The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of fully protonated proteins by proton-detected magic-angle spinning NMR.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| total genus |
10
|
| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-05-13 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ZW0 A; 2QSD A; 2KWD A; 2RMM A; 2PW9 A; 4IKG A; 5BMH A; 2KQ4 X; 1YMH E; 2NMQ A; 4D2K A; 1PGA A; 1QKZ A; 1P7E A; 1HZ5 A; 2JWU A; 2OED A; 4HKZ E; 1FCL A; 1K53 A; 5BMG A; 2J52 A; 2RPV A; 1Q10 A; 1C9F A; 4MAC A; 1F2R C; 2IGG A; 1MI0 A; 1MHX A; 1UWX A; 1IGD A; 2KAC A; 5HHD G; 2LGI A; 4OZA A; 2LUM A; 2ON8 A; 4IOI E; 1K50 A; 3GB1 A; 2JZP A; 3V3X A; 2EEL A; 2J53 A; 3FIL B; 1HZ6 A; 1IBX B; 4OZC A; 1K52 A; 2KN4 A; 1F2R I; 1MPE A; 1XF5 L; 1KH0 A; 1IGC A; 2I2Y A; 1EM7 A; 2GB1 A; 2N7J A; 4GLS C; 4KGS A; 1ZXH A; 5BMI A; 4KGT A; 1FD6 A; 4KGR A; 1XCT L; 2I38 A; 2ZW1 A; 1D4B A; 2JXT A; 1GB1 A; 2LHE A; 5HG2 A; 3FIL A; 2ONQ A; 2GI9 A; 1IBX A; 5HFY A; 2N9L A; 2IGD A; 1K51 A; 1HEZ E; 3MP9 A; 1PGX A; 1YNT E; 1JML A; 2QMT A; 3UI3 A; 2IGH A; 2JU6 X; 2PLP A; 4HJG E; 1P7F A; 2LHD A; 4WH4 A; 1MHH E; 1PGB A; 1FCC C; 2PTL A; 1XCQ L; 2N9K A; 4OZB A; 5HI1 A; 5JXV A; 2JSV X; 1MVK A; 2KDM A; 2K0P A; 1GB4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RNA C; 3KLS X; 1KOT A; 4W9L A; 5DPT A; 3LB8 C; 2LVQ A; 1J7B A; 3ZO5 B; 1V49 A; 3WCQ A; 1WXV A; 1I4P A; 1RM6 C; 4G50 A; 2GOW A; 4FHK A; 2LFI A; 5BYR A; 3P4R B; 1EU4 A; 3L0W B; 5BMG A; 3TEW A; 1UBQ A; 3C19 A; 1C9F A; 4I6P A; 3U52 E; 1XD3 B; 4WJO A; 2MP2 B; 3AH7 A; 3TEY A; 1WI0 A; 3H7S A; 4W9G A; 2LGD A; 1WMH B; 4XWT A; 3V3X A; 4BVU C; 2EEL A; 1CK1 A; 4J6I A; 1WJ4 A; 3DBR I; 4RF1 A; 1GOZ A; 1WE6 A; 2RDH A; 1TZ1 A; 2DWQ A; 2C7M B; 3W2D A; 1FRR A; 3N3K B; 2IND C; 3AEC B; 2LRU A; 2UWQ A; 3JVZ X; 5TR5 A; 1YN3 A; 1WF9 A; 3L17 A; 1E0Z A; 1H8C A; 3MJW A; 4MT5 A; 2KWC A; 3DBL I; 1WGH A; 3I9V 1; 3KUC B; 5E6P A; 4N58 A; 3PZ7 A; 4M02 A; 3CST A; 3W1Y A; 2V3S A; 4W9F A; 4M00 A; 1ESF A; 2M0A A; 1TKE A; 4P1B C; 3MP9 A; 1ET6 A; 4ZYN A; 3BZD B; 3AXC A; 3P4S B; 5FR3 A; 4EZJ A; 2MJ3 A; 1EWC A; 3D32 A; 4KKI A; 1MJD A; 4E71 A; 1WRI A; 4ANX A; 1OQQ A; 3DBH B; 3VUY A; 1EF5 A; 2LD9 A; 2BQQ A; 1PUT A; 3AED B; 2Y5B B; 1HE8 A; 3PRP B; 1WE7 A; 1WJ6 A; 4US9 A; 4AS1 A; 3QIJ A; 1IYF A; 3C8Y A; 1SBB B; 2MJD A; 1HXY D; 1P7E A; 2GMI C; 1M4V A; 2G4S A; 4M8N A; 1NI2 A; 5D3D A; 3SDL C; 3TMP B; 3E56 A; 2W82 A; 2O6V A; 1ZW7 A; 3VVW B; 5HHD G; 2WXG A; 4OZA A; 5L95 C; 2OJR A; 3OWE B; 1QT9 A; 4MJS B; 2M4N A; 1L7Y A; 3SFD B; 2JZZ A; 3GZN I; 3I63 C; 3R2T A; 2N7J A; 3N1Z C; 2QHO A; 2ZEQ A; 1ZXH A; 1D3Z A; 2V3P A; 4AJY B; 1TGZ B; 2LAS A; 4GDL A; 1VCB A; 3P42 A; 2WDQ B; 3QQ8 B; 1I4H A; 1ACC A; 2D3C A; 4KGR A; 3AV8 A; 4G0N B; 2EKI A; 2GRI A; 1IBX A; 5HFY A; 4C4V A; 2D3G A; 3H7P A; 2IGD A; 2HTM E; 1N5W A; 2PE9 A; 1QOA A; 4P16 A; 4ASW C; 3AB5 A; 2JU6 X; 3CF6 E; 1E5W A; 4MGY E; 2RPQ A; 3JSV A; 2VH2 A; 3W9C B; 3ZXR A; 1EWY C; 4WJN A; 5JXV A; 1S1Q B; 2MLB A; 3U4E G; 4BKT A; 3RT3 B; 2M56 B; 2M1M A; 3H1U A; 3RZW C; 3QAQ A; 4RFB A; 4HPM B; 5G5H A; 4S0R A; 3N1X C; 3QJZ A; 4X57 B; 1I42 A; 2K39 A; 1GPX A; 1Q1O A; 5CHW A; 1FNW A; 3VTV A; 3QAR A; 4HDQ A; 2WGS A; 1L6U A; 2RDG A; 4LTU A; 2D5G A; 2PEA A; 4PS3 A; 4ICV A; 2ON8 A; 1A5R A; 3WIM A; 2IYD B; 4AWJ A; 5KHQ A; 3AU5 A; 1K52 A; 4ZOH C; 1RWS A; 2E3T A; 1B1Z A; 4G11 A; 3K9P B; 3VTU A; 1V86 A; 2V9H A; 2DZM A; 2LGX A; 2IY0 B; 1C78 A; 3EUB 2; 4PS7 A; 2RDB C; 4GB9 A; 4HWI B; 3R2I A; 4M8M A; 1GNU A; 1GC7 A; 2JYT A; 2LWP A; 3IT6 B; 3RUL A; 1I35 A; 5LXH A; 2Y5P A; 4YSY B; 2DZK A; 4FAD A; 5C23 A; 1BML C; 1D5X C; 4PK1 A; 2WWZ A; 2XK5 A; 4REZ A; 4W9I A; 4XDC A; 1ZKH A; 4XC2 A; 2M8S A; 2R2Q A; 2QMT A; 1BXT A; 2BVC A; 1U4A A; 4XX5 A; 1YIW A; 4ACF A; 3HVZ A; 4OZB A; 1C76 A; 3VUW A; 5D7G A; 2K5P A; 2KVZ A; 2O6V B; 2M0X A; 4IM2 A; 4K81 A; 2H89 B; 2WLB A; 4WQO B; 2L1A A; 2HJ8 A; 2L3Z A; 1HTQ A; 2KWD A; 1C4A A; 4IUM B; 1N6Z A; 1E7V A; 4GXB A; 3S2A A; 2KDE B; 1J8C A; 2Y3A A; 4LLG M; 4UDU C; 1SE2 A; 1RYJ A; 3NZS A; 4FJZ A; 3GE8 C; 4HEA 1; 1JQ4 A; 4JWU C; 2DZJ A; 4AUQ C; 4KX6 B; 1PFD A; 3W5V B; 5JH5 C; 2IY1 B; 1WZ0 A; 3GB1 A; 3BVG A; 1JRP A; 1UGJ A; 2BPS A; 2J53 A; 1DOX A; 3ECI A; 5LXI B; 3DHG C; 3PT2 B; 1E8Z A; 1IBX B; 1V97 A; 2LJI A; 4C4V B; 3P1M A; 3H7P B; 4HJK A; 4ZRP A; 1JWS D; 1T3Q A; 2PJH A; 2C60 A; 3PHW B; 4NJ6 A; 3P4P B; 4MM3 A; 2VRR B; 2BKF A; 3VR8 B; 2N9X A; 3L54 A; 1E90 A; 5GMV A; 4YTN B; 3GS2 A; 5CTR C; 1GG3 A; 2QDF A; 4US8 A; 1E8W A; 3L16 A; 4BFR A; 1NEK B; 2MCN B; 2WXO A; 3SEB A; 2MQJ A; 1EO6 A; 1WGD A; 1P3Q U; 1K51 A; 2KKC A; 2CJO A; 3CIR B; 4W9J A; 3AEE B; 1I4X A; 3ZRC A; 1I7H A; 4LNN A; 1JW9 D; 1RRB A; 5HKH A; 4GU2 A; 2MBE A; 3JYU A; 4RM8 A; 1E7P B; 3LXF A; 4ANU A; 3ML8 A; 1WMH A; 2LMC A; 5HI1 A; 3VTW A; 3X23 A; 2GBK A; 3ZJT A; 3W5U B; 1T5X D; 2K3U A; 3KYD D; 2JX5 A; 3T3N A; 3ETR A; 3SHQ A; 4EUT A; 3IBE A; 5DCN A; 3NZ3 A; 2ZNV C; 2N1V A; 3TEX A; 3ZYY X; 1LQB A; 4OW0 A; 2RGF A; 2KC2 A; 1TY0 A; 1TJE A; 3PRM B; 2IO2 B; 5FR6 A; 3CMM B; 3GE3 C; 3N32 A; 3O65 B; 3DBR B; 2ZPY A; 3AE1 B; 4K7U A; 3N9Y C; 2KFK B; 2K22 A; 2LUM A; 2WU5 B; 1WWT A; 4MH0 E; 4XYC A; 4KV2 A; 3N30 A; 2WXH A; 3IVF A; 1WFY A; 2XK5 B; 1PYW D; 3KVF B; 3KYC D; 2BYV E; 5IP4 D; 3AE4 B; 1KLU D; 2J0J A; 3DBL B; 4W9E A; 2C7H A; 3QC8 B; 2I1K A; 2KX0 A; 1I4Q A; 2GBN A; 1YX5 B; 2M17 A; 3AEG B; 1YN5 A; 4DHZ E; 3T9L A; 4JIO U; 1XQQ A; 3ZTD A; 2JZ3 B; 1TZO A; 4FN2 A; 4TQ0 A; 3B0A A; 2R61 A; 4ZRK A; 2JRH A; 4RGM A; 3AE6 B; 3TEZ A; 2LHE A; 1FM0 D; 1JCK B; 4ZDV A; 2KWU B; 1L6V A; 2EMT A; 3AUL A; 2CKH B; 1PGX A; 3NVZ A; 3MC0 B; 4B6W A; 3ZGZ A; 1JAL A; 2AL6 A; 4ZRI A; 3A9K A; 1N5X A; 3U8Z A; 3VH4 B; 3A4R A; 4LJP B; 4F1S A; 1DOY A; 2KT7 A; 1JRU A; 1PDX A; 1WH3 A; 4WWN A; 4H2A A; 2L83 A; 5MPO A; 5C3J B; 1C4C A; 4MJS A; 2LGY A; 2V4L A; 2E6X A; 3L08 A; 3ZNZ B; 2JXX A; 2PVG C; 2D2Q A; 3BWU D; 2MA9 B; 2RR9 A; 3ALB A; 2KZR A; 1L0Y B; 1ZXI A; 5BO4 B; 2WXK A; 3IFW B; 4FBJ B; 2OED A; 3ZTC A; 3UIO B; 3GOE A; 1KF6 B; 1C77 A; 1WXM A; 3HVD A; 1P0R A; 1Q10 A; 4MM3 B; 3RUI B; 4BBN C; 5KHO A; 2FUG 1; 1WXQ A; 2PMV A; 2ZVN A; 4RGN A; 3VR9 B; 2FCN A; 1YJJ A; 4FXC A; 4LDT D; 4W9K A; 3GZN B; 1V5O A; 1TTN A; 4II2 B; 4NAM A; 4AP4 C; 3U30 A; 1EU3 A; 4ARI A; 2ACZ B; 2FCM A; 3R3M A; 3PGE A; 1OGW A; 2A5U A; 2AQ1 B; 2WS3 B; 3AE7 B; 4ANV A; 3IG3 A; 3Q3F A; 4IWQ A; 4KGT A; 3ZNI D; 4CQN A; 2FAZ A; 2VZK B; 1XLN A; 2Z59 B; 2DBY A; 3DPD A; 2YLM A; 4YXD B; 3DVG Y; 2BWF A; 1C79 A; 4NY0 A; 2ONQ A; 3MHZ A; 1WM3 A; 3TBL D; 5CHF A; 2N9L A; 2QC8 A; 3VUX A; 3W1S C; 3B1L X; 2KQS A; 3PSE B; 3AE2 B; 3BVZ A; 4JE3 B; 1NI3 A; 3URY A; 3PVL A; 4KDI C; 3UIN B; 2XN9 C; 4K7S A; 2D3A A; 2ZJD A; 3Q3N C; 1AWD A; 1YQ3 B; 1MVK A; 2L32 A; 2KJR A; 1FFV A; 3AEA B; 4A90 A; 2INN E; 4R3D A; 2NVU I; 4NJC A; 1UBI A; 5AZF A; 1NVI D; 1FEH A; 1DYQ A; 3R7R A; 2KNB A; 4F8C B; 2KJ6 A; 1J19 A; 3B08 A; 3Q8C A; 2PW9 A; 3H8H A; 2KMA A; 1YX6 B; 1YJ1 A; 1OTR B; 1D5Z C; 2REX A; 2RPV A; 3BVM A; 1OFF A; 3V6E B; 4WAA A; 1F0Z A; 3V05 A; 2MSE D; 4FJV B; 3V6C B; 3KQ4 A; 3KWV A; 1T0Y A; 4EZK A; 2BT6 A; 2K25 A; 2CR5 A; 1CQV A; 1TYG B; 5CX3 A; 3BYT B; 4PT5 A; 2VH1 A; 3H6N A; 2KN4 A; 4FJY A; 4G3X B; 2KJH B; 1FFU A; 2M19 A; 2OJW A; 5AUI A; 2GB1 A; 1WJN A; 2L8J A; 1LO5 D; 3HHM A; 1TS5 A; 2FBW B; 1P9D U; 3A9K B; 3RYT A; 3SFE B; 2LVO A; 2HE7 A; 5EE1 A; 1JWB D; 5H8Y E; 3VRA B; 4YTM B; 1D6E C; 2WU2 B; 1MG4 A; 2JPH A; 3UQB A; 3HIZ A; 2W54 A; 1KLV A; 2KK8 A; 4W9D A; 2L0F A; 2KLC A; 4OVZ A; 2GI9 A; 4K3C A; 2BYT A; 2VZK D; 1PQS A; 3VFK A; 2IGH A; 1P7F A; 3DWM A; 1VD2 A; 4WH4 A; 4CO7 A; 3ABV B; 1FCC C; 2LUE A; 3VDZ A; 2LXA A; 3Q8A A; 1XCQ L; 1LGR A; 4BOS C; 1UF0 A; 2JSV X; 2GBM A; 5AZH A; 3SR6 A; 2N0S B; 2K8C A; 4JWS C; 1NYR A; 1P98 A; 2MJE A; 5IOI A; 1VR9 A; 1JWM D; 3M95 A; 2IPK D; 1L4D B; 5JZE B; 3EHV A; 3DDC B; 1YMH E; 3ZJU A; 1WGG A; 1PGA A; 4A3P A; 3B2F A; 1L2N A; 2KAN A; 2DEN B; 2NBU A; 3AN1 A; 4CHK A; 4LNK A; 2PVO D; 1RLF A; 4B0M A; 4URK A; 5EE3 A; 2NTT A; 4KZC A; 1IGD A; 2BKR B; 3NS1 A; 3QHT A; 2DAF A; 3FC4 A; 4BKS D; 3NG0 A; 1MPE A; 3QX1 A; 5BYQ A; 1L4Z B; 1EM7 A; 3ZJV A; 4IWO A; 4GMV A; 4BKG A; 1WY8 A; 1RFK A; 3L4P A; 2K6D B; 4GGQ A; 1SE3 A; 2LI5 A; 2WQY B; 1DOI A; 2J7Q B; 1XLP A; 1AYF A; 5HG2 A; 1TS3 A; 4NAW A; 1H4R A; 1VZ8 A; 1WR1 A; 3VRB B; 4EE2 A; 5C2T B; 3KUZ A; 3ZLZ A; 4HPL B; 4OVV A; 4MGI E; 4O1N A; 2CHZ A; 2ICI A; 3WA0 A; 4KZ0 A; 2KFK A; 3A9J A; 4AOF A; 1GC6 A; 4HRO A; 4DBG A; 2WDR B; 3AE8 B; 3J9C A; 5H92 C; 2IO3 B; 4HLE A; 1WX9 A; 1WYG A; 2W3R A; 1WJU A; 3DVN V; 4WJQ A; 2J42 A; 4WWO A; 1ZP0 B; 3P63 A; 2WXQ A; 3O13 A; 2W55 A; 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4WUR A; 4N6E B; 2JUO A; 3TJP A; 1IP9 A; 4A55 A; 1LM8 B; 4N59 A; 2KO3 A; 3NS8 A; 5AZG A; 4NAW B; 1T0Q C; 3PRE A; 3Q3O C; 2BTE A; 3ZDT A; 3LJ3 A; 2O6V D; 4GOC A; 4RNA A; 4B0E A; 1XF5 L; 1KH0 A; 1EUV B; 3CWI A; 5AEK B; 2DHZ A; 3APF A; 3ZXV A; 1XLQ A; 2BYE A; 4KGS A; 1N61 A; 2IO1 B; 1AW7 A; 3Q14 C; 2KAJ A; 2KX3 A; 1ET9 A; 3B2G A; 4ICU A; 5L83 A; 4NQK E; 1SF0 A; 1AAR A; 3A9J B; 2WXP A; 4HRS A; 1YOV B; 5AUK A; 2JXT A; 3DBS A; 3FAH A; 1HTO A; 3R8B A; 2BB5 A; 2TSS A; 1F9J A; 3R7Q A; 3ZRF A; 3Q69 A; 4XE0 A; 2N7D A; 3CSF A; 2HDE A; 2JF5 A; 3PZ8 A; 4TUU A; 3OAW A; 3RCZ A; 3WAO A; 3I5J C; 2A4Z A; 2AX5 A; 3P2B A; 4BZA A; 2PTL A; 3RZF A; 1UWM A; 1YN4 A; 1GB4 A; 1R4M I; 1HQR D; 3BII D; 3ZKJ C; 5BYS A; 5IKC M; 2WXI A; 3ZUN A; 3HM6 X; 2PKO A; 3JW0 X; 2RMM A; 1Y56 A; 2LRW A; 2Z0D B; 4N9F 4; 2MBB B; 2O2V A; 5IAA C; 3KWL A; 3RNE C; 4Q2J A; 1QF6 A; 1NEN B; 1GJZ A; 3A1Q B; 4LCD E; 2L52 A; 1F2R C; 2N9E B; 3PV1 A; 2LZ6 A; 4TMA B; 3M63 B; 3OG5 A; 2BBC A; 3DOW A; 3RPF C; 1HZ6 A; 4A6Q A; 3MJ5 A; 4BAX A; 1FXT B; 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