5EKJA

Human carbonic anhydrase ii complexed with a two-faced guest
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Programming A Molecular Relay for Ultrasensitive Biodetection through (129) Xe NMR.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5ekjA00
3K2FA 4QJWA 3M04A 3W6HA 1CNWA 4HF3A 2W2JA 4Q8YA 1I9PA 1KWQA 3Q31A 4FPTA 1IF5A 3IGPA 3KWAA 2NNVA 1BN4A 4RN4A 4YVYA 1CVCA 3ZP9A 5FL5A 3IBUA 3P4VA 1G4OA 3UYQA 4XIWA 3V3JA 1Z97A 3MNUA 5JG3B 3OYSA 5LMDA 4Z1NA 7CA2A 3EFIA 2NWOA 4C3TA 5DSKA 1IF4A 1CVBA 1LGDA 2NXRA 3MNIA 4KUVA 5JEPB 1CALA 2Q1QA 3MMFA 1HECA 4Y0JA 4QK2A 1XQ0A 3HLJA 4Q81A 4DZ9A 4FRCA 3F7BA 4BF6A 1JCZA 1YDDA 5EH5A 2CBCA 3S73B 3CAJA 4Q49A 3T5ZA 2FOQA 3HKTA 4RUXA 5G03A 1BNQA 1CVAA 4CNXA 3U7CA 3U45X 1YDCA 4QEFA 5E2SA 1G54A 1TEQX 4E3FA 3V2JA 3P44A 3KS3A 4KAPA 2NNGA 4QIZA 1F2WA 2NNOA 5E5UA 1UGDA 3KKXA 5JEHB 2HL4A 1BZMA 1TB0X 4DZ7A 4K0TA 3V3HB 1CNHA 3M1WA 3MHLA 3N3JA 4KNJA 3BL1A 4ITOA 5CA2A 1RAZA 1FQLA 2VVAX 4ZAOA 5A6HA 4WUQA 1TTMA 3MNHA 3MWOA 3CZVA 1I9LA 5FDCA 3S77B 4CQ0A 4Q83A 3DD8A 4MLTA 4Q87A 5SZ0A 3P5LA 2WEJA 3F4XA 4YYTA 4MDLA 4KP5A 2FNNA 1ZFKA 2WEOA 3F7UA 4FU5A 4LP6A 4E3DA 5J8ZA 4ZWYA 1CNXA 2X7SA 5JG5B 1CNJA 1KEQA 4HBAA 3RZ1B 5FNGA 3ML2A 2QOAA 6CA2A 4YGKA 5JESB 3MHIA 4ZWXA 3OKUA 1OKNA 3M96A 4BF1A 3M5SA 5G0BA 1H9NA 1CNCA 2OSMA 3PYKA 4RH2A 3D8WA 5FNHA 2GD8A 2FNMA 4QJOA 4Q9YA 5L6KA 1HEDA 3DD0A 1CILA 4HEZA 3T84A 5E28A 2OSFA 3JXFA 4ILXA 4YGFA 5AMLA 5BRVA 4YXUA 1RAYA 2NXSA 5CACA 3U3AX 4RIUA 5CLUA 1ZNCA 3LXEA 1G0EA 1DCBA 1DMYA 5E2NA 2NN1A 5DOGA 4HEWA 3DCWA 2H4NA 3P55A 5FDIA 4WW8A 1XPZA 4RIVA 3DCCA 4KNNA 1LUGA 3RYVB 4YGNA 1I9OA 3RYJB 1I9MA 1CVEA 1CA2A 4PXXA 3N2PA 2HKKA 5SZ2A 1CCTA 1FSNA 4WL4A 1CNIA 2O4ZA 1FQNA 3V7XA 5G0CA 5EKHA 1BNNA 1ZSBA 4L5VA 4RFDA 5DSPA 1I9NA 3NB5A 5SZ6A 5BYIA 1RJ5A 3D92A 1YO0A 1ZSCA 2H15A 5SZ7A 2VVBX 3GZ0A 3M3XA 2FOUA 8CA2A 3V2MA 3T85A 3HKQA 4Q8ZA 3MNKA 1V9IC 4K0ZA 5FNIA 3M2YA 4N0XB 3RYYA 4XFWA 4E9OX 1UGAA 5SZ4A 3M40A 1MUAA 2CA2A 4E5QA 3P58A 1CAMA 5FLTA 2FOVA 1H9QA 3PO6A 3KONA 5DVXA 5EHEA 1KWRA 2FMZA 2HFWA 4WUPA 1AVNA 2FOYA 3MNJA 3RZ8A 1CZMA 3IAIA 1JV0A 5A25A 3M67A 4K0SA 4IDRX 3D9ZA 2EZ7A 5DOHA 4L5WA 5FL6A 5JDVB 2CBBA 4K1QA 3HKUA 3TVNX 5DSQA 5EHVA 3RG4A 4XZ5A 1ZH9A 5FL4A 2FMGA 4WW6A 3DVBA 3DAZA 3CA2A 4FIKA 1TBTX 1HCBA 3OKVA 4QK1A 2HD6A 4UOVA 1BNUA 2NMXA 5FNKA 3V3GB 1CVHA 3QYKA 3N4BA 4COQA 3MHOA 1RZDA 1CAIA 4Z0QA 3RGEA 3S9TA 2POWA 2X7UA 1H4NA 5EH8A 4QJMA 4FVNA 4CNVA 4PZHA 5EIJA 1CIMA 1CVFA 5EKMA 4ETQC 3S76A 1BNMA 4R5AA 4FVOA 3S71B 1CAKA 3M1KA 1CCUA 3KLDB 1YDAA 4L5UA 4WR7A 5SZ1A 4QSIA 1CNGA 4QY3A 1TG9A 4CNWA 4Q8XA 1RJ6A 4R5BA 3C7PA 1FQMA 4Q06A 1BNVA 1HVAA 5G01A 3IBNA 1I8ZA 2CBAA 1BNTA 1Z93A 1V9EA 4KUWA 3ZNCA 1FLJA 2AX2A 4JSZA 3RYZA 1CINA 5EOIA 3DV7A 4MLXA 1G46A 3M2XA 1CANA 1UGBA 4Q90A 2POVA 3T83A 4Q0LA 1G3ZA 5DSLA 3B1BA 1AM6A 1A42A 1RZBA 4QSAA 1TEUX 3BETA 3MNAA 4JS6A 1I90A 1ZE8A 12CAA 3EFTA 3ML5A 3M2NA 3PJJA 1G52A 4KP8A 9CA2A 3RLDA 5E2RA 4QSJA 2AW1A 5FLQA 3OY0A 4QIYA 4Z1EA 1ZGEA 4KNMA 1J9WA 5EHWA 5DSNA 3D93A 1FR4A 1RZCA 4Q99A 1CCSA 4YXOA 4YHAA 4RFCA 1BICA 1UGFA 3S8XA 4QSBA 5AMGA 2NWPA 4JSWA 4M2VA 1CNYA 1Z9YA 3UYNA 1BCDA 1HEBA 2QO8A 2Q38A 3NJ9A 3RZ7A 4G7AA 1G45A 1IF8A 1ZSAA 4M2UA 4QJPA 1UGCA 3RZ5A 4E4AA 5JQ0A 1ZFQA 3V5GA 2QP6A 5EKJA 4K13A 1CA3A 5SZ5A 3P3HA 1CAJA 1LG5A 1G4JA 1CRMA 3IEOA 3CYUA 4HT2A 5FNLA 3W6IA 1HEAA 3MHCA 3IBIA 3TVOX 5BRUA 2ZNCA 3HS4A 5DRSA 4LU3A 1I9QA 4YXIA 5FNMA 1OKLA 4YGJA 1TG3A 3M98A 3DC3A 2FOSA 3HFPA 5JGTB 3DA2A 3MHMA 5JQTA 2CBEA 4Z1JA 4PYXA 4JSSA 1UGEA 3FFPX 3DCSA 4Q7WA 1I91A 3KNEA 2X7TA 1FQRA 1BN3A 5FLSA 2ILIA 3JXHC 2ABEA 1BNWA 1YDBA 2CBDA 4FL7A 2HOCA 1EOUA 5DSJA 1DMXA 3DC9A 1LZVA 3NI5A 4CACA 1THKA 4E3GA 5IPZA 5JEGB 5C8IA 4YWPA 5AMDA 4RUZA 2NN7A 1G1DA 1HUHA 4IWZA 5SZ3A 1FSQA 4RUYA 3S78B 1YO1A 1G6VA 5FLPA 4Q6DA 4KNIA 4QTLA 1ZGFA 3T82A 2CABA 5DSOA 4JSAA 3FE4A 5HPJA 1G0FA 5BRWA 5EZTX 1YO2A 2NXTA 3OIMA 5FLOA 4ZWZA 1URTA 4PYYA 3M2ZA 2IT4A 3MZCA 1CAHA 2WD3A 4G0CA 3IBLA 2NNSA 5EH7A 3SBHA 2POUA 1CAYA 3M5TA 3DBUA 5FNJA 3JXGA 1FR7A 1FSRA 1BV3A 3SAXA 2WD2A 3DVDA 3M1JA 3RJ7A 4KUYA 1CAOA 4Q7SA 5DSIA 4TWMA 4GL1X 1TH9A 4Q07A 3V3FA 4Q6EA 3VBDA 1CAZA 4QJXA 3S97A 4ZWIA 5JGSB 3S75B 3HKNA 4Q7VA 3P3JA 3B4FA 4R59A 2WEHA 5E5RA 4CNRA 4PQ7A 3OILA 3OYQA 4E3HA 1AZMA 2FNKA 3M14A 3R17B 3BL0A 4Q08A 1IF6A 3U47A 1CRAA 4Q7PA 3R16A 2F14A 3KOIA 5BNLA 3FW3A 4MTYA 4XIXA 3M1QA 1BN1A 3F8EA 3P5AA 4CA2A 1HCAA 1DCAA 5DSMA 1TE3X 3T5UA 3MDZA 4Z1KA 2HNCA 3SAPA 1IF7A 1OQ5A 2Q1BA 4HT0A 4TWLA 4YGLA 4E49A 5E2KA 4Q09A 4MDGA 2EU2A 4ZX0A 1MOOA 1RZAA 4BCWA 1LG6A 3RG3A 4XE1A 3KIGA 1OKMA 2GEHA 4N16A 2NWZA 3OIKA 2WEGA 2EU3A 3K7KA 5FLRA 1CNKA 3S74B 4LHIA 1T9NA 3KOKA 3D0NA 1XEVA 2FW4A 4ITPA 3RZ0B 1IF9A 1KOQA 5L3OA 4ZX1A 3RYXB 3S72B 4KV0A 1UGGA 1KOPA 4HU1A 5DSRA 4X5SA 3V3IB 4M2WA 5E2MA 4QK3A 4Q78A 1HUGA 3M5EA 4M2RA 1Y7WA 3MYQA 1RZEA 4MDMA 3TMJA 1XEGA 1G53A 1JD0A 1G48A 4QJ0A 4HEYA 3SBIA 1CNBA 3K34A 5CJFA 3L14A 3N0NA 2NWYA 3DVCA 4YX4A 4MO8A 1CVDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3K2F A;  4QJW A;  3M04 A;  3W6H A;  1CNW A;  4HF3 A;  2W2J A;  4Q8Y A;  1I9P A;  1KWQ A;  3Q31 A;  4FPT A;  1IF5 A;  3IGP A;  3KWA A;  2NNV A;  1BN4 A;  4RN4 A;  4YVY A;  1CVC A;  3ZP9 A;  5FL5 A;  3IBU A;  3P4V A;  1G4O A;  3UYQ A;  4XIW A;  3V3J A;  1Z97 A;  3MNU A;  5JG3 B;  3OYS A;  5LMD A;  4Z1N A;  7CA2 A;  3EFI A;  2NWO A;  4C3T A;  5DSK A;  1IF4 A;  1CVB A;  1LGD A;  2NXR A;  3MNI A;  4KUV A;  5JEP B;  1CAL A;  2Q1Q A;  3MMF A;  1HEC A;  4Y0J A;  4QK2 A;  1XQ0 A;  3HLJ A;  4Q81 A;  4DZ9 A;  4FRC A;  3F7B A;  4BF6 A;  1JCZ A;  1YDD A;  5EH5 A;  2CBC A;  3S73 B;  3CAJ A;  4Q49 A;  3T5Z A;  2FOQ A;  3HKT A;  4RUX A;  5G03 A;  1BNQ A;  1CVA A;  4CNX A;  3U7C A;  3U45 X;  1YDC A;  4QEF A;  5E2S A;  1G54 A;  1TEQ X;  4E3F A;  3V2J A;  3P44 A;  3KS3 A;  4KAP A;  2NNG A;  4QIZ A;  1F2W A;  2NNO A;  5E5U A;  1UGD A;  3KKX A;  5JEH B;  2HL4 A;  1BZM A;  1TB0 X;  4DZ7 A;  4K0T A;  3V3H B;  1CNH A;  3M1W A;  3MHL A;  3N3J A;  4KNJ A;  3BL1 A;  4ITO A;  5CA2 A;  1RAZ A;  1FQL A;  2VVA X;  4ZAO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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