5KN1A

Recombinant bovine skeletal calsequestrin, high-ca2+ form
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
346
structure length
346
Chain Sequence
LDFPEYDGVDRVVNVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMDELILELAAQVLEDKGVGFGMVDSEKDAAVAKKLGLTEEDSVYVFKGDEVIEYDGEFSADTLVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDDNKLIGYFKNKDSEHYKAYEDAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVSFVEAHKRSTLRKLKPESMYETWEDDLDGIHIVAFAEETDPDGYEFLETLKAVAQDNTDNPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFNIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of Post-Translational Modifications to Calsequestrins of Cardiac and Skeletal Muscle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calsequestrin
molecule tags Metal binding protein
source organism Bos taurus
total genus 102
structure length 346
sequence length 346
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn1A03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn1A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn1A02
5IOXA 4V2NA 5IM9A 4WF4A 4ECIA 1JHBA 2H1AA 1VF4A 3FR3A 1O7UA 2VCZA 4PQ1A 3GN3A 5A4UA 3TJJA 4OFTA 3JCML 2DBCA 5G30A 4EF0A 5HR3A 1WJKA 4OFNA 2TRCP 2H73A 3BCKA 4K7IA 2LRNA 5IIZA 3U5RE 4AJ8A 2LSTA 3WYWA 5DDLA 5F06A 2HZFA 4EE0A 4KSMA 1B4QA 5F07A 5JCUA 3U6VA 2H71A 3WGEA 1RQMA 1UVZA 2YNXA 2OADA 1WOUA 2VL9A 5GZZB 3UL3A 1EOHA 2BMXA 4ECJA 1THOA 3QFAC 4CW9A 1O81A 4L5LA 3M9JA 6GSWA 4LMWA 2K9FA 1TRWA 1I5GA 2I9HA 3KEBA 3A3TA 4Q5FA 3RPPA 2PU9C 1NHOA 2CVBA 4I97A 3GL3A 3UARA 2N5BA 2HZEA 1Z9HA 5C00A 3CRUA 3FRCA 3PH9A 4WR4A 1PX6A 1MD4A 5IMDA 2YWMA 3QMXA 3FR6A 3NOFA 5DAKA 2YN1A 3CTFA 3HVXA 2YP6A 5ECMB 1Z6MA 3IK7A 4GF0A 2H75A 5D73A 3HVSA 1KNGA 4GXZA 2J23A 4MZBA 3IV4A 2NVLA 3VURA 5E4WA 3FK8A 4V1Ag 3GH9A 2ON5A 4X1UA 3VPQA 2V2GA 5IO2A 3FZ4A 5FT3A 5HQPA 3HXSA 2HLSA 2C3QA 1HYUA 4KB3A 3EC3A 4TR1A 3EU4A 5F0GA 4MPGA 4E8HA 1ERVA 2XPDA 3O76A 3ZVJA 2JU5A 1A24A 5D9TA 2HFDA 2F8AA 4MJCA 2VM2A 4RQXA 1O85A 5FWGA 3A5WA 4FO5A 2GT6A 2MZCA 1VRSD 2C0DA 2FWHA 3QD9A 4IKHA 2H70A 4KDXA 2GQMA 2AB6A 1VF2A 2O85A 3KD0A 3D22A 2XBIA 1K3LA 2KP1A 1WIKA 3LYPA 2H8LA 2B5YA 2CX4A 3QAGA 4WBJA 4LLRA 2CV4A 1GSQA 2GSRA 3FKFA 1JLVA 1OC9A 1OE8A 1ZMAA 3G7YA 1BAYA 2IFQA 1GUKA 2R2JA 3ERFA 2ALBA 4XHMA 2L59A 1VF3A 2WFCA 2DJKA 5D93A 2IIYA 4G19A 2L6DA 2NPBA 3GRXA 1SL0B 5ID2A 3QCPA 2GQKA 1GSYA 4NHWA 5J9BA 3DWVA 1SU9A 4FYUA 1SJ6A 4LL4B 2MYGA 5DJMA 3TJKA 2LV3A 1N8JA 2L57A 5DALA 1FB0A 1EV4A 2XC2A 1VF1A 5EY6A 3A2VA 3ZREA 1YZXA 2LJAA 2O89A 5D9XA 2ZUPA 3C1SA 3WGXA 3MWHA 4YQMA 2KLXA 4CDOA 2IMDA 2HZEB 5DJLA 1AUCA 3VPTA 1NSWA 1O6JA 2OE3A 2E2MA 4Q5QA 2ES7A 1K3YA 3F8UA 3DGQA 2R5GA 1YDKA 1Z3EA 4HEA2 4YAPA 2ZNMA 3VWUA 2GSSA 3ME8A 4K1FA 3VLNA 4EL1A 5J41A 3FEUA 5F05A 1K0OA 4MDCA 4QL7A 1PA3A 2LQQA 3FY7A 6GSYA 4ISDA 3HJOA 1T4YA 1W4VA 3D4TA 11GSA 1B9YC 1A2JA 1U3IA 4TR1B 4K8MA 5ECIB 1DE1A 12GSA 5J9CA 3C73A 4KA0A 2DJJA 5B8BA 4NPBA 1G6YA 1EOGA 5ELAA 2N5AA 3LXZA 2F8FA 3ZL5A 2DJ2A 4RUVA 3EWLA 3LEFA 1SENA 3P90A 5CREA 3O3TA 5FHIA 3VI5A 4TXVA 4ULXA 1B4PA 1FOVA 1TW9A 3RDWA 3UAPA 2O87A 3TRPA 3UVHA 1GWCA 4YQVA 3GSTA 3KCMA 2H72A 3CSIA 4OFMA 3KJYA 4ZBAA 3RAZA 2CAQA 3PGTA 1OAZA 4XS6A 1OC9B 2B6MA 1OKDA 2IFQB 3ERGA 1M9BA 2DMMA 1M7TA 1AIUA 4KE3A 4JE1A 1F37A 1PMTA 2NBSA 3L9VA 2FY6A 5F8BA 1LJRA 5AIVA 2HT9A 5CNWA 3NIVA 3VWVA 5ID2B 3APQA 2RUFA 3KH9A 5ECSA 3Q19A 4IJ3A 1BX9A 2LNSA 1TU7A 2D2ZA 3HA9A 2CZ2A 2IL3A 1ZOFA 4GSTA 1QGVA 1SK2A 3BD2A 5DALB 5ENUA 1BQ7A 3F63A 3LORA 5IMVA 4TRXA 2AJQB 4ID0A 2GZZA 3TGZA 4PURA 4IW9A 5ECHB 6GSXA 1RK4A 4IS0A 1YF1A 2PGTA 4PQIA 3TCOA 1A0FA 3F4TA 2VUPA 4N0ZA 5J3RA 4IVFA 2F9SA 2P5QA 4ZB8A 5DCGA 1TKDB 1QFNA 1FB6A 1ML6A 1Q98A 3N5OA 3K8NA 3IHQA 3TKSA 1JLWA 1SJZA 3EE2A 1FVJA 2VL2A 2OBIA 1M2DA 2IWTA 2NDOA 5JCGA 1K3OA 1PGTA 2MMZA 1DBYA 3GKNA 4KGIA 4MF7A 3APSA 3VI7A 4OWYA 3GURA 1S3CA 1XW5A 5ABRA 1F2EA 3HVVA 1A2MA 2H19A 2G2QA 3H1NA 4AJ6A 4MLYA 1RW1A 4WR5A 4MMMA 2EIQA 3J7Yb 2R4VA 1Q4JA 3BOAA 1TI3A 3I69A 1K0MA 1FAAA 4FH8A 5KN1A 2IN3A 5ECPB 3EVIA 2PERA 3CYNA 1WPIA 3ERWA 1MDJA 3RHCA 2H0IA 3US3A 3ZIVA 4BL7A 1ERWA 4BPYA 3C1RA 1XWBA 9GSSA 4HI7A 1A8LA 2MMAA 3WD6A 4BWQA 3UIWA 4EUYA 1JZDA 4MJEA 5G5FA 2REMA 2K8VA 2R6KA 1YKCA 1ON4A 2RIIA 1ZGNA 1IYIA 3M3MA 4I5QA 2KOKA 1EGRA 3DVXA 1SKWB 4HJMA 4EO3A 2YCDA 1V2AA 5B7CA 4POKA 5KN2A 4YQUA 2OACA 2VD0A 1ERTA 2WJUA 2H01A 1GSUA 5DVBA 2H76A 4DSSA 4EDYA 1USBA 2FCHA 4K7NA 4IBPA 1X9MB 1J9BA 3ISOA 3HZ4A 3DMLA 4AF2A 1T8EB 3P7XA 1K0CA 1AQWA 3W8SA 2LKUA 4OMVA 3GH6A 4NV2A 3ME7A 1GH2A 4TR4A 2L5OA 1ZYQB 3OR5A 22GSA 1V40A 5INYA 2H6YA 3HKRA 3M1GA 1WP0A 4BVXA 1TK0B 1EEJA 1TRSA 2GSTA 5HFIA 2VCVA 4L8EA 1S3DA 2L6CA 2LUSA 2WRTA 4XRAA 3LWAA 2VO4A 2V41A 1YJ6A 1XXUA 4X43A 4KSOA 2VCQA 1Z7RA 1O8XA 2FA4A 4GQFA 1ABAA 1YY7A 1XWCA 3M8NA 3KP9A 1TP9A 3F0IA 1QXHA 2QKEA 1SYXA 3M9KA 1GUHA 3HZ8A 3TOUA 5H5SA 5EPFA 5AGYA 3MAKA 3P8WA 1PKZA 2H6ZA 4YH2A 4Z7XA 1GNEA 2PPTA 1T1VA 4N11A 2KP2A 2N5FA 4ZB9A 4MH3A 1XW9A 1EGOA 1ZCPA 1YQ1A 4ECBA 3I9V2 2LJRA 2LRCA 4DVCA 2YJ7A 2H1BA 4HUAA 1G7OA 1OC3A 4KUNA 4IQAA 3GUSA 1SD9A 4MJBA 4O32A 4MJAA 3F6DA 4EC0A 1FO5A 3GHAA 3EMXA 2PBJA 2WZ9A 2WCIA 4PQHA 1T3BA 1JZOA 4O7HA 1JZRA 4J2FA 1AAZA 1U88A 5EVOA 2XHFA 1SJIA 1THXA 3E9JB 18GSA 4L0UA 3RPNA 2IMIA 1K0BA 4MK3A 3RBTA 3EMPA 5LCZA 3LJRA 3IC4A 3FZAA 1GSSA 4ZXGA 4DEJA 1QQ2A 3HDCA 3QFBC 2C3NA 1ACVA 2CA8A 1M2AA 4KDYA 2P0GA 1JFUA 1TJDA 1U3AA 5G5EA 1JZWA 4IQ1A 1GTIA 4POBA 1GRXA 4DSSB 1M9AA 4F9ZA 3C71A 5DCHA 2FA8A 4GLTA 1MEKA 4EDZA 5CRWA 1N2AA 1OKTA 1X5CA 2C4JA 2C80A 2H66A 2LNTA 2X8CA 2PVOC 1E6BA 2HRNA 3TDGA 2R37A 1FW1A 4XS4A 3LG6A 4PUAA 1F3AA 4MZWA 1PSQA 3RHBA 1EZKA 3ZIJA 2OJLA 3V1WA 1X9WB 4OCFA 2GVPA 2YJHA 3LGCA 3Q6OA 4HJ2A 2X99A 1W89A 4OO5A 3FR9A 4MF6A 2B5XA 4K2DA 1B8XA 1TI1A 5ECRB 2M80A 3CXGA 4GQCA 4GSSA 5E59A 4I8BA 4WETA 1DE2A 5IMCA 5GSTA 3G9BA 6GSSA 19GSA 4TVEA 1X9SB 2AAWA 3D5JA 4PGTA 5AIXA 2FGXA 1H4OA 1GL8A 1F3BA 5LD0A 2WGRA 3ZLPA 1SKRB 5B8AA 16GSA 4KX4A 2YWNA 3IPZA 4XRDA 2XPEA 1BEDA 1TXXA 17GSA 2LS5A 1AXDA 3Q74A 1ILOA 4EVMA 3FHKA 3ZFLA 2GTUA 4O92A 3MDKA 4IP1A 2E7PA 3TUEA 4RQRA 2B1LA 1BYEA 4ZBDA 1VGLA 4I2TA 2JZSA 2IJYA 2BTOT 3CMIA 5COHA 3GIXA 2IMEA 2HE3A 1PX7A 1HD2A 1XIYA 4NMUA 4GTUA 2I81A 3TJGA 3TJBA 8GSSA 4G10A 1A23A 3KXOA 3D0ZA 3TKSE 2JACA 1PL2A 4KDUA 10GSA 1HNAA 4L5OA 3TKPA 1GSDA 2DIYA 7GSSA 3M0FA 1DUGA 1V57A 4E8EA 1G0TA 3F9UA 4F82A 2AHEA 1A0RP 4FYBA 13GSA 1TDIA 4ML1A 1OYJA 3C7MA 5AISA 2MMOA 1TK5B 4Q5NA 5ECKB 1X5DA 1B9XC 3S9FA 3UOMA 5IOWA 3GSSA 3QR6A 4LL1B 1MTCA 2KHPA 2M72A 2V6KA 1G7EA 3UJ1A 4HQZA 5EL8A 5G1KA 5CYYA 2P5RA 1J0FA 4XTSA 4G9HA 1WRYA 3QAWA 4LA1A 1LBKA 2E0QA 5G31A 1Z5YE 2L4QA 2LRTA 2XBQA 2FNOA 3HCZA 1UC7A 3IAM2 3DYRA 4WKWA 4XS4B 5GAND 1SL2B 1F6MC 4KCEA 1NHYA 5ELGA 2WB9A 4F0CA 4NV5A 5CO3A 2Z9SA 1UN2A 5L71A 3UBLA 4RI6A 4ZL7A 3ZITA 3ZMKA 5HFKA 3G7IA 4LMVA 2H1DA 3VWXA 3L4NA 5ECOB 1K0NA 1MDIA 4WBRD 2CVKA 2LTKA 2IMFA 3GMFA 1CQGA 6GSVA 4DSRA 3DKSA 2KUCA 4XS1A 5J5NA 2YZUA 20GSA 3IE3A 4ZB6A 1YEXA 3F4SA 3KH7A 2HI7A 2GQLA 3IXRA 2OBKA 1GTAA 1OVNA 4TXOA 2C0GA 3LYKA 5IMAA 1DSBA 3TKRA 4N10A 2DLXA 1BJXA 2FWGA 3HJMA 1EP8A 4POLA 2O7KA 2BJXA 3E0UA 5JCWA 2CQ9A 2MMNA 1WWJA 4K9ZA 4KW6A 5JWRB 3TB2A 5HR2A 5CRGA 3CSJA 1T00A 2VAFA 4JRRA 4ZL9A 1HNBA 5HR0A 1TK8B 1YEPA 2EIOA 3APOA 1AQVA 1PKWA 4HOJA 4HZ2A 2NTOA 3WT2A 5IO0A 2VD1A 2GS3A 5CRDA 5IPHA 1SL1B 1EP7A 2H30A 3F3RA 2VL3A 2GLRA 2PWJA 1XFLA 4K0NA 1FG4A 4HU9A 2WDUA 3TJFA 1IYHA 3IAS2 3KGKA 3DXBA 2RLIA 4FIWA 2RM6A 2QSIA 4Q5RA 2YOIA 3LXTA 2YPMA 4OO4A 3DVWA 4TN8A 3O6TA 1T7PB 1SKSB 4WEYA 4D73A 3A2WA 4J56E 1ZZYA 2VLVA 4O5RA 1OE7A 4NXIA 2DJ0A 4K6XA 3GL5A 2K8SA 1PN9A 4P3YB 3BCIA 5IQYA 3P2AA 2V32A 4HS1A 5IMZA 1MD3A 2HNLA 1QMVA 4FYCA 3C8EA 1GTUA 3ED3A 3PR8A 3GFKA 2I4AA 3L78A 3IBHA 3TKSC 1AQXA 1GULA 2PUKC 2GDRA 2VL2C 2LEGA 5D96A 4TR3A 4OCEA 1YF0A 1XCCA 5JWQB 4MZCA 3GKXA 3W6GA 1URMA 2YWIA 3I6AA 4JR4A 3NZNA 1U6TA 1AC1A 3TOTA 5IMFA 2JADA 5GSSA 3EURA 2C1YA 3KTBA 5KN3A 1XZOA 3ZFBA 2ON7A 3A2XA 2YZHA 3GX0A 2IMKA 3KM6A 1S3AA 2VCWA 2K18A 3ZMLA 3L0HA 4KH7A 1SYRA 2CAIA 3FW2A 3CSHA 3QPMA 4MA9A 3HHVA 3H79A 5HFGA 4TXOB 2OE1A 2JZRA 4CHSA 4ZIJA 3DRNA 4AGSA 4BA7A 3LFLA 2FHEA 3UVTA 4V2MA 3ZRDA 3IA1A 1K0AA 4POMA 2V6OA 4GRFA 2C0FA 4ECCA 4XCSA 1SK0A 5G1LA 2HYXA 2X64A 2GSQA 3IOSA 3L9SA 5D9VA 1J08A 6GSUA 1R5PA 3VK9A 5A4WA 1M99A 2I3YA 3F4RA 2DSAA 4TR0A 4ZILA 2OKAA 2CVDA 4OD7A 4TKYA 2A2RA 1TRVA 3G7JA 3FZ5A 4IJIA 1GNWA 1T4ZA 4WXTA 5H5RA 3HY2A 2F51A 4KAEA 2AUVA 2B3SA 1KTEA 2H0GA 4RI7A 2GGTA 4N0VA 1XWGA 2VOCA 2JSYA 1SD8A 1Z6NA 3CBUA 1GSEA 4X0XA 2GT5A 2H6XA 4QQ7A 4D73B 5IPGA 3SBCA 1TRUA 4TW5A 4WF5A 3I43A 5CRHA 2EC4A 3UEMA 1XBSA 1EWXA 3ZVJD 3IDVA 3Q18A 1QK8A 4EXJA 4MH2A 1R26A 4IGJA 1PL1A 2B7JA 4PUFC 4MP4A 3KTLA 1O73A 2VIMA 3KMNA 3VFIA 1KEBA 1GTBA 3QAVA 4IN0A 4NAXA 1K0DA 3FYGA 4ZBBA 1ZL9A 3ZYWA 4KCAA 1YKAA 3GTUA 1TTZA 2L4CA 1FVKA 1MDKA 1XWAA 2TIRA 4ZL8A 2JL4A 3GA4A 3KZQA 2JZTA 2E2GA 3WGDA 4N30A 3UBKA 3EYTA 1GSFA 5ECQB 2FLSA 1QUWA 4BWSA 2FWFA 2DIZA 3HYPA 5ECNB 1A8YA 4QL9A 2LJKA 2HXKA 4TOPA 4IELA 4V2LA 4HU7A 2DMLA 5KN0A 3LQ7A 2ZCTA 2X8GA 2CX3A 3L9UA 5JWOB 1GLQA 4JR6A 5DQSA 5J4UA 2LQOA 3KIJA 1NW2A 3EINA 4HDEA 5D8IA 1OC8A 2FD3A 5DAKB 4GCIA 1GUMA 2FWEA 2X8HA 2F3MA 1XOBA 4XIHA 2CZ3A 1LU4A 2GZPA 2H1GA 3EU3A 2C8UA 3GX8A 2B5EA 1XVWA 2YV7A 3LSZA 1V9WA 2PN8A 3W8JA 4MCUA 4MF5A 3F6FA 2MBTA 5B6NA 1SK1A 1X5EA 1TU8A 2C0EA 1PQNA 3GNJA 3TRXA 4JBBA 5KEJA 2A4VA 2VLTA 1GP1A 3H4KA 2DJ1A 2H74A 2L5LA 3H93A 1U87A 1XOAA 2EIRA 2K6VA 3ZZXA 2VM1A 2YV9A 3ZTLA 3D4MA 2JSZA 3FZ9A 2RUEA 2RM5A 3J7Yk 3R2QA 4GWRA 4KNDA 5DBQA 3UMAA 2DC5A 3BJ5A 3DEXA 4JEDA 4L0WA 1I9DA 2WS2A 3CRTA 5AN1A 4BVYA 1G6WA 1A2LA 2M46A 2WULA 2QC7A 2G0FA 3GYKA 1PD21 4G2EA 5A5KA 2HSHA 4NWYA 2IPAA 4HZ4A 3GKKA 4MPFA 3CTGA 4GSNA 2V1MA 3QDNA 5DQYA 3MNGA 3KMOA 4ACSA 4ML6A 1EEMA 2AYTA 3SWLA 1H75A 5H5QA 2P31A 2GZYA 1ST9A 3HD5A 2DJ3A 5D9WA 5B6MA 3GTUB 4DSQA 2OE0A 1ERUA 2J9HA 6GSTA 2CT6A 5A4VA 1WE0A 3BBYA 1R4WA 1AW9A 1XW6A 2YANA 1HQOA 1KBNA 4H86A 5GAPD 2H0HA 2I1UA 1M2BA 3DD3A 4HQSA 2HSYA 3AY8A 3QOUA 2B7KA 1X0RA 3IRAA 3VWWA 2PMTA 1E2YA 1BG5A 1C72A 5G2ZA 1PRXA 4F0BA 3D6IA 2VCXA 4PNFA 4IHUA 1FHEA 3PINA 1R7HA 4IP6A 3GKMA 1XPVA 5ECLB 3H8QA 1UA5A 2B1KA 2R3XA 2TRXA 1Z7PA 2VLUA 4PX1A 2MBSA 2HRFA 5C04A 1XVQA 1B48A 1HNCA 2C3TA 3N9JA 2YWOA 4J57E 4F03A 4EKZA 3DIEA 3E3EA 3IR4A 4JU5A 5LNKe 1GLPA 3TKQA 1TOFA 3IK9A 1M0UA 1O8WA 3HJPA 2PVQA 2O8VB 4JZQA 2AV4A 2FUG2 1WMJA 2OA7A 4AJ7A 4YAVA 5HR1A 3GV1A 1R5AA 3KP8A 1Y25A 4F2IA 4K7OA 5CAXA 4I6XA 2A2SA 3F3QA 4K0GA 1Y6EA 1EV9A 1NM3A 3D21A 4NHZA 1CQHA 1XWKA 4I2UA 2VCTA 5CP1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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