5HD4A

Dissecting therapeutic resistance to erk inhibition rat wild type sch772984 in complex with (3r)-1-(2-oxo-2-{4-[4-(pyrimidin-2-yl)phenyl]piperazin-1-yl}ethyl)-n-[3-(pyridin-4-yl)-2h-indazol-5-yl]pyrrolidine-3-carboxamide
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
PEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNLNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
publication title Dissecting Therapeutic Resistance to ERK Inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 117
structure length 347
sequence length 347
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2016-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5hd4A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5hd4A01
4DTKA 1ZMVA 4OTGA 3Q04A 2WD1A 2J0LA 4CG8A 3AMBA 3JUHA 4WOVA 5E8XA 4A9TA 1SYKA 3Q9YA 3U51A 1ZOGA 5L4QA 2W1HA 1U5QA 1YDTE 4GFMA 4GIIA 3F6XA 4ZJJA 3QQGA 4YJSA 2W1IA 2W05A 4WO5A 4IQ6A 4FTJA 4BGQA 2F7EE 5DN3A 4L3LA 4EKKA 5IF1A 4BF2A 5JN2A 4AW5A 4GV1A 3GGFA 3RPVA 4RSSA 4I6QA 3LVPA 3Q2MA 3R1NA 4JAJA 4AA5A 5DH3A 5AR4A 2EUFB 3K3JA 4XLVA 2O8YA 2J7TA 1M17A 1V0OA 1PF8A 3UZRA 4FV6A 5HX8A 2VUWA 3ORZA 5D9HA 4EYMA 5LOHA 5EDRA 4NW6A 5AA8A 2UW0A 5IQEA 1R3CA 2QVSE 1I44A 2AYPA 5C4LA 4A9UA 4F08A 4IAIA 3BGZA 4IJ9A 4M84A 4E6AA 2QKRA 2GHGA 3NUUA 4C02A 5HORA 3QCXA 4D2RA 4U44A 4K2RA 4PMPA 2DWBA 3FI2A 2CMWA 2YCRA 4IWPA 4YBJA 3W2QA 3TZ9A 5H8GA 4C34A 4EORA 3QA0A 5HTIA 4UWCA 4HVGA 4BKJA 3ACKA 2O0UA 4FEQA 4FTAA 1GAGA 1YDSE 4TYIA 4X7QA 3RAIA 5JZJA 4YZDA 1W98A 4WNMA 5ETIA 3UOJA 5DOSA 3R1QA 2BTRA 5IEXA 3RMFA 3QQKA 5HEZA 5A46A 1UU7A 4UMRA 3VS2A 2C0OA 4I24A 4F0GA 3G0EA 3QD4A 3D5XA 5A4CA 4D2PA 2IZTA 3L8SA 5K4JA 4P7EA 4H58A 2O65A 4FKWA 4O0UA 4P5ZA 1YXXA 4FZAB 1XKKA 3R7EA 4MKCA 5K3YA 5EHLA 2GPHA 4A9SA 3OCBA 4TT7A 4FOBA 2UVZA 3CJGA 4C4HA 2X2KA 4W8DA 4CFVA 1ZARA 4AZEA 3DTCA 5J7HA 4IANA 2Z02A 1F3MC 4LOOA 4M12A 2PVJA 2X1NA 3C7QA 3W1FA 3HDNA 1RDQE 2DUVA 3L8PA 2QG7A 2PWLA 2XRWA 4QNAA 3VUDA 4EWQA 4XG6A 4XG7A 5EDPA 4BZNA 5CY3A 4ZXTA 3ENHA 4JQ7A 2XF0A 5M4CA 3DNEA 1KOBA 3QCQA 4OTHA 2WO6A 4QMVA 3BHVA 4RZVA 3QYWA 4F7LA 2IJMA 3HV5A 4G6LA 3H0ZA 3VF8A 3EQHA 4AN3A 5HLNA 2WZJA 3GC0A 1NY3A 1W0XC 1Y57A 4N0SA 4BKYA 3HRCA 4QP2A 3PY1A 4HGSA 3LMIA 4BWXA 2GNFA 2VN9A 2ITYA 2ESMA 4RX8A 4GK2A 1Z5MA 4C4FA 5HNIX 1T45A 4LUDA 2PE2A 3TUBA 4AGWA 2ZMDA 3RK7A 4DC2A 2UV2A 4GMYA 4O7RA 5CU3A 4DFBA 4LQMA 2C6TA 4XMOA 3AT3A 1GJOA 1Q62A 5E8TA 4FR4A 2BKZA 1ZYCA 2QOFA 5DIAA 3SW4A 5DEWA 3EKNA 3F7ZA 2XYNA 2HZIA 1WCCA 1U5RA 5M56A 5CEPA 1YHWA 1ZOHA 3IS5A 1TQPA 5AP4A 3DXNA 3R8PA 4JBOA 5ETFA 4LV8A 4QTAA 4D9UA 5GJGA 5C4KA 2Z7SA 2WMXA 1MUOA 5EHYA 4CYJA 3BYSA 2R9SA 3PE2A 3L8VA 3R01A 4J53A 3C4ZA 3KVXA 3EQIA 4QTCA 4QPMA 4RRVA 5L8JA 3E87A 3Q6WA 4AQCA 3O2MA 4D5HA 4DT9A 5DNRA 1MQBA 3H3CA 4XUFA 2PZIA 3UG1A 2KTYA 4I6BA 5AADA 3EN6A 3ORPA 3SXSA 4TYHB 2JDTA 4A06A 3Q3BA 1JKLA 2QI8A 2DQ7X 2J90A 2YAKA 3DFAA 3HAVA 3KCKA 2XNBA 4ONAA 5G6VA 1URWA 2BILB 3L1SA 3R9NA 3LLAA 4CRSA 3KMUA 3LCOA 3SV0A 3UDBA 2CDZA 1PMUA 4RX5A 1NA7A 3R8LA 2HWPA 3MJ2A 3D2KA 3PIZA 3WI6A 4H39A 3U55A 3WE8A 4PV0A 4ASXA 3UOHA 4YC8A 2I0YA 2JBPA 5BVKA 4BICA 4CCBA 4Z7GA 5FXSA 3PWDA 1XO2B 3R1SA 1VYWA 3VAPA 4M14A 4FV4A 3QKKA 2CKEA 2GS2A 3CS9A 4FKTA 4O0VA 4YPDA 5M08A 3QTXA 4NW5A 3I0QA 1RJBA 3T9TA 1UWHA 2RL5A 4IDVA 5CXHA 4EOKA 3TZ7A 4YU2A 1JKKA 5HE1A 3N51A 4PPAA 3QHRA 5AMNA 3ZSHA 3UC4A 1F5QA 4D2VA 1M7QA 1YOMA 3NAXA 4EH2A 1PJKA 3ENMA 4O86A 2C6DA 3FZ1A 4IAKA 4F1TA 4AZWA 1GZ8A 3ZLXA 2JFLA 3PE1A 3RPYA 4DEAA 4RZWA 1OITA 4YZ9A 4R3CA 4KBCA 1QCFA 1QPCA 3NNVA 5HNGA 2VAGA 5AEPA 4RIWB 3NVMB 3FMNA 4RX7A 5B2MA 2VGOA 2XKFA 5HD4A 3U9NA 2H9VA 5ANDA 3GT8A 4AW0A 1OUKA 2JKQA 5AV0A 2OWBA 3AXWA 4GL9A 4I6FA 3R9HA 4EBVA 2W17A 4O0WA 5IQGA 3EQDA 4H1JA 2Z60A 3ZSIA 1AQ1A 1UKHA 1W8CA 3PSDA 4YZCA 5A3XA 3UIUA 1V0PA 4AZFA 4LMNA 2UUEA 4DLIA 4FG7A 3RVGA 3V8SA 4PPCA 2OLCA 3R2YA 4RJ4A 4FV9A 3F5PA 4U81A 4BYIA 4G3EA 3F3ZA 4LL5A 2PULA 4E93A 5CEKA 1GNGA 3CE3A 3IECA 4IXPA 2VTRA 2IZRA 2NO3A 4BCGA 4L3PA 2PVRA 4FGBA 4L42A 3IKAA 2WXVA 3NYVA 4IZ7A 5F20A 2JKKA 4TYHA 4BHZA 1V1KA 4HVIA 4J99A 4PPBA 4ZTQA 3RP9A 5I9VA 5IA3A 3HMIA 1OGUA 3CR0A 2CKPA 5AV4A 3KL8A 3VN9A 2YWPA 5FWKK 3TNWA 3OXIA 4B6LA 4NJ3A 3F3VA 3LXKA 3TACA 1H0VA 3IW7A 4IAYA 4OBOA 4E73A 4I21A 3SC1A 4B9DA 4YJPA 4EOIA 4S32A 1R78A 2HK5A 3A7FA 4BI0A 4F99A 4F6SA 4K33A 3C4FA 3MS9A 3QRUA 2J0KA 4P4CA 3IOPA 1TKIA 4JIKA 1WBNA 4GJ3A 4YTIA 5GJFA 2PMOX 3DU8A 4KS8A 2XNNA 3E8CA 4YHFA 4RIYA 3PA4A 2XYUA 4MBLA 5HNBA 4RIXB 1Q3WA 5BPYA 4EJ7A 2VX3A 3GC9A 2XK3A 3RWPA 4E7WA 3ODYX 3D0EA 2WAJA 4BRXA 3LXPA 5EK7A 2PVMA 2UW9A 3LOKA 3LFDA 1JKSA 2QOBA 2WMQA 3HMMA 1UV5A 3PVBA 4YJUA 4YNEA 3WIGA 3ZZWA 4S33A 3ZOSA 3KU2A 4FKUA 4O0YA 4ZS4A 3C4CA 5HE2A 1H1QA 2VWVA 4MXYA 4O21A 4EWHA 3A8XA 1APME 4QMNA 5HIEA 3ZO3A 4RIWA 4ZTLA 3RINA 4RT7A 1RQQA 2JDRA 2ZV9A 3V5WA 4ACDA 4MNFA 4D28A 5LQFA 4RLLA 4YLKA 5J8IA 2ZB0A 5LMBA 4XCUA 5TR6A 3R30A 4UZHA 4QYHA 4GUBA 4QMZA 3OBGA 3W55A 4UEUA 1YHVA 4CSVA 4IB5A 3HKOA 3MBLA 1LP4A 3UMXA 2C3IB 2YM4A 4MH7A 3W2CA 3SDJA 3NUYA 3DAJA 2JFMA 3KXZA 4XRLA 2C68A 4O96A 1ERKA 1H0WA 4U0IA 5CU4A 2YLEA 2CN5A 5J9ZA 5J5TA 3HECA 3CPCA 3I81A 2F2CB 3UOKA 2R2PA 4C58A 4YUQA 4QYFA 4ORKA 5LWNA 2EB2A 5GJDA 3FEGA 4AP7A 5ANGA 5KBRA 3OW4A 4E6CA 4X2NA 3LMHA 3BCEA 3QQUA 1CSNA 3LCDA 4ZTSA 5TF9A 4K1BA 2UZTA 3MVLA 3KRLA 3CKXA 3IDBA 2BAKA 4F6WA 2HY0A 4U45A 1HCLA 5KMKA 2OICA 3DCVA 1ZOEA 5E8SA 3R8MA 2QR8A 2QCSA 4G1WA 3ZLYA 3LFCA 1OPJA 4HYUA 1IR3A 4TYGA 4RWLA 5CF5A 4LM5A 2X8EA 2XEYA 4L7SA 4XBRA 1B39A 3LIJA 2QO9A 4I5CA 5ANJA 4D4YA 5C26A 5HLPA 4BCKA 3TM0A 1H1RA 3Q52A 5AR3A 5B2LA 3AOXA 5B0XA 1R0EA 3FY0A 4UYNA 2ONLA 3NYXA 4DEEA 1OBGA 4FMQA 3E5AA 4I0RA 4N6ZA 4XOYA 3UG2A 2XMYA 3NR9A 4G34A 3QA8A 2F2UA 4ZZNA 4UMQA 3EQFA 5IA4A 3ZC5A 2O3PA 4JG7A 3WZJA 2I0EA 5BVOA 1SVHA 1W7HA 3DZQA 2ZV2A 3CGFA 2PYWA 2YDJA 2Z2WA 2B9HA 4E4NA 4X3JA 3TV6A 3AD4A 4CMOA 5J95A 4KIPA 5J1WA 4JLCA 5J9LA 2RKUA 2XNMA 4F0IA 4FV1A 5EOLA 3CD3A 4MD7E 3MI9A 3P0MA 4ZIMA 2X0GA 2WIHA 3NYNA 1CKPA 2YFXA 2XJ2A 4QMOA 5J9YA 4HNIA 4IACA 4RVLA 3HV4A 1XH9A 3DA6A 4DG2E 3GCUA 2ZOQA 4GJ2A 3TZMA 4F9CA 2XCHA 3D7ZA 4GYGA 4GT4A 4M69B 4R7BA 4QP8A 4RFZA 2EVAA 2R5TA 4BWPA 2UZDA 3FHRA 1Q4LA 4V05A 4YURA 2YIRA 3CBLA 1BKXA 3BQCA 3FZPA 4BCOA 2VTHA 1K9AA 5CZIA 3OOMA 3Q96A 3R9DA 3A2CA 3KRXA 5KMLA 4C4EA 4XG9A 2PUNA 2PVKA 3JVRA 4WG4A 5CT0A 4UB7A 4BCMA 4FA2A 3AGMA 2CNQA 5E91A 4WRGA 2F57A 2A4LA 3E3BX 4FSRA 3UNZA 4FT7A 5D12A 3FSFA 1GY3A 1BYGA 4FVRA 4ENXA 1PXMA 3ROCA 3LKMA 2I1MA 4ZTMA 4BCPA 5AUXA 3P7AA 1O6KA 2X4ZA 3PPKA 4MHAA 3F2NA 5AIRA 5CALA 1LEWA 4X3FB 5LARA 3O7LB 3A7IA 5F1ZA 3FMDA 2EXEA 2W1EA 3GFWA 5CS6A 3Q60A 2R4BA 3TNHA 3VRZA 3BEAA 3PRFA 3KRJA 4NH1A 4IVAA 3OF0A 2WGJA 4WNKA 5EI8A 3EKKA 3AC3A 2UW7A 4EOQA 2EXMA 4QQJA 4JQEA 1ZXEA 3T3UA 5I9YA 2WTJA 3BKBA 4O2ZA 4ANNA 4KIKB 4OGRA 3HVCA 4MNEB 5EM6A 4C37A 1REKA 1YQJA 2QOCA 3VW8A 3U6JA 3QRJA 1H08A 1QPJA 4YPSA 1Q8ZA 2OIDA 4RC4A 4ASDA 4O1PA 2WHBA 3V5LA 1ZYJA 3B8QA 4U41A 2W1ZA 3FLZA 4X21A 4BI1A 4CFWA 3AG9A 3L8XA 4NUSA 3HUCA 4KIOA 3HP2A 1UNLA 4RBLA 2UVYA 4RWJA 3BRBA 3UYSA 3D14A 3EYHA 4ANOA 2UW4A 5CQWA 4MBIA 1YWRA 4XHKB 1KV1A 5AAEA 2WTCA 3TIZA 4BWKA 3PSCA 1PY5A 5EYDA 2B9FA 3W32A 2HAKA 2VU3A 3NAYA 4TTHB 2PY3A 3AT4A 4AXAA 3PLAE 4EHZA 2ZB1A 5IEYA 2P4IA 4QMSA 3RM7A 3WZKA 3ZRMA 3MIYA 5FTGA 1TQMA 2PVYA 2VGPA 3EHAA 4UWYA 2C5YA 4E26A 4M69A 1W82A 2X8IA 4MQ1A 3FYJX 3L9LA 5CZHA 3EFWA 3S95A 5L8LA 2YZAA 2OJ9A 2FSLX 3FAAA 4MQ2A 3RJCA 2XUUA 4A4OA 4DGOA 4XOZA 1X8BA 3CY3A 4S2ZA 4EBWA 4MWHA 4DA5A 2G2IA 5T68A 3P4KA 2C69A 4ZJIA 3ZSGA 4HGTA 4KKEA 3D15A 1XWSA 3EFJA 3NCGA 4HOKA 5I9XA 5IEVA 2YLFA 2VTJA 4I5PA 4NM5A 5BVDA 4OTQA 3NS9A 5LWMA 2F4JA 3R7UA 2C6LA 4JS8A 3OXZA 2YACA 4D1ZA 4DG3E 5FDXA 2QHMA 3V8TA 4M68A 1I09A 4LRKA 4YZBA 4O0RA 1DI9A 4X3FA 3D2IA 4MAOA 2O64A 4KINA 5KMNA 3F66A 3ZUUA 2XM9A 3EIDA 4IVCA 2JDOA 2BMCA 3BE9A 3EZRA 3VS0A 4WUAA 2IPXA 5A9UA 5CEOA 4EC9A 2PUUA 1JWHA 2VX1A 4YJTA 3PG3A 4XV3A 3T9IA 3U9CA 1E1XA 4YMJA 3NMUF 4TWPA 2IVSA 3W8LA 3W33A 4OTRA 3S3IA 4PNIA 1HOWA 1ZY5A 3MSSA 3R22A 4BDEA 4HCUA 4FKGA 5CEMA 3UO5A 2G2HA 4IWQA 5CU2A 2JKMA 4C36A 2GHMA 4GU9A 4EOJA 5E92A 4QMWA 5IQDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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