5LDZA

Quadruple space group ambiguity due to rotational and translational non-crystallographic symmetry in human liver fructose-1,6-bisphosphatase
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
331
structure length
311
Chain Sequence
PFDTDVNTLTRFVMEEGTGELTQLLNSLCTAVKAISSAVRKAGIAHKKLDVLSNDLVMNMLKSSFATCVLVSEEDKHAIIVEPEKRGKYVVCFDPLDGSSNIDCLVSVGTIFGIYRKKSTDEPSEKDALQPGRNLVAAGYALYGSATMLVLAMDCGVNCFMLDPAIGEFILVDKDVKIKKKGKIYSLNEGYARDFDPAVTEYIQRKKFPPDNSAPYGARYVGSMVADVHRTLVYGGIFLYPANKKSPNGKLRLLYECNPMAYVMEKAGGMATTGKEAVLDVIPTDIHQRAPVILGSPDDVLEFLKVYEKHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Quadruple space-group ambiguity owing to rotational and translational noncrystallographic symmetry in human liver fructose-1,6-bisphosphatase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-1,6-bisphosphatase 1
total genus 100
structure length 311
sequence length 331
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 3.1.3.11: Fructose-bisphosphatase.
pdb deposition date 2016-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00316 FBPase Fructose-1-6-bisphosphatase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.540.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Fructose-1,6-Bisphosphatase; Chain A, domain 1 Fructose-1,6-Bisphosphatase, subunit A, domain 1 5ldzA01
3.40.190.80 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 5ldzA02
1NV5A 3RYDA 5F24A 1RDYA 1XI6A 3KC0A 1FTAA 2Q74A 3D1RA 5DW8A 5ET7A 1NV0A 2FIXA 1FPJA 1FBFA 1FBHA 2QVRA 5EQ9A 4HE1A 1NV4A 2F3BA 5EYGA 2JJKA 1FJ9A 4QXDA 4GWWA 1IMBA 1KA0A 1LBZA 2CZHA 1FBCA 4G61A 3RPLB 2QFLA 1Q9DA 4FBPA 3FBPA 4H45A 4GWSA 5ET8A 4GX4A 1DBZA 2GQ1A 3IFCA 5FBPA 1FPBA 5EYHA 4GX6A 5J16A 1NV7A 1LBWA 2P3NA 2FVZA 1NV6A 1KA1A 4GBWA 4MJOA 3RPLA 2DDKA 3ROJA 1LEVA 1RDZA 4AS4A 1DCUA 1KZ8A 5T3JA 2CZKA 1FPDA 1FPFA 3KBZA 1FPIA 1LBYA 2OWZA 1K9YA 2FBPA 5EQ7A 1YYZA 2WBDA 2PCRA 2HHMA 3A29A 4HE2A 1EYKA 1FPEA 2OX3A 1YZ0A 2R8TA 2VT5A 5LDZA 2Y5LA 5ET6A 4GWXA 1RDXA 1QGXA 1IMAA 4H46A 1EYJA 1NUWA 5I3SA 1FBPA 3KC1A 4HXVA 4I3YA 1FPGA 2QVUA 5ET5A 1NV2A 1NV3A 3LUZA 1FSAA 1D9QA 1JP4A 1NV1A 2BJIA 4I40A 1FPLA 4N81A 1CNQA 1LBXA 3T0JA 1FRPA 1NUZA 4GX3A 1IMEA 4IR8A 4GWYA 1EYIA 5IZ1A 2FHYA 2FIEA 4GWUA 2Y5KA 3QMFA 3IFAA 1IMFA 4KXPA 1FBEA 4HE0A 5IZ3B 1G0IA 1NUXA 5A5LA 1FJ6A 1NUYA 3BIHA 3BIGA 1DK4A 4I3EA 1NI9A 2CZIA 1LBVA 1SPIA 2WEFA 2WBBA 3B8BA 1IMDA 1INPA 2Q8MA 1YXIA 1BK4A 2QVVA 4O7IA 5EQ8A 1IMCA 1FBGA 4AS5A 5EQAA 1AWBA 1FPKA 4GWZA 5IZ3A 1FBDA 1VDWA 1G0HA 2F3DA 1K9ZA 3LV0A 4PTKA 5ESYA 4GBVA 2P3VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DTBA 3KC0A 4DXUA 4ECFA 2Q74A 1I69A 4MLQA 1IEJA 2QVRA 2RC8A 3K0VA 4HE1A 1BP5A 3QSLA 5IM2A 3G3KA 4QSDA 3OEKA 4QFKA 5CRYA 5H8HA 3IB0A 3U94A 3UORA 2GQ1A 2NXOA 3SETA 3R7XA 3RPWA 1MY0A 3K2DA 1DPEA 1NV6A 1UTBA 3ROJA 3Q28A 3VVFA 1YAEA 4O94A 2OZZA 4NF0A 5AA3A 3SEUA 2V3TA 3H06B 3LUYA 4LUBA 4G8NA 4YMBA 3NOHA 3PMWA 4MMPA 4RXLA 5JK4A 3FZVA 4JWXA 3U65A 2W7YA 3V8XB 3ISPA 3MVWA 1R6ZA 2KR0A 3DP8A 3H7MA 4YB6A 5ET5A 1Y1ZA 3HHGA 1VFEA 3E78A 4GQOA 3FVKA 3T66A 3CR9A 5I2KA 1A55A 2DWIA 5HM4B 2P0SA 2Z8EA 1FCKA 3Q27A 3LBSA 2ZZXA 5CMMA 4X04A 4FEDA 2XXQA 4QSEA 3N5LA 4C1TA 4PC9A 5KDTB 4OESA 3VE1B 2OWSA 4NWCA 3PMXA 2VGQA 3OO9A 4PF6A 4G4PA 2CMOA 1DOTA 2QS4A 1ZLQA 2Y7PA 5EQ8A 1JVYA 3E3KA 4JBZA 4AB5A 4EQBA 4KHZE 4NG7A 4F3GA 3SEWA 3M8UA 2IEEA 2AYSA 1A40A 3TQLA 2GHAA 2L5VA 4OVSA 4TOZA 1ZJLA 4OMBA 3V89B 1IMBA 2RF1A 4PETA 5AA2B 3RNNA 3QUJA 3BKIB 4MCOA 3OSQA 3CG1A 1KA1A 1VSOA 4BLAA 3KSXA 1RDZA 3EHSA 1MG1A 2HPGA 2DWAA 4GL8A 3OD7A 4FECA 3CI8A 1L5TA 4F3BA 2QSXA 3DP6A 5TP9A 4U1OA 4YZZA 2PCRA 4NF8A 1CE2A 1B58A 4UABA 2R6GE 4GXSB 4QFLA 3PPNA 4NEDA 1GGGA 3KBRA 3BBRA 3TKDA 4Z0IA 1H44A 3KG2A 1B1HA 1CB6A 4MNCA 3G3FA 3N6UA 5L9MA 4NAPA 4HCWA 4HE0A 4DLDA 1FJ6A 1A7LA 2ABHA 4Q5TA 4ISUA 1NI9A 2OBGA 3FV2A 1H43A 2DXYA 4DE8A 4XKPA 2I49A 3LSXA 4N07A 4XKNA 5ELVA 4PTKA 1G0HA 2ALUA 3B7DA 4LZ5A 3RYDA 3W9WA 1JW1A 2D21A 1ZTYA 2G93A 5DW8A 2O6AA 3FVGA 5H8HB 1H76A 3IOUA 4N91A 3C31A 4PFWA 3RT6B 4I62A 4QXDA 4GWWA 1IXHA 1US4A 1LFGA 1LBZA 1UTBB 3DLNA 3MVYA 4EDPA 4ELRA 4LQ5A 4PAFA 1Q9DA 4U21A 2F8DA 1DBZA 3EQ1A 4EQ9A 3MW0A 4GBWA 2Z22A 1LEVA 1DCUA 1N7WA 1GVCA 1B0HA 2V25A 2CZKA 2ZZWA 3KBZA 4E0WA 1ATGA 5EQ7A 3R6UA 4F2OA 1YZ0A 5I2KB 4THIA 5ET6A 1SDXA 2OJTA 3N94A 1J1NA 4ZEDA 1EYJA 5AA1A 4PGPA 4F31B 1UTHB 1NV2A 2Z23A 3FJMA 3KJTA 4PFIA 1LB9A 3IOTA 1QKBA 2ZXTA 2F36A 3FGSA 2DS9A 2VHAA 2I3WA 1B3FA 1I6AA 3CVGA 2DVZA 1LCTA 4NF5A 4IB2A 1XT8A 2Y7RA 4ZEBA 3OENA 1B4ZA 3P7IA 2OLBA 2WEFA 4KYEA 4LA9A 1OLAA 3N26A 4EUOA 1NV5A 1RDYA 1MXWA 1XI6A 2O68A 3L6HA 5JEIA 1NV0A 5CBSA 5AE4A 2QMXA 5L9SA 4R2FA 1D9VA 1MPCA 2VP1A 4ESWA 4F1VA 3B50A 4G77A 3Q29A 1FBCA 2XA5A 1NL5A 1ANFA 4OENA 3FVNA 1EZ9A 4LZ7A 5LOMA 3IOVA 1XOCA 4DXCA 1DPPA 1LBWA 5TP9B 4PDHA 1PC3A 4OANA 4GWOA 2Y84A 1ZKBA 4AS4A 1POTA 2H5YA 4H0WA 2H4IA 3TCFA 1GR2A 5L8DA 4O8MA 4P0GA 1YYZA 2O1MA 3ILTB 1USYH 4XTCQ 3ILUB 1MDP1 4IY6A 3U8QA 3FJGA 3KZGA 2VPNA 3V5AA 4KD5A 1D4NA 1D9YA 5CMKA 3K01A 3KFMA 3VXBA 3IAZA 4GWYA 3WAFA 3OELA 1AOVA 2XD3A 3Q25A 3KGCA 2ZYKA 4GXAA 3O6GA 3KJ7A 3IB1A 1INPA 2Q2CA 4KQPA 1IIWA 4OVJA 2XD2A 3CSBA 3U72A 1OVBA 2I4CA 3GZGA 2XXTA 3MQ9A 4NQ8A 5K2YA 2I48A 4H5FA 4HCYA 1BTJA 4MNIA 2QS1A 3E13X 4OEUA 1R9LA 4POXA 1JNFA 3K1PA 3O66A 5KDTA 2DQVA 2GHBA 4OVRA 1N84A 3PU5A 3MP8A 2Z8DA 4MAGA 2PBWA 2DSFA 1NV7A 2HAUA 1MH3A 3O9PA 2OWTA 1H45A 4KI0E 4NWDA 1NNTA 3RN8A 1LAFE 3T22A 1Q35A 2O7IA 4PGNA 2QL3A 4GWXA 1PBQA 5K2XA 5M2VA 1MXVA 3BFTA 3H6VA 3FXQA 1P1NA 2HZLA 2F35A 1SI0A 2F5XA 4NF5B 4RPNA 3K6WA 2VPOA 1A54A 3UN6A 4MF3A 5KCJA 3O29A 4KXPA 1FBEA 2Y7KA 4PBQA 1NUYA 1MQDA 1QUIA 3SEVA 1OVTA 1DK4A 2Y7IA 2DE2A 2XWIA 4P56A 4OQOA 1S7YA 3OOAA 2ANJA 1FPKA 4GWZA 3VVEA 5IZ3A 3H6TA 4LN5A 5I84A 1QUKA 5IKBA 4PP0A 3CSGA 3U92A 2Q8JA 3QAXA 3B6QA 3R26A 5A5XA 1F9BA 1QULA 1URSA 2F97A 3TTKA 2ZNTA 4QFOA 1A8EA 1LLSA 1EZOA 1KA0A 2XXXA 3W15C 3OEMA 4YICA 4O3BA 1ZMGA 2F34A 1MY4A 4GWSA 3EPEA 1NFTA 1YCJA 3C9HA 2DE3A 4U1ZA 4GX6A 3MUQA 1FW0A 4X8RA 4N17A 2QS2A 1URGA 5T3JA 1BIYA 1MY3A 1JETA 2UVHA 4X1DA 4DI4B 3TTLA 3H6UA 1VR5A 3SERA 3O6IA 4N13A 4YKJA 3C35A 3KC1A 1AL3A 3OXNA 1B7HA 1FSAA 3OSRA 1JP4A 2ESNA 3QUFA 1M5DA 1VFDA 3C4MA 4MFIA 3TELA 2FA7A 3EN3A 2PFZA 3K4UA 5DVIA 2DWHA 4OFLA 5EHMA 1NNFA 2DYXA 3H3GA 1R9QA 1N3XA 3VFJA 4MEVA 2UVIA 3HO7A 2XHDA 1SPIA 2RCBA 3OO6A 3KOTA 3T9VA 4BDQA 3U93A 5IZZA 1OLCA 4F18A 4OZ9A 1B5IA 3D4GA 4IO2A 4ELQA 5FTIA 1TWYA 1Y3QA 4PF8A 2DOJA 1UTHA 4OVTA 1MDQA 3O2AA 5EQ9A 4KYDA 5EYGA 3IO6A 1SD3A 3RQTA 4C0RA 4LONB 3FBPA 2UYFA 4DZ1A 5HBCA 4BDNA 4RK2A 4N4UA 3PGFA 4ND9A 2UYEA 1FQBA 1TFAA 2FYIA 1FPFA 3MVXA 1N04A 4OTEA 1B3GA 1QUJA 2XX7A 3F11A 4JVCA 1B52A 3K1MA 2UVGA 4O3AA 2V84A 4I9DA 1Y1MA 3HHFA 5KCJB 4I3YA 1FPGA 4G8MA 4O3CA 4OFJA 4F19A 1N0TA 1PB8A 5B70A 1B5JA 4R6HA 1FTJA 1NH8A 2PT1A 5IZ1A 1MXZA 1B1XA 1RKMA 2B4MA 4I1DA 1FQAA 2WYKA 3KEIA 3W9VA 5IZ3B 5ICQA 1MM6A 1NUXA 3JYRA 3VVDA 1TT1A 4WXJA 4XXUA 1EZPA 3LR1A 4FJPA 3GYYA 2A5TA 3HPIA 3MZ1A 5A5XB 2NUVA 1YXIA 1OQHA 1BK4A 1IMCA 3A09A 5AA4A 1MQGA 3G3HA 3S9MC 4NHBA 4N6DA 3S9EA 4POWA 4F1YA 4M1VA 2DWJA 4ZZAA 4YB5A 2XWVA 2F3BA 4E0XA 3KOSA 4GLIA 4F39A 4G61A 2O51A 4NE4A 4Q30B 4H45A 1Y3PA 4U4SA 1S9TA 3IJOB 5FHOA 4OWDA 4Q8RA 2P3NA 4N6KA 3K00A 2ONKE 1I6QA 3FASA 4X9TA 5I7IA 2X26A 4AQ4A 2PT2A 4UACA 4OETA 1LBYA 3SZPA 2FBPA 2PFYA 3N6TA 3TODA 2XXWA 5IAIA 2Y5LA 4DIGA 3E4RA 3FXBA 3RLFE 2QVUA 4HW8A 1NV3A 1N7XA 4GD5A 3FJ7A 2HZKA 4R6YA 1IMEA 1B51A 4DDDA 3K6UA 4P3LA 1H3DA 5A5LA 3K1NA 4WEPA 4PCDA 3LSLA 4DI3D 3B8BA 1IMDA 1MXUA 4RY1A 1FBGA 5J1DA 5KZTA 3FXUA 1FBDA 4RK9A 1VDWA 5ESYA 2NOOA 4H8JA 4LQ2A 5IGAA 2NWJA 4PE5B 3QYTA 1Z7NE 2AIXA 2I4BA 3H03A 1MQJA 4PAKA 5HPQA 3IOWA 1SW2A 4R9GA 1S50A 4N15A 2DE4A 2I6EA 4ZE9A 5CBRA 2REGA 4PE3A 2M8CA 1P1UA 4DXBA 4ZDMA 2D3IA 1LGBC 3G7WA 1MXYA 4NGUA 5F7VA 1SQYA 3T93B 2BJJX 4GRKA 2Y7WA 1US5A 3PMVA 1ZBMA 3PTYA 1FPDA 3RTWB 1K9YA 1O63A 2WBDA 2HHMA 3A29A 1EYKA 1FPEA 1B4HA 3RUMA 1PB7A 2B65A 3SESA 1JW5A 2A5SA 3HCQA 2V3QA 3MPKA 1FBPA 2F78A 4JVIA 2VD3A 4KYSA 4NX1A 1NV1A 4IO4A 2HXWA 2BJIA 4R2BA 1NUZA 4WEDA 2DVCA 2HEUA 4JWYA 3HFUA 5JTYA 2A5TB 1DTZA 3VLVA 4XIGQ 4MBPA 1N76A 1P1OA 1QKAA 5AA4B 4FIMA 3BIGA 5DEXA 2F7BA 2V3UA 2I0CA 4OHNA 4QBAA 4OA4A 1BLFA 4RNSA 2Q8MA 1MXXA 5EQAA 4ELOA 3LV0A 2FNCA 2LAOA 3GXAA 2HAVA 2X7QA 3IORA 3AXFA 3CIJA 3I6VA 3E9XA 4IGTA 1NV4A 3JV9A 3RTFB 3O97A 1XVYA 3A3UA 2O1LA 4G68B 4FBPA 4AB6A 3VLUA 2B4LA 2Z8FA 3HV1A 1WODA 4U22A 5FBPA 3PUVE 4H6DA 1XHYA 4I8CA 4R73A 4GIZA 4P1EA 1NKXA 1MY1A 4MJOA 3CHGA 5I58A 3RPLA 1JEVA 2F6PA 3MWBA 3C34A 1KZ8A 4G8HA 2O69A 3PPPA 2WKYA 5L9OA 1XS5A 4FEBA 2XXRA 3M3LA 4FAJA 3B6WA 1RYOA 4NMYA 4MHFA 4G68C 4P47A 1JW4A 1ZU0A 1JVXA 2OX3A 1N3WA 5I59A 1AMFA 1IXIA 4OYVA 1D3KA 1YPNA 1SW5A 5I56A 2V93A 4P11A 2PVUA 3TAJA 2H99A 3EHTA 2HQ0A 3TPAA 2GH9A 3FXRA 2ZMBA 4MX6A 3K02A 3LC8A 5DVJA 1UQWA 3MZBA 3VV5A 3PPRA 3PUYE 2XX8A 2PYYA 2PMSA 1QVSA 3EHUA 1B7UA 4L17A 3SDFA 3PUXE 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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