The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
TFVALYDYESRTETDLSFKKGERLQIVNNSEGDWWLAHSLTTGRTGYIPSNYVAPS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
|
| publication title |
Crystal structure of the intertwined form of the Src tyrosine kinase SH3 domain T114S-Q128R mutant
rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
|
| total genus |
6
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2016-02-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JS0 A; 2FPF A; 2EKH A; 1ABQ A; 2D1X A; 1K0X A; 3SEM A; 4JJD A; 1FYN A; 1WXB A; 3PE0 A; 4J9H A; 1PWT A; 1NYG A; 2KXD A; 1GBR A; 2JMC A; 1JO8 A; 2AKL A; 2ROT A; 1AD5 A; 4CC4 B; 1OV3 A; 1WIE A; 2CH4 W; 1NM7 A; 2DLP A; 4RTZ A; 2KRM A; 1GFD A; 1E6G A; 2ED1 A; 2C0I A; 1RLQ C; 2VWF A; 1A0N B; 4LUE A; 1KIK A; 1Z9Z A; 5FWB A; 3QWX X; 3SHW A; 1N5Z A; 2IIM A; 2DBK A; 1U3O A; 1I1J A; 3M0U A; 1NG2 A; 1YN8 A; 1YWP A; 2YUO A; 4CC2 A; 2JT4 A; 1T0J A; 2LX7 A; 1H3H A; 2EGE A; 2EPD A; 4ZNX A; 4Z89 A; 1G2B A; 1K76 A; 2FRY A; 1WX6 A; 1UHC A; 1OOT A; 2ENM A; 4RTY A; 4AFZ C; 1AOJ A; 2CUD A; 2YUQ A; 1WDX A; 3H0H A; 3U23 A; 1AWW A; 1AWJ A; 2M51 A; 1U5S A; 2V1R A; 2O9V A; 1VYT A; 2F2W A; 2DL7 A; 1JXO A; 4JZ3 A; 1NEB A; 1QCF A; 2CRE A; 4FSS A; 3R6N A; 4LN2 A; 2C0T A; 3JV3 A; 1PNJ A; 5FWC A; 1Y57 A; 3M0Q A; 1KJW A; 2F2X A; 2RF0 A; 2ABL A; 1WXU A; 2G6F X; 1X2K A; 2YSQ A; 2KBT A; 2EGC A; 2EW3 A; 2L3S A; 2L3P A; 3EG1 A; 2RQT A; 4AFQ C; 2J06 A; 1E6H A; 1M3B A; 2DM1 A; 1UG1 A; 2SEM A; 1E7O A; 2C0O A; 5GJV B; 3QWY A; 2DX1 A; 2NUZ A; 1HJD A; 5IHN A; 1TUC A; 1SHG A; 1KSW A; 2JM8 A; 2A37 A; 2GTJ A; 2LMJ A; 2DRM A; 1QWF A; 4GBQ A; 3EHQ A; 4DEX A; 4RUG A; 1RI9 A; 1W1F A; 2KYB A; 3VS1 A; 1SSH A; 2RQR A; 3PVQ A; 1SEM A; 2YUN A; 1AZE A; 4J9C A; 2YUP A; 1JQQ A; 1X27 A; 2HSP A; 4K11 A; 1NLP C; 3THK A; 2E5K A; 1RLP C; 4D8D A; 3I9Q A; 3VS6 A; 1YNZ A; 1IO6 A; 1JXM A; 2KRS A; 3RNJ A; 1EFN A; 3VS5 A; 4RTV A; 2LJ0 A; 1I07 A; 1SHF A; 4Z8A A; 2EVR A; 1QLY A; 2RPN A; 2A36 A; 2FPE A; 3M0S A; 1BB9 A; 3I35 A; 2F2V A; 4QT7 A; 1ZUU A; 2EYW A; 2EQI A; 2LNH B; 2RQW A; 2DL5 A; 1UUE A; 2DL8 A; 3H0F A; 2K2M A; 1GCQ A; 1NYF A; 5IHK A; 2PTK A; 2ROL A; 1CKA A; 5L23 A; 2HCK A; 1AVZ C; 2CDT A; 2DYB A; 1ZUY A; 2CUB A; 2OJ2 A; 1BBZ A; 1S1N A; 4E6R A; 2DIL A; 2P4R A; 2ESW A; 5I22 A; 1B07 A; 2LZ6 B; 1G83 A; 2JMA A; 1J3T A; 2FG0 A; 1TUD A; 4OMO A; 1ZX6 A; 1NEG A; 4JJC A; 1UGV A; 2D8J A; 2DE0 X; 4R0K A; 1BU1 A; 2HDA A; 2RNA A; 1ZBJ A; 1KFZ A; 2BZ8 A; 4ORZ A; 3UF4 A; 1UDL A; 1B3Q A; 3NGP A; 4F16 A; 2X3W D; 1OPL A; 2DL4 A; 4IIO A; 4F17 A; 1Z9Q A; 1MUZ A; 2KE9 A; 3FJ5 A; 1QKW A; 4OMQ A; 3VS3 A; 1X2Q A; 3I5S A; 2JXB A; 1UHF A; 1JU5 C; 4J9B A; 1K9A A; 2GQI A; 2GGR A; 2K79 A; 3TSW A; 2FO0 A; 2J6O A; 2SRC A; 3VS4 A; 2ED0 A; 2K7A A; 2VVK A; 2O9S A; 4OML A; 3KFV A; 1ARK A; 1UE9 A; 3NPF A; 2DBM A; 2EYY A; 2DF6 A; 1PHT A; 3RBB B; 2A08 A; 2RMO A; 2AZV A; 3GBQ A; 3EGU A; 2KNB B; 2KEA A; 3H41 A; 4JJB A; 2HEQ A; 2J05 A; 2KRN A; 4X1V A; 1X6G A; 4HXJ A; 1AEY A; 2HBW A; 4JPB W; 1QKX A; 5IXB A; 1H92 A; 1AWO A; 1TG0 A; 3VS0 A; 2J7I A; 4J9G A; 1UJY A; 2BTT A; 1QWE A; 4Z88 A; 1YP5 A; 1K1Z A; 4HVV A; 2I0N A; 2CSI A; 3I5R A; 2JTE A; 4LE9 A; 1LCK A; 2YT6 A; 1YWO A; 1PRM C; 4OMP A; 2RQU A; 2FRW A; 5GJW B; 3CQT A; 5IHI A; 3IQL A; 4OMM A; 1X43 A; 1GCQ C; 2LQW A; 3H0I A; 5EC7 A; 1U06 A; 4D8K A; 2ECZ A; 2DMO A; 1RUW A; 4ESR A; 2D8H A; 4J9D A; 2M0Y A; 2JM9 A; 2KT1 A; 4WCI A; 2QDL A; 3EHR A; 2EYZ A; 4RTW A; 2JW4 A; 5ECA A; 1X69 A; 2W10 A; 4J9E A; 3O5Z A; 1M8M A; 2X3X D; 1BK2 A; 4A63 B; 1Y0M A; 3VRY A; 4M4Z A; 4CC7 A; 2DVJ A; 1UEC A; 4AG2 C; 5I11 A; 2J6F A; 2EBP A; 2LCS A; 1GFC A; 2AKK A; 2K6D A; 1CSK A; 3M0T A; 2L3Q A; 1PRL C; 2PZ1 A; 1VYV A; 1M30 A; 1M3A A; 2W0Z A; 2KT8 A; 4J9I A; 1T3L A; 4Y92 A; 2PNI A; 1W70 A; 2MOX A; 4RTU A; 2B86 A; 4AFU C; 1PKS A; 2DL3 A; 3VS2 A; 1VA7 A; 2DNU A; 1T3S A; 2CSQ A; 1UTI A; 3M0R A; 2GNC A; 3REB B; 3NHN A; 2D0N A; 1SPK A; 2RN8 A; 1YCS B; 4RTX A; 3ZL7 C; 1SRL A; 2LQN A; 1T0H A; 1OEB A; 2EYX A; 2J6K A; 2EGA A; 2O2O A; 2L2P A; 1PKT A; 2LP5 A; 5FW9 A; 4EIK A; 3TVT A; 2DA9 A; 1ABO A; 2H8H A; 2MIO A; 2O88 A; 2YDL A; 1VYU A; 3EG2 A; 1MV3 A; 4KRT A; 1GBQ A; 2KR3 A; 2GTO A; 2O31 A; 3VRZ A; 2A28 A; 2KXC A; 1HD3 A; 3ULR B; 1X6B A; 2FPD A; 1MV0 B; 1M3C A; 1K0S A; 4J9F A; 1M27 C; 3M0P A; 3PVL A; 1GL5 A; 3UA6 A; 4HVW A; 2BZX A; 2KYM A; 2AK5 A; 1UJ0 A; 1ZLM A; 4HCK A; 3C0C A; 5IXF A; 2MCN A; 1CKB A; 3UA7 A; 2CT4 A; 1W6X A; 1HSQ A; 3UAT A; 1FMK A; 4OMN A; 1WXT A; 3EG3 A; 4HVU A; 2GBQ A; 3REA B; 3TSZ A; 5HCK A; 1K4U S; 2VKN A; 1OPK A; 3VS7 A; 2JS2 A; 4AG1 C; 1AZG B; 4IIM A; 1H8K A; 1ZUK A; 1AWX A; 2FEI A; 2RQV A; 2OI3 A; 1WA7 A; 4LUD A; 4RTT A; 1GCP A; 2LJ1 A; 2OAW A; 1GRI A; 3EG0 A; 2LJ3 A; 4CC3 A; 2L0A A; 2CT3 A; 2KRO A; 1UFF A; 1JEG A; 2V1Q A; 4AFS C; 1XOV A; 2XMF A; 3NMZ C; 3A98 A; 1SRM A; 1WYX A; 2K9G A; 4F14 A; 2DJQ A; 2DRK A; 1V1C A; 4DEY A; 4LNP A; 2CH4 A; 2K3B A; 1WLP B; 5IH2 A; 4GLM A; 1WI7 A; 4JZ4 A; 2AZS A; 1ZSG A; 2KGT A; 1I0C A; 1WFW A; 2NWM A; 1NLO C; 2BZY A; 3LH5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2FPF A; 1QVF P; 4M78 G; 1ABQ A; 1NPP A; 2DEU A; 1ZSZ C; 1Q7Y C; 3SEM A; 1WXB A; 3PE0 A; 1R77 A; 4E7H A; 3OS0 A; 1PWT A; 2BUD A; 1KD1 R; 1JO8 A; 2AKL A; 2ROT A; 1M8V A; 4JS5 A; 1YHQ Q; 1WIE A; 3EGD B; 1O75 A; 1SG5 A; 1E6G A; 3OS5 A; 3G4S T; 2QA4 Q; 1Q7Y R; 1B34 A; 4LUE A; 5FWB A; 1RAG B; 2PVD B; 3JCM c; 3CCR T; 4C8Q B; 4LDW A; 3JCM b; 5GMK l; 3NTH A; 2X9H A; 1SSF A; 4BI8 B; 2HKN A; 3C12 A; 3QJY A; 1YN8 A; 4FSX A; 3G6E A; 2KI7 A; 4BB7 A; 2HAX A; 1H3H A; 4Z89 A; 3EGD A; 3J81 E; 4PKC C; 4E7Z A; 1UHC A; 3QKJ A; 2YHT A; 1VQ8 A; 4E47 A; 2V1R A; 2XI9 A; 5CKD A; 1VYT A; 1NPR A; 3V8J A; 1M1K C; 1Y7X A; 2HSE B; 4M7A C; 3C94 A; 4L6V 5; 4C8Q A; 5LJ5 e; 4X9D A; 3MEV A; 2C0T A; 3QII A; 3AT1 B; 3CC7 A; 1N9R A; 5GAN 6; 1M1K R; 4EDU A; 1Q7Y U; 1PM3 A; 1S72 A; 5GMK j; 2G6F X; 1X2K A; 2KBT A; 2COY A; 9ATC B; 5GAN 4; 1E6H A; 4M77 F; 1M3B A; 4V2S A; 2SEM A; 1XQH A; 2C0O A; 5I21 A; 3QWY A; 3G6E T; 3M54 A; 2QEX T; 5IHN A; 8AT1 B; 1SHG A; 4J7I A; 1H64 1; 2A37 A; 2LMJ A; 1QWF A; 4L5G A; 1KQ1 A; 2ZZD A; 4PJL A; 1W1F A; 2KYB A; 4FT2 A; 2QK0 A; 2E3I A; 3VS1 A; 5GAM e; 1IGU A; 2PUO B; 1SEM A; 4IUT A; 2YUN A; 1AZE A; 2NUP B; 2YUP A; 3JCM h; 2HSP A; 4JDS A; 3FIF A; 4M75 F; 5CKB A; 4KH1 B; 2QQB A; 2YLB A; 3CEY A; 4D8D A; 4LDV A; 3JCM g; 1QVG S; 3NTI A; 3HTR A; 5L8R E; 2ZPB B; 3EH1 A; 1IO6 A; 1JXM A; 1OU9 A; 1X6O A; 2OAU A; 3MJX A; 3OYN A; 1MND A; 2EQK A; 3VS5 A; 3LW5 E; 3CMA A; 1PCX A; 4N0A A; 3OYL A; 4RTV A; 1G3W A; 1YFN A; 1S72 T; 2RHZ A; 1M1K U; 1SHF A; 2G3R A; 2RB6 A; 4ELY C; 4JLI A; 1WNL A; 2CP6 A; 4XU0 A; 4C8Q D; 4NL3 A; 4XTU A; 2NUP A; 3OBY A; 4QT7 A; 1ZUU A; 1MHN A; 3DLL A; 5D7U A; 4MDX A; 2KAF A; 3RIR A; 2RJD A; 3H0F A; 1ZA1 B; 4XTZ A; 5I2S A; 5IHK A; 2ROL A; 1W4S A; 1MMN A; 1ZUY A; 2OJ2 A; 4M77 G; 4FL6 A; 4E6R A; 5I22 A; 1VQ9 Q; 2JMA A; 5C0M A; 3BFM A; 4E7J A; 4QVC A; 1NEG A; 2YXY A; 4JJC A; 1UGV A; 5DY9 A; 3CCM T; 2RI5 A; 1U1T A; 3OYC A; 2HDA A; 2RNA A; 2D6F A; 1YCY A; 2XG8 D; 4XU3 A; 4KGV B; 3CMA T; 4F16 A; 4M75 G; 3OW2 S; 2X51 A; 4HT8 A; 1QKW A; 4NOY A; 3VS3 A; 4FM4 B; 3SD4 A; 3CC4 Q; 2JXB A; 1UHF A; 2OTL Q; 3CME A; 2K79 A; 4M78 E; 4C0D B; 3X20 B; 4MML A; 2VVK A; 2JJ9 A; 5IN1 A; 2CGH A; 3V8K A; 1MNE A; 3LH0 A; 1VQM Q; 1PG5 B; 4J5Y A; 3P8D A; 4ZGJ B; 4C5G A; 5DM7 R; 2RMO A; 2A0F B; 3EGU A; 3LWI A; 3VYH B; 2WSE E; 4B9X A; 3H41 A; 4OGC A; 4JJB A; 3CCS A; 2GFA A; 1D1B A; 3A8O B; 4RCC A; 4F7U B; 5LJ3 d; 5IXB A; 1K73 R; 4ATO A; 4J7F A; 1TG0 A; 4X34 A; 3VS0 A; 2BTT A; 3S3M A; 4MZT A; 2I0N A; 2CSI A; 4LE9 A; 1QVP A; 4D6W A; 5A0L A; 3CXC P; 3MO8 A; 4GLK A; 2EFI A; 3CQT A; 1ZBX A; 1JBM A; 4X9C A; 1BI3 A; 1VQ6 Q; 1G8X A; 5EC7 A; 4JS4 A; 4D8K A; 3GLX A; 2COZ A; 1BIA A; 2D8H A; 2M0Y A; 2KT1 A; 1WHK A; 3MEU A; 2EYZ A; 4OGE A; 4RTW A; 4F7U A; 3LWH A; 5ECA A; 2OTJ A; 1M8M A; 1RL2 A; 1Y0M A; 1FMV A; 4HCZ A; 4ZN1 A; 2X4J A; 3VU3 C; 4DBF A; 4EMK C; 4M78 D; 2F5T X; 2HL5 C; 3OYD A; 4OF1 A; 2DIG A; 1BI1 A; 2EBP A; 2YRD A; 1GFC A; 2AKK A; 2K3Y A; 3CCS T; 2PZ1 A; 1VYV A; 2LQK A; 1H3Z A; 4HCB A; 1TS9 A; 3OMG A; 2KT8 A; 1T3L A; 4OB1 B; 4C92 B; 1EIF A; 3CCR Q; 1TTH B; 4PNO A; 4RCB A; 3E1S A; 1QVG P; 1T3S A; 2DNU A; 2CSQ A; 1UTI A; 1B7T A; 4EMH A; 2HQE A; 3CCQ Q; 1C0M A; 2ZGW A; 3JAM E; 1Q81 C; 1YCS B; 3ZL7 C; 2IPO B; 2LCC A; 1VQ4 T; 2LQN A; 2DK3 A; 2EYX A; 4TVR A; 3X26 B; 1WZO A; 1OQK A; 2O2O A; 2E1H A; 4EIK A; 4BE1 A; 2H8H A; 4C8Q F; 1M1G A; 3AHU A; 2OTJ T; 4C92 A; 4KRT A; 2L3R A; 3C95 A; 2KSS A; 2QXF A; 2D9T A; 4M77 C; 4E7I A; 4LDX A; 1MV0 B; 4QW2 A; 2E41 A; 3QPH A; 3TEE A; 2FZK B; 1XJW B; 3NTK A; 2RI3 A; 3EFR A; 3JCM X; 3CCL Q; 5GMK h; 3A8G B; 2E5Q A; 1RI0 A; 2MCN A; 1CKB A; 1YIJ A; 1IRX A; 3I56 A; 2D0Q B; 2CP0 A; 2H3E B; 3REA B; 3TSZ A; 3RER A; 2M1H A; 1ZUK A; 2LQ8 A; 2DD5 A; 1D0Y A; 4Y91 A; 2FEI A; 4DBR A; 2OI3 A; 5KYU B; 2Y4Y A; 4M77 E; 4LUD A; 4OVA A; 1YBY A; 2EQU A; 1VQ8 Q; 2VV5 A; 3PMI A; 2LJ3 A; 1I5O B; 4QVD A; 4P5N A; 4A4H A; 1N6A A; 1UFF A; 4ANJ A; 4ELZ C; 1KQS A; 4AFS C; 5D6Y A; 2DXC A; 5LL6 S; 4XTY A; 2KMT A; 1SRM A; 3EFS A; 1C6V X; 2VGN A; 5FRN A; 2YRC A; 3KXT A; 2DRK A; 5A2Q E; 4BDY A; 3OSV A; 2K3B A; 3CC7 Q; 2PVO B; 4C8Q G; 1ZSG A; 4M75 E; 5KYU A; 5LJ3 f; 1YIJ T; 3I56 T; 3VUB A; 2D1X A; 5LJ5 j; 1LJO A; 5GAN 2; 1FYN A; 4KGX B; 2NYS A; 4O6J A; 3X25 B; 2M16 A; 3FRN A; 4E7K A; 1OV3 A; 2MF2 A; 2CH4 W; 1IZ6 A; 2KRM A; 1GFD A; 4C5E A; 3HSB A; 1VQK A; 4BY6 C; 2ED1 A; 2RI2 A; 2RH2 A; 4UC4 A; 4BAC A; 2VWF A; 4GY5 A; 2K4Y A; 4ZGE B; 2KDS A; 3A8M B; 1Z9Z A; 1YJ9 A; 2YRV A; 3GIB A; 1VQ7 A; 2IIM A; 1I1J A; 3M0U A; 3UWN A; 4FCY A; 3CPW A; 1NG2 A; 1YWP A; 4RG8 A; 4IUV A; 1KHC A; 4CC2 A; 3OYM A; 1T0J A; 3RES A; 2LX7 A; 2EPD A; 1W2B A; 4ZNX A; 1WPY A; 3CMA Q; 1I8F A; 2FRY A; 1WX6 A; 2RD1 A; 5GAM j; 5M9O A; 5GAN d; 4MMK A; 4XTW A; 3V7R A; 3H0H A; 1AWW A; 3U23 A; 1MMA A; 2M51 A; 5GAN 5; 5CVI A; 8ATC B; 1FWZ A; 1YJW A; 1JXO A; 4BUG A; 3WXM B; 1NEB A; 1LNX A; 2CRE A; 4BI3 A; 3JCM V; 2RO0 A; 5A0G A; 1JJ2 P; 4M75 D; 3JSC A; 2JNG A; 4ZN3 A; 1VQK T; 3H9N A; 5FWC A; 5J26 A; 1FXX A; 4BI4 A; 2GQV A; 1JB0 E; 1YJ9 T; 1YI2 A; 2EGC A; 1Y07 A; 2L3S A; 1VQ7 T; 4PJO B; 2RQT A; 2AT1 B; 3JCM W; 2DM1 A; 4A4K A; 3WVD B; 5GJV B; 2DX1 A; 2MK5 A; 2X4Y A; 2B8A A; 1HJD A; 3RMS A; 1TUC A; 4OMF B; 1KSW A; 2E65 A; 2JM8 A; 2GTJ A; 2E10 A; 2DRM A; 3EHQ A; 3OYI A; 3BE3 A; 2DET A; 2RJF A; 3BDU A; 2O01 E; 3PVQ A; 1YJW T; 3MP1 A; 5GAN 3; 1KD1 C; 4J9C A; 3URG A; 1NLP C; 3L42 A; 1N9S A; 4PJO A; 2COW A; 3CME Q; 2DO3 A; 5FU7 C; 5CAI A; 3I9Q A; 4F04 B; 3VS6 A; 2RHI A; 3M59 A; 1YNZ A; 2K57 A; 3CCV Q; 2KRS A; 4NL2 A; 4F7U F; 3VV0 A; 1VQP Q; 2PUK B; 1XNI A; 1NJI C; 3OYB A; 1VOM A; 2F69 A; 2XDD A; 2EYQ A; 1BCM A; 1YI2 T; 4Z8A A; 2PU9 B; 1QLY A; 2FZG B; 2DXU A; 1ZSZ B; 4LDU A; 3I35 A; 2F2V A; 4J8O A; 3M58 A; 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