4PURA 1PD21 1K0CA 4XRAA 1EZKA 3L4NA 3MAKA 1AXDA 1QQ2A 16GSA 3HVXA 1Z6NA 2IPAA 1AQXA 4O92A 3EINA 2VLUA 1EP8A 2VL2C 1X9MB 4QL7A 4HOJA 1U87A 1BQ7A 5FT3A 2DJJA 2PWJA 2VOCA 5INYA 2AV4A 1ST9A 1B48A 4HUAA 3BBYA 4KA0A 1ML6A 2FLSA 2VL9A 1V98A 2LJKA 1GSUA 4MH3A 3KMOA 1GULA 1A8YA 2H6ZA 5ECQB 1XCCA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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