5TP9A

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with compound 2 (gne9178)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
278
structure length
275
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title GluN2A-Selective Pyridopyrimidinone Series of NMDAR Positive Allosteric Modulators with an Improved in Vivo Profile.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 84
structure length 275
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-10-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tp9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tp9A02
5AA2B 4Q5TA 1TT1A 5DVIA 2I4CA 3DELB 1IIWA 5CMBA 5IAIA 5TP9B 1MQJA 1OQHA 4YZZA 1A99A 4G8NA 4R75A 2Q2CA 1Y3PA 3EN3A 3Q26A 1A8EA 2F5XA 5HPQA 2YPNA 1LCTA 1AMFA 3H03A 3O9PA 1MXWA 4PQJA 1B52A 1UQWA 1JW5A 4R9GA 1NH8A 3M8UA 3CG3A 4UA8A 2ZYKA 3TQWA 3KN8A 1USYE 4ND9A 4F1YA 3G3IA 4IY5A 2YJPA 5TPAA 3MPLA 2XXYA 3K6XA 4X9TA 5CBRA 1BIYA 1ZBMA 3RTFB 2PBWA 1LFHA 4TLLB 3O29A 2ZNTA 1MXZA 4EF1A 4YMBA 3TDJA 4QHQA 3CI8A 3V8XB 2GH9A 5CRYA 5CBSA 1PC3A 3TCFA 5ISUA 3MZ9A 3TEPA 2Y7WA 2BJJX 2RC8A 2GRVA 4F3GA 3N6UA 1B4ZA 3TTMA 1US5A 1SI1A 4DXUA 3TTLA 1UTBA 4AB5A 3OSQA 4FORA 4KPTA 3TQLA 3OOAA 2XXWA 1OIBA 3KSXA 2Y7IA 2DWHA 1B40A 5H8QB 1MRPA 2VP1A 5I57B 2RINA 3LSLA 3VXBA 3C9HA 3T9HB 3VLVA 3H6UA 1SI0A 5H8NB 4OTEA 1RYOA 5B7DA 1MY2A 2F34A 4JB7A 3E13X 4ELQA 4P0IA 1B7HA 4ZE8A 2ANJA 5ICTA 2OZZA 3RGYA 1QUJA 3H06B 1TFAA 2XXXA 4Q30B 3H7MA 2D5WA 2O7IA 1EZPA 4GF8A 5M2VA 3U1OA 2DP8A 1OVTA 3GBBA 4JWXA 1BTJA 4KFQA 3K6UA 2I0BA 2V3QA 1IXGA 4XXUA 5I56B 2I49A 4PFWA 1AL3A 2PVUA 4TQUQ 4YKIA 4QFKA 2RCAA 3MJNA 5DYHA 4YU0A 2UVGA 4BDLA 3FUZA 3KOSA 4KI0E 5DEXB 3K1PA 3U8QA 3B6QA 2A5SA 3MVYA 5BUUA 4U2RA 5I59A 5H8FA 4O3AA 1LCFA 2NOOA 2ZNSA 4HS7A 2O1MA 3F11A 4R2FA 2F36A 1PB8A 1IEJA 4WKMA 3QK6A 3M3LA 3T22A 1Y3NA 4ECFA 2ZYOA 3HCQA 4X1DA 3K00A 3N94A 4FJPA 4QFOA 1FQCA 4P11A 1IZ1A 5FHNA 4KHZE 3ILTB 4OFJA 3KJ7A 3PUYE 2OBGA 4KCDA 2G29A 2PT2A 1A8FA 3CFLA 5K2YA 3O28A 2FYIA 4G8MA 3R6UA 4Q0CA 1SW4A 1DOTA 1XOCA 3BFUA 2XXIA 1PB9A 3MC2A 3QUJA 1MY0A 4QRZA 4ZEKA 1O7TA 4NF6B 3PGFA 3C33A 2PX1A 1DPEA 3QIMA 4QSDA 4X1BA 2ONKE 2DOJA 3OELA 2DWIA 4UACA 2HZLA 3O97A 4U22A 3ZKKA 2VD2A 2DS9A 3U72A 4PETA 2V84A 3UIFA 4MF3A 3RUMA 4BDOA 1MPCA 1XVXA 1QW0A 4POXA 3OSRA 2CMOA 1HSEA 1P1WA 3LR1A 3K02A 4G2ZA 2THIA 2DE4A 3PUXE 2O7UA 1DMBA 1FQAA 3BKIB 3VE1B 1R9LA 4OEUA 2V25A 2OCUA 3HO7A 4RPNA 4LONB 2H9BA 4G68C 1PBPA 1I69A 4ELRA 5I2NB 4F1UA 5EHMA 4EDPA 3PUVE 5FTIA 1LAGE 1YPNA 1OLCA 2Z8EA 1MS7A 3MVZA 4U21A 5TP9A 2ESNA 1NNFA 1GGGA 3MBPA 1XC1A 3BFTA 1YCJA 2XXHA 3HHGA 3SETA 5I2KB 2R9JA 3FVGA 1H43A 1EH3A 4H6DA 4H5FA 4LQ5A 1QUKA 2B3BA 4H1XA 1SBPA 1NKXA 1PEBA 4F3BA 2O69A 5DT6A 1JQFA 3OD7A 2XX7A 3DM0A 1MDQA 3O6IA 5I59B 1B0LA 3K0VA 3KGCA 3C35A 4G77A 5AA4B 5L8DA 3MZBA 4M1VA 5F7VA 2CZLA 1QKBA 1PB7A 1OVBA 4K3FA 1O64A 3PPOA 3L6GA 3C34A 1JETA 1A7LA 4U4SA 3U94A 3E3KA 4FAJA 2VOZA 4OZ9A 4NF8A 1MDP1 4GIZA 3LSXA 1XHYA 4LATA 2OK2A 1LB8A 1URDA 4C0RA 2F6GA 1UTHB 4RPOA 5DVJA 3A3CA 3T93B 4ISUA 2RCBA 5DTBA 4PFTA 1Y4TA 5ITOA 1CB6A 3TKDA 4THIA 1B6HA 1OMPA 4HCYA 2B3FA 4PFUA 3TCGA 4IB2A 2ALUA 1UIUA 3H6VA 3KZGA 4KD5A 1TXFA 4IO6A 4G68B 1MH3A 1Z7ME 4EQ7A 5H8QA 4OHNA 3HHFA 4U23A 3PUZE 5CMKA 3OEKA 4ZEIA 4RXLA 3KJTA 2F97A 3AXFA 2Z23A 4RYAA 1GR2A 1MY1A 3VLWA 3S9EA 4NEDA 2F7AA 2ZYMA 4DZ1A 2QRYA 3DP4A 3KN3A 4GD5A 2Q89A 1ZIUA 1S50A 5HBCA 2A5TA 4OVJA 4MLQA 3MUQA 4GL8A 3OO8A 1JEUA 1LBBA 5I56A 2DE2A 1B51A 3N6TA 4YB6A 3H3GA 1US4A 4ELOA 4IGRA 4M4GA 5DEXA 1TWYA 1LSTA 4L17A 4G4PA 4HTGA 1II5A 3PPRA 2DYXA 4YKKA 1H45A 3OO7A 4OERA 5EHSA 3SEVA 3PD9A 4ZZEA 1R1NA 2ONRA 4I62A 1ELJA 2Q8JA 4EF2A 1SVXB 4LZ8A 5AA3A 4POWA 4R74A 2PYYA 3HN0A 1OQGA 5FHMA 3E4RA 1AOVA 2E1SA 1B5IA 3SKPA 5B70A 4NF4B 2RKMA 4MLVA 5JEIA 1IUDA 4ZEFA 3V5AA 4KCCA 2P1SA 3RTWB 2QL3A 4GVOA 4ZS9A 2UVHA 4NF8B 3UK4A 3C32A 1YTVA 3HSTA 3W9VA 1QJMA 2XXPA 4RNSA 2QSXA 4NF6A 3QXMA 4R73A 4NMYA 2XXQA 3PMVA 4FE8A 1B1XA 4GL0A 1NNKA 4GFRA 1P99A 3GZGA 3IJOB 2O6AA 2UYFA 3PPQA 3RPWA 2Y7KA 3FV2A 1YAEA 1N3XA 5A5XB 4FATA 3HV1A 2XX9A 4ZZAA 4IO2A 2GHAA 2I3VA 4NE4A 5CMMA 1B1HA 4XKQA 3L6HA 2Z8FA 2ZNUA 5I2NA 3GXAA 1ZTYA 5LOMA 2A5TB 1DTGA 3LSFB 3TPAA 2F7BA 3CIJA 5DVFA 3GBAA 4ONYA 4JXIA 1A54A 1LAHE 4E0WA 4XIGQ 1BKAA 5I2KA 4MH5A 2DXYA 2X26A 3VV5A 3A3UA 3PD8A 3IL1B 1MXYA 5AE4A 4YKJA 1FTLA 4PP0A 4P0GA 2DVCA 2I0CA 5H8SA 3KOTA 3FJMA 2B65A 5I84A 5CM6A 3DLNA 5AA4A 4H65A 4ZEBA 1MQGA 3LUYA 4YICA 4OFLA 1SYIA 2V3UA 4LZ7A 4F29A 4C1UA 1NNPA 2XXRA 4HW8A 3D4GA 1ZLQA 3K2DA 3C36A 1UTHA 1FQDA 1B3FA 1ZMGA 3HPIA 1R9QA 3MP8A 3RNNA 3DP8A 4R6YA 5CI5A 1IXHA 4JWYA 2Y7RA 1N7WA 3TYHA 1CE2A 4F39A 2X7QA 1JVYA 1M5FA 2P0SA 1T0KA 1FQBA 3OO9A 4FEBA 4AB6A 1FTJA 4I8CA 1I6AA 3TTKA 3FASA 1LBCA 4BLAA 4IO7A 2X7PA 4G68A 2QMWA 3CSGA 1B7ZA 4H0WA 1EZ9A 3QUFA 3W9WA 4YMAA 3KG2A 3DP6A 4RK2A 3IB2A 3IOTA 2HXWA 4PFYA 1L5TA 1R6ZA 4U1OA 4F3SA 3B6TA 3K1MA 1H44A 1IQ7A 4OESA 3IR1A 4DXCA 1JW1A 3ZSFA 5ELVA 2QS2A 4KQPA 3UP9A 1B3LA 2HAVA 1S9TA 3PPNA 1MM6A 4YB5A 2FA7A 4U4XA 1B3EA 2OWTA 3ZS6A 5KZTA 1NL5A 3T66A 2V93A 5JK4A 1LAXA 3SEWA 3IO4A 5L9SA 4QF9A 3TODA 1HSJA 5JTYB 3O2AA 3S9MC 1EU8A 4F2QA 3IK6B 4FEDA 3V89B 4KR5A 5BWJA 1B2HA 2Y84A 2I4BA 3MVXA 4YAHX 1POY1 2DSFA 4FIMA 4KYSA 3Q25A 4OENA 2H98A 3RQTA 4XKRA 4Q8RA 2REJA 2IEEA 3ODBA 3MW0A 1BP5A 3O6HA 4JDFA 3EQ1A 1MQDA 4WEDA 3P7IA 1IXCA 3TTNA 3PU5A 3FV1A 4NF4A 5FHOA 2PT1A 1AH5A 4XTCQ 3M3FA 3I5OA 4DLDA 4I9DA 4ZECA 1VE4A 2KLFA 4F1VA 4RY1A 3EHSA 2FNCA 2UXAA 3A09A 3FJ7A 2ZYNA 2IA4A 2XXTA 1LLSA 4H8JA 2HZKA 1EZOA 1AIVA 1MXXA 5H8HA 1S7YA 1ATGA 4OMBA 2RC9A 4QSEA 2O1LA 5KCJB 2DQVA 3PPPA 2ZMBA 1B58A 1A40A 3OEMA 4RJZA 2XX8A 2QPQA 4EQBA 4XKNA 4F22A 1RYXA 1B7UA 3H4ZA 3FJGA 1USYH 3IOWA 5ITPA 5I58A 3VVEA 2XXVA 5A5XA 2D21A 1D9VA 3G3JA 2DE3A 2F8DA 1M5CA 4ESXA 3QAXA 1N3WA 4OFOA 3UGWA 5TU0A 4OWDA 1MM7A 4F31B 2HQ0A 4JSOA 1H76A 2Q9TA 1LFGA 3IO6A 4OXVA 1VFDA 3CG1A 3T9XB 3FXRA 2ZXTA 4JWOA 3IJXB 1P1UA 4R72A 1Y1ZA 4IO5A 4KYDA 1OLAA 3PMWA 2DVZA 1NH7A 2UYEA 3D4CA 3GLBA 1ZJLA 3S4UA 3USDA 3FVKA 4N13A 1KWHA 3C31A 2I48A 2O68A 4H67A 2AL5A 5KDTB 1Q35A 4DCYA 2UVIA 3TAJA 3LSWA 3TTRA 3TELA 1WODA 3N5LA 2UVJA 3VFJA 2VGQA 2V3TA 1SQYA 1JNFA 3FXQA 2QJEA 2XHDA 2H4IA 5IKBA 4U1ZA 3VXCA 3KFMA 1B4HA 3U92A 1GTKA 3EPEA 3VVFA 3IX1A 2F7CA 4R2BA 2H25A 4DIGA 2QS3A 2XD2A 2XD3A 2O51A 1QKAA 2Z22A 1F9BA 3WAFA 2OJTA 3MVWA 3G7WA 3BBRA 2RF1A 2QS1A 3KBRA 3MPKA 2NVUB 4IY6A 4ZDMA 1RKMA 3O66A 2G93A 5ICQA 1FQFA 3MWBA 4ZEDA 1ZKBA 1URGA 4HCWA 1PDAA 5H8HB 1Q1KA 3FXUA 1SD3A 2DWJA 4QFLA 4GWOA 5L9OA 3IOUA 4LVQA 1FQEA 3VLUA 4ELPA 3IB1A 3OMBA 2NXOA 1Y3QA 1B3HA 2WKYA 1I6BA 3T9VA 2GHBA 1VFEA 3MQ9A 4RA1A 3CSBA 4LQ2A 3CR9A 3TFLA 1DTZA 4BDRA 3SERA 1N7XA 2I6EA 5I58B 1N04A 2ONSA 1IXIA 4NF5A 4ESWA 3IORA 5CMCA 3R7XA 3E9XA 3SEUA 3WAEA 3FIRA 1P1QA 3RT8A 3TZAA 4G8HA 3T9UA 4IO4A 5JTYA 3PUWE 3CVGA 2Q88A 3SEYA 3FD3A 1LGBC 2E0SA 4LUBA 2D3IA 1MPDA 3G3KA 4EUOA 1WVJA 4GLIA 1DSNA 2H99A 3TCHA 4O3BA 2M8CA 2YLNA 3H6TA 3RY3A 4F3PA 3FATA 3CRBA 1MXVA 4NWCA 4Z7EA 2RC7A 3EHUA 4O3CA 4MFIA 4GQOA 2HCAA 3ECRA 4QFPA 4F2OA 3I6VA 3QYTA 5J1DA 5CC2A 4TOZA 3OXNA 3SDFA 3RN8A 4R6KA 2Q2AA 4BDQA 1B3GA 4H8IA 1BLFA 3G3FA 3Q29A 2AIXA 3B6WA 2NWJA 4R6HA 2R6GE 1M5EA 2LAOA 2F78A 3TMGA 3H6WA 1N0TA 3SEXA 3TUSA 4MBPA 1GVCA 4EXKA 1TFDA 1J1NA 3Q28A 4F19A 1JVXA 1MQIA 4BDNA 5TPAB 1NNTA 2OLBA 3C4MA 5FTHA 4OYVA 1FTKA 2VD3A 2I3WA 4IGTA 5KCJA 3EHTA 1SW1A 4EQ9A 4DE8A 3VVDA 1FCKA 1Z7NE 3S2VA 3CFXA 4LA9A 3JZJA 1LAFE 1N84A 2W7YA 3IAZA 3LBSA 3M3KA 2GFEA 1IITA 1FW0A 3SESA 1UTBB 3RLFE 4X48A 3UN6A 3U93A 4BDMA 3V83A 1D4NA 4LZ5A 1ANFA 2REGA 3K4UA 2DXRA 2O84X 4NF5B 1ZU0A 3UORA 1UIVA 1MQHA 2F6PA 2XXUA 3W15C 1MY4A 1XT8A 1MH4A 2H5YA 3R26A 1M5DA 1GV8A 1B5HA 4GRKA 2Y7PA 4C1TA 3KEIA 3G3GA 1JEVA 1B9JA 4GOTA 2AL4A 1O63A 2VHAA 1D3KA 5AA2A 4N6PA 4PE5B 4WEPA 3G3HA 3QSLA 2HFBA 1B5JA 1Y20A 4DXBA 4E0XA 2DWAA 3JYRA 3MZ1A 5EYFA 2NUVA 3CFZA 4RK9A 1P1OA 1B32A 5KDTA 3THIA 2QS4A 1POTA 4N07A 2PMSA 1QVSA 4R9FA 1QULA 4DDDA 2F35A 1B0HA 1P1NA 4I1DA 4OQOA 5HM4B 1XVYA 4FECA 3S9LC 4QFNA 4OETA 1Y4CA 4NWDA 2AYSA 5AA2D 1NFTA 1A55A 5AA1A 3EF7A 1SW2A 3ILUB 1N76A 3UA8A 4XKPA 5H8FB 1JW4A 1QUIA 3IOVA 3JV9A 2ABHA 4GXAA 4LP2B 1H3DA 3ONMA 3KN7A 4IO3A 1PBQA 1B05A 1XS5A 2HEUA 1SW5A 4NTLA 3S9NC 2R71A 3O6GA 3MP1A 2P2AA 5F1QA 1LFIA 4YKPA 1Y1MA 3K1NA 2OWSA 3MP6A 1WDNA 4EXLA 3B7DA 3IB0A 4OEVA 2HAUA 1SDXA 4AQ4A 3I3VA 3RT6B 5L9MA 1MG1A 3ZKLA 4GXSB 1B46A 3FVNA 1VSOA 1MPBA 4DCXA 1D9YA 1URSA 4YB7A 3MAMA 3VDFA 3FVOA 4Z0IA 2QMXA 3Q27A 1FTOA 3T96B 1M5BA 4F18A 1DPPA 5K2XA 3N26A 1NMUA 2I58A 3LC8A 2Z8DA 1HSLA 5I57A 1MY3A 4ZE9A 4JBZA 5H8NA 4WXJA 1SYHA 3FGSA 3KSJA 1LB9A 4H5GA 3K01A 3OENA 4QSCA 3FZVA 4KYEA 3PMXA 4JSDA 3PV0E 4TLMB 3OO6A 3K6VA 3K6WA 1MXUA 1FTMA 1VR5A 1Y9UA 1I6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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