5TP9A

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with compound 2 (gne9178)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
278
structure length
275
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title GluN2A-Selective Pyridopyrimidinone Series of NMDAR Positive Allosteric Modulators with an Improved in Vivo Profile.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 275
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-10-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tp9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tp9A02
4OWDA 2O84X 4PE5B 5DEXA 1A8FA 1BKAA 4F31B 3V83A 1ZU0A 3S4UA 1M5DA 2Y84A 1FQCA 1D4NA 4PFWA 3LSLA 4QSCA 3I5OA 1N04A 2HFBA 1UIUA 1QUJA 4ZEBA 5I57A 1N3WA 3CG3A 3L6HA 4LVQA 4ZE8A 2DS9A 2RF1A 1SW1A 4HCYA 4NF8B 4F2QA 3KEIA 3T9HB 1SQYA 1UTBB 2I6EA 3FIRA 3MP6A 4OFOA 4F3PA 3H6WA 4R73A 5AE4A 4X1BA 4GL8A 3MVYA 1R1NA 4EF2A 2ZYNA 2PT2A 3RPWA 4EQBA 1NNPA 2ZYKA 4QFOA 5A5XA 1GR2A 1B6HA 2I58A 1OIBA 3DELB 4OYVA 1MY1A 4O3BA 1KWHA 2G29A 4HTGA 2RC7A 5HBCA 2ZYMA 1JETA 3CIJA 3EQ1A 2HCAA 2VD3A 2Q2AA 1B4ZA 2HZLA 3RTWB 4KCDA 1HSEA 2QS4A 3OO9A 3T96B 3JZJA 4YICA 1MPDA 2R9JA 1FQFA 1A54A 3TTMA 1DTZA 4ISUA 3EPEA 3SEYA 4ELQA 4X9TA 3O6GA 2YLNA 5AA4A 4IO4A 4EQ7A 1Y20A 1EZOA 1YTVA 2UVIA 3TTLA 2V84A 5TPAB 2I4CA 4RYAA 4G68C 1SI1A 3L6GA 5TP9A 2PYYA 1L5TA 1DPPA 1ZBMA 3LSFB 5I59A 4F39A 1LFGA 3W9VA 3HHFA 3OO6A 1Q35A 3PD8A 4OQOA 3UN6A 4FATA 3IB0A 2GH9A 3O6IA 1NMUA 5TU0A 4GXAA 4OEUA 1LAHE 1SW4A 2FYIA 3HV1A 4OTEA 2RCAA 4K3FA 1NH8A 4HCWA 4JDFA 5I56B 1RYXA 2DYXA 4P0IA 4YKKA 4MLQA 3QUFA 4TQUQ 4BDLA 5DT6A 1MQDA 3AXFA 1B3HA 4H0WA 1MY3A 4FORA 4NWDA 5CRYA 1OQGA 3EN3A 4OETA 2XXIA 1FQEA 4F3SA 3PPPA 3U72A 3MZ1A 4OHNA 3TMGA 1T0KA 1M5CA 4KPTA 1LBBA 4ZEKA 1B1HA 1JW1A 3K6XA 1P1WA 4C1TA 5H8QB 2V3QA 2O1LA 1R6ZA 5LOMA 4NF8A 3TZAA 3K2DA 1MXUA 3EHUA 2XX7A 1FQDA 1UTBA 3K4UA 1QVSA 4EXKA 3MPKA 4MLVA 3CFLA 2OWSA 1FTMA 3TTNA 4LZ7A 1XS5A 1M5BA 5JTYB 5IAIA 5FHNA 1I6AA 3ZKLA 2ALUA 2O69A 4POXA 1NKXA 3KJTA 2PVUA 4GVOA 3PUVE 3CVGA 3JV9A 3C31A 3K1PA 2I49A 3C33A 2BJJX 4IO2A 3V8XB 5KZTA 1B0HA 2XHDA 3M3LA 1GTKA 3KN8A 4OEVA 3R7XA 3Q27A 4DE8A 1S9TA 2DP8A 1D3KA 2RCBA 4YB6A 2ZMBA 3W15C 1LB9A 4RK2A 4R6KA 4DDDA 2ANJA 5KDTB 2ABHA 4I8CA 3QSLA 3F11A 4RNSA 1N84A 3N6UA 5TPAA 1URDA 5M2VA 2WKYA 1FCKA 4H8IA 4IY5A 4N13A 2Y7WA 2X26A 3TFLA 4ELPA 4GF8A 2D5WA 4OENA 5B7DA 3FVNA 1UTHB 4OVJA 3KOTA 1Z7NE 4FEDA 2V3UA 4QRZA 4ELOA 1MQHA 1PB8A 3FZVA 3USDA 3TCGA 2B65A 3KG2A 4R2FA 3C4MA 4FE8A 3H6VA 2H99A 4Q0CA 2F35A 1LBCA 3UP9A 5I56A 4U21A 1VR5A 2O7UA 5DYHA 2F6GA 2HAVA 3HO7A 2QSXA 1ANFA 2THIA 4H6DA 1LGBC 4GIZA 5CI5A 3MVZA 3E13X 5FTIA 1B51A 3FVKA 5FTHA 4GRKA 3OO7A 4FEBA 3RN8A 4RPNA 4JSOA 4WKMA 3C32A 5L9OA 3OEMA 2H4IA 2Y7KA 4PQJA 5H8QA 1R9LA 2AL5A 3DP8A 5CBSA 3LSXA 1OLAA 1DOTA 4PFTA 2NWJA 3IAZA 3BFTA 3O6HA 3O28A 2DVCA 3C34A 3C9HA 4LQ2A 1WDNA 1A55A 4NF6B 4G8HA 5IKBA 1M5EA 1B32A 5K2XA 4WXJA 1XVXA 2H98A 2VOZA 3PMXA 5AA2D 1XC1A 3IOWA 4Q30B 5JTYA 2QS2A 4ZECA 5ITOA 1USYE 3V5AA 2Z22A 3PUZE 2NXOA 1US5A 4QFLA 1N7WA 3KOSA 1YPNA 3ZSFA 4FAJA 3RY3A 4LQ5A 3K00A 1ZJLA 4O3CA 3T66A 4O3AA 3PGFA 5ITPA 1N7XA 4EUOA 1MM6A 3K0VA 1B7UA 4QSEA 3LC8A 4F3GA 2AL4A 3VLWA 2GRVA 1AMFA 3OO8A 2Y7RA 1BIYA 2QL3A 3TQLA 1ZLQA 4Z0IA 4AQ4A 4U2RA 1XVYA 3K1MA 3SEXA 2QPQA 3G3HA 2F97A 4XKQA 2HZKA 1LSTA 2VP1A 3MVWA 4F18A 1Y1MA 1MDQA 3M3FA 2Q89A 5I2KB 4JSDA 1IXCA 2F6PA 2A5TB 3IJOB 4AB5A 1A40A 2F7BA 2XXTA 2XXPA 4KD5A 2UYEA 4M4GA 3MP1A 1UTHA 2V93A 1EU8A 2ONSA 3T93B 3RNNA 1Y4TA 4BDMA 3FXUA 2UVJA 1J1NA 3S2VA 3RUMA 3ZS6A 1QUKA 1MXXA 1RYOA 3ODBA 1FTJA 2V25A 1ZTYA 1SBPA 3MAMA 3OOAA 1B46A 1B0LA 4RPOA 3EF7A 3TPAA 2I3WA 1JW4A 1BP5A 3N5LA 4ZEIA 2IEEA 1A8EA 3CFZA 4LATA 4EDPA 4KFQA 1SYHA 2QJEA 3IR1A 2VD2A 2W7YA 4R9FA 1S50A 2V3TA 3RGYA 3MWBA 1FQAA 2XXXA 1O64A 3D4GA 4EF1A 4G2ZA 1PEBA 1Q1KA 1HSJA 1PBQA 2VGQA 1B3LA 2XXWA 3D4CA 3VLVA 3BKIB 1Y3QA 2E1SA 4KHZE 4NF6A 3VFJA 3CSBA 5KCJB 1DSNA 3VE1B 2H9BA 3LUYA 3E4RA 2REJA 4OFJA 3FUZA 3PV0E 2O68A 5ICQA 4IY6A 3O9PA 3B6QA 3QAXA 4YB5A 3FVGA 2YPNA 4F2OA 1MY2A 1XHYA 1JNFA 4H65A 1H3DA 1BLFA 3KZGA 1GVCA 3OD7A 4NWCA 4ZDMA 4MH5A 2HQ0A 3KBRA 4RXLA 3FATA 1H44A 2KLFA 3PMVA 1S7YA 2YJPA 4KI0E 3CRBA 2NOOA 4GL0A 5H8HB 3W9WA 4R2BA 4DXBA 2NUVA 3IOTA 1B9JA 4EXLA 5J1DA 5F1QA 1F9BA 3U94A 1NL5A 5I2KA 3ILTB 2A5TA 2ZYOA 4RA1A 3V89B 2XXRA 1LFIA 4HS7A 1LCTA 3TUSA 3SEUA 2HAUA 3IB1A 3B6WA 3GXAA 2QMXA 1IITA 4FECA 1ZMGA 3IB2A 4DXUA 2G93A 1Y3PA 1OVTA 2DVZA 3IOUA 1D9YA 2CZLA 4GOTA 4OXVA 1P1NA 5DTBA 3TEPA 3RQTA 3VV5A 1MQIA 3BFUA 4PFYA 3B7DA 1IXIA 1DTGA 2DWHA 3OXNA 2HXWA 1RKMA 1EZPA 1UIVA 4POWA 4H5FA 3A3UA 4NE4A 4DIGA 5ICTA 2Z8EA 4JB7A 1IUDA 4BDQA 1EZ9A 3CFXA 1B7ZA 1B3FA 2M8CA 1MPCA 4KCCA 3SKPA 2REGA 1TFDA 1USYH 2B3FA 3H06B 4BDOA 4ELRA 4YKPA 2F34A 4N07A 4OERA 1FTKA 3KSJA 1IIWA 1JQFA 1MQGA 1B40A 4I9DA 2GFEA 2DSFA 1GV8A 4MBPA 4RY1A 1SVXB 4P11A 1N76A 1NNTA 3I6VA 3C36A 3G3FA 5L8DA 3EHTA 2R6GE 3MW0A 3UORA 1OQHA 4ONYA 3KJ7A 1MXZA 1US4A 1P1OA 2I4BA 3OMBA 3BBRA 3GBBA 4ECFA 3K1NA 4Q5TA 4NMYA 2ZNSA 4DXCA 2B3BA 3FV1A 3KSXA 1N0TA 3SEWA 3O2AA 2QRYA 1LAFE 2DWJA 2Q9TA 1MXWA 4IGRA 4N6PA 1MY4A 3G3GA 2E0SA 3G7WA 5H8HA 4LA9A 4R6YA 1IXGA 1SDXA 5I58B 3QIMA 3PPOA 2H5YA 4EQ9A 1TXFA 3MVXA 5ISUA 3DP4A 3I3VA 4U4XA 3UA8A 2H25A 3FXRA 3K01A 4M1VA 3LSWA 1XOCA 3DM0A 3IO4A 1VFEA 5AA2B 5CMBA 3N94A 3DP6A 3SDFA 3MQ9A 3HN0A 1B05A 2DE2A 2D3IA 4F19A 1P1UA 3A09A 2Y7IA 4HW8A 3HHGA 3RT6B 2FA7A 2FNCA 4UA8A 2HEUA 3OELA 2XX9A 3H7MA 4TLLB 2AIXA 3H4ZA 2DWAA 5DVIA 4GQOA 4XKNA 3SETA 3TDJA 1B52A 1OMPA 1A99A 2CMOA 3GLBA 3PPNA 5JK4A 2PT1A 1MQJA 4QSDA 2F36A 4OMBA 3UGWA 4R75A 4U4SA 3MZ9A 2OWTA 3RLFE 5B70A 3K6VA 4H8JA 1Y3NA 4I1DA 2F7AA 1LAGE 4QF9A 1Y9UA 1WVJA 4BDNA 4E0XA 4NEDA 4IB2A 2O6AA 1MXVA 4F29A 4F1YA 1TFAA 3U8QA 3KGCA 1B3GA 2ZNUA 3FXQA 1MRPA 3HPIA 5KDTA 3FJ7A 5H8FB 4U1OA 4BLAA 4XTCQ 4ZE9A 4R72A 1MPBA 4Z7EA 4ZZAA 1H43A 1YAEA 1A7LA 4LP2B 1OLCA 3R26A 3TODA 1B5IA 3FVOA 3IO6A 3OENA 5EYFA 1N3XA 5CMKA 1LCFA 5HPQA 2VHAA 1FQBA 1ELJA 1B58A 4IO3A 3PU5A 4DZ1A 4YMBA 5CMCA 2QS3A 4WEPA 3R6UA 5EHMA 3H3GA 2XXHA 4E0WA 2DXRA 4DCYA 3U1OA 1PB9A 5I58A 2X7PA 2Z23A 4G8NA 5HM4B 3TTRA 3LR1A 4G68B 2Q8JA 3TQWA 3IOVA 4AB6A 1PBPA 2I48A 4TOZA 1QULA 3GZGA 3U92A 4H67A 2GHAA 3Q25A 5AA2A 4ZZEA 5CBRA 4JWYA 3QK6A 4NTLA 4KYSA 1BTJA 3ILUB 3THIA 3VDFA 1B1XA 3S9MC 3K6WA 1IEJA 1DMBA 1GGGA 2ESNA 1QKBA 4XIGQ 2DQVA 5BUUA 1IZ1A 4GLIA 3VVFA 2NVUB 4YZZA 3FJGA 2Q2CA 2Z8DA 4U23A 1MH4A 4U1ZA 3KN3A 3CR9A 3UIFA 4JBZA 4OESA 1QUIA 2RINA 1MM7A 1MH3A 2P0SA 5K2YA 3TYHA 2XXYA 3G3KA 2O7IA 2ZNTA 3TCHA 4IO5A 4GWOA 4OZ9A 4XXUA 5F7VA 3Q26A 3FV2A 1QW0A 3C35A 4F1UA 2XD3A 2OBGA 3T9UA 3JYRA 4F22A 3S9LC 2DXYA 3M3KA 1PDAA 3H6UA 2XXQA 1WODA 1O7TA 3Q28A 4GD5A 3GBAA 4FIMA 2RC9A 2OJTA 3HSTA 5I2NB 5DVJA 3MZBA 2F78A 4RJZA 1ATGA 3QXMA 2OCUA 4YB7A 2OLBA 3IJXB 3T9VA 3ZKKA 3G3IA 1AOVA 1Y4CA 2XD2A 2GHBA 3TCFA 4L17A 4R9GA 5H8FA 3T9XB 2OK2A 1VE4A 3MC2A 4FJPA 5CMMA 1B5HA 4P0GA 2F7CA 4YU0A 5EHSA 1QJMA 4G77A 1IQ7A 4TLMB 1QKAA 4UACA 4XKRA 4KR5A 3MBPA 4F1VA 1SW2A 3SEVA 1II5A 2O51A 1NFTA 2ONKE 1URGA 1VFDA 4KYDA 4LUBA 1HSLA 3MPLA 2I0CA 4NF4B 1URSA 4MF3A 3FGSA 2DWIA 3Q29A 2DE4A 4G68A 4LONB 5L9SA 4IO7A 3PUXE 3RTFB 1Z7ME 1TWYA 3N6TA 3P7IA 3HCQA 3CG1A 4MFIA 1B3EA 2Q88A 4DLDA 3O66A 4U22A 1EH3A 3VVEA 4X1DA 3FJMA 3TELA 1JW5A 4QFNA 1O63A 1YCJA 3S9EA 5FHOA 1POY1 3IORA 3WAEA 4C1UA 3TAJA 1B7HA 1MG1A 2X7QA 1SD3A 3K02A 1FW0A 2IA4A 1LLSA 5KCJA 4NF5B 1AL3A 3SESA 3ONMA 3FD3A 4GFRA 1CE2A 1XT8A 4QFKA 1SI0A 3KFMA 3MJNA 2QMWA 2D21A 2XXUA 4G4PA 5BWJA 5H8NB 4PP0A 3UK4A 3E3KA 3S9NC 3KN7A 4KQPA 4LZ8A 3DLNA 3ECRA 1AH5A 5ELVA 2PX1A 1MXYA 1ZIUA 2LAOA 3IK6B 4JWXA 4QHQA 3U93A 3PD9A 5I2NA 1FTLA 1D9VA 4IO6A 1Y1ZA 5AA3A 4F3BA 3FASA 3K6UA 2UXAA 1I6BA 3H6TA 5DEXB 1PC3A 4JWOA 1LAXA 3TKDA 3H03A 3O97A 4ESXA 3MP8A 4OFLA 4IGTA 4DCXA 1NNFA 1AIVA 5H8SA 5I57B 3N26A 3RT8A 3O29A 3VXBA 2QS1A 3QYTA 3PMWA 2Z8FA 5I84A 4Q8RA 2XXVA 4LZ5A 3CI8A 3VLUA 4X48A 3VVDA 2P2AA 4ZEDA 4THIA 3A3CA 2DE3A 1LFHA 4H1XA 1SW5A 1MS7A 3EHSA 2I0BA 4XKPA 2I3VA 4NF4A 1VSOA 4R6HA 1MDP1 2AYSA 3M8UA 2F8DA 2F5XA 4G8MA 3VXCA 4ND9A 5CM6A 4PETA 5A5XB 3PUWE 4I62A 4YKIA 1LB8A 1POTA 1IXHA 4GXSB 1H76A 1JVYA 3PPRA 2PMSA 4ZEFA 1UQWA 4H5GA 2O1MA 5JEIA 2RKMA 4YAHX 1B4HA 2ZXTA 4R74A 5FHMA 4QFPA 5CC2A 3E9XA 1M5FA 2UYFA 2R71A 3OSRA 4ESWA 3LBSA 1CB6A 3IX1A 2UVHA 5DVFA 1JEUA 4KYEA 5AA4B 3TTKA 5AA1A 1SYIA 1P1QA 3B6TA 2P1SA 1NNKA 1ZKBA 3PUYE 1R9QA 1P99A 4NF5A 2PBWA 5TP9B 1H45A 1PB7A 1I69A 3OSQA 4PFUA 1I6QA 3SERA 1JVXA 1OVBA 5I59B 2RC8A 2UVGA 5H8NA 4YKJA 3CSGA 3OEKA 3G3JA 1DPEA 1MY0A 4ZS9A 4RK9A 1B5JA 3T22A 4BDRA 3QUJA 3WAFA 1B2HA 5L9MA 4C0RA 4YMAA 2DOJA 4JXIA 1NH7A 4WEDA 2OZZA 2Y7PA 2A5SA 3IL1B 2ONRA 3PPQA 1TT1A 1JEVA 1FTOA 3MUQA 2XX8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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