5HQPA

Crystal structure of the erp44-peroxiredoxin 4 complex
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
181
structure length
181
Chain Sequence
LSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVSPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFEHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/chaperone
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Crystal Structure of the ERp44-Peroxiredoxin 4 Complex Reveals the Molecular Mechanisms of Thiol-Mediated Protein Retention.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 50
structure length 181
sequence length 181
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5hqpA00
5IIZA 2GDRA 3QFAC 3CTFA 1TRVA 2DLXA 4YQVA 4NV5A 2FCHA 4GXZA 4MF7A 1FOVA 4Q5RA 4I8BA 3ERWA 5GAPD 4BL7A 5ECQB 1EP7A 1OYJA 1RK4A 4JR6A 2HFDA 4MJEA 4OCFA 2GTUA 3LEFA 3GX8A 1AQWA 1GL8A 6GSWA 3QAGA 5DCHA 3QPMA 4ZL7A 2BMXA 5CP1A 4YAVA 5ECRB 2H01A 2HYXA 2HT9A 2HI7A 1XVWA 3VWWA 2YJ7A 3US3A 3ZTLA 1S3CA 1YY7A 4POBA 1QXHA 4HQZA 1JZWA 1MDJA 3IRAA 4IJ3A 2ALBA 1F2EA 1DSBA 4WR4A 3RPPA 3CMIA 1JZOA 5LNKe 4IP6A 1TRWA 4WBJA 5G5EA 4L5OA 1XWAA 5CRGA 4EF0A 4MJAA 1Y25A 4XHMA 3DEXA 2CZ2A 3LQ7A 2TRXA 3GIXA 3GH9A 3HVSA 1EZKA 4ECBA 3FHKA 1KNGA 1PKWA 2GZYA 3KD0A 2XC2A 1FHEA 1B9XC 1OVNA 4PURA 2MYGA 2HE3A 1SJ6A 4OO5A 2NDOA 1GSEA 3KJYA 3HDCA 3MDKA 3J7Yk 3GYKA 4L0UA 1Z6MA 3JCML 5D73A 4GSTA 2DC5A 4TXVA 1UN2A 1H75A 4ECIA 2B5YA 4LL4B 3EWLA 3IBHA 3LXZA 5DAKB 4F03A 5EY6A 2N5AA 1WP0A 3I9V2 4POMA 3U6VA 2F3MA 3TKPA 3HVVA 2JACA 4H86A 4KH7A 5A4VA 1U3IA 1QMVA 2OBKA 3F6DA 1ZL9A 5D9VA 1UVZA 2CZ3A 4RQXA 2KP1A 2LJKA 1MD3A 5DALA 3MAKA 4L5LA 4IBPA 3KIJA 4ZBBA 4IP1A 1M2DA 3QAVA 3UIWA 1N2AA 4PQHA 3HY2A 3WD6A 3O6TA 1BX9A 1W4VA 3RHCA 2WJUA 5G5FA 1T7PB 2TRCP 5LD0A 3DVXA 2J23A 4JR4A 2VL2C 1AQVA 3TRXA 1AAZA 2G0FA 4TR0A 1F37A 1SJZA 2OADA 2GZPA 1Z9HA 2ZCTA 3WGEA 2EC4A 4MABA 4TRXA 3PINA 4WEYA 4PQIA 3NOFA 4LA1A 3W6GA 4MJBA 1X9MB 4V2LA 3APOA 3O3TA 2DSAA 1ABAA 1Z6NA 4EE0A 3NZNA 2H1AA 3GFKA 2V32A 2FWFA 4EDZA 2FD3A 3RAZA 5HFKA 2GS3A 1R4WA 1XWKA 3HJPA 4TKYA 4F9ZA 2OJLA 3UVTA 3UARA 1UC7A 5KN2A 2WCIA 4TXOA 2OKAA 4TR1B 2DJJA 1CQGA 1TI1A 2I81A 4IHUA 2RM6A 4ZB8A 3DGQA 3CRTA 1LBKA 5ECSA 1XWBA 1MEKA 4JBBA 3IPZA 2CAQA 4V2MA 5G2ZA 3Q19A 2YV7A 2H19A 3GKKA 1V98A 4FIWA 3GKNA 4BWQA 2I4AA 3N9JA 2FWEA 1J0FA 3H1NA 2YZHA 1R26A 3KCMA 5LCZA 10GSA 1GTBA 3W8JA 2HRFA 3FEUA 1GNWA 1K0MA 3H8QA 2GQKA 4TW5A 3F3QA 1SD8A 2VCWA 3C73A 5FT3A 1GSUA 3ME8A 1OC3A 4HUAA 1O8XA 3GSSA 4K7OA 2VCZA 13GSA 3IDVA 1O81A 1DBYA 4NPBA 2GZZA 1WE0A 2QGVA 2VIMA 2H66A 2OE0A 3VI5A 1UA5A 1G7OA 1XZOA 2H1BA 1FO5A 1MDKA 1QGVA 5F07A 3MNGA 3GMFA 1FAAA 3BCKA 2B7JA 4DSRA 5IPGA 1HYUA 5H5QA 5DALB 1VF1A 2MMOA 3HA9A 3HYPA 1EOHA 1GLQA 2O87A 1X9WB 1TXXA 3TKRA 3GTUA 1IYIA 1F6MC 4JZQA 3LXTA 2H1DA 1T00A 2NPBA 4ZB6A 2RIIA 5D9XA 5HR1A 1A23A 1PQNA 3A2VA 5A5KA 2ZUPA 2H72A 2GSQA 6GSSA 3DD3A 3D6IA 1OE7A 4ECCA 1X0RA 5EPFA 1A2MA 4Z7XA 2GLRA 2DJ1A 5AISA 2H75A 2GVPA 1RQMA 4Q5NA 2FY6A 1OKDA 1X5CA 4KSMA 4MDCA 1GUHA 2LJAA 4WETA 4Q5QA 2D2ZA 2P31A 1Z3EA 2HNLA 5D96A 1EEMA 3LSZA 2CX3A 3IAM2 2LRTA 4O7HA 4QL9A 2WZ9A 2CVKA 1ON4A 4X1UA 3EU3A 2I9HA 2O89A 2JZSA 1PGTA 1SJIA 4PUFC 1WRYA 2B6MA 2VAFA 3KP8A 5H5RA 2AJQB 1OAZA 1U6TA 1ZCPA 1Z5YE 1K0OA 1K3LA 2GSSA 4IKHA 3PGTA 2LRCA 4G9HA 2R4VA 4RQRA 1FB0A 5HFIA 4IVFA 3O76A 4DSSA 4QL7A 2O7KA 5H5SA 4WXTA 1XCCA 2K6VA 2DIYA 2CQ9A 5HFGA 3P7XA 2OE3A 4BWSA 3LGCA 3LYKA 3HVXA 11GSA 4K8MA 1VF4A 4IQAA 4HU7A 3APSA 2RM5A 4TOPA 1EOGA 3FKFA 1U87A 5HR2A 1ERVA 3EMXA 2C0GA 4K7IA 1M9BA 4XIHA 2PPTA 4ILFA 1FVKA 2RUFA 2EIQA 2H8LA 2LRNA 3K8NA 1SK1A 1O73A 3CSHA 4EDYA 1K3YA 4OD7A 2QSIA 2LTKA 2J9HA 1R7HA 4KCEA 2HSHA 1A2LA 5DAKA 2JL4A 3ZIJA 1SL1B 2C3NA 4YH2A 4V2NA 1M99A 1K0AA 2MMAA 1HNAA 4K0NA 4PUAA 4NXIA 3G9BA 2DBCA 1S3DA 4I6XA 3GTUB 5J4UA 3GKMA 4LMVA 1TK5B 2JSYA 2L5LA 1YDKA 1XW5A 2MMNA 5AIVA 5HR3A 1XIYA 1PL1A 2CVDA 4E8HA 1MTCA 1G0TA 1GH2A 3F3RA 3L9VA 3KEBA 3V1WA 2C0EA 2YNXA 3W8SA 4TR3A 2LS5A 3KH7A 4N0VA 4HZ2A 3GHAA 4HDEA 1JFUA 3CTGA 3HCZA 4AJ7A 1XWGA 2YWOA 1MD4A 1F3AA 1E2YA 2LEGA 4MF5A 3FYGA 2VCVA 1XW9A 5E4WA 3TOUA 4G10A 1NHYA 4ISDA 4HEA2 2YCDA 2PU9C 3QDNA 4PGTA 16GSA 2H0IA 3GL5A 1F9MA 6GSVA 2LNSA 2IWTA 5B6MA 2C0FA 1PSQA 3LJRA 1S3AA 4CDOA 5IOXA 1A8LA 2HZEA 3A2XA 4NHZA 4KE3A 3TDGA 4NWYA 1YZXA 1SU9A 3F9UA 4HS1A 4L8EA 5IPHA 2YWIA 1XXUA 2K9FA 4DSSB 2YV9A 4TR1A 2CV4A 2E2MA 5F0GA 5JWRB 3DRNA 4L0WA 2M80A 2HSYA 1T3BA 2H0HA 4KAEA 2VM1A 2VCTA 2LSTA 4IS0A 3ZMLA 2RUEA 2YWMA 4D73A 1T1VA 5ABRA 3GRXA 1GLPA 1HNCA 1XBSA 1A0FA 2H74A 3HD5A 2CVBA 4ECJA 3UEMA 2MZCA 2H0GA 4KDYA 1GTIA 1TW9A 2X8CA 4TN8A 3DVWA 5ECMB 1ZYEA 4AJ6A 3S9FA 1GSYA 3GUSA 2VO4A 5F8BA 1LU4A 1GULA 3QMXA 1VF2A 3EINA 3ZLPA 3L9UA 3FY7A 5J9BA 4WF4A 2H30A 3C7MA 2V2GA 2B5EA 1KBNA 2R37A 5DJLA 3L78A 1SK0A 4V1Ag 3RBTA 2MBSA 1PL2A 2N5FA 3DXBA 2FNOA 3VLNA 3P8WA 1YEXA 3P90A 6GSTA 1SYRA 4N10A 2JZTA 3ZVJD 4HQSA 4PX1A 1EV9A 3UAPA 3EMPA 3D22A 3G7IA 2O85A 5ECIB 3G7YA 2WS2A 1SL2B 2IMEA 3ISOA 2KOKA 2OA7A 1EP8A 1A2JA 1I9DA 6GSXA 2ES7A 5IMDA 2TIRA 2B5XA 4TVEA 2H70A 5KN1A 3MWHA 4J57E 9GSSA 2YZUA 3ZITA 3FRCA 5IMAA 2F8AA 4YAPA 2K8SA 1B8XA 3RDWA 3KGKA 2PUKC 1PA3A 5FHIA 1KEBA 1J9BA 2C0DA 1SD9A 5ECLB 2CA8A 5CREA 2XPDA 1A8YA 1O6JA 5B6NA 4DVCA 1SKSB 1TI3A 4PXOA 1W89A 4WF5A 5ECOB 2A2RA 3SBCA 3GKXA 1NSWA 3WT1A 2HZEB 3SWLA 4OCEA 3Q6OA 5HQPA 5D9TA 3F0IA 1JLWA 1I5GA 1K3OA 1OKTA 4GF0A 2F51A 3U5RE 3NIVA 2AB6A 4MZCA 4EXJA 4BVXA 2IPAA 3UBLA 1V2AA 2I1UA 1PRXA 1ERWA 2PVOC 5C00A 1K0DA 1V40A 3LYPA 2PGTA 2H6XA 1AIUA 4XTSA 1GUKA 4D73B 2JU5A 2P5QA 3KMOA 1BYEA 4IQ1A 4MPFA 2VM2A 3KH9A 1WOUA 2HZFA 3FK8A 5HR0A 4PQ1A 3VWUA 4XS6A 2FWHA 2VCXA 4MF6A 3VURA 4GCIA 1GNEA 3EU4A 4KCAA 2FWGA 2RLIA 4KDXA 1Z7RA 5KN3A 3QR6A 4XS1A 3L0HA 4Q5FA 1M2BA 2IJYA 3L4NA 3F63A 3IR4A 3GH6A 14GSA 4RUVA 1OC8A 5GAND 3EVIA 1BAYA 4XS4B 5KN0A 2GQMA 2VL3A 2VLUA 1TKDB 3HHVA 4I2TA 2HLSA 4K9ZA 2OE1A 4IGJA 1NHOA 4ZBAA 4DSQA 3GV1A 4OFTA 1CQHA 5CRWA 1Y6EA 1VGLA 3WT2A 3WYWA 3FZAA 5D9WA 5KEJA 3ZREA 1M0UA 3GNJA 4EVMA 3DMLA 1YEPA 1B48A 5ECNB 1SYXA 1GTUA 3LFLA 3QAWA 3BJ5A 4AGSA 3E0UA 2E7PA 2X8HA 5ENUA 4HJMA 1X9SB 1XPVA 4OO4A 3UOMA 5G30A 3KZQA 2PMTA 4PNGA 3TJFA 1DE2A 3FR3A 4P3YB 5AN1A 4LMWA 3M0FA 2LKUA 3D5JA 1TRSA 3VFIA 4OFMA 2LQOA 2CAIA 1YKAA 4NV2A 1ZOFA 22GSA 3BBYA 2LV3A 4I97A 2K18A 4ACSA 4FO5A 4IN0A 2FUG2 5DQSA 3RPNA 1QK8A 2IMKA 2N5BA 2PVQA 3E9JB 4OMVA 2LQQA 1Q4JA 1JZRA 3TRPA 3IOSA 2WB9A 4O92A 4CHSA 3IC4A 1USBA 1NW2A 5GSTA 1BG5A 2AUVA 2V1MA 1GUMA 3TJJA 3BCIA 5CAXA 1PKZA 5JCUA 4V1Ap 3ZFLA 1V9WA 5IOWA 2VCQA 3GL3A 5A4WA 4KUNA 4WKWA 1URMA 2X99A 1ZZYA 1YQ1A 3EC3A 1NM3A 3IV4A 4YQUA 3LORA 4KDUA 4YQMA 2H6YA 2VD0A 2LNTA 4BA7A 2YANA 3D4TA 2DMMA 4HZ4A 1G7EA 3C8EA 2EIRA 3UJ1A 2OBIA 3AY8A 3KM6A 3ED3A 5ECKB 1GSFA 2IIYA 3C1RA 3ZZXA 2K8VA 2KLXA 4N11A 4RI7A 5B7CA 4FH8A 4CW9A 3GX0A 4J2FA 4F2IA 5B8AA 2YN1A 5DJMA 4ID0A 1M7TA 4ULXA 5CO3A 4ZL9A 1O7UA 2FA4A 3TJKA 3BOAA 2WDUA 1A0RP 4X0XA 6GSUA 1XOAA 2JSZA 4EL1A 5D8IA 2AAWA 2QC7A 4ZB9A 3TKSA 3VWVA 3H4KA 4GSNA 3EE2A 5J3RA 4POLA 5G31A 1XFLA 2P5RA 4IELA 4GRFA 4RI6A 4HU9A 2DJ2A 2GGTA 5DBQA 2ON5A 1ACVA 17GSA 1K0BA 1JZDA 2XBQA 3I6AA 1OE8A 4OFNA 3GURA 5IM9A 4MP4A 2WULA 4F0BA 1FW1A 5ECHB 1THXA 3DWVA 3TOTA 3TCOA 3KP9A 4I5QA 4AF2A 3WGDA 4XRAA 2XHFA 3A3TA 5CNWA 1M9AA 2M46A 3GSTA 1GSDA 3IE3A 4K2DA 5IO0A 2FA8A 2BTOT 2H73A 4HI7A 4J56E 5B8BA 2DIZA 4XCSA 5JWOB 5EL8A 3DIEA 2IMFA 2FGXA 1IYHA 2IFQB 2KHPA 2REMA 3UL3A 1YKCA 2C4JA 3ZFBA 3ERFA 5ID2B 3J7Yb 3CSJA 3LWAA 5CRDA 2B3SA 2PWJA 1PD21 1G6WA 2O8VB 3IAS2 5DQYA 5GSSA 2VOCA 5J5NA 4MZWA 1YF1A 2XBIA 1M2AA 1VRSD 1XW6A 3M9JA 5F06A 2KUCA 2VL9A 5IQYA 2R2JA 4KGIA 3HZ4A 1TTZA 2AV4A 2F8FA 1GRXA 3H93A 3D0ZA 5G1KA 1O85A 1B4QA 3EURA 5INYA 3IA1A 4EUYA 3TKSE 2X64A 3ZRDA 3TKQA 2G2QA 2R6KA 1AUCA 1EV4A 4GWRA 3UMAA 2H1GA 1C72A 2DJKA 2A2SA 2IL3A 2VUPA 1ST9A 1B9YC 1XOBA 2HRNA 3BD2A 4KX4A 4EKZA 3E3EA 4ZBDA 2R3XA 2IMIA 3WGXA 1OC9A 4ZILA 5AIXA 4GSSA 3PH9A 3A2WA 4KB3A 5ELGA 3F4TA 1FVJA 4FYBA 4EC0A 1ML6A 3I43A 4XS4A 1V58A 1TOFA 5AGYA 3KXOA 2MBTA 4O5RA 3EYTA 1BEDA 1K0NA 1TJDA 2P0GA 5C04A 1WPIA 3HJOA 1Q98A 2L6DA 3F8UA 5A4UA 19GSA 3QOUA 2Z9SA 1F3BA 5JCGA 4ML6A 4OWYA 5COHA 4JE1A 3C1SA 3ZIVA 3FZ9A 4WR5A 1WWJA 2NTOA 12GSA 1G6YA 3G7JA 3KTLA 2ON7A 3UBKA 3CXGA 5D93A 3ZYWA 2EIOA 3PR8A 4POKA 1AC1A 2LUSA 4TR4A 4KSOA 3VPQA 1BQ7A 3ZMKA 1YF0A 3D4MA 5IO2A 4HJ2A 4MPGA 2L5OA 1T4YA 1AW9A 3RHBA 1TDIA 3VI7A 7GSSA 4MA9A 1TRUA 2CT6A 5EVOA 1ZYQB 3UVHA 4K7NA 5L71A 3FR9A 3TGZA 4AJ8A 2PERA 5J9CA 2B1KA 1V57A 4KW6A 4X43A 2HXKA 3FW2A 3H79A 1GSSA 1HQOA 2YP6A 18GSA 3M3MA 4I2UA 4K6XA 4LLRA 3DKSA 3VWXA 4PNFA 1ERTA 4ZXGA 2IN3A 3IHQA 4NHWA 3F4RA 3GA4A 2L57A 3ME7A 3IK7A 3L9SA 2YPMA 3HKRA 3F4SA 1EGOA 2H71A 1AXDA 1EWXA 3OR5A 4KNDA 5G1LA 4DEJA 5ELAA 3R2QA 1R5PA 2LJRA 4XRDA 1WJKA 4MH3A 2H6ZA 1GWCA 4IJIA 4JEDA 2XPEA 4LL1B 4G2EA 1O8WA 3TKSC 1R5AA 2ZNMA 4QQ7A 4GQFA 3ERGA 1ILOA 1EGRA 5GZZB 4N30A 3IXRA 1SL0B 1K0CA 1WIKA 1PMTA 3HZ8A 1TK8B 1LJRA 1THOA 2JADA 5E59A 4F0CA 1TU8A 1VF3A 4FYUA 1OC9B 3VPTA 1WMJA 2WFCA 3IK9A 2DJ3A 1GSQA 3LG6A 1FB6A 4EO3A 2C3QA 2GQLA 2V6KA 3TJGA 3M8NA 2E0QA 5DCGA 3P2AA 2YOIA 5IMVA 1JHBA 2FHEA 2B1LA 4GTUA 5JWQB 1RW1A 5J41A 6GSYA 4NMUA 1ERUA 1N8JA 1E6BA 1HD2A 2FLSA 1MDIA 1EEJA 1SENA 4BVYA 1J08A 2E2GA 3TJBA 1T8EB 3DYRA 4ML1A 5CYYA 3CSIA 2VLTA 3ZL5A 1PN9A 1XVQA 4MZBA 3M9KA 1SKRB 2L6CA 1JLVA 4HOJA 3VK9A 1X5DA 2BJXA 2C1YA 2GSRA 1X5EA 3KTBA 1PX6A 4GLTA 4BPYA 1U88A 1BJXA 2V6OA 2YWNA 2WGRA 3ZVJA 1YJ6A 3A5WA 3TB2A 2KP2A 4FYCA 4K1FA 4G19A 2IMDA 4N0ZA 3TUEA 4MCUA 1Z7PA 1T4ZA 1QFNA 1TP9A 2AYTA 1DE1A 1GTAA 4MK3A 4ZL8A 1SK2A 2C80A 4JRRA 4MLYA 3M1GA 4NAXA 2IFQA 2CX4A 4K0GA 5FWGA 2NVLA 4MH2A 1A24A 5ID2A 4IW9A 2B7KA 2VD1A 5CRHA 2L4CA 2MMZA 2A4VA 1SKWB 2L4QA 2VLVA 1PX7A 5F05A 4TXOB 2C3TA 2L59A 1TK0B 2GT5A 2H76A 4F82A 3QCPA 2OACA 5JCWA 1U3AA 2QKEA 1B4PA 4JU5A 3MSZA 4GQCA 4ZIJA 2VL2A 3FZ5A 3CRUA 3APQA 8GSSA 2YJHA 5IMCA 3I69A 2R5GA 1ZGNA 2C8UA 4MMMA 3CYNA 2V41A 2M72A 4WBRD 2I3YA 3FZ4A 5IMZA 5IMFA 2GT6A 5DVBA 1KTEA 3HJMA 1GP1A 3C71A 5ECPB 3KMNA 3Q74A 2NBSA 1QUWA 2DMLA 3CBUA 2WRTA 2AHEA 1H4OA 1HNBA 2GSTA 1TU7A 5DDLA 3HXSA 1DUGA 3TRQA 4E8EA 3D21A 1AQXA 3FR6A 4MJCA 1XWCA 3GN3A 1QQ2A 2DJ0A 4KA0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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