5LJWA

Mamk non-polymerising a278d mutant bound to amppnp
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
GEGQAKNRLFLGVDLGTSHTAVMSSRGKKFLLKSVVGYPKDVIGLKLLGRPYVVGDEAFEMRSYLDIRYPLQDGVLSEISDRDIEVARHLLTHVVKSAEPGPNDEICAVIGVPARASAANKALLLKMAQEVVHTALVVSEPFMVGYGLDKLINTIIVDIGAGTTDICALKGTVPGPEDQVTLTKAGNYVDERLQNAILERHPELQMNVNVACAVKEQFSFVGTPTEVASFEFRAAGKPVRADVTEPVKIACEALMPDIIESIETLLRSFQPEYQDTVLQNIVFAGGGSRIRGLAAYVKEKLRPFGDANVTCVKDPTFDGCRGALRLAEELP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title X-ray and cryo-EM structures of monomeric and filamentous actin-like protein MamK reveal changes associated with polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Magnetospirillum magneticum amb-1
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Actin-like ATPase
total genus 106
structure length 331
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljwA02
5LY3A 1GLBG 2V7YA 4CD3A 3AY9A 2HMPA 4JN4A 4IJAA 4BRDA 3QDKA 3CJCA 5JLFA 1NGJA 2ZGZA 3M1FA 2E8AA 1KXPA 1JCFA 3D2FA 1MWKA 3DXKA 4QS8A 4H0OA 5AQMA 2CH6A 2Q2RA 3VESA 4FWMA 2D4WA 2GELA 5AZJB 3WUHA 2ASOA 1T44A 3C0BA 1HUXA 1ZBSA 2P9PB 3EN9A 4BROA 4FOIA 2Q36A 1ZXOA 1E4FT 1T6DA 2P9IB 3R9PA 1WUAA 3S41A 2GTDA 4K41A 2D0OA 3MCPA 4JHDA 1U6ZA 3VGLA 5BREA 2V52B 3H3OB 1NGBA 3O1WA 4PKIA 3ZETA 4GNIA 2YHYA 3JXUA 1MWMA 3R6MA 3A0IX 5F0XA 1R59O 2D0PA 4A2AA 3QB0A 2A5XA 3ATVA 1NM1A 4K42A 3ZEUB 1ATSA 3IMXA 3I8BA 5AQTA 2FF3B 4BRCA 4DB3A 3F9MA 3HBTA 5FPEA 3B8AX 2P9LA 3A5LC 1X9JA 2YJFA 1TYQB 3HTVA 2BTFA 1BWFO 3MMVA 4NO7A 4EHTA 1QQOA 3MN6A 1BDGA 4BG9A 3CERA 3J8AA 1LCUA 4HTLA 3EL2A 3I33A 2DPNA 4CI6A 4H0XB 4HWIA 3VEWA 2GEMA 5AQZA 4BC5A 3A5MC 4H0YB 3W3DA 5LJVA 2F9TA 2E2QA 4FPBA 1HX1A 1WOQA 2HF4A 1OKJA 1MDUB 3GL1A 3ZEUA 3WEEB 4FWRA 5FPNA 3ULEB 4DQ8A 2Q0RA 1RDWX 1DGKN 3ENOA 3ULEA 1QQMA 2ASPA 4Y0WA 4XH1A 4WQ4A 2QM1A 4H0VB 4JD2B 3D2FB 3HI0A 4XH5A 5AQUA 2QWOA 1BUPA 1X3MA 1IG8A 3CJAA 4CZMA 2P9NB 2IVNA 4JHDB 3FZHA 4IZ9A 3U9DA 3LDNA 4BVPA 4BR9A 1XC3A 4MO5A 5BPNA 4B1ZA 3FLCO 5LJWA 4H03B 2ITMA 4LC9B 4QS9A 2PBDA 3UKUB 3LDPA 3TPQA 1BG3A 3L0QA 4XH4A 3WT0A 3WXLA 3CIPA 3CQXA 3WQTA 4F9OA 5FPMA 3G25A 5E26A 3HZ6A 1J6ZA 4B1WB 2QXLA 1K8KA 4CZFA 1JCGA 1BA0A 1GLEG 2YCHA 4WQ5A 1HKBA 4MLEA 2V7ZA 3CJ9A 3H1VX 3IFRA 5EVZA 3VGMA 3WXJA 3GG4A 2I7PA 1GLLO 3ZETB 1V4TA 3M6GA 3H6EA 1ZC6A 5BRDA 3FFKB 1GLAG 1Q18A 4L3QA 5AFUA 4O8KA 1NWKA 3CI5A 3FE1A 2D1KA 1NGGA 4DCHA 1GLDG 3VENA 2E1YA 2V51B 4I6MB 4H0TB 1TUUA 2YHXA 3EKUA 1C0GA 2H3GX 2GWKA 1HLUA 3U4LA 4M63C 2QWLA 4AM7A 2VWBA 3UKRB 3A5NC 4AM6A 1HKGA 4PKGA 2E88A 1QZ6A 1KAXA 4BC2A 3IUCA 4BR5A 3DJCA 4MO4A 3MDQA 3RSEB 5AQPA 5ADXH 1BU6O 4BRHA 3DXMA 4ISFA 3A8YA 3VGKA 4CZKA 4ISEA 2QWPA 1D4XA 1NMDA 4BR7A 4M7YA 4CZHA 1E4GT 1YVNA 4A2BA 2CGLA 3KZBA 4PL8A 1EQYA 2ZF5O 4BRMA 5EY4A 5AFUH 2IVPA 3U9ZA 1HPMA 2QWQA 4XEIA 4BRNA 2FSKA 1KAZA 4FL9A 4EAHD 3JS6A 4WQ5C 5AQXA 1YXQA 5AQVA 3UB5A 4JAXA 3H1QA 4FWOA 2W41A 5FPDA 1QHAA 4B1YB 3FGUA 3SK3A 1CZAN 4BR2A 1GLJO 1DKGD 2YI1A 3MN9A 3DXKB 5BRHA 3HSCA 2WUSA 1G99A 3QBWA 4RWTA 4BREA 4EFHA 5KQ8A 3RSEA 3MN7A 2P9KA 1U2VA 1RFQA 2VYPA 4K25A 2W40A 3UKRA 2VCPA 1GLFO 2E2NA 2Q97A 4FO0A 2P9NA 3EO3A 4H0PA 3VETA 5AQSA 5TKYA 3HM8A 3LDLA 3FZFA 5AQRA 3LDQA 4DHYA 2GUPA 4M7XA 3GOIA 2P9SB 3WXKA 3BF3A 3SMSA 2OANA 1BO5O 4EIAA 1JCEA 2HOEA 2PAVA 2BUPA 4BRIA 1ESVA 1V4SA 4C23A 4B1VA 4BRKA 5AQLA 2UYTA 5AZJA 3VEZA 3VF4A 4YDUA 5ADXA 4Z94A 2QWNA 3O80A 4BRLA 2P9SA 2IVOA 4RTFD 3KHYA 4H5TA 1NGEA 1SAZA 2Q0UA 3BP8A 4O5FA 3FZLA 4QS7A 3WXIA 1T6CA 3VEYA 3SJHA 2AA4A 3MK6A 3VEXA 1TYQA 3O1BA 4BQLA 3KVGA 5JICA 2Q31A 3ZX0A 5B8HA 2E1ZA 5AQHA 2EWSA 4CZIA 1H1VA 4J8FA 2FLOA 4BC3A 5BPLA 2NZTA 1IJJA 3UKUA 3DAWA 3EKSA 3W0LA 2CH5A 1NGIA 4I6MA 4H5NA 4MLHA 4FOEA 5AQWA 5F2RA 4YDUC 3CETA 1TUYA 4BRPA 4CZLA 2ASMA 3VF2A 3O5BA 4IJNA 2YHWA 1NGFA 2F9WA 5AQJA 4PL7A 4FWSA 5AQFA 5BR9A 2E20A 3WEEA 3H3NO 1ATNA 3LM9A 3R8EA 3CJ7A 4FSVA 2Q1NA 4IWVA 2P9PA 1RGIA 3SMPA 3H46O 2A41A 5EX5A 5EXWA 4BR4A 2A40A 3QFUA 1U2VB 3CHWA 2P9KB 2NRHA 2QWMA 4FWQA 4BRFA 4BR0A 1X3NA 3C7NA 2A6AA 4CBXA 3DWLA 4FPAA 3QMLA 2QWRA 3BF1A 2A3ZA 1HKCA 5AZIA 3LL3A 4BRGA 3FR0A 2FXUA 3IDHA 1QZ5A 5JLHA 3QICA 1K8KB 1C0FA 3QFPA 5KPRA 4ISGA 1QQNA 3U8XA 4BRAA 1NLVA 3VPZA 1NGDA 2CGJA 5AZIB 4CZGA 4EHUA 2A42A 1KAYA 3P4IA 3SLCA 3UE5A 4H5WA 1P8ZA 5F1XA 1DEJA 4FWLA 2E2OA 3O08A 3C7NB 1YUWA 3VF6A 4FWPA 3AAPA 3ZX3A 4H5RA 3L6QA 4BG8A 4B1XB 4CD1A 2HF3A 4BGAA 2ZWHA 3D2EA 4WYBA 2P9UB 3OHRA 3QBXA 4KBOA 3O4WA 4WQ4C 5BN9A 2I7NA 1Y64A 3VOVA 2ZGYA 3ENHA 5AQIA 2E2PA 4CBWA 4E1JA 2FSJA 2P9UA 1NGHA 2NLXA 3EZWA 3GDQA 3D2EB 4JNEA 4CZJA 2P9IA 2KHOA 3H45C 3O8MA 1SZ2A 1SQKA 1BOTO 3CJBA 3VEVA 1Z6RA 4BC4A 4H5VA 5AQGA 5E84A 4IXCA 3MN5A 5I9EB 5AQOA 4CZEA 1NGAA 2J4RA 4CBUA 3AARA 3M3ZA 4K43A 5EOYA 2GWJA 4FWNA 3DXMB 3WQUA 4B1UB 4FWKA 3GE1A 3BEXA 2YJEA 4GY2B 1Z05A 3GBTA 3FZMA 4NB4A 4A62A 4BGBA 5BRFA 4PKHA 1NGCA 1GLCG 3LDOA 3L4IA 5AQNA 3AAQA 1BA1A 5CE3A 2FSNA 3ATUA 1S22A 2P9LB 4BRQA 5JMVA 3ZX2A 5KPTA 3A5OC 3FZKA 5ELZA 1YAGA 2FF6A 1S3XA 5BN8A 4JD2A 4BVOA 3VERA 4A61A 3TU5A 3BUZB 3ID8A 3VEOA 3LM2A 5AQKA 4IO8A 5BPMA 3D7EO 4CJ7A 1XQSC 5AQYA 2CGKA 5KPZA 1NBWA 3O6WA 1HJOA 4BQZA 1LOTB 2IIRA 4RCHA 1XUPO 5AQQA 4B9QA 3CQYA 5KQDA 2QW9A 3CJ1A 2AP1A 1ATRA 1MA9B 5AR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CC2N 3PO4A 1WSHA 3AO4A 4IEIA 1XHXA 2OA8A 3N4QA 4OPHA 4CD3A 1YJ9N 2HNZA 3AY9A 3K2PA 2ZGZA 1KVCA 5CY4A 3M1FA 3D2FA 3KJVA 1ILYA 3E9PA 3DXKA 2CH6A 3CCMN 3HVTA 2Q2RA 3MECA 1J9AA 1T44A 4M3WA 2P9PB 4BROA 5HOOA 3V9ZA 4M3ZA 4LSNA 1T6DA 3LDSA 3R9PA 3AVGA 2GTDA 1T05A 3LAKA 3F2KA 4F2RA 1U6ZA 3AGKA 3VQ5A 4HUEA 4PKIA 4HUFA 2YHYA 3MWPA 3JXUA 1LWCA 3OYIA 3VN5A 1CXQA 4JKGA 2IOCA 3ATVA 4XIUA 4CJ5A 3I8BA 3MAQA 1X9JA 3MEGA 1L3TA 3HTVA 2P5GA 4DUZK 1BWFO 5LMNK 3AGRA 3MN6A 4FJHA 4E1MA 1RCHA 2KLAA 4DR3K 4GVMA 4X65K 2UUAK 3I33A 1TVRA 4CI6A 3KTQA 4MQ3A 1YI2N 4H0YB 3W3DA 1IV0A 1TKXA 2E2QA 3E9LA 1HX1A 1QQCA 3SYZA 1S9GA 3NBPA 1S1TA 4RW6A 5J2NA 4DQ8A 4O4GA 4AHSA 1NOYA 1QSSA 4Y0WA 2O4IA 2QM1A 4H0VB 4JD2B 3SQ0A 1TK5A 4FYDA 3DMJA 4FZZA 1BUPA 4CGJA 2P9NB 4JHDB 3U9DA 4IZ9A 4HCBA 4MO5A 3OYEA 5DMRA 4DR1K 3CCUN 4B1ZA 4BE2A 1YITN 4DR2K 2ITMA 3C94A 4LF9K 2PBDA 4PWDA 3LDPA 4FJIA 1BG3A 3WXLA 3SCXA 3CQXA 3TAGA 5DM7L 2HHXA 1K9MO 3G25A 5E26A 4DFPA 3T69A 3VQAA 2HBMA 4NCAA 2UUCK 1K8KA 2DFFA 4CZFA 4WQ5A 1RBSA 1HKBA 3CJ9A 2X6NA 4WCEL 3ZCMA 1K6YA 4JKCA 4LY7A 1EP4A 3ULDA 5KRTA 3VA3A 3H6EA 1ZC6A 4AHTA 3SUPA 1Q18A 1TAUA 2D5RA 4ELTA 1NWKA 3FE1A 1N32K 1L3VA 1GLDG 3CCVN 3DLEA 4ICLA 3ZSZA 1TUUA 5M1OA 2GWKA 3UIQA 1VQ4N 3UKRB 4PKGA 4DV5K 4B9VA 4B08A 3DI6A 4MO4A 4O0IA 3OS0A 4B9MA 2QXFA 4MDAA 2F7TA 3PX0A 1Q7YO 1YTUA 4DTPA 4PA1A 3DM2A 3SAFA 1S1VA 4ISFA 1J54A 2XY8A 1D4XA 1NMDA 3LP1A 4DF8A 2XHBA 1E4GT 1YVNA 4A2BA 3OYFA 2CGLA 3S3MA 4IOAL 2Z1GA 2ZF5O 4J2AA 3HPOA 4K0KK 4BRMA 5EY4A 5AFUH 2IVPA 3U9ZA 1S1WA 4F8RA 4BRNA 3G10A 4Z4EA 4CF0A 1RDDA 4KHUA 2HMIA 3B6PA 4DV1K 4CHZA 3DLGA 1XHZA 4AHUA 1IO2A 3H1QA 3OYGA 4LD0A 1D5AA 3Q7CA 4LH5A 5BR8K 2HBLA 1K8AO 4BR2A 2YI1A 4DSEA 5BRHA 1G99A 3QBWA 4B9TA 5CZ2A 3PV8A 1T8EA 3WNEA 3RSEA 1HJRA 3D45A 2X6SA 4K25A 3VETA 4H0PA 1ZBUA 5AQSA 3HM8A 3LDLA 2G8WA 1JL2A 4FLUA 1QSLA 3LDQA 2GUPA 3ASMA 4BDZA 3WXKA 4IOXA 3BF3A 2JLEA 3DRSA 3MXMA 3SMSA 1BO5O 4EIAA 2HOEA 4FZXC 1T03A 2PAVA 2BUPA 4BRIA 3P38A 4CK2A 1V4SA 2G8UA 2UYTA 5AZJA 5FLXO 1RDCA 5ADXA 2YV0X 1NG9A 3TAMA 2O8EA 4CHNA 2JWKA 4KHYA 3SJJA 2Q0UA 1I39A 2NRWA 3MWTA 3SQ4A 3FZLA 4JK7A 4CGGA 1SL1A 4DR7K 1C6VA 4LF6K 3SJHA 4CHOA 1JLAA 2AA4A 4FM0A 4NCBA 3AA2A 3ZX0A 2DFEA 2EWSA 3SNNA 2FLOA 4OPAA 5C10A 3TANA 1TK0A 3BY5A 3G71N 4HCCA 5BPLA 1IKVA 1MU2A 1IKWA 2CH5A 3RRGA 1JLGA 4H5NA 4N56A 2VQEK 5AQWA 2OTJN 4BE0A 4YNQA 4FJJA 4Z4CA 3VF2A 4I9QA 3O5BA 1BI4B 2QKBA 4DTSA 5AQJA 1ASWA 4WFAL 3THXB 4KHPK 3CJ7A 2Q1NA 3H46O 1U2VB 1X9MA 3CHWA 4CJEA 2NRHA 4FWQA 1D9FA 2HNDA 3NGZA 4BR0A 2A6AA 4CBXA 1OH8A 3SBTA 4G9ZA 1G15A 2UXCK 1IBKK 4X64K 3PSFA 4LF5K 4YFUA 4C8KA 4AHCA 4MFBA 4M45A 4ISGA 4KPYA 1RDUA 4E1NA 3ZSRA 4JKDA 2QI2A 4KTZA 4CZGA 2OPRA 1KAYA 1HNIA 1P8ZA 4M3UA 4CVNE 1A5VA 4CF1A 5LMUK 4FXDA 3G4SN 3P5JA 3VQEA 3AAPA 4H5RA 4B1XB 3CCQN 4BGAA 2DY4A 2ZWHA 3D2EA 4WYBA 3I56N 1VQ7N 4CHQA 3OBWA 4FM1A 1KFSA 1VQNN 4NYNA 5BN9A 2ZGYA 4IG0A 3BZCA 3C6HA 4CBWA 2P9UA 1NGHA 3DYAA 1ZBLA 5J2PA 5K14A 4DV3K 1YIJN 4QCLA 2KHOA 1UWBA 3WNHA 1N8RO 4B3OA 1D8YA 3LP0A 2UXBK 4FJGA 1YT3A 2O8DB 4IXCA 5AQOA 1HNWK 5JVHL 2UXDK 3WNFA 4CBUA 4K43A 1KLNA 2RHKA 4ID5A 2VGMA 1U4BA 2E6LA 1WLJA 2YJEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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