5TPAB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with compound 9 (gne3500)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
289
structure length
279
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title GluN2A-Selective Pyridopyrimidinone Series of NMDAR Positive Allosteric Modulators with an Improved in Vivo Profile.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 279
sequence length 289
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-10-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tpaB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tpaB02
3FVKA 4ND9A 2XXRA 1ZLQA 3K1PA 3PUVE 4GXAA 1FQCA 1WVJA 3S4UA 2F5XA 1SW4A 1ZIUA 5B70A 2Y7KA 5DVJA 3CG3A 2BJJX 1POY1 2F97A 1XOCA 2DP8A 4EDPA 5LOMA 1UTHA 2VD2A 1B2HA 1BIYA 4I62A 4IO5A 4IO2A 2O68A 4U22A 4KQPA 4FJPA 1NFTA 3H6UA 3U93A 4O3AA 4GL8A 5H8FA 1I69A 3RQTA 4MFIA 2DE2A 3MVZA 4P0IA 3LUYA 5CM6A 5AE4A 1MM6A 5IKBA 1AIVA 2O7UA 2R71A 3TTLA 4BDMA 2X26A 1QUJA 1M5FA 3T22A 2DOJA 2XXQA 3RY3A 3GBAA 2V93A 3DP4A 4GFRA 3GZGA 4NF5B 4XTCQ 4U21A 4GWOA 3TQLA 1OQGA 2R6GE 3KN7A 4NEDA 4PFWA 4ELOA 4WEPA 2H4IA 1ZJLA 2UYFA 3A3UA 2THIA 3W9WA 4NE4A 2FA7A 2FNCA 1NNTA 3RTWB 1US5A 3FV1A 1N0TA 3LSLA 4KYDA 2CMOA 5CMCA 3U8QA 3S9LC 2P0SA 2ABHA 1DTGA 5EHSA 4O3BA 1PB7A 1IXGA 3ILTB 3EQ1A 1MDQA 4QFOA 4Z0IA 4EF2A 2Z8FA 2HAVA 4LQ2A 1S50A 1UTBA 1P1QA 2QS2A 4XKQA 4AB5A 1XC1A 1MPBA 4NF8B 3O66A 3ZKKA 3D4GA 1I6AA 2XXVA 3VVEA 5L9SA 1SYIA 2AL4A 4R74A 5DVFA 4LUBA 5FHMA 2PX1A 2OLBA 1Y4CA 1MQHA 1LLSA 2XD2A 1B6HA 4DXUA 2ONKE 1HSLA 4OETA 3WAFA 5HBCA 2P2AA 3M8UA 4ZDMA 1B05A 3KOTA 1Z7NE 4IGTA 3VV5A 1MQIA 1MXYA 3RGYA 2NVUB 1R9QA 4F1VA 4JXIA 2QMWA 3UA8A 3HSTA 1SVXB 3O97A 4XKPA 4IY6A 2I58A 2F6GA 2NOOA 2G93A 4GLIA 2QS3A 4PE5B 2I6EA 3PPNA 5HPQA 4OFOA 1B52A 3FVOA 2NUVA 2RKMA 3FD3A 4G4PA 4ESWA 5I2NB 5KCJB 2D5WA 4R6YA 3C35A 4EF1A 4RPOA 4XKNA 3TUSA 3G3FA 3ECRA 2ALUA 5L9MA 1Y3PA 2Q2CA 4IO4A 3PD9A 5CBRA 3V5AA 2I3WA 3K1MA 3T9VA 3SDFA 1MXWA 3A09A 1M5DA 1LCTA 3UN6A 4RA1A 1D9VA 4YU0A 3OXNA 1IQ7A 3TPAA 1LFHA 4R9GA 2Q9TA 4F2OA 1R1NA 3CVGA 2Z8EA 3MW0A 2NWJA 1B51A 3CI8A 3KSXA 5I58B 3CG1A 2DWHA 4QFPA 2DVCA 3DLNA 4F19A 4OFLA 5L8DA 3EN3A 3FASA 3R7XA 2M8CA 3V89B 2O51A 2Q8JA 4JBZA 4KYSA 4U1ZA 1JEUA 1AMFA 3JV9A 3EHSA 2DE4A 2XHDA 1LB9A 4JSOA 5H8NB 2GFEA 5I2KB 4NWCA 2Q88A 1LCFA 3DM0A 3K6WA 3L6HA 2H5YA 3Q29A 3TTKA 4FECA 2V84A 3Q27A 1JEVA 4OXVA 1F9BA 4KCDA 2AIXA 5AA1A 4POXA 1LBBA 4O3CA 1NKXA 4YB5A 4IY5A 1T0KA 1IEJA 3CSBA 1B46A 3SERA 4P0GA 4DIGA 1Y1ZA 3KN8A 2QL3A 5H8HA 3VVFA 2DWIA 5ELVA 5TP9B 4X1BA 4OTEA 4G8NA 1QUIA 4YKKA 5AA2A 4QFLA 2REGA 2ZYMA 1Y20A 4QSDA 3IJOB 3QYTA 4BDQA 4K3FA 3N94A 2DSFA 3LSFB 2DVZA 2ZMBA 2QSXA 1FTJA 5I59B 4YICA 1M5CA 1PB8A 3FV2A 2DWJA 2A5TB 4DZ1A 1ATGA 1MDP1 3MQ9A 3IOUA 4OHNA 5B7DA 3OO7A 2UXAA 3MZ1A 1Y3QA 3OO8A 3VE1B 2Y7PA 3E4RA 1A8EA 3IJXB 2ANJA 2XX8A 4OESA 1LAFE 4IO7A 5TP9A 3TZAA 1H45A 2Z23A 1P1NA 4F3PA 4OERA 4N07A 1I6BA 5ICQA 3VLVA 3PU5A 1B9JA 1N84A 4MH5A 4YMAA 3W15C 1RYOA 3B7DA 1AH5A 2OJTA 1SDXA 1P1UA 4PETA 3BKIB 3S2VA 4XKRA 4IGRA 4Q30B 1UIVA 4AQ4A 3OEKA 3SEWA 2VP1A 1UTHB 4HTGA 5DVIA 1MXZA 4TLMB 3N5LA 2ZNSA 2XX9A 3K6VA 3C34A 3LC8A 4MF3A 3VDFA 2IEEA 3U72A 3MC2A 4HCYA 5H8FB 1FQBA 3TCHA 1FQAA 5FTIA 3QIMA 3T66A 2OWSA 3G3KA 4G2ZA 4OWDA 3K0VA 1B40A 2DXRA 1TFDA 3FXUA 2Y7WA 3H03A 4FEDA 2HCAA 3E13X 3HPIA 3TKDA 4HS7A 3R6UA 1IXCA 1OVTA 4GQOA 3SEVA 1S9TA 1IITA 1FTMA 4H65A 3H6TA 3V8XB 3T9XB 3Q28A 4THIA 5K2YA 4F18A 4ZECA 1LBCA 1DSNA 4EQ7A 3W9VA 4LA9A 4WXJA 3K02A 1SBPA 1EZ9A 3KN3A 3K6UA 4F1UA 1BKAA 3C9HA 4N6PA 5CMKA 3RUMA 2Q2AA 3PMWA 2AL5A 3WAEA 3PMVA 3ZKLA 2XXXA 2D3IA 4TQUQ 1ZBMA 3PPPA 1UTBB 3E3KA 3MPLA 3BFUA 3SEUA 3RNNA 1PB9A 4KD5A 3CR9A 4YB7A 4Q8RA 3GLBA 3UIFA 3OSRA 4PP0A 4LATA 1A40A 3U92A 1MQJA 1USYH 3PUYE 4FE8A 4C0RA 4U1OA 2I4BA 1QJMA 2F7CA 2ESNA 3BBRA 3IL1B 3TTRA 1IUDA 4NTLA 4HCWA 4EUOA 3PV0E 3H7MA 5FHOA 5TPAA 4ZE8A 4ECFA 3PPQA 3SETA 3ONMA 3SEYA 1B1XA 2GRVA 4E0WA 2AYSA 4KHZE 1IXIA 1CE2A 2I48A 1Y4TA 2Q89A 3HO7A 4I8CA 1TT1A 1B5HA 1XVYA 1EZOA 3K01A 3A3CA 1JQFA 3FXRA 2I4CA 4F3GA 1N04A 4MLVA 1JVYA 4ELPA 1Q1KA 4R2FA 1NNKA 3B6QA 3QXMA 2QJEA 4NMYA 4RXLA 4F2QA 4ELQA 5H8QA 4PFTA 2NXOA 4EXKA 2GH9A 1VSOA 1PDAA 2ZNTA 3RLFE 1LSTA 3DELB 3G7WA 3KFMA 1XHYA 4DE8A 2V3QA 4YAHX 3RPWA 1ZKBA 1TWYA 4EXLA 1MM7A 3IK6B 1KWHA 3E9XA 3LBSA 5CC2A 2F78A 4Q5TA 2Y7IA 3PD8A 2F36A 4G8MA 1QKBA 3VVDA 1FTKA 2XXHA 4F3SA 1VFEA 5ISUA 1NL5A 1ZMGA 3TFLA 2Z22A 4QHQA 1FW0A 1MY2A 1WODA 4F3BA 4IO3A 1FQDA 5JTYA 3I5OA 2XXYA 3K1NA 4FEBA 3IOTA 5AA2D 1WDNA 2O7IA 4DDDA 3IB2A 3Q25A 2X7QA 2QMXA 3FATA 1DOTA 5CI5A 1AOVA 2RCBA 1OMPA 2P1SA 1H44A 2V3UA 1QW0A 3SESA 1IIWA 3T9HB 1HSEA 1D4NA 3UP9A 5J1DA 3MUQA 5I56A 5ICTA 1Y1MA 2DWAA 3I3VA 1B5IA 3THIA 2HXWA 5H8HB 4YKPA 2VHAA 2VD3A 4F39A 2F34A 4N13A 2B65A 1H3DA 3K6XA 1II5A 2OWTA 2PT2A 2O84X 4ZS9A 5AA2B 3T9UA 2XX7A 4GD5A 1SW1A 2UVHA 3C32A 2DE3A 5L9OA 1A55A 5AA4A 1NH8A 1MY0A 5ITPA 3MVXA 4ONYA 2I0BA 2G29A 3TDJA 4ESXA 1PEBA 1XVXA 4JSDA 1P99A 2HAUA 3FVNA 1RKMA 1LAGE 1DPEA 1FCKA 4L17A 2QPQA 4F29A 4X48A 2OCUA 3SKPA 2XXWA 1VR5A 1LGBC 3H3GA 2UYEA 2CZLA 2ZNUA 2RINA 3HHGA 3FXQA 5H8SA 1N3XA 4EQBA 4MLQA 1OIBA 3H6WA 2VOZA 2I0CA 1ZU0A 4GIZA 3FJMA 1MH3A 4YZZA 2R9JA 2UVGA 3CRBA 4C1UA 2DS9A 2DXYA 3IR1A 3MZ9A 3K4UA 3OD7A 4GL0A 4QSCA 4AB6A 1SW2A 3VXCA 2F35A 3DP8A 3PMXA 3PUZE 1RYXA 2E1SA 1R9LA 4YKJA 1OLAA 5CRYA 3PPOA 4NWDA 4FATA 1N76A 1FTOA 1SD3A 1AL3A 4F1YA 4ZEFA 1MH4A 4X9TA 4UACA 5I84A 5I57A 1A99A 1B0LA 3R26A 4OZ9A 1GR2A 1MXVA 4U2RA 5IAIA 1J1NA 1URDA 2O6AA 2H25A 3TTNA 4M4GA 2B3BA 2RC9A 3IO4A 4JDFA 2ZYKA 1B7UA 3RTFB 3JYRA 4OYVA 3RT6B 3TTMA 3FIRA 1SI0A 3KBRA 1B4ZA 2A5SA 2B3FA 1OQHA 2F7AA 2ZYNA 1A7LA 4RY1A 1YTVA 1ANFA 3C31A 2Z8DA 2HEUA 3IB1A 3TAJA 1NH7A 3ODBA 5A5XA 1Y9UA 3QAXA 5AA3A 2ZYOA 3N26A 3G3HA 3EHUA 2I49A 3H4ZA 4DXBA 2YJPA 1ZTYA 2XXTA 2YPNA 4H0WA 3KJTA 3HHFA 3TYHA 4M1VA 1L5TA 1US4A 3MBPA 1MY4A 4H8JA 3O2AA 3OO6A 2HFBA 4I9DA 5TU0A 1JNFA 3K2DA 5JK4A 1TFAA 1N7XA 4OEUA 3UGWA 3MP1A 3MVYA 4FIMA 1FQEA 3QSLA 4G68A 2DYXA 1QKAA 4PFUA 3S9EA 5DEXA 1MXUA 1B58A 4H6DA 1B3FA 2UVIA 5CMMA 5TPAB 3H6VA 3N6UA 1O64A 2W7YA 2O69A 4QFKA 1Z7ME 5KDTB 3T96B 4HW8A 3OELA 4R6HA 4KCCA 1XT8A 5FTHA 1N7WA 1LFGA 1B0HA 3MP8A 3TEPA 1QULA 2QS1A 1Q35A 1R6ZA 3MZBA 1MPCA 4KPTA 3OSQA 2UVJA 3C4MA 4QFNA 1B5JA 1B3LA 3M3LA 4H8IA 2ONSA 1BTJA 3Q26A 2F8DA 3MPKA 2OZZA 4GVOA 2XXPA 4R2BA 1ELJA 5H8QB 3N6TA 1URSA 3G3IA 1QUKA 1GGGA 4POWA 3TODA 1HSJA 3M3FA 1Y3NA 1MY1A 4R6KA 1EZPA 4OENA 2F6PA 1LAHE 1BP5A 3LSXA 2RCAA 5KDTA 1EU8A 4KFQA 4KR5A 3T93B 2LAOA 4YMBA 1B1HA 2O1MA 4H5GA 4LVQA 3TELA 4LQ5A 3RN8A 3IOVA 3VLUA 3HCQA 5BUUA 1UIUA 4U23A 1OLCA 1LB8A 3S9MC 5F1QA 1LFIA 4BLAA 2V25A 1POTA 4PFYA 1GV8A 2HZKA 5F7VA 4DLDA 4NF5A 2Y84A 2OBGA 2PMSA 5ITOA 5JTYB 4H5FA 1H43A 5JEIA 4R75A 3IB0A 1OVBA 1YPNA 4ZEDA 5BWJA 5EYFA 4GF8A 2VGQA 3ZSFA 2F7BA 4FAJA 1IXHA 2IA4A 3IO6A 1MPDA 3QK6A 4OEVA 1CB6A 4G77A 1LAXA 2Y7RA 4LZ8A 4ZEIA 3GXAA 5I56B 4ZEKA 1O7TA 3EPEA 4QRZA 4QSEA 4NF8A 4U4SA 1NNFA 1DMBA 4TOZA 1JW1A 1DPPA 1JW5A 3D4CA 1YAEA 4OQOA 5K2XA 3DP6A 1TXFA 4OVJA 4ISUA 1B4HA 4BDNA 4XIGQ 3MVWA 3M3KA 1NMUA 1B3HA 3OOAA 4DCXA 4LONB 2WKYA 4G8HA 5AA4B 3HN0A 3QUFA 3IOWA 4LP2B 4ZEBA 4QF9A 3I6VA 3CSGA 4UA8A 3U94A 2QRYA 4JB7A 3B6WA 2PT1A 4IB2A 4BDOA 3OEMA 3C33A 3O6GA 4LZ5A 3LSWA 4NF4B 1O63A 2PVUA 2HZLA 4KYEA 1JETA 3FGSA 4RYAA 1YCJA 3F11A 4RNSA 1SQYA 3FUZA 4JWOA 3USDA 3TQWA 3JZJA 3KSJA 3S9NC 1UQWA 4E0XA 1S7YA 3PUWE 4KI0E 2D21A 2HQ0A 4YKIA 3B6TA 3KZGA 3LR1A 1MS7A 3RT8A 4JWXA 1FTLA 3G3GA 4R72A 5I2NA 2X7PA 5KCJA 3TCFA 1GTKA 1PBQA 1B3GA 2OK2A 3SEXA 3HV1A 1VE4A 3CIJA 5CBSA 4BDLA 1SI1A 5HM4B 2YLNA 4RK9A 2FYIA 4WKMA 3K00A 3OMBA 4P11A 2KLFA 1SYHA 3EHTA 4RPNA 4NF4A 3UORA 3V83A 3IAZA 1P1WA 3BFTA 4PQJA 2RC7A 4GXSB 4RJZA 4X1DA 4ZZAA 1IZ1A 3KG2A 3L6GA 3KGCA 4ZZEA 3PUXE 2XXUA 5I57B 3H06B 3TCGA 1PC3A 3MP6A 1M5EA 3O6IA 1MXXA 1B32A 3EF7A 4FORA 2ONRA 5DTBA 2V3TA 5I58A 1MRPA 4JWYA 4MBPA 4ZE9A 2GHAA 3FJ7A 4DXCA 4XXUA 3FZVA 1VFDA 2H99A 3C36A 1D3KA 3UK4A 4TLLB 4GRKA 2REJA 3KJ7A 3ILUB 1M5BA 2PBWA 4OFJA 2H9BA 5H8NA 5I2KA 1B7ZA 1FQFA 3IX1A 4NF6B 3ZS6A 1JVXA 3VFJA 1BLFA 1JW4A 3MJNA 4H1XA 2XD3A 2PYYA 1PBPA 4R73A 1A8FA 1MQDA 3CFZA 3O28A 2O1LA 3KEIA 4EQ9A 2RC8A 2H98A 4F22A 5A5XB 1EH3A 5M2VA 1GVCA 4Q0CA 4BDRA 3O9PA 5DYHA 4GOTA 1N3WA 5KZTA 4WEDA 1MG1A 4G68C 3OO9A 1H76A 5CMBA 4YB6A 4Z7EA 1D9YA 3VXBA 5DT6A 3GBBA 2E0SA 4H67A 4U4XA 2QS4A 4LZ7A 3G3JA 1SW5A 2I3VA 3OENA 2GHBA 1MY3A 2ZXTA 2RF1A 1URGA 1A54A 3O29A 3CFXA 3VLWA 3TMGA 4NF6A 1QVSA 4G68B 5I59A 4ELRA 4C1TA 2XXIA 4I1DA 3CFLA 3FVGA 4F31B 5DEXB 2A5TA 5EHMA 4DCYA 3P7IA 2DQVA 3U1OA 3FJGA 4RK2A 1B7HA 1P1OA 1USYE 1DTZA 1I6QA 3O6HA 4IO6A 3MAMA 3QUJA 4OMBA 5FHNA 3AXFA 1XS5A 3IORA 3PGFA 3PPRA 1NNPA 1MQGA 3MWBA 3KOSA 4R9FA 1B3EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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