5B6NA

Crystal structures of human peroxiredoxin 6 in sulfinic acid state
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
221
structure length
220
Chain Sequence
GLLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNCEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-6
publication title Crystal structures of human peroxiredoxin 6 in different oxidation states
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 220
sequence length 221
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 5b6nA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5b6nA01
4AJ8A 1TRUA 3QAGA 2GSTA 1BQ7A 1H75A 3UOMA 3PGTA 4IVFA 3LEFA 5JWQB 4RI6A 1EEJA 3KH9A 3C7MA 2GVPA 4IQAA 4FIWA 5C00A 2TRXA 4L0WA 1Z3EA 2HLSA 2YN1A 3JCML 2PMTA 2R4VA 1PN9A 4IGJA 1WP0A 3LYPA 2HE3A 2OBKA 4TR3A 5G2ZA 2YOIA 3NOFA 5DVBA 1Q98A 2C80A 1AW9A 1U3AA 2AUVA 4FYUA 4I2UA 5IPGA 1PSQA 2JL4A 3MWHA 2ON7A 5KEJA 2H8LA 3WGEA 4ZBBA 2OBIA 4V1Ag 3VK9A 5B7CA 3H79A 2IMKA 3HJOA 1TI3A 3E3EA 2O89A 3Q6OA 2PN8A 1XBSA 2GZPA 3P2AA 1NSWA 1BX9A 1Y25A 1CQGA 2WULA 1KTEA 1SD8A 1GSUA 1GTAA 2VLUA 4OFNA 4PXOA 4K6XA 4G9HA 4IW9A 3U6VA 1TK0B 1JZDA 2LV3A 3ZIVA 2N5BA 4K7OA 5AGYA 4YH2A 4BPYA 5J9CA 5DQYA 2FWGA 2XC2A 1AQXA 2C3NA 1M2DA 3C1RA 1AC1A 3WT2A 4K7NA 1K0DA 3WD6A 3ZZXA 1I9DA 4LA1A 1AQVA 4KDUA 1EOHA 5G1KA 3IR4A 3VI5A 3F63A 2OACA 5E59A 3US3A 1HD2A 5ABRA 5JWOB 5D9TA 3EE2A 4WEYA 2DIZA 3TKSC 2M80A 2HFDA 4NAXA 1M7TA 3I6AA 2H66A 3GX8A 4IKHA 4ZB6A 4FYCA 4KDYA 5HFGA 2JU5A 2VUPA 4FH8A 3LSZA 5C04A 1I5GA 1TK8B 5HR1A 2YZHA 13GSA 1QK8A 3GYKA 2FCHA 2B6MA 2CZ3A 1XWGA 3CBUA 3QAWA 18GSA 2VLTA 2K18A 1S3CA 3KMOA 4V2LA 2JSYA 4IJ3A 3GV1A 2LQOA 1F2EA 3UMAA 1A8LA 2VCWA 1N2AA 1B9YC 4Q5NA 1ERTA 1J0FA 1HYUA 2LTKA 4XTSA 3QDNA 4ZL7A 4MJBA 1T1VA 4EF0A 1MDIA 4EC0A 2ALBA 5E4WA 1VF4A 1YF0A 3EU3A 2X99A 3DYRA 1F6MC 4GRFA 4EUYA 2PPTA 2DBCA 3KP9A 2NPBA 5FWGA 2OE0A 5D9VA 5B8AA 1E6BA 5GSTA 3I9V2 4POMA 12GSA 3ERGA 5F8BA 1C72A 3EMPA 2L57A 1SL1B 3QR6A 1K3YA 2GT6A 2HT9A 3F6DA 4MF7A 1MTCA 4WETA 3HJMA 2N5AA 5GZZB 3DD3A 3GL3A 4ECBA 3BJ5A 1QFNA 5ELGA 2R5GA 3ZMKA 3TKSA 1OC8A 2V2GA 3TKSE 1FO5A 3HZ8A 1TW9A 2E0QA 4ECIA 1O73A 1SD9A 5A4VA 4RI7A 2FUG2 4KCAA 2V32A 9GSSA 1GUMA 3GN3A 4LL1B 4KA0A 2H70A 1JLWA 5J4UA 2R3XA 3HA9A 4F03A 1KBNA 2VCZA 3TJJA 4OCEA 2OE3A 1M2BA 1WMJA 2VCXA 3F3RA 3QD9A 3NIVA 2WFCA 2CX3A 1R4WA 1O7UA 2KHPA 5D73A 6GSSA 3L0HA 1ZYEA 5HQPA 1GWCA 3F0IA 2YWOA 3N5OA 1KEBA 2B1KA 2WRTA 3DGQA 1Q4JA 3KJYA 3MNGA 4E8EA 4PQIA 3HVVA 2C0FA 4HZ2A 3TJGA 5CRWA 4WF5A 1GP1A 2X8HA 5F05A 2HYXA 1ON4A 2C1YA 3L9VA 2YWIA 1GSQA 2YCDA 5D8IA 2YWMA 1VF2A 4LMVA 5IIZA 2ZCTA 4GWRA 4PNFA 2P0GA 4RUVA 1NHYA 1JHBA 3UVHA 3WT1A 2QGVA 5HR3A 3FEUA 1J9BA 3LG6A 1PKZA 1GUKA 2I3YA 2C0DA 5KN3A 5B6MA 3MAKA 1XWBA 3A2WA 1GTUA 2C8UA 2JZRA 3VWVA 4P3YB 3KCMA 3N9JA 1TI1A 1A0FA 2VCVA 3ED3A 4GTUA 2BJXA 4DVCA 5IMAA 3HHVA 2BMXA 1PD21 4D73A 4PUFC 1M9BA 1BAYA 2M46A 3GMFA 1EP7A 5IMDA 3WGXA 2QC7A 3FR3A 3APOA 1XXUA 4X1UA 1LBKA 3IDVA 2V41A 4K2DA 1ZZYA 4OO5A 4K7IA 2O8VB 4K0GA 1MEKA 5AISA 5ECPB 1UA5A 4MF6A 1OC3A 3BOAA 1A24A 2IPAA 1K0BA 2O85A 4OCFA 4F82A 1YEXA 4JRRA 1GSSA 1Z6NA 2VLVA 2H0IA 4IELA 3CTFA 2Z9SA 2ON5A 1JLVA 4LLRA 1X9SB 2H72A 1ERVA 1N8JA 3C1SA 1DE2A 4NWYA 2RUEA 7GSSA 1FHEA 1UVZA 1K0AA 2LS5A 3VWUA 6GSYA 2DJ1A 4MA9A 3RBTA 4POBA 1GSFA 1ZYQB 4TN8A 2XPDA 3VFIA 3ZFBA 2CT6A 2B7JA 4K8MA 2X64A 1G0TA 1ZGNA 1M0UA 4IBPA 4F2IA 4KGIA 4KUNA 2IFQA 4PNGA 4XRAA 4XIHA 3ZYWA 3UBKA 1ACVA 1EP8A 1ERUA 5ECRB 3RDWA 4KSOA 1PX6A 1TRWA 5J3RA 3PINA 4NV5A 4WR5A 4HS1A 5ENUA 4PGTA 1SJ6A 3QFBC 4XS4A 2MBSA 4D73B 1X5DA 1V57A 3QOUA 1T4YA 4QQ7A 5F06A 4HI7A 4AJ6A 16GSA 3KM6A 5CYYA 3O3TA 1QQ2A 5D96A 3C71A 3BCKA 5IMFA 3L4NA 2AV4A 3F8UA 1B4QA 4TKYA 1ILOA 3QCPA 2J9HA 4LL4B 4I8BA 2CQ9A 1V2AA 1SKRB 1AAZA 3A3TA 5ECIB 4L5OA 2DC5A 3KP8A 2P5QA 2RM5A 4OD7A 2CA8A 1AQWA 1A2MA 1S3AA 3GSTA 1X9WB 3FW2A 3C8EA 1EV9A 14GSA 4PQHA 5J9BA 4POKA 1X5CA 3FKFA 5ECHB 2OE1A 1E2YA 4MP4A 2MMOA 2L5LA 1TRSA 3I69A 3KIJA 2L5OA 8GSSA 4IHUA 1ML6A 2B3SA 3UIWA 1Z6MA 1YEPA 3IPZA 4XCSA 5A4UA 1GTBA 2CAIA 1R7HA 1VGLA 2HXKA 1M99A 4FYBA 1B4PA 2GTUA 2VD1A 3KTLA 3L9SA 2VCQA 2IFQB 5DAKB 5ECNB 4G2EA 1WWJA 1PL1A 2FA8A 1GNWA 1XVQA 4XHMA 3CSIA 1G6YA 4EL1A 5KN2A 1GUHA 4N0VA 5EPFA 5DCGA 3FZ9A 3OR5A 4IP1A 2NVLA 1QGVA 1GSEA 3EINA 4WBRD 3DWVA 4GQCA 2PERA 1SKWB 5CP1A 1BJXA 4DSSB 5GAPD 1TP9A 3ZRDA 4MZWA 2AAWA 4I2TA 2LNSA 2K8VA 3D4TA 2F9SA 3H1NA 5A5KA 3BD2A 4MLYA 2D2ZA 3KTBA 2LRNA 2N5FA 1R5AA 3H4KA 4XS1A 3SWLA 1GNEA 2R37A 2WCIA 2C3TA 1O8XA 2H75A 5AIVA 3TRPA 3EVIA 4BWQA 3V1WA 2ZUPA 2PUKC 4JEDA 2CV4A 3HXSA 3M8NA 4GSTA 4DSRA 3M9KA 3D5JA 1EV4A 3IK9A 3IHQA 3F9UA 3FR6A 1A8YA 2H6YA 1UN2A 5ECLB 1YKCA 4HJ2A 5B8BA 5IQYA 2R6KA 4O5RA 1HNBA 1V58A 2YWNA 1GSYA 1X5EA 1YKAA 3HVXA 5B6NA 2FY6A 2E7PA 3TDGA 5ECKB 3GSSA 3UARA 1XWCA 2HI7A 2LJKA 5D9XA 3BCIA 4YAVA 1V40A 2WZ9A 4O7HA 2EC4A 5ECQB 2WGRA 1U3IA 3KGKA 1WE0A 4OFMA 3UBLA 2IMDA 1EOGA 1FW1A 2CVDA 3U5RE 1F37A 1QXHA 3VI7A 2I1UA 1NHOA 1CQHA 3LXTA 4L8EA 1X9MB 3ZIJA 2VAFA 4ZBAA 4YQUA 4J2FA 2AJQB 4O32A 1FB6A 3TJFA 4ISDA 2FWEA 2DJKA 2IJYA 1MDJA 1ZCPA 2H30A 1YDKA 1EEMA 1RK4A 2KLXA 1PQNA 3FK8A 1USBA 5G1LA 3M0FA 4MJAA 1YJ6A 4ZB8A 5JCGA 4QL9A 3FZ5A 3A2XA 3VWXA 3DKSA 2JADA 3HY2A 5IO0A 3GTUA 1T4ZA 1FVKA 1XPVA 4N30A 2GS3A 2C4JA 5KN1A 1K0MA 4GCIA 1QUWA 2V6KA 5FT3A 2PVQA 5J5NA 2IWTA 1GH2A 4L0UA 4V1Ap 4TR4A 1F3AA 4CDOA 1A0RP 3ZMLA 3GKKA 2IMIA 3ZREA 4BWSA 4HOJA 1YQ1A 5G5FA 3TB2A 4PUAA 4JR4A 3G9BA 5GAND 2I9HA 3D0ZA 2O7KA 1W89A 4MK3A 4NMUA 4OFTA 4DSQA 4IJIA 3L9UA 3CXGA 1JZWA 2LEGA 1OE7A 2MYGA 1DUGA 4TW5A 3ZL5A 3UVTA 2LJAA 3H93A 4MJEA 1SENA 3RPPA 4K9ZA 3LQ7A 1JZOA 3GIXA 4F0CA 1K0OA 3EMXA 2DIYA 3ZITA 1XVWA 4AGSA 4N0ZA 1YY7A 1IYIA 1GLPA 1SU9A 4O92A 6GSXA 3TKPA 3BBYA 2FGXA 1XWKA 3CTGA 3IRAA 2H19A 4I97A 2CVKA 3DIEA 2K6VA 4Q5QA 2H1AA 4HU7A 11GSA 1SJZA 2DMLA 4I5QA 2EIRA 2PWJA 2RUFA 4NPBA 2GZYA 3GTUB 4HZ4A 4OMVA 2OADA 3VLNA 2GSQA 4MZBA 3E0UA 2RLIA 2F8AA 2P31A 1PX7A 4GSSA 1O8WA 5F07A 5LNKe 3CRTA 1GULA 4TXVA 3HD5A 1LU4A 3RPNA 3H8QA 1GL8A 4MH2A 3ZVJA 3VPQA 1OC9A 4BA7A 1FOVA 5IMCA 3PR8A 2IN3A 2L6DA 1RQMA 4NHWA 2V1MA 2OJLA 2A2RA 3W6GA 3A5WA 4KNDA 4POLA 4J56E 3TRQA 4N11A 4WBJA 3K8NA 1TDIA 4PX1A 3IC4A 3EU4A 1XW9A 3FZ4A 2REMA 4LMWA 3CYNA 2JZTA 2A4VA 4X43A 4H86A 3DMLA 2H1DA 3D6IA 2JZSA 3D4MA 3F6FA 4GF0A 2L59A 5KN0A 2ZNMA 5CO3A 2CZ2A 1LJRA 5JWRB 2F8FA 5HR2A 5IOXA 2K8SA 3VWWA 4EXJA 3J7Yb 3G7JA 2LNTA 3Q18A 1U87A 1GRXA 4G19A 2X8CA 4OO4A 3TKRA 2L6CA 3IBHA 4EDYA 1SK2A 2RIIA 1O81A 3RHCA 2YPMA 3QMXA 1PKWA 2XPEA 4JU5A 2H74A 1MD3A 1VF3A 5F0GA 2FLSA 2WS2A 5G5EA 2XBIA 1OE8A 2H71A 2O87A 4ZBDA 1JZRA 5HFKA 3TJBA 1TU8A 2DLXA 2WJUA 3IAS2 1ST9A 4EDZA 2H6ZA 4IQ1A 4ACSA 1K3OA 1OC9B 3CSJA 1QMVA 4QL7A 2YV7A 1M2AA 2YP6A 2VM2A 1OKTA 2WDUA 5CRGA 1HNCA 1EZKA 3LJRA 1X0RA 3IV4A 1O85A 1ZOFA 3ZTLA 4GQFA 2R2JA 1URMA 2YZUA 4V2MA 2I81A 2LRTA 2H76A 3HCZA 4ML1A 1B9XC 1DBYA 5GSSA 4IN0A 2ES7A 4JBBA 4KE3A 3MDKA 1XW6A 1GTIA 1WIKA 1OYJA 3C73A 2IMEA 2I4AA 3P8WA 2GZZA 2EIQA 4MJCA 3IE3A 2LSTA 4MF5A 4KDXA 5D93A 3IK7A 2B7KA 2MZCA 5L71A 4TOPA 3FR9A 1WRYA 1ZMAA 4HUAA 3A2VA 4MABA 2VD0A 5DBQA 4WXTA 3MSZA 5H5SA 1TXXA 20GSA 4ILFA 4NHZA 5DALA 3UEMA 2RM6A 3HDCA 2WB9A 2C0GA 4JE1A 2GSSA 4ZB9A 4EVMA 1FB0A 3VURA 2G0FA 4FO5A 1GLQA 3GX0A 1TJDA 2YNXA 2VO4A 6GSTA 3UJ1A 4XS4B 2FHEA 1R5PA 1SL0B 2LJRA 2QSIA 2AB6A 2FWHA 2C3QA 2DSAA 3P7XA 3TKQA 2DMMA 2JSZA 3ERWA 4XS6A 4BL7A 5EY6A 3GKXA 1FG4A 2GQLA 1THXA 4N10A 1SK1A 3HJPA 1NM3A 3IAM2 1Z9HA 2VL2C 1XOBA 3LFLA 1WJKA 1W4VA 1Z5YE 3GH9A 2B1LA 3RHBA 2HRNA 2B5EA 2PVOC 3GRXA 3QFAC 3TJKA 3ERFA 3W8SA 2VL9A 4IP6A 2GQMA 1XZOA 3Q74A 5CAXA 3GNJA 3UAPA 2AYTA 4DEJA 2JACA 1BEDA 1A2LA 2DJJA 3GUSA 2LRCA 2B5YA 4BVYA 3APSA 1HQOA 1UC7A 1R26A 4WR4A 1J08A 2HZEA 3F4SA 5DALB 5H5QA 3ISOA 2V6OA 3D22A 2GT5A 3FY7A 5EVOA 4ZL8A 2H01A 1MD4A 2NBSA 1B48A 3TOTA 2CAQA 3O6TA 3QAVA 2C0EA 1V9WA 3LWAA 4HDEA 3FHKA 2VCTA 3G7YA 1PGTA 2A2SA 5IM9A 2F51A 3GKMA 4KH7A 1PL2A 3M1GA 5DJMA 2HSYA 1XWAA 1V98A 2NDOA 2LKUA 4PQ1A 4MCUA 3GURA 4I6XA 3FRCA 2PGTA 4ZIJA 2XBQA 1ZL9A 3UL3A 5LCZA 1Z7RA 5ID2A 4G10A 2L4QA 4GLTA 4NXIA 1TU7A 1YZXA 5IPHA 1OAZA 3DXBA 4CHSA 2VL2A 1EGOA 1IYHA 3IOSA 1ABAA 3ZFLA 5H5RA 5IMZA 1WPIA 5COHA 3F4TA 3GFKA 4MMMA 1TTZA 4GSNA 1TRVA 5ELAA 5IMVA 3CSHA 2YV9A 5JCWA 1U88A 2HSHA 3DVWA 2KP2A 2G2QA 1O6JA 2EIOA 5CREA 2OKAA 5J41A 5AIXA 1XOAA 3KD0A 4AF2A 3GL5A 2HZEB 4ECCA 1PA3A 4WF4A 4ECJA 5IOWA 3HYPA 2H0HA 3W8JA 3HKRA 4ZL9A 5DCHA 3P90A 2KOKA 3M3MA 4AJ7A 3G7IA 2VM1A 4IS0A 3J7Yk 1XFLA 3HVSA 2CVBA 5A4WA 1OVNA 2OA7A 2CX4A 5CRDA 2BTOT 3SBCA 2X8GA 2P5RA 2VIMA 5ECSA 4JR6A 2DJ3A 4V2NA 19GSA 2NTOA 4ZXGA 4TR0A 2GSRA 5ID2B 1S3DA 3E9JB 4K1FA 5IO2A 3IXRA 1TOFA 1A23A 4TRXA 2HRFA 2H0GA 1BG5A 5CNWA 1SYRA 4MPGA 3I43A 1MDKA 1SL2B 3F3QA 1G7OA 5G30A 1TKDB 1T8EB 1VF1A 3AY8A 2PU9C 4XRDA 4HQZA 1K0CA 2VOCA 3EYTA 3EC3A 5DQSA 5LD0A 1DSBA 1FAAA 2GGTA 4JZQA 2FWFA 2HZFA 1NW2A 5ECOB 2FD3A 2TIRA 3CRUA 1XIYA 3KXOA 3L78A 3KH7A 4CW9A 2GQKA 2J23A 2TRCP 4KSMA 1SYXA 5AN1A 4PURA 1RW1A 4TR1A 1SKSB 2MMNA 2GDRA 3LXZA 1AXDA 2DJ0A 2H6XA 3WYWA 1PRXA 4EKZA 2DJ2A 4HJMA 3DEXA 1DE1A 3EURA 2YANA 5G31A 2QKEA 1U6TA 3DVXA 3QPMA 3APQA 1Z7PA 4MPFA 1H4OA 3S9FA 4Z7XA 2GLRA 5INYA 3TOUA 3IA1A 2H1GA 6GSVA 4F9ZA 1F3BA 3KEBA 3CMIA 1YF1A 3FZAA 22GSA 5JCUA 2KP1A 3TUEA 5HR0A 4HU9A 1G6WA 3PH9A 3FYGA 2AHEA 1EWXA 3LGCA 3LYKA 4YQVA 2E2MA 3NZNA 3TGZA 4ZILA 2H1BA 2K9FA 5D9WA 5FHIA 3O76A 2IL3A 1HNAA 4YQMA 4BVXA 6GSUA 4K0NA 2LUSA 2MMAA 4TXOA 2FNOA 1T3BA 4EE0A 1K0NA 3GA4A 4RQRA 3VPTA 5EL8A 4MH3A 3F4RA 2MMZA 1M9AA 4J57E 17GSA 2HNLA 1FVJA 4MDCA 2XHFA 1JFUA 4ML6A 4TVEA 2LQQA 1VRSD 3GH6A 4GXZA 4TR1B 1A2JA 1EGRA 1T00A 3GHAA 4Q5RA 4ID0A 1AIUA 3EWLA 4NV2A 1XCCA 4MZCA 5DJLA 2B5XA 4KX4A 4WKWA 5HFIA 4X0XA 3Q19A 3LORA 3ME7A 3R2QA 1TK5B 1ERWA 4F0BA 5DAKA 4E8HA 2H73A 1XW5A 1T7PB 4KAEA 1THOA 2FA4A 4EO3A 1OKDA 1B8XA 3GKNA 4KCEA 1G7EA 1SK0A 4OWYA 4ULXA 3ZVJD 3WGDA 4YAPA 2L4CA 4DSSA 4RQXA 2MBTA 5DDLA 3RAZA 3TCOA 1Y6EA 5CRHA 2M72A 1KNGA 4Q5FA 1WOUA 3D21A 2VL3A 3HZ4A 4KW6A 2IIYA 4L5LA 2IMFA 3ZLPA 1F9MA 10GSA 3M9JA 2YJ7A 2YJHA 3KMNA 1K3LA 4TXOB 2E2GA 1AUCA 4KB3A 1SJIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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