5HENA

Crystal structure of the n-terminus r100l bromodomain mutant of human brd2
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
VTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFLQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the N-terminus R100L bromodomain mutant of human BRD2
rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 2
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5henA00
3JVLA 4LZSA 4ZW1A 5CTLA 4BW3A 4OGJA 4J0SA 5A83A 5IGKA 5FB0A 4CUUA 5EWDA 2R0SA 3SVGA 5L8UA 4HBYA 5ETBA 4O72A 4NUEA 5DYXA 4TT4A 5A85A 3U5KA 5E74A 5C85A 5EI4A 5FB1A 4TT2A 5I89A 2NXBA 5HRXA 3LQJA 4NQNA 5ENEA 3U5NA 5FG6A 5FG4A 2OSSA 5ENJA 4ALGA 4A9LA 5FG5A 5D7XA 5L97A 5FE7A 5EK9A 5L99A 5E9KA 5II1A 3LQHA 4LYWA 4QBMA 4UIVA 5DLZA 4YATA 3Q2EA 4TQNA 3HMEA 3DAIA 4QSSA 5EPSA 2R0VA 4YYNA 5H1VA 4BW1A 4TZ2A 5LJ0A 5EPBA 5EQ1A 3QZTA 5E3GA 3RCWA 2FSAA 5C89A 5I40A 4A9MA 3U5OA 2I7KA 5E7DA 2RI7A 2RNWA 4NXJA 5ENCA 3MB3A 5CU8A 3P5OA 4Z93A 5EWHA 2YDWA 5IIDA 4QNSA 5C4QA 5CZGA 5AMEA 4NYXA 5L8TA 3ZYUA 5DKHA 5EWCA 5F36A 1F68A 2RNXA 5II2A 5FFVA 5FE0A 5KO4A 4HXKA 2F6NA 4YY4A 2N9GA 5D26A 4ALHA 2WP2A 3S92A 4BW4A 4NYWA 3I3JA 4A9FA 5EICA 4YYHA 4N3WA 2G4AA 2OUOA 5CUCA 5TB6A 4NR4A 5A7CA 4LZ2A 3O33A 3UV5A 5FE5A 5HQ6A 5LKTA 4QYDA 3JVMA 4Z1QA 4CUQA 5A81A 5H1UA 5E73A 2DVVA 5DW2A 5K29A 4CFKA 5I29A 3G0JA 4YH4A 4XY8A 5LJ1A 4QSPA 4YYDA 3Q2FA 4A9IA 4PCIA 4QSXA 4A9JA 5CS8A 5D24A 2GRCA 5HQ5A 3U5JA 5EGUA 4CFLA 4O71A 5ETDA 4OGIA 5HRVA 1JM4B 5FFYA 4NR8A 2YYNA 4QSRA 4O7EA 4AKNA 5E9YA 4Q0NA 4TU6A 4QYLA 5AD2A 5CGPA 5I1QA 4MENA 3UVXA 4XUBA 5CUDA 5A5RA 4KV1A 4A9KA 4QSQA 4NR6A 5F2PA 3MUKA 4UIUA 1WUGA 5DFBA 4LC2A 4YABA 5EVAA 5FE4A 5EV9A 5C8GA 3NXBA 5FH7A 5F61A 2E3KA 3ONIA 4YC9A 5CQ3A 5JWMA 4NUDA 5IGLA 5EISA 4Z6HA 3MQMA 2DKWA 4YK0A 5D25A 4O77A 5DYCA 5D3HA 4Q0OA 4O7CA 3UV4A 4O74A 3UV2A 5HCLA 4XY9A 5ENBA 4NUCA 4QY4A 3P1DA 4DONA 4NRAA 2RS9B 3IU5A 2E7NA 4HXLA 4ZQLA 4TYLA 5CUEA 4N4GA 5KHMA 4A9HA 4N4FA 4WHWA 4LYIA 4YADA 4UIWA 5D3JA 3JVKA 4J1PA 4LZRA 5CQAA 5D3PA 5DY7A 4PKLA 4A9NA 4TS8A 4UYDA 5F63A 4PCEA 5HQ7A 4UYHA 5CQ8A 5H85A 5KTUA 5JI8A 2D9EA 5CQ4A 3U5MA 5IGNA 4QSWA 4Y03A 2OO1A 2WP1A 4IOOA 5HJCA 5DLXA 3UVYA 2DVQA 5CRMA 4YYMA 2L5EA 4A9OA 5EWVA 4NYVA 2YEKA 4NRBA 4N4HA 4YBSA 4NQMA 2H60A 4YBTA 2F6JA 3UW9A 4IORA 4BW2A 5LKXA 5E9IA 5CY9A 4QUUA 4PTBA 5FDZA 4QEVA 3MB4A 4YH3A 4O70A 3LJWA 5FH6A 2R0YA 2DVSA 5TCMA 5I80A 4HXPA 4WIVA 5EA1A 3O35A 3HMFA 5D3RA 5FE6A 4IR6A 5DFDA 5D3TA 4UIYA 4BJXA 5DFCA 1X0JA 4YY6A 1ZS5A 4UYEA 4A9EA 5IBNA 5C87A 5LVQA 3UVWA 2DATA 5A5SA 5LKUA 5D3SA 4MEQA 5FBXA 5CUAA 5LVRA 5KU3A 5LKZA 5DYAA 4QC1A 3P1EA 5FH8A 4GPJA 5CUBA 5CRZA 3P1CA 5DBMA 2YW5A 4YBMA 4Z1SA 5EPRA 4O75A 3U5LA 2DVRA 5IGMA 4TT6A 5DKDA 4MR4A 2RFJA 4YYGA 3AQAA 5DKCA 5G4SA 2RO1A 4LYSA 5CPEA 2E7OA 5A5QA 4QSUA 4QUTA 5KTWA 5A5NA 5BT4A 2RNYA 3LQIA 4UYFA 5F25A 3HMHA 5DYUA 3DWYA 3S91A 4TU4A 4UIXA 4QSVA 4CUTA 4RVRA 2YELA 5A5OA 5DW1A 3P1FA 4F3IA 1JSPB 3LXJA 2KTBB 5FE3A 4KV4A 4YYJA 4HXOA 4MEPA 5KTXA 4PY6A 4YYIA 4HXMA 5F3AA 4LRGA 4NRCA 5A82A 4CUPA 4MR3A 5I7XA 5BT3A 3TLPA 4YYKA 2D82A 3AADA 5FE9A 4IR5A 5LJ2A 5E9LA 5EM3A 4TTEA 4O7BA 5D3LA 4UITA 5CQ6A 3QZSA 4QEWA 5HFQA 4UIZA 5I86A 4HXSA 4IR3A 3FKMX 5HM0A 5CQ7A 5FE8A 2I8NA 5E0RA 1N72A 5FFWA 2DWWA 3UVDA 4QC3A 4NR7A 4TZ8A 5HEMA 5L98A 5AD3A 5F60A 5ACYA 5D3NA 4O7FA 4PS5A 4ZC9A 2MJVB 5HELA 5G4RA 5L96A 4MR6A 4N4IA 4C67A 4O7AA 5IG6A 5F1HA 4O78A 3K2JA 4QB3A 5HRWA 4BHWA 5EU1A 5ENFA 3U5PA 3SVFA 4MEOA 4NS5A 4LDFA 4HBXA 4Z6IA 4HBVA 5I88A 4KCXA 5CQ5A 5C7NA 5CQTA 4NR5A 4HXNA 5EWWA 5HFRA 4CUSA 4IOQA 2L85A 4XUAA 3O36A 4UYGA 5HENA 2LSPB 3SVHA 4OUFA 5I83A 3O34A 5J0DA 4XYAA 5I7YA 2YQDA 5CFWA 5CUGA 5A5PA 4LR6A 4E96A 5FE2A 3JVJA 5H1TA 5HLSA 4HXRA 1EQFA 4J3IA 5FE1A 3O37A 5F1LA 5F62A 5COIA 2L84A 4QR5A 5CP5A 4HBWA 4QZSA 3G0LA 3MULA 5E9VA 4FLPA 4J0RA 5E3DA 2YEMA 3D7CA 3QZVA 5EP7A 4QEUA 1E6IA 4NR9A 5E9MA 1WUMA 2R10A 4X2IA 5AMFA 4WHUA 5ENIA 4C66A 4UYFB 4QSTA 3GG3A 4CL9A 3IU6A 5D0CA 4IR4A 4MR5A 5DX4A 3MXFA 4YAXA 4O76A 4CLBA 5ENHA 5ENGA 4QR3A 5F5ZA 4CURA 5BT5A 4QR4A 5LUUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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