5AQIA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqiA04
4AM7A 2YHYA 2CH6A 2ASPA 4BG8A 1Y64A 2QXLA 2FXUA 4CZMA 1GLEG 4BG9A 5KPZA 1GLDG 2ASOA 1BU6O 2Q0RA 1ESVA 1BO5O 2D4WA 4H0TB 3A5OC 3ZEUA 1BG3A 2QW9A 2FF3B 1JCEA 1BA0A 5AR0A 3SK3A 2E88A 4H0OA 2NLXA 1OKJA 2PBDA 1HJOA 5ADXH 3SMSA 2FSJA 1IG8A 3D2FB 3C7NB 5BRFA 2YJFA 5BREA 2J4RA 4JD2A 4BRGA 1ZXOA 2AP1A 3LDPA 3HBTA 2AA4A 3MK6A 4BROA 3DXMB 3CJ1A 2GWKA 1P8ZA 2YHXA 2Q0UA 2Q36A 3A5MC 3VENA 4PL7A 3FZHA 3WT0A 4H03B 2VYPA 3B8AX 4BRHA 5EY4A 4FWSA 3JXUA 3SJHA 2P9UB 3VEVA 2P9NB 1V4TA 2IIRA 2ZWHA 4BVPA 3U4LA 3O80A 4FWLA 3VGLA 4BRDA 3SLCA 4DCHA 1KAZA 4HWIA 5E26A 2QWOA 4BRKA 1ATSA 1QQOA 4BRPA 2D1KA 4FSVA 2GWJA 3QB0A 1HKBA 2E1ZA 4BRIA 2GUPA 5BRHA 4O5FA 1RDWX 2P9IB 3FE1A 4CJ7A 1R59O 4IJAA 3UE5A 5BRDA 2P9KB 1NGIA 3D2EB 2IVNA 4GNIA 5AQIA 5KQDA 4JN4A 4BRLA 2I7NA 4CZIA 4Z94A 5AQWA 3BP8A 1WUAA 4CBXA 2E2NA 3U9DA 1NGJA 1NGCA 5AQQA 2P9LB 2V7ZA 4Y0WA 2HF4A 3VEOA 3ULEA 5EOYA 3IFRA 3VEXA 4BR7A 4BREA 3H6EA 4BQZA 1DKGD 2GEMA 3WQTA 4B9QA 1NGHA 4QS8A 1H1VA 3KZBA 2A6AA 4B1UB 2YHWA 4BRQA 3FLCO 4CZLA 5JMVA 4FWNA 5AZIB 2YCHA 3DXKA 1E4FT 4CD1A 5BPMA 2NRHA 3ZX3A 4HTLA 1CZAN 2D0OA 4K42A 1QQMA 1YXQA 1TUYA 3O5BA 2P9SB 3WQUA 2IVPA 4FWOA 2ZF5O 5BPLA 3FFKB 3W0LA 1U6ZA 3WEEA 1G99A 2BTFA 2YJEA 3J8AA 3DAWA 3RSEB 4FPBA 5AQLA 1NGGA 2CGJA 4I6MA 2VWBA 1JCFA 3H1VX 3LDOA 3EO3A 1SZ2A 4WQ5C 4J8FA 5AZJB 3WXKA 2CGLA 3WUHA 4CZGA 3CHWA 1HLUA 5AQVA 5F0XA 3CIPA 3MN9A 4BGAA 3R8EA 3O4WA 4FWPA 3WXJA 4JAXA 5LJWA 1SQKA 3HM8A 1XQSC 4BRNA 1QZ6A 3MDQA 4BRAA 1C0FA 2FSKA 3GE1A 4CZHA 3FZKA 3LM2A 1Z6RA 5EXWA 3CJ7A 5AQYA 5LJVA 3OHRA 3A5LC 4JHDA 4CZEA 3UB5A 1DEJA 1TUUA 2FSNA 4M63C 5FPEA 3VGMA 4WYBA 3RSEA 4IWVA 3MMVA 1ATNA 3A8YA 3VGKA 2DPNA 3ZETB 4XH5A 4RWTA 4BC2A 3UKRB 1HX1A 2Q2RA 3ATVA 2QWMA 4K25A 4MLHA 2PAVA 4A2AA 1RGIA 4FPAA 3CERA 2A42A 1X3NA 2W40A 5EX5A 2ZGZA 2V52B 3L0QA 5AQRA 1X9JA 1NGBA 2V51B 1QQNA 4RCHA 3VEYA 4BR4A 4K41A 3MN5A 3VF4A 3VESA 2FF6A 3G25A 5CE3A 4H0XB 4IJNA 2GTDA 3D2FA 3C7NA 2I7PA 3W3DA 4BRCA 3H3NO 4PL8A 3GL1A 3M6GA 1GLCG 1T6DA 4E1JA 3DXMA 1S3XA 1GLLO 1NGEA 3IDHA 3O08A 1TYQB 1LOTB 3LDNA 3LM9A 3O8MA 1JCGA 4BC4A 4IZ9A 2A40A 2E2PA 5BN9A 4IO8A 2YI1A 1XC3A 3I8BA 4H5TA 3P4IA 4ISGA 4EAHD 2P9UA 2P9NA 2IVOA 3ENOA 5I9EB 4H5VA 2FLOA 4FOEA 3IMXA 2BUPA 5AQSA 3ENHA 4H5NA 4B1ZA 4H0VB 5ELZA 4BQLA 1J6ZA 4JNEA 3GG4A 1DGKN 3QDKA 4FOIA 4XH4A 4QS7A 3QFUA 4NB4A 3UKUB 2H3GX 1ZC6A 3S41A 4BC3A 5AQUA 2P9IA 2P9PB 4QS9A 1GLFO 3IUCA 2P9KA 1NGFA 3AY9A 1HKGA 4GY2B 4MO5A 3CJBA 3MCPA 3D2EA 1BWFO 4H0PA 3ZX0A 3U9ZA 1U2VB 1NM1A 2CGKA 3QBWA 1LCUA 3R6MA 2ITMA 2P9LA 1KXPA 3CJCA 3ZEUB 1BUPA 5AQHA 5ADXA 4WQ4A 4A61A 3QFPA 3BUZB 1NGAA 3SMPA 5AQZA 4K43A 4O8KA 2QM1A 3FR0A 3GBTA 5AQFA 2D0PA 4JD2B 5EVZA 4B1VA 3HI0A 1KAXA 3M1FA 3CJAA 4DHYA 3M3ZA 3AAPA 2E2OA 4PKIA 1GLAG 5AZIA 2E8AA 2Q97A 3D7EO 3FGUA 4BVOA 3O1BA 1S22A 5AQJA 4EHTA 2P9PA 3I33A 3HSCA 5AFUH 1KAYA 5F1XA 1NWKA 1HKCA 3CETA 3EKUA 3O1WA 2Q1NA 4YDUA 3L4IA 2QWLA 5JLHA 3A0IX 3EZWA 2P9SA 2VCPA 3JS6A 4BR2A 5AQMA 5E84A 3EKSA 1X3MA 1U2VA 2HF3A 5LY3A 2GELA 1YAGA 1YUWA 2W41A 3GDQA 3BEXA 3CI5A 1NLVA 4M7YA 1NBWA 4WQ4C 4H0YB 4BRFA 4AM6A 1HUXA 3HZ6A 2ZGYA 5BPNA 2QWPA 3QICA 1YVNA 5F2RA 1K8KB 3H3OB 1MWKA 4BRMA 5AZJA 3AARA 3H46O 3EN9A 3CJ9A 2HOEA 2HMPA 4BGBA 3VPZA 1QZ5A 1ZBSA 3FZFA 2EWSA 4B1WB 4EIAA 2NZTA 1D4XA 1QHAA 2WUSA 3MN6A 3H45C 1BOTO 1SAZA 4B1XB 4CZJA 4YDUC 3KVGA 2UYTA 5JLFA 3EL2A 4B1YB 3VETA 2E20A 3KHYA 3ULEB 1C0GA 1GLBG 3L6QA 1NMDA 4ISFA 2QWNA 2KHOA 1E4GT 4BR5A 4PKHA 4XEIA 1T6CA 4MLEA 3LDQA 1NGDA 4CBWA 2A3ZA 4MO4A 2OANA 3AAQA 3ZETA 1MA9B 3BF3A 3F9MA 3HTVA 4A62A 1HPMA 3DWLA 1K8KA 2QWQA 4CZKA 2E2QA 3H1QA 5B8HA 5AQOA 3DXKB 3UKRA 3U8XA 5AQGA 4LC9B 3VEZA 5AQTA 3FZLA 4FWMA 5AQXA 4FL9A 4H5WA 3C0BA 3WXIA 3VF6A 4ISEA 3QBXA 2CH5A 2E1YA 4IXCA 3WEEB 1GLJO 5KPRA 3MN7A 5AQNA 5FPNA 4CZFA 4RTFD 2A5XA 3A5NC 4CI6A 2F9TA 4I6MB 3CQXA 1XUPO 4DB3A 4A2BA 3O6WA 2Q31A 5TKYA 5BR9A 4C23A 2V7YA 5AQKA 1MWMA 4XH1A 4WQ5A 2A41A 5JICA 2ASMA 1WOQA 3VERA 1TYQA 3VF2A 4M7XA 3VOVA 3BF1A 4FO0A 4L3QA 4CBUA 3QMLA 4PKGA 4DQ8A 1Z05A 5FPMA 1EQYA 3ID8A 2QWRA 4BC5A 4BR9A 1IJJA 4KBOA 4BR0A 5BN8A 5AFUA 3DJCA 1MDUB 5KQ8A 4FWRA 2F9WA 1BA1A 4H5RA 3ATUA 3LL3A 4NO7A 3VEWA 3FZMA 4JHDB 4EFHA 4FWKA 3ZX2A 5FPDA 3WXLA 4FWQA 5AQPA 1V4SA 1BDGA 3TPQA 3UKUA 3LDLA 3TU5A 3GOIA 1RFQA 4EHUA 5KPTA 1ATRA 1Q18A 3CQYA 3R9PA 4CD3A 4F9OA 1T44A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AM7A 4LF6K 2YHYA 4FW2A 3G4SN 2PY5A 5CY4A 2QXLA 1LWCA 2FXUA 1S1VA 4CZMA 5KRTA 4NYFA 3LP1A 4DTXA 2ZM6K 2Q0RA 1ESVA 3KC6A 2D4WA 2RE2A 2HHXA 4E0DA 1X9MA 3ZEUA 1F21A 2YIPA 2E88A 5J2NA 4LFAK 2NLXA 3VQ5A 1HJOA 2E3GA 1HPZA 4CJSA 3C6HA 3SMSA 5ADXH 2FSJA 1IG8A 3KWGA 1SN1A 4QOZB 5CZ1A 3ZCMA 2LI7A 2J4RA 1RBSA 4DQSA 4FZYA 1VSEA 3KD1E 2GWKA 1P8ZA 5GADP 1XMQK 3A5MC 3VENA 5GIOA 3WT0A 4M3RA 4CGDA 1TK0A 3B8AX 3HYFA 5EY4A 1YTAA 1Q82O 4L8RB 3SJHA 4DV1K 3T1YK 2ATBA 3U6FA 3U4LA 3CCUN 4FK4A 4JI4K 1YT3A 2VG6A 1IKWA 1WSIA 5KTQA 3SLCA 2KGQA 1KAZA 3AVLA 1B7DA 4CEEA 4WFAL 1VSHA 5E26A 3K9KA 4BRKA 4DV4K 2NNWA 3AA2A 4MDAA 4CK2A 3AO5A 4H4OA 1YIJN 2GWJA 4KH5A 1RTJA 3MEEA 1DQ7A 2GUPA 4X66K 3OBYA 1JKHA 4LFBK 4E7JA 2G8FA 2P9KB 1NGIA 4GNIA 3NBPA 4JN4A 4BRLA 3PLAA 4CZIA 4Z94A 5AQWA 1OH8A 1WUAA 3MXMA 3U9DA 5AQQA 2HF4A 4R5PA 1L5UA 3OYIA 2BGGA 5EOYA 3IFRA 1HRHA 4IOAL 1N32K 1DKGD 4DQQA 4EZ9A 4CEAA 2HMIA 1NGHA 4QS8A 3LANA 3SUPA 2A6AA 3OYNA 4CGFA 2YHWA 4BRQA 4CZLA 4Z4GA 4LFCK 4CCHA 4E7IA 1E4FT 3KK2A 4CD1A 3CG7A 1NMNA 3EYZA 2XY6A 2KBHA 1RBVA 2QKBA 1RDDA 4PQUA 2D0OA 1OVYA 4E1MA 5C15A 3HVRA 3OYBA 1RCHA 2P9SB 3WQUA 2G8IA 5BPLA 3FFKB 3QEVA 1U6ZA 1G99A 5M1PA 1T0ZA 1TL1A 3J8AA 4IBNA 1NGGA 3MEGA 1W9HA 1NNEA 2NUBA 2VWBA 2WTUA 1XRSB 1JCFA 3H1VX 4WQ5C 3CYGA 2UUCK 3MECA 4MDBA 5LMNK 5AZJB 3WXKA 3AA4A 3AO2A 4CZGA 2KBJA 1T1TA 3MX5A 3WXJA 4J2AA 4ILHA 1SKWA 4AHRA 1SQKA 1HJRA 4BRNA 2NRXA 4BDPA 3MDQA 4FJJA 3CM5A 3LM2A 3J7YP 2BDPA 1WBBA 1C1BA 5LJVA 3TABA 3VTHA 3OHRA 4JHDA 4NXNK 3WNHA 1D5AA 2OPSA 5C10A 2W00A 4IWVA 1ATNA 3VQQA 4LY7A 3SF4D 4J2EA 1ZU3A 3PX6A 3TWHA 5FRNA 4KHQA 1JLEA 3O3FA 3PX0A 2YKMA 2PAVA 1HNWK 3C6TA 2IOCA 2N66A 1RGIA 3BZCA 3AVIA 3CERA 4E72A 2Z1JA 3L0QA 5M1KA 5CYQA 1NGBA 4C8OA 2LR3A 4DR5K 3K5OA 4K41A 3R2VA 1ZBLA 4JI6K 3VESA 3G25A 4H0XB 4IJNA 2GTDA 1PTXA 2GMOA 3SBTA 3H3NO 3CFRA 4PL8A 2YHBA 1T7AA 3M6GA 2UUBK 1GLCG 3DRRA 4GV9A 4CW7B 2O8EB 1SS6A 2X6NA 3O08A 1TYQB 4BWMA 4ELVA 3KOZA 4NCAA 1N6QA 3O9RA 1O1WA 2W42A 3TSUA 4CERA 1N33K 3VQ9A 4DKWA 2P9NA 4BDZA 4OLAA 5I9EB 3M5RA 3TTFA 2O8DB 3IMXA 2FBVA 3UIQA 2VQFK 4BE0A 4H0VB 2DFHA 2F96A 1J6ZA 4FJIA 3TTCA 3SAHA 1HYVA 3PIPL 4XH4A 3T69A 4DSIA 1ZC6A 3S41A 3LAMA 3TANA 1GLFO 4N47A 3IUCA 4FLVA 4UADE 3AY9A 4FJ5A 2O8FA 4H0PA 5H1SQ 1EWQA 1GPTA 2WONA 2YNHA 3J7AP 4JI7K 1U2VB 3KLEA 3K59A 2ZJQL 4FLWA 2CGKA 1YJNN 2P9LA 5C24A 1BGXT 4DS4A 3ZEUB 1M90O 5AQHA 2YILA 2KTQA 2O8CB 1NGAA 4K43A 3AGRA 1X9SA 1NH5A 4YOUA 4BY9C 3E66A 1KD1O 2HHTA 5AQFA 1VK0A 5HRRA 1QQCA 4B1VA 4FVMA 2PYLA 3CJAA 1SEGA 4NYNA 3WNFA 1GLAG 5AZIA 4XIUA 2E8AA 5HROA 4AEIA 5HP1A 3I33A 2D56A 3HSCA 5AFUH 3DMJA 4JLHA 3CETA 3EKUA 3O1WA 1RDUA 5KK4A 1IKXA 2Q1NA 1VQ8N 3A0IX 3JS6A 4ILGB 5AQMA 1WSHA 4BR2A 4W5NA 4JKHA 3EKSA 5LY3A 2GELA 4OPKA 3RMDA 1YAGA 3HT3A 3CI5A 1NLVA 4M7YA 1NBWA 4WQ4C 4DTOA 3HJFA 4CJUA 4AM6A 3HZ6A 5BPNA 3S5TA 3QICA 1YVNA 1K8KB 5CR4A 3NVMA 3OYGA 3H46O 4BDYA 5GAGP 1JLGA 2HBKA 4FM0A 5BR8K 3VPZA 1QZ5A 1YHQN 3BY5A 4AAZA 3AV9A 3IRXA 2NRWA 5FLXO 1WN7A 3TAMA 4B1XB 1U48A 3OYEA 5J2PA 1TKZA 4FJ7A 5JLFA 1CZBA 1X1PA 2YIOA 4B8CA 1Q86O 2QKKA 2YNFA 3SUOA 4KYPA 1ZVEA 4C8NA 1KVBA 3HP6A 3LZIA 1S9EA 2RKIA 2QWNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4AM7 A;  4LF6 K;  2YHY A;  4FW2 A;  3G4S N;  2PY5 A;  5CY4 A;  2QXL A;  1LWC A;  2FXU A;  1S1V A;  4CZM A;  5KRT A;  4NYF A;  3LP1 A;  4DTX A;  2ZM6 K;  2Q0R A;  1ESV A;  3KC6 A;  2D4W A;  2RE2 A;  2HHX A;  4E0D A;  1X9M A;  3ZEU A;  1F21 A;  2YIP A;  2E88 A;  5J2N A;  4LFA K;  2NLX A;  3VQ5 A;  1HJO A;  2E3G A;  1HPZ A;  4CJS A;  3C6H A;  3SMS A;  5ADX H;  2FSJ A;  1IG8 A;  3KWG A;  1SN1 A;  4QOZ B;  5CZ1 A;  3ZCM A;  2LI7 A;  2J4R A;  1RBS A;  4DQS A;  4FZY A;  1VSE A;  3KD1 E;  2GWK A;  1P8Z A;  5GAD P;  1XMQ K;  3A5M C;  3VEN A;  5GIO A;  3WT0 A;  4M3R A;  4CGD A;  1TK0 A;  3B8A X;  3HYF A;  5EY4 A;  1YTA A;  1Q82 O;  4L8R B;  3SJH A;  4DV1 K;  3T1Y K;  2ATB A;  3U6F A;  3U4L A;  3CCU N;  4FK4 A;  4JI4 K;  1YT3 A;  2VG6 A;  1IKW A;  1WSI A;  5KTQ A;  3SLC A;  2KGQ A;  1KAZ A;  3AVL A;  1B7D A;  4CEE A;  4WFA L;  1VSH A;  5E26 A;  3K9K A;  4BRK A;  4DV4 K;  2NNW A;  3AA2 A;  4MDA A;  4CK2 A;  3AO5 A;  4H4O A;  1YIJ N;  2GWJ A;  4KH5 A;  1RTJ A;  3MEE A;  1DQ7 A;  2GUP A;  4X66 K;  3OBY A; 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