5LJWA

Mamk non-polymerising a278d mutant bound to amppnp
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
b'GEGQAKNRLFLGVDLGTSHTAVMSSRGKKFLLKSVVGYPKDVIGLKLLGRPYVVGDEAFEMRSYLDIRYPLQDGVLSEISDRDIEVARHLLTHVVKSAEPGPNDEICAVIGVPARASAANKALLLKMAQEVVHTALVVSEPFMVGYGLDKLINTIIVDIGAGTTDICALKGTVPGPEDQVTLTKAGNYVDERLQNAILERHPELQMNVNVACAVKEQFSFVGTPTEVASFEFRAAGKPVRADVTEPVKIACEALMPDIIESIETLLRSFQPEYQDTVLQNIVFAGGGSRIRGLAAYVKEKLRPFGDANVTCVKDPTFDGCRGALRLAEELP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray and cryo-EM structures of monomeric and filamentous actin-like protein MamK reveal changes associated with polymerization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like ATPase
source organism Magnetospirillum magneticum amb-1
molecule tags Hydrolase
total genus 106
structure length 331
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljwA02
3GE1A 4O5FA 3HTVA 3IMXA 1GLBG 3LDPA 2W40A 1V4TA 1Z6RA 3U4LA 4O8KA 3CQYA 1T6DA 1X3MA 4BREA 2GUPA 4IJAA 4FWRA 4JAXA 1BG3A 2NLXA 5AQQA 1KXPA 2V7YA 3GG4A 5EY4A 3VETA 5KQDA 3FE1A 3ZETA 5EOYA 2Q36A 3CHWA 4JNEA 3G25A 4DQ8A 4J8FA 5AQGA 3D2FA 5FPMA 4A62A 1TUYA 3C7NA 3HM8A 1NGIA 2QM1A 4HWIA 4EFHA 2E2QA 2FF3B 1RFQA 4M63C 4FWLA 3VEXA 4FWKA 1KAXA 3ZETB 4QS9A 4A2AA 4BRLA 3H3NO 4Z94A 2YHXA 4IJNA 5ADXH 3VEOA 1GLEG 5AFUH 5AQKA 5BR9A 4YDUC 3U8XA 1J6ZA 5F1XA 5LJVA 3MN9A 4FO0A 1K8KB 3ATUA 4H5TA 2ASPA 2P9LB 3FZMA 3TPQA 1LOTB 3I33A 1T6CA 2FXUA 2Q1NA 4KBOA 3VEYA 2OANA 2CGKA 3KVGA 4H5VA 4CBWA 2CH6A 5AZIA 2P9KA 4BRHA 1NGCA 3LM9A 3S41A 3CQXA 4BC5A 4CZHA 3ULEA 4ISEA 3CJ7A 2ITMA 2W41A 2KHOA 3M3ZA 3AAQA 1DEJA 3AARA 3H46O 5AQTA 2P9KB 4FSVA 5KPTA 4EIAA 3EO3A 2GWJA 5BRHA 5BREA 1X9JA 3WQTA 1KAYA 4MLHA 4A61A 1GLCG 5AQNA 1YAGA 1JCGA 4FWNA 1H1VA 2QWPA 4IO8A 4WQ4C 4IZ9A 4BRIA 4IWVA 2FSJA 5AQRA 3WUHA 1SQKA 5AQYA 2Q97A 1IG8A 3MN6A 4BR7A 3CJ1A 3D7EO 3O1BA 3C0BA 4BVOA 3LM2A 5LJWA 1MWMA 3JXUA 3TU5A 3VENA 5AQMA 2E2PA 1D4XA 3P4IA 2PBDA 1HKBA 2A5XA 5EXWA 4BRCA 5BRFA 2D1KA 3MK6A 3LDNA 1TUUA 2BUPA 1WUAA 3CJBA 5AZJA 3EKSA 3M1FA 1GLAG 4FWMA 2A6AA 1S22A 3JS6A 4AM6A 3CJCA 3D2EA 4M7XA 3SJHA 4A2BA 4CBXA 1JCEA 1RDWX 5AZJB 3CERA 3DXKB 4XEIA 3FFKB 3OHRA 1HJOA 1BU6O 1Q18A 3MMVA 3U9DA 2YHYA 2A41A 1YUWA 4FL9A 4ISFA 3D2EB 1LCUA 3CJAA 4H5RA 5AQHA 4B1XB 3MCPA 4K43A 2CGLA 1ATSA 1XQSC 3QBWA 1NWKA 5AQPA 5CE3A 2D4WA 3GL1A 3MDQA 3B8AX 1DKGD 3ID8A 2V7ZA 5AQJA 2A3ZA 4DHYA 1ATNA 4FOEA 4FWQA 1NLVA 4B1YB 4H5WA 2P9PB 5BN9A 2E88A 5BPLA 4BRNA 4BG9A 4LC9B 1K8KA 4BRMA 2PAVA 5AQIA 2P9LA 3DAWA 4BR4A 3LDOA 1R59O 1G99A 4ISGA 1SZ2A 3FZFA 5EX5A 2HF3A 4BQLA 3CIPA 4BRAA 1NGAA 1QHAA 5JMVA 1BUPA 1XUPO 3SMSA 4BROA 4B1WB 2CGJA 4CZEA 5FPDA 5ADXA 3A5OC 4CZFA 4B1VA 3ENOA 5AFUA 2I7NA 4WQ5A 2Q0UA 1NGBA 2FSKA 4XH4A 1JCFA 4WQ5C 1T44A 5JICA 1BA0A 1NGJA 3VF2A 5BPNA 3O80A 3ZEUA 4H0PA 4H0VB 3GOIA 3HI0A 2E20A 1RGIA 2EWSA 1MDUB 2ZGZA 5F0XA 2P9IB 1HX1A 4CBUA 1BOTO 3WEEB 3AAPA 1HPMA 3QBXA 3CI5A 3A5LC 3FLCO 3O6WA 1DGKN 2NZTA 3ZEUB 1GLJO 5AQLA 4EHUA 4E1JA 3ZX3A 4BC2A 4M7YA 4JHDB 4CZKA 2A40A 3WQUA 1ESVA 1BO5O 3H1VX 3MN5A 3WXLA 2E2NA 1ATRA 1OKJA 1TYQA 3O8MA 2AP1A 2YJEA 1QZ6A 3ATVA 2D0OA 4Y0WA 5FPEA 4GY2B 1HKCA 1XC3A 4CZIA 3QB0A 5E26A 4K25A 5BPMA 3CETA 3VF6A 3I8BA 1TYQB 4MO4A 3A5MC 3HBTA 1C0GA 2HMPA 2P9UA 3EL2A 4RWTA 4BGAA 3DXKA 3VGMA 4F9OA 4MO5A 3VGLA 3W3DA 4EAHD 2IVOA 4FPAA 3SLCA 3HZ6A 5AQSA 1HLUA 4H0XB 4FWPA 1NGDA 5E84A 4BC3A 4EHTA 2ASOA 1HUXA 1NGFA 2E8AA 2P9UB 3WXIA 3A8YA 3DJCA 5BN8A 4JD2B 2YHWA 1E4GT 5AR0A 3UKUA 4NO7A 5AQUA 1MA9B 4CI6A 3FGUA 2YJFA 4DCHA 4HTLA 3A5NC 1U6ZA 3RSEA 1SAZA 4BRKA 1QQOA 4FWSA 4H0OA 4K41A 1U2VB 2F9TA 2QW9A 2P9PA 2F9WA 3VEVA 4WYBA 3UKUB 1CZAN 1BDGA 3HSCA 1NGGA 1ZC6A 2P9SB 2CH5A 2QWQA 5JLHA 2GWKA 2UYTA 5JLFA 3RSEB 5KPZA 4FPBA 4K42A 4MLEA 2ZF5O 3BF3A 2VWBA 4BR2A 3QFPA 4PKHA 1Y64A 5FPNA 4BC4A 3VPZA 4DB3A 1NMDA 3H3OB 5ELZA 3VESA 3FZLA 1YVNA 1GLDG 2AA4A 2FF6A 1V4SA 2IVNA 3R9PA 4PL8A 4QS8A 2E2OA 1MWKA 3VEZA 3DXMA 2P9NA 1P8ZA 5BRDA 1YXQA 4H0YB 2H3GX 2IVPA 3LDQA 3QDKA 4BRGA 3DWLA 1BWFO 3O4WA 3F9MA 3M6GA 4NB4A 2I7PA 3H45C 3VEWA 3D2FB 4BRPA 2IIRA 2QXLA 1NM1A 3R6MA 4CZMA 4H0TB 2J4RA 3C7NB 2P9IA 3DXMB 2P9NB 3IFRA 3WEEA 2V51B 2VYPA 3O08A 3O5BA 4FOIA 4L3QA 2BTFA 2Q0RA 3BP8A 3EKUA 4YDUA 4I6MA 5AQXA 2NRHA 2GEMA 3UKRA 5LY3A 3A0IX 2E1YA 5B8HA 4JHDA 3ZX0A 3IUCA 3CJ9A 3KZBA 4QS7A 5AQOA 4BRQA 3BF1A 1X3NA 3KHYA 1E4FT 3O1WA 3QMLA 5F2RA 2GTDA 2VCPA 2FSNA 3VERA 2A42A 4I6MB 4CD1A 3UKRB 4BR5A 4B1UB 2WUSA 3L6QA 4CZLA 2HF4A 1EQYA 1ZXOA 2GELA 4JN4A 3H1QA 1QQNA 2QWRA 3LDLA 1NGEA 3L4IA 4RTFD 4IXCA 3W0LA 4PL7A 4PKGA 3VF4A 4BR0A 1QZ5A 3LL3A 5AZIB 4BRFA 4GNIA 1S3XA 5I9EB 4BGBA 2DPNA 3L0QA 5AQZA 3EZWA 3FZKA 4PKIA 4XH1A 3ULEB 4CD3A 3GBTA 3AY9A 3WXKA 3VOVA 3BUZB 4RCHA 4C23A 2QWMA 2ZWHA 3MN7A 5AQVA 3SMPA 4BR9A 1NGHA 4WQ4A 3ZX2A 3IDHA 1C0FA 3FR0A 5EVZA 3QFUA 2QWNA 1QQMA 4JD2A 4B1ZA 2ASMA 2V52B 4FWOA 1WOQA 4CJ7A 4CZJA 5TKYA 2YI1A 1GLFO 4BVPA 1IJJA 3UE5A 3QICA 3H6EA 3WT0A 5KQ8A 4H03B 5AQWA 5AQFA 3VGKA 4BG8A 5KPRA 2D0PA 1U2VA 1HKGA 3U9ZA 2HOEA 1KAZA 2E1ZA 2ZGYA 1Z05A 3ENHA 1BA1A 3GDQA 3R8EA 4AM7A 3FZHA 2FLOA 4B9QA 1ZBSA 2P9SA 3WXJA 1NBWA 3J8AA 4BQZA 2QWLA 2YCHA 2Q31A 4H5NA 4CZGA 3EN9A 4XH5A 2QWOA 2Q2RA 3SK3A 3UB5A 4BRDA 3BEXA 1GLLO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQ8N 4O5FA 1X9WA 3IMXA 4JI2K 4ILGB 2W40A 3CCJN 4C8KA 4WFNL 1X9MA 4DSIA 2GUPA 4DTSA 4IJAA 3KLHA 3P31A 1WLJA 4X66K 2PY5A 5AQQA 2V7YA 2OZMA 4DR4K 3E1YA 4IFYA 3K59A 5EOYA 4JI0K 5AQGA 4YY3K 2HHQA 3C7NA 1OVQA 1NGIA 4FK0A 3CXCM 3L8BA 2FF3B 2WONA 3ZSWA 1JLFA 1RFQA 4M63C 1IKVA 4FWKA 3OYLA 2I5JA 2EX3A 1XMOK 4QS9A 4A2AA 3I0RA 4KPYA 4FJIA 3P1GA 1SL0A 1GLEG 3AVKA 1HQEA 2KZZA 4KV8A 4JV5K 2XO7A 2G8IA 3ZT1A 1RTJA 3HVTA 5LJVA 3MN9A 3ATUA 2P9LB 4RW8A 3IG1A 2Z1HA 4H4MA 3TPQA 2Q1NA 4KBOA 2NRZA 2CGKA 2F7TA 2F96A 4CGGA 4CFCA 5HL7L 5GADP 1HYSA 2CH6A 2E6LA 3LM9A 3S41A 4CEDA 2VG6A 1EXQA 1FKOA 4BC5A 4YORA 3ULEA 4CZHA 4WCEL 3CJ7A 3OBYA 4FZYA 5A2QO 3DRPA 5C2FA 2HHUA 3O9UA 2KHOA 1VQ7N 3AAQA 4EZ9A 3AARA 4FLXA 2P9KB 1WSIA 2NRRA 3TI0A 4B3RK 3E9LA 3CCUN 4EIAA 5BRHA 3QESA 5BREA 4AHSA 1KAYA 4M41A 4MDBA 4Z4FA 4KHUA 4CF0A 2QWPA 4WQ4C 2XY5A 2HBKA 2FSJA 1NJZA 1VQ6N 5JS1A 4YOWA 1T05A 4E3SA 1EWQA 4Y1DA 4B3OA 5AQYA 3K0SA 2ETJA 2P51A 1B92A 3CJ1A 3D7EO 3AGRA 5LJWA 1NK7A 4UQGA 4CEFA 3VQ8A 2DTUA 3CPWM 1HKBA 3LDNA 4B9SA 1WUAA 3PSFA 3CJBA 4DFKA 3EE8A 3EKSA 3M1FA 4CEOA 4CHOA 3OYDA 3IAYA 1NKCA 3AO1A 1BGXT 5EU7A 3PX0A 3CJCA 1YIJN 3VA0A 3SJHA 4CBXA 3K5LA 4FJXA 4M3UA 1YT3A 5CY4A 5GIOA 1WBBA 1NK6A 5C0YA 3M5RA 3VQBA 4BE1A 3MMVA 5C12A 1Y97A 3D0PA 3KIOA 4C1NK 5HRRA 1JLGA 1VSFA 1EETA 1VRUA 3HRGA 4H5RA 5AQHA 4DSFA 4DS5A 3MCAB 3SUQA 4HHTA 2FBTA 3HYFA 1KC8O 2CGLA 1RTIA 3QBWA 3THXB 3EYZA 3ID6A 4C8OA 1UOCA 3K58A 1JLCA 3GL1A 3E9OA 3EZ5A 1A5WA 5AQJA 2A3ZA 4FOEA 4O4GA 4DTNA 5M1KA 4H5WA 4AH9A 1KTQA 5CYMA 4FJ8A 3BGRA 4X62K 5BPLA 4FXDA 4BRNA 2ZJPL 5AQIA 2P9LA 4WFBL 1WN7A 4FVUA 3T1HK 4YOYA 3LP3A 1UA0A 1TGOA 1QQCA 4H4OA 5M1NA 4BROA 2CGJA 4B08A 4KHSA 4KTZA 4M42A 3LAKA 4R79A 2FSKA 4DF8A 1JCFA 4WQ5C 4DF4A 2DFHA 4OPHA 5LMUK 2FBXA 4B9VA 1BA0A 1NGJA 4LSLA 3SBGA 1I39A 3VQQA 3NGYA 3O80A 4B9TA 4FJMA 1WNSA 5DK5A 4JRPA 3AVFA 1MDUB 1NOZA 1JKHA 1FXXA 3PO5A 1N33K 5SZTA 1HPMA 3A5LC 3ZEUB 3AVJA 4EHUA 4HUEA 4FYDA 3WQUA 1ESVA 1NK0A 2HVHA 3CFOA 1BO5O 4CCHA 1ATRA 2OPRA 1TYQA 4IFEA 5DM7L 2PYLA 4OPAA 5C15A 4LF5K 1QZ6A 3NF8A 4W5TA 4KHQA 2D0OA 4Y0WA 5FPEA 1HKCA 4CZIA 2HHXA 3MX5A 1RT1A 4I2QA 5BPMA 1IKXA 3I8BA 4KB1A 4DTPA 1RBTA 4MO4A 3A5MC 3L2UA 4CHYA 1VSJA 4RW6A 2GV9A 4KH4A 1WB9A 2HMPA 4RWTA 1HNWK 3VGMA 3VQ5A 3W3DA 3RVCA 4RW4A 4H0XB 2Z1JA 4IG0A 2HVIA 5HLFA 4CJSA 1YJWN 1NGFA 3KD5E 1Q8IA 3CPEA 2VGMA 3TTCA 3RMBA 3WXIA 1TVRA 3VQPA 3DJCA 4B8AB 4NLBA 1CLQA 5BN8A 1DTTA 2YHWA 3ZT2A 4AQYK 2QKBA 3NMUA 1VQKN 1BIZA 1MA9B 5CYQA 1CXQA 3TTFA 4HTLA 1U6ZA 3RSEA 4A5AA 4FWSA 4H0OA 4DV7K 3KLFA 4CFBA 3NE6A 2F9TA 1T03A 1N32K 4Z0UA 1BCMA 2P9SB 2QWQA 3AVNA 1XHXA 4CJPA 5TKWA 4KREA 1K8AO 5M1OA 3ZT3A 4BR2A 4PKHA 2Z1IA 5FPNA 1NOYA 3RMAA 1S1TA 1XNQK 2VWKA 1EWRA 2X6NA 3DOLA 2QA4N 2AA4A 1CZ9A 2IVNA 1S72N 3R9PA 4FZZA 3VEZA 3SAGA 1TKXA 2P9NA 3V9UA 5K14A 4J2BA 3SNNA 1J9AA 3DWLA 1BWFO 1IBKK 2IDOA 4NB4A 2WOMA 1M90O 2IIRA 3R6MA 4CVNE 4H0TB 2J4RA 1C0UA 3DXMB 4CE9A 4L3QA 1RT4A 4PY5A 2OPQA 2GEMA 3AO4A 4LF6K 3A0IX 1VSKA 4QS7A 4BRQA 4YOTA 5FDLA 3KHYA 3O1WA 1L3SA 5F2RA 3KK2A 3AO3A 2FSNA 1U47A 4CD1A 2PYJA 4DLEA 2HHTA 2P5OA 2XY6A 4GKJK 1ZXOA 4LSNA 3AVMA 3QEPA 3CM6A 3L4IA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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