5AQNA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqnA04
2P9IB 3VEWA 3VENA 5AZJA 1HLUA 1QQOA 1HUXA 4BG9A 3H3OB 3UE5A 1YVNA 3GBTA 1X3NA 3FZHA 5FPNA 2D1KA 4ISFA 4JN4A 1J6ZA 2P9PB 3MMVA 1T44A 2QXLA 1RDWX 3KHYA 5AQJA 4ISEA 3O80A 1K8KA 4EHTA 3FZKA 4CJ7A 3QDKA 4BROA 2ZGYA 3O5BA 3VEYA 1YXQA 3CQYA 4FPBA 3FE1A 4B9QA 2V7YA 2V52B 3S41A 2E2PA 1BA1A 2P9KA 4EFHA 3D2FB 2H3GX 4B1XB 4RCHA 2VYPA 1X3MA 1SAZA 1X9JA 3ULEA 2AA4A 4BGAA 4BG8A 4NB4A 2Q31A 4BC2A 5EVZA 3FR0A 1BOTO 5LJVA 3EZWA 4BC3A 5AFUA 1HKBA 3TPQA 2QWLA 3C7NB 1GLCG 3M3ZA 5EY4A 4J8FA 4IJAA 1KXPA 4AM7A 4JHDA 1QQNA 1JCFA 5AQZA 2IVNA 2E1ZA 3ZX2A 4AM6A 2HMPA 5LY3A 1E4GT 2FSKA 4CBWA 1TUUA 2J4RA 3O4WA 3DXKA 4BRLA 2UYTA 3I8BA 4CZGA 2F9WA 2QWNA 2A40A 2P9LB 4K41A 3U8XA 3ATUA 2BTFA 2QWPA 4MLEA 3DXMB 4M63C 3LL3A 3A0IX 2KHOA 1BU6O 1BDGA 5AZIA 3VETA 3W3DA 3EO3A 4BRIA 3O6WA 3C7NA 2PAVA 3IFRA 3ZEUA 2FLOA 3CJBA 4M7XA 2P9SB 3HM8A 4CZLA 5AQRA 3WQUA 3DJCA 3FLCO 3OHRA 3WUHA 4BQZA 3SLCA 4DHYA 1JCEA 3DWLA 5CE3A 1NLVA 1NGEA 1CZAN 3VF2A 1T6DA 2EWSA 3G25A 5E26A 2E2OA 3BP8A 3VPZA 1S22A 4B1YB 1DKGD 3VEVA 5F0XA 4QS9A 5AQSA 5AQMA 2P9UB 1SZ2A 5AQYA 1Z6RA 2AP1A 4IXCA 3KVGA 2IVPA 3O08A 2E8AA 2QWQA 1C0GA 3DXMA 5BPMA 1T6CA 3ID8A 2E20A 1V4TA 3H6EA 3VESA 4CI6A 4PKIA 3L4IA 1NBWA 4BGBA 3CI5A 4WYBA 5AQLA 5AQOA 4WQ4A 3BF3A 3ENHA 3O8MA 2CH5A 3MCPA 3FZFA 3O1WA 4FL9A 2ASMA 3VGMA 1NGCA 3MN5A 2ZGZA 3CIPA 4K42A 3UKRB 5KPTA 3IDHA 3VF4A 1BA0A 4NO7A 3BUZB 3QFUA 3ZX3A 1NGJA 4BRGA 4CZMA 3QMLA 4DCHA 1ZXOA 1ATNA 2W40A 4H0TB 4GNIA 3FZMA 4L3QA 2HF4A 4O5FA 4FWMA 4BR7A 1U2VB 2P9UA 5I9EB 4H5VA 4BR4A 4BRCA 1QHAA 2CGJA 1ESVA 3M1FA 4CBUA 4XH5A 3L6QA 5F1XA 5AQHA 2A6AA 4IJNA 4IWVA 3EL2A 2V51B 4C23A 3AARA 4PL8A 1XUPO 4CZKA 4A2BA 2CGKA 4B1ZA 4BC4A 3CETA 4IO8A 5F2RA 4H0PA 2ITMA 4DQ8A 4FWSA 2ASOA 1QZ5A 3U4LA 3UKRA 4K43A 4B1WB 2YHYA 3CQXA 3A5NC 3VERA 4JNEA 2P9IA 4BRMA 1WOQA 1MA9B 5TKYA 1YAGA 3QB0A 3TU5A 4BVPA 2E88A 3CHWA 3D7EO 4FWKA 4A61A 1E4FT 3VGKA 4BR2A 3CJCA 2P9PA 3WEEB 3UB5A 2QWMA 3CJ7A 3AAPA 3J8AA 3ATVA 3H1VX 5KQDA 3EKSA 3H46O 4QS7A 4PKGA 5ADXH 1BWFO 2ZWHA 4BRPA 4A2AA 3SMSA 4FWRA 3CJ9A 4O8KA 3QBWA 4BRFA 3A5OC 3D2FA 3P4IA 4FWOA 4I6MB 4BRNA 5BPLA 1HKGA 4CZEA 5JICA 2GWKA 5AQPA 5BRDA 3CJAA 3I33A 4BC5A 3LDLA 1GLBG 1DGKN 3HI0A 4WQ5A 4CD3A 3RSEB 1HKCA 3D2EB 1NGGA 1LOTB 5BREA 2F9TA 2A5XA 3VEXA 5AQKA 3GDQA 4H03B 1ATRA 5BPNA 2Q1NA 4MLHA 4B1VA 3DAWA 1QZ6A 1D4XA 3EKUA 3WEEA 4JD2B 5JLHA 4BR9A 4BR5A 3VF6A 4PKHA 3VEZA 4BRDA 2A41A 1NMDA 2NRHA 4FWQA 3VGLA 4XH1A 3UKUB 3QICA 1RGIA 3QBXA 1NGAA 4XEIA 4EHUA 3B8AX 2E2NA 1BG3A 2P9LA 1HPMA 5AQGA 2Q2RA 3SMPA 2P9NB 3W0LA 3H45C 1QQMA 3JXUA 1ATSA 5AQFA 1TYQB 3A5LC 4CZIA 4WQ4C 3D2EA 2IVOA 1BO5O 2GELA 2P9SA 4H5RA 3IUCA 1NGIA 1KAZA 4BR0A 3ZETB 4FO0A 2CGLA 2GUPA 3WXIA 3ZX0A 3KZBA 5EX5A 4LC9B 2HOEA 3MN6A 3F9MA 4A62A 4BRHA 4F9OA 2YJEA 5BRFA 1JCGA 3UKUA 1Y64A 1Q18A 2D4WA 5BN8A 5FPDA 2WUSA 4QS8A 1NGFA 4FWPA 4FOIA 2PBDA 4H0VB 3R8EA 4PL7A 5BRHA 2A42A 5AQNA 3M6GA 4MO4A 5AFUH 3MN9A 5B8HA 2P9NA 1P8ZA 4CZJA 2P9KB 3BF1A 3HZ6A 3H1QA 5FPEA 3HTVA 1BUPA 3ULEB 1G99A 2VCPA 4YDUA 2A3ZA 3U9DA 4EIAA 4H0YB 3U9ZA 4FWNA 4ISGA 3IMXA 5AQWA 2YHWA 3ZETA 1NGBA 2QWOA 3EN9A 1HJOA 1U6ZA 3ENOA 3MDQA 3AAQA 4JHDB 3FGUA 2D0PA 2GTDA 4Z94A 1KAYA 1SQKA 2FF3B 3GG4A 1U2VA 1NGDA 2QW9A 3VOVA 1HX1A 3WXLA 1KAXA 4BRQA 1GLFO 1MWKA 2YCHA 2Q0RA 2Q36A 3DXKB 4IZ9A 3GL1A 2YJFA 1MDUB 1XC3A 4BQLA 2QWRA 2QM1A 4DB3A 3WXKA 4HWIA 1MWMA 1Z05A 4FWLA 1GLEG 5KPZA 5AQVA 5AQTA 2GEMA 4Y0WA 5EOYA 5AZIB 3A5MC 4H5NA 4M7YA 3A8YA 4BREA 3ZEUB 4CZHA 4FPAA 3CJ1A 4BRAA 3LM9A 4WQ5C 3R9PA 2CH6A 2IIRA 1R59O 2E2QA 5AQQA 2OANA 4GY2B 2BUPA 2VWBA 4CBXA 3WT0A 2ZF5O 3LDQA 1WUAA 2I7PA 5JMVA 4HTLA 1RFQA 1C0FA 3GE1A 5LJWA 3LDNA 3MN7A 5E84A 4MO5A 4H5WA 5FPMA 4E1JA 5JLFA 2HF3A 3L0QA 5ELZA 3HSCA 3BEXA 4EAHD 3HBTA 3LM2A 3MK6A 2YHXA 1NGHA 1IG8A 5AQUA 5BN9A 1GLLO 4B1UB 2E1YA 4RTFD 3C0BA 1GLDG 4I6MA 2NZTA 3GOIA 1XQSC 3JS6A 4CD1A 2D0OA 3VEOA 2ASPA 2YI1A 5ADXA 2FF6A 4H0XB 1NM1A 4H0OA 3LDOA 1DEJA 4BVOA 3WXJA 3RSEA 2V7ZA 1YUWA 1S3XA 4FSVA 1EQYA 2FSNA 4BRKA 2NLXA 5AZJB 2FXUA 4JD2A 2I7NA 3FFKB 5KQ8A 1IJJA 4FOEA 5EXWA 2GWJA 1OKJA 5BR9A 4XH4A 5AQXA 2DPNA 2Q0UA 3CERA 3LDPA 3FZLA 3SJHA 5KPRA 1LCUA 1K8KB 1GLAG 2Q97A 4H5TA 5AR0A 1GLJO 3WQTA 3O1BA 3R6MA 3H3NO 2FSJA 1ZBSA 4JAXA 1TUYA 1V4SA 1TYQA 3AY9A 4RWTA 4YDUC 1H1VA 4K25A 4KBOA 4CZFA 3QFPA 1NWKA 5AQIA 1ZC6A 2W41A 3SK3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P9IB 3KKSA 4HTUA 4GV3A 1HMVA 4IKFA 3UE5A 3FZHA 4ISFA 1RDWX 3O4NA 1N33K 5HROA 3ZSXA 1WAFA 4CJSA 1JLCA 3FZKA 4DMNA 1VHXA 2HSTA 1C55A 1YXQA 3KOYA 3TSQA 2YNHA 1FK9A 3G0ZA 4FPBA 3FE1A 3ZSVA 4B08A 2V7YA 2V52B 4YHHK 3ZT2A 3V6DA 3E1YA 1ZUTA 4HUGA 3D2FB 2H3GX 3LDSA 1LAWA 4B1XB 4O0JA 1IBMK 3RVCA 1C1CA 4DV0K 3CCSN 4BG8A 4BC2A 3O9QA 4EP4A 1NJZA 1EP4A 3EZWA 4BC3A 4KI4A 5AFUA 3A2FA 1TI5A 1C6VA 3C7NB 1GLCG 4F4KA 1U4BA 3M3ZA 3CCJN 4PA1A 4UJ0A 2QA4N 5AQZA 3ZX2A 2E1ZA 4DLEA 3HM9A 3TI0A 1IV0A 4JK9A 2FSKA 3BZKA 1TUUA 3KJVA 3M8PA 3CM5A 4CGIA 2O8DB 4CFDA 3DXKA 5C10A 2UYTA 1N5YA 4CJUA 3CQ8A 4FZYA 5KRSA 1S9GA 2IC3A 2A40A 5JVGL 2BTFA 1TK0A 2E6LA 4M63C 1TGOA 3A0IX 3CXCM 1BDGA 4HCBA 5GADP 3J7AP 4OJRA 3DLLL 3KOWA 3O6WA 3P5JA 1D9DA 4Z4IA 3C7NA 3DLGA 2EHGA 4CZLA 2KTQA 1KLMA 5AQRA 3WQUA 2P5OA 2W6KA 3SLCA 3VQCA 4BE2A 1NJYA 1LWCA 1NGEA 4BDZA 1T6DA 2SN3A 1HNXK 3L2QA 4B1YB 1Z6RA 3THWA 3RMBA 4DF8A 3O08A 2E8AA 4LSLA 1KVBA 1C0GA 4BECA 1NU0A 1QQCA 2E20A 1ZU3A 2G8FA 2D56A 4CI6A 4PKIA 1Q9YA 4KB1A 3L4IA 3CI5A 1AHOA 4YOYA 4IEEA 2HMIA 1OH5A 3MCPA 3O1WA 3VGMA 4ILHA 3MN5A 1N32K 5T7BA 2ZJQL 1VQPN 1BA0A 4CZMA 3QMLA 2KW4A 4KH4A 4DCHA 2YIOA 4H0TB 3AVCA 4L3QA 2HF4A 4JK8A 1L3UA 1U2VB 3IS9A 1RTHA 2D0BA 4F2SA 4KHUA 1WAJA 1S9EA 5C0YA 3K5OA 4AB0A 4XH5A 5F1XA 4CIFA 2G2KA 2A6AA 2Z1IA 4IJNA 3NH2A 3EL2A 3OYFA 4M3TA 1WBDA 1WSFA 2VQFK 4LY7A 4LH4A 3RMAA 3AARA 4M3RA 1VQ6N 2B68A 4B1ZA 1S5JA 3NHGA 1JXBA 4H0PA 1WNSA 3DLRA 3U4LA 2G8UA 3OYEA 4IO9L 3A5NC 4AF1A 1UAXA 4OGEA 1MU2A 4M45A 4BRMA 3AVFA 3NF9A 4YOVA 4BVPA 4FWKA 1KV0A 2RKIA 3BZCA 4MFBA 1NH5A 5H1SQ 3KLHA 5CYMA 2P9PA 5M1QA 4FZXC 3LPUA 4JKCA 4CW7B 2DY4A 3C94A 1POIA 3DYAA 3EKSA 5CY0A 1XI1A 4CHNA 4CK1A 3OYIA 1DLOA 1FXXA 2ZWHA 3OBWA 4FCYA 4A2AA 3CJ9A 3T1AA 4BRFA 3CCUN 2NRRA 2B5JA 4FM0A 1CHZA 4BWJA 3V9UA 2KSKA 4JI5K 1T3VA 4CZEA 5JICA 4FJJA 4NYNA 1VQ4N 2YNIA 5CZ1A 2F8SA 5CR4A 1NMNA 4DUZK 3SV3A 3SBTA 4B3TK 3I33A 4BE0A 4JV5K 3LDLA 3HI0A 1DGKN 4MDAA 4Y1CA 4LD0A 4KYPA 3O4QA 5BREA 3VEXA 3GDQA 1VSJA 4DUYK 1NKBA 4FM2A 2OPQA 4JD2B 5JLHA 4BR5A 4CF9A 1BL3A 3SYZA 3CYGA 4FK0A 2X6SA 1VAZA 4B3OA 3T19A 4KTQA 1GOBA 1NMDA 2HHIA 1YF5L 4DQIA 1RGIA 4I2QA 3RWUA 1NGAA 1BIUA 3J7ZO 1KD1O 4EHUA 2E2NA 3PV8A 3MEEA 3VQBA 2JLEA 3AGKA 2P9LA 2G8IA 1QS4A 3W0LA 3TABA 1TK8A 4JKEA 4QCLA 4C8MA 3JXUA 1ATSA 1JJ2M 3A5LC 5K14A 4CZIA 4DV1K 1OH7A 1ZBLA 1BO5O 1QTMA 4H5RA 3VQ4A 1KC8O 4GKKK 3HYFA 1JXCA 3ZETB 1I6FA 3T1HK 3O9TA 5EX5A 4KV8A 2FBXA 2I61A 4DV2K 1Y64A 1JKHA 3THXB 4FOIA 1YVUA 1C1BA 3R8EA 4PL7A 1C0UA 5JVHL 2A42A 4FVMA 1VNAA 3OS0A 4LFCK 3OBYA 3NGYA 3SPYA 2E4LA 4M3ZA 3U6FA 2OTLN 4E1MA 4FWNA 4ISGA 3B6PA 5AQWA 3ZSRA 3ZETA 4NLBA 1NGBA 3DRPA 2GBZA 2QWOA 1HJOA 4M3XA 4CQKA 1XNQK 1HNVA 3C65A 4JHDB 4B3RK 3FGUA 4Z94A 2KFNA 4ELVA 2FF3B 1RILA 1M1KO 3WXLA 1WMTA 1HX1A 1P0AA 4BRQA 3C6UA 3V9XA 1VRTA 1XMQK 1HQUA 2YJFA 1YJ9N 3Q7BA 4DLGA 2QWRA 4KPYA 2YILA 2KBKA 3WXKA 1LQQA 4HWIA 4CJ4A 2KBHA 4M3UA 4IFYA 5KPZA 2HNZA 4Y0WA 4JKGA 3RR7A 3KLGA 1J9AA 4CZHA 1KQSM 2F4VK 1Q82O 2M8BB 4FPAA 4FJ5A 3CJ1A 5GINA 2RHKA 2F96A 3SQ1A 1N6QA 2IIRA 2YNFA 3HXMA 4Y1DA 2E2QA 5AQQA 3T7ZA 2VWBA 3O9RA 1JLBA 3LDQA 1RDBA 1WUAA 4HTLA 4RW8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2P9I B;  3KKS A;  4HTU A;  4GV3 A;  1HMV A;  4IKF A;  3UE5 A;  3FZH A;  4ISF A;  1RDW X;  3O4N A;  1N33 K;  5HRO A;  3ZSX A;  1WAF A;  4CJS A;  1JLC A;  3FZK A;  4DMN A;  1VHX A;  2HST A;  1C55 A;  1YXQ A;  3KOY A;  3TSQ A;  2YNH A;  1FK9 A;  3G0Z A;  4FPB A;  3FE1 A;  3ZSV A;  4B08 A;  2V7Y A;  2V52 B;  4YHH K;  3ZT2 A;  3V6D A;  3E1Y A;  1ZUT A;  4HUG A;  3D2F B;  2H3G X;  3LDS A;  1LAW A;  4B1X B;  4O0J A;  1IBM K;  3RVC A;  1C1C A;  4DV0 K;  3CCS N;  4BG8 A;  4BC2 A;  3O9Q A;  4EP4 A;  1NJZ A;  1EP4 A;  3EZW A;  4BC3 A;  4KI4 A;  5AFU A;  3A2F A;  1TI5 A;  1C6V A;  3C7N B;  1GLC G;  4F4K A;  1U4B A;  3M3Z A;  3CCJ N;  4PA1 A;  4UJ0 A;  2QA4 N;  5AQZ A;  3ZX2 A;  2E1Z A;  4DLE A;  3HM9 A;  3TI0 A;  1IV0 A;  4JK9 A;  2FSK A;  3BZK A;  1TUU A;  3KJV A;  3M8P A;  3CM5 A;  4CGI A;  2O8D B;  4CFD A;  3DXK A;  5C10 A;  2UYT A;  1N5Y A;  4CJU A;  3CQ8 A;  4FZY A;  5KRS A;  1S9G A;  2IC3 A;  2A40 A;  5JVG L;  2BTF A;  1TK0 A;  2E6L A;  4M63 C;  1TGO A;  3A0I X;  3CXC M;  1BDG A;  4HCB A;  5GAD P; 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