5KJ9A

Anticancer activity of ru- and os(arene) compounds of a maleimide-functionalized bioactive pyridinecarbothioamide ligand
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Anticancer activity of Ru- and Os(arene) compounds of a maleimide-functionalized bioactive pyridinecarbothioamide ligand.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5kj9A00
1JKBA 1BB3A 2HTXA 135LA 4NHIA 5B05A 1FDLY 1UUZC 1JSFA 1LJNA 4L41A 4J0LA 5FHWA 1LZRA 1AZFA 5LVIA 1HF4A 4J1BA 1GFEA 1TAYA 4CFPA 3RT5X 4NGKA 5FEKA 1GB2A 2HEEA 5I4YA 1GBOA 2Z39A 4NGVA 1MELL 4H9EA 4H90A 5ILCA 3LYTA 5LVKA 1GEZA 1NBYC 1QIOA 2MEDA 1IOQA 4HPIA 3K3TA 5LYZA 5KY1A 4TX7A 1B5UA 2DQAA 4BADA 1NF5A 2I26L 3WYHA 3B6LA 153LA 1VDTA 1HEPA 1IVMA 5ILFA 3RZ4A 4WOAA 3GXRA 4B0DA 3J6KA 1LOZA 2BQNA 3ZVQA 4M4OA 2HEBA 2G4PA 2IHLA 2BPUA 3LZTA 1CNSA 1LKSA 3AGGG 1UCOA 1LSBA 4NGYA 1FKQA 1KXYA 1B5YA 4WLDA 1LSMA 4YF2A 8LYZA 1LSNA 2C8OA 3W6FA 1DPXA 1F10A 1IY3A 1XEIA 1VAUA 3AYQA 1GF9A 3A92A 4ETCA 1OUEA 1LMPA 5L3IA 1VATA 1GBZA 5HMJA 5KKJA 4LYMA 4NEBA 1JTTL 4XJDA 2GV0A 1CKDA 4YENA 1GDWA 1B0DA 2AUBA 5L3HA 3P65A 5HLLA 4IATA 3CSRA 3CT0A 1BVXA 1GF0A 4WL6A 2MEHA 5KXXA 1BVKC 3OK0A 1DPWA 4G4HA 2YBHA 4GN4A 3LYZA 1UA6Y 2B5ZA 4H8ZA 5B07A 1GB8A 2ZIJA 4WM6A 1IP7A 1XGPC 4NY5A 3WXTA 5E4PA 4NHSA 2Z2FA 4LYCA 1OUBA 1YIKA 4Z46A 1VEDA 2ZILA 4CFOA 1WVUA 2Q0MX 5KXYA 1JIYA 1DI3A 1HERA 5APFA 2XBRA 4B4IA 1V7SA 1UC0A 1TCYA 4DDCA 4YEMA 1GHLA 1IWTA 1HELA 2BLXA 3WU7A 3TXHA 1I1ZA 1J1XY 1EQ4A 1UIAA 1RJCB 1OUJA 1VDPA 3LZ2A 3WW5A 3CT5A 5F16A 1RCMA 5C6LA 1GEVA 5E9RA 4HTQA 4G49A 3WPLA 4ZEEA 3QNGA 3WUMA 1LHHA 1GB7A 4H9CA 4LYZA 1EQ5A 3A3QA 4J1AA 5I4XA 1DI4A 3B0OA 4DD3A 5M1YA 1GFGA 2EKSC 5LAFA 4ETAA 1W08A 4DD7A 3N9AA 1H87A 1D0LA 2C8PA 5HQ1A 3LYOA 1HFXA 5KXSA 1YKXX 2HU3A 4NGIA 4LT2A 1IOTA 1GFUA 1LZ5A 5FCPA 1LHKA 5FSTA 3A6CY 2BQHA 3W6CA 5F14A 1LYSA 4B4JA 4H92A 4C3WA 3FE0A 1GWDA 1IORA 1PZYA 1GE4A 1C7PA 3WU8A 1LSCA 2NWDX 1GFJA 1UICA 5HNLA 3AB6A 2HECA 4IASA 1YAPA 4P2EA 2Z19A 1DZBX 7LYZA 1YILA 4ANRA 4GN3A 2ZYPA 2BQOA 1XGQC 3AZ7A 1IP3A 2HEDA 2W1YA 4H9AA 1YKZX 4N1CC 4WLXA 3A34A 2CDSA 2DBTA 4GCEA 3TXKA 1LSDA 5KXKA 1B7SA 4QEQA 5IHGA 1LJ4A 4DD2A 1HMKA 1XEKA 2BQFA 4J7VA 1LZAA 207LA 3WUNA 1IP2A 3W3EA 4XJIA 3GXKA 1FBIX 1GFHA 4H8XA 3VWOA 9LYZA 2YSSC 4E3UA 1DQJC 3AW6A 1LMCA 5DN4A 4AXTA 2HEAA 1DXJA 4H9HA 1EL1A 1IOSA 2FYCA 1IY4A 4GN5C 1IO5A 1LYYA 4WM4A 4ETBA 4QDNA 3IJUA 6LYZA 5DL9A 1GE0A 4NGJA 1REXA 5LAGA 1FKVA 1CJ7A 1GBYA 1AM7A 1LZTA 1IP6A 1UIGA 4W94A 1LSAA 4TWSA 5A3EA 1G7IC 2ZNWY 2F2NA 4LT3A 1P2CC 3M18B 4HJVA 1IC7Y 1GF5A 1GBXA 1YAMA 4Z3MA 1JJ0A 1LJJA 1GE3A 1QUSA 1C46A 1LSPA 1QSAA 2LYOA 3AZ6A 4QY9A 5KXOA 3A96A 1JUGA 1IWYA 3QE8A 1UACY 1GFKA 1NDMC 1AT5A 1ZMYL 2BQCA 2LZ2A 4UWUA 1LJ3A 2WARA 3WL2A 2DQDY 4NSIA 2LZTA 4LT0A 3AGHA 2LHMA 4H91A 1WTMA 2A7DA 1OUDA 1PS5A 1GE2A 4LGKA 1LJIA 1B7RA 1TBYA 1WTNA 1LZ6A 1AKIA 4OWHA 5LYTA 4PRUA 1LZ1A 2F4AA 4H93A 1CKFA 1SLYA 194LA 5DN5A 3LN2A 4M6DA 5HNCA 4II8A 4NGZA 1LZCA 4DWXA 1IIZA 1QTEA 1YROA 2EIZC 1OP9B 2MECA 4RLMA 3BKHA 4AGAA 1BQLY 4CGEA 5F9XA 1KIRC 1B7PA 2YBIA 3AZ4A 4W96A 2DQJY 1ZVHL 2DQCY 1GF4A 4LZTA 4XADA 1OUIA 4ET8A 3KAMA 1LZNA 1VDSA 1JKAA 4WO9A 6LYTA 1D0MA 1GD6A 1KXXA 1QTKA 2BAAA 2Z12A 1CJ9A 1JPOA 1J1OY 1LSYA 1OUAA 4KL7A 4KXIA 5KXMA 1FLQA 1NKHA 3M3UA 1FN5A 3P4ZA 1IWVA 5DLAA 1JJ1A 1G7HC 1RI8B 3ZVQB 4HTNA 5IELA 1B5ZA 3P64A 1D6PA 2F30A 5D5FA 3WH1A 1GAYA 5K7OA 5B06A 4Z41A 1A4VA 2ZWBA 4ML7A 4ZFPA 3F6ZA 4GCDA 4LFXA 1XGUC 5I4WA 2YBNA 4HJZA 1XGTC 1JTOL 1IR7A 1NHEA 1BB6A 4WLTA 3A94A 2YVBA 4NWEA 5LVHA 5B1FA 3TXJA 2RSCA 1I20A 3WMKA 3P66A 1B7QA 3D9AC 5KKIA 4DDBA 1BGIA 2BQLA 1GB9A 1REYA 3N9EA 3ATOA 1NWGA 2EPEA 3A8ZA 1FLUA 2A7FA 2XTHA 1UBZA 3WPJA 5FDJA 2D4IA 1IEEA 1VFBC 4R6CA 1INUA 1LHJA 3WULA 1BB5A 1DKKA 3AZ5A 4OOOA 3LHMA 1C10A 1GDXA 2LYZA 3WUAA 2G4NA 4NGWA 4QGZA 1LSGA 1TDYA 4WLYA 1JWRA 5KJ9A 1YL1X 2W1LA 1F6SA 2PC2A 4KPMA 4BAPA 1GFVA 4LYTA 4TSBA 1GB0A 4YOPA 2ZQ3A 3CSQA 4XJGA 3D3DA 1ZVYB 3WVYA 4DT3A 4N5RA 4I0CA 2Z18A 4NGOA 1B7LA 3HBHA 3T6UA 1JHLA 4H8YA 2ZYCA 4ET9A 5KXWA 1OUGA 1CJ8A 1LMQA 1V7TA 4XJFA 2H5ZA 3A91A 1IP4A 2Z2EA 5KXPA 1XFPL 4LYBA 2BQBA 1XSFA 1LZDA 4EMNA 4LFPA 5KXZA 193LA 1HHLA 4OWEA 4TUNA 3RU5A 4RW1A 2D4KA 1GAZA 1NMMA 5APCA 1TEWA 3HBDA 4NSHA 1LHLA 1BB4A 1C45A 5EBHA 3W6BA 1HFZA 1GXV2 4BAFA 4B49A 3B0KA 4WM1A 1MLCE 3MGWA 5D5CA 2BQJA 4PGJB 2XBSA 1GBSA 4D9ZA 1LZGA 4MCKA 1RFPA 4HPEA 4CJ2A 4LYOA 1IP1A 1IWXA 1DI5A 4WM2A 2BQGA 3AGIA 1AT6A 2DQFC 1Z55A 208LA 1BWHA 5DM9A 1HEMA 2CGIA 2EQLA 3T36A 133LA 1KIPC 1GF8A 1HFYA 1B7OA 1C08C 1GFRA 1W6ZA 1T6VL 4XENA 1WQNA 1REZA 5J7CA 1JJ3A 4GLAA 1LTMA 4PPOA 1GB6A 3W6DA 4ETDA 134LA 4NG8A 2YBMA 5FELA 3A93A 1HSWA 4NSJA 4RW2A 5F9UA 2XJWA 1LKRA 1GFTA 3CT1A 4GCCA 3G3AB 1HNLA 1LSEA 5KXLA 1GE1A 1G7MC 1LHIA 4HSFA 3WU9A 1HEWA 2H9JA 1C43A 1LZ4A 2BQEA 2F4GA 1HC0A 2D91A 1NDGC 1WQPA 1OUHA 4NFVA 4G4BA 2X0AA 1HEQA 4HV1A 3HFMY 4Z98A 3WVXA 1GFAA 3AW7A 4KT3A 4N8ZA 1CKCA 2N5ZA 4UWNA 2MEIA 5KXTA 1QUTA 3QY4A 2CJLA 4IJ4A 3LYMA 3HBEX 1UIDA 5A3ZA 1IWWA 5JENB 5LA8A 1GXXA 3OJPA 4O34A 1LZ9A 4FJRA 4GCFA 4B4EA 1YQVY 5LINA 4N9RA 1LJFA 3TXEA 4WG7A 1E8LA 3ATNA 1BHZA 1GB3A 1LJGA 1QDTA 2BQMA 1CJ6A 1JKCA 3CQLA 4WMGA 3RW8A 3EBAB 4LT1A 3TXGA 1D0KA 1LJKA 4OWCA 4DC4A 1O23A 4UWVA 1CKGA 1HEOA 2YBJA 5HMVA 2MEEA 2Y8PA 3EXDA 1F0WA 4WL7A 3TMUA 4PHIA 1HSXA 1B7NA 2VB1A 4CHXA 4I8SA 1LCNA 3TMXA 3AJNA 1LZEA 1LZ8A 1WQRA 3EO5A 1D6QA 5B59A 4H1PA 1REMA 4NGLA 5C6IA 3BKVA 1N4FA 3CB7A 4OWAA 1I56A 1LPIA 3TMWA 2Z37A 5IDDA 4XJHA 4G9SA 4OWBA 5II3A 4HJYA 2CWIA 1QDRA 1JISA 1QQYA 1WVVA 1OUCA 3WPKA 2W1XA 1GPQC 4HV2A 3N9CA 1B5VA 4TTDA 1CKHA 2DQHY 1UIEA 4WM5A 4XJBA 1GF7A 4YEOA 3TMVA 5LVJA 4ZIXA 2HUBA 1B9OA 2DQGY 4GLVA 1IC5Y 1LZSA 4NG1A 4C5FA 4YM8A 1JEFA 4WG1A 4MSTA 1H6MA 1BWIA 1IP5A 2H9KA 4XYYA 5B1GA 4NHQA 3J4GA 4RDSA 2HEFA 2D4JA 4N1EI 1F6RA 3A95A 2IFFY 2G4QA 2BQDA 1JKDA 3WW6A 3SP3A 4DD1A 4DD0A 1FLYA 1LSFA 2W1MA 4B1AA 1YANA 2MEGA 1OUFA 5I53A 5KXRA 3B72A 3W6EA 4DYGA 1LZBA 1GBWA 2LYMA 3WXUA 4ETEA 5L9JA 4H9IA 2DQEY 1J1PY 1WQMA 2YBLA 4HP0A 1LJEA 3ULRA 5APDA 5LYMA 1YAOA 2MEFA 154LA 3ZEKA 1LHMA 1T3PA 1LYZA 2BQIA 4NHPA 2DKVA 5F81A 4NSGA 1LMAA 2I6ZA 1FLWA 2HU1A 3IWRA 3FI7A 3W6AA 1IR9A 5LVGA 4NHTA 2D6BA 1B5XA 1D9UA 4RLNA 1GF6A 2YDGA 1DKJA 1G7JC 1GB5A 1BB7A 4OOTA 3CSZA 1NBZC 1B5WA 3IJVA 4N0JA 5LIOA 5LA5A 1JITA 3A3RX 4G4CA 4EOFA 4XN6A 1B2KA 4U3XB 4DDAA 4WO6A 1LJHA 4PRQA 5AMYA 1HENA 5I54A 4OW1A 4GCBA 1EQEA 2MEBA 1IX0A 4DD9A 1IR8A 3A67Y 132LA 2DQIY 3E3DA 5I5QA 1A2YC 1IWUA 4H9FA 2ZNXY 2MEAA 1SQ2L 2ZQ4A 1KIQC 2FBBA 1LSZA 4H94A 1OQMA 2BQAA 4FDYA 1WQOA 1IWZA 3RNXA 3TXIA 1YL0X 4BS7A 1B7MA 1LAAA 4PJ2C 3TXFA 3G3BB 4TSCA 1LYOA 1XEJA 1BWJA 4R0FA 5T3FA 3TXDA 1IC4Y 1LZYA 3P68A 5C6JA 1NQIA 4A7DA 1HMLA 1UIBA 4X3BA 1GF3A 4NWHA 2FBDA 4HTKA 2ZIKA 1WQQA 1LMTA 1VDQA 2BLYA 1LMNA 3A6BY 1IOCA 3A90A 5LXWA 2FYDA 1XGRC 4MR1A 1YAQA 1YKYX 1KXWA 1UIHA 4NIJA 1LMOA 1RE2A 1ALCA 1QSWA 5KXNA 1JTPL 1UIFA 1ZV5L 2BQKA 1JSEA 2I25L 4WM3A 3TXBA 3B0IA 3EMSA 2Z38A 5APEA 4H9BA 1G7LC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L2XA 2Q9DA 254LA 5FHWA 1L66A 1AZFA 1TAYA 3RT5X 4NGKA 5FEKA 1C6FA 1GBOA 1LYFA 4LDEA 4H90A 5ILCA 4HPIA 5KY1A 112LA 239LA 1B5UA 2DQAA 1C64A 1NF5A 2I26L 3G3VA 4W53A 153LA 1VDTA 3RZ4A 185LA 3J6KA 1LOZA 4LDOA 2HEBA 3LZTA 1LKSA 4ARMB 162LA 1UCOA 1LSBA 4YXCA 103LA 1C68A 4YF2A 8LYZA 157LA 1DPXA 1IY3A 1XEIA 4EKSA 1OYUA 3A92A 3HUAA 1OUEA 1LMPA 4ETCA 4W54A 5KKJA 1JTTL 1C63A 1GDWA 1B0DA 5L3HA 3GUJA 171LA 1L83A 4I7LA 1BVKC 1GB8A 3WXTA 5E4PA 4NHSA 4LYCA 1VEDA 1C67A 4CFOA 5KXYA 4EKRA 4EKQA 2XBRA 4B4IA 1IWTA 2BLXA 4K5YA 3TXHA 1J1XY 1OUJA 1VDPA 125LA 3CT5A 214LA 1L29A 2RAYX 4H9CA 1EQ5A 3GULA 1DI4A 4OO9A 5M1YA 4DD7A 3LYOA 1PQKA 5KXSA 1L23A 2CUUA 2HU3A 1NHBA 1GFUA 1D3JA 5FCPA 4EPIA 3A6CY 5F14A 3RUNA 3PDSA 1PZYA 1GE4A 2NTHA 1L40A 3WU8A 2RH1A 4ARJA 3AB6A 2HECA 3SB7A 2Z19A 1OVHA 1D2WA 2BQOA 102LA 4WLXA 1P2LA 4GCEA 3TXKA 5KXKA 3HUKA 4J7VA 1IP2A 9LYZA 2YSSC 3GUOA 1LMCA 227LA 4H9HA 1IOSA 2FYCA 1QSBA 4DJHA 144LA 4GN5C 1LYYA 6LYZA 5DL9A 217LA 1UIGA 1G0JA 2F2NA 1L09A 1P2CC 3M18B 4HJVA 1IC7Y 1GE3A 2B6WA 3A96A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JKB A;  1BB3 A;  2HTX A;  135L A;  4NHI A;  5B05 A;  1FDL Y;  1UUZ C;  1JSF A;  1LJN A;  4L41 A;  4J0L A;  5FHW A;  1LZR A;  1AZF A;  5LVI A;  1HF4 A;  4J1B A;  1GFE A;  1TAY A;  4CFP A;  3RT5 X;  4NGK A;  5FEK A;  1GB2 A;  2HEE A;  5I4Y A;  1GBO A;  2Z39 A;  4NGV A;  1MEL L;  4H9E A;  4H90 A;  5ILC A;  3LYT A;  5LVK A;  1GEZ A;  1NBY C;  1QIO A;  2MED A;  1IOQ A;  4HPI A;  3K3T A;  5LYZ A;  5KY1 A;  4TX7 A;  1B5U A;  2DQA A;  4BAD A;  1NF5 A;  2I26 L;  3WYH A;  3B6L A;  153L A;  1VDT A;  1HEP A;  1IVM A;  5ILF A;  3RZ4 A;  4WOA A;  3GXR A;  4B0D A;  3J6K A;  1LOZ A;  2BQN A;  3ZVQ A;  4M4O A;  2HEB A;  2G4P A;  2IHL A;  2BPU A;  3LZT A;  1CNS A;  1LKS A;  3AGG G;  1UCO A;  1LSB A;  4NGY A;  1FKQ A;  1KXY A;  1B5Y A;  4WLD A;  1LSM A;  4YF2 A;  8LYZ A;  1LSN A;  2C8O A;  3W6F A;  1DPX A;  1F10 A;  1IY3 A;  1XEI A;  1VAU A;  3AYQ A;  1GF9 A;  3A92 A;  4ETC A;  1OUE A;  1LMP A;  5L3I A;  1VAT A;  1GBZ A;  5HMJ A;  5KKJ A;  4LYM A;  4NEB A;  1JTT L;  4XJD A;  2GV0 A;  1CKD A;  4YEN A;  1GDW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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