5I2NA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with n-ethyl-7-{[2-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-2-methyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 29)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nA02
3PMXA 3MVZA 3UK4A 3C4MA 4O3CA 3VVEA 4MH5A 4YKJA 2OCUA 3TYHA 3K01A 3Q29A 3M8UA 2DS9A 1VFEA 1IZ1A 1A7LA 3SEXA 2ALUA 1IEJA 3O29A 1MRPA 2O51A 3HO7A 3JYRA 3OO7A 3OXNA 4F29A 3H06B 3RT6B 3FXUA 3KN8A 1MPCA 4F2OA 3D4GA 3MQ9A 4OWDA 3TCHA 3GBAA 3B6TA 4FATA 1QUJA 4MF3A 3RY3A 4YKIA 5HM4B 3AXFA 1MXWA 1R1NA 3EN3A 4N13A 3IB0A 3FJMA 3TFLA 3PD8A 3H6UA 3O6HA 4Z7EA 1OMPA 3UIFA 3FASA 5AA2D 5HBCA 3F11A 3DP8A 2ZYOA 2I6EA 5DEXB 1MDP1 1NH7A 4WXJA 5TPAB 1SQYA 1B05A 4JXIA 2GFEA 3MVXA 3CG1A 4AB5A 3E4RA 1D9VA 1GV8A 1MQJA 4C0RA 2Z8DA 4DCXA 3OSQA 4NEDA 3V8XB 3MUQA 2UVJA 3O28A 4E0WA 1USYE 3CIJA 1N0TA 4ELRA 1JQFA 2OJTA 3T9UA 2XX8A 2ZYMA 4DDDA 1MQDA 1XT8A 1JW1A 5DVJA 3B7DA 4KI0E 1OIBA 3K1PA 3K1MA 2QS3A 3MP1A 5K2XA 1QUIA 3SDFA 4QFNA 4NF8A 2UYFA 3EHUA 3RGYA 2XD2A 1BTJA 2XD3A 4H0WA 1B51A 4EXKA 4HW8A 3SEVA 4WEPA 1SVXB 5H8HA 3K2DA 4RPNA 2Q8JA 3SEUA 3RLFE 2ANJA 3KOTA 1LAXA 1FCKA 4BDQA 1Z7ME 2THIA 3K4UA 3PUWE 2V84A 1Y1ZA 2Y7IA 1MY4A 3OMBA 4DLDA 5KDTA 1Y3QA 4YKPA 4JBZA 3TDJA 4QFLA 5CBSA 2OWTA 3CSGA 2Y7KA 1SD3A 2RC9A 3H6VA 5B70A 4BDLA 2HAVA 1NKXA 2DXYA 1QUKA 4PFYA 3WAEA 1B5JA 1MQHA 3M3KA 1FTOA 1LAFE 1ZTYA 3PMWA 1H76A 2E1SA 4I9DA 3O6GA 4ZEDA 4GQOA 1URDA 2F6GA 1N84A 4FEDA 3T9HB 2R6GE 3O2AA 1D4NA 4R73A 5M2VA 2O1LA 4U1ZA 3E9XA 4NWDA 5AA2B 1BP5A 3KG2A 4KR5A 3T93B 5DEXA 3IOVA 3IX1A 3KJTA 3LUYA 5J1DA 5TPAA 3K6VA 1ZIUA 3I5OA 3TTKA 1MXYA 4XKRA 5H8NB 3RUMA 3MW0A 2G93A 2GH9A 1FQCA 5L9SA 4AQ4A 1I6AA 2IEEA 2QJEA 1B5IA 5DVIA 4IY6A 4PQJA 3H6WA 1EZ9A 3MZ1A 5ICTA 5FHMA 4F3PA 4O3AA 3N94A 4MLVA 2I58A 3EF7A 4OESA 4GXSB 4F1VA 5CBRA 1MH4A 3IL1B 3KSXA 2B3BA 1TFAA 3THIA 2O7IA 2ABHA 1B1HA 2X26A 2DWHA 1EZOA 3KZGA 1MS7A 3Q25A 4Q5TA 3KFMA 4IO3A 1I69A 4G77A 4FORA 2VOZA 3A3CA 1MY3A 5K2YA 1A54A 1Z7NE 1LBCA 1ZBMA 1NH8A 2X7QA 2XXPA 4X9TA 4K3FA 3W9VA 4F1UA 3KOSA 4R74A 1EH3A 2RC8A 4ZECA 4HTGA 5L9OA 3SERA 3V5AA 3IOTA 3TEPA 4I8CA 3C35A 3ONMA 5H8QB 3A09A 1LB8A 4ZS9A 5AA4A 1B7ZA 1AH5A 3USDA 2O7UA 5H8NA 3G3FA 1LLSA 1GGGA 3QAXA 3MWBA 1PDAA 1FQDA 3TCFA 3G3JA 3QIMA 1ZMGA 1P1NA 5HPQA 1FTMA 4IGTA 3BFTA 3PPOA 1PB8A 3MZ9A 2Q88A 1P1QA 4WKMA 4G68C 3UGWA 4POXA 4R2BA 1MY1A 3OEKA 4XKNA 1MY0A 4U4SA 4XTCQ 4RK9A 3CFLA 2I3WA 2CMOA 1XS5A 3PPPA 4X1BA 4N07A 3CSBA 4IGRA 4UACA 3QYTA 3ZSFA 1B5HA 2RC7A 5EHSA 1DTZA 3KN3A 3PMVA 1SBPA 1IIWA 1LAGE 1PB9A 3MVWA 1B7HA 5TP9A 4FECA 3TQWA 3OO6A 1ZKBA 2PX1A 3U92A 3TELA 1VSOA 4TQUQ 4F3SA 3N6UA 1US5A 2UXAA 5ISUA 1S50A 3TTNA 3B6WA 2PYYA 4H6DA 3P7IA 3S9LC 2XHDA 3RNNA 4EQBA 4G8MA 2VP1A 3SETA 5EHMA 4I62A 1R6ZA 3PUVE 5ELVA 2XXVA 4F3GA 1ELJA 1MY2A 5A5XB 3U8QA 2ZNSA 4YZZA 4LA9A 4OHNA 3OELA 2VGQA 1L5TA 5H8QA 3VFJA 1JW4A 4RA1A 4Q8RA 4JWXA 5ITOA 3MBPA 1HSEA 3K6XA 4R9GA 2GHAA 1R9LA 1JEUA 2D5WA 2V3QA 2NVUB 5AA3A 1N3XA 5I59B 4I1DA 3Q28A 4TLMB 2XXQA 1LB9A 3HN0A 1OQHA 4U1OA 1OVTA 3TAJA 4TOZA 3PGFA 1YAEA 3PU5A 4MLQA 2PT1A 1FW0A 4DE8A 2QL3A 2Z8EA 4DCYA 1BLFA 1H43A 1O64A 3DP4A 4GL8A 1QULA 3S9EA 4P0IA 1DPEA 5JEIA 2AIXA 3Q27A 3PPQA 4HCYA 3WAFA 5IAIA 2A5TB 2W7YA 3EHSA 4Q0CA 4DZ1A 5H8FB 1J1NA 3ZKKA 1CE2A 4NF5A 5DT6A 1SI0A 3IO6A 4U21A 3ILTB 4C1TA 4KHZE 5I2KB 1T0KA 4RXLA 3G3GA 3TTLA 4LVQA 1DPPA 2I0CA 4H5FA 5CMBA 2H98A 4OMBA 4QSDA 2ZXTA 5A5XA 1WDNA 4L17A 1ANFA 1SYIA 1NNKA 3TQLA 3FUZA 4ISUA 3TZAA 3K1NA 4OFOA 3IR1A 2ZNUA 2OLBA 1O63A 3K02A 2O84X 2QS1A 1B52A 1F9BA 1AMFA 5I58A 3S9NC 3IORA 2XXWA 2QS4A 3OO8A 2M8CA 2I49A 2I4CA 1UTBA 4RK2A 4EQ7A 2F6PA 4BDNA 3FVKA 3C36A 2V25A 1JNFA 3GBBA 4P11A 3RQTA 1Y9UA 1OVBA 3Q26A 1P1OA 5JTYB 4DIGA 1NL5A 3O9PA 2DXRA 1O7TA 2O68A 3D4CA 3ECRA 4KYSA 3LSLA 2HCAA 3TUSA 4RPOA 2XXHA 1SW2A 1B46A 5I84A 3OENA 3H3GA 1BKAA 1I6QA 2YPNA 4JB7A 3HCQA 1MXVA 4F19A 2F7CA 3L6GA 1EZPA 3LC8A 4KQPA 3S4UA 5F7VA 5H8FA 4QHQA 1NMUA 4U23A 4NTLA 4DXBA 4QSEA 2RF1A 3V83A 3N5LA 3VE1B 1AL3A 3T96B 3GLBA 4KCCA 5I56B 3VV5A 3PV0E 1S9TA 3DM0A 3IOUA 3PUYE 3C33A 3MPKA 4LQ5A 1II5A 1A40A 1MM6A 3G7WA 1UIUA 5BWJA 4IO2A 4YMAA 4GWOA 4LQ2A 2RKMA 2Y7WA 1GVCA 4G4PA 4OZ9A 5FHOA 1SYHA 5CM6A 1PB7A 4QF9A 2ZYNA 1XVYA 4NMYA 1M5EA 3IOWA 1LFIA 3FJ7A 4R75A 4MBPA 1GR2A 2AL5A 4EXLA 2I48A 4ECFA 2XXRA 4GLIA 1ZLQA 4EF1A 1SW4A 3FV2A 2FYIA 1WODA 2DSFA 1JEVA 2DE2A 4LONB 1NNFA 3OOAA 2OK2A 1QJMA 3TKDA 4QFKA 4H8JA 1B0HA 4IO5A 4GF8A 2Y7PA 4NF4B 1LGBC 2UYEA 5ICQA 3K0VA 2Y84A 3C9HA 3T22A 4ZZAA 5CMKA 1NNTA 5CMMA 3TMGA 4THIA 4OEVA 2ESNA 3UA8A 1URGA 3OEMA 4ONYA 3GZGA 1A8EA 2HAUA 3H4ZA 5EYFA 2H4IA 4OXVA 4PP0A 1A8FA 1VFDA 1TXFA 2Q2CA 2IA4A 4BLAA 5KZTA 5I56A 3O66A 1MDQA 1JW5A 3VXCA 2H99A 2O69A 4LZ8A 3R26A 1D3KA 2HZLA 5AA2A 4AB6A 1SI1A 1OQGA 1RYOA 2NXOA 2REGA 2ZMBA 4R9FA 2WKYA 4IO4A 1B4HA 2DWAA 2ZYKA 3MC2A 5DVFA 2A5SA 3LBSA 2FA7A 1B32A 1VR5A 4G68B 3OD7A 1Y20A 3RT8A 2Z23A 4JSDA 4BDMA 2UVIA 3VVFA 1B58A 4PE5B 3W15C 4NF4A 5ITPA 5BUUA 3LSXA 5L9MA 4TLLB 1IQ7A 2HFBA 4U2RA 2F7BA 1SW1A 4XXUA 1XVXA 1LFGA 4U22A 1MQIA 2QMWA 3VVDA 1YTVA 3HSTA 3B6QA 4FAJA 1MXXA 2Z8FA 2F5XA 4OVJA 1N76A 4LZ7A 3N6TA 2O1MA 3CRBA 2X7PA 3A3UA 4OQOA 1JVYA 3G3IA 3HHFA 1PBPA 3T9XB 2DOJA 2UVHA 2HZKA 4E0XA 1LBBA 2RINA 4ELQA 1H45A 1MPDA 1JVXA 4R72A 5L8DA 2FNCA 3EQ1A 1MH3A 4GVOA 4LUBA 3O6IA 3PUZE 4KCDA 2PT2A 2GRVA 4F31B 3FJGA 3CFZA 1AOVA 1QVSA 2BJJX 2V3TA 3IJOB 2ONSA 1OLAA 4YB6A 1MXUA 4POWA 3H03A 4YICA 1LFHA 4ESWA 2F97A 3IK6B 1AIVA 1B1XA 4F1YA 1N7WA 2E0SA 2DE3A 1B40A 3SESA 5CC2A 2QPQA 1RYXA 3QUJA 3MVYA 4OERA 3KN7A 1UIVA 3FGSA 4G8NA 4OEUA 4YAHX 5KCJB 2DYXA 1N7XA 2DWJA 1M5FA 1B3EA 3C31A 3QK6A 4GIZA 3EHTA 3VLUA 1H44A 4KFQA 3SEYA 1FTLA 4ZEFA 3UP9A 1M5BA 4ZEBA 4R6KA 2DVZA 4NF8B 2HQ0A 2Y7RA 3G3KA 1B4ZA 2VHAA 4QFOA 2VD3A 3RTWB 1MG1A 4FJPA 3I6VA 5H8HB 4IO7A 4JWYA 1YCJA 5FHNA 3PPNA 1M5DA 4YMBA 1YPNA 2RCAA 2V93A 3KJ7A 4JWOA 5DTBA 1B2HA 1H3DA 5KDTB 4ZDMA 4R6YA 3T9VA 1LCTA 1P99A 3CI8A 5FTHA 3QXMA 1IITA 3CVGA 3RTFB 4O3BA 4X48A 4DXUA 3MJNA 1LAHE 1NFTA 4DXCA 1N04A 2AYSA 5F1QA 3CR9A 2I3VA 4NF6B 3MP8A 3RN8A 2H9BA 4LZ5A 4Z0IA 5I59A 2Z22A 3JZJA 3ZKLA 4X1DA 1I6BA 2F35A 3UN6A 4ZEIA 4YB5A 2F7AA 3GXAA 1LSTA 2D21A 3VLVA 3L6HA 4F39A 1B3FA 3C32A 4KYDA 5H8SA 3U1OA 2YJPA 5KCJA 2F36A 1US4A 1ZJLA 1M5CA 3ODBA 2ZNTA 1Y1MA 5IKBA 4XKPA 4ELPA 2OBGA 2DP8A 4HS7A 3TODA 1IXIA 3KGCA 1DSNA 2RCBA 1VE4A 4NE4A 1NNPA 2CZLA 4QFPA 2A5TA 4EQ9A 3FIRA 2Q2AA 1PBQA 4F3BA 1Y3NA 1HSLA 1B7UA 3G3HA 1R9QA 3IO4A 3OSRA 5I2KA 3K6WA 4ZZEA 1B3GA 4YU0A 3UORA 4QSCA 3I3VA 3IAZA 1UQWA 1N3WA 2DQVA 1PC3A 3E3KA 2QMXA 4H5GA 4YB7A 1Q1KA 1D9YA 1EU8A 3U72A 2OZZA 3SEWA 4PETA 4ZE9A 1ATGA 2NWJA 2P2AA 3OO9A 1MXZA 3MPLA 1MPBA 4OETA 4IY5A 4NF6A 3SKPA 1B6HA 3U93A 1MM7A 3K00A 3R7XA 5AA4B 4KPTA 3H7MA 4BDOA 4C1UA 1Q35A 3FXRA 1SDXA 4G2ZA 4JDFA 3FATA 3HHGA 5TU0A 5JTYA 1TFDA 1IXHA 2HXWA 4M4GA 1POTA 3MZBA 2DE4A 1B9JA 4KYEA 4IO6A 1S7YA 3BBRA 4OTEA 2XXYA 4GL0A 3E13X 3DLNA 2P1SA 2PVUA 5DYHA 4NWCA 3QUFA 4BDRA 1LCFA 3O97A 2XX9A 4FEBA 1BIYA 4N6PA 3LR1A 4OYVA 3EPEA 2PMSA 5CMCA 3FV1A 3FVGA 3TCGA 2XX7A 4GFRA 3PUXE 4YKKA 1FQAA 1XC1A 2HEUA 2ONKE 5I57B 4EUOA 3K6UA 4XIGQ 3LSWA 2G29A 1FQEA 2R9JA 2I4BA 2XXUA 5TP9B 2XXIA 5JK4A 1P1WA 3BKIB 2YLNA 5I2NB 5FTIA 1SW5A 2VD2A 4OFJA 1FQBA 3ILUB 2F34A 2D3IA 3MP6A 4ELOA 1B3HA 3MAMA 4WEDA 4EDPA 1UTHB 1PEBA 4U4XA 1RKMA 3KBRA 3S2VA 4KD5A 2NUVA 3FVOA 2DVCA 4LATA 1XOCA 3M3LA 1OLCA 5LOMA 1FTJA 3TTRA 4G8HA 2Q9TA 3FXQA 3IB1A 1DTGA 1Y4TA 1MQGA 3W9WA 3TTMA 4PFTA 3T66A 4M1VA 3TPAA 4ESXA 2B65A 4R6HA 4QRZA 2B3FA 3VDFA 3LSFB 3QSLA 3U94A 5CI5A 3V89B 3IB2A 1GTKA 4GXAA 1QKBA 3FZVA 3KEIA 2NOOA 4RYAA 3VLWA 4F22A 2QS2A 1FQFA 4GOTA 3HPIA 2ONRA 3FD3A 3N26A 2O6AA 3CFXA 1QW0A 3FVNA 2PBWA 2Q89A 2R71A 1ZU0A 1XHYA 4P0GA 4Q30B 4H67A 4EF2A 1QKAA 1POY1 4H1XA 1IXCA 3BFUA 2V3UA 3HV1A 2H5YA 4XKQA 2AL4A 1TWYA 4GD5A 3PD9A 4F18A 2QRYA 2F8DA 4FE8A 3DP6A 5I57A 2KLFA 3M3FA 1HSJA 2F78A 4OENA 1Y3PA 2UVGA 1CB6A 4PFUA 1A55A 3PPRA 3RPWA 1IUDA 3DELB 5AE4A 4NF5B 4ND9A 3IJXB 4IB2A 1DOTA 5I2NA 1B3LA 4PFWA 2OWSA 1URSA 1FTKA 4RNSA 4RJZA 1JETA 1KWHA 3VXBA 2LAOA 2I0BA 2XXXA 5B7DA 1DMBA 1USYH 4ZEKA 3ZS6A 1TT1A 4UA8A 2H25A 4H8IA 2REJA 1UTHA 4RY1A 3CG3A 2P0SA 1Y4CA 2XXTA 1IXGA 4R2FA 5CRYA 1P1UA 4FIMA 3C34A 5I58B 4GRKA 4G68A 1B0LA 1A99A 1UTBB 3R6UA 4JSOA 3JV9A 5AA1A 3H6TA 4H65A 1WVJA 2DWIA 2GHBA 4ZE8A 4HCWA 2QSXA 4F2QA 4LP2B 3KSJA 4MFIA 4OFLA 3S9MC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PMXA 3MVZA 3UK4A 3C4MA 4O3CA 4MIJA 3VVEA 4MH5A 4YKJA 2OCUA 3TYHA 3K01A 3Q29A 3M8UA 2DS9A 1VFEA 1IZ1A 3KBZA 1A7LA 3SEXA 2ALUA 1IEJA 2HHMA 3O29A 1MRPA 2O51A 3HO7A 3JYRA 3OO7A 3OXNA 1DCUA 4F29A 1KZ8A 3H06B 3RT6B 1EYJA 3FXUA 3KN8A 1MPCA 3B50A 4F2OA 2Q74A 4H46A 5IZZA 3D4GA 2WX9A 5EYHA 3MQ9A 4OWDA 3TCHA 2CEXA 3GBAA 3B6TA 4N15A 4FATA 1QUJA 4MF3A 3RY3A 4YKIA 1FPIA 5HM4B 3AXFA 1MXWA 1R1NA 2CEYA 3EN3A 4N13A 3IB0A 4PFIA 3FJMA 3TFLA 3PD8A 3H6UA 3O6HA 3U65A 4Z7EA 1OMPA 5EQ7A 3FASA 3UIFA 5AA2D 5HBCA 3F11A 1FPDA 5EQ9A 3DP8A 1FSAA 2ZYOA 2I6EA 5DEXB 1MDP1 1NH7A 4WXJA 5TPAB 1SQYA 1B05A 4JXIA 2GFEA 3MVXA 3CG1A 4IR8A 3E4RA 4AB5A 1D9VA 1GV8A 1MQJA 1AWBA 4C0RA 2Z8DA 4DCXA 1NUYA 3T1BA 3OSQA 4NEDA 3V8XB 3MUQA 2UVJA 3O28A 4E0WA 1USYE 3CIJA 1FBGA 1N0TA 4ELRA 1JQFA 2OJTA 4HE1A 3T9UA 5J16A 2WBDA 2XX8A 4XEQA 4X04A 2ZYMA 4DDDA 1MQDA 1XT8A 1JW1A 5DVJA 3B7DA 4KI0E 1OIBA 3K1PA 3K1MA 2QS3A 3MP1A 5K2XA 1QUIA 3SDFA 4QFNA 4NF8A 2UYFA 4GWYA 3EHUA 3RGYA 2XD2A 1BTJA 2XD3A 4H0WA 1B51A 1KA0A 4EXKA 4HW8A 3SEVA 3MSTA 4WEPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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