5AQPA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqpA04
5LJVA 3DAWA 3MK6A 4XH1A 1BA1A 2F9WA 2GELA 3W0LA 4A2AA 3O8MA 2IVOA 5F1XA 4BRFA 3VOVA 4B1XB 3QFPA 1T6DA 2P9KB 2Q36A 1RFQA 2P9KA 1S3XA 4DHYA 3F9MA 3GOIA 4CZHA 1X9JA 2QW9A 3FFKB 3H45C 4FWNA 2GTDA 1NGIA 4BGBA 4BRQA 3MDQA 3CJCA 4EAHD 4FWKA 1GLCG 3R9PA 1NGFA 5FPEA 3VEOA 3VERA 5AQIA 5AQTA 2NRHA 3A5MC 3O6WA 3J8AA 2V52B 2Q2RA 2F9TA 4CZMA 5TKYA 2ZGYA 2D4WA 4WYBA 4IO8A 1D4XA 1GLLO 1Z05A 4Y0WA 3OHRA 2V51B 4CD3A 2YJFA 5KPZA 5BRHA 3UKRB 1QZ5A 3CQXA 1HKCA 1RGIA 2A6AA 4K41A 2ZGZA 3UKRA 3VEWA 4WQ4C 3ULEB 3RSEB 5BPNA 3W3DA 3ULEA 1NGJA 4H5WA 3LDNA 3RSEA 3SMPA 4QS8A 3EZWA 2AA4A 3HM8A 3SMSA 1ATNA 4GNIA 4I6MB 2ASOA 1H1VA 2VCPA 1SZ2A 1WUAA 4QS7A 3R8EA 4I6MA 2NZTA 1G99A 1LCUA 2FXUA 3ZX2A 2E1YA 4BR4A 2Q0UA 3L0QA 3FGUA 4M63C 3LDOA 2IVNA 4B1WB 4FPBA 3DWLA 5BREA 3VGLA 2VWBA 1ZXOA 4BRIA 2ZWHA 4XH5A 2BTFA 5AQMA 3ZEUB 4CBUA 1BWFO 1YUWA 3ZEUA 4BR0A 4H5RA 5EY4A 3O80A 1ATSA 3EN9A 4FWLA 3G25A 2E2QA 3VEVA 3JXUA 3AY9A 3CHWA 4B1ZA 2Q0RA 4FL9A 2CH5A 3EKSA 2GEMA 2QXLA 2P9IB 3DXKB 2P9IA 3LDQA 5AQWA 2E2PA 3CJ1A 3O1BA 3DXKA 1OKJA 1NGGA 3BUZB 1HPMA 3CJ7A 1CZAN 1R59O 3KZBA 5AQOA 5AQXA 1YVNA 3GG4A 2V7YA 3CQYA 4CZGA 3AAPA 2A40A 4O5FA 3A5NC 4H03B 1QQOA 3ZX0A 4WQ4A 4C23A 3O5BA 4H0TB 2QWRA 3FZLA 3CETA 4MO4A 3WXLA 4JN4A 2PAVA 4CBXA 2D1KA 3QBWA 4H5TA 3UE5A 4XH4A 3WT0A 5AQRA 1QZ6A 2E1ZA 3VPZA 5AQZA 3O08A 5KQDA 4FO0A 4BRDA 2E8AA 3EKUA 4L3QA 3EO3A 4FOIA 3U8XA 3H1VX 2A3ZA 4YDUC 3H1QA 1TUYA 1ZC6A 2P9SB 5BR9A 1GLJO 4IJNA 4H0VB 3SLCA 2GUPA 5AQLA 2V7ZA 1MWKA 5LJWA 1QQMA 5AQKA 1U2VB 3U4LA 5BRDA 5EX5A 1U2VA 2PBDA 3L4IA 3WQTA 4K42A 5AFUH 2ITMA 3CIPA 1P8ZA 5AQQA 4H0YB 3D2EB 4A61A 4K25A 3D2EA 1YXQA 4PL7A 3FLCO 2W40A 3BF3A 5FPMA 4Z94A 3B8AX 4CD1A 3I33A 4XEIA 1Z6RA 1EQYA 1KXPA 2QWPA 1GLFO 3I8BA 4RTFD 2Q31A 3GDQA 5AQPA 3FZMA 2YJEA 2E2OA 3VEZA 4BG9A 2QWLA 4CI6A 3VETA 1E4GT 3LM2A 4AM7A 4E1JA 4EHUA 4JNEA 4JD2B 2P9UB 5AQNA 3CJ9A 4CZFA 1XUPO 1Y64A 4IXCA 2P9UA 1GLEG 1ATRA 3IUCA 2E88A 3HZ6A 4M7XA 4YDUA 2E20A 2Q1NA 4K43A 3DXMB 3O1WA 4WQ5A 2DPNA 1C0FA 4BRKA 3CJBA 1TUUA 1SAZA 3DXMA 1SQKA 2I7PA 3VF6A 3VESA 2VYPA 3H3OB 1Q18A 3VENA 4CZEA 3QB0A 2IVPA 4BGAA 4B9QA 1MWMA 4BRLA 4FOEA 3S41A 4FWMA 3FZFA 5AFUA 1KAXA 5JMVA 1DEJA 1HKBA 5CE3A 5BN8A 4CZLA 1BDGA 1NMDA 2ASPA 2KHOA 4JAXA 1DKGD 2ZF5O 2AP1A 5I9EB 5KPTA 1BOTO 3LM9A 3MCPA 1NLVA 2QM1A 4BVOA 2CGLA 1BA0A 1XC3A 1S22A 3GL1A 3C0BA 2YHYA 3TU5A 1NGDA 5ADXA 1QQNA 3M3ZA 5F0XA 4QS9A 3ZETB 3QBXA 4BROA 4CZJA 3ZETA 3EL2A 3DJCA 4BVPA 1DGKN 1IG8A 4A2BA 3FR0A 2NLXA 4IWVA 3IFRA 1ESVA 1T44A 3IMXA 3LL3A 3M1FA 4B1YB 4DB3A 5AQSA 3BF1A 4BRGA 3ENHA 4AM6A 4BR2A 5EXWA 1GLBG 4PKIA 5JICA 3VEYA 3TPQA 2D0PA 2YCHA 5F2RA 1U6ZA 2FSJA 1BG3A 1MDUB 1E4FT 4MO5A 2CGJA 2QWOA 4HWIA 4BRHA 1JCFA 4M7YA 1BU6O 4EIAA 5BPMA 3A5LC 2QWQA 3BEXA 3BP8A 4BR9A 2P9SA 1NGHA 3A0IX 3HTVA 3CI5A 4DQ8A 1BO5O 5AQHA 4RWTA 1IJJA 3C7NB 3IDHA 5B8HA 4BC5A 3C7NA 4FSVA 3WXJA 5AQFA 4FWOA 4IZ9A 1T6CA 5BRFA 4EFHA 4H0PA 1NGAA 1J6ZA 4ISFA 3MN6A 1JCGA 3WQUA 4BC4A 3FE1A 5AQGA 5KQ8A 2YHWA 2FF6A 1V4SA 5AR0A 3WUHA 4BRPA 4BREA 4FPAA 3QICA 2J4RA 3QMLA 3SJHA 3GE1A 4PKHA 4FWRA 4FWPA 5ADXH 3A5OC 2Q97A 3VGMA 3VF2A 5LY3A 4GY2B 3U9DA 1MA9B 4FWQA 4PKGA 4BRNA 3UB5A 1WOQA 4JD2A 1C0GA 2FLOA 3MMVA 5BN9A 3H6EA 4JHDB 5AZJB 4BQZA 4F9OA 4LC9B 3HI0A 5E84A 1HX1A 4JHDA 2H3GX 5AZJA 2I7NA 3CJAA 3ATVA 1YAGA 3ZX3A 3LDLA 4IJAA 3WEEB 1X3NA 4BQLA 3WEEA 5BPLA 2FSKA 3MN9A 2E2NA 3KHYA 2CH6A 1HKGA 3HBTA 4CZIA 2A42A 3VEXA 4CZKA 5FPDA 1NWKA 3GBTA 1TYQB 1NM1A 4B1VA 4CJ7A 2UYTA 5E26A 4DCHA 1TYQA 2YI1A 2W41A 1V4TA 4H5NA 2GWKA 2P9PB 1LOTB 5ELZA 4HTLA 5FPNA 3H46O 2P9PA 1KAYA 2D0OA 2HOEA 3H3NO 1K8KB 2P9NB 3MN5A 1K8KA 3HSCA 2P9NA 3ENOA 1XQSC 4EHTA 5JLHA 4H5VA 3UKUB 3QFUA 3FZKA 1NGEA 5AQJA 2HMPA 3UKUA 4KBOA 1BUPA 4B1UB 2FSNA 4BRMA 1GLAG 1NGBA 3ATUA 4NO7A 4A62A 4BR7A 4RCHA 2A41A 1NGCA 2ASMA 4O8KA 3AARA 3KVGA 2CGKA 4PL8A 1QHAA 2P9LB 2A5XA 3O4WA 4FWSA 4BRAA 3WXIA 2P9LA 1HLUA 3M6GA 2FF3B 3ID8A 4MLHA 5AQVA 5EOYA 3L6QA 2HF4A 2WUSA 4H0XB 2HF3A 1HUXA 4BG8A 2BUPA 3CERA 2YHXA 3D2FB 3WXKA 4ISGA 1JCEA 1X3MA 3D2FA 3R6MA 3SK3A 3D7EO 3VGKA 4BC2A 1HJOA 4BC3A 2OANA 2EWSA 5AQYA 2IIRA 3JS6A 3LDPA 5AQUA 2GWJA 5EVZA 1ZBSA 3VF4A 3P4IA 3MN7A 1KAZA 4CBWA 4J8FA 3A8YA 5JLFA 1NBWA 2QWMA 3U9ZA 1RDWX 4H0OA 4ISEA 5AZIB 4MLEA 5KPRA 3AAQA 5AZIA 4NB4A 4BR5A 3QDKA 4BRCA 1GLDG 4WQ5C 3FZHA 2QWNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CM6A 3DAWA 3RR8A 2HHQA 3MK6A 4FK4A 1BA1A 2F9WA 1HNWK 1FKOA 2LT8A 1MU2A 4B1XB 1T6DA 3NF6A 3CMEN 1WNSA 1RFQA 1LAVA 1TKZA 3F9MA 1GPSA 4MDAA 3GOIA 1J5OA 1X9JA 3FFKB 3H45C 1TL3A 4I2PA 2FC0A 1NGIA 3MAQA 1T8EA 4DSEA 3CJCA 4EAHD 3L2UA 1N4NA 5HLFA 1GLCG 5FPEA 1RT2A 4RW8A 3RMDA 1UA0A 1BRZA 4FVMA 4DV5K 2HNZA 3O6WA 4HVJA 1YIJN 1D8YA 2V52B 2OPRA 4JLHA 4LFBK 1GLLO 2YV0X 1LQIA 5GINA 2ETJA 2YHAA 1C56A 3AO4A 1U47A 5BRHA 3CC7N 4JK8A 3TAPA 2A6AA 3B6PA 5FROA 4B8AB 5CZ2A 4JEPA 4CEZA 3W3DA 1VSKA 4BDZA 3ULEA 5IWAK 1L3UA 1L3VA 4QS8A 2P5OA 1A5XA 1S1UA 2ZJRL 3CMAN 4I6MB 1H1VA 2VCPA 3R8EA 3SQ1A 2FXUA 1QSLA 4CEEA 3ZX2A 3QEVA 3L0QA 4G1QA 4AEIA 2E6LA 1RTJA 4IOXA 3VGLA 2ZWHA 5AQMA 4CBUA 4CEFA 1BWFO 1YUWA 1M1KO 3ZEUA 4FWLA 3G25A 3JXUA 3AY9A 3CHWA 4B1ZA 2Q0RA 4FL9A 1YITN 3I8DA 2UUBK 3UIQA 3AA4A 1PTXA 3EEQA 3KLHA 5AQWA 3CJ1A 1YJNN 5T7BA 3CJ7A 4DQRA 4Y1DA 3PV8A 4JYAK 2O8FB 4E0DA 3GG4A 4LF5K 2QKKA 4JI7K 3RWUA 2BANA 4O5FA 3G10A 4H03B 4CFAA 2Z1IA 4JI3K 4KHUA 3QINA 4C23A 2KKZA 3O5BA 3FZLA 2B6AA 1U48A 3TAQA 2HBJA 2Z1HA 4JN4A 1HYSA 1LWEA 2PAVA 3N4QA 4ID5A 4B3RK 3WT0A 2E1ZA 4RW4A 5AQZA 3O08A 4BECA 1OH8A 2RE2A 3T1AA 3EO3A 3MCAB 5JVHL 3PY8A 2KZMA 4AB0A 5BR9A 1P90A 1A5WA 4J2BA 2QK9A 4RW6A 1SL2A 1QQMA 5AQKA 1VK0A 2LSNA 1L3TA 4KTZA 4GV9A 3NMUA 3MEDA 4DTUA 2ITMA 4IEIA 4OPHA 4CESA 3D2EB 1VSFA 4A61A 1RT3A 3KD1E 1VQ9N 4IFYA 2G8IA 4CJTA 5GIOA 1BK8A 3FLCO 5FPMA 3SBGA 1Z6RA 2O4GA 4DR6K 4CQKA 1VNAA 4DV6K 4IOAL 1I6GA 1VQ4N 5J2QA 4LF9K 2Q31A 4JKEA 3SUNA 3QEIA 3FZMA 4FJXA 4M42A 3VETA 3LM2A 4EHUA 4FLZA 4LFCK 3IAYA 2VY6A 1VQNN 2O8EB 4DQPA 2P51A 3KOZA 4CJEA 4DQSA 2P9UB 5AQNA 1Y64A 1X9WA 2YKNA 2KLAA 2KZZA 4YDUA 2Q1NA 3OYEA 2DPNA 4CF8A 4BRKA 1ZBIA 1SS6A 2GUIA 1RDUA 3DOKA 2QXFA 3CC2N 3VF6A 2I5JA 3QB0A 4BGAA 1B9FA 1RDCA 4FOEA 4B8CA 1NE5A 4F8RA 5AFUA 3OJUA 1KQSM 3FFIA 1HKBA 2BGGA 1TAUA 1S72N 1PE4A 1Z26A 1O13A 3C6HA 2R7YA 1UA1A 1BDGA 4JAXA 1TI5A 2KHOA 2ZF5O 2A1RA 1FKPA 3AVHA 4RW7A 5C2DA 4J2DA 3G6EN 3I56N 2CGLA 1BA0A 4XJXA 3LAMA 3AVFA 4CJVA 1NGDA 3DM2A 3VTIA 1JXEA 4CHYA 3M3ZA 5F0XA 3AO5A 4C1NI 5KRSA 1IKVA 1T03A 4OX9K 3DJCA 2LJMA 3U3GA 5EU7A 3IMXA 1YI2N 4W5QA 3RMAA 4EP4A 3NDKA 4KB1A 4DV1K 4Z4GA 3DYAA 4JI2K 1GLBG 3T3FA 3G71N 1LWFA 2UXDK 3NH1A 4KKOA 2HHUA 5HOOA 4AHSA 1IKWA 1JXBA 1J9AA 1S1WA 1MDUB 3MX2A 2ZJQL 4JRPA 2JDQD 2CGJA 2YKMA 2P9SA 3A0IX 3HTVA 4O55A 3VQAA 4RWTA 4CJ5A 3OYBA 3DLBA 3S5TA 3E66A 3D6RA 2HHIA 4DSIA 3S3NA 3J81O 4BE7B 3ZSYA 4V1DC 1TKTA 4LFAK 4B9TA 4KB0A 3AVCA 4RG8A 1REVA 4ISFA 2HHVA 3V6DA 3P38A 5C25A 2UXCK 3HYFA 1KLMA 3NF8A 2NRWA 3TTFA 3MEGA 4PWDA 4U67L 1ASVA 1HPZA 2QI2A 3EE8A 4FLVA 4FWRA 4AILC 3V9ZA 1WAJA 1ZYWA 1WSFA 2Q97A 1EP4A 3PUFA 1HNXK 3U9DA 3CXCM 4FWQA 1WOQA 1Q9XA 3HP6A 4JD2A 3BZKA 1C0GA 3MECA 4JHDB 4DR1K 1BCGA 3CCMN 4YOXA 5DMRA 1ZBUA 4IJAA 4FM1A 4OKKA 3WEEB 1X3NA 4CGJA 4BQLA 2FBTA 3KTQA 3BGRA 1N32K 3V9SA 2E2NA 2ASCA 2CH6A 3E9OA 1HKGA 3OYNA 4Z0UA 4FJ5A 3VEXA 1XNQK 4CEBA 3AO2A 4YNQA 1NWKA 2OTJN 2WTUA 1NM1A 4KI4A 1WN7A 1TYQA 2YI1A 4DV4K 3SUPA 3OS2A 5ELZA 4HTLA 4O5BA 3QLHA 1OMYA 1KAYA 3ZSVA 3H3NO 4Z4CA 4KTWA 4F3TA 3L3UA 3HK2A 4LF7K 4C8MA 4AAZA 3O3GA 1BI4B 3CCJN 4CK1A 3UKUB 3FZKA 1NGEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3CM6 A;  3DAW A;  3RR8 A;  2HHQ A;  3MK6 A;  4FK4 A;  1BA1 A;  2F9W A;  1HNW K;  1FKO A;  2LT8 A;  1MU2 A;  4B1X B;  1T6D A;  3NF6 A;  3CME N;  1WNS A;  1RFQ A;  1LAV A;  1TKZ A;  3F9M A;  1GPS A;  4MDA A;  3GOI A;  1J5O A;  1X9J A;  3FFK B;  3H45 C;  1TL3 A;  4I2P A;  2FC0 A;  1NGI A;  3MAQ A;  1T8E A;  4DSE A;  3CJC A;  4EAH D;  3L2U A;  1N4N A;  5HLF A;  1GLC G;  5FPE A;  1RT2 A;  4RW8 A;  3RMD A;  1UA0 A;  1BRZ A;  4FVM A;  4DV5 K;  2HNZ A;  3O6W A;  4HVJ A;  1YIJ N;  1D8Y A;  2V52 B;  2OPR A;  4JLH A;  4LFB K;  1GLL O;  2YV0 X;  1LQI A;  5GIN A;  2ETJ A;  2YHA A;  1C56 A;  3AO4 A;  1U47 A;  5BRH A;  3CC7 N;  4JK8 A;  3TAP A;  2A6A A;  3B6P A;  5FRO A;  4B8A B;  5CZ2 A;  4JEP A;  4CEZ A;  3W3D A;  1VSK A;  4BDZ A;  3ULE A;  5IWA K;  1L3U A;  1L3V A;  4QS8 A;  2P5O A;  1A5X A;  1S1U A;  2ZJR L;  3CMA N;  4I6M B;  1H1V A;  2VCP A;  3R8E A;  3SQ1 A;  2FXU A;  1QSL A;  4CEE A;  3ZX2 A;  3QEV A;  3L0Q A;  4G1Q A;  4AEI A;  2E6L A;  1RTJ A;  4IOX A;  3VGL A;  2ZWH A;  5AQM A;  4CBU A;  4CEF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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