5LJWA

Mamk non-polymerising a278d mutant bound to amppnp
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
GEGQAKNRLFLGVDLGTSHTAVMSSRGKKFLLKSVVGYPKDVIGLKLLGRPYVVGDEAFEMRSYLDIRYPLQDGVLSEISDRDIEVARHLLTHVVKSAEPGPNDEICAVIGVPARASAANKALLLKMAQEVVHTALVVSEPFMVGYGLDKLINTIIVDIGAGTTDICALKGTVPGPEDQVTLTKAGNYVDERLQNAILERHPELQMNVNVACAVKEQFSFVGTPTEVASFEFRAAGKPVRADVTEPVKIACEALMPDIIESIETLLRSFQPEYQDTVLQNIVFAGGGSRIRGLAAYVKEKLRPFGDANVTCVKDPTFDGCRGALRLAEELP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray and cryo-EM structures of monomeric and filamentous actin-like protein MamK reveal changes associated with polymerization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Magnetospirillum magneticum amb-1
molecule keywords Actin-like ATPase
total genus 106
structure length 331
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljwA02
1DGKN 3MCPA 4BR2A 1G99A 2FF3B 4IO8A 3GDQA 3LDQA 4K42A 4GNIA 5EOYA 3H3OB 3UKRA 1HPMA 4A2AA 2CGLA 1NGHA 2GTDA 4BRHA 1YXQA 5AQRA 2YHWA 4LC9B 2ZGZA 5AQSA 2QW9A 1BOTO 3VGLA 3ZX0A 5I9EB 3I8BA 1C0FA 4H5RA 2QWLA 1NGBA 2QWOA 3WQTA 4B1WB 4J8FA 3BEXA 3A5NC 3JS6A 1BWFO 4FWMA 1S22A 3SK3A 3VENA 1XQSC 3LDOA 2GWJA 4HTLA 3VERA 1WOQA 4ISEA 4PKIA 2E2OA 5EVZA 1D4XA 3U8XA 3VETA 3VEXA 1HKCA 5AQUA 3O6WA 1S3XA 3O1BA 4DB3A 2QWMA 4E1JA 1YUWA 3HSCA 3DJCA 3CJ9A 3O1WA 4CD3A 2A6AA 4FWQA 2Q0RA 4FWNA 4C23A 4XH4A 3CI5A 1K8KA 1Z6RA 3MDQA 3FR0A 1HKGA 1TUYA 3VEZA 4AM7A 5LJVA 4CZMA 4FL9A 3AAQA 4WQ5C 2QWQA 4BRIA 3O08A 4A61A 3TPQA 5EXWA 1NBWA 2ZGYA 2A3ZA 3MN6A 4H5NA 3VF4A 4BRKA 4CBWA 3I33A 1X3MA 4H03B 2NZTA 2ZWHA 4PL8A 1QQMA 3IMXA 2GUPA 2P9IB 3H3NO 4BR0A 3HZ6A 2ZF5O 2D0OA 1LCUA 4H5TA 3VGKA 5F0XA 5AQMA 4BR5A 1GLLO 4ISGA 4FWSA 4JAXA 1Y64A 1TUUA 4WQ4C 3ZETA 3A5MC 4DHYA 4CI6A 5BN8A 3QDKA 3O5BA 1RFQA 1NGIA 4FPAA 4MO5A 1JCFA 3VOVA 3H46O 2QWPA 2A41A 2Q0UA 1Z05A 2IVOA 3A0IX 3LDNA 5EY4A 3FE1A 5BR9A 1LOTB 3CJCA 3KVGA 3BP8A 1MWMA 1ZC6A 1BDGA 1NGDA 3EL2A 2FSNA 4H0PA 3ATVA 2DPNA 4EAHD 3R9PA 3FFKB 1KAXA 3CJAA 4YDUC 3VEYA 4BGBA 3EZWA 1NGEA 1YAGA 4JHDA 3M6GA 1OKJA 2FXUA 5FPNA 5ELZA 4DCHA 1R59O 4FSVA 3A8YA 4B1XB 1BUPA 3DAWA 3CETA 2F9WA 3CHWA 3ULEB 1SAZA 1MDUB 2E2NA 4B1ZA 2GEMA 5AQNA 5BRHA 4BRGA 3CQXA 3O80A 5CE3A 2CGKA 4EFHA 4PKGA 3VF2A 1NGJA 3FGUA 2E2PA 5BPNA 4AM6A 4CZEA 2P9KA 3DWLA 1J6ZA 3LDLA 1GLFO 1T44A 2YHXA 4NO7A 4XH5A 5BPLA 5LY3A 5JLHA 4PL7A 2J4RA 4BC2A 1WUAA 3GBTA 2ITMA 2BTFA 5AR0A 5AFUH 3QB0A 3WXIA 2E1YA 1BU6O 3GG4A 5E26A 4BRCA 1BG3A 1TYQB 3P4IA 2E88A 1X3NA 3H6EA 1U2VA 4BG8A 5AQXA 4B1UB 3GOIA 4CZKA 4BREA 4I6MA 5KPRA 3UKRB 4FWOA 4K25A 5ADXH 3OHRA 4FO0A 1MWKA 2P9KB 5LJWA 2P9SA 3HTVA 4F9OA 2ASPA 4WYBA 1RDWX 5JMVA 2VWBA 2IVPA 3O4WA 3WQUA 3L4IA 5FPEA 2D0PA 3FZMA 4H5VA 2P9UA 3D7EO 3QBWA 1X9JA 5F2RA 2A5XA 1U2VB 2Q36A 2EWSA 4L3QA 4FOEA 4O8KA 4EIAA 1E4GT 1KXPA 4M7XA 4FWRA 3CERA 2HMPA 1QQOA 5TKYA 3VESA 3C7NA 1HJOA 2QWNA 1EQYA 1U6ZA 4FOIA 4K43A 5BN9A 3IFRA 1KAYA 3ATUA 1BA0A 2AA4A 4M63C 5AQPA 2WUSA 2V7ZA 1NM1A 4CZIA 1RGIA 2HF4A 4MO4A 1NLVA 3MN5A 2D4WA 4M7YA 5AQHA 2CH5A 5AQTA 3CQYA 2P9UB 2D1KA 3CJBA 1GLDG 1QHAA 1ATNA 1K8KB 5EX5A 3FZLA 3AY9A 4BRPA 2FSJA 2PAVA 3CJ7A 4KBOA 3VGMA 3SLCA 2E1ZA 1CZAN 3EKUA 3RSEA 4A2BA 2KHOA 3H1QA 3M3ZA 3C7NB 2W40A 2FSKA 3ZX2A 3ENHA 1KAZA 1GLBG 4B1VA 4IWVA 3MN9A 4BG9A 3U4LA 4BVOA 4CBXA 2CGJA 2BUPA 3ZETB 1YVNA 4Z94A 3QFUA 3W0LA 2V51B 3BUZB 3UKUA 1DEJA 2P9LA 4JNEA 3HI0A 1NGFA 2V52B 1T6CA 3AARA 2P9PA 4CZFA 3WXJA 4BRLA 1BA1A 3CIPA 4JD2A 3QBXA 2UYTA 2YJEA 3QMLA 4MLHA 3RSEB 1DKGD 5B8HA 5AQOA 2VYPA 2H3GX 3S41A 2HOEA 5KQDA 3FZFA 4IJNA 1ATRA 3WUHA 5BREA 2GELA 1NMDA 4WQ5A 2E2QA 3L6QA 3U9ZA 1GLEG 2V7YA 2Q31A 3ENOA 4IXCA 2E20A 3EN9A 5KQ8A 2P9LB 3EO3A 4JHDB 1HUXA 1NGGA 4RWTA 2P9PB 3JXUA 4BVPA 3MK6A 1XUPO 2OANA 4CBUA 2W41A 4H0VB 4WQ4A 5AFUA 2A40A 4RCHA 4BRQA 4BRNA 1GLJO 2A42A 3DXKA 3HBTA 1HX1A 4NB4A 3BF1A 3H1VX 4BR4A 4BRAA 4PKHA 4FWLA 5AZJA 5FPDA 5F1XA 3GL1A 2FLOA 1ZXOA 5AQIA 4BROA 1SQKA 3SJHA 3W3DA 3HM8A 3UB5A 2AP1A 5ADXA 3ID8A 1JCGA 1NGAA 4B9QA 4IZ9A 5BRFA 4H0TB 3TU5A 5AQYA 5AQZA 3G25A 2NRHA 2CH6A 1ZBSA 4H0OA 1NWKA 5JLFA 1C0GA 2QXLA 1GLAG 2PBDA 4DQ8A 3DXKB 4YDUA 3D2EA 5BPMA 5AQLA 5KPZA 4BQLA 4FWPA 4B1YB 1Q18A 2E8AA 4I6MB 4FWKA 4EHTA 3EKSA 5AZJB 1HLUA 2VCPA 5AQVA 5FPMA 3VEWA 3A5LC 3DXMA 2P9IA 4H0XB 5KPTA 2P9SB 2Q1NA 3L0QA 3AAPA 5E84A 1V4SA 4XEIA 1HKBA 1QQNA 3UE5A 1NGCA 5AQGA 5AQWA 5BRDA 2HF3A 2QWRA 2P9NA 4CZGA 2IVNA 2YHYA 3IUCA 3ZEUA 1H1VA 4O5FA 4H5WA 4CZLA 2IIRA 4EHUA 3WXKA 1XC3A 3LL3A 1ESVA 4BGAA 1T6DA 3QICA 2YCHA 4BRFA 5AQJA 1QZ6A 3CJ1A 3D2EB 4BR7A 5AQQA 2ASOA 4ISFA 4JN4A 4QS8A 3VEOA 1IJJA 3M1FA 4BQZA 5AZIA 3GE1A 4XH1A 3VF6A 4GY2B 3DXMB 4CZJA 3MN7A 2Q2RA 5JICA 3D2FA 1P8ZA 2FF6A 3MMVA 3LM9A 3O8MA 2QM1A 3WEEA 3F9MA 4HWIA 3BF3A 2P9NB 3WXLA 4BR9A 2YJFA 2F9TA 3ZEUB 4QS9A 3ZX3A 3C0BA 4BC3A 3SMPA 3J8AA 1MA9B 4IJAA 3WT0A 3IDHA 1JCEA 4CJ7A 3ULEA 4BRDA 3LM2A 2ASMA 5AQFA 4BC4A 1V4TA 4FPBA 4RTFD 2GWKA 5AZIB 1ATSA 4A62A 4CD1A 1IG8A 3QFPA 3D2FB 4QS7A 3FZHA 4H0YB 3VPZA 4MLEA 3KHYA 3H45C 3WEEB 1BO5O 4CZHA 3R8EA 4BC5A 3KZBA 3U9DA 1E4FT 1QZ5A 1SZ2A 2NLXA 3A5OC 3LDPA 1GLCG 2YI1A 4Y0WA 3UKUB 3R6MA 4BRMA 3VEVA 3B8AX 2Q97A 1TYQA 5AQKA 2I7NA 4JD2B 4K41A 3SMSA 3FLCO 3FZKA 2I7PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LL6Z 4LH4A 4OKJA 3LDQA 1TGOA 1HPMA 5LMUK 3THXB 2HBMA 3HXMA 4BRHA 4W5TA 3OYJA 4DFMA 1OH8A 4JV5K 4B9VA 3KIOA 1S5JA 4X66K 3DOKA 1TKTA 5T7BA 2FBXA 3AVJA 3KLHA 3CPEA 1HYVA 3VGLA 4Z4GA 3OYEA 1I3AA 3I8BA 4B3MK 4JYAK 4FVUA 1XQSC 4DSFA 4FJ5A 1WOQA 3T69A 4KAZA 1D4XA 2W42A 1A5VA 3QIPA 3OY9A 1CXQA 4CEDA 4DB3A 4CHZA 3PIOL 1YUWA 3CJ9A 4C8NA 4DLEA 4FWNA 3UIQA 2HBJA 1VRUA 2YNFA 3TSQA 1VQPN 3MXJA 3ZSXA 4ILHA 3MDQA 4DF4A 4AM7A 2W6LA 4FL9A 3CYMA 4BRIA 1SS6A 4E7IA 1BGXT 2A3ZA 4W5QA 4DR5K 3CCJN 4AILC 5H1SQ 1VRTA 4FZZA 3RTVA 3NGZA 1QQMA 3QIOA 3IMXA 2GUPA 2P9IB 4WFBL 1CZBA 1GOBA 3HZ6A 4O44A 3T1AA 4H5TA 3VGKA 1WLJA 5F0XA 4DQRA 4JAXA 4YOVA 4WQ4C 4AHCA 4CJ4A 3A5MC 4CI6A 2WC9A 3O5BA 1IKXA 4FPAA 3CCMN 1NK7A 1N6QA 2F8SA 4MO5A 1JCFA 4MQ3A 5FROA 3MWTA 5KI6A 1NJYA 3OJSA 1A5WA 1Z05A 2IVOA 3HOSA 1CLQA 3MEGA 2YKMA 4B9MA 3HVTA 4ELTA 4ID5A 3VQ6A 1MWMA 4ELUA 2KZZA 1NGDA 4Q5VA 3V9UA 1R0AA 2UXBK 2G8VA 4W5NA 3KTQA 4E7JA 4EAHD 3R9PA 3OBWA 1B9DA 4BGBA 3EZWA 1NGEA 1YAGA 5HRNA 3KK2A 4C8OA 4DFKA 2FXUA 4FSVA 4LF7K 3VQBA 3A8YA 3MWPA 4HTUA 1C0UA 3LP3A 3PSFA 4H8KA 3ULEB 1SAZA 2I5JA 5BRHA 4BRGA 2HB5A 4O55A 1J5OA 4LD0A 4EFHA 3V6DA 4HUGA 4PKGA 4DQQA 3O9SA 3T1HK 3SQ4A 3QEWA 4AM6A 1XHXA 3AV9A 2P9KA 1ASVA 1G15A 1J6ZA 4I7FA 1K6YA 2B6AA 4NO7A 5BPLA 5M1NA 1RBRA 4CHQA 2FC0A 4PL7A 2J4RA 3ENBA 1BQMA 3DLEA 1TK0A 1VSEA 3GG4A 5E26A 1TYQB 4AHUA 3AO5A 1U2VA 1XWLA 1ZBUA 1Q8IA 4BWMA 3SUNA 2KTQA 3BZKA 4XIUA 4BREA 4I6MA 4CEZA 1EX4A 2G8HA 3D6RA 4K25A 3C95A 3AVHA 3V1QA 2P9KB 1EWQA 2NNWA 2P9SA 3AVFA 4U67L 4DUYK 1SL0A 4M42A 2ZE2A 3FZMA 4H5VA 2UXCK 5F2RA 3MXMA 4FCYA 1U2VB 2EWSA 4L3QA 4O8KA 4CFAA 1LWCA 3G6EN 4N41A 2KFNA 1I94K 1BHLA 1QVGM 5DK5A 1LW2A 1VQ9N 4GVEA 3DRSA 4A57A 2QWNA 4M3ZA 1U6ZA 4FOIA 5BN9A 3IFRA 4JI8K 3BY5A 5AQPA 1NM1A 2HF4A 1M90O 1S9EA 2OPRA 4M7YA 3NF6A 4N56A 4KB1A 3JYTA 1ATNA 1JL2A 4KBOA 1CZAN 3L3UA 3C6HA 3OA9A 4M3YA 2PFUA 3P31A 3EKUA 2GX9A 3NGIA 5CZ2A 4A2BA 4O8UA 1FW6A 4GV3A 3M3ZA 5CYMA 3AVBA 2OPQA 2FSKA 1QS4A 3OVNA 3MN9A 3DRRA 4KO0A 4CBXA 5AJ3K 1VSHA 4DV4K 3SQ0A 1QTMA 2F96A 4OGCA 3ZETB 3K9KA 1YVNA 4MFBA 3QFUA 3UKUA 2P9LA 1QE1A 2V52B 1LWFA 4YOYA 1HQEA 2XO7A 2YJEA 5M1KA 1OH7A 3RR8A 2H3GX 3S41A 5KQDA 5C12A 2GELA 1NMDA 1FKOA 2BE2A 1GLEG 5GIPA 2IGIA 4C1NK 3T1YK 2Q31A 3J81O 3QEXA 4GKJK 4IFVA 4CVNE 3OS2A 3EN9A 4OVLA 4JKFA 2P9LB 1EXQA 5TKWA 5CR4A 1VQ7N 3MK6A 4DU1A 4JKBA 1SL1A 4J2DA 4FJNA 3QEPA 4C8LA 4JKAA 1NKCA 2NUBA 3SYZA 2A40A 4RCHA 3HPOA 4DG1A 2P1JA 2A42A 2OPSA 4IOAL 3H1VX 2F7TA 4PKHA 1W7AA 5FPDA 5F1XA 3LZJA 3CC4N 4BROA 4FW2A 4KREA 4O0IA 1XMOK 1VQ5N 3OBYA 4NXNK 1Q86O 3OYFA 5AQYA 1K9MO 1RT1A 3K5LA 4V19S 4U7BA 3S3MA 2CH6A 3OYIA 3NH1A 1N5YA 1C0GA 1REVA 2YNIA 4YDUA 4DQIA 2O4IA 5BPMA 1TKXA 1QSSA 4BQLA 2E8AA 4FLVA 4FWKA 2Y1IA 3V1OA 1WSEA 3SJJA 1NNEA 4JK7A 3I56N 5KPTA 2VQEK 2Q1NA 3OYBA 4FM2A 1V4SA 1HKBA 1QQNA 3B6OA 3SAFA 5CZ1A 5AQGA 3G10A 3O9RA 2P9NA 3NF7A 2P5GA 3IUCA 4ELVA 3ZEUA 3ZSRA 2O8CA 2PYLA 4CGHA 2UUCK 2HVHA 2YCHA 4BRFA 1QZ6A 1C1AA 4M3TA 4BY9C 5HBMA 3AVKA 3M8PA 1VAZA 1IJJA 4EP4A 4DR1K 5AZIA 1RTJA 3GE1A 4XH1A 4E7KA 5JICA 3CQ8A 3MN7A 4L8RB 2X78A 2A1SA 3N4QA 3TTFA 4O4GA 1HNIA 3WNHA 3VQ4A 3WEEA 3QEVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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