5L97A

Crystal structure of baz2b bromodomain in complex with 3-amino-2-methylpyridine derivative 3
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Derivatives of 3-Amino-2-methylpyridine as BAZ2B Bromodomain Ligands: In Silico Discovery and in Crystallo Validation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5l97A00
4YH3A 3LQIA 4YATA 5DW2A 4PKLA 4MEQA 4PTBA 4QSUA 3O37A 4DONA 5FG5A 5E73A 4O75A 4NR8A 4YADA 3UV2A 4QEVA 5A5SA 5EGUA 3G0JA 5EP7A 5D3LA 5D3RA 5E9KA 3P5OA 4A9KA 2RFJA 5CQ8A 2DKWA 4QSQA 5KO4A 5CZGA 4CL9A 5E9YA 5CTLA 4NS5A 2YDWA 5E3GA 5EPBA 5F63A 5D3NA 4OGIA 4UIVA 4XY9A 4TYLA 5J0DA 5A7CA 5ENIA 5DKCA 3I3JA 3K2JA 4IR6A 4NR7A 4CURA 5L8UA 4Q0NA 4C67A 5EK9A 3U5OA 4O78A 5D25A 3DWYA 5BT3A 4XYAA 5F61A 2L85A 4IOOA 4QSWA 4ZW1A 5TCMA 4E96A 4TS8A 2E7NA 5I7XA 5C4QA 5FB0A 4BJXA 5EV9A 4Z93A 4IORA 5D3SA 5FE5A 2F6NA 5L98A 5I89A 5H85A 4N4IA 5IG6A 4QUUA 4HBYA 5A5NA 5DKHA 5EPRA 2RI7A 4NUCA 1F68A 5AMFA 4NR9A 4OGJA 4TU6A 4MR5A 4KV4A 4X2IA 5FE7A 4QC3A 2YELA 4CFKA 2I8NA 5E9VA 4XY8A 5CP5A 5CS8A 5CQ3A 4O74A 5D3TA 5EA1A 5HEMA 4CUSA 3HMFA 3MQMA 5HFQA 2GRCA 3GG3A 5DY7A 4BHWA 5LKZA 4QNSA 5LKXA 4Z6IA 2N9GA 4A9HA 2MJVB 4BW2A 4QYDA 5E0RA 4QSRA 3P1DA 4NR6A 4IR3A 4C66A 4YYGA 4NQNA 3SVFA 4LYWA 5CUGA 3S92A 5CGPA 4YYMA 4A9MA 5G4RA 1EQFA 4N4FA 3SVHA 4O76A 5LKUA 5DFBA 3MXFA 1N72A 4UYGA 5AMEA 3QZTA 3UV5A 4CUQA 5FE9A 2WP2A 4QC1A 3RCWA 4Q0OA 5EQ1A 4HXOA 5EVAA 4TZ2A 5FFYA 5D7XA 5FH6A 5IIDA 5BT5A 5FFWA 5F36A 4LDFA 5CUDA 2OSSA 5A83A 4O70A 5DYXA 4QZSA 2FSAA 4CFLA 5HM0A 3U5NA 4QBMA 5KHMA 5HCLA 1ZS5A 5E3DA 5EU1A 4UITA 5F5ZA 1WUGA 5FFVA 4NUDA 2L5EA 5CQ4A 3P1EA 4TT6A 1WUMA 4NYVA 5IGLA 5LUUA 5IGMA 5F62A 5FE3A 4NR5A 4CLBA 5H1UA 5LVRA 5CPEA 4QY4A 5JWMA 4O7AA 2I7KA 5EWVA 4XUAA 4Y03A 3U5KA 5HELA 5BT4A 2RO1A 4QR3A 5ENFA 5FE6A 5C87A 4O72A 5DBMA 4NRBA 4J3IA 2R0SA 4A9IA 2RNWA 3U5JA 5KTXA 5FB1A 5ETDA 5A81A 4A9EA 2YYNA 4A9OA 5C85A 3MB3A 4O77A 5ENCA 3O34A 5JI8A 4UIXA 4Z1QA 4A9NA 4TTEA 5HQ7A 2DATA 3QZSA 4PS5A 1E6IA 4NYWA 5FBXA 3HMEA 5ENEA 5FH7A 5F1LA 2KTBB 5F3AA 3S91A 4TZ8A 3UW9A 4QR4A 3U5MA 4YBTA 5CRZA 2L84A 5D0CA 3G0LA 3Q2FA 5CQ6A 3O33A 4ZC9A 2D9EA 3ONIA 5L8TA 4NR4A 4ALGA 4HXMA 4IOQA 3LXJA 3DAIA 4J0SA 2E7OA 3UV4A 5I88A 3O35A 3QZVA 4YYHA 4YK0A 4KCXA 4QYLA 5I40A 4HBVA 5E74A 4XUBA 4HXSA 4HXPA 5K29A 4NXJA 5D3JA 4LRGA 4LC2A 5I80A 4N4HA 5II2A 5I1QA 1X0JA 5L99A 3JVJA 2LSPB 5ENBA 4MR3A 2RNXA 1JM4B 4BW3A 4NRCA 5ACYA 5DKDA 4A9FA 5IGNA 4LYSA 5FG4A 4CUTA 4YBMA 5ETBA 4IR5A 3AQAA 5D3HA 4PCIA 5D26A 4YYKA 5D3PA 5I83A 4PY6A 2YW5A 4QSVA 2OUOA 2YEKA 2OO1A 5DFDA 4LZRA 2H60A 2RS9B 4YYIA 4UYHA 4YYNA 4UYFB 5C7NA 5CQ7A 5F25A 4PCEA 4YYJA 4YBSA 2D82A 2G4AA 4LR6A 5CRMA 5HENA 4QSSA 5CUBA 5EWWA 4Z6HA 4O7CA 5FG6A 3U5PA 4UYFA 4HXNA 5D24A 4ALHA 3FKMX 5A5OA 3D7CA 3O36A 5EICA 4YY4A 5HJCA 3UVXA 5F1HA 2WP1A 3TLPA 2R0YA 5ENHA 5HRWA 4WIVA 2RNYA 5DLXA 3LJWA 2YQDA 4FLPA 3NXBA 4O7FA 4AKNA 5HRXA 2R10A 4TU4A 4MENA 4A9LA 5I7YA 3JVKA 3U5LA 5COIA 4MR6A 5A5RA 5A82A 3LQHA 3IU6A 4HXRA 4LZ2A 5FE1A 4UYEA 2DVRA 5AD2A 4NUEA 5LVQA 4Z1SA 4KV1A 4UIYA 4QB3A 5E7DA 3HMHA 4QSTA 5LJ0A 3MUKA 5A5QA 5FE4A 4CUPA 5DLZA 5L97A 5FE0A 5HLSA 4N4GA 5E9MA 5AD3A 2DWWA 5CQAA 2F6JA 5I86A 3UVDA 5IBNA 3MB4A 4OUFA 4YY6A 5DFCA 5HRVA 3P1CA 5IGKA 5KU3A 5CUCA 4NQMA 4A9JA 5H1TA 5EISA 5L96A 5FDZA 4QR5A 4YC9A 3SVGA 5CQTA 5KTWA 5EWCA 5DW1A 4TQNA 5E9IA 3IU5A 5DX4A 5EWDA 4YYDA 4TT4A 3JVLA 4IR4A 5ENJA 4MEOA 5CQ5A 5C8GA 2YEMA 5DYAA 3UVYA 3LQJA 4RVRA 4QEWA 5LJ1A 4YABA 2DVVA 5H1VA 4UIUA 4ZQLA 5G4SA 5EWHA 5CY9A 4O71A 4HXKA 4O7BA 2DVSA 3MULA 4UIZA 4YAXA 4QSXA 5HFRA 5LJ2A 5II1A 5E9LA 5F60A 4WHWA 3AADA 4HBXA 3JVMA 4WHUA 4YH4A 5FE8A 5A5PA 2E3KA 4LZSA 4UIWA 4MEPA 2DVQA 4GPJA 5CU8A 4LYIA 5C89A 5FH8A 5CUEA 4J0RA 4BW4A 5CFWA 4J1PA 3P1FA 5LKTA 5A85A 5TB6A 4QEUA 5HQ5A 1JSPB 3Q2EA 4F3IA 4HXLA 4UYDA 4NRAA 3UVWA 4MR4A 5ENGA 5DYCA 5I29A 4BW1A 5EI4A 4QSPA 5DYUA 4TT2A 5CUAA 4NYXA 4N3WA 5EM3A 5EPSA 2NXBA 3ZYUA 2R0VA 5FE2A 5HQ6A 5F2PA 4QUTA 4HBWA 5KTUA 4CUUA 4O7EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YH3A 3LQIA 4YATA 5DW2A 4PKLA 4MEQA 4PTBA 4QSUA 3O37A 4DONA 5FG5A 5E73A 4O75A 4NR8A 4YADA 3UV2A 4QEVA 5A5SA 5EGUA 3G0JA 5EP7A 5D3LA 5D3RA 5E9KA 4AKIA 3P5OA 4A9KA 2RFJA 5CQ8A 4AKHA 2DKWA 4QSQA 5KO4A 5CZGA 4CL9A 5E9YA 5CTLA 4NS5A 2YDWA 5E3GA 5EPBA 5F63A 5D3NA 4OGIA 4UIVA 4XY9A 4TYLA 5J0DA 5A7CA 5ENIA 5DKCA 3I3JA 3K2JA 4IR6A 4NR7A 4CURA 5L8UA 4Q0NA 4C67A 5EK9A 3U5OA 4O78A 5D25A 3DWYA 5BT3A 4XYAA 5F61A 2L85A 4IOOA 4QSWA 4ZW1A 5TCMA 4E96A 4TS8A 2E7NA 5I7XA 5C4QA 5FB0A 4BJXA 5EV9A 4Z93A 4IORA 5D3SA 5FE5A 2F6NA 5L98A 5I89A 1ZKRA 5H85A 4N4IA 5IG6A 4QUUA 4HBYA 5A5NA 5DKHA 5EPRA 2RI7A 4NUCA 1F68A 5AMFA 4NR9A 4OGJA 4TU6A 4MR5A 4KV4A 4X2IA 5FE7A 4QC3A 2YELA 4CFKA 2I8NA 5E9VA 4XY8A 5CP5A 5CS8A 5CQ3A 4O74A 5D3TA 5EA1A 5HEMA 4CUSA 3HMFA 3MQMA 5HFQA 2GRCA 3GG3A 5DY7A 4BHWA 5LKZA 4QNSA 5LKXA 4Z6IA 2N9GA 4A9HA 2MJVB 4BW2A 4QYDA 5E0RA 4QSRA 3P1DA 4NR6A 4IR3A 4C66A 4YYGA 4NQNA 3SVFA 4LYWA 5CUGA 3S92A 5CGPA 4YYMA 4A9MA 5G4RA 1EQFA 4N4FA 3SVHA 4O76A 5LKUA 5DFBA 4AI6A 3MXFA 1N72A 4UYGA 5AMEA 3QZTA 3UV5A 4CUQA 5FE9A 2WP2A 4QC1A 3RCWA 4Q0OA 5EQ1A 4HXOA 5EVAA 4TZ2A 5FFYA 5D7XA 5FH6A 5IIDA 5BT5A 5FFWA 5F36A 4LDFA 5CUDA 2OSSA 5A83A 4O70A 5DYXA 4QZSA 2FSAA 4CFLA 5HM0A 3D1DA 3U5NA 4QBMA 5KHMA 5HCLA 1ZS5A 5E3DA 5EU1A 4UITA 5F5ZA 1WUGA 5FFVA 4NUDA 2L5EA 5CQ4A 3P1EA 4TT6A 1WUMA 4NYVA 5IGLA 5LUUA 5IGMA 5F62A 5FE3A 4NR5A 4CLBA 5H1UA 5LVRA 5CPEA 4QY4A 5JWMA 4O7AA 2I7KA 5EWVA 4XUAA 4Y03A 3U5KA 5HELA 5BT4A 2RO1A 4QR3A 5ENFA 5FE6A 5C87A 4O72A 5DBMA 4NRBA 4J3IA 2R0SA 4A9IA 2RNWA 3U5JA 5KTXA 5FB1A 5ETDA 5A81A 4A9EA 2YYNA 4A9OA 5C85A 3MB3A 4O77A 5ENCA 3O34A 5JI8A 4UIXA 4Z1QA 4A9NA 4TTEA 5HQ7A 2DATA 3QZSA 4PS5A 1E6IA 4NYWA 5FBXA 3HMEA 5ENEA 5FH7A 5F1LA 2KTBB 5F3AA 3S91A 4TZ8A 3UW9A 4QR4A 3U5MA 4YBTA 5CRZA 2L84A 5D0CA 3G0LA 3Q2FA 5CQ6A 3O33A 4ZC9A 2D9EA 3ONIA 5L8TA 4NR4A 4ALGA 4HXMA 4IOQA 3LXJA 3DAIA 4J0SA 3ERRA 2E7OA 3UV4A 5I88A 3O35A 3QZVA 4YYHA 4YK0A 4KCXA 4QYLA 5I40A 4HBVA 5E74A 4XUBA 4HXSA 4HXPA 5K29A 4NXJA 5D3JA 4LRGA 4LC2A 5I80A 4N4HA 5II2A 5I1QA 1X0JA 5L99A 3JVJA 3VKHA 2LSPB 5ENBA 4MR3A 2RNXA 1JM4B 4BW3A 4NRCA 5ACYA 5DKDA 4A9FA 5IGNA 4LYSA 5FG4A 4CUTA 4YBMA 5ETBA 4IR5A 3AQAA 5D3HA 4PCIA 5D26A 4YYKA 5D3PA 5I83A 4PY6A 2YW5A 4QSVA 2OUOA 2YEKA 2OO1A 5DFDA 4LZRA 2H60A 2RS9B 4YYIA 4UYHA 4YYNA 4UYFB 5C7NA 5CQ7A 5F25A 4PCEA 4YYJA 4YBSA 2D82A 2G4AA 4LR6A 5CRMA 5HENA 4QSSA 5CUBA 5EWWA 4Z6HA 4O7CA 5FG6A 3U5PA 4UYFA 4HXNA 5D24A 4ALHA 3FKMX 5A5OA 3D7CA 3O36A 5EICA 4YY4A 5HJCA 3D1BA 3UVXA 5F1HA 2WP1A 3TLPA 2R0YA 5ENHA 5HRWA 4WIVA 2RNYA 5DLXA 3LJWA 2YQDA 4FLPA 3NXBA 4O7FA 4AKNA 5HRXA 2R10A 4TU4A 4MENA 4A9LA 5I7YA 3JVKA 3U5LA 5COIA 4MR6A 3VKGA 5A5RA 5A82A 3LQHA 3IU6A 4HXRA 4LZ2A 5FE1A 4UYEA 2DVRA 5AD2A 4NUEA 5LVQA 4Z1SA 4KV1A 4UIYA 4QB3A 5E7DA 2EJNA 3HMHA 4QSTA 5LJ0A 3MUKA 5A5QA 5FE4A 4CUPA 5DLZA 5L97A 5FE0A 5HLSA 4N4GA 5E9MA 5AD3A 2DWWA 5CQAA 2F6JA 5I86A 3UVDA 5IBNA 3MB4A 4OUFA 4YY6A 5DFCA 5HRVA 3P1CA 5IGKA 5KU3A 5CUCA 4NQMA 4A9JA 5H1TA 5EISA 5L96A 5FDZA 4QR5A 4YC9A 3SVGA 5CQTA 5KTWA 5EWCA 5DW1A 4TQNA 5E9IA 3IU5A 5DX4A 5EWDA 4YYDA 4TT4A 3JVLA 4IR4A 5ENJA 4MEOA 5CQ5A 5C8GA 2YEMA 5DYAA 3UVYA 3LQJA 4RVRA 4QEWA 5LJ1A 4YABA 2DVVA 5H1VA 4UIUA 4ZQLA 5G4SA 5EWHA 5CY9A 4O71A 4HXKA 4O7BA 2DVSA 1PUOA 3MULA 4UIZA 4YAXA 4QSXA 5HFRA 5LJ2A 5II1A 5E9LA 5F60A 4WHWA 3AADA 4HBXA 3JVMA 4WHUA 4YH4A 5FE8A 5A5PA 2E3KA 4LZSA 4UIWA 4MEPA 2DVQA 4GPJA 5CU8A 4LYIA 5C89A 5FH8A 5CUEA 4J0RA 4BW4A 5CFWA 4J1PA 3P1FA 5LKTA 5A85A 5TB6A 4QEUA 5HQ5A 1JSPB 3Q2EA 4F3IA 4HXLA 4UYDA 4NRAA 3UVWA 4MR4A 5ENGA 5DYCA 5I29A 4BW1A 5EI4A 4QSPA 5DYUA 4AKGA 4TT2A 5CUAA 4NYXA 4N3WA 5EM3A 5EPSA 2NXBA 3ZYUA 2R0VA 5FE2A 5HQ6A 5F2PA 4QUTA 4HBWA 5KTUA 4CUUA 4O7EA
chains in the Genus database with same CATH topology
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