5A4EA

Dyrk1a in complex with methoxy benzothiazole fragment
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
347
structure length
341
Chain Sequence
KVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTEYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Probing the ATP-Binding Pocket of Protein Kinase Dyrk1A with Benzothiazole Fragment Molecules
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION-REGULATED KINASE 1
total genus 109
structure length 341
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2015-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5a4eA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5a4eA01
2X81A 3NX8A 1BLXA 1ZOGA 3CD8A 2NP8A 3VW6A 4O82A 1PXMA 3MTLA 3ZZEA 4BDHA 4WKQA 2WMTA 3BPRA 3D9VA 3Q96A 4DH1A 3GT8A 4D0WA 4FV4A 2JGZA 4EHVA 2XK6A 2QVSE 4FKTA 4IIRA 3TV7A 3WIGA 4EK8A 3PLAE 1LP4A 1YKRA 4X2GA 3JVSA 4KWPA 4C38A 2GS7A 5CI7A 4EC9A 4QMOA 2RFNA 3MDYA 4LFIA 5AM7A 1PJKA 1VJYA 1R0PA 5BYZA 4FKIA 3C9WA 3HMMA 4B0GA 4C59A 3R1QA 1OL2A 3GGFA 5EKOA 4MBIA 2XNPA 3OBJA 4APCA 3LJ1A 5A4LA 4DCAA 3NCZA 1U59A 3EN5A 3CLYA 3DKCA 5DIAA 5LXMA 5BVNA 3HV4A 1TQMA 3DZQA 3S95A 4C36A 3MH1A 2PVYA 3ATSA 4CYJA 4C2WA 4DEBA 5FP6A 2QOFA 3UOLA 4D9TA 3MVMA 4LQMA 3VC4A 2B54A 5CSPA 4U41A 3SXSA 3ZM9A 2B9HA 2PMLX 2YAAA 3A8WA 4NFMA 3E3PA 5HO7A 1PMUA 1XBCA 3LQ8A 2PZPA 3AGLA 3WYYA 1G8AA 4IJ9A 3F3ZA 4D5KA 1HCLA 3FL5A 5HD7A 5BVEA 5BUEA 5J1WA 3TUBA 1XH9A 5BMSA 4BCIA 1PXLA 3I7BA 3VS2A 4CGAA 1Y91A 4YJRA 3ZO4A 4Y85A 3LVPA 3IONA 5J5TA 1OVEA 3GI3A 2IVVA 4AGDA 4Z55A 4DFXE 3QX4A 5HQ0A 5ETFA 3LFCA 4FIHA 2OICA 2B55A 3BHTA 4ZJVA 1YXVA 4IM2A 3P7CA 3ZFMA 5BYLA 4WT6A 3GC0A 3KF7A 5AWMA 3ZXTA 2OLCA 1YXSA 3MGYA 2OI4X 2WTCA 4J99A 3ORPA 3UDBA 4EYMA 3KULA 1UU8A 4TTHB 4U81A 3V8SA 1L8TA 3DLSA 1QCFA 4CFUA 3CY3A 4FKVA 5DHJA 5DFPA 2ETKA 3F5GA 4ERKA 4MD8E 4QT1A 4CTBA 4EWHA 5BNJA 4NEUA 2W7XA 3UTOA 4OR5A 5C4LA 3E7VA 2J0LA 4FZ6A 3W33A 3D7TB 2WD1A 3UIXA 5D7VA 4LRMA 3R6XA 4BL1A 3GCQA 2XM8A 3QLFA 4FR4A 4H58A 4MQ2A 4YLJA 4FOBA 4FV2A 1YWVA 1T46A 5EYCA 2X4ZA 3FJQE 2Y4PA 3A7IA 3M1SA 4WSYA 3W2QA 4YHTA 4IW0A 2XIXA 4OGRA 3POOA 2XZSA 4PPAA 2UZTA 4C4FA 4EBWA 5L8KA 3KXNA 1H4LA 2R0UA 3F3TA 4R7HA 4F70A 5LJJA 4BGGA 3P4KA 4FKLA 4J1RA 4XHKB 3LLAA 5K9IA 2UW8A 2W5HA 4L68A 4FKWA 4X3FB 5HBJA 2VWUA 4LOQA 5CALA 5HLNA 3C1XA 5E8WA 3L9PA 4E3CA 1OKYA 4BRXA 5EW9A 3OWKA 4IE9A 4IEBA 2VWXA 2XP2A 3G5DA 3AXWA 4IZAA 3A99A 4PWNA 3E87A 2R2PA 4C3FA 4QMTA 1AGWA 2XRWA 3VULA 4QYEA 2J2IB 4QP8A 5E8ZA 5F4NA 4U5JA 3UJGA 4J53A 1PKGA 5HLPA 3QWJA 2R7BA 5ANGA 2YERA 3ZLYA 3CTJA 3LXKA 5GZ9A 2XF0A 1JSVA 4DGMA 2C6LA 5GIOE 3EQHA 3CQEA 3ZZWA 3OCSA 5HG9A 4NIFB 2CGUA 3BU5A 3JY9A 4YLKA 4JQ8A 3FMHA 4RWKA 4Y83A 3U4WA 5DEWA 5L6WL 3KCKA 3QHWA 5TT7A 1Q8ZA 3EYGA 3FC1X 3OCBA 1U5QA 2Y7JA 3HV5A 2J5EA 3GFEA 4YTIA 2HWPA 4YURA 3KRWA 1OL1A 4EH5A 3KFAA 3A4OX 3UOHA 5CEPA 4D2RA 5F95A 4FYOA 4TL0A 2I1MA 2VO3A 2B1PA 3VS3A 1HOWA 2VX1A 2XNGA 4P4CA 4I0SA 5HU3A 5HLWA 1PRYA 4FKJA 4YC6A 1BI8A 1OIYA 3NYOA 4RPVA 1PY5A 4HYUA 2ZAZA 2I40A 4FEWA 4Y5HA 2BRGA 5K4IA 1P4OA 3I5ZA 5HTCA 4O1OA 2RIOA 2C69A 4FG8A 5KMJA 4RQVA 4IBMA 4OTRA 3ULIA 4IX3A 2LAVA 3EQDA 5ACBC 3L8XA 2ZM1A 1OMWA 3D5VA 1ZZLA 3P23A 5HKMA 3SOAA 2X2LA 3BBTB 4S30A 4OTDA 4P90A 3RTPA 4CFVA 2OO8X 3MIYA 3C5UA 4UY9A 5A3XA 3FSFA 5HG7A 3ZO1A 2JAMA 4N6YA 2O63A 2V0DA 1H00A 1SYKA 4I6BA 4X21A 4KBAA 5DI1A 5CSVA 3W8LA 4DA5A 2EB3A 4G31A 4ONAA 3RMFA 4LRJA 4X2KA 5EYDA 3R8ZA 3RPRA 1WBSA 3IW8A 3QQHA 4ZK5A 3E88A 4TNBA 4YPSA 4ASEA 5CF4A 5HNIX 3UOKA 2FSOX 4YU2A 3MPAA 5C1QB 3QZIA 3OFMA 3FZRA 4NM3A 4YLLA 1U4DA 2R3QA 5CVGA 4DHFA 4YJOA 5G1XA 2VTJA 3R7EA 5EQEA 2CKQA 2HENA 3RPVA 3BHHA 3GC8A 3I1AA 4IAZA 3IPHA 5DGZA 3N9XA 5J7HA 3RM7A 5AFVA 4D5HA 2EB2A 3R9OA 2VTRA 3E8CA 4GFGA 4L00A 2ACXA 3VNTA 4ANQA 1YWNA 4F6UA 4A4OA 2Z7LA 3VBVA 2LGCA 4FSWA 4L53A 4PP9A 3P08A 5J9YA 2JKQA 2VTAA 5KMOA 4KS7A 3JPVA 3VUHA 2EWAA 5LMAA 2VWWA 2OXXA 4AXAA 3OOMA 4A7CA 4C33A 4F9CA 4LM5A 4RQKA 5EKNA 4JX3A 2X7FA 2AYPA 3F3UA 5IA5A 3G9NA 3VAPA 4HW7A 4E20A 2VUWA 3H30A 3O2MA 4OTGA 5IA0A 2C68A 2QHNA 3WZJA 3EFLA 3ZDIA 4FKUA 4EZ7A 2XBAA 2XEYA 3GBZA 1YDRE 1RW8A 3VWAA 3G2FA 2C3LA 1MRYA 3RAHA 3VO3A 4IHPA 3VVHA 5CENA 4FV6A 3QRIA 5JFSA 2C1AA 4U8ZA 4CRLA 3WF5A 3HUBA 1FBNA 2YDIA 3ODZX 4R3CA 4YJQA 1ZY4A 4O86A 2WKMA 4OTFA 3PXKA 1AQ1A 3H10A 4M14A 4S2ZA 2J0MB 4XMOA 5HGIA 4DGNA 4KRCA 2OJFE 2ZDUA 4M12A 5E1EA 4BI1A 2RF9A 4JI9A 4NSTA 3LZBA 3SA0A 1Q99A 4PTEA 4L52A 2R0IA 2WMBA 4QMZA 3VHEA 2UV2A 3BIZA 3RCJA 2PZYA 4ZTLA 5CAUA 4MEDA 4MHAA 3KXGA 4H1JA 5DEYA 2A0CX 2WNTA 3FWQA 5ITAA 4FK6A 4YPDA 2J9MA 4BCPA 3OCGA 4C3RA 2IJMA 4KIOA 4G6LA 4D58A 1H07A 2WELA 4I92A 3PVWA 4RJ3A 3R9NA 5L8LA 5FM3A 3IO7A 2C1BA 2QR8A 2GU8A 4Y8DA 2VTLA 4FUYA 4APPA 2WTKB 3NYXA 2ERKA 4MXYA 3TZ7A 4UX9A 4W4VA 3WILA 4DAWA 4CFFA 5TE0A 3PIYA 2Y4IC 1Q3DA 4OBQA 4A9RA 3QXOA 5AA8A 4TT7A 4C58A 3DK7A 4BHZA 3PRIA 5DWRA 5FRIA 4B4LA 4RJ6A 2FSLX 2YIRA 4IADA 4E5AX 3KXXA 5JT2A 4IANA 3B8RA 4EJ7A 4QOXA 4O6EA 3T9IA 4FODA 3RNIA 4QMQA 2ZM3A 3DNEA 5AR3A 5LCKA 3JS2A 1O9UA 4J97A 1R39A 2PTKA 2YN8A 3HRBA 3OW4A 4HVSA 3MH2A 2GFCA 2JLDA 3R00A 5C8MA 3UC4A 4S31A 4E1ZA 5A9UA 4E4LA 3QZGA 4DINA 4I5CA 3BYUA 3NW5A 1B6CB 3ATTA 2FO0A 3LXLA 2CNVA 3NAXA 4R6VA 2R64A 3A7JA 3HZTA 2XM9A 2PVHA 1IA8A 4FIJA 3DAKA 2C30A 5JRQA 5JGBA 4G6NA 3C4WA 2BHEA 4TWOA 4DTKA 3D14A 3D7TA 4NH1A 1OKZA 3GP0A 4O0RA 2W96B 2E9PA 5BVFA 4IACA 5ANOA 2BALA 4K8AA 5DT0A 5LVMA 4HNIA 4QO9A 4PRJA 3C0HA 3QA0A 3QHRA 1G3NA 4UWBA 1I44A 1Y6BA 4R77A 4KIQA 4MNEB 1S9IA 2W06A 3ZRMA 4KKEA 2X4FA 3F61A 4WNOA 5EOBA 3R2BA 2VD5A 4X3FA 4BDBA 4E6DA 1XR1A 3LHJA 3SXFA 2XK3A 3ZM4A 4RG0A 5BQ0A 3SC1A 2IVSA 3Q9WA 3HMOA 4RJ5A 4ANSA 3RAKA 2XKCA 4P5ZA 4AOIA 4LMNA 4UN0C 5IUGA 3AD4A 3BGQA 5EI6A 3NR9A 4E26A 2QI8A 4GJ2A 4F1TA 2Y8OA 4XBRA 4BBEA 3OS3A 2RG5A 4EEVA 4HVIA 4QPSA 2R3MA 3F5XA 3Q9YA 2YCFA 4JAIA 1ZYLA 4AA4A 4JG8A 1JSTA 2JAVA 2W4JA 2CCIA 2Y0AA 3D5WA 3S2PA 3KK8A 3QFVA 5KUPA 1S9JA 4KABA 4MXAA 1GNGA 4I6FA 2E9VA 1Z9XA 3EIDA 4NIFA 4CYIA 3DV3A 4I5HA 3GOKA 5EM7A 5DT4A 5IQBA 4RGJA 2YDKA 2UW0A 3QRJA 5HG8A 3CY2A 4ACCA 3L9LA 4QNYA 4AN9A 1Y8GA 2GNLA 4PL3A 4JL9A 5AUYA 3VF8A 1KV1A 3FSKA 3TV6A 4AGUA 1J7UA 2C4GA 3G9LX 3OY1A 2RL5A 4CKRA 4XS2A 4FC0A 4PNKA 4JIKA 5LCJA 4HGEA 4O2PA 4F0IA 3BWJA 2OFUA 4DN5A 4J95A 5HIDA 2PVRA 5HTIA 1IA9A 4QTCA 4B6LA 2DQ7X 2YM6A 2R3JA 3QGYA 3MJ1A 3V5LA 3OXTA 3KQ7A 2UVZA 4XP0A 3EL7A 2YDJA 2PE2A 4I24A 4PL4A 2AC5A 2JEDA 3G6HA 1P5EA 1JKLA 2P55A 2BRMA 3HVCA 3O51A 4O0WA 5CSWA 4B99A 1Y8YA 2W1ZA 2I7QA 4NYEA 2BVAA 1W83A 3Q9ZA 4YSJA 3TNPC 2ZMCA 2OK1A 1FMKA 3R9DA 5E9EA 4DLJA 4D0XA 3OBGA 2UZWE 4E7WA 4DCEA 3E7OA 4TWPA 4EOLA 4C4HA 5E1SA 2BPMA 2YJRA 5FDXA 4D4VA 3O50A 2F2CB 4PY1A 2PZRA 3A2CA 4CZTA 4IVDA 4FV7A 4EQUA 3GU7A 5AV2A 2CMWA 4F7JA 2CHLA 5KMLA 1FVRA 4IB1A 4Q9ZA 5JFXA 3G6GA 3U9NA 5L4QA 4YC3A 4YZ9A 4OAUC 2QD9A 4BYIA 2WEVA 5CASA 2XVDA 3OXZA 4NCTC 2VGOA 4UMTA 5EI8A 3AC8A 5ANJA 3PG1A 5AIRA 1M52A 2X6DA 3EB0A 3NAYA 3VW8A 4FKPA 3EFKA 5HNGA 1YRPA 4ZAUA 4L7FA 3W55A 3EYHA 2C3IB 3DQXA 4CFXA 2BRNA 3OT3A 2WOTA 3FBVA 4GUEA 5AMNA 4XG9A 4MKCA 5DYJA 5CWZA 4KNBA 5CSHA 2V62A 4IAKA 3QYWA 1HCKA 4EHZA 2GQSA 1OUKA 1YDTE 5L6OA 4QMVA 4X2JA 3DDPA 3TEIA 1Z57A 2W99B 3DFCB 4IH8A 4ALVA 5CQWA 4OBOA 3HAVA 4FV3A 4A9YA 3OG7A 4FTLA 4NM7A 3FMNA 2YCQA 4BTJA 4OT6A 4GEOA 4GFMA 1P2AA 4AW5A 3E93A 4QMPA 3SW4A 5BPYA 5J79A 1YI3A 5IH5A 4YGAA 2PL0A 3TZ9A 2C6DA 3DZOA 5IQGA 4IFCA 2Z7SA 1DS5A 5IH6A 4MVFA 4U97A 4HZSA 1ZZ2A 5H8BA 1PF8A 3KXHA 4GCJA 3UG1A 1WFCA 2QQ7A 3FLNC 4A07A 5E8YA 3R2YA 3SG9A 2QOKA 3DJ5A 1LPUA 2VV9A 3BV2A 3PZHA 4YBJA 5F20A 2UW9A 2JFMA 5I9UA 4F08A 3A7HA 4O7SA 4V01A 3KN5A 1IAJA 2ITXA 4XV1A 3ZLXA 4I0RA 5BVDA 2ETMA 3LFNA 4W9XA 4ITIA 2IZSA 4CG8A 3ITZA 4H36A 3EWHA 4QNAA 1Q61A 4MWIA 4ZLOA 3QD2B 1WCCA 3MY0A 1M17A 4WIHA 2XKDA 3IW6A 5DNRA 3W2SA 4AFJA 4FSTA 3PYYA 3VF9A 2BFYA 4IZYA 4HGTA 2VTQA 4M68A 2IZTA 5HNBA 3R8PA 5ETAA 4XH6A 3EZVA 5GJDA 4JVGA 3CCNA 4AF3A 4O81A 3PXFA 4LV5A 3R7YA 3FZ1A 5BUIA 3EQGA 1W7HA 1NT2A 3P86A 1NW1A 4Q5EA 3OWJA 4BBMA 5JGAA 4O0XA 4FIIA 1RQQA 1J1BA 3HEGA 4U45A 1QPDA 4QQTA 2G15A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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