5LJWA

Mamk non-polymerising a278d mutant bound to amppnp
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
GEGQAKNRLFLGVDLGTSHTAVMSSRGKKFLLKSVVGYPKDVIGLKLLGRPYVVGDEAFEMRSYLDIRYPLQDGVLSEISDRDIEVARHLLTHVVKSAEPGPNDEICAVIGVPARASAANKALLLKMAQEVVHTALVVSEPFMVGYGLDKLINTIIVDIGAGTTDICALKGTVPGPEDQVTLTKAGNYVDERLQNAILERHPELQMNVNVACAVKEQFSFVGTPTEVASFEFRAAGKPVRADVTEPVKIACEALMPDIIESIETLLRSFQPEYQDTVLQNIVFAGGGSRIRGLAAYVKEKLRPFGDANVTCVKDPTFDGCRGALRLAEELP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like ATPase
publication title X-ray and cryo-EM structures of monomeric and filamentous actin-like protein MamK reveal changes associated with polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Magnetospirillum magneticum amb-1
molecule tags Hydrolase
total genus 106
structure length 331
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljwA02
1NGFA 4BRHA 1D4XA 4A2AA 3CJ7A 4RCHA 3EL2A 5AFUA 3GDQA 3VGMA 4H5RA 2E2OA 5AQWA 3C0BA 4BQLA 3CHWA 3SK3A 3FZFA 2FLOA 3GG4A 4FPBA 5F0XA 2P9PA 3ZX0A 5AQGA 5E26A 3WUHA 4BGBA 4H03B 5KPTA 1ATNA 3TPQA 5AQNA 4K42A 3SMSA 1V4SA 5E84A 1BA1A 3O08A 1E4FT 4QS7A 5AQUA 2CGKA 1U6ZA 3SLCA 3M6GA 1NGCA 1ESVA 3TU5A 4BRFA 4BREA 1HLUA 3H1VX 4BRCA 1TUUA 1RGIA 2P9LA 3D7EO 3CJ1A 4BR9A 1ZXOA 3HBTA 2D0PA 2V51B 3UKUA 4Y0WA 4BC5A 1HX1A 4MO4A 1QQMA 3A5OC 1HKCA 4QS9A 3ZX2A 4Z94A 1GLBG 1SQKA 2FSKA 3ENOA 5AFUH 5EXWA 3CERA 5AQTA 2F9WA 4B1VA 1TUYA 3QDKA 2IIRA 4A62A 4CD3A 1SZ2A 4JHDB 4CZLA 3HI0A 4AM6A 1HKBA 3BUZB 1WUAA 3FGUA 4AM7A 3C7NA 1MWKA 3H3NO 4BRGA 1BUPA 3VPZA 4EAHD 3W3DA 4MLHA 2YHYA 4WQ4A 1NGIA 5JLHA 5AQMA 4FWRA 5BN8A 4WQ4C 4DQ8A 2E8AA 3QFPA 3VEVA 5LY3A 4M63C 4BC2A 2QWPA 3WEEB 1U2VA 5EX5A 2W40A 3DXKA 3FZKA 2CGJA 3VEWA 3BP8A 3H1QA 4IJAA 2Q0UA 3D2EA 5AQJA 4CJ7A 3ATVA 3VENA 1BDGA 2YI1A 3AARA 4ISEA 4L3QA 3U8XA 1ZBSA 4MO5A 2D0OA 2I7NA 1RDWX 4BRAA 5AQFA 5BRFA 1NMDA 3ID8A 5EY4A 4BRNA 4CBXA 5AQIA 5EOYA 4CBUA 3ZETB 5BPLA 4BR0A 1LOTB 2P9UB 3VERA 5ADXA 2Q0RA 3L6QA 3LDNA 4CBWA 4DB3A 1NGDA 4DCHA 1QQNA 2GUPA 2PBDA 1T6CA 1JCEA 5AQYA 5AZJA 4I6MB 3UKRA 5BRDA 3VF6A 3JXUA 2PAVA 3B8AX 2HF3A 5KPRA 2F9TA 2HOEA 1V4TA 2I7PA 4LC9B 1NBWA 3EO3A 2QWRA 3FZHA 2Q36A 4JD2B 5AQSA 1GLFO 4BRLA 1GLEG 4CZFA 2P9SA 1MA9B 5FPNA 2E1ZA 2H3GX 3RSEB 3DWLA 3LDOA 5B8HA 4FWOA 4BC4A 2QWNA 4H0OA 1DGKN 1J6ZA 2EWSA 1X3MA 4BRPA 3ZEUA 4FWNA 4KBOA 5ELZA 4K43A 3VF4A 5AQOA 5AZIA 4BVOA 3DJCA 4A2BA 3QBWA 1IG8A 3EKSA 5AQHA 4CZMA 5TKYA 4B9QA 2V7YA 5AR0A 1LCUA 3VGLA 5ADXH 1Y64A 1X3NA 5KQ8A 3FLCO 1YXQA 2VCPA 2YJFA 3IFRA 2GWJA 4JNEA 3HTVA 3ENHA 3OHRA 2KHOA 3VF2A 1OKJA 4H0VB 1K8KB 4BG9A 3O80A 4GY2B 1KAYA 3O4WA 3D2FA 3FZLA 2FSJA 2D4WA 5JMVA 1XUPO 4ISGA 4FWPA 2P9NB 2Q1NA 3AAQA 5CE3A 3I33A 1NGAA 3QBXA 2VYPA 1ATSA 1JCFA 3CETA 3SMPA 4CZHA 3GBTA 1GLAG 1QZ5A 4E1JA 1NLVA 1QHAA 2ASOA 2P9PB 3J8AA 1T44A 4BC3A 2YJEA 1NGJA 2QWQA 2P9IA 3MMVA 1TYQA 2AA4A 4B1WB 2Q97A 3WEEA 3GE1A 1XC3A 1MDUB 2VWBA 2NRHA 3QICA 3H6EA 1X9JA 2ZWHA 3R9PA 4BG8A 2Q31A 3CQYA 4NB4A 3MDQA 2P9LB 3S41A 3L4IA 5KQDA 3VESA 4CZKA 3IMXA 1GLCG 2NZTA 4IO8A 2YHXA 3A5NC 5AQZA 5BPNA 1T6DA 3UKUB 3KHYA 4DHYA 3QB0A 3CJAA 4J8FA 1QQOA 2FF6A 3WXLA 3ZETA 4H5WA 1GLJO 2E2QA 2ASPA 2V7ZA 5AQVA 1YAGA 1BO5O 3BF3A 1YVNA 5AQLA 2E2PA 1RFQA 3ULEA 1H1VA 1NWKA 3LM2A 4B1ZA 3CIPA 3VETA 4H0PA 1E4GT 5I9EB 3KZBA 4H5NA 3C7NB 3WQTA 3IDHA 4WQ5C 1IJJA 2A40A 4WYBA 3HSCA 3LDPA 4PL8A 4QS8A 2E88A 3H46O 1JCGA 3U9ZA 2GWKA 4EHTA 5BPMA 1DEJA 4CI6A 3VGKA 1BWFO 5AQPA 2YCHA 2DPNA 3DXKB 1MWMA 3MN7A 3LDQA 3ATUA 3D2EB 2UYTA 2ITMA 2GELA 1YUWA 2Q2RA 3MK6A 1P8ZA 3CJCA 2QM1A 3L0QA 1DKGD 3EN9A 4XH1A 3M1FA 2BTFA 3O1BA 3FFKB 3HM8A 4PKIA 4CD1A 4B1YB 1KAZA 1K8KA 1C0GA 1HUXA 3ZX3A 2E2NA 4RTFD 4H0TB 5EVZA 3GL1A 1BU6O 1C0FA 4NO7A 1Q18A 4CZEA 3VEZA 2FXUA 5AZJB 3G25A 3BEXA 3UKRB 4BR5A 2ASMA 4BRDA 2GTDA 4PKGA 1S3XA 2A41A 4BRQA 4CZIA 1NM1A 5BR9A 1XQSC 4FSVA 4O8KA 1HKGA 2W41A 1HPMA 2HMPA 3CI5A 4BROA 4K25A 2P9SB 4BVPA 4FPAA 4BR4A 2FF3B 1EQYA 5AQXA 2D1KA 3AAPA 3DXMB 2P9KB 3FR0A 3MN9A 1CZAN 4BRIA 4K41A 1BG3A 4PKHA 1NGBA 4IZ9A 3ZEUB 4JHDA 5AZIB 5BRHA 2A3ZA 3U4LA 4HTLA 2WUSA 5AQKA 3VEXA 5AQQA 4IWVA 3WT0A 3H3OB 3CJ9A 2IVOA 2OANA 2CH5A 3A8YA 4FWSA 4BR7A 5LJVA 4FOIA 3U9DA 3VEOA 1G99A 3A5LC 3KVGA 3LL3A 4H0XB 3JS6A 3O6WA 5JLFA 4FL9A 2HF4A 1HJOA 2CGLA 3QFUA 5JICA 3EZWA 3D2FB 5F2RA 2YHWA 2GEMA 1QZ6A 1R59O 2ZF5O 3WQUA 2CH6A 5KPZA 1ZC6A 4EHUA 5FPDA 3P4IA 2BUPA 2IVPA 1Z05A 4CZGA 2QWLA 3O8MA 3CJBA 3EKUA 3H45C 4RWTA 4FO0A 4FWMA 5AQRA 1NGEA 1ATRA 4EIAA 3O1WA 3CQXA 1Z6RA 3A5MC 4M7XA 3VEYA 2P9UA 3FZMA 3F9MA 3MN5A 5FPMA 3UB5A 3QMLA 4IJNA 2V52B 3WXKA 2QWMA 2ZGYA 3UE5A 4WQ5A 2P9IB 4XH5A 3VOVA 4I6MA 1TYQB 1WOQA 2A42A 3O5BA 4MLEA 3WXIA 1S22A 2FSNA 3W0LA 4A61A 1KXPA 4B1XB 3LM9A 4IXCA 4GNIA 4JD2A 4FWLA 4H0YB 3M3ZA 4CZJA 4EFHA 4JN4A 4YDUA 5BN9A 3RSEA 1NGHA 5LJWA 1NGGA 4BR2A 4BQZA 3BF1A 5FPEA 4BRMA 4XEIA 2NLXA 4XH4A 4YDUC 3SJHA 2A5XA 1U2VB 2E1YA 4FWKA 3LDLA 4BGAA 2QW9A 2A6AA 4H5VA 4C23A 4B1UB 3I8BA 3HZ6A 3MN6A 2J4RA 4FWQA 4JAXA 4H5TA 3A0IX 2QWOA 3R6MA 3ULEB 1GLDG 2QXLA 1SAZA 1BOTO 4FOEA 1KAXA 2IVNA 3AY9A 4O5FA 3MCPA 5BREA 3WXJA 4F9OA 3GOIA 5F1XA 2E20A 3IUCA 2AP1A 4HWIA 4PL7A 1GLLO 3R8EA 3DAWA 4ISFA 4M7YA 4BRKA 1BA0A 3DXMA 2P9KA 2P9NA 2ZGZA 3FE1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NGFA 3B6OA 4AHCA 4DV2K 4M3UA 4QOZB 4I9QA 3SBTA 3P83D 5AFUA 3GDQA 3VGMA 3LPUA 3SBGA 2JWLA 3I0RA 2DY4A 3CHWA 5IT9O 3FZFA 2UXBK 1Q86O 3GG4A 4KAZA 4FPBA 3G4SN 3PSIA 5FDLA 3DOKA 2F7TA 4H03B 4NCBA 1S1TA 4XIUA 2BANA 1HR0K 3HPGA 1BA1A 3CCMN 1N6QA 2CGKA 5J2PA 1JL1A 1GOBA 4N76A 3M8RA 3CC2N 4Q0BA 3TSPA 3ULDA 3H1VX 4BRCA 1TUUA 3RMBA 1RGIA 3V6DA 2HBJA 5FLXO 2FBVA 3S3MA 4J2AA 2KFZA 5C2FA 1S9EA 3DRRA 3UKUA 1ZBLA 1SKSA 3P31A 1A5XA 1I39A 1HKCA 2VG5A 4KH6A 4JKCA 3L2VA 4DTPA 2YKMA 5EXWA 2RHKA 1VQ7N 4A59A 4OPJA 2F9WA 3Q7BA 4DQRA 1TUYA 1KSPA 4PY5A 3JAMO 4KHQA 1SZ2A 3AO3A 2ZQBA 4FJMA 5CHIA 1WUAA 3FGUA 3PX0A 4AM7A 1MWKA 3H3NO 4LH5A 2YHYA 4WQ4A 5JLHA 1YJ9N 4E7LA 4FWRA 3TR8A 4IFVA 1M90O 2E8AA 3I56N 1L3SA 1IBKK 5LY3A 4M3ZA 2E4LA 4CEEA 3O3FA 3T1AA 4JLHA 1EKEA 2G8FA 1NK9A 1UOCA 1VQMN 4FVUA 5AQJA 4OPHA 4CJ7A 4ZHRA 3AARA 2YI1A 4F3TA 4B9NA 1ZBSA 4ICLA 3OYCA 2A1SA 4O0IA 2IAJA 3N4QA 3CCRN 1VQ4N 1SUQA 5EY4A 4DTMA 3SUQA 4G9ZA 3K57A 4BR0A 1LOTB 4PA1A 3K9JA 5ADXA 3NVKA 2Q0RA 3LDNA 1TKDA 4KO0A 1NGDA 4DCHA 2B5JA 2GUPA 4O44A 1T6CA 1JCEA 4EZ6A 3Q7CA 5KPRA 2HOEA 3EO3A 4BRLA 5AQSA 1HPZA 2YX6A 2P5GA 2E1ZA 3DWLA 1VSFA 1T8EA 4BY9C 3C94A 3LP0A 1Q82O 3MXJA 4LFCK 1DGKN 1X3MA 2KLAA 1L3VA 1C0MA 4MFBA 4DTUA 3QIPA 4IEIA 2G8UA 5AQHA 4DG1A 4CZMA 4EP4A 4FVMA 5H1SQ 5AR0A 4C8NA 2D0AA 3VGLA 3PUFA 4DU3A 2F4VK 3ALYA 1NMNA 3PIOL 3VQ4A 3HTVA 3ENHA 2O8CB 4ZTJA 4H0VB 3VQDA 3D2FA 1Q8IA 3HJFA 5JMVA 1VRTA 4FJ7A 1QQCA 3QESA 5CE3A 1DTQA 3LP2A 4CZHA 3TTCA 3OYHA 1QHAA 2HBKA 2P9PB 2RF2A 3VMFB 2YJEA 4JKEA 4CHOA 4NXMK 3BY5A 2UUCK 3TARA 1MU2A 3ASMA 2RKIA 4CF1A 2AA4A 1RTIA 4B1WB 3PX4A 3MWTA 3WEEA 2NRHA 4B9VA 3H6EA 1X9JA 4UY8O 4W5RA 3I0SA 3HM9A 3OYAA 4B3OA 5LMUK 4E19A 3MDQA 2P9LB 5M1QA 3VQPA 3IMXA 1X9MA 4IO8A 3A5NC 4FJLA 5AQZA 1QS4A 1T6DA 4HUGA 3PO5A 3KHYA 3QB0A 4J8FA 3LWMA 4AHUA 3CPWM 4IG3A 1RT1A 2V7ZA 2I5JA 3TAFA 1YVUA 1YHQN 1BO5O 1YVNA 4OLBA 3ULEA 3LM2A 3EE9A 3CIPA 2HSTA 1YI2N 2IDOA 4W5NA 5I9EB 3KZBA 4FLUA 2LSNA 4IBNA 1KLMA 4Z4HA 3C7NB 4LY7A 1VSDA 1TL3A 4YOUA 2KZMA 4WYBA 4DLGA 2PZSA 3KKRA 3NGZA 1LAWA 3LP3A 1NKCA 1YIJN 3M8PA 4DR4K 3MWPA 1NK8A 1DEJA 4ELTA 5CR4A 3VGKA 2QTDA 1BWFO 1VSLA 4FJGA 1S6QA 3KLEA 3MN7A 4DTRA 4H4MA 3ATUA 5CYMA 4JI1K 2ITMA 2QK9A 2YHAA 2Q2RA 3SNNA 1QSYA 1N5YA 3MK6A 3OVNA 1P8ZA 2QM1A 1BQNA 1DKGD 2BTFA 4CW7B 3HM8A 4PKIA 4AH9A 3THXB 4QAGA 1QHTA 4CFCA 1K8KA 3ZSXA 1HUXA 2OPQA 4AHRA 1FKOA 3THVA 1WLJA 1EO1A 3GL1A 2XRIA 4PHTX 4F2RA 4JYAK 2E5LK 1I3AA 1HQUA 3S9HA 4CJWA 3AVJA 2ZM6K 3BGRA 3G25A 1VSKA 2X6SA 3UKRB 2ASMA 1ZBFA 1RT2A 3BZKA 3MEDA 3L4QA 1HNXK 5BR9A 4O8KA 4FSVA 4CHQA 1DLOA 4LD0A 1HPMA 3NAEA 1S9GA 3E9OA 3OS1A 3I55N 4FPAA 2Q3SA 2HHHK 2O8BA 1NU0A 4CGFA 3FR0A 4DS4A 3ZCMA 5KRSA 4CHYA 1L3UA 1LAVA 5AZIB 5FRMA 5BRHA 2A3ZA 4BE0A 4L8RB 3CD6N 1JLGA 3HVRA 4WFNL 1BGXT 3VQQA 3AA4A 4DR3K 3L2RA 5EU7A 4RG8A 3CFPA 3H3OB 3CJ9A 2OANA 2F8SA 2D0BA 4NLCA 3QEWA 5M1PA 3U9DA 4HTUA 4CF9A 3O6WA 2CGLA 3CFRA 3QFUA 4ILGB 3G10A 3EZWA 4NXNK 3RTVA 2W42A 3WQUA 1VRUA 1EWQA 3P4IA 2BUPA 1FJGK 1Z05A 1N8RO 4B9MA 3O8MA 3EKUA 4DMNA 5AQRA 5HLFA 4BACA 4NYNA 4FJHA 1ATRA 3AA5X 3DM2A 1Q7YO 4CJUA 3O1WA 3CQXA 4ILJA 5FPMA 3HYFA 1LW2A 3VQ9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3VEY A;  4Z4I A;  3CPE A;  1B9D A;  4GV9 A;  3QIN A;  4DF4 A;  3HPO A;  3UB5 A;  4IJN A;  1NJY A;  3DLB A;  2QA4 N;  3ZSO A;  3V9Z A;  4FJX A;  1D5A A;  4B3M K;  3TTD A;  3C6T A;  1NJW A;  1KLN A;  3O5B A;  5M1O A;  3OYM A;  3MXM A;  4N47 A;  1KXP A;  4B1X B;  1S1V A;  1WSJ A;  4DSF A;  1XMO K;  4JD2 A;  4CEO A;  3PSF A;  4CJ5 A;  4JN4 A;  4YDU A;  5M1K A;  5BN9 A;  5LJW A;  1NGG A;  3SZ2 A;  1S72 N;  1G15 A;  2WC9 A;  3BF1 A;  4RW7 A;  4BDY A;  3V1O A;  3SJH A;  2A5X A;  1KD1 O;  3TSU A;  4E1N A;  5HOO A;  2UUA K;  2G8I A;  4FWK A;  3LWL A;  4DR7 K;  4C23 A;  2HVI A;  1UA0 A;  4JAX A;  4RW8 A;  1L3T A;  3ULE B;  4CEA A;  3TAP A;  4KHW A;  2JLE A;  1RDB A;  2OCE A;  1U4B A;  2NRT A;  4O5F A;  3MCP A;  4DQS A;  4FLY A;  2AP1 A;  2UU9 K;  1YIT N;  4M3X A;  3E1Y A;  3R8E A;  3DAW A;  3K5O A;  4O4G A;  3IG1 A;  3SCX A;  2WBN A;  1GLB G;  2D5R A;  3FE1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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