5HELA

Crystal structure of the n-terminus y153h bromodomain mutant of human brd2
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
119
structure length
119
Chain Sequence
SMKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCHIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the N-terminus Y153H bromodomain mutant of human BRD2
rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 2
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 119
sequence length 119
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5helA00
5AD3A 3UW9A 4Y03A 3U5PA 4UIVA 5A5PA 2OUOA 5E73A 4YYGA 3LQIA 5EWCA 5FE5A 5DW2A 5CUAA 3UVXA 4TT4A 5D3TA 5ENFA 5ENJA 4WHUA 5F5ZA 5KU3A 3S92A 2E7NA 5DBMA 3NXBA 5FE3A 2E7OA 4N4GA 4A9OA 5FH6A 5E74A 2YEKA 1WUMA 5A82A 4LRGA 4QBMA 4YYIA 5C8GA 5LJ2A 5C85A 3U5LA 3G0JA 4YH3A 4A9HA 4UIZA 4BJXA 5FFVA 5I83A 5HFQA 3UVWA 5FG5A 5E7DA 5CQ7A 4ALHA 4N3WA 4ZQLA 4A9EA 4UIWA 4RVRA 5I88A 4NRAA 4QSTA 5DY7A 4E96A 4O7CA 4KCXA 2DVSA 4O78A 5H1TA 4QYLA 4NUDA 5D3NA 5HQ6A 5A5RA 4O7EA 4UIXA 2RFJA 5D0CA 5IGLA 4IR6A 4XUAA 5D3HA 5AMEA 5LKTA 5D3SA 5EQ1A 3U5JA 3TLPA 4HXRA 5F2PA 5DFCA 4IR4A 3U5NA 4NQMA 5L99A 5ENHA 5DYXA 5KTXA 4XYAA 1WUGA 5D3JA 5LJ0A 3QZVA 5IBNA 4OGIA 5FFWA 3JVMA 4UIUA 5A5QA 5EU1A 1JSPB 4MEQA 5I29A 5FH8A 5AMFA 5I1QA 5TB6A 5LKXA 4QR5A 5EICA 5ENEA 3MB4A 4O72A 2FSAA 3HMEA 2I7KA 4UIYA 2WP1A 4NRBA 2N9GA 5L8TA 3HMFA 5E3GA 5D7XA 5DKHA 4YYJA 4HXSA 3DAIA 4UYFA 2RO1A 5CUEA 5HJCA 4YYHA 3P1FA 5A5SA 5HELA 2YELA 5EVAA 4NQNA 4YAXA 5FE7A 4O71A 5CRMA 3SVFA 5KHMA 2DATA 4NS5A 4XY9A 3RCWA 5II2A 5I80A 3P1EA 4MEOA 4CFLA 4YATA 5CRZA 5CU8A 3DWYA 5E9KA 4QYDA 4QC3A 4A9FA 5IGNA 5EM3A 4IORA 4F3IA 3UV2A 5E9MA 4A9KA 4NR6A 3U5OA 5FBXA 4QEUA 5EWWA 5EPSA 4C66A 5FDZA 5F62A 4NR9A 5CY9A 4LYSA 4OGJA 3ONIA 5IGMA 5BT5A 5I7XA 2OSSA 4MR5A 5F25A 5DFBA 5CUBA 5FB0A 4QNSA 5HRVA 5KTUA 2DKWA 5DFDA 5CUGA 1ZS5A 5HFRA 2DVVA 5C7NA 3P1DA 5D26A 4NYVA 4O76A 5CQ5A 5E9VA 5IG6A 4IR3A 4C67A 4HXKA 4O70A 5FG6A 5E3DA 5FE0A 2L5EA 1JM4B 4A9LA 4O77A 4A9NA 4ZC9A 3G0LA 4QC1A 5CFWA 4QSSA 4YK0A 5ETDA 5LKZA 1N72A 4HXLA 4LZRA 5I7YA 5BT3A 5HRXA 3Q2EA 3O36A 5E9YA 4CFKA 4YBTA 4XY8A 5G4RA 5I89A 5AD2A 2YDWA 5LJ1A 3HMHA 5FE8A 5ENIA 2RS9B 4N4IA 4FLPA 4ALGA 5FE4A 5D3LA 5FFYA 4PY6A 4Q0OA 5CZGA 5HEMA 4O7BA 3O35A 5HQ5A 2R0YA 4GPJA 4PS5A 4J0SA 5G4SA 4IOQA 5J0DA 4CURA 4HBVA 4OUFA 5CTLA 3P5OA 4LR6A 4QSUA 5HQ7A 1F68A 4Z6HA 5ETBA 4MR4A 4ZW1A 5D25A 4QY4A 4HXMA 4MEPA 5I40A 3MQMA 4CUPA 4J1PA 5D3PA 5A85A 4LYIA 5L8UA 4QSWA 4TQNA 4WHWA 4Z6IA 4A9JA 4MR6A 5C4QA 3LJWA 4CL9A 3O34A 2R0SA 4PKLA 5EA1A 2WP2A 4HXOA 3LXJA 5HRWA 4UYDA 4QR3A 5CQAA 3QZTA 2MJVB 4TTEA 5L98A 4BW1A 3MUKA 5CPEA 4PCIA 2RNYA 5A5OA 3AADA 2H60A 4BW4A 4CUUA 5ENBA 5L97A 4A9IA 4BHWA 4QUTA 5EK9A 4HXPA 5DKCA 4NR7A 4YBSA 4X2IA 4TZ8A 4QZSA 5CP5A 4TS8A 5ENGA 5KO4A 3IU6A 4O7AA 3SVGA 5HENA 2LSPB 4YY6A 3O37A 4DONA 5DYUA 2YQDA 5DLZA 4AKNA 4KV4A 4NR8A 4YYNA 3FKMX 4O75A 2RI7A 2DVRA 5EWDA 5JWMA 5LVQA 5CUCA 5F3AA 4UYEA 4LDFA 5F1LA 3GG3A 2F6JA 5A5NA 2R0VA 3QZSA 4CUTA 3JVKA 5CQ6A 5CQ8A 5A7CA 5DYAA 4TT6A 4KV1A 4NUEA 5FB1A 5EWVA 3UVYA 5EGUA 3JVLA 5C89A 3LQHA 4LC2A 2DVQA 5H1VA 4J3IA 5CS8A 4O7FA 1EQFA 4BW3A 4MR3A 4YYMA 2R10A 5FE1A 2D9EA 1X0JA 4HBWA 4TU4A 5L96A 3UVDA 5E9LA 4A9MA 4TZ2A 2NXBA 5F36A 3ZYUA 4HBXA 3K2JA 3I3JA 4NUCA 4QB3A 4TT2A 4NR5A 5EI4A 5CUDA 3O33A 3S91A 5BT4A 2YW5A 5EV9A 2I8NA 4XUBA 2L85A 4IOOA 5I86A 2GRCA 4QUUA 4TYLA 3U5KA 4Z93A 4MENA 2E3KA 4NYXA 2OO1A 5FH7A 4NXJA 5C87A 5EWHA 4Z1SA 3IU5A 4QSVA 5IGKA 4Q0NA 3JVJA 4UYGA 3SVHA 4YH4A 5ACYA 5FE2A 5K29A 5LKUA 4NYWA 4YABA 5CGPA 2G4AA 5IIDA 5CQ3A 5F63A 4O74A 5A83A 4QSPA 5FG4A 5COIA 5E9IA 5LVRA 2L84A 1E6IA 3UV4A 5H1UA 5EPRA 5DYCA 3AQAA 5A81A 4QSQA 5HCLA 5F1HA 5EISA 4QSXA 5CQ4A 2D82A 5KTWA 2RNXA 4YBMA 5D3RA 5HM0A 4N4HA 4YC9A 4LYWA 5FE6A 3MULA 3P1CA 5DKDA 5FE9A 4NRCA 4WIVA 4CUSA 5LUUA 4N4FA 3Q2FA 4YADA 5E0RA 3U5MA 5TCMA 4Z1QA 5CQTA 2DWWA 2RNWA 2YEMA 5F61A 4LZSA 4J0RA 4LZ2A 3MB3A 2KTBB 3LQJA 4NR4A 4QR4A 5II1A 4CUQA 3MXFA 3D7CA 5DW1A 3UV5A 4PTBA 5EP7A 5EPBA 4YYDA 4CLBA 5ENCA 5F60A 5H85A 5HLSA 4UITA 4QSRA 4YY4A 4BW2A 5D24A 4HXNA 4UYFB 4QEVA 4YYKA 4TU6A 2YYNA 4HBYA 4UYHA 4IR5A 5JI8A 5DLXA 2F6NA 5DX4A 4QEWA 4PCEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AD3A 3UW9A 4Y03A 3U5PA 4UIVA 5A5PA 2OUOA 5E73A 4YYGA 3LQIA 5EWCA 5FE5A 5DW2A 5CUAA 4AKGA 3UVXA 4TT4A 5D3TA 5ENFA 5ENJA 4WHUA 5F5ZA 5KU3A 3S92A 2E7NA 5DBMA 3NXBA 5FE3A 2E7OA 4N4GA 4A9OA 5FH6A 5E74A 2YEKA 1WUMA 5A82A 4LRGA 4QBMA 4YYIA 5C8GA 5LJ2A 5C85A 3U5LA 3G0JA 4YH3A 4A9HA 4UIZA 4BJXA 5FFVA 5I83A 5HFQA 3UVWA 5FG5A 5E7DA 5CQ7A 4ALHA 4N3WA 4ZQLA 4A9EA 4UIWA 4RVRA 5I88A 4NRAA 4QSTA 5DY7A 3D1DA 4E96A 4O7CA 4KCXA 2DVSA 4O78A 5H1TA 4QYLA 4NUDA 5D3NA 5HQ6A 5A5RA 4O7EA 4UIXA 2RFJA 5D0CA 5IGLA 4IR6A 4XUAA 5D3HA 5AMEA 5LKTA 5D3SA 5EQ1A 3U5JA 3TLPA 4HXRA 5F2PA 5DFCA 4IR4A 3U5NA 4NQMA 5L99A 5ENHA 5DYXA 5KTXA 4XYAA 1WUGA 5D3JA 5LJ0A 3QZVA 5IBNA 4OGIA 5FFWA 3JVMA 4UIUA 5A5QA 5EU1A 1JSPB 4MEQA 5I29A 5FH8A 5AMFA 5I1QA 5TB6A 5LKXA 4QR5A 5EICA 5ENEA 3MB4A 4O72A 2FSAA 3HMEA 2I7KA 4UIYA 2WP1A 4NRBA 2N9GA 5L8TA 3HMFA 5E3GA 5D7XA 5DKHA 4YYJA 4HXSA 3DAIA 4UYFA 2RO1A 5CUEA 5HJCA 4YYHA 3P1FA 5A5SA 5HELA 2YELA 5EVAA 4NQNA 4YAXA 5FE7A 1ZKRA 4O71A 5CRMA 3SVFA 5KHMA 2DATA 4NS5A 4XY9A 3RCWA 4AKHA 5II2A 5I80A 3P1EA 4MEOA 4CFLA 4YATA 5CRZA 5CU8A 3DWYA 5E9KA 4QYDA 4QC3A 4A9FA 5IGNA 5EM3A 4IORA 4F3IA 3UV2A 5E9MA 4A9KA 4NR6A 3U5OA 3VKHA 5FBXA 4QEUA 5EWWA 5EPSA 4C66A 5FDZA 2EJNA 5F62A 4NR9A 5CY9A 4LYSA 4OGJA 3ONIA 5IGMA 5BT5A 5I7XA 2OSSA 4MR5A 5F25A 5DFBA 5CUBA 5FB0A 4QNSA 5HRVA 5KTUA 2DKWA 5DFDA 5CUGA 1ZS5A 5HFRA 2DVVA 5C7NA 3P1DA 5D26A 4NYVA 4O76A 5CQ5A 5E9VA 5IG6A 4IR3A 4C67A 4HXKA 4O70A 5FG6A 5E3DA 5FE0A 2L5EA 1JM4B 4A9LA 4O77A 4A9NA 4ZC9A 3G0LA 4QC1A 5CFWA 4QSSA 4YK0A 5ETDA 5LKZA 1N72A 4HXLA 4LZRA 5I7YA 5BT3A 5HRXA 3Q2EA 3O36A 5E9YA 4CFKA 4YBTA 4XY8A 5G4RA 5I89A 5AD2A 2YDWA 4AI6A 5LJ1A 3HMHA 5FE8A 5ENIA 2RS9B 4N4IA 4FLPA 4ALGA 5FE4A 5D3LA 5FFYA 4PY6A 4Q0OA 5CZGA 5HEMA 4O7BA 3O35A 5HQ5A 2R0YA 4GPJA 4PS5A 4J0SA 5G4SA 4IOQA 5J0DA 4CURA 4HBVA 4OUFA 5CTLA 3P5OA 4LR6A 4QSUA 5HQ7A 1F68A 4Z6HA 5ETBA 3D1BA 4MR4A 4ZW1A 5D25A 4QY4A 4HXMA 4MEPA 5I40A 3MQMA 4CUPA 4J1PA 5D3PA 5A85A 4LYIA 5L8UA 4QSWA 4TQNA 4WHWA 4Z6IA 4A9JA 4MR6A 5C4QA 3LJWA 4CL9A 3O34A 2R0SA 4PKLA 5EA1A 2WP2A 4HXOA 3LXJA 5HRWA 4UYDA 4QR3A 5CQAA 3QZTA 2MJVB 4TTEA 5L98A 4BW1A 3MUKA 5CPEA 4PCIA 2RNYA 5A5OA 3AADA 2H60A 4BW4A 4CUUA 5ENBA 5L97A 4A9IA 4BHWA 4QUTA 5EK9A 4HXPA 5DKCA 4NR7A 4YBSA 4X2IA 4TZ8A 4QZSA 5CP5A 4TS8A 5ENGA 5KO4A 3IU6A 4O7AA 3SVGA 5HENA 2LSPB 4YY6A 3O37A 4DONA 5DYUA 2YQDA 5DLZA 4AKNA 4KV4A 4NR8A 4YYNA 3FKMX 4O75A 2RI7A 2DVRA 5EWDA 5JWMA 5LVQA 5CUCA 5F3AA 4UYEA 4LDFA 5F1LA 3GG3A 2F6JA 5A5NA 2R0VA 3QZSA 4CUTA 3JVKA 5CQ6A 5CQ8A 5A7CA 5DYAA 4TT6A 4KV1A 4NUEA 5FB1A 5EWVA 3UVYA 5EGUA 3JVLA 3ERRA 5C89A 3LQHA 4LC2A 2DVQA 5H1VA 4J3IA 5CS8A 4O7FA 1EQFA 4BW3A 4MR3A 4YYMA 2R10A 5FE1A 2D9EA 1X0JA 4HBWA 4TU4A 5L96A 3UVDA 5E9LA 4A9MA 4TZ2A 2NXBA 5F36A 4AKIA 3ZYUA 4HBXA 3K2JA 3I3JA 4NUCA 4QB3A 4TT2A 4NR5A 5EI4A 5CUDA 3O33A 3S91A 5BT4A 2YW5A 5EV9A 2I8NA 4XUBA 2L85A 4IOOA 5I86A 3VKGA 2GRCA 4QUUA 4TYLA 3U5KA 4Z93A 4MENA 2E3KA 4NYXA 2OO1A 5FH7A 4NXJA 5C87A 5EWHA 4Z1SA 3IU5A 4QSVA 5IGKA 4Q0NA 3JVJA 4UYGA 3SVHA 4YH4A 5ACYA 5FE2A 5K29A 5LKUA 4NYWA 4YABA 5CGPA 2G4AA 5IIDA 5CQ3A 5F63A 4O74A 5A83A 4QSPA 5FG4A 5COIA 5E9IA 5LVRA 2L84A 1E6IA 3UV4A 5H1UA 5EPRA 5DYCA 3AQAA 5A81A 4QSQA 5HCLA 5F1HA 5EISA 4QSXA 5CQ4A 2D82A 5KTWA 2RNXA 4YBMA 5D3RA 5HM0A 4N4HA 4YC9A 4LYWA 5FE6A 3MULA 3P1CA 5DKDA 5FE9A 4NRCA 4WIVA 4CUSA 5LUUA 4N4FA 3Q2FA 4YADA 5E0RA 3U5MA 5TCMA 4Z1QA 5CQTA 2DWWA 2RNWA 2YEMA 5F61A 4LZSA 4J0RA 4LZ2A 3MB3A 2KTBB 3LQJA 4NR4A 4QR4A 5II1A 4CUQA 3MXFA 3D7CA 5DW1A 3UV5A 4PTBA 5EP7A 5EPBA 4YYDA 4CLBA 5ENCA 5F60A 5H85A 5HLSA 4UITA 4QSRA 4YY4A 4BW2A 5D24A 4HXNA 4UYFB 4QEVA 4YYKA 4TU6A 2YYNA 4HBYA 4UYHA 1PUOA 4IR5A 5JI8A 5DLXA 2F6NA 5DX4A 4QEWA 4PCEA
chains in the Genus database with same CATH topology
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