The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
b'MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of fully protonated proteins by proton-detected magic-angle spinning NMR.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| source organism |
Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis
|
| molecule tags |
Immune system
|
| total genus |
10
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-05-13 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JWU A; 2PTL A; 4IKG A; 5BMI A; 2JU6 X; 2QSD A; 1D4B A; 1PGX A; 2ON8 A; 5BMH A; 1MHH E; 2IGH A; 2LUM A; 2KAC A; 2NMQ A; 4OZC A; 3UI3 A; 2JSV X; 1F2R C; 4HJG E; 1P7F A; 5HFY A; 2KDM A; 1Q10 A; 1MHX A; 3GB1 A; 1K50 A; 1YMH E; 4D2K A; 4KGS A; 5JXV A; 1GB1 A; 1UWX A; 2J53 A; 1EM7 A; 1P7E A; 2I38 A; 2RPV A; 2N9L A; 2QMT A; 1HEZ E; 4MAC A; 2KN4 A; 2EEL A; 1IGC A; 1YNT E; 1K51 A; 2GI9 A; 2IGD A; 3MP9 A; 1MPE A; 2PW9 A; 4WH4 A; 1F2R I; 1IBX B; 3FIL B; 1PGA A; 2PLP A; 2RMM A; 4KGT A; 1HZ5 A; 1HZ6 A; 2J52 A; 1IGD A; 1PGB A; 2JZP A; 2I2Y A; 1QKZ A; 2ZW1 A; 5HG2 A; 1K53 A; 2N7J A; 3V3X A; 2JXT A; 2KWD A; 1MI0 A; 5BMG A; 2GB1 A; 4KGR A; 1ZXH A; 4OZB A; 2KQ4 X; 1XCQ L; 4HKZ E; 2K0P A; 1IBX A; 2LHD A; 1JML A; 1FCC C; 1FCL A; 3FIL A; 2LHE A; 1XCT L; 4GLS C; 1FD6 A; 2N9K A; 2IGG A; 1GB4 A; 5HI1 A; 1XF5 L; 1K52 A; 4IOI E; 2LGI A; 2ONQ A; 1KH0 A; 2OED A; 1C9F A; 1MVK A; 4OZA A; 2ZW0 A; 5HHD G; #chains in the Genus database with same CATH topology 2M19 A; 2WDQ B; 3Q14 C; 1MG4 A; 2PVG C; 3SFD B; 1VJK A; 1D4B A; 1H8C A; 3QC8 B; 4TSS A; 3Q3M C; 5BMH A; 4JX1 C; 4B0M A; 2IND C; 3PRZ A; 2BB6 A; 5C2T B; 3PZ7 A; 3AE9 B; 1GJZ A; 1YMH E; 5JZE B; 3EC8 A; 1Y56 A; 4ZHP A; 2NS5 A; 4KDI C; 4EZJ A; 3P4R B; 2E6X A; 2FUH B; 4FLH A; 2X38 A; 4N59 A; 1ET6 A; 4XE0 A; 2N4F A; 1TS5 A; 3V60 A; 3ZXR A; 2PW9 A; 4NAW B; 3W2D A; 4G0N B; 2KXJ A; 2I1J A; 1E9M A; 2QCZ A; 2LVQ A; 1JWS D; 2KMC A; 1HA5 A; 4NJC A; 1QZE A; 3PSE B; 4HWI B; 2IO1 B; 2WXN A; 2KC2 A; 3U52 E; 4ICV A; 3NVV A; 4RFB A; 2L52 A; 1C1Y B; 1L0X B; 2MBB B; 3HM3 A; 1AYF A; 1FXT B; 1V8C A; 2LZ6 A; 2JWZ A; 1E90 A; 1E7P B; 2JQR B; 2N1W A; 4TQ1 A; 2O2V A; 1N63 A; 3DBS A; 1TS3 A; 4UDU C; 1ZP0 B; 3RNA C; 3ZIM A; 2NBV B; 4DK5 A; 2NVU I; 2HJ1 A; 3C8Y A; 4MM3 B; 5IOI A; 4DXA B; 4C4V B; 1NI2 A; 4IG7 B; 2D3C A; 1NEN B; 3KQ4 A; 3W5U B; 1NI3 A; 5E6P A; 1MFW A; 5EDS A; 2NR2 A; 1KM7 A; 2N9E B; 5J18 A; 3WAO A; 4IUM B; 2W3R A; 2R2Q A; 2Y5B B; 2DEN B; 5AUK A; 3U30 A; 4WIP A; 1LM8 B; 3L13 A; 1NDD A; 2PPH A; 2G4S A; 1P7F A; 4A3O A; 2WDR B; 3Q3N C; 4D2K A; 4WUR A; 4HJK A; 2FE8 A; 2XK5 B; 3TUO A; 2G45 B; 1GC7 A; 1WGH A; 5C3J B; 4XDD A; 3CF6 E; 1R4N I; 2JYE A; 3WA0 A; 4HEA 1; 1ZE3 D; 1Z5S B; 3W1S A; 4ITK A; 3A9K A; 1GNU A; 5DPR A; 2KWU B; 4ACF A; 1UZX B; 2KKC A; 1ZOY B; 5AUI A; 4KDL B; 5LNK 1; 1TS4 A; 2J42 A; 1HZ6 A; 1JRU A; 1OQY A; 2L00 B; 3H7P B; 3N9Y C; 1WH3 A; 3IAS 1; 2KVZ A; 1I4P A; 4WWM A; 1UNS A; 5L83 A; 1Z2M A; 2PJH A; 2K1F A; 3I63 C; 3P4S B; 2ASQ A; 3PT2 B; 1V49 A; 3V6E B; 4J3O D; 1WM3 A; 1DOI A; 2LUE A; 1OQQ A; 1BML C; 2PEA A; 1SE4 A; 4EKU A; 2GBM A; 1RFA A; 2LFI A; 4GLS C; 4K1R B; 3L54 A; 4GIV A; 2BF8 B; 4K3B A; 5EE9 A; 3UGB B; 1WR1 A; 3HM6 X; 1K8R B; 2BW2 A; 2C5L C; 1K52 A; 4IOI E; 4LNI A; 1SJE D; 3AEA B; 1WJ4 A; 4NAM A; 4A6Q A; 1P1A A; 3KUZ A; 4ANV A; 2SAK A; 4C00 A; 1RLF A; 1WR6 E; 3NY5 A; 4AP4 C; 3OLM D; 3N32 A; 1WGY A; 2AEH A; 1D5M C; 1MHH E; 1SF0 A; 1SGH A; 2NPT B; 3VQI A; 2K6D B; 1YIW A; 1GPX A; 1L6V A; 1FFU A; 2C7H A; 5HFY A; 1C4P A; 4ANW A; 3EUB 2; 3TSS A; 1XD3 B; 3JSV B; 1BXT A; 1WYW B; 3NS1 A; 4P6V F; 4K7U A; 4M0W B; 1J8C A; 2RPV A; 3NS8 A; 3QAQ A; 3ABV B; 1I42 A; 2LI5 A; 1TY0 A; 4XWW A; 4MGK E; 2D11 A; 1F77 A; 5CX3 A; 4A3P A; 4DHZ E; 3L16 A; 3VH4 B; 3MC8 A; 4MDK E; 1AAR A; 4KGT A; 2BQQ A; 1BUI C; 4WWP A; 3DCG A; 2KDB A; 3K9P B; 1N61 A; 2WDV B; 4J6I A; 1CMX B; 3AEG B; 2IZV B; 1R4M I; 3AH7 A; 4NJ7 A; 5C23 A; 2CJO A; 1TTN A; 3AM9 A; 3KWL A; 3R8B A; 2BBC A; 1V9J A; 1C79 A; 3ZJV A; 2R61 A; 2VH2 A; 2KJR A; 2LXA A; 1EU4 A; 1I35 A; 2L76 A; 3DWG C; 3OJ3 A; 2LJ5 A; 2GLS A; 2FNJ B; 3RPF C; 3APD A; 2KQS A; 1ROE A; 2ONQ A; 3Q69 A; 1QOG A; 4AOF A; 1V5T A; 2MEK A; 3VR8 B; 4KIK A; 3IG3 A; 4N58 A; 4URK A; 5H92 C; 4RM9 A; 1SXT A; 3C19 A; 3DQV A; 5BMI A; 4C80 A; 4TV3 A; 4WAA A; 3DBH I; 1B9R A; 2IO2 B; 4GDK A; 3OWE B; 1UGM A; 2MBO A; 1WXA A; 2MCN B; 2C60 A; 2WHI A; 3H8H A; 2IY1 B; 1V5O A; 4KGS A; 4US8 A; 1GUA B; 1P98 A; 3MHZ A; 1JCK B; 2INP E; 3HK0 A; 1SE9 A; 1E5W A; 1V80 A; 1YX5 B; 3ETR A; 4ZRK A; 5CHW A; 1GG3 A; 2WXG A; 2M1M A; 3FAH A; 2DZK A; 4YTN B; 4GXB A; 3Q2A C; 1OEY J; 4WH4 A; 2M8S A; 3M3J A; 1JAL A; 3N1X C; 3VDZ A; 1S1Q B; 3AEF B; 2Z0E B; 2QIE B; 2KO3 A; 1EWY C; 2KTR A; 3AB5 A; 2JZP A; 2I2Y A; 2PVO D; 2GBK A; 3A4S C; 2LVO A; 1P0R A; 3A9J B; 2RD0 A; 2LRU A; 1UEL A; 4HK2 A; 1E0Z A; 2DYB A; 4L2Y A; 2GB1 A; 2J0K A; 3ZUN A; 4JE3 B; 5BYQ A; 5G2N A; 4KZ0 A; 1JML A; 3VFK A; 3O13 A; 1FNU A; 1WIA A; 3DVN U; 4YXD B; 4PS8 A; 3M62 B; 4FA6 A; 5CTR C; 2PKO A; 5GXG B; 4HCN B; 3PS6 A; 3ZNG C; 1PUT A; 4GDL A; 2BT6 A; 2LJI A; 3GOE A; 2MX2 A; 4WWN A; 3WAL A; 4JGH B; 1TY2 A; 2J0J A; 1L0Y B; 4N9F 4; 1N5X A; 2LUM A; 3EGR A; 1PYW D; 3AE4 B; 2AQ3 B; 2AYO B; 3D32 A; 1SBB B; 4OZC A; 3UI3 A; 1FO4 A; 4RF0 A; 2JPH A; 4DHJ B; 3X23 A; 2K8H A; 4YSX B; 2J53 A; 2UWQ A; 2WP9 B; 4IM2 A; 2BS4 B; 2KOX A; 4HVB A; 4IWQ A; 3QJZ A; 2TSS A; 3P4Q B; 2MP2 A; 1T6B X; 1F52 A; 2G9H D; 2REX A; 1E8X A; 1ZPS A; 4BAX A; 1WF9 A; 1IBX B; 3DHI C; 2L0F A; 3PLU A; 4EFO A; 5D3D A; 2DZI A; 2BYF A; 1WGR A; 3ZXV A; 3HRD D; 1EF1 A; 3V62 A; 1L4D B; 4F8C B; 1STE A; 3HHM A; 2KQ7 A; 4HRS A; 1ZUD 2; 4BKS D; 4RM8 A; 1OQR A; 1FEH A; 2KAN A; 3VR9 B; 2KNB A; 2M0A A; 3SEB A; 2J7Q B; 1NBF C; 2KLG A; 1MJD A; 1NVI D; 2ICI A; 3IBE A; 5EE0 A; 4BBN C; 4OZB A; 4HKZ E; 3HUI A; 1JRP A; 1UBQ A; 3PHW B; 1WJN A; 2CJN A; 1GB4 A; 5KHQ A; 4XDC A; 5FR6 A; 3JW0 X; 2C7N B; 2N7D A; 1TKG A; 4WJO A; 4ZDV A; 2KWV B; 4TKN A; 3B1L X; 1IPG A; 1PDX A; 2N1V A; 1SJH D; 3E56 A; 2VH1 A; 3BIN A; 3AED B; 1J0G A; 1I4H A; 3TJP A; 2KJ6 A; 2O6V A; 3KYC D; 5LXH A; 4NQL B; 4TMA B; 2LGS A; 1YQ4 B; 3RNC C; 3DPD A; 2WLB A; 3TEW A; 4FJZ A; 1XLN A; 3ZW3 A; 4A90 A; 2NBW B; 2KVR A; 2JSV X; 1F2R C; 1BT0 A; 4ZRQ A; 3GB1 A; 2INN E; 3R2T A; 2DLB A; 2FAZ A; 4FN2 A; 3NJT A; 3DHH C; 3PO0 A; 1P7E A; 4YTP B; 2K3U A; 2KX3 A; 2KN4 A; 1WJU A; 3LXF A; 3DBL I; 1V97 A; 2GI9 A; 4I6N B; 3RFZ B; 1IP9 A; 3NHE B; 4AWJ A; 2N9X A; 4KX6 B; 1FRR A; 5FR3 A; 2W9N A; 2CS4 A; 2BS3 B; 3NVZ A; 4GN1 A; 1WRD B; 3GZN I; 4GB9 A; 2WXO A; 3AN1 A; 2RMM A; 1EF5 A; 2VZK B; 2PE6 B; 3AE6 B; 2HTM E; 2GRI A; 2Y5P A; 4LDT D; 4MJS B; 3T3N A; 2ZW1 A; 1TZO A; 2BPS A; 4ZRP A; 4GGQ A; 3P4P B; 4X57 B; 4YWG G; 5D94 A; 2ACZ B; 3VRA B; 1E7U A; 1ENF A; 1FMA D; 1G6J A; 1QT9 A; 1XCQ L; 3EEC A; 4GU2 A; 1WYG A; 4NAW A; 1T0R C; 4RMA A; 1UUP A; 1SE3 A; 1FRD A; 2KX0 A; 4KSK C; 3SFE B; 3AEB B; 1JWM D; 3PRE A; 4P16 A; 3VUW A; 3Q8F A; 1RWS A; 2IDY A; 3VVW B; 3S2A A; 2ZW0 A; 1D5X C; 1JWB D; 1V2Y A; 5CHF A; 1NEK B; 2DYO A; 2QSD A; 2D3B A; 4W9C A; 4S17 A; 3PV1 A; 2D10 A; 3CST A; 3CSF A; 2MJ3 A; 2NMQ A; 4MM3 A; 4LNO A; 3RCZ A; 1T3Q A; 3GE3 C; 4K81 A; 1OGW A; 4C4V A; 1WXS A; 1E8W A; 2QHO A; 5JXV A; 1ZDX A; 2GBN A; 1FPY A; 2KD0 A; 2CHW A; 1L4Z B; 2JXX A; 1L5P A; 3TCA A; 2QEJ C; 2WXI A; 4NNJ B; 2J0M A; 2JZ3 B; 2ZVN A; 3NOB A; 3ZO5 B; 1I4G A; 3RNB C; 2WNM A; 2D5G A; 2MBH A; 1WXM A; 4EUT A; 1TJE A; 3FIL B; 2QC8 A; 5IA7 A; 1DOX A; 2PLP A; 1QOA A; 2XK5 A; 4AJY B; 1FNW A; 2FCS A; 4OW0 A; 1XEE A; 3MC0 B; 1NYQ A; 1YQ3 B; 4JL9 A; 1K53 A; 1PQS A; 1T0Q C; 2K5P A; 5HKH A; 4TUU A; 4RF1 A; 1H4R A; 1WX7 A; 3KH0 A; 4EOY A; 2BYV E; 3AEE B; 3ML9 A; 4LJP B; 5IP4 D; 2ZNV C; 4MT5 A; 3RN9 C; 2ZZP B; 2DNF A; 4ZHO A; 1UGJ A; 3H7P A; 3ZGZ A; 3ALB A; 3AV8 A; 2YLM A; 2XBB C; 4P1B C; 2JVC A; 1LO5 D; 2BGF A; 2JU6 X; 2MWS B; 3RNG C; 3MJW A; 4E3C A; 1ZKH A; 4CYE A; 2CHZ A; 4M8M A; 4W9L A; 3VHT C; 2DYM A; 2DAJ A; 3O65 B; 3W1Y A; 3RD2 A; 1M94 A; 4L1B A; 4DDI D; 2LGY A; 1RYJ A; 2AX5 A; 2IY0 B; 1TIF A; 4TQ0 A; 1EM7 A; 3AUL A; 5G55 A; 2WWZ A; 1LGR A; 1ZW7 A; 2INC C; 1YNT E; 1K51 A; 3RI7 C; 3MP9 A; 4OVV A; 3JYU A; 2FIF A; 2H89 B; 2L0T A; 2NPT A; 3BY4 B; 4LLG M; 5FK9 C; 3R7Q A; 2MLB A; 3AU4 A; 1AWD A; 3RUI B; 3MJ5 A; 4DHJ D; 1UWM A; 3H9D A; 1WFY A; 4MGZ E; 1C77 A; 3JSV A; 4IM0 A; 3VTV A; 2NBU A; 4II2 B; 1GAQ B; 3KYD D; 4XYC A; 4M0W A; 1PGB A; 4LDT B; 3ZTC A; 3NG0 A; 4WJN A; 5HG2 A; 3URY A; 2BYT A; 3TEZ A; 4ZRJ A; 3AMZ A; 1A5R A; 3QX1 A; 2FBW B; 2WU2 B; 4WQM A; 1A70 A; 3DHG C; 1QOF A; 1DYQ A; 1FCC C; 2CU3 A; 1Q0W B; 4ZYS A; 1GOZ A; 1FXI A; 3N30 A; 1V1P B; 2ZVO A; 2N9K A; 2ZCB A; 3RT3 B; 4DWF A; 4MEL A; 1WGD A; 2GOW A; 4IWP A; 3ZQ4 A; 1DOY A; 1SE2 A; 4XC2 A; 3Q6B A; 2KFK B; 2W55 A; 4ZOH C; 5HHD G; 2HE7 A; 3ZRF A; 4BFR A; 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5E6N A; 4N6E B; 3A9J A; 3P2B A; 3GP7 A; 3U2S C; 4LJO B; 2ZPY A; 4MEM A; 1I4Q A; 3R7R A; 2JWU A; 3RNE C; 3VTU A; 4W9I A; 2RPQ A; 4M8N A; 4WJQ A; 1TYG B; 3W5V B; 2A4Z A; 3MHS D; 1TGZ B; 1E8Y A; 1TS2 A; 3QCA A; 3IT4 B; 4WJP A; 4JPS A; 1JWA D; 3ENE A; 1TKY A; 2LRW A; 1JRO A; 2CU1 A; 4RGM A; 1Q5W B; 3RYT A; 3VTW A; 3AEC B; 3V6C B; 3HIZ A; 3PRP B; 3AI5 A; 1VRA B; 4BKT A; 2LWP A; 4W9J A; 3KVF B; 1HTQ A; 1E8Z A; 2AQ1 B; 3ZJT A; 4W9H A; 3QAR A; 5D7G A; 1XO3 A; 3NZ3 A; 1WMH B; 4ASW C; 4OVZ A; 1XQQ A; 3L17 A; 3CMM B; 1ACC A; 3B9J A; 2RR9 A; 3RNF C; 3DVG X; 3GE8 C; 2JY6 A; 2I1K A; 4B95 A; 2EMS A; 1DGJ A; 1LQB A; 2M0X A; 3B2G A; 4AS1 A; 3AE5 B; 2MH7 A; 2YEP B; 3JVZ X; 4BZA A; 1L2N A; 5DPT A; 3ZVV A; 2E3T A; 1IBX A; 4W9K A; 2WX1 A; 3Q3J A; 2AL6 A; 3UIO B; 1XCT L; 3U7Z A; 4DHZ B; 1ZGU B; 4LNK A; 4FJV B; 4HLE A; 1YJ1 A; 1GC6 A; 2IBI B; 2K8B A; 4KZC A; 5TR5 A; 1WY8 A; 2M17 A; 1R4M B; 2AL3 A; 3IXS A; 1VLB A; 2KC1 A; 2MRP A; 2VRR B; 5FKA C; 1E6E B; 3ZNH B; 4E74 A; 4WQO B; 2D3A A; 2PE9 A; 4JWS C; 2XEW A; 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