5L71A

Crystal structure of mouse phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase 4 (gpx4)
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
DDWRCARSMHEFSAKDIDGHMVCLDKYRGFVCIVTNVASQCGKTDVNYTQLVDLHARYAECGLRILAFPCNQFGRQEPGSNQEIKEFAAGYNVKFDMYSKICVNGDDAHPLWKWMKVQPKGRGMLGNAIKWNFTKFLIDKNGCVVKRYGPMEEPQVIEKDLPCYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal and solution structural studies of mouse phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase 4.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase, mitochond
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mus musculus
total genus 60
structure length 165
sequence length 165
ec nomenclature ec 1.11.1.12: Phospholipid-hydroperoxide glutathione peroxidase.
pdb deposition date 2016-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00255 GSHPx Glutathione peroxidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5l71A00
3TKSA 5EY6A 1PX7A 1Z9HA 2X8GA 1WJKA 2V2GA 1M7TA 3TJFA 4CW9A 4I6XA 4V2MA 3HD5A 5COHA 1J08A 5D73A 3F9UA 2ZNMA 4K9ZA 2C80A 5AIXA 1A2JA 3VK9A 2WZ9A 4ZL7A 3P90A 3GX8A 4ECIA 1DE2A 1H4OA 4ZXGA 3MNGA 3L78A 1YDKA 4MH2A 1R26A 2LS5A 2YJ7A 3UEMA 3G7JA 3TKQA 2YANA 3RDWA 1TRWA 3DVXA 1KNGA 2N5FA 3KH9A 3ME7A 3KJYA 2VCVA 2XC2A 4AJ6A 1GSYA 1U3AA 5GSSA 3FZAA 3DD3A 3C7MA 1TK0B 3LGCA 4Q5FA 2YWIA 5EL8A 2OA7A 3EVIA 2J9HA 2LRCA 3TJBA 1V57A 4DSQA 1TI3A 2YWNA 3VWXA 1XVQA 1U88A 3D4TA 2OADA 3NOFA 3TKRA 2PU9C 5CP1A 4K8MA 1WRYA 2L57A 3WT2A 1NW2A 1OKTA 2OBIA 3HJOA 5DVBA 1AQXA 1EGOA 2F51A 2DLXA 3FHKA 3SWLA 1T00A 4KCAA 4IP1A 3N9JA 3KGKA 2YOIA 2YN1A 2F8AA 4F82A 2H1GA 4WEYA 1TK8B 1Q4JA 3ZIJA 2DSAA 4XHMA 1O73A 2FGXA 3LJRA 1XCCA 3L9UA 4XTSA 4MP4A 4Z7XA 3G7YA 6GSWA 1K0CA 2MMNA 1C72A 4PURA 3D4MA 4MK3A 3UL3A 1TXXA 4G19A 5INYA 4MJEA 3F3RA 5ECRB 5DALA 3FW2A 2LJKA 3K8NA 1GUKA 4QQ7A 3M3MA 2DJKA 2VL2A 2PN8A 2PUKC 1O7UA 2C4JA 1G6YA 3ZFBA 3GKNA 1XOAA 1S3CA 3ZTLA 2ALBA 2GS3A 2VCWA 3NIVA 1EEJA 3H79A 2E2MA 1M0UA 3APSA 2OBKA 4ZBDA 4OD7A 1BYEA 3M1GA 1E2YA 1X9MB 1MDJA 5HR2A 4ZILA 4DVCA 4GXZA 2DJ0A 4EDZA 4WF4A 1TRUA 5HR1A 2C0GA 3ERFA 3DGQA 1S3DA 2H6XA 1XOBA 3FZ4A 3CSHA 4GTUA 3HDCA 4Q5QA 2WS2A 2P31A 4L0WA 3L9VA 1EOHA 2GSRA 3GKMA 4PQ1A 3KCMA 1K0DA 3I69A 4BL7A 5CO3A 1A2MA 3LYKA 2LKUA 5ECHB 3GN3A 2X8HA 1V98A 1JZDA 3TGZA 3KZQA 2MBTA 1TK5B 1M9AA 5D8IA 5DJLA 2JSYA 5CYYA 3KMNA 4DSSB 5ABRA 4IQ1A 1EP7A 3U6VA 3GKKA 5DJMA 3FZ9A 3QR6A 4ML1A 4KCEA 1NM3A 4ECCA 3GKXA 2M80A 3V1WA 1YEPA 4E8EA 2O8VB 4QL9A 4LMVA 1ERWA 3IBHA 2IMFA 2YNXA 2VOCA 3EMXA 3QFAC 1GTUA 1X5DA 2K9FA 4MCUA 10GSA 4LL4B 1F3AA 4MLYA 3GX0A 4IJ3A 1K0MA 4FYBA 2CZ2A 3KM6A 2GZPA 2AB6A 4L5OA 3DRNA 2IPAA 1VF1A 2KUCA 1E6BA 4OCEA 3LWAA 3BJ5A 5J5NA 3D0ZA 5IPGA 2FA8A 1A8LA 2DJJA 2XPEA 2H0GA 3N5OA 1HYUA 1PKZA 1X5EA 4GCIA 1YJ6A 2OJLA 3MWHA 3DVWA 3I43A 3F0IA 1ML6A 3HA9A 4IQAA 1Q98A 5F05A 4WBJA 3F4SA 3UAPA 4EVMA 2JZTA 2L5LA 4TW5A 2WFCA 2B3SA 3HHVA 2GQMA 5IMDA 4YAVA 2FA4A 3QDNA 11GSA 1U87A 2H1BA 4GQCA 2HNLA 4ILFA 4K7IA 5GAND 4NXIA 1SU9A 2LSTA 3HVXA 5F8BA 3RPNA 2KHPA 1SK1A 5H5RA 2IFQB 3RHBA 5DQSA 3WT1A 3ISOA 2H6YA 5JCUA 4NPBA 2P5RA 4JR6A 4L8EA 5A4WA 1XXUA 3BCIA 17GSA 9GSSA 4F2IA 1X9WB 1AXDA 2H6ZA 3KP8A 2GT5A 3VI7A 4JE1A 1UC7A 5B7CA 3CSJA 3Q18A 4IHUA 4HUAA 4TR0A 5E59A 1GSSA 3H1NA 2L4CA 3ZVJA 3VI5A 5KN0A 3ME8A 1B4QA 4TR4A 4J2FA 4XRAA 2NPBA 1TTZA 2H71A 1MEKA 4RQRA 3H4KA 1HNCA 2H74A 3C1RA 3L9SA 1VF2A 1FO5A 1ZYEA 2H73A 4N11A 2WDUA 3HYPA 5HFIA 2IL3A 1K0AA 2DBCA 2DMLA 2PWJA 1VGLA 2B7JA 3W8JA 4XS4A 4HOJA 2J23A 3TUEA 3DMLA 5ENUA 1XFLA 4MF6A 2B5EA 5KN2A 1SL2B 5F0GA 2F9SA 3ED3A 4EF0A 3DXBA 4GF0A 1W89A 4HI7A 2C0EA 1TOFA 3PH9A 5ECPB 1EEMA 3APOA 3GA4A 5LD0A 2WGRA 3ERGA 6GSXA 2E7PA 4MF7A 1BEDA 1G7EA 4PNFA 2LQOA 3L0HA 2CAIA 2KLXA 2N5BA 4GSSA 4OFMA 5ECSA 1Z5YE 3EE2A 3JCML 2KP1A 2K6VA 4I8BA 3UBLA 1T4YA 1O8WA 4G2EA 4ML6A 2F8FA 1TRVA 1GSDA 3KTLA 1BX9A 5G5EA 2V41A 3E3EA 4KSMA 3IE3A 2DIYA 5B8BA 1GTIA 4POBA 1SJ6A 5AIVA 2PGTA 4ZBAA 4BVYA 1PL1A 1A23A 2PBJA 3C73A 3KD0A 3AY8A 2P5QA 3RHCA 1A24A 2VCQA 2YPMA 4KNDA 2WRTA 1U3IA 1OC9B 3EC3A 2PPTA 1X5CA 2QC7A 5ID2B 3R2QA 4IN0A 5B8AA 1JFUA 1O81A 3M8NA 1N2AA 2VLTA 4OWYA 4RUVA 2E0QA 1PA3A 5J9BA 2I4AA 4ZL9A 5IO0A 3I6AA 1ON4A 4TXOA 2FWGA 5HR0A 5G30A 1OVNA 4JRRA 4HS1A 1PRXA 2I9HA 4IVFA 2PERA 1NHYA 1A8YA 2HRFA 4HDEA 3IPZA 1PSQA 3ZVJD 5L71A 5ECQB 4K0NA 4XCSA 4NWYA 4LA1A 1OE7A 3QPMA 1V40A 5DAKB 3M9JA 3GTUA 1ST9A 1U6TA 2E2GA 2HZEA 2V32A 1KEBA 1J0FA 1T3BA 2CX3A 4KDXA 6GSYA 1AUCA 1RW1A 2CA8A 2CAQA 4MJAA 4WF5A 2RM6A 4NHWA 4CHSA 1TKDB 1WMJA 1YF1A 4K7NA 4HQSA 1FVJA 3IV4A 2XHFA 3A2XA 4O7HA 1JZOA 3ZITA 3HVVA 1QQ2A 3GIXA 2R2JA 4NMUA 3KMOA 3TDGA 1FVKA 3CTFA 3EYTA 5J9CA 2HRNA 2RIIA 5IOWA 1WWJA 3Q74A 3O3TA 3VLNA 1YY7A 3GH9A 3TJKA 5CNWA 1IYHA 3QOUA 1TP9A 4PUAA 1YKCA 4GWRA 4MABA 4MF5A 1FB0A 3GRXA 2AYTA 2JU5A 5F07A 4KH7A 1K3YA 2VCZA 2LEGA 3M9KA 3UOMA 2GSTA 3UVTA 2L5OA 2EIQA 4MH3A 2WB9A 1EP8A 4JZQA 4GRFA 1GSQA 2MMOA 3WYWA 3TB2A 4BPYA 3DYRA 1Y6EA 1SYXA 5CRDA 1JLVA 1ERUA 3CXGA 1O85A 5C04A 3CRTA 3H8QA 3WD6A 1QMVA 4IELA 1PGTA 1CQHA 1ZCPA 3LYPA 2QKEA 22GSA 2B7KA 1GULA 3UVHA 2CQ9A 2YZUA 1R7HA 3TCOA 5G31A 1NSWA 2HLSA 2A4VA 4OO5A 4PNGA 5G1LA 1G6WA 3PR8A 4POLA 3ZMKA 4YQMA 3HJMA 4LL1B 2RLIA 2VM1A 2GDRA 4IW9A 4D73A 2MMZA 2G0FA 3ZMLA 3BBYA 4YAPA 3GFKA 19GSA 4PGTA 4HU7A 1VF3A 1F3BA 3P8WA 4ZIJA 2IWTA 4L5LA 5ELGA 2F3MA 1B4PA 3CMIA 4ZB8A 3VURA 2AJQB 4BWSA 2DMMA 5IM9A 1S3AA 3GYKA 1ABAA 1W4VA 2MMAA 3KTBA 2GLRA 2D2ZA 2PVOC 5FT3A 1SKRB 2EIRA 4ECJA 4I5QA 1GSEA 1V9WA 1YKAA 1GWCA 4TR1A 5DQYA 3I9V2 5D9WA 2C3TA 2IN3A 3P2AA 5JWRB 2LJRA 1RK4A 2DC5A 4TKYA 5HFKA 1XW6A 1DSBA 1LJRA 1ERTA 2NBSA 18GSA 4KA0A 5EPFA 5AISA 3H93A 4AJ7A 1XWGA 3CYNA 5JCWA 5IMZA 2BTOT 2LNTA 1WE0A 5IMVA 2GT6A 1OYJA 2JSZA 6GSUA 3LG6A 1EV9A 1JZWA 1EV4A 1ZZYA 4F0BA 1R4WA 1TW9A 4EXJA 3L4NA 4YQUA 1J9BA 3TKSC 2C8UA 1NHOA 2CVBA 4XIHA 2I81A 2O85A 4MZWA 1CQGA 4POMA 4ZBBA 1ILOA 4OO4A 2JACA 2VL9A 2H19A 1K0OA 1XW5A 3D21A 5IMCA 2IMEA 1M2BA 3PINA 4DSRA 1ERVA 3VWWA 2IMKA 3MDKA 5EVOA 5ECIB 2GSSA 2VLUA 5LNKe 2XPDA 3TKPA 2Z9SA 5JCGA 1M9BA 5J4UA 5D9VA 3VFIA 1GL8A 3GV1A 4MJBA 3F4TA 1XWKA 5D9XA 4RI7A 1QK8A 4ISDA 4FO5A 3O76A 3KIJA 2JADA 1I9DA 4KE3A 2HI7A 3US3A 4MJCA 2GQKA 1XVWA 1K3LA 4OMVA 2M46A 3UMAA 8GSSA 2X99A 3TRXA 2R4VA 4F0CA 2H0HA 4HU9A 1XPVA 1BG5A 2DIZA 4AGSA 1HD2A 5CRHA 3QAVA 3SBCA 4HQZA 2XBQA 1YEXA 2O7KA 5IMFA 3HCZA 5H5SA 5LCZA 4TXVA 5J3RA 3IC4A 4TVEA 2GZZA 4HZ4A 4GSTA 4OFTA 2C3NA 3IAS2 1ZOFA 4WR5A 5ECNB 2VUPA 1THOA 3RAZA 1X9SB 3IR4A 5GZZB 1FHEA 2WJUA 3UBKA 4ACSA 1SKSB 1O6JA 5IO2A 3F3QA 4I2TA 3MSZA 3OR5A 2XBIA 4O5RA 4JR4A 1GLPA 4J57E 5ELAA 1GNEA 1TDIA 3TJJA 5IPHA 3W8SA 4WBRD 3QMXA 4EKZA 2HSYA 2BMXA 2IIYA 2FHEA 4NV2A 3CSIA 2LUSA 4EE0A 5DALB 5CRGA 3DEXA 1GUMA 3E0UA 2GSQA 2HSHA 3EURA 2VL2C 6GSSA 3C1SA 5J41A 4ZB6A 2H66A 3F8UA 1BAYA 3LEFA 1XWAA 4AJ8A 1EWXA 5D96A 3D5JA 3NZNA 4NAXA 3IDVA 2AUVA 2VIMA 1GSUA 2X64A 2FUG2 4TN8A 3GUSA 2YWOA 3LORA 1A0FA 3A2WA 2P0GA 3F6FA 2QSIA 2V6KA 1F2EA 4RQXA 1HNBA 2TIRA 3HZ8A 1K0NA 3VWVA 2C1YA 2YJHA 2MYGA 4FH8A 1B8XA 1JLWA 3QFBC 4X43A 1TI1A 3KXOA 1G7OA 4AF2A 3LQ7A 1TRSA 3HKRA 4BVXA 1SK2A 2YV7A 3Q19A 5C00A 2YCDA 3MAKA 2H01A 2OACA 4KB3A 2LNSA 14GSA 1T8EB 4HEA2 4MA9A 4DSSA 4HJ2A 1X0RA 3IOSA 4KW6A 2H1AA 5JWOB 1B9YC 1QFNA 2LRNA 1UVZA 1MDIA 4YH2A 5FWGA 2EC4A 3IA1A 4MMMA 1LU4A 3ZREA 2HXKA 3Q6OA 1F37A 3FYGA 3UARA 2R37A 3HJPA 3HVSA 1SL0B 1SK0A 3GSTA 1TU7A 2H30A 2HYXA 16GSA 2B1LA 4EDYA 4KAEA 1OAZA 2H0IA 1OKDA 4POKA 1Z6NA 4ID0A 1Z7PA 1OC8A 3ZIVA 3FK8A 1THXA 12GSA 1FOVA 4X0XA 2YP6A 5B6MA 1FB6A 3IRAA 4TOPA 4RI6A 2EIOA 3DWVA 1XIYA 2VCXA 1HNAA 3A3TA 4PQHA 4NV5A 3UJ1A 5HQPA 1K3OA 3EWLA 5CRWA 4EL1A 2NTOA 1UA5A 2H8LA 1Y25A 1PD21 2LV3A 1N8JA 1YQ1A 5DCHA 4F9ZA 2ZCTA 1URMA 2JZRA 3FY7A 1SYRA 3U5RE 4N0ZA 1GSFA 4KDUA 2MZCA 4TR3A 5ECOB 2O87A 5IIZA 2REMA 3D6IA 2IFQA 4LMWA 4EUYA 4F03A 1RQMA 4BA7A 2I3YA 2FWHA 5KN1A 4ZB9A 4J56E 2CT6A 5IOXA 5DBQA 1TJDA 4BWQA 2DJ1A 3WGEA 1FG4A 2FNOA 2WULA 2RM5A 2K8VA 6GSTA 5AN1A 3UIWA 3A2VA 3ZFLA 3IK9A 2OE3A 1JZRA 3C71A 4XS1A 4IGJA 4EO3A 1AW9A 2LRTA 4X1UA 3LFLA 2JZSA 1M2AA 2KOKA 4IBPA 5G2ZA 1H75A 5HR3A 2NDOA 4LLRA 2VL3A 4XS4B 5KEJA 3HZ4A 2CVKA 4HZ2A 3TKSE 4K1FA 1IYIA 5GAPD 3QD9A 1ZL9A 4GQFA 4KDYA 4WR4A 4V1Ag 1WIKA 3E9JB 5B6NA 1R5PA 4QL7A 1Z3EA 2O89A 3TRPA 2FY6A 5IMAA 4NHZA 2IMDA 6GSVA 1TU8A 3FZ5A 1KTEA 3EMPA 3W6GA 3P7XA 2GQLA 2VO4A 1QXHA 2B1KA 4Q5RA 2YZHA 4WKWA 2LJAA 1USBA 1ZMAA 3QAGA 3LSZA 7GSSA 1MD4A 3ZYWA 1XWBA 2QGVA 1I5GA 1B48A 1QUWA 1WPIA 4OCFA 4PQIA 5F06A 1SD8A 2GGTA 3GNJA 3GL5A 1VRSD 2B6MA 3GH6A 2OE1A 2ON5A 1AC1A 1MTCA 2CV4A 2DJ3A 5GSTA 1YZXA 3CRUA 3WGDA 2VAFA 1GNWA 2L59A 2C0DA 4N0VA 4PUFC 3O6TA 4KSOA 1T7PB 1A0RP 1AAZA 1AQVA 5HFGA 1ZYQB 3G9BA 4K7OA 1OC9A 4O92A 2V1MA 5FHIA 4JU5A 5CAXA 3ERWA 5AGYA 4MDCA 5ID2A 1MD3A 1PL2A 2TRCP 1JHBA 2G2QA 4PX1A 4O32A 2HZFA 3M0FA 1EGRA 1BQ7A 3C8EA 1GP1A 1WP0A 1FAAA 4TXOB 2LTKA 5D93A 3PGTA 4OFNA 3LXZA 3KEBA 3FR9A 3HXSA 3IXRA 4CDOA 3QAWA 5E4WA 1M99A 1GLQA 2GVPA 2VLVA 3EU3A 2ON7A 3KH7A 4IP6A 3J7Yk 2CX4A 4XS6A 3FRCA 4MPFA 1AQWA 1T1VA 3GTUB 5DAKA 3BD2A 2H70A 1QGVA 4IS0A 1GTBA 2L6DA 2HZEB 1XZOA 3TOTA 4I2UA 1Z7RA 2GZYA 2DJ2A 3CTGA 4FIWA 2WCIA 4GSNA 1OC3A 3VPTA 1EOGA 3F6DA 4V1Ap 1GRXA 3GSSA 3IK7A 1ZGNA 4GLTA 1BJXA 3EINA 3WGXA 3FR6A 3S9FA 2IJYA 2H1DA 2ES7A 5A4UA 3A5WA 2YV9A 3GURA 5JWQB 3ZL5A 4WETA 4TRXA 3TJGA 5ECLB 1SL1B 1DUGA 3D22A 2K18A 1EZKA 1OE8A 1GTAA 1B9XC 4EC0A 1ACVA 4FYUA 1GH2A 3DKSA 2VCTA 1UN2A 2OE0A 3FR3A 5ECKB 2ZUPA 2B5XA 1DBYA 5G1KA 1V58A 2FWEA 2KP2A 4G10A 2MBSA 13GSA 4JEDA 1R5AA 5A5KA 1F9MA 1PMTA 2HFDA 1AIUA 2OKAA 4G9HA 4E8HA 2H76A 1A2LA 2K8SA 2L6CA 2BJXA 1XWCA 2RUEA 2CVDA 3APQA 4ZL8A 1SKWB 5A4VA 4I97A 4N30A 3ZLPA 4K2DA 20GSA 4FYCA 3CBUA 1SENA 2N5AA 4H86A 4PXOA 2AAWA 3VPQA 4YQVA 2NVLA 2FCHA 1T4ZA 4JBBA 1PX6A 4IKHA 2YWMA 2PVQA 1LBKA 1XBSA 1M2DA 2HT9A 1VF4A 2HE3A 3ZZXA 4N10A 5D9TA 3TRQA 2RUFA 4V2NA 4KX4A 2TRXA 2H72A 2AV4A 1FW1A 2A2SA 2R5GA 5G5FA 4HJMA 2FD3A 4ULXA 3GHAA 3QCPA 5CREA 4D73B 4KGIA 1V2AA 2CZ3A 3RBTA 5IQYA 1Z6MA 1MDKA 4L0UA 1KBNA 4WXTA 2VD1A 4MZBA 3F4RA 3ZRDA 1XW9A 4K0GA 3HY2A 2A2RA 5DDLA 1PKWA 3F63A 3FKFA 2R6KA 1DE1A 2H75A 1O8XA 4MZCA 5H5QA 1F6MC 4Q5NA 3GL3A 3J7Yb 2AHEA 2L4QA 3BOAA 4XRDA 1SJIA 3BCKA 2FWFA 4MPGA 1GUHA 1PN9A 1PQNA 3GMFA 2JL4A 4P3YB 1K0BA 1YF0A 4TR1B 4DEJA 2X8CA 5DCGA 4IJIA 3RPPA 1SD9A 4V2LA 2M72A 2LQQA 2B5YA 2C3QA 4K6XA 3IAM2 5KN3A 2VM2A 2I1UA 4ECBA 3EU4A 5ECMB 2C0FA 1HQOA 1G0TA 2VD0A 2PMTA 4KUNA 3FEUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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