5EX5A

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 7-deaza-adp and inorganic phosphate
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 123
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5ex5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ex5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ex5A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5ex5A04
4FWQA 3SMSA 3U9DA 3ZEUB 1WOQA 1Z6RA 4IJAA 4K43A 1NGJA 5BN8A 4AM7A 1XQSC 1NGHA 2QWMA 3FLCO 3UKRB 2QWPA 3P4IA 2ZGZA 1QQNA 2A42A 1Z05A 5F0XA 4MO5A 3VESA 5TKYA 4BGBA 4YDUC 3D7EO 4XH5A 2E88A 2E2PA 1T6CA 4FWPA 4WQ5A 2DPNA 1HJOA 4XEIA 1SAZA 2P9LB 3VF6A 3H46O 3EKSA 3UE5A 4O5FA 2Q1NA 3VERA 1ATRA 3FZFA 4FOIA 2VYPA 3AY9A 4QS7A 5AQMA 3EN9A 3A8YA 2YJFA 3UB5A 2FLOA 3VEVA 2GUPA 2IVNA 1DEJA 2QXLA 1Q18A 5AQXA 3VOVA 2QWQA 4CZLA 1V4SA 4BC4A 4EFHA 3HI0A 2ASPA 4BRLA 1NWKA 1KAYA 2QWOA 1ZBSA 4HWIA 5EOYA 4DB3A 4YDUA 5AZJA 4PKHA 5AQHA 2OANA 2A3ZA 2E2QA 1GLDG 5I9EB 1QQMA 1NGFA 2FF3B 3EL2A 2V51B 3U4LA 1ATSA 4IWVA 4WYBA 5AQFA 3QBWA 3ZX0A 4EHTA 5AQJA 2Q97A 2PBDA 3LM2A 2HF3A 3LDNA 3LDLA 2HMPA 4BR7A 1JCEA 3SLCA 1MWKA 5AQUA 3O6WA 3EKUA 4XH1A 1DGKN 3HBTA 4M7YA 3MMVA 3CETA 1BO5O 3MN9A 3HZ6A 1YUWA 3CJCA 5EVZA 1NGCA 4BR2A 4FPBA 3U8XA 3ZX3A 4DCHA 4FL9A 2CGJA 4CD3A 1BUPA 4E1JA 1GLJO 2P9UA 3C0BA 2A41A 4JNEA 2CH6A 4IZ9A 3UKUB 2AP1A 3O80A 3GE1A 2BUPA 2F9WA 5LJWA 4PL8A 3KVGA 1Y64A 5EY4A 3ULEA 3TPQA 3O1WA 4M63C 4BRDA 2ASMA 2P9NA 3WXJA 1NGGA 1BA1A 1QHAA 4CZGA 1X3NA 4H5TA 2D4WA 3ULEB 4QS9A 1E4FT 1NM1A 5AQOA 5E84A 2GEMA 2IVOA 3LDQA 4B1WB 5AQSA 2E1YA 5AQQA 4JD2A 3SK3A 5KQ8A 5ELZA 3L6QA 5FPDA 3CJ1A 2IIRA 2YI1A 3DXKB 5EX5A 2GWKA 4AM6A 4FSVA 3R8EA 2WUSA 4JD2B 4WQ5C 4B1VA 3FGUA 1GLFO 1YXQA 2ZWHA 1XUPO 4JAXA 1YAGA 2GTDA 3LL3A 1V4TA 4CZMA 4FO0A 2BTFA 3BF3A 3D2FA 4CBXA 3AAQA 1MA9B 3W3DA 4WQ4A 3WT0A 4H5NA 5AQPA 4K41A 1K8KA 1S22A 3GOIA 2KHOA 3IFRA 4F9OA 3VPZA 4GY2B 4BQLA 5JMVA 3QDKA 1KXPA 2ASOA 4ISFA 4MO4A 2E2NA 4FWSA 4H5VA 4EIAA 3VEXA 1K8KB 3HM8A 3ZETA 5AQWA 1JCGA 5BPLA 5AQLA 3O1BA 4HTLA 2CGLA 1HKGA 3S41A 2P9PA 4LC9B 5BRDA 5F2RA 3DWLA 4FWNA 4ISGA 4GNIA 3HTVA 2I7PA 4FPAA 3VENA 4CZIA 2EWSA 2NZTA 4BR5A 4O8KA 5AZIA 5BPNA 3O8MA 2A6AA 4B1UB 1DKGD 3CERA 3I33A 3FZMA 5AZIB 3MK6A 1NGAA 5E26A 2PAVA 2Q31A 4BG8A 2CH5A 2HOEA 4FWOA 1C0FA 4A62A 5CE3A 3A5NC 1BA0A 3DJCA 1NLVA 4A2AA 5KPZA 4ISEA 3GL1A 2E1ZA 1NBWA 2V7ZA 4BRCA 1HKCA 1J6ZA 3EO3A 5AZJB 4H0VB 2UYTA 3VEYA 1ZXOA 4BRAA 3VF2A 3WUHA 3CHWA 2A40A 3CJ7A 4JN4A 3VETA 4CI6A 3J8AA 4DHYA 4BRGA 3VEWA 2FSJA 3I8BA 3WQTA 1E4GT 4CZFA 3M1FA 2J4RA 4CZKA 3R9PA 4PL7A 2E8AA 1TYQA 1U2VA 3ATUA 1JCFA 3BP8A 3CQYA 1HPMA 4A2BA 3QMLA 3IMXA 2E2OA 5BREA 2P9IA 4IJNA 1BWFO 4PKGA 3H1QA 3QFPA 2D0PA 4FWMA 5BRHA 2FF6A 3WEEA 3VGMA 1BU6O 3VGLA 5AQTA 3HSCA 1HUXA 2P9IB 5BRFA 5BR9A 4QS8A 4BREA 2P9SA 3MDQA 2P9UB 4B9QA 4NB4A 2ZF5O 3FR0A 3O5BA 2QW9A 2F9TA 1IG8A 1NGEA 4CBUA 3RSEA 4BQZA 4BRNA 1OKJA 2NRHA 2V7YA 2W41A 1NGDA 1X3MA 3ATVA 3R6MA 4WQ4C 3D2EA 4JHDA 4BR9A 2P9NB 3TU5A 3RSEB 3MN7A 4BG9A 3IUCA 3LDOA 4Z94A 2P9KA 4MLHA 2YHWA 3QBXA 5BPMA 2YJEA 2NLXA 5FPNA 5ADXA 2E20A 1LOTB 2D0OA 2FSKA 2YHYA 1KAXA 1EQYA 2H3GX 2QWRA 1T6DA 2QWLA 4IO8A 1BOTO 4BR4A 2FXUA 5FPEA 3QB0A 3WQUA 2QWNA 4RWTA 3CJBA 4L3QA 1S3XA 2Q0UA 3QICA 1TUUA 3ZEUA 3D2FB 4BRPA 3FFKB 5LY3A 3O08A 4BR0A 4BRMA 5KPRA 4FWRA 4FWLA 3UKRA 1RFQA 1G99A 3M6GA 5ADXH 4H03B 3ID8A 3FZHA 5JLHA 4H0OA 2D1KA 3ENOA 3FE1A 3ZETB 2IVPA 1GLAG 4BRKA 1R59O 5AQIA 2P9PB 3C7NA 3WXIA 1NMDA 1GLLO 5AFUH 4BROA 2P9LA 3KHYA 2AA4A 3AARA 4FOEA 1QQOA 4CJ7A 3L4IA 5AQRA 3O4WA 3C7NB 5AQYA 3H6EA 5AR0A 1QZ5A 3H1VX 4H0PA 1C0GA 3GDQA 5BN9A 3AAPA 4C23A 1GLBG 5FPMA 4NO7A 4M7XA 2I7NA 4B1XB 2CGKA 4BRIA 1KAZA 1IJJA 4BVOA 4H0YB 4MLEA 2Q0RA 3A5OC 4H0TB 2Q36A 2FSNA 3CJ9A 1ZC6A 2GELA 2VCPA 3JXUA 3ENHA 3L0QA 1SQKA 5AQZA 4I6MA 4XH4A 3FZKA 3F9MA 2YCHA 4B1YB 2VWBA 1LCUA 1WUAA 5AQKA 3H3OB 4PKIA 3ZX2A 4I6MB 1HX1A 4CZEA 1BG3A 1SZ2A 4IXCA 3WXLA 3FZLA 2QM1A 3QFUA 4Y0WA 5LJVA 3B8AX 4EHUA 1CZAN 2HF4A 2V52B 3SJHA 1H1VA 1HKBA 1TYQB 1U2VB 4B1ZA 1D4XA 4H5RA 3VEZA 5AQNA 1U6ZA 3IDHA 4FWKA 4EAHD 2YHXA 3WXKA 3H3NO 1RGIA 3GBTA 1XC3A 3DXMA 4CZJA 3GG4A 5JICA 3VEOA 4BC3A 3W0LA 1T44A 3WEEB 3EZWA 2Q2RA 5F1XA 1YVNA 3DXMB 3KZBA 4DQ8A 1QZ6A 4K42A 3A5LC 3SMPA 4CZHA 2P9SB 3UKUA 1TUYA 4K25A 3A0IX 3CQXA 1BDGA 3JS6A 1MDUB 1HLUA 4BRQA 4BGAA 3CJAA 4CBWA 1GLEG 3LM9A 3M3ZA 1P8ZA 3G25A 3D2EB 5KPTA 4JHDB 4A61A 3MN6A 4RTFD 1X9JA 3OHRA 3CI5A 4H0XB 4H5WA 1NGBA 3CIPA 5B8HA 5KQDA 5AQVA 3BEXA 2ITMA 1RDWX 1NGIA 1ESVA 3VF4A 3MN5A 2P9KB 4KBOA 5AQGA 3A5MC 3DXKA 1GLCG 4RCHA 2W40A 4BC2A 3U9ZA 3BF1A 2A5XA 5JLFA 4J8FA 3VGKA 5AFUA 3DAWA 4BC5A 2ZGYA 3H45C 1ATNA 3BUZB 4BRHA 4BRFA 1MWMA 5EXWA 3MCPA 4CD1A 3LDPA 2GWJA 4BVPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZEUB 4WFAL 1P90A 1E3MA 1IKYA 3ZSZA 1Z6RA 5BN8A 3CFPA 3IAYA 3TANA 5GAEP 4LFAK 1XQSC 1VK0A 2IDOA 1NGHA 3UKRB 4DV3K 2O8DB 2MN5A 2NRWA 3P4IA 4DFPA 3LPUA 4YOYA 3LAMA 3TSUA 1Z05A 4BEBA 4KI4A 2HBKA 4DS4A 5TKYA 3ITHA 3HK2A 3VA0A 4FJLA 4XH5A 1IO2A 1T6CA 4FWPA 4CEBA 3N4PA 1JZAA 1C55A 1Z25A 1HJOA 4O4GA 1T7BA 1I3AA 3OTOK 3VERA 1L3VA 1XNQK 4FOIA 3AY9A 4AHTA 1UAXA 1WSEA 3EN9A 2YJFA 2B68A 3T3FA 2OYQA 4FZZA 2IVNA 1DEJA 1UOCA 2QWQA 4CZLA 1V4SA 4BC4A 2IS3A 3AGKA 1HQUA 2N2RA 4BRLA 4HWIA 4PKHA 3MX2A 1W9HA 5CHIA 1GLDG 4CJ5A 3EYZA 1ICAA 3EL2A 3CG7A 3ULDA 2NRTA 4DTJA 5CY0A 4BACA 1EP4A 5AQJA 5C15A 2PBDA 3LM2A 3TTFA 4DQQA 4IDHA 4BR7A 3I56N 4LF5K 2LT8A 3OYLA 3OYDA 3EKUA 3QEIA 5HRSA 3VQ6A 3HBTA 3MMVA 3CETA 1BO5O 3RMCA 4IEIA 3K5LA 4FJHA 4OGCA 4M41A 2GBZA 3OBWA 4I2QA 3SCXA 4BWJA 3AO1A 4FPBA 3ZX3A 4CHZA 1OZZA 3OYFA 3Q7CA 2EHGA 3P31A 1T03A 1YHQN 1Q8IA 5M1NA 4R5PA 2CH6A 4MDBA 2XY6A 3RRGA 1NG9A 4FJ7A 2QKKA 1ZBFA 3OYHA 2VQFK 4CGHA 2ZQBA 3ULEA 4DR3K 4M63C 5KTQA 4ELVA 3VA3A 3EE9A 1QHAA 1RT3A 4CZGA 4DMNA 4CF0A 1S1UA 2WBNA 4QS9A 1E4FT 1BK8A 4PQUA 2IVOA 1NU0A 3ZT1A 5J1EA 2GL1A 4CHYA 5AQQA 2YKMA 3AVAA 4JD2A 4E1NA 5KQ8A 3MCAB 1VQMN 4IOAL 3THVA 3UIQA 3CMAN 2RN2A 2D5RA 3HYFA 4OLBA 1GLFO 1YXQA 3KJVA 4QCLA 1VRTA 4KI6A 4CZMA 2KQ2A 2BANA 4FO0A 4CF8A 3BF3A 4KH6A 4M3XA 2X6NA 2MZ0A 5AQPA 1WNSA 1K8KA 1S22A 1NRBA 2KHOA 4F9OA 3CYGA 4CJFA 3B6OA 1EETA 4KKOA 4ISFA 5HP1A 1WBDA 2E2NA 4ICLA 2XRIA 2HSTA 3VEXA 4FK4A 3HM8A 3CCVN 1RBTA 3O1BA 5AQLA 3J7AP 2O4IA 4HTLA 3A2FA 4Z4FA 1LWFA 1HKGA 5F2RA 4FWNA 1JL1A 2NZTA 3EEQA 2F4VK 4O8KA 2LKBA 5GIOA 1HJRA 3O9QA 2A6AA 3G0ZA 4Y1CA 3CERA 1KSPA 4F2RA 2WONA 5AZIB 2LY6A 4DWIA 1RCHA 5FRMA 2Q31A 1NJWA 2NRRA 4WCEL 5CE3A 3IG1A 1IH7A 1NLVA 4E7LA 2N2QA 2IAJA 2Z1JA 4CW7B 3MWTA 3SBGA 3DI6A 1NBWA 1P0AA 2V7ZA 1SEGA 1HKCA 3EO3A 4NCAA 1YF5L 2G8WA 5HROA 4A5BA 3K58A 4CEAA 2G8HA 3T69A 4CECA 4GV3A 3HO1A 2UYTA 1K9MO 4DTPA 2LN8A 3J81O 1WSIA 3VF2A 3CHWA 1ZBLA 4U67L 4CI6A 3ZSXA 3L3UA 4BRGA 1T7PA 2FSJA 3M1FA 4AAZA 2J4RA 3NH2A 2RKIA 4PL7A 1L3TA 3ATUA 1JCFA 3BP8A 2OZSA 3NAEA 1LV5A 5M1FA 3MEGA 3TAGA 3K5OA 1C56A 3ZT3A 2O8BB 3PY8A 5BREA 3WNHA 4KV8A 3QIOA 1OH5A 2IGIA 4YHHK 1S1VA 1LAVA 2FF6A 4O5BA 5A2QO 1SL0A 5BR9A 4BREA 4IO9L 4C1NK 4NB4A 5KRSA 2QKBA 3HP9A 2I61A 4CJRA 2F9TA 3RTVA 4DU1A 2ZE2A 3AVNA 3CMEN 4BR9A 4ELUA 3DLRA 5HOOA 3DMJA 4PWDA 4KFBA 4KTWA 4K0KK 1N6QA 1TGOA 4B3MK 4KHSA 4OLAA 1WSGA 1LQHA 3V1RA 4IG0A 3QBXA 1GOBA 2NLXA 4FW2A 2E20A 1LOTB 2HBJA 1NPIA 2D0OA 5EU7A 2FSKA 1EQYA 1BCGA 5C0YA 2QWRA 4FLZA 4ELTA 1TK0A 5CZ2A 2QWLA 1D9DA 4BR4A 1X1PA 1M1KO 1IG9A 3F9KA 2QWNA 3TI0A 4DR5K 4KHNA 1TL3A 2WC9A 5DM7L 3K59A 2OPRA 4JI2K 4KB0A 2RHKA 4X66K 2YNHA 3K0SA 3SUNA 2GX9A 3CCRN 4CCHA 1LWEA 4BRMA 4FWRA 5KRTA 3E66A 1RFQA 3NH1A 1RTJA 2D1KA 3MAQA 3FE1A 2IVPA 4M3UA 4PY5A 2ITGA 5AQIA 5CZ1A 4K8ZA 4FJJA 3CCQN 4I9QA 3WXIA 5AFUH 4BROA 1QQOA 1G15A 3VQCA 1ZU3A 3C7NB 5AQYA 3QLHA 4ZTFA 1W2BM 3AAPA 4HHFA 1NK6A 1OVYA 1J53A 1KAZA 4I9LA 1QS4A 3LZIA 2QK9A 2Q0RA 3A5OC 2Q36A 1HNXK 3T1HK 3SAHA 2HVHA 2VCPA 3D0PA 4GKKK 3JXUA 4WFBL 3D6RA 3QEVA 1J5OA 1A5VA 4I6MA 4XH4A 1BI4A 3JSMA 4PKIA 1I2UA 3KTQA 2YNFA 1IKXA 1U04A 1N36K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ZEU B;  4WFA L;  1P90 A;  1E3M A;  1IKY A;  3ZSZ A;  1Z6R A;  5BN8 A;  3CFP A;  3IAY A;  3TAN A;  5GAE P;  4LFA K;  1XQS C;  1VK0 A;  2IDO A;  1NGH A;  3UKR B;  4DV3 K;  2O8D B;  2MN5 A;  2NRW A;  3P4I A;  4DFP A;  3LPU A;  4YOY A;  3LAM A;  3TSU A;  1Z05 A;  4BEB A;  4KI4 A;  2HBK A;  4DS4 A;  5TKY A;  3ITH A;  3HK2 A;  3VA0 A;  4FJL A;  4XH5 A;  1IO2 A;  1T6C A;  4FWP A;  4CEB A;  3N4P A;  1JZA A;  1C55 A;  1Z25 A;  1HJO A;  4O4G A;  1T7B A;  1I3A A;  3OTO K;  3VER A;  1L3V A;  1XNQ K;  4FOI A;  3AY9 A;  4AHT A;  1UAX A;  1WSE A;  3EN9 A;  2YJF A;  2B68 A;  3T3F A;  2OYQ A;  4FZZ A;  2IVN A;  1DEJ A;  1UOC A;  2QWQ A;  4CZL A;  1V4S A;  4BC4 A;  2IS3 A;  3AGK A;  1HQU A;  2N2R A;  4BRL A;  4HWI A;  4PKH A;  3MX2 A;  1W9H A;  5CHI A;  1GLD G;  4CJ5 A;  3EYZ A;  1ICA A;  3EL2 A;  3CG7 A;  3ULD A;  2NRT A;  4DTJ A;  5CY0 A;  4BAC A;  1EP4 A;  5AQJ A;  5C15 A;  2PBD A;  3LM2 A;  3TTF A;  4DQQ A;  4IDH A;  4BR7 A;  3I56 N;  4LF5 K;  2LT8 A;  3OYL A;  3OYD A;  3EKU A;  3QEI A;  5HRS A;  3VQ6 A; 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