5KTWA

Crebbp bromodomain in complex with cpd 44 (3-((5-acetyl-1-(cyclopropylmethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1h-pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl)amino)-n-isopropylbenzamide)
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
AAFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQAL
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Discovery of a Potent and Selective in Vivo Probe (GNE-272) for the Bromodomains of CBP/EP300.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CREB-binding protein
total genus 37
structure length 114
sequence length 114
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2016-07-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5ktwA00
4YBMA 5AMEA 5DBMA 5KTWA 3SVHA 5HQ5A 4LZSA 5CQTA 4UYHA 5DY7A 1WUGA 4BW3A 1F68A 3MQMA 5CUGA 5I40A 4PY6A 4YH4A 4UYGA 4J0SA 4IR6A 5D3LA 4O78A 4QUTA 5ENCA 4Z1SA 5LKTA 5C85A 3NXBA 4HBVA 3HMFA 4QUUA 5G4RA 2YELA 3U5LA 4MR4A 5FB1A 4WHWA 4DONA 4LRGA 2YQDA 2WP1A 4XUBA 3AQAA 5IGLA 5FFVA 5D3JA 3HMHA 3MB3A 4YADA 4LDFA 4WHUA 5ACYA 4QR3A 4BW2A 4TT4A 4O77A 5H85A 4HXPA 4QC3A 4UYDA 3U5OA 2RI7A 5F36A 4J1PA 4HXMA 4O71A 5C87A 4O74A 2L84A 4YYDA 4UIUA 5I80A 4UIVA 4OGIA 5DYAA 5F3AA 4YYKA 5FG4A 4BHWA 3JVLA 5BT3A 4Z6IA 4NR9A 3P1CA 2L85A 5FBXA 5HQ7A 4UIWA 5II1A 4LC2A 5IG6A 4LYWA 4QSVA 5EISA 4QYDA 4XY8A 3DAIA 2R0SA 4NRBA 5I88A 4UYFA 2LSPB 4QSTA 2NXBA 3SVGA 2DVSA 4YAXA 5A5RA 5TB6A 4NS5A 2I7KA 4N4HA 5A5QA 5EWHA 4QZSA 4Y03A 5FE6A 4HXSA 4QSPA 4KV1A 4IR3A 4A9KA 4TU6A 4QB3A 5FE9A 5D26A 4UITA 4QC1A 5EQ1A 5CRMA 2YDWA 4ALGA 3HMEA 3P1DA 5I7XA 2RO1A 3UV2A 5FFWA 5I83A 5D3HA 4CURA 4NQNA 2N9GA 5CPEA 4FLPA 4O7EA 5H1UA 5LJ1A 2F6NA 5BT4A 5KTUA 5E9LA 5E7DA 4CFLA 5A85A 5E73A 2R0YA 5FE7A 4NR7A 5D24A 4YYIA 5EPBA 4UYEA 4TQNA 4IOQA 3LQJA 3O37A 5DLZA 5I89A 4HXKA 5D3SA 4CUTA 1JSPB 2RNXA 4NR5A 4A9EA 4OGJA 5CTLA 5HCLA 4LYIA 5F25A 4N3WA 4TZ8A 5F2PA 4YATA 3IU5A 2YYNA 4ZQLA 3UVWA 4YY6A 4YBSA 5D3TA 4UIYA 5E9MA 5EA1A 4YABA 5HFQA 2E7NA 4PCEA 5C4QA 5CS8A 3FKMX 5BT5A 5DKDA 5FB0A 5A81A 5E9KA 5A5OA 2I8NA 5DW2A 2RFJA 5FFYA 4QR4A 1JM4B 4NUDA 4IR4A 5D7XA 4A9HA 5KTXA 5EWCA 2YW5A 5CRZA 5FE5A 4O7CA 3G0JA 5JWMA 5F61A 5FE2A 4NR4A 2R0VA 5LUUA 3UW9A 5IGMA 4MEPA 5L8TA 5EPSA 5HFRA 5D0CA 5E3DA 4UIXA 3LJWA 5A7CA 4YBTA 5COIA 4F3IA 4NYVA 5E0RA 5HEMA 5EICA 4HBYA 5KHMA 2DKWA 5FH8A 4MEQA 5CQ3A 4NQMA 4E96A 5ETBA 3SVFA 2G4AA 5DFDA 4C67A 5ENJA 3G0LA 5DFCA 4QSXA 5EWVA 1X0JA 5F5ZA 3JVKA 3TLPA 4YH3A 4QYLA 4NRCA 5EI4A 5D3RA 4YYNA 4HXNA 5CP5A 4A9MA 4QSUA 5LJ2A 3P1EA 5LKZA 1E6IA 1EQFA 4QEWA 2KTBB 5E9VA 2D82A 4N4IA 4O72A 4ZC9A 5LKXA 5LVRA 5E9IA 5EWDA 4XUAA 4IOOA 5HRWA 4QSSA 5I86A 5FE8A 4NR8A 3AADA 5C89A 4YYJA 4TS8A 3LXJA 4O75A 4YYHA 4HXLA 5EU1A 2R10A 5DW1A 2RNWA 5EV9A 4QR5A 4TT2A 1ZS5A 4TTEA 4CUUA 2GRCA 2OUOA 4NYXA 4NRAA 2YEMA 4PCIA 5D3PA 5A5NA 5IGNA 5DFBA 3O34A 2DVVA 3QZTA 5FDZA 5KO4A 5FG6A 2E7OA 4N4FA 5I29A 3GG3A 5A82A 4MENA 2D9EA 3Q2FA 4LZ2A 5CZGA 3QZSA 5I1QA 3MULA 4Z6HA 4QBMA 3LQIA 5FE0A 4UIZA 5DLXA 4PTBA 4MR5A 5DYXA 5CQ6A 5FE4A 3MXFA 3O36A 5CQ5A 3UVDA 5HQ6A 5E3GA 4IR5A 4A9IA 5E74A 5A5PA 4QNSA 4Q0OA 5DYUA 4HXOA 4QY4A 3D7CA 2DWWA 4Q0NA 5EGUA 5HJCA 4J0RA 3UV4A 2WP2A 4PS5A 3ONIA 5E9YA 5CGPA 4LR6A 2L5EA 5CQ4A 1WUMA 5F63A 4J3IA 2H60A 3O35A 3U5JA 4NUEA 4PKLA 4CUSA 5C8GA 5K29A 5ENFA 4BJXA 5AD2A 3DWYA 5FH7A 4X2IA 3U5NA 5L99A 4HBXA 4O7FA 4HBWA 5L97A 5ENEA 5CUAA 5CUDA 5HM0A 4ZW1A 5F1HA 5HLSA 4RVRA 4KV4A 4Z93A 5L98A 5HENA 2OSSA 3JVJA 5EK9A 5F60A 5ENGA 3UVYA 2DVQA 4LZRA 4UYFB 5CQ8A 4CUPA 5LKUA 3LQHA 2FSAA 2DATA 5CQ7A 3JVMA 5EP7A 3RCWA 5L96A 3U5PA 5D3NA 4MR3A 4N4GA 5LJ0A 5EPRA 5I7YA 5JI8A 5CU8A 4QEUA 4CLBA 5F62A 5FE1A 5CFWA 4BW4A 4XY9A 4GPJA 5II2A 4AKNA 4TT6A 3P5OA 3QZVA 5ENHA 5J0DA 3UV5A 5DKCA 5FH6A 3UVXA 2DVRA 5CUCA 4YYGA 5G4SA 3MUKA 3O33A 5TCMA 4YC9A 4IORA 5A5SA 5AD3A 4TYLA 4QSRA 4TZ2A 1N72A 3IU6A 4HXRA 5KU3A 5IGKA 5ETDA 5CY9A 2YEKA 4WIVA 4C66A 4Z1QA 5EM3A 4ALHA 5IIDA 5L8UA 3I3JA 4O70A 4NUCA 4QSQA 5H1VA 3P1FA 5ENBA 5EWWA 4O7AA 3S92A 2RNYA 5IBNA 5D25A 2OO1A 5HRVA 5C7NA 5DYCA 5EVAA 3U5MA 4TU4A 3MB4A 5CUBA 5CQAA 4O7BA 4YY4A 5HRXA 4QSWA 2MJVB 4A9LA 4CUQA 3S91A 4MEOA 2RS9B 4XYAA 4LYSA 4BW1A 3K2JA 5A83A 4QEVA 2E3KA 3Q2EA 4MR6A 3ZYUA 4NYWA 5FE3A 4CFKA 5LVQA 4YK0A 4KCXA 4NXJA 4A9FA 4A9OA 5AMFA 4NR6A 5DKHA 3U5KA 4YYMA 5HELA 4A9JA 4CL9A 5F1LA 5ENIA 4A9NA 5H1TA 4OUFA 5CUEA 4O76A 5FG5A 2F6JA 5DX4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YBMA 5AMEA 5DBMA 5KTWA 3SVHA 5HQ5A 4LZSA 5CQTA 4UYHA 5DY7A 1WUGA 4BW3A 1F68A 3MQMA 5CUGA 5I40A 4PY6A 4YH4A 4UYGA 4J0SA 4IR6A 5D3LA 4O78A 4QUTA 5ENCA 4Z1SA 5LKTA 5C85A 3NXBA 4HBVA 3HMFA 4QUUA 5G4RA 2YELA 3U5LA 4MR4A 5FB1A 4WHWA 4DONA 4LRGA 2YQDA 2WP1A 4XUBA 3AQAA 5IGLA 5FFVA 5D3JA 3HMHA 3MB3A 4YADA 4LDFA 4WHUA 5ACYA 4QR3A 4BW2A 4TT4A 4O77A 5H85A 4AKIA 4HXPA 4QC3A 4UYDA 3U5OA 3D1BA 2RI7A 5F36A 4J1PA 4HXMA 4O71A 5C87A 4O74A 2L84A 4YYDA 4UIUA 5I80A 4UIVA 4OGIA 5DYAA 3D1DA 5F3AA 4YYKA 5FG4A 4BHWA 3JVLA 5BT3A 4Z6IA 4NR9A 3P1CA 2L85A 5FBXA 5HQ7A 4UIWA 5II1A 4LC2A 5IG6A 4LYWA 4QSVA 5EISA 4QYDA 4XY8A 3DAIA 2R0SA 4NRBA 5I88A 4UYFA 2LSPB 4QSTA 2NXBA 3SVGA 2DVSA 4YAXA 5A5RA 5TB6A 4NS5A 2I7KA 4N4HA 5A5QA 5EWHA 4QZSA 4Y03A 5FE6A 4HXSA 4QSPA 4KV1A 4IR3A 4A9KA 4TU6A 4QB3A 5FE9A 5D26A 4UITA 4QC1A 5EQ1A 5CRMA 2YDWA 4ALGA 3HMEA 3P1DA 5I7XA 2RO1A 3UV2A 5FFWA 5I83A 5D3HA 4CURA 4NQNA 2N9GA 5CPEA 4FLPA 4O7EA 5H1UA 5LJ1A 2F6NA 5BT4A 5KTUA 5E9LA 5E7DA 4CFLA 5A85A 5E73A 2R0YA 5FE7A 4NR7A 5D24A 4YYIA 5EPBA 4UYEA 4TQNA 4IOQA 3LQJA 3O37A 5DLZA 5I89A 4HXKA 5D3SA 4CUTA 1JSPB 2RNXA 4NR5A 4A9EA 4AKGA 4OGJA 5CTLA 5HCLA 4LYIA 5F25A 4N3WA 4TZ8A 5F2PA 4YATA 3IU5A 2YYNA 4ZQLA 3UVWA 4YY6A 4YBSA 5D3TA 4UIYA 5E9MA 5EA1A 4YABA 1ZKRA 5HFQA 2E7NA 4PCEA 5C4QA 5CS8A 3FKMX 5BT5A 5DKDA 5FB0A 5A81A 4AKHA 5E9KA 5A5OA 2I8NA 5DW2A 2RFJA 5FFYA 4QR4A 1JM4B 4NUDA 4IR4A 5D7XA 4A9HA 5KTXA 5EWCA 2YW5A 5CRZA 5FE5A 4O7CA 3G0JA 5JWMA 5F61A 5FE2A 4NR4A 2R0VA 5LUUA 3UW9A 5IGMA 4MEPA 5L8TA 5EPSA 5HFRA 5D0CA 5E3DA 4UIXA 3LJWA 3VKHA 5A7CA 4YBTA 5COIA 4F3IA 4NYVA 5E0RA 5HEMA 5EICA 4HBYA 5KHMA 2DKWA 5FH8A 4MEQA 5CQ3A 4NQMA 4E96A 5ETBA 3SVFA 2G4AA 5DFDA 4C67A 5ENJA 3G0LA 5DFCA 4QSXA 5EWVA 1X0JA 5F5ZA 3JVKA 3TLPA 4YH3A 4QYLA 4NRCA 5EI4A 5D3RA 4YYNA 4HXNA 5CP5A 4A9MA 4QSUA 5LJ2A 3P1EA 5LKZA 1E6IA 1EQFA 4QEWA 2KTBB 5E9VA 2D82A 4N4IA 4O72A 4ZC9A 5LKXA 5LVRA 5E9IA 5EWDA 4XUAA 4IOOA 5HRWA 4QSSA 5I86A 5FE8A 1PUOA 3AADA 4NR8A 5C89A 4YYJA 4TS8A 3LXJA 4O75A 4YYHA 4HXLA 5EU1A 2R10A 5DW1A 2RNWA 5EV9A 4QR5A 4TT2A 1ZS5A 4TTEA 4CUUA 2GRCA 2OUOA 4NYXA 4NRAA 2YEMA 4PCIA 5D3PA 5A5NA 5IGNA 5DFBA 3O34A 2DVVA 3QZTA 5FDZA 5KO4A 5FG6A 2E7OA 4N4FA 5I29A 3GG3A 5A82A 4MENA 2D9EA 3Q2FA 4LZ2A 5CZGA 3QZSA 5I1QA 3MULA 4Z6HA 4QBMA 3LQIA 5FE0A 4UIZA 5DLXA 4PTBA 4MR5A 5DYXA 5CQ6A 5FE4A 3MXFA 3O36A 5CQ5A 3UVDA 5HQ6A 5E3GA 4IR5A 4A9IA 5E74A 5A5PA 4QNSA 4Q0OA 5DYUA 4HXOA 4QY4A 3D7CA 2DWWA 4Q0NA 5EGUA 5HJCA 4J0RA 2EJNA 3UV4A 2WP2A 4PS5A 3ONIA 5E9YA 5CGPA 4LR6A 2L5EA 5CQ4A 1WUMA 5F63A 4J3IA 2H60A 3O35A 3U5JA 4NUEA 4PKLA 4CUSA 5C8GA 5K29A 5ENFA 4BJXA 5AD2A 3DWYA 5FH7A 4X2IA 3U5NA 5L99A 4HBXA 4O7FA 4HBWA 5L97A 5ENEA 5CUAA 5CUDA 5HM0A 4ZW1A 5F1HA 3VKGA 5HLSA 4RVRA 4KV4A 4Z93A 5L98A 5HENA 2OSSA 3JVJA 5EK9A 5F60A 5ENGA 3UVYA 2DVQA 4LZRA 4UYFB 5CQ8A 4CUPA 5LKUA 3LQHA 2FSAA 2DATA 5CQ7A 3JVMA 5EP7A 3RCWA 5L96A 3U5PA 5D3NA 4MR3A 4N4GA 5LJ0A 5EPRA 5I7YA 5JI8A 5CU8A 4QEUA 4CLBA 5F62A 5FE1A 5CFWA 4BW4A 4XY9A 4GPJA 5II2A 4AKNA 4TT6A 3P5OA 3QZVA 5ENHA 5J0DA 3UV5A 5DKCA 5FH6A 3UVXA 2DVRA 5CUCA 4YYGA 5G4SA 3MUKA 3O33A 5TCMA 4YC9A 4IORA 5A5SA 5AD3A 4TYLA 4QSRA 4TZ2A 1N72A 3IU6A 4HXRA 5KU3A 5IGKA 5ETDA 5CY9A 2YEKA 4WIVA 4C66A 4Z1QA 5EM3A 4ALHA 5IIDA 5L8UA 3I3JA 4O70A 4NUCA 4QSQA 5H1VA 3P1FA 5ENBA 5EWWA 4O7AA 3S92A 2RNYA 5IBNA 3ERRA 5D25A 2OO1A 5HRVA 5C7NA 5DYCA 5EVAA 3U5MA 4TU4A 3MB4A 5CUBA 5CQAA 4O7BA 4YY4A 5HRXA 4QSWA 2MJVB 4A9LA 4CUQA 3S91A 4MEOA 2RS9B 4XYAA 4LYSA 4BW1A 3K2JA 5A83A 4QEVA 2E3KA 3Q2EA 4MR6A 3ZYUA 4NYWA 5FE3A 4CFKA 5LVQA 4YK0A 4KCXA 4NXJA 4A9FA 4A9OA 5AMFA 4NR6A 5DKHA 3U5KA 4YYMA 5HELA 4A9JA 4CL9A 5F1LA 5ENIA 4A9NA 5H1TA 4OUFA 5CUEA 4O76A 4AI6A 5FG5A 2F6JA 5DX4A
chains in the Genus database with same CATH topology
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