5TP9A

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with compound 2 (gne9178)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
278
structure length
275
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title GluN2A-Selective Pyridopyrimidinone Series of NMDAR Positive Allosteric Modulators with an Improved in Vivo Profile.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 84
structure length 275
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-10-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tp9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tp9A02
5K2YA 2F5XA 1UIVA 3C31A 3LSLA 4IY5A 3OO8A 1OLCA 4R75A 2I0CA 2R9JA 2REGA 4FECA 2VGQA 1LB8A 5CMMA 4DXCA 3Q27A 3K02A 5IAIA 3THIA 5I2KA 2A5TB 3FIRA 5TU0A 1FQEA 1FTOA 3B6WA 4RY1A 3W15C 4E0XA 4X9TA 5EHSA 1MY4A 1JVYA 1QUIA 4JSDA 3U93A 4DXBA 1WVJA 4DDDA 4OXVA 2I6EA 3DM0A 1EZPA 3IAZA 1TFDA 4RK9A 1A40A 4O3CA 1FCKA 4U4XA 4KPTA 2P2AA 1JW5A 3CG1A 1B1HA 4IO7A 4OESA 3RUMA 4ONYA 3UN6A 4RJZA 4UA8A 2OK2A 2OZZA 2XXHA 4OFLA 3QUJA 5HBCA 4ZEKA 1B0LA 4U1OA 1SW5A 2AIXA 4XKPA 3TTNA 1N76A 1P1NA 4OERA 3IOVA 1M5FA 1I6AA 3MPKA 1URGA 5I2NA 1GV8A 1EU8A 1FQAA 1PB7A 3EPEA 4WKMA 3EN3A 4BDNA 4F22A 3MBPA 5AA4A 2QL3A 4JWYA 2LAOA 3SESA 4M4GA 2HEUA 3T93B 1CE2A 1PEBA 3CG3A 3KN7A 2DQVA 1BIYA 1MS7A 3TQWA 3OXNA 1VFEA 1HSLA 2ABHA 2QS4A 4GXAA 4FJPA 1B3EA 3TYHA 5I56A 3PUVE 1B32A 5CC2A 2VOZA 4BDLA 1M5EA 3B6TA 3T22A 2AYSA 4NF4A 1R9LA 1M5CA 3RQTA 1LB9A 3EF7A 2Q88A 3O6IA 2XXVA 4I1DA 1LAXA 1SW4A 4GVOA 1B1XA 1MDP1 2REJA 1UTBA 3FJMA 4G77A 4P0GA 3RNNA 3KEIA 3T9UA 3VFJA 1UTBB 3ILUB 5DVJA 3L6HA 1Y3PA 5TPAA 1PBQA 1FQCA 3PPOA 3U92A 4HCWA 2ONKE 2DYXA 1JETA 2Z23A 3N5LA 3IOWA 1N04A 4H5FA 4TLMB 4ELRA 1KWHA 3OOAA 2ZNUA 3BFTA 5CI5A 1Y20A 3GBAA 4F3SA 4GOTA 3M8UA 1VE4A 2DVCA 3C9HA 4JB7A 4OETA 1Y4TA 1FTMA 2A5TA 2H5YA 1L5TA 2NUVA 2V93A 1MPDA 3CI8A 3MVXA 4RA1A 3V83A 2F34A 2XX8A 3I6VA 3TEPA 3O9PA 4QSEA 1R1NA 2DVZA 1QVSA 1USYE 3DP8A 2ESNA 4H8JA 1Y3QA 4OEVA 4YU0A 1LSTA 3LSXA 4LZ8A 3G3HA 4G68A 3VVEA 4XIGQ 3HSTA 1OMPA 2PT2A 4BDMA 2QMXA 1USYH 3H6VA 1N3XA 4AB5A 3K01A 3OMBA 3IJXB 4XKQA 2GRVA 1B0HA 2XXQA 4MH5A 2Y7KA 3ZS6A 2DE2A 3K6UA 3MZ9A 1YCJA 5AA2B 5KCJA 1P99A 5JK4A 3QSLA 4EUOA 4NF6B 3VLVA 4RK2A 2O69A 2V84A 3MAMA 1URSA 3IX1A 2GFEA 1N0TA 4ISUA 5FTIA 2ZMBA 2F7AA 3PD8A 1F9BA 1P1QA 2X7QA 3UGWA 2P0SA 3T66A 4DZ1A 1NMUA 3IB1A 1PDAA 2QMWA 3ODBA 4H65A 3U1OA 2RC8A 4DE8A 1XHYA 5CMKA 4OTEA 5I57B 1OLAA 4BLAA 3A3UA 3E4RA 3C33A 4ZEFA 4ZEBA 1TWYA 1GGGA 1IUDA 2Z8EA 4F18A 3EQ1A 3HPIA 4ZEIA 3QYTA 3OEKA 2DSFA 3HO7A 4IB2A 4NF5A 1I6BA 4EXKA 5J1DA 2XXXA 4F3BA 1IXGA 4I8CA 1A7LA 2ZNSA 4LZ7A 4X1BA 4E0WA 4F2QA 4ZECA 4LQ2A 3IB0A 5BWJA 4EDPA 5H8HB 1GVCA 1B5HA 2XXYA 1B58A 4FATA 4LVQA 1J1NA 2QS1A 5FHOA 3MC2A 3KJ7A 4FE8A 3Q25A 5CRYA 2O6AA 4IO6A 1PC3A 5TPAB 2Y7WA 4F31B 4Q8RA 2ZYKA 1MXXA 3HHGA 5LOMA 3GLBA 1OVBA 3E13X 3H4ZA 4JWOA 4EQBA 1XS5A 3FJGA 4NF8B 1VFDA 4KD5A 1B3FA 1MH4A 3U94A 4GQOA 3FASA 4KYEA 2GHAA 3K0VA 2PYYA 4IGRA 3MWBA 2DP8A 3R6UA 4JBZA 4Q0CA 1DTZA 2AL4A 2QRYA 4YAHX 3JV9A 5I84A 1B5IA 1QKAA 3IORA 5JTYB 1AOVA 2F7BA 1ZLQA 4YB7A 1D4NA 3LUYA 2Q8JA 3ECRA 3SEYA 4F2OA 1MXUA 4ZEDA 4YKKA 3CFXA 3OSRA 5DVIA 4F19A 5BUUA 1NL5A 5A5XA 1N3WA 1XVXA 4HCYA 4IGTA 3VLWA 2ZYOA 3ZSFA 2PVUA 1JW1A 3G3IA 4FEBA 4YICA 4EF2A 1SW2A 4OQOA 1GTKA 2D21A 4NTLA 2RC9A 5KDTB 3AXFA 1ZIUA 1B46A 1MM7A 1XT8A 2HZLA 3I5OA 3O2AA 2XD3A 2YLNA 1HSJA 2Q89A 3C4MA 4OENA 1JQFA 1NNTA 2OLBA 1GR2A 1NNKA 2E1SA 2H99A 3BFUA 2O1LA 3Q26A 2I48A 4G8MA 3RY3A 2D3IA 2FYIA 1VSOA 4F1VA 2IEEA 4ESWA 3H3GA 4R6HA 2AL5A 4QHQA 3SKPA 4YMBA 1OVTA 2I4BA 2Z22A 1MPBA 5I2KB 4YB5A 4H67A 2R71A 1MY1A 2RCAA 3G3KA 3VLUA 4P0IA 3I3VA 3PPPA 2P1SA 4DIGA 4N6PA 3FATA 3UP9A 3IOTA 3MVYA 4U23A 1BTJA 1S50A 5H8QB 1MRPA 1POTA 5I58B 1MPCA 3SEUA 4GFRA 1LAGE 3H6WA 2QS2A 3LSWA 4YMAA 1NH8A 3FVOA 3MZBA 1B7ZA 3FD3A 3TQLA 2H4IA 3HN0A 4QRZA 2XXIA 2I58A 2O68A 3A3CA 3N6TA 4QF9A 4RYAA 5FHNA 2DWAA 3PPRA 1A99A 4JDFA 2F6GA 3T9XB 4PETA 1LAFE 3CRBA 1ZKBA 4QFNA 4R9GA 2Q2CA 1QJMA 3QIMA 2Q2AA 2OWSA 1A55A 3QUFA 4FORA 4OWDA 4UACA 5EYFA 4F39A 2XD2A 1SYHA 4H6DA 1MXWA 4PP0A 3TTRA 5H8SA 1JW4A 4F1YA 4GIZA 1MXYA 3TMGA 1UIUA 1ZBMA 3MPLA 3TFLA 1MY3A 2GH9A 4MLQA 4ND9A 1US4A 5DYHA 4NMYA 1QKBA 4N13A 3EHUA 5I58A 1YPNA 1R6ZA 1ATGA 3M3KA 5M2VA 1O63A 1Z7NE 3OO6A 5CMBA 2OJTA 3RPWA 3MVZA 4ZS9A 4G68C 2UYFA 2XXWA 1QULA 3MZ1A 4EQ9A 4PE5B 4RNSA 5I2NB 3OSQA 3K2DA 4NF8A 4R6YA 1WDNA 1Q35A 3BBRA 3DLNA 3MP6A 4L17A 3TCGA 4KR5A 3ZKLA 1Y3NA 3KSJA 3FV1A 3T9VA 1B40A 1QUJA 2OWTA 1I6QA 1JEUA 3MVWA 3FGSA 3RTFB 3S2VA 4EQ7A 2H98A 3C36A 3WAEA 3EHSA 2NXOA 4GL8A 3QXMA 1Q1KA 3LC8A 3U8QA 1SW1A 2XXTA 4ZE8A 3ZKKA 2I4CA 5AA3A 4ZZEA 2QJEA 4I9DA 2M8CA 5H8HA 1D9VA 3FVNA 1BP5A 3S9EA 3GZGA 4MFIA 4EXLA 4AB6A 3KOTA 1IEJA 1A8EA 4K3FA 3WAFA 3OENA 3FXUA 2HXWA 3K6VA 4GWOA 4DCXA 3FZVA 5CBSA 1Y1ZA 1DTGA 1QW0A 3PMWA 1POY1 4YKIA 1N84A 2THIA 3RLFE 5A5XB 4KYSA 5CM6A 5I56B 4G2ZA 4ESXA 1LLSA 2QPQA 2O51A 1FQBA 2VHAA 2F6PA 3TTKA 3PPNA 1EH3A 3TDJA 2XXRA 4OYVA 2Y7PA 3KG2A 3EHTA 3ONMA 3D4CA 4POWA 5F7VA 1BKAA 3UIFA 3G3FA 3FVGA 1O64A 5ITPA 4YB6A 4LQ5A 3TAJA 1RYXA 1ZJLA 2DE3A 2ONRA 2UVIA 1II5A 4OZ9A 3OO9A 3RGYA 3SERA 3G3JA 4H5GA 4ZE9A 1B4ZA 4Q5TA 3KSXA 3SEXA 3VE1B 3GBBA 1MXVA 3HHFA 4GD5A 3O6HA 2F36A 1XOCA 3FVKA 4NWDA 5AA1A 2UVHA 5H8NA 3S9NC 2PX1A 1IXHA 4ZDMA 3D4GA 1IIWA 5KCJB 2Y7IA 3PU5A 3K1NA 3TZAA 3CSBA 3LBSA 4R6KA 4YZZA 5AA2A 5DEXB 3K4UA 1YAEA 1D3KA 3O28A 1A8FA 3IO6A 4OFJA 4BDOA 1AL3A 1NKXA 2HFBA 4MBPA 4PFWA 2V3UA 3S9LC 4NF5B 2F97A 3MP8A 2RINA 2H9BA 3O29A 4G68B 4DCYA 3IK6B 4U22A 4MLVA 3W9WA 2O7UA 2ONSA 4DLDA 1SYIA 1H44A 3KZGA 1FQFA 4LZ5A 3V5AA 3E3KA 4JSOA 5IKBA 1LFHA 3TCHA 1DMBA 2G29A 3GXAA 2DWIA 3H7MA 3CSGA 3QK6A 4LUBA 3HCQA 4TOZA 1MQJA 3N6UA 1IQ7A 2QSXA 3E9XA 2I49A 1JNFA 1LAHE 2W7YA 3M3FA 4OEUA 3VV5A 2GHBA 4R2BA 4BDQA 1IXIA 1PB9A 3N94A 3DP6A 2VP1A 2OBGA 2V3QA 3CVGA 1OQGA 3OO7A 3TUSA 1IZ1A 1EZOA 3C35A 3SEWA 1DPEA 4GXSB 3PUXE 4FEDA 5K2XA 3KJTA 4QFKA 1SD3A 3CR9A 4R9FA 4Z7EA 2X7PA 2BJJX 5FHMA 3FV2A 5CMCA 3PUYE 2UVGA 2ZYMA 2ZYNA 1IXCA 3P7IA 1LBCA 1R9QA 4TQUQ 4DXUA 1MQGA 5HPQA 4WEPA 2NWJA 3UA8A 1NNPA 4MF3A 4ELQA 2HAUA 4LONB 4XKNA 5EHMA 4QFPA 2R6GE 5B70A 3PUZE 4R74A 1FQDA 5ICTA 2XXPA 1AIVA 1ANFA 1YTVA 5TP9B 2B3BA 4Z0IA 4RPNA 4GF8A 4QFLA 3O97A 5ISUA 1T0KA 4AQ4A 4Q30B 2DWJA 4KFQA 1D9YA 4M1VA 4OFOA 1HSEA 2PMSA 3PMXA 4H0WA 4XTCQ 3IOUA 1FTLA 3F11A 3M3LA 3MP1A 5TP9A 3SDFA 3TODA 5L9OA 1MY0A 1Y4CA 4YKPA 3PD9A 2I0BA 1O7TA 1P1OA 3S9MC 1ZTYA 1FW0A 2Z8DA 4N07A 1DOTA 4ECFA 2O7IA 3KGCA 5KZTA 2PT1A 2X26A 2UVJA 3IL1B 1TT1A 2UYEA 3FJ7A 4GLIA 4IO3A 3G7WA 3JYRA 4KCCA 4R73A 4RXLA 3USDA 3IR1A 3TTLA 2DE4A 1IITA 1FTJA 1B3LA 3PGFA 2V3TA 1BLFA 4JXIA 4GL0A 3L6GA 3MJNA 1B05A 3SEVA 3OEMA 1MQDA 3KOSA 4POXA 1UTHB 1PBPA 2UXAA 3UK4A 5JEIA 4H1XA 3H6TA 1MH3A 1SVXB 2I3WA 4LATA 1B7UA 2VD3A 3H6UA 1H3DA 1SDXA 2YJPA 1FTKA 5AA4B 1NNFA 2DOJA 1Y9UA 3B6QA 4PFTA 1US5A 1MQIA 4IY6A 5H8QA 1EZ9A 4FAJA 3MUQA 5I57A 2RCBA 4KI0E 1SI0A 1LGBC 2H25A 4PFYA 1OQHA 4U21A 4U1ZA 2OCUA 3HV1A 3MQ9A 2ZNTA 4XXUA 3C34A 5ICQA 3H06B 1I69A 2HCAA 2O84X 3PUWE 2Z8FA 1OIBA 3K00A 2QS3A 5DT6A 4NEDA 4THIA 4YKJA 4BDRA 4ELOA 3PMVA 3KFMA 4G8HA 4IO5A 4NF6A 5B7DA 5H8FB 1LCFA 2RC7A 4NE4A 5H8NB 4I62A 4X1DA 3QAXA 2DXRA 3RN8A 1H76A 2D5WA 3OELA 1ZMGA 2CMOA 2VD2A 3V89B 2Y7RA 4C0RA 3Q28A 1ELJA 1VR5A 3VXBA 4U2RA 4QFOA 2Y84A 4KYDA 4GRKA 4F3GA 2NVUB 4IO4A 2FNCA 3FUZA 4OVJA 4X48A 4G8NA 2I3VA 5F1QA 5I59B 3RT6B 1B7HA 2RKMA 2PBWA 2Q9TA 2ANJA 1Y1MA 3B7DA 2XX7A 2YPNA 4HTGA 4ZZAA 4C1TA 1B3HA 2WKYA 3R26A 1B5JA 3IO4A 4QSCA 3A09A 1JEVA 2O1MA 1PB8A 5CBRA 1A54A 1MXZA 3C32A 4PFUA 1UTHA 1UQWA 2XXUA 4IO2A 3G3GA 1H43A 3K1MA 3FXQA 5L8DA 1XVYA 1DPPA 2HQ0A 2XHDA 3TTMA 2CZLA 1B3GA 1B9JA 1N7XA 1P1UA 3PV0E 4R72A 3U72A 2ALUA 3CIJA 4LA9A 4KHZE 4EF1A 3K1PA 3VXCA 5AE4A 4XKRA 1NH7A 2B3FA 3DP4A 5DEXA 5AA2D 1TXFA 4G4PA 4OMBA 3VVDA 4NF4B 3SETA 4QSDA 1QUKA 3O66A 4C1UA 5L9MA 5HM4B 3H03A 4KQPA 5KDTA 1TFAA 4JWXA 3IJOB 4LP2B 1NFTA 3BKIB 4HS7A 1M5DA 1RKMA 2F35A 4RPOA 3LR1A 3N26A 4R2FA 2DWHA 2F8DA 1LFGA 5JTYA 3K6XA 3KBRA 1MQHA 3VDFA 1SBPA 1AMFA 1N7WA 3T9HB 2F7CA 2F78A 3KN8A 1AH5A 1B2HA 1MG1A 1S9TA 1DSNA 4OHNA 1SQYA 1B52A 3DELB 5ELVA 2IA4A 3UORA 4FIMA 1B4HA 1H45A 2KLFA 1LFIA 1S7YA 5ITOA 3KN3A 1WODA 4WXJA 5FTHA 2E0SA 4U4SA 2V25A 2B65A 3TCFA 4H8IA 3TELA 3O6GA 3IB2A 3FXRA 4NWCA 4WEDA 5H8FA 2HAVA 4TLLB 1LCTA 2ZXTA 2G93A 3Q29A 2RF1A 4PQJA 3CFLA 3CFZA 1B6HA 1MY2A 1MM6A 1XC1A 4KCDA 3LSFB 1CB6A 1ZU0A 4O3AA 2A5SA 3JZJA 3MW0A 3RT8A 2DS9A 1SI1A 3PPQA 1JVXA 1M5BA 4P11A 1P1WA 3T96B 5L9SA 1B51A 1URDA 3R7XA 1Z7ME 3TKDA 2DXYA 1LBBA 5DVFA 2HZKA 2NOOA 3W9VA 3RTWB 3ILTB 4HW8A 4F3PA 3S4UA 2FA7A 4F1UA 1RYOA 3V8XB 5I59A 4ELPA 3TPAA 3OD7A 3VVFA 3K6WA 4F29A 2XX9A 1MDQA 4O3BA 5DTBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1A99A 2F6GA 4R9GA 3QIMA 4X04A 1SYHA 4H6DA 1MXWA 3TTRA 1UIUA 5DYHA 1QKBA 3QMFA 3M3KA 4QBAA 2XXWA 4EQ9A 4RNSA 1VDWA 1FPJA 4NF8A 3BBRA 3DLNA 3KSJA 3T9VA 2CEYA 3S2VA 4EQ7A 3QXMA 3U8QA 5AA3A 4ZZEA 5ET7A 2M8CA 5H8HA 1D9VA 1G0IA 3FVNA 1A8EA 2HXWA 1N84A 1LLSA 2VHAA 2Y7PA 3EHTA 3TAJA 2DE3A 4H5GA 1B4ZA 1FBEA 1FBHA 3KSXA 3GBBA 4GD5A 1FPBA 2PX1A 3D4GA 5KCJB 2Y7IA 5AA2A 3TZAA 3CSBA 3LBSA 4GBWA 3K4UA 1YAEA 3O28A 4IR8A 3MP8A 4G68B 2H9BA 4DCYA 3IK6B 4U22A 4PBHA 2XXKA 3W9WA 2ONSA 1IMAA 2DWIA 2BJIA 3QK6A 5ESYA 1MQJA 3E9XA 1JNFA 1LAHE 2HXRA 2W7YA 4HE0A 4BDQA 4R2BA 1IXIA 3N94A 3RPLB 3SEWA 1SD3A 2X7PA 5CMCA 3PUYE 2ZYNA 4TQUQ 1MQGA 4MF3A 2ZZVA 2DDKA 4AQ4A 4O94A 2DWJA 1HSEA 2PMSA 4MHFA 3M3LA 4GX6A 4PGNA 1DOTA 2UYEA 4RXLA 3IR1A 5EYGA 2WYPA 3E78A 3L6GA 3KOSA 4N81A 3E79A 2Y5LA 4LATA 1B7UA 2VD3A 1NNFA 4FAJA 5I57A 3MUQA 2RCBA 3PTYA 4X8RA 4U1ZA 5ICQA 2ZNTA 3C34A 2CZIA 5DT6A 4O7MA 4BDRA 4ELOA 3PMVA 3KFMA 3T0JA 4I62A 3QAXA 3V89B 4PC9A 4NF0A 4GRKA 4IO4A 2FNCA 3FUZA 5I59B 2RKMA 1FPIA 4ZZAA 2WKYA 3IO4A 3A09A 1JEVA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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