5L98A

Crystal structure of baz2b bromodomain in complex with 3-amino-2-methylpyridine derivative 4
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Derivatives of 3-Amino-2-methylpyridine as BAZ2B Bromodomain Ligands: In Silico Discovery and in Crystallo Validation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5l98A00
5IIDA 5CY9A 4MR4A 5CRMA 5I7YA 3P1CA 3JVJA 5LJ0A 4UIXA 4CUUA 5IGKA 4N3WA 5CQAA 4NRBA 5CQ6A 3QZTA 4TT2A 4MENA 4LYSA 4O78A 5ENCA 4J0SA 5JI8A 4YY4A 1E6IA 3UV5A 4CUTA 2DATA 5D3RA 4QY4A 5TB6A 4YYJA 5A5SA 4HXNA 4NR4A 5LKTA 4A9IA 4HBXA 5D0CA 5F1LA 4A9OA 4CUSA 5ACYA 3MULA 4UIZA 4CFLA 5I88A 4QEWA 4QSQA 4YY6A 5E7DA 3JVMA 4NS5A 5CPEA 5AD3A 5DKCA 5E74A 4MR5A 5II1A 5FDZA 4ZQLA 4QSTA 4TYLA 4TT4A 4TT6A 5A5RA 3Q2FA 3MQMA 5EPSA 5J0DA 3U5PA 3DWYA 5KTXA 4OUFA 3SVHA 4TU4A 4N4FA 5D26A 2R0VA 4YC9A 4O7FA 4TZ8A 3MB4A 5I80A 5HQ5A 4HXPA 5ENHA 3RCWA 5DKDA 5BT4A 4UITA 2E3KA 5ENEA 4YYGA 5G4SA 4IORA 5FB0A 4LZ2A 2DWWA 4O76A 3UVXA 5D3HA 3LQIA 4QC1A 2E7NA 5A81A 4QUTA 5DYAA 5CUGA 5CRZA 3TLPA 4NR6A 5KU3A 5FG4A 4LZRA 4QEUA 3NXBA 5DX4A 5HRWA 4NUDA 4YYNA 4BW1A 3U5OA 4NR8A 5H1TA 4PS5A 2LSPB 5A5OA 5HRXA 4O71A 2L84A 5D3NA 5A5QA 4LYWA 4J0RA 3Q2EA 3GG3A 4TU6A 5IG6A 3MUKA 5BT5A 4LZSA 4QSSA 4WHUA 1WUGA 2D82A 1JM4B 5C85A 5I40A 4OGIA 4XUBA 4BW2A 5EQ1A 3O34A 4HXLA 5CTLA 4IR3A 4UYEA 4YATA 2YQDA 4PKLA 4QEVA 4Y03A 4NR7A 5E3GA 4A9NA 4IOOA 5EV9A 5CUDA 2G4AA 4N4IA 3HMHA 4ZW1A 5LKZA 5EU1A 4YH4A 4QBMA 4QSWA 4QZSA 4J1PA 2YEKA 5EA1A 4KV1A 5DW1A 4A9HA 2MJVB 5F3AA 4WIVA 5FE4A 5FE3A 2YW5A 4NRCA 5AMEA 5FFYA 5FH7A 5A5NA 4BHWA 5CUCA 1JSPB 4HBVA 5HQ7A 5F1HA 5KHMA 4O7EA 5F62A 1X0JA 5FBXA 3U5JA 5G4RA 4HXKA 5IBNA 3ZYUA 5F25A 5ETDA 5DFDA 5LUUA 5CQTA 5E9LA 2OUOA 5L99A 5E9YA 5LJ1A 5DLZA 2E7OA 3U5LA 3O37A 5DYXA 2YELA 5DLXA 4E96A 4J3IA 4QSRA 3ONIA 3LXJA 3P1FA 5F60A 4ALHA 5EPBA 2GRCA 4LR6A 5CQ7A 3G0LA 4ZC9A 5LVQA 5I83A 3AADA 5KO4A 5C8GA 5COIA 5DBMA 4NR9A 2F6JA 3LQHA 2RS9B 5CZGA 4OGJA 3P5OA 5DY7A 3UW9A 4O74A 4TQNA 5D25A 5FE8A 3SVGA 3P1DA 5F5ZA 3O36A 4LDFA 2R0SA 4NUCA 3UVYA 5HELA 4CUQA 4YK0A 5A7CA 2RNYA 5L8UA 5EICA 4UIVA 4HXOA 5EWVA 4KV4A 5D3TA 1N72A 5CUAA 5FH6A 3UV4A 4CLBA 4N4HA 3G0JA 4UYGA 2KTBB 2R10A 3JVKA 5C4QA 5C89A 4UIUA 4MR6A 5A82A 4QSPA 4TZ2A 5DFBA 4C66A 4YYHA 5ENJA 4HXMA 5I1QA 4IOQA 4YAXA 5F61A 5HCLA 5H85A 4TTEA 4QC3A 5EPRA 2I8NA 4MR3A 2DVSA 4GPJA 5FE9A 4MEPA 5FE1A 4CUPA 2DVVA 4NQMA 5CU8A 5H1VA 3UVWA 4YBMA 4YYMA 5CQ5A 5HQ6A 2WP2A 4YYDA 4UYFB 5HFRA 4UYHA 5HFQA 5CS8A 5FG5A 4NYVA 5CQ8A 5ENFA 4YYKA 4PCEA 4QNSA 3FKMX 4BJXA 2N9GA 3IU5A 5ENIA 2RI7A 4QR4A 4IR5A 4QUUA 5HJCA 5LJ2A 4PTBA 4IR4A 5E73A 4CL9A 4PCIA 2OSSA 4O77A 5FH8A 3UV2A 1F68A 3U5MA 5EM3A 4XY9A 3O33A 5A83A 4C67A 5CUEA 5CUBA 4ALGA 5FE0A 2OO1A 3IU6A 4UYDA 4QB3A 4HXRA 5A5PA 4YABA 5D3SA 4A9LA 4BW3A 5K29A 4QSUA 3U5KA 4MEOA 4O7CA 4BW4A 4Z6IA 4O70A 4N4GA 3AQAA 5HENA 5FG6A 5I29A 5LKUA 4Z1SA 4TS8A 4QR5A 3QZVA 2D9EA 2L5EA 4CFKA 4DONA 4YADA 3K2JA 4LC2A 5EGUA 5HEMA 4NUEA 5EP7A 4PY6A 4NRAA 5H1UA 4Z1QA 5L98A 4CURA 4UIWA 4NXJA 4Q0NA 2L85A 4HXSA 5D24A 5EWHA 3SVFA 4HBWA 5E9IA 4O7BA 4O7AA 4A9EA 3JVLA 5HM0A 5C87A 5HRVA 4KCXA 5KTUA 3P1EA 5E9MA 2NXBA 5EVAA 2FSAA 5F36A 1EQFA 4QSVA 5II2A 3LQJA 5FFWA 4X2IA 5FFVA 3DAIA 3MXFA 5CQ4A 4A9FA 4LYIA 3QZSA 5I86A 5L97A 5D3PA 5FE6A 5BT3A 3O35A 4Q0OA 5IGLA 3U5NA 4XY8A 3S91A 4HBYA 4MEQA 5AD2A 5L96A 4Z6HA 2YYNA 5IGNA 5D3LA 5I89A 5FE5A 4O75A 4Z93A 3D7CA 5EWCA 2YDWA 3UVDA 4F3IA 4A9MA 5FE2A 4WHWA 2RNXA 4FLPA 5F2PA 4YYIA 4IR6A 5FE7A 4NYXA 5DYUA 4QYLA 5EWWA 4A9JA 4RVRA 5C7NA 2DVQA 5ETBA 4O72A 4YBSA 2H60A 4QSXA 5CP5A 5CGPA 1WUMA 5DKHA 2RO1A 3MB3A 2I7KA 5I7XA 4XYAA 4UYFA 5AMFA 4AKNA 5LVRA 5FB1A 5ENBA 4YH3A 2F6NA 5CFWA 2WP1A 3I3JA 5CQ3A 5IGMA 3HMFA 4QYDA 5D3JA 4XUAA 4LRGA 5E9KA 5DW2A 5EWDA 4A9KA 5L8TA 1ZS5A 5EI4A 2YEMA 5F63A 4NYWA 4NQNA 3LJWA 5D7XA 5KTWA 3HMEA 2R0YA 4NR5A 3S92A 5E3DA 5TCMA 2RFJA 4UIYA 5DYCA 4YBTA 5ENGA 5EK9A 2DKWA 5JWMA 2DVRA 4QR3A 5DFCA 5EISA 5LKXA 5A85A 5E9VA 5HLSA 5E0RA 2RNWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IIDA 5CY9A 4MR4A 5CRMA 5I7YA 3P1CA 3JVJA 5LJ0A 4UIXA 4CUUA 5IGKA 4N3WA 5CQAA 4NRBA 5CQ6A 3QZTA 4TT2A 4MENA 4LYSA 4O78A 5ENCA 4J0SA 5JI8A 4YY4A 1E6IA 3UV5A 4CUTA 2DATA 5D3RA 4QY4A 5TB6A 4YYJA 5A5SA 4HXNA 4NR4A 5LKTA 4A9IA 4HBXA 5D0CA 5F1LA 4A9OA 4CUSA 5ACYA 3MULA 4UIZA 4CFLA 5I88A 4QEWA 4QSQA 4YY6A 5E7DA 3JVMA 4NS5A 5CPEA 5AD3A 5DKCA 5E74A 4MR5A 5II1A 5FDZA 4ZQLA 4QSTA 4TYLA 4TT4A 4TT6A 5A5RA 3Q2FA 3MQMA 5EPSA 5J0DA 3U5PA 3DWYA 5KTXA 4OUFA 3SVHA 4TU4A 4N4FA 5D26A 2R0VA 4YC9A 4O7FA 4TZ8A 3MB4A 5I80A 5HQ5A 4HXPA 5ENHA 3RCWA 5DKDA 5BT4A 4UITA 2E3KA 5ENEA 4YYGA 5G4SA 4IORA 5FB0A 4LZ2A 2DWWA 4O76A 3UVXA 5D3HA 3LQIA 4QC1A 2E7NA 5A81A 4QUTA 5DYAA 5CUGA 5CRZA 3TLPA 4NR6A 5KU3A 5FG4A 4LZRA 4QEUA 3NXBA 5DX4A 5HRWA 4NUDA 4YYNA 4BW1A 3U5OA 4NR8A 5H1TA 4PS5A 2LSPB 5A5OA 5HRXA 4O71A 2L84A 5D3NA 5A5QA 4LYWA 4J0RA 3Q2EA 3GG3A 4TU6A 5IG6A 3MUKA 5BT5A 4LZSA 4QSSA 4WHUA 1WUGA 2D82A 1JM4B 5C85A 5I40A 4OGIA 4XUBA 4BW2A 5EQ1A 3O34A 4HXLA 5CTLA 4IR3A 4UYEA 4YATA 2YQDA 4PKLA 4QEVA 4Y03A 4NR7A 5E3GA 4A9NA 4IOOA 5EV9A 5CUDA 2G4AA 4N4IA 3HMHA 4ZW1A 5LKZA 5EU1A 4YH4A 4QBMA 4QSWA 4QZSA 4J1PA 2YEKA 5EA1A 4KV1A 5DW1A 4A9HA 2MJVB 5F3AA 4WIVA 5FE4A 5FE3A 2YW5A 4NRCA 5AMEA 4AKHA 5FFYA 5FH7A 5A5NA 4BHWA 5CUCA 1JSPB 4HBVA 5HQ7A 5F1HA 5KHMA 4O7EA 5F62A 1X0JA 5FBXA 3U5JA 5G4RA 4HXKA 5IBNA 3ZYUA 5F25A 5ETDA 5DFDA 5LUUA 5CQTA 5E9LA 3VKGA 2OUOA 5L99A 5E9YA 5LJ1A 5DLZA 2E7OA 3U5LA 3O37A 5DYXA 3VKHA 2YELA 5DLXA 4E96A 4J3IA 4QSRA 3ONIA 3LXJA 4AKGA 3P1FA 5F60A 4ALHA 5EPBA 2GRCA 4LR6A 5CQ7A 3G0LA 4ZC9A 5LVQA 5I83A 3AADA 5KO4A 5C8GA 5COIA 5DBMA 4NR9A 2F6JA 3LQHA 2RS9B 5CZGA 4OGJA 3P5OA 5DY7A 3UW9A 4O74A 4TQNA 3D1DA 5D25A 5FE8A 3SVGA 3P1DA 5F5ZA 3O36A 4LDFA 2R0SA 4NUCA 3UVYA 5HELA 4CUQA 4YK0A 5A7CA 2RNYA 5L8UA 5EICA 4UIVA 4HXOA 5EWVA 4KV4A 5D3TA 1N72A 5CUAA 5FH6A 3UV4A 4CLBA 4N4HA 3G0JA 4UYGA 2KTBB 2R10A 3JVKA 5C4QA 5C89A 4UIUA 4MR6A 5A82A 4QSPA 4TZ2A 5DFBA 4C66A 4YYHA 5ENJA 4HXMA 5I1QA 4IOQA 4YAXA 5F61A 5HCLA 5H85A 4TTEA 4QC3A 5EPRA 2I8NA 4MR3A 2DVSA 4GPJA 5FE9A 4MEPA 5FE1A 4CUPA 2DVVA 4NQMA 5CU8A 5H1VA 3UVWA 4YBMA 4YYMA 5CQ5A 5HQ6A 2WP2A 4YYDA 4UYFB 5HFRA 4UYHA 5HFQA 1ZKRA 5CS8A 5FG5A 4NYVA 5CQ8A 3ERRA 5ENFA 4YYKA 4PCEA 4QNSA 4AI6A 3FKMX 4BJXA 2N9GA 3IU5A 5ENIA 2RI7A 4QR4A 4IR5A 4QUUA 5HJCA 5LJ2A 4PTBA 4IR4A 5E73A 4CL9A 4PCIA 2OSSA 4O77A 5FH8A 3UV2A 1F68A 3U5MA 5EM3A 4XY9A 3O33A 5A83A 4C67A 5CUEA 5CUBA 4ALGA 5FE0A 2OO1A 3IU6A 4UYDA 4QB3A 4HXRA 5A5PA 4YABA 5D3SA 4A9LA 4BW3A 5K29A 4QSUA 3U5KA 4MEOA 4O7CA 4BW4A 3D1BA 4Z6IA 4O70A 4N4GA 3AQAA 5HENA 5FG6A 5I29A 5LKUA 4Z1SA 4TS8A 2EJNA 4QR5A 3QZVA 2D9EA 2L5EA 4CFKA 4DONA 4YADA 3K2JA 4LC2A 5EGUA 5HEMA 4NUEA 5EP7A 4PY6A 4NRAA 5H1UA 4Z1QA 5L98A 4CURA 4UIWA 4NXJA 4Q0NA 2L85A 4HXSA 5D24A 5EWHA 3SVFA 4HBWA 5E9IA 4O7BA 4O7AA 4A9EA 3JVLA 5HM0A 5C87A 5HRVA 4KCXA 5KTUA 3P1EA 5E9MA 2NXBA 5EVAA 2FSAA 5F36A 1EQFA 4QSVA 5II2A 3LQJA 5FFWA 4X2IA 5FFVA 3DAIA 3MXFA 5CQ4A 4A9FA 4LYIA 3QZSA 5I86A 5L97A 5D3PA 5FE6A 5BT3A 3O35A 4Q0OA 5IGLA 3U5NA 4XY8A 3S91A 4HBYA 4MEQA 5AD2A 5L96A 4Z6HA 2YYNA 5IGNA 5D3LA 5I89A 5FE5A 4O75A 4Z93A 3D7CA 5EWCA 2YDWA 3UVDA 4F3IA 4A9MA 5FE2A 4WHWA 2RNXA 4FLPA 5F2PA 4YYIA 4AKIA 4IR6A 5FE7A 4NYXA 5DYUA 4QYLA 5EWWA 4A9JA 4RVRA 5C7NA 2DVQA 5ETBA 4O72A 4YBSA 1PUOA 2H60A 4QSXA 5CP5A 5CGPA 1WUMA 5DKHA 2RO1A 3MB3A 2I7KA 5I7XA 4XYAA 4UYFA 5AMFA 4AKNA 5LVRA 5FB1A 5ENBA 4YH3A 2F6NA 5CFWA 2WP1A 3I3JA 5CQ3A 5IGMA 3HMFA 4QYDA 5D3JA 4XUAA 4LRGA 5E9KA 5DW2A 5EWDA 4A9KA 5L8TA 1ZS5A 5EI4A 2YEMA 5F63A 4NYWA 4NQNA 3LJWA 5D7XA 5KTWA 3HMEA 2R0YA 4NR5A 3S92A 5E3DA 5TCMA 2RFJA 4UIYA 5DYCA 4YBTA 5ENGA 5EK9A 2DKWA 5JWMA 2DVRA 4QR3A 5DFCA 5EISA 5LKXA 5A85A 5E9VA 5HLSA 5E0RA 2RNWA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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