5TP9A

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with compound 2 (gne9178)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
278
structure length
275
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title GluN2A-Selective Pyridopyrimidinone Series of NMDAR Positive Allosteric Modulators with an Improved in Vivo Profile.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 84
structure length 275
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-10-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tp9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tp9A02
2ZYMA 2ALUA 4QRZA 4LZ7A 3HHGA 5F1QA 2QRYA 2F7AA 4GXAA 1P1UA 4LZ8A 5CC2A 1UTBB 3C4MA 3GZGA 1SBPA 4I8CA 3H03A 3ZS6A 5CMMA 1URGA 4X48A 3RNNA 1QVSA 4PFYA 4TOZA 3DP8A 1JVYA 1BIYA 3VVDA 4ESXA 1QKBA 4NMYA 1MY0A 3O97A 2XD2A 1US5A 4G77A 3TTRA 1PB7A 4DLDA 3OELA 3FASA 2QL3A 2AL5A 1B3LA 2DXYA 1M5FA 1RYOA 1SW5A 3KJ7A 4U2RA 3G3JA 4PP0A 2I49A 4QSEA 4RY1A 1RYXA 3SDFA 1SW4A 4LZ5A 3UK4A 3Q26A 3T9XB 3TUSA 1LFGA 2QS4A 4N13A 1Y1ZA 1UTHA 3H06B 4GVOA 1OMPA 3PUVE 1DMBA 4H1XA 1HSEA 1XVXA 1B7ZA 4NF8A 3KZGA 3M3FA 1XC1A 1ELJA 4ZS9A 3RTFB 3TQWA 3CFZA 2YJPA 2PT2A 3CR9A 2I0CA 4NWDA 2DE2A 4OEVA 5JTYA 4F1VA 1Z7NE 2DS9A 3ZKKA 5I59B 4MFIA 2Q2CA 1JW5A 4NF4B 2I0BA 1LB8A 1D4NA 3KSXA 3VVFA 3OXNA 4NF6B 5CBRA 3RPWA 3QK6A 1XVYA 5AA2A 4PQJA 2Z23A 4TLLB 3TMGA 4RK9A 2AIXA 3KFMA 1EU8A 3PMXA 3N6TA 1ZU0A 2Q8JA 2VGQA 5CI5A 4KQPA 2PX1A 3TODA 4F3GA 1LBBA 1B6HA 1B40A 4FJPA 5I56A 2ZYOA 3PV0E 3F11A 5TP9A 1J1NA 4OEUA 3IR1A 2UVJA 1R9LA 3QSLA 4FECA 3M8UA 4BDRA 2XXQA 2OZZA 4FEDA 4WKMA 4KCCA 4DDDA 3PPPA 3FJ7A 4BDOA 3A3CA 4F2OA 3U92A 3FXQA 4U23A 4DZ1A 4GL0A 3TTLA 3D4GA 2V25A 5L9SA 2PYYA 3UA8A 3PMWA 1L5TA 2P2AA 3OEMA 1F9BA 2FYIA 3S9LC 4FIMA 3RTWB 1NNTA 4ZEDA 2O69A 4IO4A 1A99A 4DXUA 3THIA 4XXUA 3I5OA 1BTJA 1GGGA 1JVXA 3CG3A 4R9GA 4GLIA 4IY6A 4KCDA 5CMCA 2ZNSA 4YKPA 3K1MA 3LSXA 4QFLA 1YPNA 1MQHA 2D3IA 3PUWE 4MH5A 3VV5A 5HBCA 1TFAA 3CVGA 1VFDA 1B7UA 1PBQA 2Y7WA 5H8FA 3OEKA 3KG2A 3SKPA 5TU0A 4GRKA 3MVZA 3TZAA 2X26A 1A7LA 3VXBA 4OFJA 1ZBMA 4MLVA 4Q30B 4MLQA 1SYHA 1B32A 3TTMA 1IQ7A 2NVUB 2QJEA 1OQGA 1P1OA 3U8QA 4EQ9A 3BKIB 3RQTA 3MJNA 4EXKA 4G4PA 1B4HA 1H3DA 3G3KA 1DOTA 1TFDA 3CSGA 4KD5A 2V3UA 2R6GE 3H7MA 3E9XA 2QS3A 2DWIA 1LAFE 3MBPA 3RT6B 5I2NB 4F1UA 1UTBA 3IAZA 3CFXA 4OETA 5I58B 4LA9A 1II5A 1A40A 2DOJA 4AB5A 2XX8A 4NE4A 4U1ZA 5A5XA 3HSTA 4MF3A 3N5LA 1MDP1 4LQ5A 3ZSFA 5AA1A 1LFHA 1QJMA 1ZKBA 4ELPA 1B3GA 1TXFA 2FNCA 4RXLA 4EXLA 2ONSA 3W9VA 4QFKA 4F19A 4H8IA 1SI1A 4ZEFA 1PB8A 1FCKA 2ZNUA 3ONMA 1GV8A 1SYIA 1MQGA 2DSFA 4YICA 3UIFA 3O2AA 2DWAA 1EZOA 3O9PA 2NWJA 4UA8A 1USYE 1O63A 1SW1A 1Q35A 1ZIUA 2A5TB 5DVJA 2V84A 1MM7A 4RPOA 2GRVA 2V3QA 2ONKE 2ZNTA 1A8EA 4FORA 2GHBA 1I69A 4GXSB 1YTVA 4OWDA 3LSWA 4QFOA 1MY3A 3I3VA 4AQ4A 1OQHA 4G8HA 3L6GA 3TFLA 1B1HA 1LBCA 1FTLA 4IO6A 3SERA 2D21A 3TPAA 1CB6A 4FEBA 4O3BA 4ECFA 3CIJA 1VR5A 4H6DA 1LB9A 4XKPA 5ICQA 3DLNA 5DVIA 4YZZA 1XT8A 2UVHA 1B52A 3EN3A 3H4ZA 5I59A 1HSLA 2I58A 2Z8EA 3I6VA 4NF4A 3DP4A 5LOMA 2D5WA 1A8FA 4NF6A 2F35A 3MP6A 2KLFA 1JW4A 4H65A 1BKAA 1B05A 2ONRA 3O28A 1D3KA 3KN8A 3K6VA 3EPEA 2PVUA 5FTHA 2Z22A 4ZEKA 3S4UA 1LLSA 4F2QA 1MXUA 4FE8A 2W7YA 4M1VA 1MXVA 3ZKLA 4GIZA 5KCJB 4BDMA 2I48A 5AE4A 1NH8A 2O51A 2VD2A 3H3GA 3SETA 3ILUB 4OYVA 4GQOA 2Q88A 3LC8A 2VD3A 4KFQA 4X1DA 4DCXA 3WAEA 4U4XA 4ELOA 3EHUA 1US4A 2O7IA 5JEIA 2F36A 1DSNA 2F78A 3KOSA 5H8QB 2VHAA 3DP6A 1VE4A 1N04A 4LP2B 1NMUA 3PPQA 1FTKA 3OO6A 3KJTA 1NKXA 4OFLA 2H25A 3KOTA 4QFPA 1M5EA 4WXJA 4JXIA 2RC7A 1MS7A 1N84A 2ABHA 3HO7A 1GVCA 4F3PA 3PUZE 4R6KA 3MVWA 1B3EA 1AH5A 1LAXA 4OHNA 2PBWA 1JETA 3GBBA 1QULA 3OSRA 2QS1A 1FQFA 2UXAA 2XD3A 1H43A 4X9TA 3U72A 3IJOB 1MXWA 3FGSA 4XTCQ 1JEUA 2WKYA 1URDA 2ZMBA 2P0SA 3T9HB 3T9UA 3FD3A 3SEUA 2OLBA 4EF1A 2BJJX 1JEVA 4DE8A 3T66A 2G93A 1Y3QA 2QPQA 1S50A 4GWOA 1IIWA 2RCAA 1LFIA 3MZ1A 3ODBA 4I62A 3OO8A 5AA4B 4ZZEA 4U21A 2CMOA 3TTKA 3MPLA 1M5CA 1IZ1A 2XXUA 2I3WA 5ELVA 5CBSA 3QIMA 4YKKA 1CE2A 4YAHX 1WDNA 4QSCA 2HAUA 1MPBA 3ILTB 3OO9A 3UN6A 1P1QA 1B51A 1FQDA 2DWJA 2O7UA 1MRPA 3EHTA 2ZYNA 3IOWA 3IO6A 1S7YA 3SEWA 1IXGA 5I2NA 5AA3A 2I4BA 3PD9A 1MPDA 1I6BA 2H5YA 1USYH 4OVJA 1MXYA 2ANJA 3GBAA 4TQUQ 2GH9A 1ZJLA 1IXHA 1OLCA 4GF8A 3D4CA 5CMBA 3C33A 3RN8A 1SW2A 4PETA 5AA2D 5B70A 2Y7IA 4OZ9A 1EZPA 5DVFA 1PC3A 3V5AA 5FHOA 5B7DA 1IXIA 1TT1A 1QUIA 3M3LA 2VP1A 3G3HA 4Z7EA 1Y9UA 4RA1A 4Q8RA 3S9NC 3SESA 1AL3A 1POY1 3E3KA 3U1OA 1POTA 4GD5A 3TCHA 2HAVA 1DPEA 3K6XA 5IKBA 4OESA 3USDA 1DTGA 4H5FA 3VLUA 4R74A 2B65A 3C9HA 2A5TA 4PFTA 1Y4CA 4ZEBA 3RUMA 3LR1A 4WEPA 5BWJA 4NF5B 2UYFA 4IO7A 2H98A 1B46A 1AOVA 5CMKA 4YB6A 2AL4A 2O68A 4F29A 1N0TA 3QUJA 2DE4A 1LSTA 3BFUA 1PEBA 2DVCA 4M4GA 2DP8A 2HCAA 3EHSA 3A3UA 3T22A 2XXYA 3FVKA 1OVBA 1MDQA 3TDJA 1R1NA 2Y84A 3K6WA 5IAIA 3DM0A 4RJZA 4XKQA 1NH7A 1LCTA 2DWHA 2O84X 1FQAA 3IOVA 2XXHA 4HCWA 3KN3A 2VOZA 2QS2A 3TTNA 1KWHA 4H67A 4F1YA 5KCJA 3QAXA 3PUXE 3VFJA 5DYHA 1PB9A 1LGBC 3IB0A 2I4CA 1UTHB 3LUYA 3EQ1A 2PMSA 3K02A 3K4UA 1FW0A 2ZXTA 5H8QA 4C1TA 4DIGA 3FVGA 2Q89A 4KYEA 4R72A 4K3FA 3HHFA 4QF9A 4E0WA 3JZJA 3KGCA 3KSJA 1M5DA 1H44A 4Q5TA 3FJGA 1GR2A 5K2XA 3MZ9A 4KPTA 2G29A 3B7DA 2RC8A 3MP1A 1N7XA 1MG1A 3TCGA 2GFEA 1FQBA 1OIBA 2B3BA 2Q2AA 5I57B 5DT6A 2UVGA 3V8XB 3MQ9A 1MY4A 3S9MC 2A5SA 5CM6A 3PU5A 3HPIA 2DYXA 1B0LA 3VLVA 2RF1A 2UYEA 3FV1A 5KZTA 4P11A 5ISUA 4HS7A 3K01A 1NFTA 1B2HA 5HM4B 3CG1A 2PT1A 2DQVA 3FUZA 3FXUA 3K00A 1MY2A 1N3XA 5AA4A 3VLWA 5L8DA 4XKNA 2XHDA 4MBPA 2IEEA 1R6ZA 1WVJA 4R75A 3IOTA 2XXWA 1SD3A 5TPAB 4PFUA 4GFRA 1JNFA 5FTIA 4E0XA 3H6WA 3L6HA 4NWCA 3M3KA 4BLAA 3MZBA 2F6PA 4YB7A 4I1DA 4POXA 4JWYA 1Q1KA 4KHZE 3MWBA 5H8HB 4HTGA 2Y7PA 2OCUA 2F97A 1I6AA 1SDXA 3SEXA 3BFTA 2H4IA 1JQFA 1NNFA 3GXAA 4BDQA 3HCQA 3C34A 4IO5A 1B58A 3OOAA 2REGA 3R7XA 1GTKA 2XX7A 4I9DA 1UIUA 4N6PA 4KYDA 5I2KB 4YMAA 1SQYA 4OENA 3DELB 3FVOA 3RY3A 1AMFA 1MM6A 4EDPA 4R6YA 1MY1A 1A54A 4JWXA 2O6AA 1QW0A 4YB5A 1B3HA 4G8MA 1O64A 1N7WA 2NXOA 3FATA 3FJMA 3TELA 1VSOA 1P99A 3O6HA 4YKJA 1XHYA 3OO7A 3QUFA 2RKMA 1LCFA 1ANFA 4F3SA 4NF5A 5L9OA 3OSQA 3RT8A 1EZ9A 3IK6B 1ZTYA 2B3FA 3IJXB 4XKRA 1B1XA 1BP5A 2XXPA 1NL5A 3MP8A 2H9BA 2O1MA 2HQ0A 3VDFA 5DEXB 4R9FA 1D9VA 4G68B 3HN0A 3OMBA 3FXRA 4QFNA 5A5XB 3AXFA 1P1NA 3CI8A 4OMBA 2R9JA 1OLAA 3QYTA 4QHQA 3O66A 3WAFA 3G3FA 5FHMA 4XIGQ 1N3WA 4GOTA 3CSBA 4G2ZA 4O3AA 4ZECA 4JWOA 3MW0A 1NNPA 3K1NA 1SVXB 3T93B 3TYHA 4GL8A 4OERA 3U94A 4RYAA 3R26A 3VXCA 5ITOA 3KBRA 2XXRA 1MXZA 4ESWA 3B6WA 5KDTB 4EUOA 3N26A 1P1WA 2V93A 4F39A 4OFOA 5K2YA 3IB1A 1Y3NA 3K6UA 3H6TA 4ZZAA 2F8DA 2O1LA 1Y4TA 2XXTA 2Y7RA 2ZYKA 4L17A 1LAHE 2ESNA 3K0VA 5EHMA 4X1BA 3VVEA 3U93A 1PDAA 4BDLA 1FQEA 2F6GA 1QUJA 1H45A 1D9YA 4ND9A 4IO3A 5I58A 3W9WA 3ECRA 4C1UA 4G8NA 3JYRA 3PMVA 4LATA 3LSFB 3BBRA 2E0SA 3O6GA 3VE1B 4FATA 2OBGA 3IORA 1UQWA 1UIVA 3TCFA 1S9TA 3C36A 5I57A 2YPNA 5F7VA 1Y20A 3C32A 3C31A 5J1DA 1VFEA 1PBPA 4DXCA 1JW1A 4JB7A 3E4RA 3PPRA 3O6IA 3PD8A 5H8SA 4ZDMA 1NNKA 5EHSA 4R2FA 2Z8FA 2Y7KA 3IX1A 4THIA 1Z7ME 3EF7A 1RKMA 3QXMA 5JK4A 3OD7A 1IITA 5ICTA 5H8NB 1Y3PA 4N07A 3T96B 2AYSA 2M8CA 3OENA 4HCYA 3O29A 3CFLA 2NOOA 3H6UA 1I6QA 4F18A 1B7HA 3KEIA 5TPAA 3H6VA 2F5XA 1LAGE 4ZE8A 4IB2A 1ZLQA 3CRBA 3R6UA 2IA4A 4YMBA 4YU0A 2QSXA 3V89B 1WODA 1OVTA 2P1SA 4PE5B 3MC2A 3IL1B 4KI0E 1B5HA 5L9MA 1H76A 3N94A 2THIA 1FQCA 4IGTA 1SI0A 4O3CA 5H8HA 3FIRA 1MH3A 1MQDA 4ELQA 4R73A 3RGYA 1BLFA 3RLFE 3P7IA 5ITPA 2F34A 1T0KA 3MPKA 5I2KA 4U22A 1Y1MA 2DXRA 1MQJA 3K2DA 1B9JA 1ATGA 3JV9A 4EF2A 5M2VA 2DVZA 4P0IA 1HSJA 2UVIA 3TQLA 4RK2A 2Z8DA 1R9QA 4IY5A 1TWYA 4RNSA 2HZKA 3V83A 4LVQA 4UACA 2Q9TA 2DE3A 2X7QA 4R2BA 2LAOA 4POWA 2I6EA 4OXVA 1XOCA 3IO4A 3PPOA 4C0RA 4NF8B 3TKDA 1IUDA 3FV2A 4P0GA 3KN7A 1B5JA 2XXIA 5JTYB 3Q28A 4TLMB 1URSA 4JDFA 3K1PA 4U1OA 3FZVA 3B6QA 4F31B 5AA2B 4JSOA 1MH4A 1FTOA 3G3IA 3LSLA 5DEXA 2FA7A 5EYFA 4U4SA 4G68A 3S2VA 3PGFA 3HV1A 4RPNA 1A55A 4H5GA 3E13X 2OK2A 2XXVA 2HFBA 3MVYA 1IXCA 2REJA 1N76A 5I56B 5BUUA 5TP9B 1AIVA 4G68C 4IGRA 4Z0IA 4HW8A 3FVNA 3IB2A 3Q27A 1B3FA 4EQBA 2CZLA 3MAMA 3T9VA 1FTJA 4NTLA 4F3BA 1IEJA 4H8JA 3IOUA 4KYSA 2RINA 4JBZA 4LQ2A 1DPPA 5CRYA 5KDTA 1B5IA 2QMWA 4PFWA 3SEYA 1O7TA 1M5BA 3PUYE 4ONYA 3MVXA 1B4ZA 2HZLA 3UORA 1EH3A 3Q29A 2XX9A 2OJTA 2GHAA 4OQOA 5DTBA 1YAEA 1ZMGA 4KR5A 3SEVA 2YLNA 3Q25A 3UGWA 5I84A 2XXXA 3W15C 4AB6A 2NUVA 2OWSA 4FAJA 4ZE9A 1QUKA 2HXWA 1MQIA 4LONB 1YCJA 4R6HA 4YKIA 2QMXA 2RC9A 3PPNA 3TAJA 3B6TA 1QKAA 2OWTA 4DCYA 4QSDA 4ZEIA 4WEDA 2F7BA 1XS5A 2V3TA 4JSDA 3N6UA 4EQ7A 4IO2A 3S9EA 5H8FB 2I3VA 1DTZA 4LUBA 4BDNA 4OTEA 2RCBA 5FHNA 2X7PA 4DXBA 4ELRA 2F7CA 1FTMA 1MXXA 3UP9A 4NEDA 5HPQA 3G3GA 3G7WA 3C35A 4ISUA 3A09A 3GLBA 3TEPA 4Q0CA 5H8NA 3LBSA 4F22A 2E1SA 2H99A 2HEUA 4H0WA 1MPCA 3MUQA 1B0HA 2R71A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZYMA 2ALUA 4QRZA 4LN5A 4OVSA 4LZ7A 3HHGA 5F1QA 2QRYA 2F7AA 1BK4A 4GXAA 3KC0A 1P1UA 4LZ8A 1FJ6A 5CC2A 1UTBB 3C4MA 3GZGA 4I40A 1SBPA 4I8CA 3H03A 3ZS6A 5CMMA 1URGA 4X48A 3RNNA 1QVSA 4PFYA 2B4MA 4TOZA 4PAKA 3DP8A 1JVYA 1BIYA 3VVDA 4ESXA 1KZ8A 1DK4A 4X04A 1QKBA 4NMYA 5EQAA 1MY0A 3O97A 2XD2A 1US5A 4G77A 3TTRA 1PB7A 4DLDA 4PF6A 2PCRA 3OELA 3FASA 2GQ1A 2QL3A 3MYUA 2AL5A 3B8BA 1B3LA 3IFCA 2DXYA 1M5FA 1RYOA 1SW5A 3KJ7A 4GWWA 4U2RA 3G3JA 4PP0A 2I49A 1NV6A 4QSEA 4RY1A 1RYXA 3SDFA 1SW4A 4LZ5A 3UK4A 3Q26A 3T9XB 3TUSA 1LFGA 2QS4A 4N13A 1Y1ZA 1FPIA 1UTHA 3H06B 2CZHA 4GVOA 2FIEA 1OMPA 3PUVE 1DMBA 4H1XA 1HSEA 1XVXA 1B7ZA 4PCDA 4NF8A 3KZGA 3M3FA 1XC1A 1ELJA 4ZS9A 3RTFB 3TQWA 2XXKA 3CFZA 2YJPA 1CNQA 2PT2A 3CR9A 2I0CA 4NWDA 2DE2A 4OEVA 1FBPA 5JTYA 4F1VA 1Z7NE 2DS9A 3ZKKA 5I59B 4MFIA 2Q2CA 1JW5A 4NF4B 2I0BA 1LB8A 1D4NA 3KSXA 3VVFA 3OXNA 4NF6B 5CBRA 3RPWA 3QK6A 1XVYA 5AA2A 1EYKA 4PQJA 2Z23A 4TLLB 3TMGA 4RK9A 2AIXA 3KFMA 1EU8A 3PMXA 3N6TA 1ZU0A 3ISPA 2Q8JA 2VGQA 5CI5A 4KQPA 2PX1A 3TODA 4IR8A 4F3GA 1LBBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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