5B6M | Genus

Total Genus 71

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	71
sequence length	221
structure length	221
Chain Sequence	GLLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNCEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Peroxiredoxin-6
publication title	Crystal structures of human peroxiredoxin 6 in different oxidation states pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	71
structure length	221
sequence length	221
chains with identical sequence	B, C, D, E, F
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2016-05-30

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.1020.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2	Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2	5b6mA02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	5b6mA01

4MMMA 5AISA 3TKRA 3F0IA 4KH7A 5DALB 3FKFA 2WGRA 1EGRA 4WBJA 3UAPA 1DSBA 2QKEA 2H1BA 3HYPA 3ED3A 4MF6A 4PX1A 1TW9A 4Q5RA 1FO5A 3GV1A 4ZILA 2B5XA 3KIJA 2K9FA 1A0FA 1G0TA 1R5PA 3F3QA 2DBCA 1Q4JA 1WIKA 2RUEA 4TXVA 1HNBA 1BG5A 2C80A 4J2FA 4FIWA 3M1GA 4N0VA 4HZ2A 3ZMKA 2DJ0A 3GSTA 2AB6A 3TCOA 4K6XA 2FLSA 4QL7A 1QMVA 5IPHA 3L9SA 2V6OA 3ZVJA 3ZRDA 2IIYA 4OCFA 2C8UA 5G5FA 3L78A 2LRTA 1CQHA 1J08A 1TRUA 2EC4A 4MZBA 3QFBC 1ZGNA 1JLVA 2GQLA 2LJKA 1XVWA 3LQ7A 1U87A 2B7KA 4IHUA 4ECBA 2L59A 1OAZA 4XS4B 4JZQA 3QR6A 1J9BA 1GP1A 3HVSA 1SL2B 2FGXA 3EMXA 1JLWA 4MABA 2A4VA 1XWCA 3P90A 1X5CA 3R2QA 5HR2A 4KX4A 5L71A 1EZKA 2I81A 2L4CA 4LL1B 4BA7A 1VF1A 3L9VA 1XW9A 2YV9A 1VF3A 2CAIA 1ERUA 3ME7A 2H01A 2B7JA 3M8NA 2IMIA 2HZEB 1TP9A 1WRYA 1N2AA 2OE3A 3Q18A 6GSUA 2JL4A 5F05A 2VIMA 2LS5A 4HS1A 1VGLA 1WMJA 2H76A 4N11A 1EV4A 5KN2A 3C7MA 3ME8A 2CX3A 4IQAA 3PH9A 2DIYA 2N5FA 2VM2A 1YJ6A 3SBCA 1H4OA 5E4WA 1BJXA 4NPBA 1HQOA 3FW2A 4WETA 1QK8A 1GUHA 1UC7A 3HCZA 4XHMA 3HVXA 3GTUA 3W6GA 2H75A 2YZUA 1V57A 1TI1A 3GX8A 3TUEA 4O7HA 1ABAA 4PQIA 1X0RA 5D93A 2YWOA 3CRTA 2Z9SA 2BMXA 3DGQA 4KDUA 4HQZA 3BBYA 1XPVA 1EV9A 2O7KA 3QCPA 4IVFA 3ZITA 4F2IA 2IMKA 2YANA 2HFDA 3CSHA 4HDEA 2WULA 5CO3A 1T4ZA 2C0EA 1TK0B 3ZREA 1K0BA 4JR6A 4ZL8A 4ID0A 3DEXA 3ERGA 1U3AA 2GTUA 4RI6A 3S9FA 3F4RA 2DJKA 4N0ZA 4XRDA 3TJFA 3HDCA 2AJQB 3VWUA 2H1GA 3WT2A 4L0UA 4RQRA 2NVLA 2YWMA 2GT5A 5A4WA 2LJAA 2TRXA 4PUAA 4WEYA 4JBBA 4DSQA 3GKMA 1GSSA 3ZFLA 1NSWA 1X9WB 3DIEA 3UJ1A 3N5OA 3UVTA 3QAGA 1GSFA 5B6NA 2KP2A 4JRRA 1GSEA 2IJYA 11GSA 1PL2A 2ALBA 3ZZXA 1TK5B 1N8JA 5IMZA 4I6XA 5GSSA 2YJ7A 5F07A 4D73A 3IR4A 1YDKA 1OC3A 5LNKe 1SKWB 3HKRA 4FYCA 1U3IA 2AUVA 1EWXA 4TVEA 3A2WA 4OFMA 3KMNA 1MTCA 4MF7A 3D4TA 3G7IA 4BPYA 3I69A 1BAYA 2B1KA 2QC7A 4PQHA 3VPTA 3I9V2 3UIWA 1AW9A 3EC3A 3C73A 1AC1A 2X64A 1M2BA 4GSSA 4XIHA 5ELAA 3FR6A 3AY8A 3IPZA 4WR5A 2FWHA 1MDJA 1TJDA 1WPIA 2VCXA 18GSA 2H6YA 2P31A 4NV5A 4I2UA 1Y6EA 2GSQA 3BJ5A 2DIZA 1URMA 1EOGA 2H73A 2JU5A 2DMMA 2VAFA 2QGVA 4F03A 3CTGA 14GSA 1KTEA 1PL1A 3KEBA 4N10A 2CQ9A 4TXOB 4K9ZA 4V2LA 1ZL9A 4KCEA 4ULXA 4L5LA 4ZBBA 2H70A 2PBJA 2OE1A 3GYKA 2J9HA 3TB2A 2NBSA 2DSAA 2OA7A 4NV2A 1WJKA 1EEJA 5ECSA 3APOA 3KP9A 4MPFA 4I5QA 2H19A 3KH9A 3VFIA 2F8AA 4RUVA 1SJIA 4X1UA 1ZYQB 1G7EA 1X9MB 4K0GA 4IW9A 2L4QA 3VWXA 3EURA 3PR8A 4G19A 1SENA 2C3NA 2DMLA 1V2AA 1OE8A 2V6KA 4KUNA 5JWRB 2M72A 3F8UA 5GAND 1TOFA 4IELA 4JE1A 5CRDA 2F3MA 2ZNMA 4ZBDA 3LSZA 5D8IA 4PQ1A 4NAXA 3TKSE 1GRXA 2R37A 2GDRA 3GIXA 5CYYA 4KDYA 4YQVA 3PGTA 1CQGA 2K8VA 3DXBA 1NW2A 4TR1B 4CDOA 2LJRA 1B4QA 2L57A 2WZ9A 4EDYA 3N9JA 2M80A 1HD2A 4PNFA 3QAWA 2VL2C 3IAS2 2LQOA 2V1MA 1U88A 4JR4A 2C1YA 3VLNA 4NXIA 3GX0A 4MPGA 3H4KA 1YEPA 1A2MA 1GNEA 3GUSA 4O92A 6GSXA 1E2YA 1GLQA 2HSHA 1PX6A 2H72A 1TDIA 2LNSA 2VCZA 2MMAA 5CREA 3RPNA 2DJ3A 1K0NA 1TI3A 2X8CA 1GSDA 2PPTA 5ECMB 1M2AA 2WS2A 4P3YB 1ST9A 1ERWA 1F37A 2VO4A 4KCAA 2RM5A 4ZL9A 2FWEA 4MF5A 5COHA 1GNWA 4MK3A 2YNXA 2CA8A 2VL2A 1PKWA 5LCZA 1UA5A 3QPMA 1OYJA 2PUKC 1LBKA 1W4VA 1Q98A 5ID2B 3CXGA 1OKDA 3ERWA 1JHBA 4KB3A 2B1LA 2CZ2A 3ZTLA 3ZVJD 3CBUA 5DALA 2VUPA 1YY7A 3KJYA 3K8NA 1V40A 1SKSB 4TN8A 1O8XA 2NPBA 1O85A 4I8BA 1OC9B 19GSA 2IWTA 5JWOB 4XS1A 4HJMA 3CRUA 3BCKA 3IBHA 4Q5NA 1AUCA 3WT1A 1XVQA 2YCDA 1GL8A 2H30A 1VF4A 2WRTA 3FRCA 3Q74A 3DRNA 1YEXA 2OADA 1SD8A 1I5GA 3UVHA 3TOTA 3HZ8A 5DCGA 1K3YA 3IAM2 4BWQA 3OR5A 2IN3A 4FH8A 3LWAA 1K0DA 4TR3A 5B7CA 2O85A 4HUAA 5KEJA 5B8AA 4ACSA 2CX4A 1Z6MA 4FO5A 3EU3A 3IE3A 1PMTA 5FWGA 2AV4A 4OFTA 4OO5A 1F2EA 1YQ1A 2P0GA 4POKA 2XPDA 2L6CA 1BYEA 2H74A 2JZSA 1B8XA 1IYHA 4JU5A 3TKSC 1FVKA 4FYBA 3TGZA 4GSNA 1A8LA 1G6YA 1XWAA 3APQA 4XS4A 1XW5A 2I3YA 3KTBA 3ZIVA 1A2LA 3A2VA 4ZL7A 3DMLA 3VK9A 3C71A 2CZ3A 1QFNA 2JSZA 4ZXGA 2V32A 5KN1A 1O81A 2REMA 5IQYA 5AGYA 2WDUA 5AIXA 1AQVA 5KN0A 2VLVA 3QOUA 3QAVA 2HZEA 3LYKA 3PINA 5F8BA 2EIQA 3FHKA 3CSIA 3G9BA 3FY7A 4ZB8A 3HY2A 4G2EA 4IN0A 2A2RA 2WCIA 2RUFA 2VLTA 2ZCTA 4Q5FA 3TKSA 5F0GA 1FHEA 2VM1A 3GURA 5IIZA 4AJ6A 5ECRB 6GSSA 4MCUA 3ZIJA 1F3BA 6GSYA 1H75A 2O89A 1EP8A 4BVYA 4WF5A 4MJAA 5DVBA 5H5RA 3BCIA 3KD0A 1T4YA 4ECCA 4FYUA 4POMA 5ECHB 1XWKA 3DKSA 5DDLA 3VWWA 2K8SA 2LV3A 2GS3A 4HI7A 4EDZA 4GRFA 2DC5A 1A2JA 3IC4A 4DSSA 1GTUA 4ML6A 1ZMAA 3DVWA 4MLYA 5GSTA 2CVBA 1SU9A 2FNOA 4RI7A 2YZHA 3M3MA 3UBLA 3L9UA 1G6WA 5KN3A 1HNAA 7GSSA 2B5YA 2E7PA 4L8EA 3TKQA 3FZ9A 1M2DA 4ZB9A 3LJRA 3NZNA 1GSYA 5LD0A 3US3A 3W8JA 4L5OA 2GQKA 1A23A 1TXXA 3J7Yk 2I1UA 3F9UA 2V2GA 1K3LA 4GCIA 1S3AA 5EVOA 4MJBA 4MZCA 3W8SA 1J0FA 5E59A 4YAPA 3GMFA 3ZL5A 4H86A 1XWBA 4ECIA 4OWYA 2DJJA 5AN1A 1XWGA 3MWHA 2KLXA 5GZZB 2C0DA 6GSWA 2YWNA 1SYXA 2BTOT 4L0WA 5JCWA 1JZOA 1TU7A 5G1KA 5C00A 4NHWA 4HQSA 1S3CA 5J5NA 1PQNA 4TKYA 2WB9A 2B6MA 4ILFA 4WR4A 3VI5A 3BOAA 3O6TA 1GWCA 3FZ5A 3GKNA 1BEDA 4PURA 5ECNB 4YQUA 3DD3A 1GTBA 2PERA 1FOVA 1X5EA 4HJ2A 2LRCA 1XIYA 3LG6A 1JZDA 5G30A 5INYA 1SD9A 5EL8A 1GH2A 3GL3A 2G0FA 2C0GA 2DLXA 3I43A 1PX7A 4I97A 5D96A 2CAQA 3QMXA 4KW6A 3D0ZA 3HJPA 4ISDA 4O5RA 4EVMA 2IMFA 2MZCA 5IO2A 4MZWA 4AJ7A 5J9BA 4GWRA 2FCHA 3CMIA 1V9WA 5D9WA 1QUWA 1SJ6A 4KE3A 2NDOA 1ZCPA 4PNGA 3ERFA 2FHEA 3ZMLA 1DUGA 2JACA 3A2XA 1XXUA 5IMAA 2MMZA 3Q19A 4ML1A 1A0RP 3BD2A 1Z5YE 1ZYEA 2OKAA 1BQ7A 1HNCA 3ZFBA 3FR9A 3GHAA 2FWFA 3FZAA 22GSA 2I4AA 4TXOA 2H71A 1T00A 4MP4A 4BL7A 2YWIA 2LRNA 1K0CA 3UEMA 3RAZA 4F9ZA 4GQCA 12GSA 2P5QA 4WF4A 3LORA 3EE2A 2HRFA 5DAKB 4Q5QA 2GT6A 2CT6A 4K7OA 3V1WA 1AQXA 1SK2A 3EU4A 3F63A 4BWSA 3C1RA 1UN2A 2XBIA 3KMOA 4KGIA 5H5QA 4JEDA 3VURA 1WP0A 3DWVA 4N30A 2L6DA 2JZRA 4LMVA 4ZIJA 1T7PB 2LQQA 8GSSA 1X5DA 4QQ7A 4IJIA 4PGTA 3HJOA 4TW5A 2H1DA 2HXKA 1EGOA 6GSVA 1VRSD 3RBTA 4EL1A 2GQMA 4LMWA 2LKUA 3P2AA 4J57E 2O87A 3F4TA 2GSSA 1KNGA 1SK0A 1ON4A 1GUKA 1QGVA 3GSSA 1IYIA 4AGSA 1V98A 2PN8A 4PUFC 2DJ1A 1XOBA 1K0AA 2GGTA 1R4WA 5IMCA 2A2SA 5CP1A 2FD3A 3GFKA 2HYXA 1A8YA 2L5LA 3GKXA 4IBPA 3GKKA 4TRXA 3IK7A 3QDNA 5HR3A 2PWJA 3VWVA 5CRWA 5AIVA 3IDVA 2D2ZA 1ZZYA 1AIUA 2C3QA 2TRCP 3RHCA 3TJJA 2H0GA 5A4UA 2GZZA 5IMVA 1DBYA 1KEBA 5A5KA 3D6IA 5CNWA 5JCUA 1OC8A 5B8BA 1FG4A 1YKAA 4LA1A 1C72A 2O8VB 2FA8A 2FUG2 1T1VA 3O3TA 2IFQB 1NM3A 5ECQB 5ID2A 1TRVA 1WE0A 4KSOA 4DEJA 3RPPA 2LEGA 1WWJA 1M9BA 4IP1A 1SL1B 3KGKA 3H8QA 1A24A 1FB6A 1QXHA 1M9AA 5J4UA 3TJGA 3EWLA 1GTIA 5HR0A 1MDKA 3DYRA 1DE1A 1NHOA 4G10A 2F9SA 5D9TA 3E0UA 1RW1A 1THOA 4O32A 3Q6OA 4MH2A 4DSRA 4V1Ag 1USBA 3E9JB 1O7UA 2OE0A 3VPQA 4E8HA 4MJEA 1F3AA 3TOUA 3MDKA 1FAAA 4KSMA 1I9DA 5D9XA 3UARA 1YF0A 1M99A 3FK8A 2H8LA 2V41A 5CRGA 5HFKA 2RM6A 3NOFA 5IMFA 1XCCA 3NIVA 4PXOA 1PRXA 5DQSA 3EVIA 2QSIA 1NHYA 1M7TA 2CVDA 1KBNA 4K8MA 2F51A 3J7Yb 2VD0A 1RK4A 9GSSA 1GULA 2WFCA 3MSZA 4YH2A 1F6MC 3LYPA 3P8WA 2YOIA 4EXJA 1TU8A 1MDIA 1R26A 5ECPB 4F0CA 2CV4A 4NMUA 3LEFA 1EEMA 3VI7A 4CW9A 1PSQA 3WD6A 2EIRA 1O8WA 2VCVA 1LU4A 3TJBA 5A4VA 3FYGA 1K3OA 1YF1A 2H0IA 1Z3EA 2H6ZA 5FT3A 4CHSA 4G9HA 4KAEA 4K0NA 1ACVA 4XS6A 4ECJA 2JZTA 1YKCA 1EOHA 2PGTA 1BX9A 1WOUA 2K18A 4ZBAA 3MAKA 10GSA 3DVXA 1AXDA 4K7NA 2LTKA 2OACA 13GSA 3TJKA 1K0MA 3LXTA 2LNTA 3IK9A 1JFUA 1FVJA 4GF0A 2MBTA 4X43A 3WGDA 5IM9A 3H1NA 1GTAA 2PVOC 4RQXA 2KUCA 1ML6A 16GSA 2AHEA 1R5AA 4K2DA 2MMOA 2BJXA 5IO0A 2MBSA 2EIOA 1F9MA 2CVKA 2IPAA 2NTOA 3LXZA 3GN3A 3KZQA 2IMDA 1B9XC 1EP7A 2E2GA 2PVQA 1OKTA 1FB0A 3M9KA 3UMAA 5G1LA 3FR3A 3D21A 1SJZA 3G7JA 3IXRA 2HRNA 2ZUPA 4DVCA 2H0HA 3QD9A 1MEKA 2B3SA 1T3BA 5JCGA 5EY6A 2YV7A 5ECLB 2R6KA 4IP6A 4IGJA 2C4JA 2FWGA 1MD4A 1Z7RA 5ECOB 2YP6A 3L0HA 2HLSA 3HZ4A 4POBA 1GSQA 4NWYA 4J56E 3TRPA 2PMTA 2FA4A 1Y25A 3KCMA 2MYGA 3A5WA 1PD21 2HNLA 3HVVA 1SYRA 2GZYA 3D5JA 5G31A 5C04A 4AJ8A 4TOPA 3I6AA 3HD5A 2XBQA 4YAVA 1XOAA 3C1SA 3TDGA 2IL3A 3TKPA 4DSSB 5J3RA 3IHQA 3HJMA 2HE3A 1VF2A 3KH7A 3FEUA 1W89A 4EUYA 3F3RA 3GTUB 5HFGA 1G7OA 3ISOA 5G5EA 2J23A 4MDCA 1TKDB 5DJMA 2H6XA 2VL9A 3GNJA 3KM6A 4K7IA 2RIIA 2X8GA 3H79A 5GAPD 3U5RE 2MMNA 5HR1A 3HA9A 2OBIA 2VL3A 3G7YA 4XRAA 4HEA2 4HZ4A 2GVPA 4Z7XA 4ZB6A 1X9SB 4KA0A 3MNGA 4OMVA 1YZXA 3IRAA 2VOCA 1MD3A 5HFIA 5DJLA 3IA1A 3EINA 4V2MA 4MA9A 2GSTA 2KP1A 5ABRA 3O76A 4F0BA 2VLUA 2LSTA 5H5SA 2HI7A 3IOSA 2VD1A 3WYWA 3CYNA 3D4MA 1THXA 3TRQA 5IPGA 3EYTA 2HSYA 3SWLA 4OCEA 2C0FA 1XBSA 5F06A 1XW6A 4IS0A 2FY6A 4WKWA 4EC0A 3GRXA 1PGTA 5DAKA 4V2NA 4GLTA 3F6FA 2N5AA 1LJRA 3KP8A 5J9CA 2HT9A 1M0UA 4OO4A 3EMPA 3FZ4A 4D73B 2H1AA 2IMEA 3GL5A 3M9JA 2R4VA 2E0QA 2XC2A 1XFLA 1E6BA 2VCWA 1OE7A 3RHBA 3ZYWA 3F4SA 1RQMA 4WXTA 2YN1A 3F6DA 2R2JA 3GH9A 4EF0A 4LLRA 3M0FA 3WGXA 4EE0A 2GSRA 2YPMA 2PU9C 2HZFA 3JCML 2C3TA 4MH3A 3TRXA 2LUSA 1ZOFA 4OD7A 3ZLPA 3LGCA 3KTLA 5ECIB 3RDWA 1JZWA 2KOKA 2G2QA 5DBQA 4KNDA 1DE2A 2I9HA 2X99A 4TR1A 1B9YC 3QFAC 1TTZA 2K6VA 4MJCA 2L5OA 2R3XA 4GTUA 4I2TA 3LFLA 2VCTA 4POLA 1TK8B 2WJUA 2OJLA 1GUMA 1T8EB 5CAXA 4XTSA 1ERVA 1QQ2A 4EO3A 4HU9A 2F8FA 3UL3A 5DCHA 5HQPA 2GLRA 3A3TA 5B6MA 1Z9HA 3E3EA 4V1Ap 1GSUA 2ES7A 1U6TA 5FHIA 5D73A 2IFQA 3L4NA 2JADA 3U6VA 1Z7PA 2AYTA 1S3DA 4X0XA 20GSA 4HU7A 4KDXA 1TRWA 5G2ZA 2ON5A 2N5BA 1R7HA 1AQWA 1O6JA 4GSTA 3UBKA 4AF2A 1AAZA 1SL0B 5ELGA 3CSJA 4HOJA 1HYUA 5JWQB 1UVZA 1XZOA 4OFNA 2H66A 3WGEA 5CRHA 3H93A 4IKHA 3HHVA 1B4PA 1Z6NA 2TIRA 4XCSA 5ECKB 2E2MA 6GSTA 3P7XA 3IV4A 1V58A 2R5GA 5IMDA 4F82A 1OC9A 4BVXA 2VCQA 3CTFA 3HXSA 17GSA 3GH6A 2AAWA 4TR4A 5J41A 4QL9A 4IJ3A 4WBRD 2GZPA 5IOXA 1PKZA 2B5EA 3GA4A 2M46A 4YQMA 1SKRB 5DQYA 2XHFA 1FW1A 4IQ1A 1ERTA 1O73A 3D22A 1K0OA 4E8EA 2OBKA 5EPFA 3UOMA 1PA3A 4GQFA 5ENUA 1GLPA 3KXOA 1SK1A 3C8EA 4LL4B 3APSA 2XPEA 2DJ2A 4K1FA 1ILOA 4GXZA 4NHZA 2YJHA 2RLIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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5B6MA

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structure length

Chain Sequence

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Chord Diagram

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