5AQRA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqrA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqrA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqrA04
3DAWA 5BN8A 3FZKA 5ADXH 5EVZA 1TYQB 5JLHA 3F9MA 3CJ1A 3D2FA 4IXCA 3HZ6A 3ENHA 4CJ7A 3DXKB 2E2QA 2H3GX 4A2BA 1SAZA 1ESVA 4B1WB 5FPMA 3FZLA 5AQSA 3SJHA 2A3ZA 3O08A 3U8XA 3UB5A 4L3QA 5LY3A 3R6MA 4IJNA 5BREA 2HOEA 5E26A 3KVGA 4CZEA 5BN9A 4PKIA 3GOIA 3U9DA 2YI1A 4YDUA 3WQUA 3DXMA 4PL7A 3ID8A 4FWPA 4H0TB 3ZX2A 1GLEG 3MMVA 5F1XA 5AQFA 1SZ2A 3G25A 3VF2A 2Q0UA 3FZFA 3H45C 3O1BA 3CJ9A 3WUHA 1HUXA 2YJEA 3ATVA 4BRQA 1IJJA 4LC9B 1NGAA 1S3XA 4BRCA 4BROA 3D2FB 5AQOA 3LDQA 3FZHA 1WOQA 5AQGA 1QQMA 4H5TA 1ATNA 3UKUA 4BVOA 4CZHA 3GG4A 5JLFA 4CZKA 5JICA 2A5XA 1NGCA 3I33A 3AARA 1XC3A 1NGBA 2IVOA 3W3DA 1G99A 4WQ4A 4AM7A 2VCPA 4BRHA 5AZIA 4FWQA 4EFHA 3VEZA 2CGLA 1T44A 4EIAA 2CH5A 5FPNA 2ASOA 4FL9A 4O5FA 4BREA 2Q0RA 4FWOA 4EAHD 4F9OA 1DGKN 4JAXA 1U2VA 2Q2RA 4A2AA 4EHUA 4BR4A 4H5WA 3R8EA 2NRHA 4NO7A 1HLUA 2E1YA 4H0VB 3BEXA 4BG8A 4GNIA 3ZX0A 1BA0A 3A8YA 1E4FT 4BC3A 4H0YB 4H03B 5AQRA 4M7XA 4BRAA 4BRLA 1J6ZA 1HKBA 2NZTA 2GTDA 3EKUA 4CZGA 2V7YA 3CIPA 1KXPA 5AQUA 1QZ6A 3BF3A 2P9UB 5AQHA 3CI5A 1TUYA 2ITMA 2Q31A 4E1JA 2ZGYA 4DCHA 3VF6A 4Y0WA 2YJFA 1TYQA 3VETA 1U6ZA 3L6QA 4BC5A 3B8AX 1HKGA 1GLBG 2OANA 3O8MA 1KAXA 3TPQA 4PKHA 5KPZA 3EO3A 2P9KB 4NB4A 3VF4A 3WXKA 1MWKA 2FSKA 5EX5A 4BRFA 2IVNA 2PAVA 3KZBA 1MA9B 4FOEA 3ENOA 3VEOA 2FSJA 2YCHA 2Q97A 3CJAA 3H1VX 1JCEA 1NGJA 1BDGA 3VGMA 5F2RA 2E88A 3LDNA 4JN4A 5AQMA 4FWRA 4ISFA 3QMLA 1RDWX 5LJWA 4KBOA 4B1YB 3LDPA 2YHXA 4BRMA 4BRKA 3O1WA 2YHYA 3BUZB 3QDKA 1QQNA 1GLCG 4FSVA 3VESA 3EN9A 2CGJA 3FZMA 5AQZA 4XH1A 3S41A 2QWRA 3M3ZA 4BQZA 3LDOA 1Y64A 4RCHA 1MDUB 3CQXA 3QFPA 1GLAG 2E1ZA 5BR9A 3H3NO 3VEXA 5FPEA 1YAGA 1Z6RA 4JHDB 1NGDA 4K43A 2PBDA 4WYBA 3P4IA 1EQYA 5EXWA 2GELA 4IO8A 2FF3B 4H5VA 3O4WA 2HF3A 2P9LA 3D7EO 2Q36A 3CQYA 3L4IA 2J4RA 5BRHA 3WT0A 1ATRA 4XH4A 2P9IB 2P9UA 1NBWA 3WXJA 2QWMA 2GWJA 5B8HA 4FPBA 3SMSA 1DKGD 4RWTA 2QWPA 3OHRA 3MN5A 5AQPA 3FLCO 1Q18A 1V4SA 4H0PA 5AR0A 5AQWA 3FGUA 3M1FA 5AZJA 2Q1NA 2FF6A 2NLXA 1ATSA 4IJAA 5BRDA 3AY9A 2P9NB 3HTVA 3VGKA 2P9KA 2P9PB 4C23A 2A6AA 3QFUA 4PKGA 4CD1A 3CERA 3VGLA 5EY4A 3ATUA 1HJOA 1DEJA 2P9LB 2A42A 4IWVA 4BR9A 1X9JA 1XUPO 1X3NA 3CJCA 1T6DA 2V52B 3KHYA 4K42A 4H5RA 3HM8A 1SQKA 4DHYA 1BA1A 3W0LA 2BTFA 4MO5A 1BOTO 2E20A 5AQVA 5BPMA 3GE1A 1BU6O 1TUUA 4HTLA 4FWLA 2GUPA 3CHWA 3IFRA 2E2NA 2D1KA 4WQ5C 4FWMA 5LJVA 3MCPA 4CZJA 5AZJB 3UE5A 2BUPA 5ELZA 3ZETB 1LCUA 4I6MB 3ZX3A 1NGGA 3A5NC 5KPRA 2CGKA 2E2OA 1V4TA 3ZEUB 4B1UB 3SK3A 4CZLA 1R59O 2V7ZA 5KPTA 4BRDA 1NLVA 4JNEA 1K8KA 1S22A 2QWOA 2EWSA 4FWKA 3AAPA 4BVPA 1QQOA 3A0IX 1KAZA 2D0OA 4JHDA 4CD3A 5BRFA 4BRGA 2I7PA 3HBTA 4M63C 2WUSA 3IDHA 3M6GA 2F9TA 2W41A 4J8FA 1YVNA 4CBWA 5TKYA 1NMDA 4B9QA 3IUCA 3I8BA 3D2EA 3VPZA 3C0BA 2VYPA 2W40A 3H3OB 5I9EB 2HMPA 1GLJO 3WXIA 2P9IA 4QS9A 4ISEA 3C7NA 1IG8A 3QICA 1T6CA 3U9ZA 3H1QA 3L0QA 2ZGZA 3U4LA 4CZFA 1RFQA 3MN7A 3VEWA 4ISGA 5AQJA 1K8KB 1BWFO 4BQLA 3CJBA 5ADXA 2I7NA 4Z94A 3WQTA 2P9NA 4BRPA 3RSEB 4BR5A 5KQDA 2IIRA 2P9PA 1NWKA 1BG3A 2ZWHA 3DWLA 4BC2A 2V51B 2D0PA 3JS6A 4RTFD 3EZWA 3MDQA 4FWNA 1E4GT 4BG9A 2E8AA 3EKSA 4B1VA 1XQSC 3BF1A 2GWKA 1YUWA 3QB0A 4FOIA 3D2EB 3JXUA 4JD2B 1GLDG 4YDUC 3TU5A 4QS8A 2E2PA 3O5BA 3QBWA 1Z05A 2FXUA 3LM9A 3LL3A 5BPLA 4K25A 4BR0A 3C7NB 4CBXA 2GEMA 2P9SA 4BR7A 1LOTB 1ZXOA 2A40A 3LM2A 5EOYA 3ULEB 1H1VA 2DPNA 4K41A 3FE1A 1HX1A 3MK6A 4CI6A 4MO4A 3UKRA 2ASMA 1GLFO 2QWNA 3H6EA 3ZETA 4I6MA 2ZF5O 3GL1A 1NGEA 3J8AA 4PL8A 5E84A 4FPAA 4B1XB 4FO0A 3ZEUA 5AQNA 1GLLO 2ASPA 5AQKA 5FPDA 2AP1A 3EL2A 5AFUH 4GY2B 2IVPA 4FWSA 4A62A 2FSNA 3O80A 1D4XA 3WEEA 5AFUA 3A5MC 5F0XA 3DXMB 2QWQA 4BGBA 1OKJA 3FR0A 3SMPA 4WQ4C 4BGAA 3VEVA 2F9WA 5KQ8A 4EHTA 1BUPA 2A41A 1MWMA 4WQ5A 4MLEA 2P9SB 5AQLA 3O6WA 5CE3A 1KAYA 1ZC6A 3CJ7A 4XEIA 5AQTA 5AQXA 3A5OC 4DB3A 4H0XB 1P8ZA 3UKRB 1C0FA 4H5NA 5BPNA 5JMVA 1HKCA 2QXLA 1NGFA 1JCGA 2YHWA 3DJCA 3CETA 1ZBSA 3AAQA 5AQQA 1NGIA 3HI0A 3UKUB 2KHOA 5AQYA 3QBXA 4M7YA 5AQIA 3BP8A 3GDQA 1C0GA 2QWLA 4HWIA 3WEEB 3HSCA 4B1ZA 1RGIA 2FLOA 3GBTA 4A61A 5AZIB 1JCFA 3DXKA 1WUAA 3RSEA 3VERA 2CH6A 4BC4A 4BRIA 1QHAA 1QZ5A 2HF4A 1NM1A 3VOVA 3A5LC 1BO5O 3MN6A 3FFKB 4BRNA 1NGHA 4CZIA 4DQ8A 3MN9A 1U2VB 1CZAN 1HPMA 4IZ9A 3IMXA 4QS7A 3VEYA 3H46O 4XH5A 2QW9A 2VWBA 4H0OA 3R9PA 4AM6A 1X3MA 2D4WA 4O8KA 3SLCA 2AA4A 4CBUA 4JD2A 3VENA 4BR2A 2UYTA 2QM1A 1YXQA 4MLHA 4CZMA 3LDLA 3WXLA 3ULEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O9SA 1NH5A 1OH7A 2QI2A 5GADP 4LY7A 5JLHA 1NG9A 1ASWA 2Z1IA 3CJ1A 3ENHA 4CJ7A 5GAGP 2Z1JA 4C8NA 1SAZA 1ESVA 3KJVA 5DM6L 5AQSA 5FDLA 2A3ZA 3O08A 3UB5A 2IS3A 1TK0A 3R6MA 2GX9A 2C1IA 2HMIA 1LQQA 5E26A 4CZEA 3PO4A 3VTHA 3U9DA 2YI1A 3VQCA 3HVTA 2G8IA 4H0TB 4FWPA 4DSIA 2C1GA 3MMVA 4DQRA 1N6QA 2HBMA 3AV9A 3VF2A 4IBNA 4EP4A 2YIOA 3FZFA 1NMNA 2A7TA 4NXNK 4NCGA 3L3VA 1WWNA 3E9OA 1B7DA 4BRQA 3ZLJA 1VQ5N 4M41A 2HHVA 2VY6A 1FJGK 3TAGA 3LDQA 1WOQA 3M8SA 4H5TA 4CEBA 5I42A 2LR3A 3E7RL 3DMJA 3GG4A 1NGCA 4HVJA 2Y1IA 3MECA 3ISNC 4U7BA 1XWLA 3QEVA 4ELUA 4WQ4A 3RMAA 2PZSA 4DV2K 5AZIA 4CF8A 2VWJA 3HSTB 3P31A 3VEZA 1T44A 1C0UA 2DTUA 5LMUK 1KSPA 2ITGA 4F9OA 1DQ7A 1DGKN 5HROA 4A2AA 2E1YA 3ZT1A 4UY8O 1VNAA 3A8YA 3E01A 4BC3A 1FW6A 4H03B 4M7XA 4CFDA 3IS9A 1J6ZA 4KKOA 4IOAL 1A5VA 2GTDA 1O1WA 2KYQA 5AQUA 2LI7A 4IFYA 2GUIA 1QVFM 3CC7N 4KI4A 3SUQA 4RW9A 2VG6A 4DCHA 1TYQA 4AHRA 4LFAK 3AA4A 1HKGA 4AH9A 2HSTA 1VSJA 3KLEA 2ETJA 1QHTA 1KAXA 3CC4N 4BACA 2F8TA 2UXCK 4B3RK 3CCVN 1XC9A 1KVAA 2F8SA 5EX5A 3DM2A 3PX0A 3ITHA 4O55A 3KZBA 1MA9B 4FOEA 3DLKA 3C6TA 1U48A 3DLEA 2YCHA 2Q97A 1IBKK 3H1VX 4E7IA 4M42A 1VSFA 1K8AO 3KKRA 2NRXA 4E0DA 3DRRA 1NJXA 4KHNA 2P5GA 2IC3A 4N47A 1IKWA 5F2RA 1S1WA 4FWRA 1VSKA 2QXFA 3QMLA 1RDWX 2UUCK 4CJPA 2VGNA 3S9HA 2XHBA 4CEAA 3O1WA 3R1XA 2G8UA 4H4MA 3QERA 3M8QA 3KTQA 4DR4K 3RVCA 1NK8A 4DQSA 4Z4IA 1BI4A 3F73A 1JXEA 1T3VA 1MDUB 3RRHA 4Y1CA 3V9UA 4DU4A 2E1ZA 4ZTJA 5BR9A 4JHDB 1NPIA 4DTMA 2G8HA 1L3SA 4IEEA 3V81A 2HHHK 2HHTA 1XHXA 3AGRA 3OYEA 5EXWA 4AHUA 4DQPA 3VQDA 4WCEL 4YY3K 2NRVA 1K73O 3SBTA 3CQYA 4KB0A 4O0IA 2J4RA 3BDPA 3KKSA 2YEOA 3P38A 2E3GA 4B9NA 3WT0A 1ATRA 1X9MA 2P9IB 4JK7A 4CF9A 1NBWA 3AO1A 4WFBL 4B3TK 2YIPA 3SUOA 2KBHA 1DKGD 5BR8K 2QWPA 2UUBK 4LF6K 4DR3K 4JS5A 4H0PA 4E7HA 4CJ5A 4B8CA 3FGUA 2Q1NA 1HNXK 1VSHA 1OH5A 2XRIA 2YNIA 3CFRA 1GPTA 4Z4FA 3QFUA 4CHPA 3CCRN 3NF9A 5EY4A 3ATUA 1HJOA 4JYAK 2E3FA 5KRSA 4HE7A 2FBXA 4CF1A 2KFZA 2ZJPL 4IWVA 4JK8A 4BR9A 1RDUA 3CJCA 2MBKA 2V52B 4FK2A 4K42A 3SQ0A 3W0LA 1J54A 3ENBA 3OYNA 2OCEA 5AQVA 3MEEA 2RPIA 3PO5A 5BPMA 1W0HA 2KSKA 3TSQA 3OYJA 4FWMA 5FLXO 5J2MA 4N5SA 2W6KA 4CJKA 3SAHA 2X74A 4F2SA 1TKXA 3LP3A 1LCUA 2VG5A 1CZBA 1YJNN 1S9EA 3HOSA 3ZEUB 1VSIA 1JLGA 2B4JA 5FRMA 2HHXA 2KJAA 1RTHA 1YJ9N 4CHQA 1K8KA 1QS4A 4YOWA 4FZYA 1RT5A 4DR1K 3LP1A 5JS2A 1KAZA 2D0OA 4JKGB 5AJ3K 3KIOA 5CZ2A 2HNZA 4M3XA 3HPOA 2WUSA 3M6GA 1SS6A 2W41A 2O4GA 2KGQA 2VGMA 1WSHA 4IDHA 4UQGA 4E7KA 1NRAA 1IBLK 4C1NK 3ULDA 3D2EA 3C0BA 3OBWA 2OPSA 5FRNA 2GMOA 2SN3A 3H3OB 1P90A 3WXIA 1GLJO 1RTJA 1QTMA 1N36K 2YNFA 3U9ZA 5HP1A 1RFQA 1JZAA 4LSLA 3MN7A 1NKBA 5AQJA 3K5NA 1ZBHA 1KCFA 3CJBA 4CK3A 1VQPN 4JS4A 3VQQA 2I7NA 1DT9A 2P9NA 4BRPA 2IIRA 1YVUA 2JGUA 4AHCA 4BC2A 1SKWA 5M1NA 4RTFD 1BCOA 4CJSA 1DJTA 3DOKA 1RDDA 2XY6A 1L3TA 2GWKA 4KREA 4FOIA 3K0SA 3NHGA 4HUGA 3O9TA 1XNQK 3TU5A 1VRTA 3OYMA 1Z05A 3LANA 4B8AB 1HR0K 4BR0A 4LF9K 4BR7A 3VA0A 4DR2K 4M3UA 1YT3A 1XRSB 3MX5A 4CESA 1XHZA 2FBVA 3MK6A 1TKDA 1N8RO 4IFEA 2QWNA 2KBKA 2A1RA 4YOTA 4OGCA 4MDBA 4OJRA 3ZETA 4LH5A 5E84A 3K5MA 2KW4A 5DK5A 4HHFA 4GY2B 3KWIA 1UA0A 4DLEA 3KOYA 2FSNA 3EEQA 4RW8A 1D4XA 1NK0A 2QKKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3O9S A;  1NH5 A;  1OH7 A;  2QI2 A;  5GAD P;  4LY7 A;  5JLH A;  1NG9 A;  1ASW A;  2Z1I A;  3CJ1 A;  3ENH A;  4CJ7 A;  5GAG P;  2Z1J A;  4C8N A;  1SAZ A;  1ESV A;  3KJV A;  5DM6 L;  5AQS A;  5FDL A;  2A3Z A;  3O08 A;  3UB5 A;  2IS3 A;  1TK0 A;  3R6M A;  2GX9 A;  2C1I A;  2HMI A;  1LQQ A;  5E26 A;  4CZE A;  3PO4 A;  3VTH A;  3U9D A;  2YI1 A;  3VQC A;  3HVT A;  2G8I A;  4H0T B;  4FWP A;  4DSI A;  2C1G A;  3MMV A;  4DQR A;  1N6Q A;  2HBM A;  3AV9 A;  3VF2 A;  4IBN A;  4EP4 A;  2YIO A;  3FZF A;  1NMN A;  2A7T A;  4NXN K;  4NCG A;  3L3V A;  1WWN A;  3E9O A;  1B7D A;  4BRQ A;  3ZLJ A;  1VQ5 N;  4M41 A;  2HHV A;  2VY6 A;  1FJG K;  3TAG A;  3LDQ A;  1WOQ A;  3M8S A;  4H5T A;  4CEB A;  5I42 A;  2LR3 A;  3E7R L;  3DMJ A;  3GG4 A;  1NGC A;  4HVJ A;  2Y1I A;  3MEC A;  3ISN C;  4U7B A;  1XWL A;  3QEV A;  4ELU A;  4WQ4 A;  3RMA A;  2PZS A;  4DV2 K;  5AZI A;  4CF8 A;  2VWJ A;  3HST B;  3P31 A;  3VEZ A;  1T44 A;  1C0U A;  2DTU A;  5LMU K;  1KSP A;  2ITG A;  4F9O A;  1DQ7 A;  1DGK N;  5HRO A;  4A2A A;  2E1Y A; 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