5TP9B

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with compound 2 (gne9178)
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
287
structure length
284
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title GluN2A-Selective Pyridopyrimidinone Series of NMDAR Positive Allosteric Modulators with an Improved in Vivo Profile.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 76
structure length 284
sequence length 287
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-10-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tp9B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tp9B02
3FJ7A 2I3VA 4DLDA 1FQBA 2HAVA 4DCXA 3UK4A 4EDPA 2X7QA 4AB6A 5KDTA 2DWAA 2YLNA 4F18A 1Y3NA 1RYXA 5DT6A 1ATGA 3PUWE 1AH5A 3K6VA 3MPKA 2V25A 4U4SA 3U8QA 3PD9A 4IY5A 1DTZA 4JB7A 3HHFA 4UACA 4YKJA 4JSDA 2VD3A 3Q28A 1MY4A 3B6WA 4U21A 3PGFA 2F36A 3CFXA 1B3FA 3PMXA 4NE4A 4EQ9A 3K6UA 1WODA 1US4A 1UTHB 2XXVA 4ZDMA 3G3GA 3T96B 4LP2B 4EUOA 3H06B 3QUFA 5FHOA 2HCAA 2LAOA 1UTHA 4FE8A 3RGYA 3K6XA 3IJXB 3EN3A 1JETA 2X26A 4QRZA 1B3LA 3PPRA 3CIJA 2PYYA 1MRPA 4YZZA 2F7CA 4FATA 3QUJA 1LBCA 3GZGA 3S9EA 3IL1B 3A3CA 2QS3A 3W9WA 5JEIA 2OCUA 1H44A 2ONKE 1I6QA 5JTYB 2ALUA 2H99A 2QS4A 3TCGA 4YU0A 1A7LA 1T0KA 1B4ZA 3LSWA 2RF1A 3D4CA 3OO6A 5JTYA 2Y7RA 3KOSA 3VXBA 2W7YA 4BDRA 2P1SA 3LSXA 2OZZA 4ZZAA 1ZBMA 4NF6B 4POXA 2M8CA 5ELVA 4O3CA 1MDP1 4OENA 4JXIA 4OEUA 3T9XB 5IKBA 1MXUA 4YB7A 1B1XA 3I3VA 1SBPA 1UQWA 4NF6A 1P1OA 3LUYA 3IORA 2F5XA 1MH3A 4ELQA 3USDA 3JZJA 2ONSA 1OIBA 3RN8A 3ZSFA 2R71A 2NOOA 5I2NB 1MG1A 2YJPA 3OENA 4EXLA 2QL3A 2QS2A 4I62A 2VHAA 2PBWA 4F1VA 2I48A 2Q88A 5I2NA 1B0HA 1LFIA 4N13A 1IXCA 2V3UA 4YB6A 3IB2A 1JVXA 2DE2A 3MVZA 1TT1A 5L9OA 1PB9A 1B3EA 1Q35A 3IK6B 4YKKA 4FEDA 1J1NA 2XXXA 5CC2A 4PFUA 2DYXA 1QKBA 5DEXB 4F31B 1D3KA 1MY0A 2RCAA 4ZE8A 3K1NA 4TQUQ 4LA9A 1NH7A 2D3IA 2I4BA 5ISUA 3B6TA 3DP4A 3RTFB 1EZPA 5DEXA 3O29A 3WAFA 3DP6A 1AIVA 1IUDA 2ZYMA 4XKPA 3OXNA 1URGA 4XIGQ 2RC8A 5I84A 2V93A 5KCJA 3T9VA 1SYHA 2ZNUA 4R6HA 1FTOA 3PUVE 1DOTA 4F1YA 4I1DA 2B3FA 4Q0CA 3T9HB 1QW0A 3TYHA 4R2FA 2F35A 4U1OA 2UYFA 1BLFA 4ZEDA 1PEBA 4FJPA 4E0XA 5JK4A 1IIWA 4YICA 4H8JA 1D9YA 1USYH 1MPCA 3FIRA 3MBPA 4U1ZA 4U2RA 1BP5A 2V3TA 2RKMA 3RLFE 4DXCA 5CBSA 1FQCA 2P2AA 1LAHE 3I5OA 4F22A 4OEVA 3UGWA 3H6TA 4YMAA 3BBRA 5K2YA 4NEDA 2DS9A 1SYIA 1FTJA 3FVGA 2DWHA 1WDNA 1R9LA 3DELB 4BDOA 2QMWA 1B7ZA 1SDXA 1DSNA 1UTBB 4NWDA 5TP9B 5TU0A 1AOVA 3E4RA 2H9BA 3E13X 3ODBA 4GFRA 1UTBA 5TP9A 4F39A 1A40A 1URSA 4ELRA 2XXPA 2O6AA 3VLUA 3BFTA 5I57B 2XHDA 4YMBA 3N6TA 1VE4A 3LSLA 5CMMA 3FVOA 1O64A 4RA1A 5F1QA 4HCWA 3TMGA 2PVUA 3CG1A 3GBAA 4KYEA 5I57A 4G68B 3CFZA 4XKQA 1VFEA 1R9QA 3VVFA 1N04A 4ECFA 5HM4B 4YB5A 4C1UA 2PX1A 3M3KA 3FXQA 1ZU0A 4QSEA 4THIA 4P11A 4F29A 1LAGE 1XOCA 1P1WA 1HSLA 3AXFA 2Z8DA 1QUKA 5B7DA 3KSXA 4NF5B 4ZEIA 3U72A 1JNFA 4Q8RA 4ELOA 5L8DA 3KEIA 3A3UA 4IO2A 4OESA 4GIZA 1RKMA 3JYRA 2CZLA 1H3DA 3S9NC 3MVWA 4TLMB 1EH3A 4ZEKA 2IEEA 2AYSA 3GBBA 4OXVA 3FJGA 1M5BA 2REGA 1Y9UA 4K3FA 5CMCA 4LONB 5ITOA 1RYOA 4R72A 3TPAA 5ITPA 2ZNSA 5DVJA 1ZJLA 3VVDA 4ESWA 2O7IA 1LAXA 4BLAA 5L9SA 3VLVA 3SEXA 3UIFA 4JDFA 1MPDA 1AL3A 5HPQA 4ZECA 3CFLA 3S9MC 3HSTA 2XXWA 1S50A 1POTA 1MQDA 4F2QA 4EF2A 1R1NA 3FVKA 2B65A 1PBQA 2BJJX 1B58A 5I58B 1LSTA 1VFDA 4H5FA 2UVHA 4AB5A 2I3WA 3SEUA 4KQPA 1IZ1A 4JSOA 4IGRA 3MWBA 5H8QB 3K1PA 3MZBA 1MXZA 1YTVA 5B70A 3K00A 3TODA 3K6WA 2UVIA 3U92A 1QUIA 5H8QA 1SW4A 3VE1B 3LBSA 4JWYA 1JEVA 1LCTA 4H67A 3Q27A 5KDTB 5CI5A 3ZS6A 2PMSA 1NL5A 3D4GA 5CMBA 3OELA 4LQ2A 2D21A 3PMWA 2V3QA 2F7AA 1FCKA 3SEVA 4KI0E 4OZ9A 1NNTA 1CB6A 4FEBA 1PB8A 3LC8A 4ZZEA 1PC3A 1XS5A 3ECRA 2CMOA 5DVIA 1B51A 1US5A 1QUJA 2DP8A 5H8HB 4WXJA 3L6GA 1BIYA 4R2BA 1QJMA 3KN8A 4RNSA 4PP0A 3IAZA 3P7IA 1LBBA 1Y3QA 5H8HA 2XXQA 1PDAA 1R6ZA 3SEYA 4QFNA 3IOVA 1MPBA 2I58A 3TCFA 2Q8JA 5ICQA 1SI1A 1F9BA 4P0IA 4MH5A 3PV0E 2Y7KA 4KHZE 2QPQA 1MY1A 4G8HA 4G77A 1YAEA 4QSDA 2FYIA 2GRVA 1Y3PA 3TTMA 4ZEBA 3EHUA 4BDQA 1TWYA 4F3GA 1IXHA 3CVGA 4GF8A 5F7VA 2XXHA 4R6YA 2VP1A 3KOTA 2ZYKA 3G3HA 1OQHA 1MY3A 4MFIA 3PPPA 4R75A 4I8CA 1NNFA 3G3IA 4Q5TA 4PFYA 4XKRA 3KZGA 5AA2B 3UP9A 4M4GA 3U1OA 4QHQA 3IOWA 3VFJA 3VDFA 1S9TA 3O28A 2G29A 1N0TA 1Z7NE 4IY6A 3K0VA 4O3AA 5AA2A 3B6QA 3H4ZA 3HPIA 3OSQA 1UIUA 4JWOA 2GHAA 2D5WA 3IOTA 4RYAA 4U22A 1NKXA 4DIGA 3C35A 3EHSA 4ZEFA 3OEKA 1ZLQA 2QRYA 3RQTA 2NUVA 1GGGA 1POY1 2FNCA 3LR1A 4U23A 2X7PA 2O69A 2OBGA 1SW2A 2O7UA 5AA4A 2H4IA 3U93A 4X1BA 4NMYA 1LGBC 3FGSA 4ISUA 3I6VA 3G3FA 3IB0A 2FA7A 1M5CA 4U4XA 4JBZA 3MZ1A 1P1UA 4OFOA 3TKDA 1Q1KA 4O3BA 3QIMA 2Q89A 1GR2A 2H25A 1B5IA 3C31A 5BUUA 5KCJB 1B46A 3FUZA 2HZKA 2UVGA 1B05A 1Y1MA 2F7BA 3PUZE 4POWA 4OFLA 3O2AA 2ZMBA 1FW0A 3N6UA 4C1TA 1NNPA 5H8NA 3HHGA 3O6IA 4EQBA 1DPPA 1PBPA 3DP8A 1N76A 4H6DA 3IO6A 2XX9A 1M5DA 1EZ9A 2UXAA 1FTLA 1FQAA 2ZYNA 4KR5A 1JW4A 3CR9A 2O1LA 4X1DA 3THIA 3MW0A 4OETA 3TCHA 1XVXA 1S7YA 3T9UA 3S2VA 4GRKA 4WEPA 3KN7A 2NWJA 4BDNA 2Q2CA 3N94A 1N84A 5K2XA 3V8XB 5FTHA 2OK2A 1JQFA 3S9LC 2ABHA 4Z7EA 4IGTA 2B3BA 2O51A 3QAXA 1LB8A 3CG3A 1N7WA 1ZMGA 1B9JA 3CSBA 2HQ0A 2Q2AA 2Y7PA 3G7WA 3C34A 2NVUB 4R9GA 4IO7A 3QSLA 3TAJA 3PUXE 4IO6A 1GVCA 1QVSA 1DPEA 1H76A 2ZYOA 5LOMA 3MP6A 2RC9A 5A5XB 3H6WA 3KFMA 3IR1A 5I59B 3A09A 3O66A 4WEDA 4E0WA 3MZ9A 2XD2A 1YCJA 5CM6A 3ZKLA 1B5JA 1B6HA 3FXRA 5A5XA 1ZTYA 5I59A 2O68A 4IO5A 3SKPA 1BKAA 1QKAA 3T93B 1P1NA 3MPLA 1Y20A 2THIA 2A5TB 4F2OA 2VD2A 3FZVA 1L5TA 2V84A 4QFLA 3DLNA 4G68C 3IX1A 3EQ1A 3N5LA 4KYSA 4MF3A 1ZKBA 2A5TA 5J1DA 1HSJA 1MQJA 4OHNA 4DDDA 4PFWA 2HXWA 4H1XA 4KFQA 1TFAA 1SQYA 3WAEA 2F97A 3V89B 2E1SA 5TPAB 3OEMA 2HEUA 1B40A 3MVYA 3G3KA 1H43A 3B7DA 5TPAA 4NTLA 3RT6B 2RINA 2DOJA 4DXBA 1FQFA 4N6PA 1SD3A 1SVXB 3K2DA 1YPNA 3GLBA 3CSGA 3RPWA 5I56B 1LAFE 1B3HA 1A54A 2OWTA 4Z0IA 5I56A 3FXUA 4GWOA 1SW5A 2I0CA 3TEPA 3K02A 4L17A 4PETA 3V83A 1MXXA 4OERA 4RK9A 2PT1A 5DTBA 4KCCA 3HO7A 3OO9A 2ZXTA 4ESXA 1VSOA 3Q25A 2UYEA 3EF7A 1M5FA 4OWDA 4GQOA 4OYVA 4Q30B 1VR5A 5EHMA 4YKPA 2Z8FA 4RY1A 3MQ9A 3KN3A 3O6GA 3OO8A 4NF8B 1II5A 3TFLA 3QK6A 1URDA 3OD7A 5DYHA 3W15C 4F19A 2XD3A 5CRYA 2QMXA 5HBCA 3EHTA 1B52A 1UIVA 4NF8A 4FAJA 5DVFA 3E9XA 3TQWA 2F8DA 3TELA 2GFEA 1N7XA 5FHNA 3BKIB 3FJMA 4IO3A 3MC2A 4G8NA 1OVBA 2AL5A 3FV2A 2Z23A 3C36A 3N26A 2H5YA 1PB7A 3UN6A 1OQGA 1OVTA 4XTCQ 4WKMA 1MS7A 2XXYA 3OO7A 4KYDA 1FQDA 3MAMA 4GOTA 3O97A 1I6AA 2F78A 4NWCA 4H8IA 2HFBA 3MUQA 3TTRA 4GL0A 4FORA 4KD5A 4X48A 4YAHX 2OJTA 1LFGA 2E0SA 1B2HA 4IO4A 2F34A 1IXGA 4OVJA 5CBRA 2Z8EA 1B7UA 4YKIA 1MM7A 3TZAA 3RY3A 1NFTA 2XXRA 3H03A 5EHSA 2F6GA 1Y4CA 5H8FB 4GXSB 5AA3A 2XX8A 3UA8A 3KJTA 3CI8A 1JVYA 1O63A 1FQEA 2XXIA 5H8FA 1B4HA 5AA1A 2I4CA 4BDMA 3O6HA 1B0LA 4G2ZA 5ICTA 3ILUB 3MP1A 3HV1A 2P0SA 1P99A 3KGCA 3KBRA 5IAIA 2XXUA 4F3SA 2IA4A 5BWJA 4HCYA 3OMBA 3PMVA 3FV1A 4RK2A 3H7MA 1D4NA 1ELJA 3FATA 3VVEA 4ZE9A 1Z7ME 3VXCA 4HTGA 2DE3A 5AA4B 2NXOA 4MLVA 3OSRA 1A99A 1DMBA 3R6UA 3RNNA 1KWHA 3SESA 3H6VA 2R6GE 3K4UA 3UORA 1JEUA 3M3LA 1OLAA 4QFPA 3K1MA 2ANJA 4F3BA 1WVJA 2DE4A 3SETA 1JW1A 4H65A 2Y7WA 4KPTA 4C0RA 4LATA 3C33A 2ESNA 2XX7A 5CMKA 1DTGA 3Q29A 3O9PA 1IITA 5KZTA 3R7XA 3C9HA 1MM6A 1N3XA 2I49A 3PPNA 4EQ7A 2QS1A 3FASA 2DWIA 2OWSA 5H8NB 4OTEA 3IO4A 1GTKA 1ZIUA 3GXAA 2HZLA 4M1VA 3TTLA 4XKNA 1SW1A 3HCQA 3TQLA 1H45A 1SI0A 4FIMA 3LSFB 3MJNA 1A55A 4TLLB 3H3GA 1XHYA 4EXKA 2O1MA 2YPNA 2G93A 1MY2A 3PPQA 1NNKA 5AE4A 3KSJA 4MBPA 4OFJA 3VV5A 2Y84A 4RJZA 2F6PA 1BTJA 1EU8A 2XXTA 1D9VA 1P1QA 3FVNA 4H5GA 1A8FA 2Z22A 4UA8A 1MH4A 4LVQA 3Q26A 2Q9TA 3TUSA 3R26A 4GXAA 2Y7IA 4RPNA 4HS7A 4ONYA 1USYE 3MVXA 1LLSA 1IXIA 4G8MA 4GD5A 3V5AA 2DXRA 1I6BA 1QULA 3G3JA 4PE5B 1IEJA 4F3PA 2DVZA 3E3KA 3IOUA 5EYFA 5FHMA 4QFKA 4EF1A 3PPOA 1I69A 1OMPA 4MLQA 4DZ1A 4G4PA 3RT8A 2ZNTA 1OLCA 4PQJA 4LZ7A 1ANFA 3JV9A 3TDJA 3C4MA 3SDFA 4OQOA 2RCBA 4R73A 3TTNA 3S4UA 4DCYA 2RC7A 1XC1A 3F11A 4BDLA 3H6UA 2REJA 3L6HA 4IB2A 2H98A 1M5EA 2PT2A 2QSXA 1NMUA 2ONRA 2KLFA 4LUBA 3T22A 1N3WA 3KJ7A 4LQ5A 4TOZA 2A5SA 4G68A 1LFHA 2I0BA 3MP8A 1TXFA 4I9DA 1Y4TA 2DVCA 3FD3A 3HN0A 4GVOA 3VLWA 2AL4A 3PD8A 3QYTA 2QJEA 3RUMA 2DQVA 1LCFA 1GV8A 4F1UA 2VGQA 4GL8A 4QF9A 4ZS9A 3OOAA 4QSCA 3SEWA 2DSFA 3K01A 3IJOB 4DE8A 3ONMA 1AMFA 4LZ8A 5AA2D 4FECA 4H0WA 1LB9A 1MXWA 4ND9A 4NF5A 3C32A 1EZOA 1XVYA 3QXMA 1CE2A 2GH9A 4NF4B 1FTKA 3M8UA 4QFOA 4R9FA 1JW5A 4RPOA 5M2VA 4LZ5A 1MXYA 3EPEA 5FTIA 2I6EA 1FTMA 3M3FA 4NF4A 2O84X 1NH8A 3BFUA 1B32A 4HW8A 4JWXA 5L9MA 3PUYE 1MQGA 4ELPA 1HSEA 2DXYA 1XT8A 5H8SA 4GLIA 3DM0A 2AIXA 2UVJA 1B3GA 1TFDA 1B5HA 4OMBA 2GHBA 1MQIA 4P0GA 4RXLA 2VOZA 3ILTB 3T66A 3PU5A 3W9VA 1A8EA 1O7TA 3U94A 2DWJA 2HAUA 1Y1ZA 5I2KB 5I58A 4DXUA 4N07A 2OLBA 2R9JA 3IB1A 3RTWB 4X9TA 4KCDA 2WKYA 3CRBA 4XXUA 1B1HA 1MXVA 1IQ7A 5I2KA 3TTKA 4PFTA 1MQHA 4AQ4A 4R6KA 1B7HA 3KG2A 4R74A 3ZKKA 1MDQA 3SERA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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