5KU3A

Brd4 bromodomain in complex with cpd59 ((s)-1-(3-((2-fluoro-4-(1-methyl-1h-pyrazol-4-yl)phenyl)amino)-1-(tetrahydrofuran-3-yl)-6,7-dihydro-1h-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5(4h)-yl)ethanone)
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
b'STNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery of a Potent and Selective in Vivo Probe (GNE-272) for the Bromodomains of CBP/EP300.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 42
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-07-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5ku3A01
4A9KA 4NYVA 5H1VA 5HFQA 2KTBB 4LYIA 3UV2A 3I3JA 4CUPA 5BT4A 3LQJA 5FG5A 4A9FA 2RS9B 3LJWA 5IIDA 4QSSA 4UYHA 3NXBA 4YATA 4LYWA 4QUUA 4O7CA 5CS8A 5EWWA 4A9HA 5HQ5A 5C85A 4MEOA 4LYSA 5E9YA 5KHMA 4BW4A 4NRAA 4CURA 5C7NA 4J1PA 5E0RA 5C87A 4A9OA 4AKNA 5DYUA 5ENGA 4IORA 4O72A 5EA1A 4BJXA 4BHWA 5H1UA 5E9KA 3ONIA 3MB3A 5CRZA 4TZ8A 4YADA 3K2JA 4HXKA 5AD2A 4O76A 5C8GA 3JVLA 5TCMA 2OO1A 4ZC9A 3TLPA 1ZS5A 5COIA 2L85A 5AMFA 2RFJA 5LUUA 5CQ4A 5EGUA 4TQNA 5FE6A 3U5OA 5DW2A 4J3IA 3MULA 4A9LA 4HXSA 4F3IA 5FE7A 5F60A 4A9NA 1E6IA 3JVKA 5CQ7A 2L84A 4MR4A 5CQ8A 5D7XA 3AADA 5A5RA 3P1CA 5IGNA 5CP5A 4O71A 5LKZA 4TTEA 1WUMA 4PY6A 5EWCA 5F3AA 5FH6A 4O77A 3HMEA 3U5NA 4QYLA 5CU8A 4YK0A 2D82A 5CQAA 5I89A 3UVWA 4IOQA 4HXRA 2WP1A 3RCWA 5HM0A 4OGIA 5LJ1A 5KU3A 5DLZA 5EICA 5DX4A 1JM4B 5E9VA 2F6NA 5FE9A 2YQDA 3LQHA 4NYWA 5DKCA 4NS5A 5D0CA 4YY4A 2R0YA 5CGPA 4J0RA 5EPRA 4TU6A 4TT2A 4LC2A 2D9EA 5HRXA 2G4AA 4HXMA 4PCEA 5DFBA 5ENEA 2NXBA 4A9EA 4YH3A 5L96A 5G4RA 4NR5A 4QB3A 4UIZA 4DONA 2DWWA 5D26A 4NR4A 3LXJA 3G0LA 3UVYA 2E7NA 5F1HA 5ENFA 5HFRA 1EQFA 5CUDA 4NRCA 1X0JA 4N4GA 1WUGA 4NUEA 4YYMA 2WP2A 5E9IA 5LJ0A 4Q0OA 4UIVA 5I83A 4PCIA 5D3NA 4PTBA 4QSRA 2MJVB 5ENBA 4XUBA 5I7YA 5I88A 4YYNA 5L98A 5EWVA 5IG6A 4HXPA 5HELA 5CRMA 4TT6A 2DKWA 4O70A 3O35A 4HBWA 2RNXA 5F63A 3P1EA 5L97A 4N4FA 4QEWA 3DWYA 4Z1QA 2YEKA 4O75A 2I8NA 4QYDA 5D3HA 4IR3A 5D25A 4Z6IA 5TB6A 2E7OA 4YBMA 5LJ2A 4C66A 4YAXA 3MXFA 5E7DA 5HQ7A 5A5PA 4WIVA 4UYEA 5EISA 5LKXA 5EI4A 5FDZA 3IU5A 2N9GA 4LR6A 4KV1A 4QR4A 3O36A 3FKMX 3P1DA 3UV5A 5F62A 5BT5A 5EWDA 3UV4A 4QSPA 5LVQA 4NYXA 5E9MA 4LRGA 5CY9A 4MR6A 3G0JA 3DAIA 4YH4A 5CUCA 4QC3A 5A83A 5DY7A 4UIUA 5FFYA 2RO1A 4PKLA 2DVRA 4YYKA 2YDWA 5D3LA 4UYFA 4QSQA 4QZSA 4WHWA 4HBYA 5E3DA 3IU6A 4A9JA 5FBXA 3QZSA 5ENIA 5ENHA 2DVSA 5KTUA 5EU1A 5A5SA 5I86A 4O7AA 5FFVA 2DVQA 5DLXA 5F5ZA 5HQ6A 5H85A 5D3PA 3UVDA 4NUCA 5AD3A 5LKUA 5ENJA 4PS5A 5A81A 4MENA 3QZVA 4ZW1A 5FE1A 4NQMA 5IGMA 3P5OA 5D3JA 2RI7A 4C67A 5FE3A 4E96A 4O74A 5DYCA 3UVXA 5G4SA 4CUUA 5A5OA 4IOOA 5E3GA 4UYDA 4QR5A 5I7XA 5EQ1A 4ALGA 4O7BA 4HXNA 4LDFA 5ETDA 5IGLA 4NR9A 4TYLA 1JSPB 4WHUA 2E3KA 5C89A 5EK9A 5FE2A 4QSWA 2F6JA 4MEPA 5AMEA 5CPEA 5EVAA 4YYIA 4IR6A 4QSUA 4TU4A 3JVJA 5L99A 4A9MA 4UYFB 2LSPB 3UW9A 4BW3A 5FE8A 5HCLA 3AQAA 3MUKA 4HXOA 5HRVA 5CUBA 4HBVA 5KO4A 5LVRA 3ZYUA 2L5EA 4ZQLA 3MQMA 4IR5A 4MEQA 5H1TA 3S92A 2I7KA 4Z93A 5LKTA 5KTWA 4NR7A 4IR4A 4RVRA 5DW1A 4N4HA 5J0DA 5CFWA 3HMFA 4N3WA 4TZ2A 5L8UA 4NXJA 4BW2A 5FH8A 5F25A 5FE0A 3GG3A 2YELA 4CUTA 4UIWA 5KTXA 3U5LA 5IBNA 4LZSA 5DYXA 5D3TA 4CFKA 2R0VA 4YYDA 5CQ3A 5ETBA 5I40A 4O7EA 4GPJA 5L8TA 4QEVA 3SVGA 3LQIA 5FFWA 3U5KA 5DFCA 4QSTA 5E74A 5BT3A 4Z1SA 4KV4A 5I29A 5A85A 4CLBA 2YW5A 2RNYA 4KCXA 5CQTA 3O34A 4QSXA 5A5QA 3U5PA 5FE5A 4BW1A 4MR3A 4XYAA 4YYJA 2H60A 5A5NA 5HEMA 5FG4A 5E9LA 4YBSA 3SVHA 3D7CA 4HBXA 5HENA 5IGKA 5DKDA 4O78A 5HJCA 4OGJA 4XY9A 2YEMA 3P1FA 5CQ6A 4A9IA 5F1LA 4NR8A 2DATA 2OUOA 5HRWA 4X2IA 4UIYA 4UYGA 5FB0A 5EPSA 1F68A 3QZTA 5EWHA 2R10A 4LZ2A 2OSSA 4FLPA 2R0SA 4O7FA 5II1A 4QR3A 3U5JA 4TS8A 4NRBA 5I1QA 5DBMA 4CUQA 2GRCA 2DVVA 5F2PA 4N4IA 3SVFA 5JWMA 4QUTA 5DKHA 5EP7A 3U5MA 5F61A 1N72A 5FH7A 4QEUA 5ACYA 3HMHA 5JI8A 5CTLA 5EPBA 5A7CA 5HLSA 5ENCA 5D3SA 5DYAA 3Q2EA 4YYHA 3O33A 5K29A 4ALHA 4NR6A 4CFLA 4UITA 5II2A 5I80A 4YBTA 5D3RA 4YY6A 4QC1A 4Z6HA 5CQ5A 4TT4A 5EM3A 4Y03A 4J0SA 5A82A 4QY4A 5D24A 5CUAA 4YABA 4CUSA 4NUDA 4HXLA 5CZGA 4QNSA 5DFDA 4NQNA 3JVMA 3MB4A 4YYGA 2RNWA 4QSVA 5FG6A 5CUGA 5FB1A 5E73A 5C4QA 2YYNA 3O37A 4Q0NA 5F36A 4MR5A 3S91A 5FE4A 5CUEA 5EV9A 4CL9A 4LZRA 4XUAA 4QBMA 2FSAA 3Q2FA 4YC9A 4OUFA 4UIXA 4XY8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4A9KA 4NYVA 5H1VA 5HFQA 2KTBB 4LYIA 3UV2A 3I3JA 4CUPA 5BT4A 3LQJA 5FG5A 4A9FA 2RS9B 3LJWA 5IIDA 4QSSA 4UYHA 3NXBA 4YATA 4LYWA 4QUUA 4O7CA 5CS8A 5EWWA 4A9HA 5HQ5A 5C85A 4MEOA 4LYSA 5E9YA 5KHMA 4BW4A 4NRAA 4CURA 5C7NA 4J1PA 5E0RA 5C87A 4A9OA 4AKNA 5DYUA 5ENGA 4IORA 4O72A 5EA1A 4BJXA 4BHWA 5H1UA 5E9KA 3ONIA 3MB3A 5CRZA 4TZ8A 4YADA 3K2JA 4HXKA 5AD2A 4O76A 5C8GA 3JVLA 5TCMA 2OO1A 4ZC9A 3TLPA 1ZS5A 5COIA 2L85A 5AMFA 2RFJA 5LUUA 5CQ4A 5EGUA 4TQNA 5FE6A 3U5OA 5DW2A 4J3IA 3MULA 4A9LA 4HXSA 4F3IA 5FE7A 5F60A 4A9NA 1E6IA 3JVKA 5CQ7A 2L84A 4MR4A 5CQ8A 5D7XA 3AADA 5A5RA 3P1CA 5IGNA 5CP5A 4O71A 5LKZA 4TTEA 1WUMA 4PY6A 5EWCA 5F3AA 5FH6A 4O77A 3HMEA 3U5NA 4QYLA 5CU8A 4YK0A 2D82A 5CQAA 5I89A 3UVWA 4IOQA 4HXRA 2WP1A 3RCWA 5HM0A 3ERRA 4OGIA 5LJ1A 5KU3A 5DLZA 5EICA 5DX4A 1JM4B 5E9VA 2F6NA 5FE9A 2YQDA 3LQHA 4NYWA 5DKCA 4NS5A 5D0CA 4YY4A 2R0YA 5CGPA 4J0RA 5EPRA 4TU6A 4TT2A 4LC2A 2D9EA 5HRXA 2G4AA 4HXMA 4PCEA 5DFBA 5ENEA 2NXBA 4A9EA 4YH3A 5L96A 5G4RA 4NR5A 4QB3A 4UIZA 4DONA 2DWWA 5D26A 4NR4A 3LXJA 3G0LA 3UVYA 2E7NA 5F1HA 5ENFA 5HFRA 1EQFA 5CUDA 4NRCA 1X0JA 4N4GA 1WUGA 4NUEA 4YYMA 2WP2A 5E9IA 5LJ0A 4Q0OA 4UIVA 5I83A 4PCIA 5D3NA 4PTBA 4QSRA 2MJVB 5ENBA 4XUBA 5I7YA 5I88A 4YYNA 5L98A 5EWVA 5IG6A 4HXPA 4AKIA 5HELA 5CRMA 4TT6A 2DKWA 4O70A 3O35A 4HBWA 2RNXA 5F63A 3P1EA 5L97A 4N4FA 4QEWA 3DWYA 4Z1QA 2YEKA 4O75A 2I8NA 4QYDA 5D3HA 4IR3A 5D25A 4Z6IA 5TB6A 2E7OA 4YBMA 5LJ2A 4C66A 4YAXA 3MXFA 5E7DA 5HQ7A 5A5PA 4WIVA 4UYEA 5EISA 5LKXA 5EI4A 5FDZA 3IU5A 2N9GA 4LR6A 4KV1A 4QR4A 3O36A 3FKMX 3P1DA 3UV5A 5F62A 5BT5A 5EWDA 3UV4A 4QSPA 5LVQA 4NYXA 3VKGA 5E9MA 4LRGA 5CY9A 4MR6A 3G0JA 3DAIA 4YH4A 5CUCA 4QC3A 5A83A 5DY7A 4UIUA 5FFYA 2RO1A 4PKLA 2DVRA 4YYKA 2YDWA 5D3LA 4UYFA 4QSQA 4QZSA 4WHWA 3D1DA 4HBYA 5E3DA 3IU6A 4A9JA 5FBXA 3QZSA 5ENIA 5ENHA 2DVSA 5KTUA 5EU1A 5A5SA 5I86A 4O7AA 5FFVA 2DVQA 5DLXA 5F5ZA 5HQ6A 5H85A 5D3PA 3UVDA 4NUCA 5AD3A 5LKUA 5ENJA 4PS5A 5A81A 4MENA 3QZVA 4ZW1A 5FE1A 4NQMA 5IGMA 3P5OA 5D3JA 2RI7A 4C67A 5FE3A 4E96A 4O74A 5DYCA 3UVXA 4AKHA 5G4SA 4CUUA 5A5OA 4IOOA 5E3GA 4UYDA 4QR5A 5I7XA 5EQ1A 4ALGA 4O7BA 4HXNA 4LDFA 4AI6A 5ETDA 5IGLA 4NR9A 4TYLA 1JSPB 4WHUA 2E3KA 5C89A 5EK9A 5FE2A 4QSWA 2F6JA 4MEPA 5AMEA 5CPEA 5EVAA 4YYIA 4IR6A 2EJNA 4QSUA 4TU4A 3JVJA 5L99A 4A9MA 4UYFB 2LSPB 3UW9A 4BW3A 5FE8A 5HCLA 4AKGA 3AQAA 3MUKA 4HXOA 5HRVA 5CUBA 4HBVA 5KO4A 5LVRA 3ZYUA 2L5EA 4ZQLA 3MQMA 4IR5A 4MEQA 5H1TA 3S92A 2I7KA 4Z93A 5LKTA 5KTWA 4NR7A 4IR4A 4RVRA 5DW1A 4N4HA 5J0DA 5CFWA 3HMFA 4N3WA 4TZ2A 5L8UA 4NXJA 4BW2A 5FH8A 5F25A 5FE0A 3GG3A 2YELA 4CUTA 4UIWA 5KTXA 3U5LA 5IBNA 4LZSA 5DYXA 5D3TA 4CFKA 2R0VA 4YYDA 5CQ3A 5ETBA 5I40A 4O7EA 4GPJA 5L8TA 4QEVA 3SVGA 3LQIA 5FFWA 3U5KA 5DFCA 4QSTA 5E74A 5BT3A 4Z1SA 4KV4A 5I29A 5A85A 4CLBA 2YW5A 2RNYA 4KCXA 5CQTA 3O34A 1ZKRA 4QSXA 5A5QA 3U5PA 5FE5A 4BW1A 4MR3A 4XYAA 4YYJA 2H60A 5A5NA 5HEMA 5FG4A 5E9LA 4YBSA 3SVHA 3D7CA 4HBXA 5HENA 5IGKA 5DKDA 4O78A 1PUOA 5HJCA 4OGJA 4XY9A 2YEMA 3P1FA 5CQ6A 4A9IA 5F1LA 4NR8A 2DATA 2OUOA 5HRWA 4X2IA 4UIYA 4UYGA 5FB0A 5EPSA 1F68A 3QZTA 5EWHA 2R10A 4LZ2A 2OSSA 4FLPA 2R0SA 4O7FA 5II1A 4QR3A 3U5JA 4TS8A 4NRBA 5I1QA 5DBMA 4CUQA 2GRCA 2DVVA 5F2PA 4N4IA 3SVFA 5JWMA 4QUTA 5DKHA 5EP7A 3U5MA 5F61A 1N72A 5FH7A 4QEUA 5ACYA 3HMHA 5JI8A 5CTLA 5EPBA 5A7CA 5HLSA 5ENCA 5D3SA 5DYAA 3Q2EA 4YYHA 3O33A 3VKHA 5K29A 4ALHA 4NR6A 4CFLA 4UITA 5II2A 5I80A 4YBTA 5D3RA 4YY6A 4QC1A 4Z6HA 5CQ5A 4TT4A 5EM3A 4Y03A 4J0SA 3D1BA 5A82A 4QY4A 5D24A 5CUAA 4YABA 4CUSA 4NUDA 4HXLA 5CZGA 4QNSA 5DFDA 4NQNA 3JVMA 3MB4A 4YYGA 2RNWA 4QSVA 5FG6A 5CUGA 5FB1A 5E73A 5C4QA 2YYNA 3O37A 4Q0NA 5F36A 4MR5A 3S91A 5FE4A 5CUEA 5EV9A 4CL9A 4LZRA 4XUAA 4QBMA 2FSAA 3Q2FA 4YC9A 4OUFA 4UIXA 4XY8A
chains in the Genus database with same CATH topology
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