5L8LA

Aurora-a kinase domain in complex with vnar-d01 (crystal form 1)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
264
structure length
263
Chain Sequence
RQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTLAGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Allosteric inhibition of Aurora-A kinase by a synthetic vNAR domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Aurora kinase A
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 263
sequence length 264
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5l8lA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5l8lA01
3SKCA 3EQBA 1CTPE 3QUDA 4GEOA 4GIHA 2Z7QA 1P4OA 2X9FA 3QRIA 5M44A 2RFNA 2E9VA 3G2FA 3LHJA 3HVCA 4GMYA 3PY1A 4ALVA 3WZUA 5FLFA 4DT9A 4JNWA 3EN5A 4JX7A 3RK5A 4JBQA 2XP2A 4C2VA 1JLUE 2HOGA 4QMNA 3QTWA 4YJOA 3NVMB 5CU6A 3QQFA 2YAAA 3LQ3A 2WTKC 4MHAA 3QRUA 2WB8A 3KGAA 2C6KA 4B7TA 1E1VA 2RKUA 4KKEA 2YAKA 2WU7A 4FV6A 4XUFA 4PPCA 5HCYA 3MY0A 3RHKA 4LGHA 3EQIA 2X6DA 4FG7A 4V05A 1HCLA 2YLEA 4TPTA 2UW6A 3DKOA 2O63A 3NCGA 1F0QA 4QNAA 2C5XA 3D5VA 4A9SA 4A9UA 3DKCA 4MD9E 5JRSA 2GFSA 2Z8CA 4UWCA 2DYLA 2G9XA 1SNXA 4Z7HA 4ZOGA 4DINA 4EK6A 3VBQA 2AUHA 3BE2A 3ENHA 3PIYA 4ENYA 3I0OA 3P4KA 3QRKA 3BE9A 4M8TA 4WG4A 3VVHA 3C5UA 3PVUA 3W2OA 1G8SA 3E62A 3PP0A 5D9HA 4E4MA 1IRKA 2V7OA 4CMTA 4DTKA 3LMGA 3D5WA 4Y85A 1URCA 1ZXEA 1P5EA 2QU5A 3RHXA 4DEAA 2HXLA 2HZ4A 2GMXA 2UZTA 4WBOA 2WZJA 5IH5A 4FKGA 1Q5KA 2YACA 2UZNA 4X2KA 4X21A 5M4FA 1WBSA 3R22A 3PXQA 5HG8A 3T3UA 4P4CA 3ACKA 4I5HA 5E7RA 5EI6A 3T9IA 4XH6A 3QCYA 3RPSA 4M13A 5IQCA 3TL8A 4YURA 3BBTB 4E20A 5CNOA 5IA3A 2PE2A 3A7HA 5J9LA 4J95A 4WKQA 2BPMA 4TYIA 4P90A 4GK2A 3LQ5A 4RC4A 2CCIA 4U42A 3W2SA 3QUEA 3LFDA 3UIMA 4CQGA 2YM8A 4QMXA 4AW0A 4BWPA 4YZNA 4MBLA 4G6LA 5FTOA 4JAJA 1CKIA 3ZZWA 3F5PA 4JQEA 3SLSA 1Y57A 3W2RA 4KB8A 5HVYA 3OWJA 4QMVA 3E8DA 5HNGA 4ANSA 3A8XA 3R7UA 4IIRA 2VTOA 3V8TA 3F3WA 4FTJA 4PDYA 2PUNA 1TKIA 4F1OA 4WT6A 4F7JA 2QC6A 3VW6A 4DA5A 3GQLA 4CFFA 2ITNA 2VNWA 4AZTA 4S33A 2XVDA 3BGZA 3FC1X 3H30A 1G5SA 2F7XE 2FYSA 3JY9A 1XH6A 3LJ0A 3MTFA 2PUPA 3NW6A 4NKAA 3W2CA 1XHAA 5E1EA 2E9PA 3MJ2A 3PP1A 4IBMA 3L8XA 4U3YA 3G6GA 4OTRA 5EOLA 1UKHA 4CGAA 3ZLWA 4PWNA 1APME 4AZWA 4BIBA 4J52A 2J7TA 3RPRA 3SG8A 4YHFA 4IDTA 4GG7A 4FKUA 4EWQA 5HGIA 3MDYA 3QFVA 3FSKA 3LZBA 3BRBA 3UZPA 4BTJA 4O6EA 2C5VA 4E1ZA 4U8ZA 4L45A 3LCSA 5A3XA 2PL0A 4ZTRA 3DXNA 3UQCA 2J50A 4CTCA 5I9UA 3ZO3A 2JBPA 5L6WL 2AC3A 4AA0A 4G2FA 5L2IA 1Z5MA 2R3MA 4HNIA 3TZ7A 4F9CA 3TNWA 3UIBA 4K0YA 3QHWA 3Q9YA 1GIJA 3CC6A 3SDJA 3EQFA 4FEQA 3LAUA 3IW4A 4JS8A 4B9DA 2ITUA 4CRSA 4L01A 1U54A 1JSUA 3OEFX 5HIEA 2X6EA 4UEUA 2EUFB 3LFNA 3WF7A 3G0EA 2PZ5A 3MA3A 5AADA 5CU4A 3H10A 5EQYA 3AXWA 4QTBA 3QZHA 3G9LX 3PPKA 4D2SA 1NA7A 4ANMA 4C4EA 3PWYA 3EQGA 1T46A 2YA9A 4U79A 4MNFA 4ZXTA 1V1KA 3CXWA 5H8GA 2O5KA 3OOMA 3JPVA 4BKJA 4QYGA 4RIOA 1TQPA 3ODYX 3S3IA 4GSBA 1Q97A 3L8SA 5FP6A 3R1YA 3KB7A 1NVRA 3EN7A 1H1SA 1FVVA 1WBNA 3V5QA 2GS2A 3TTJA 4DLIA 3ODZX 1RDQE 3UOJA 2W5HA 3OF0A 4X2JA 3PLSA 2BRNA 3OD6X 1YXUA 4D1SA 4DN5A 2R7BA 5IA4A 3FHRA 3SV0A 2QURA 3PY3A 4NWMA 2VNYA 5JSMA 4O38A 4YLKA 4FKRA 3NUYA 4C3PA 3OTVA 4IX3A 3DB6A 3GVUA 5ANOA 3A62A 5KMJA 3N4UA 4DAWA 3NAYA 4RVKA 3U4WA 5EM7A 4MTAA 4L44A 4W9XA 3MWUA 5FEEA 3AT2A 5AV0A 2PY3A 2R9SA 3D2KA 3DA6A 2XNBA 5ANIA 3Q4UA 4K77A 3SQQA 4CV9A 4X7QA 4DFNA 2BFYA 2QHNA 3BGPA 4N70A 4ZZMA 5I9XA 4G3CA 3GT8A 3EL7A 3UDBA 3K3JA 4RPVA 1JSTA 4HYIA 3IGOA 3DKGA 5AR2A 4H05A 3E7OA 3NNVA 3ZM4A 5I5ZA 4ZLOA 4JJRA 4W4XA 5AM7A 3Q6WA 2XK6A 3TV6A 2FSLX 3IONA 5K0KA 4ZJIA 2UZDA 5GZAA 4RX5A 2ERZE 4KSQA 3ZUUA 4QTEA 3FI8A 5DWRA 4FODA 4ASXA 2QQ7A 3FL4A 3PY0A 5EYKA 5EHOA 5EKOA 1XBAA 2WQBA 1W83A 3WF9A 4I6FA 4C33A 2J2IB 3QX4A 3BZ3A 3KK8A 3R7GA 4M68A 5J95A 3TZMA 3RJCA 1FMKA 2I0HA 3IDPA 3KRXA 2C6EA 4MD8E 3AMYA 1K2PA 4G3EA 3VJNA 4HZRA 3VULA 1JAMA 3VBWA 4CLJA 3V8WA 4UX9A 1WBOA 5A9UA 2UVYA 4HVIA 1H0VA 2A1AB 3E64A 3PJ1A 1A9UA 2VX3A 4YTCA 3F6XA 3PJ2A 3CR0A 3V6SA 1YXVA 5CEPA 4I0SA 4X2FA 3V5WA 3SXFA 4BRXA 4J71A 4YJTA 2ONLA 4BZOA 3DK3A 3M2WA 4IACA 3G33A 4DTBA 2XEZA 3A7GA 2JFMA 4FIEA 3OT8A 4CEGA 4JDJA 2Y8OA 4KAOA 4IVCA 5DEWA 4CG9A 5L3AA 5JT2A 2CMWA 3VNTA 4M15A 5IF1A 4TYJA 3LIJA 4G31A 2X7OA 4GUEA 3T9TA 1V0PA 3MPMA 3VUKA 2J0LA 3QQKA 4LMNA 5CAVA 5EM6A 4MEDA 3CGOA 4A9TA 1LEWA 3SGCA 3F69A 4RIWA 2QHMA 3QALE 4OTQA 4UXQA 5ANKA 1CKJA 1OBDA 3V6RA 3T8OA 5IQHA 4HCVA 1YWRA 2BR1A 3JR1A 5D10A 2PK9A 3CJFA 1P4FA 5HCXA 3MIYA 2WMBA 3QD2B 4JAIA 3ZCLA 3ORPA 4TYHB 5TE0A 3CQUA 3DBEA 3JVSA 4YC3A 3AC2A 5C8NA 3WF6A 3PJ3A 4XEYA 3EKKA 4RWJA 2PHKA 5J5SA 5FBOA 3ZO1A 3TUBA 2VAGA 2XZSA 3DS6A 2WXVA 3DKFA 4G17A 2F7ZE 4BR3A 4YJSA 4UY9A 3ULZA 2ITYA 4B8MA 4GKHA 1WVXA 2VTJA 2UUEA 1UU8A 2W96B 2J90A 2VO7A 4WNOA 3H9OA 5JFXA 3EIDA 5A14A 2C68A 3EHAA 3OXIA 1KE8A 3TV4A 1PHKA 4G1WA 4IANA 4E4NA 4AP7A 5CXZA 3MPTA 4IEBA 3CE3A 4IX6A 1R1WA 3QTSA 1WZYA 3QUPA 3MPAA 5I9WA 1XH8A 2Q83A 3QQHA 2ZV7A 4I41A 4MKCA 3FY2A 4S30A 3ZXZA 3OUNB 4EOIA 2CNUA 1BL6A 4C35A 1OPKA 2FB8A 2XKDA 3LM5A 5BMSA 4YNEA 3ZEPA 3EQPA 2UW9A 4LI5A 4TL0A 4DEDA 5J1WA 3BYUA 1GY3A 5EM8A 3NNWA 2PU8A 1Q8WA 2PZPA 3K3IA 1FGKA 3BELA 4XV1A 5HE3A 1XKKA 3BLRA 3HDMA 4IADA 3CKWA 3BPRA 5LARA 5GJDA 3DU8A 3MFRA 3E93A 3PA3A 4V0GA 3GCPA 3C4EA 5A6NA 4MWIA 4PMMA 1KE6A 3ATTA 1ZOEA 4Q5HA 2YDIA 5CEQA 5FM3A 5HBJA 5T6KA 3DB8A 5HE1A 4WNMA 4NJ3A 2C3LA 1W84A 1DAYA 1VEBA 2PUIA 3HUBA 3W8QA 2VWVA 4F7SA 2GCDA 1CM8A 2V7AA 1MQBA 2CGWA 2WD1A 3FLYA 3KMMA 4GJ2A 4IB1A 4NT4A 1BX6A 3HYHA 4D2PA 5E8XA 5CT0A 1VZOA 5ETCA 4EKLA 3DTCA 4XLIA 4QMWA 3P23A 3MH1A 1ZOGA 3VS0A 4X6RA 2QOKA 4ANOA 5FQDC 3R0TA 3QQGA 1WVWA 1UWJA 4J96A 3BYOA 4JG6A 2CN5A 1AGWA 5AAFA 2AYPA 2FA2A 3KXGA 4XG8A 4QYFA 3PFQA 5M57A 4AGCA 3G6HA 5KMKA 4UZHA 3KXHA 2R3QA 3EYGA 4FNWA 4ASZA 2YISA 3V01A 3W18A 3CD3A 2GHGA 4B8LA 3QTXA 4KSPA 5GIOE 5BVOA 1DM2A 3R01A 4O0TA 2A27A 4BICA 3MFUA 5F95A 3FKOA 2P3GX 5TO8A 2RG6A 5F1ZA 4EUUA 4O1PA 2JC6A 2YDJA 3VO3A 2EXEA 2IJMA 1WFCA 4FI1A 5AAGA 3VS6A 4X3FC 3UMWA 4Y46A 3ZLYA 5J1VA 4YJPA 1YHWA 2X4FA 4BDBA 3PZEA 4AGDA 4HPUE 3VHKA 2YZLA 3OXZA 3OT3A 5CY3A 4JOAA 2X1NA 2C6OA 3W2PA 1BLXA 4IB3A 5KMMA 4FKPA 4E3CA 1FVRA 4AQCA 1JNKA 5HVKA 1Y91A 2Z02A 3Q4TA 4QYYA 3GUBA 5DGZA 2JIIA 3OEZA 4BDCA 2XH5A 3CLYA 4TWPA 4BKZA 4DGLC 2PVLA 2QO2A 2Z60A 4BCKA 2Q0BA 5DPVA 4O7WA 4AW5A 4C3FA 2CDZA 1JKTA 5FM2A 4F1TA 1XBBA 3FLQA 4IVAA 2XCKA 4LV5A 1PXLA 4BDFA 3PVGA 3BEAA 5A6OA 4CCBA 5JN2A 3ITZA 2CGVA 1H00A 1UWHA 5D41A 2F9GA 4O6LA 4NFMA 1ZMWA 4ZZNA 5HEZA 2X4ZA 2O3PA 4YPSA 3UGCA 4CFVA 3NX8A 5DN3A 2VX0A 5D7AA 4R77A 1YDSE 1YOJA 3VIDA 3G9NA 3L8PA 2XJ2A 3C4FA 2BILB 3MW1A 4QO9A 3SHEA 4EOOA 5HLNA 5J8IA 3CTJA 3LFBA 3VS3A 4ITHA 2ZV2A 4CLIA 2R5TA 3B2TA 1OGUA 5DI1A 4AZEA 4DCEA 4LG4A 2XNGA 5I3OA 2BKKA 2I7QA 3CKXA 4JRNA 4U3ZA 5E4HA 3MI9A 2DUVA 2OIDA 3DLSA 4EBWA 1OMWA 3EQRA 3FZTA 4GFOA 4E6AA 3W2QA 4FL3A 2DQ7X 2X9EA 4BI2A 3UNJA 3D7TB 4BZDA 5CXHA 4R78A 5CI6A 3TACA 3E8CA 2XIYA 2OI4X 3ZS5A 5CAUA 5FXQA 5J5TA 3FPQA 3R8MA 4WG3A 4Y95A 4BY9E 4BN1A 1K9AA 4EJNA 3POZA 4XG9A 5M06A 3PWDA 2CGUA 3ZC6A 3R1SA 1QPEA 4ID7A 1QL6A 4Y73A 4E6CA 4GKIA 1Z57A 2RG5A 4FGRA 3M42A 4OTHA 3ZBXA 4BL1A 2VV9A 4ERKA 2XS0A 2WNTA 5FGKA 1GNGA 3LLTA 2JIUA 3NEWA 3FMNA 5HORA 1OKWA 3ORTA 4W8DA 3LE6A 2ZMDA 3VS2A 2XCHA 3TIYA 1J1CA 1J7LA 5AWMA 3DJ5A 3HL7A 5CF8A 3Q5ZA 1YOMA 1ZAOA 3MA6A 4GJ3A 4ALWA 4IAYA 1ERKA 4BGHA 4CNHA 4ZSAA 4XMOA 5AP7A 3MFSA 1UV5A 3SVVA 4M0ZA 3ZUTA 5DH3A 1SVEA 4FV3A 4KD1A 3NS9A 2C6IA 3QKKA 3OY3A 3D5XA 4U6RA 2B9HA 4F70A 4QMYA 5AR3A 3HV6A 3P1AA 2R3HA 2JKQA 3KN5A 4PDPA 3VQHA 3EFJA 4H3QA 4LRMA 5CALA 4IM3A 3IKAA 3SXRA 3ZFXA 4NIFA 5AEPA 3QX2A 2PSQA 5HZNA 3C50A 3ORKA 4MF0A 3V5LA 5KKRB 1KSWA 3F9NA 2FSOX 4CCUA 1PF8A 3O7LB 5DT3A 2UW5A 3U6HA 5HICA 3QD3A 1SYKA 1GZ8A 3PXYA 4FKSA 5AR7A 1DI8A 1B6CB 2BRHA 3F5GA 3BHHA 5GNKA 4ZK5A 4JDIA 4ANBA 3KN6A 5KO1A 3V5JA 5AIKA 2XIZA 4EYJA 4YTHA 2WQEA 2B9FA 5EG3A 5H8BA 5HIDA 4IWQA 4A4OA 1I09A 3PXRA 3FQHA 4AT3A 1PMNA 3S00A 4FBXA 3TT0A 3G0FA 4FVQA 4YZMA 3LMHA 4JIKA 4EZ5A 4ZLZA 5HD4A 5HU3A 4RIYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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