5KJ9A

Anticancer activity of ru- and os(arene) compounds of a maleimide-functionalized bioactive pyridinecarbothioamide ligand
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Anticancer activity of Ru- and Os(arene) compounds of a maleimide-functionalized bioactive pyridinecarbothioamide ligand.
pubmed doi rcsb
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5kj9A00
1HSWA 4OOOA 1JKCA 1UICA 2FBDA 2BQCA 1IORA 1D0MA 1LZ5A 2ZIKA 4AXTA 1QUTA 1B7OA 1BB3A 2H9KA 5B05A 1LSMA 1JJ3A 2EQLA 2W1MA 4RDSA 3CT0A 2MEIA 2YBHA 4EOFA 1IO5A 1G7IC 2XJWA 1AKIA 1JKBA 3J4GA 3K3TA 4NGOA 4QGZA 4WL6A 5B07A 3RZ4A 2F4AA 4GN5C 4XENA 1CKCA 1BB7A 1VEDA 4YEMA 4M4OA 2D4KA 1HHLA 4WMGA 1XEIA 2YBNA 1F6SA 1OQMA 4XJIA 1HEOA 2DQHY 1QQYA 1TDYA 3WU7A 1XGUC 2D6BA 8LYZA 3TMVA 1LMAA 3W6BA 1IWZA 1B7NA 3WXTA 7LYZA 1GFVA 4G49A 3HBEX 2AUBA 4GCBA 3OK0A 4DWXA 1GB6A 5KXRA 4II8A 4KL7A 4U3XB 1YL1X 5KXLA 1UBZA 1GB3A 1PS5A 1LOZA 1WVVA 2CJLA 5LVIA 5JENB 1LHLA 1OUIA 5ILCA 1UIDA 3GXKA 4NHTA 1B5YA 5KXTA 1FLQA 5M1YA 1GFGA 1XGTC 1WQPA 2A7DA 2BQIA 4WLDA 3WH1A 1LSZA 4DD1A 1YAPA 3QY4A 4NSJA 1N4FA 1GWDA 4H93A 1GE0A 5T3FA 1IWTA 1T6VL 1HEQA 1B9OA 1JIYA 1AT6A 4NHQA 4CFOA 1ZV5L 3A67Y 5AMYA 2W1LA 5E4PA 4H1PA 3W6DA 4LZTA 3VWOA 4WO9A 2I26L 3QNGA 1IP3A 3TXHA 1BHZA 1GFUA 1NDMC 4P2EA 1IR7A 4TTDA 4H9BA 4NWHA 1XGQC 3AGIA 2VB1A 1GFEA 5FCPA 2C8OA 4FDYA 3ULRA 2BQOA 4PPOA 4NSHA 2ZIJA 1CKFA 2MEFA 4XJBA 4YENA 4DDAA 1IP5A 3ATOA 3IWRA 1KIQC 1C43A 1FBIX 2ZILA 3A90A 1EL1A 4B0DA 1LSCA 5APFA 1B5VA 1LMPA 4GLVA 4MCKA 3AZ6A 1LZTA 5KXZA 3P68A 1LSFA 1QIOA 1OUFA 1GE4A 5KXSA 2F30A 4I8SA 2ZNXY 2D4IA 1UC0A 2H9JA 3N9EA 4HTKA 1LJNA 1GHLA 1IP6A 3T36A 3QE8A 5LA8A 1LYSA 5I54A 2XBRA 1GBYA 3B0IA 1V7SA 4LYBA 133LA 1GEVA 4GCEA 5DL9A 5F9XA 4B49A 1C10A 5F16A 1B5ZA 1YKXX 1YKYX 207LA 4YOPA 5IDDA 5HMJA 2Z2FA 5B1FA 1VDPA 5IELA 3TXFA 1C45A 4DD2A 1IOSA 4WLYA 3W6CA 2D91A 1G7LC 1GB5A 3ATNA 3EO5A 1WVUA 4H9AA 4KT3A 4DC4A 5LVKA 4Z46A 1JWRA 4NGKA 5II3A 1IC4Y 4YF2A 1LZSA 2I25L 1ZVYB 2Q0MX 5APCA 3WXUA 2DQFC 5LYMA 1GBZA 1NMMA 4LT1A 2I6ZA 4HJZA 4QY9A 5KXKA 1GBOA 2H5ZA 5DM9A 5KXPA 5KY1A 1DXJA 1FDLY 1W6ZA 4HPEA 4YEOA 1IWYA 1UA6Y 4GCDA 4OW1A 4LT3A 1C46A 1KIPC 1KIRC 3FI7A 2Z39A 1ALCA 1UIFA 1DKJA 3RW8A 1UCOA 4DYGA 2CDSA 5APEA 1GPQC 1LMNA 1TBYA 3HBDA 5B59A 1WQNA 2XBSA 3BKVA 4C5FA 2YVBA 4XJGA 1IY4A 1LZBA 5IHGA 3ZVQB 1LSAA 2Z19A 1HMLA 3EXDA 4CJ2A 5F9UA 1GDWA 4LYCA 2LYMA 1IP4A 2YBJA 2DQEY 1GFKA 4HJYA 4NGWA 4ANRA 5KXWA 1OUBA 134LA 1OUCA 1RFPA 1IC7Y 1LAAA 1JKDA 3TXIA 1GBXA 1IX0A 1J1PY 1LZ8A 1SLYA 3E3DA 1HENA 1LZ4A 3B72A 4TWSA 1LJEA 4R0FA 1DPWA 1DQJC 2LZ2A 1LJFA 2D4JA 3LYMA 1BB6A 1IWWA 2ZYPA 4NG1A 5EBHA 1C7PA 1HF4A 4WLXA 3TMXA 4I0CA 4B4EA 4BAPA 2FYDA 3BKHA 1IR8A 3WUAA 4N8ZA 5HQ1A 1LJ4A 4IATA 1B7RA 1LJHA 4Z98A 4NGIA 1Z55A 1YAOA 1GXXA 1LJGA 2RSCA 1CJ6A 1CKDA 1LSPA 1RCMA 1VFBC 4NY5A 4RLNA 4ETCA 3B6LA 5C6LA 3A92A 1LSNA 1BGIA 2BLXA 1F0WA 2ZNWY 4DD0A 5HMVA 4WLTA 1LHHA 4HJVA 153LA 1GF4A 1QTKA 5B06A 1JKAA 3EBAB 3CT1A 4O34A 1BB5A 1HEWA 1PZYA 1NBYC 2W1YA 4LYOA 4OWEA 1BWHA 1GBWA 3LHMA 4RW2A 2DKVA 4HTQA 2CGIA 1LZ6A 3AZ5A 1B7MA 1B7SA 5FELA 1DKKA 1DI4A 4CFPA 1FLWA 5LVJA 3A6BY 3MGWA 2MEGA 1LJ3A 4GN4A 2G4NA 5FSTA 2DQDY 1LZEA 4J1BA 1YL0X 3D3DA 1RI8B 4L41A 2LZTA 1HFZA 1B0DA 4LYZA 5KKIA 4LYTA 5L3IA 1LMOA 3F6ZA 1B7LA 5DN4A 3RU5A 3AYQA 1F10A 1LCNA 1UIHA 3WMKA 4OWAA 2X0AA 4WM6A 1YAQA 5LA5A 1KXXA 2ZYCA 3WW5A 2BQFA 1OUGA 2EPEA 3LZTA 1LKSA 4PJ2C 2G4QA 1NHEA 1G7HC 1LMCA 1LZNA 4XN6A 4WM3A 3ZEKA 5DN5A 2NWDX 2XTHA 5J7CA 2Z12A 2BQJA 2BQLA 2Z37A 1GB9A 1KXYA 1YIKA 4HP0A 3AJNA 5DLAA 1D6QA 1W08A 4ET9A 1C08C 5D5FA 1HMKA 1GE2A 4GLAA 1OUJA 1LZCA 5I53A 4J1AA 1EQEA 4UWUA 1INUA 1CKHA 4PGJB 1GDXA 4TSCA 4OWBA 1GE1A 1LKRA 5F81A 3TXKA 1FKQA 3TXBA 1B7PA 2DQAA 4FJRA 4XYYA 5LYTA 1JJ0A 1HEPA 5FHWA 1GE3A 2LHMA 1OP9B 5D5CA 1BQLY 2EKSC 1QTEA 1LZGA 3AGHA 4DT3A 1IWVA 3AZ4A 2HEAA 2W1XA 1GEZA 4NFVA 4DD9A 1G7JC 2HU1A 4LT2A 3A93A 2Y8PA 5LYZA 2BQBA 2C8PA 1REYA 2HEEA 4M6DA 1IOCA 1J1XY 1REMA 3WYHA 2BQEA 1HEMA 4H9HA 1JSEA 1OUDA 4TX7A 1AZFA 1LZDA 1QDRA 4R6CA 3W6FA 1CKGA 3A95A 2FBBA 2DQJY 5KXXA 4HTNA 1XSFA 5F14A 3M18B 5KXNA 1XEKA 1BVXA 1LSBA 4KPMA 1UIAA 4NWEA 2HU3A 2DQCY 3LYTA 4N1EI 5KJ9A 5KKJA 3WULA 3WVYA 1D9UA 2EIZC 4ML7A 2Z2EA 1JPOA 2BQKA 3AW7A 1LMQA 1YILA 1TCYA 135LA 4G4BA 4PHIA 1DI3A 1YANA 4GCCA 3TMWA 2WARA 1MLCE 4DDCA 1RE2A 4ZIXA 1RJCB 2HUBA 1LHIA 3A8ZA 4WO6A 1NDGC 1GF6A 3A6CY 5I5QA 4GN3A 5FEKA 4CGEA 4NSIA 4NHSA 1B5UA 1TEWA 1XEJA 1SQ2L 1HERA 4W94A 4H9EA 5HLLA 1IOTA 5I4WA 3A94A 2LYOA 1JEFA 5I4XA 1LSDA 1LTMA 1ZVHL 1LJJA 1VDTA 3IJVA 1H6MA 1HELA 2G4PA 3CSQA 4ETBA 4ET8A 4LYMA 9LYZA 4WM4A 4NGYA 1YROA 4D9ZA 1XFPL 1XGRC 4NSGA 4LFXA 2YBLA 1LZ1A 4IJ4A 4MR1A 3P4ZA 1I56A 2Z18A 4Z41A 3J6KA 4WM1A 1FN5A 1IP1A 4H91A 1GF0A 2IHLA 1AM7A 1GXV2 4J0LA 4H9FA 1GFAA 4NHPA 1HFYA 3WPLA 2DQGY 3AGGG 2HEFA 4DD7A 1E8LA 1GFHA 1LHMA 4NGZA 4ZEEA 3CT5A 1UACY 2MEHA 2PC2A 1GF7A 1DZBX 5LVHA 194LA 1VDQA 4A7DA 1HSXA 3OJPA 1WTMA 1GF8A 1HFXA 1FKVA 2B5ZA 2FYCA 1BWIA 5I4YA 2MEDA 2HEBA 1LHKA 1OUAA 5KXYA 3A91A 3P66A 5L9JA 1JUGA 2BQGA 1JTTL 2F4GA 4ETAA 1D6PA 3G3AB 2BPUA 1JJ1A 2BLYA 4ETEA 3WW6A 4DDBA 1QDTA 2Z38A 4H8ZA 1IY3A 1NQIA 3RT5X 1HC0A 3KAMA 2YDGA 4WM2A 3TXJA 1GFRA 3CSRA 2MEAA 1JSFA 4G4CA 3TXEA 4N9RA 1VDSA 3B0OA 4X3BA 1GB7A 1CNSA 2MECA 1A2YC 3G3BB 1B5XA 1D0KA 1LJIA 1T3PA 3A96A 3ZVQA 4H90A 5APDA 4PRUA 1UUZC 1LZYA 1D0LA 2ZWBA 4ZFPA 1UIBA 208LA 1J1OY 3IJUA 3WU9A 2BQNA 2ZQ4A 3CSZA 1QUSA 1HNLA 5LVGA 1GF3A 5C6IA 1DI5A 1LZRA 2BQDA 4WM5A 3WVXA 3WPKA 4XJDA 5A3ZA 1LZ9A 4NG8A 2DBTA 4B4JA 4WG7A 1FLUA 1I1ZA 3AB6A 1IR9A 5LAGA 4QDNA 2IFFY 4DD3A 5K7OA 1GB0A 4H92A 4QEQA 4UWNA 4WL7A 1H87A 1REXA 4W96A 3W6AA 4C3WA 5KXOA 5LIOA 4H9CA 1UIGA 1REZA 1YKZX 1LHJA 4N0JA 4ETDA 1CJ7A 1IOQA 2F2NA 1NKHA 3HBHA 2YSSC 4EMNA 4HV2A 3CQLA 4G9SA 1DPXA 154LA 193LA 4RW1A 5L3HA 4CHXA 3W3EA 5A3EA 3SP3A 1IWUA 4H9IA 1VATA 1ZMYL 1IWXA 3HFMY 4HV1A 3WL2A 1OUHA 1GAYA 3A34A 1BB4A 1F6RA 4H8XA 4XJHA 1LJKA 4BS7A 1AT5A 3FE0A 2HECA 4LFPA 2YBMA 1LYYA 2YBIA 4UWVA 3AW6A 3TXDA 4MSTA 4J7VA 1TAYA 1NF5A 3M3UA 3TMUA 3EMSA 3N9CA 3WU8A 4HSFA 4H8YA 2DQIY 1A4VA 4HPIA 4OWCA 4YM8A 3P65A 3RNXA 5E9RA 1GFJA 1LPIA 1GAZA 5HNLA 1IP7A 1JTPL 5B1GA 1WQQA 4RLMA 1IEEA 4NHIA 1LSEA 2GV0A 4NEBA 4WOAA 4XJFA 4BADA 2BQMA 4KXIA 3T6UA 1LYZA 6LYZA 2N5ZA 3D9AC 4LGKA 3WUNA 4AGAA 1GF5A 4G4HA 1IC5Y 4TSBA 1BWJA 1CJ9A 5LINA 4NIJA 1VAUA 3TXGA 1JITA 3P64A 4WG1A 3CB7A 1CJ8A 1NBZC 3A3RX 4NGVA 2BQAA 1GD6A 2CWIA 4B1AA 1V7TA 4OWHA 2A7FA 1UIEA 3WPJA 1FLYA 1GF9A 1O23A 1EQ5A 3AZ7A 3GXRA 5FDJA 3N9AA 1IIZA 4BAFA 1GB8A 1G7MC 1P2CC 5LXWA 2BAAA 1LSYA 1WQRA 1LYOA 1WQOA 1XGPC 2LYZA 3LN2A 5LAFA 132LA 1JTOL 4OOTA 1JHLA 1BVKC 1EQ4A 1WTNA 1B5WA 1B7QA 1WQMA 4NGJA 2MEEA 1LSGA 3LYZA 1JISA 3LZ2A 1YQVY 3W6EA 3B0KA 5KXMA 1QSAA 4E3UA 1IP2A 3LYOA 4B4IA 3A3QA 1NWGA 4LT0A 5ILFA 2HTXA 1GBSA 5C6JA 1LZAA 2BQHA 1IVMA 6LYTA 4IASA 1MELL 1GB2A 1LMTA 1QSWA 2ZQ3A 4N5RA 5HNCA 1B2KA 3WUMA 2HEDA 4Z3MA 1GFTA 2MEBA 1OUEA 4XADA 1KXWA 4GCFA 4NGLA 4H94A 4PRQA 4N1CC 1I20A 4TUNA 1YAMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FBDA 2ZIKA 1B7OA 1P3NA 4RDSA 4EOFA 4PJZA 1IO5A 1AKIA 4QGZA 3RZ4A 1G0MA 1VEDA 1L57A 4GBRB 4XJIA 1QQYA 3TMVA 1LMAA 1B7NA 3WXTA 1D3JA 3CDQA 125LA 1JQUA 249LA 5KXLA 1GB3A 1PS5A 1LOZA 151LA 2XQOA 5JENB 1OUIA 3HWLA 3GXKA 5KXTA 4WLDA 3WH1A 1C67A 3QY4A 4NSJA 224LA 1B9OA 1L69A 170LA 1ZV5L 2B6YA 3A67Y 4WO9A 1BHZA 1GFUA 1NDMC 4P2EA 4H9BA 5FCPA 1GFEA 3ULRA 1EPYA 4NSHA 3IWRA 1KIQC 3A90A 2L78A 196LA 1L27A 1P7SA 1C6TA 1LZTA 3L64A 1L45A 3GUKA 2F30A 1G1VA 2H9JA 1V7SA 4GCEA 5F9XA 1C10A 5F16A 1YKXX 220LA 207LA 4I7PA 1P5CA 5IDDA 205LA 4DD2A 2D91A 3ATNA 1D3FA 1JWRA 1ZVYB 233LA 2DQFC 4LT1A 2I6ZA 4HJZA 1GBOA 5KY1A 5DM9A 1W6ZA 3HT7A 4DQ5A 2OTZX 5B59A 1WQNA 2XBSA 3D4SA 2YVBA 1D3NA 157LA 1LZBA 1LSAA 1HMLA 3EXDA 1C6MA 1WTHA 2RB1X 1OUBA 1L94A 1OUCA 237LA 3E3DA 4TWSA 3B72A 3DN2A 181LA 1DQJC 3CDVA 1L50A 3LYMA 1BB6A 1IWWA 4I0CA 3BKHA 1LJ4A 126LA 1B7RA 3QAKA 1VFBC 4RLNA 1F0WA 4DD0A 1P6YA 156LA 4HJVA 4O34A 4OWEA 3PDSA 1BWHA 3LHMA 2LCBA 2CGIA 1DI4A 4I7QA 1C6FA 2MEGA 3DMZA 1HFZA 1QTDA 1L26A 3GUOA 107LA 2HUMA 1B7LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HSW A;  4OOO A;  1JKC A;  1UIC A;  2FBD A;  2BQC A;  1IOR A;  1D0M A;  1LZ5 A;  2ZIK A;  4AXT A;  1QUT A;  1B7O A;  1BB3 A;  2H9K A;  5B05 A;  1LSM A;  1JJ3 A;  2EQL A;  2W1M A;  4RDS A;  3CT0 A;  2MEI A;  2YBH A;  4EOF A;  1IO5 A;  1G7I C;  2XJW A;  1AKI A;  1JKB A;  3J4G A;  3K3T A;  4NGO A;  4QGZ A;  4WL6 A;  5B07 A;  3RZ4 A;  2F4A A;  4GN5 C;  4XEN A;  1CKC A;  1BB7 A;  1VED A;  4YEM A;  4M4O A;  2D4K A;  1HHL A;  4WMG A;  1XEI A;  2YBN A;  1F6S A;  1OQM A;  4XJI A;  1HEO A;  2DQH Y;  1QQY A;  1TDY A;  3WU7 A;  1XGU C;  2D6B A;  8LYZ A;  3TMV A;  1LMA A;  3W6B A;  1IWZ A;  1B7N A;  3WXT A;  7LYZ A;  1GFV A;  4G49 A;  3HBE X;  2AUB A;  4GCB A;  3OK0 A;  4DWX A;  1GB6 A;  5KXR A;  4II8 A;  4KL7 A;  4U3X B;  1YL1 X;  5KXL A;  1UBZ A;  1GB3 A;  1PS5 A;  1LOZ A;  1WVV A;  2CJL A;  5LVI A;  5JEN B;  1LHL A;  1OUI A;  5ILC A;  1UID A;  3GXK A;  4NHT A;  1B5Y A;  5KXT A;  1FLQ A;  5M1Y A;  1GFG A;  1XGT C;  1WQP A;  2A7D A;  2BQI A;  4WLD A;  3WH1 A;  1LSZ A;  4DD1 A;  1YAP A;  3QY4 A;  4NSJ A; 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 4HSF A;  4H8Y A;  2DQI Y;  1A4V A;  4HPI A;  4OWC A;  4YM8 A;  3P65 A;  3RNX A;  5E9R A;  1GFJ A;  1LPI A;  1GAZ A;  5HNL A;  1IP7 A;  1JTP L;  5B1G A;  1WQQ A;  4RLM A;  1IEE A;  4NHI A;  1LSE A;  2GV0 A;  4NEB A;  4WOA A;  4XJF A;  4BAD A;  2BQM A;  4KXI A;  3T6U A;  1LYZ A;  6LYZ A;  2N5Z A;  3D9A C;  4LGK A;  3WUN A;  4AGA A;  1GF5 A;  4G4H A;  1IC5 Y;  4TSB A;  1BWJ A;  1CJ9 A;  5LIN A;  4NIJ A;  1VAU A;  3TXG A;  1JIT A;  3P64 A;  4WG1 A;  3CB7 A;  1CJ8 A;  1NBZ C;  3A3R X;  4NGV A;  2BQA A;  1GD6 A;  2CWI A;  4B1A A;  1V7T A;  4OWH A;  2A7F A;  1UIE A;  3WPJ A;  1FLY A;  1GF9 A;  1O23 A;  1EQ5 A;  3AZ7 A;  3GXR A;  5FDJ A;  3N9A A;  1IIZ A;  4BAF A;  1GB8 A;  1G7M C;  1P2C C;  5LXW A;  2BAA A;  1LSY A;  1WQR A;  1LYO A;  1WQO A;  1XGP C;  2LYZ A;  3LN2 A;  5LAF A;  132L A;  1JTO L;  4OOT A;  1JHL A;  1BVK C;  1EQ4 A;  1WTN A;  1B5W A;  1B7Q A;  1WQM A;  4NGJ A;  2MEE A;  1LSG A;  3LYZ A;  1JIS A;  3LZ2 A;  1YQV Y;  3W6E A;  3B0K A;  5KXM A;  1QSA A;  4E3U A;  1IP2 A;  3LYO A;  4B4I A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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