5I56A

Agonist-bound glun1/glun2a agonist binding domains with tcn201
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
288
structure length
286
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 286
sequence length 288
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i56A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i56A02
1MXXA 3OXNA 4YB5A 3QAXA 4TLLB 5H8HA 1B0HA 5CBRA 2YLNA 1IXCA 4N6PA 2UYEA 3H7MA 4F1UA 1RYXA 3UGWA 4GOTA 1TT1A 3CFXA 3K00A 1EZPA 1R9LA 3EQ1A 3KOSA 1LSTA 1LCTA 5H8QA 1H43A 4OFOA 4OWDA 5F1QA 3H06B 1NNFA 1YAEA 4GF8A 2A5TA 4PP0A 1B32A 1Y3QA 3A09A 4FJPA 3RLFE 3KOTA 2O69A 4EQ9A 3EHTA 3DP8A 3VLVA 1P1UA 4ZECA 3MP8A 3VDFA 3B7DA 3FXQA 5H8NA 4LQ2A 3PUXE 3G3GA 3HPIA 3GBBA 1LGBC 4E0XA 4OERA 1FTMA 1MM6A 4H1XA 5JK4A 2QL3A 4Q30B 3LBSA 2VD2A 4I8CA 1Z7NE 3CR9A 2Z8DA 4EXKA 2CMOA 4KPTA 2NOOA 1POTA 2ZYMA 5AA4B 4OTEA 4QHQA 3G3HA 2Q2AA 3PD8A 4F18A 2QS2A 1A54A 4FATA 2Y7RA 3RN8A 1FQDA 4EXLA 4EDPA 5AA2B 4IO7A 1NH7A 1NNTA 2XXYA 1MRPA 4EF2A 3IOVA 5AE4A 3FD3A 3LSLA 4ZE8A 3K6XA 3L6HA 1BLFA 2QS3A 2O6AA 5IAIA 3LR1A 4R75A 2REGA 1FQBA 1YTVA 3CSBA 3HHGA 1VR5A 3C34A 4F3GA 1SW5A 4PETA 4N07A 1R1NA 3S2VA 1LAXA 4QSCA 4IO6A 4KFQA 3IAZA 3IOTA 3PD9A 3ILUB 2OLBA 4DXBA 2D21A 1LAFE 2AL4A 3K2DA 2Z8FA 5I84A 5EYFA 2AL5A 3FVGA 1O7TA 2VP1A 2XXVA 5I59A 1Q1KA 4YKIA 4FEBA 4QSDA 4DCYA 5CRYA 5JTYB 3C36A 2PBWA 4XKPA 2Z23A 3PPRA 2Q89A 3UP9A 3OSQA 1IIWA 4F29A 2PVUA 1MY0A 1QJMA 3PU5A 4LZ8A 1YCJA 1ZJLA 4RPNA 3MZ9A 1N84A 5ITOA 1P1OA 4LATA 2Z8EA 3FVOA 4H0WA 3JYRA 3TTRA 4ELQA 4F2QA 2V3TA 1PC3A 1NNKA 3M8UA 3GBAA 2XX8A 4L17A 3G3KA 5CMCA 1MY4A 3EHUA 1LFIA 3OOAA 3ZKKA 1FTKA 1VE4A 4U1ZA 2OK2A 3S4UA 3H6UA 2F7BA 3DELB 4GWOA 4RJZA 1DTGA 3HSTA 3MJNA 1SYIA 1ANFA 2I49A 3TQLA 3D4CA 3I3VA 2HFBA 3V8XB 3RT6B 1EZ9A 3FASA 3TEPA 3DP4A 1MXYA 4AB6A 4QFKA 2Y7PA 1PB8A 2DP8A 1MQHA 4QSEA 2THIA 3ZKLA 4F3SA 2I6EA 2I0CA 3GZGA 3QIMA 3SDFA 1EZOA 4GQOA 3VLUA 3UIFA 2FNCA 1JQFA 4MLQA 2NWJA 3CFLA 1IITA 3SERA 4U4XA 3T9XB 5DTBA 4PQJA 5KDTA 4FE8A 4FECA 4DCXA 2RCAA 1OQGA 1CE2A 2H25A 1ZIUA 5H8FB 4F19A 3VLWA 5EHMA 5K2XA 5TPAA 1M5CA 1XHYA 1O64A 1SW2A 1ZU0A 3TCFA 4O3BA 3G3JA 1A8EA 4F39A 2QS1A 1B51A 3MPLA 4RK2A 1P99A 3QUJA 5KCJA 1USYE 4GVOA 3I6VA 1AL3A 4OFJA 4NE4A 1B7UA 3Q29A 4M1VA 1M5EA 4HW8A 1URGA 5CMBA 1IXIA 4RXLA 4ESXA 2X7PA 3F11A 1AIVA 2HCAA 4DE8A 1FTLA 4OQOA 3CI8A 1B7ZA 2W7YA 2XXUA 3QYTA 1D9YA 5M2VA 1QW0A 1FQEA 1FQCA 1OVTA 3DP6A 3OELA 1MY2A 1B3FA 1B3HA 4RPOA 4YKJA 1SDXA 4GXAA 3OEMA 4JDFA 4PFUA 2DE2A 1Y20A 1AMFA 3B6WA 1L5TA 4AB5A 3T66A 2RC8A 3C9HA 2YPNA 4ZEIA 3MWBA 4GXSB 5I58B 4EQBA 4DDDA 1R9QA 1SYHA 1B6HA 4U4SA 1B5IA 1IQ7A 4WKMA 5CI5A 1MH4A 5L9OA 4KD5A 2RC7A 1B4ZA 2H5YA 2F35A 2XXIA 3KBRA 1AOVA 1B3EA 3VV5A 4Q8RA 5AA3A 1OMPA 3IJXB 2Z22A 3BKIB 3PMXA 5CMKA 4ESWA 3MZBA 1QUIA 5DEXA 3PMWA 4F31B 2H99A 3HN0A 5CC2A 3RNNA 2HZLA 2F78A 4NF4A 4Q5TA 2B65A 1B3LA 2I0BA 1SW4A 3FJGA 5I2NB 3KSXA 5JEIA 3R7XA 2HEUA 4R9FA 1M5BA 3MZ1A 2F34A 3OENA 3D4GA 3TYHA 3ECRA 4LA9A 1POY1 1XS5A 1B58A 1GR2A 2PYYA 5ITPA 4R6HA 3K6VA 3IORA 3FV2A 4NWCA 1SVXB 2Y7KA 3UK4A 4XXUA 3O6HA 2OWSA 3MVWA 2O7IA 3O9PA 1BP5A 3C35A 5FHMA 4OXVA 4DXCA 3M3FA 4X1BA 5I56B 1LB9A 4H5FA 4NMYA 2HAUA 1FTOA 3IOWA 3UA8A 2KLFA 4PFWA 3K6UA 1NL5A 5H8QB 1IZ1A 5HPQA 4YMBA 1A7LA 5DYHA 4RNSA 2QMWA 3EF7A 4H6DA 1TFDA 4F2OA 3PUZE 3LSFB 1ZMGA 1H44A 2BJJX 2HZKA 1CB6A 1H45A 2FYIA 4TLMB 3SETA 2OJTA 4OEVA 2O51A 3O6GA 4HCWA 3HHFA 3THIA 4I1DA 1A55A 1I6QA 2DXRA 2OZZA 1Y3PA 3PPNA 1ELJA 4MH5A 2VGQA 4BDQA 3H4ZA 4ZEBA 3FIRA 4OMBA 3MPKA 1SBPA 2DWJA 1MQDA 2E1SA 5TU0A 3CFZA 2V3UA 4FIMA 3PGFA 3KN3A 1MH3A 4LZ5A 5AA4A 1I69A 1J1NA 1B1HA 1B2HA 4RA1A 1S7YA 3RGYA 2ZNUA 4OESA 1LFGA 4RY1A 2P0SA 1B46A 4NF5B 3KSJA 4R6KA 2Q8JA 4ZE9A 2HAVA 1KWHA 3M3LA 4ELOA 1GTKA 1ZTYA 1NMUA 1Z7ME 1B40A 3H03A 1O63A 2B3FA 3DM0A 2DVZA 3JZJA 4U23A 3RTWB 2V25A 5I2KB 5ELVA 5TP9B 4LZ7A 1Y3NA 4DZ1A 4F3BA 3TMGA 4O3AA 2I4BA 1T0KA 4KCDA 1P1WA 4TQUQ 1USYH 4I9DA 2VOZA 5A5XB 1YPNA 2Q9TA 1RKMA 3C32A 4YB6A 2Q2CA 1SD3A 2HXWA 1OVBA 2D5WA 2F97A 4ZDMA 4PFTA 3R26A 5F7VA 4OENA 2ZXTA 3TTLA 3MQ9A 3C31A 4KCCA 3PV0E 5JTYA 2H98A 3DLNA 2H9BA 4ELPA 3OMBA 2NUVA 4C0RA 3EPEA 3V83A 4BDOA 1DMBA 3CSGA 3MBPA 3N6UA 3ZS6A 1H3DA 2D3IA 4F1VA 2UVGA 4DIGA 3V89B 1Q35A 1F9BA 1B9JA 4I62A 1N7WA 2UYFA 2O84X 3W9VA 4EF1A 4RK9A 4ZEKA 4ECFA 4R74A 2ONRA 4G77A 3AXFA 3O6IA 3N6TA 2RCBA 3TCHA 3IL1B 4ISUA 3LUYA 4OYVA 3IB0A 4C1TA 1MM7A 4IO3A 2UVIA 1UTBA 3RTFB 1PB7A 1I6AA 4H8IA 4RYAA 1BKAA 4EUOA 4G8NA 3QSLA 3TODA 2I3VA 4GL0A 2XXHA 3VXBA 3UORA 1US4A 1JVXA 3PUWE 1JW4A 3VXCA 3Q27A 4GFRA 1MDP1 3KN8A 2DE3A 2GHBA 1II5A 1UTHB 1VFDA 5BWJA 1EU8A 2I4CA 3FV1A 4OZ9A 2P1SA 4PFYA 2RINA 3SKPA 1PDAA 4H8JA 3BFTA 3BBRA 5H8SA 3OO9A 4ZEFA 4Z7EA 1N3XA 4YU0A 1SI0A 4YZZA 4PE5B 1MDQA 4E0WA 3IK6B 4GD5A 3E13X 5KCJB 1N3WA 4IB2A 3HO7A 4YAHX 3MC2A 2DWHA 1QKAA 4IGTA 3MP1A 5I57B 2I48A 1QULA 4WEPA 3IR1A 4JSDA 4X48A 4YB7A 2DE4A 1D4NA 4LUBA 3WAEA 1NFTA 4XIGQ 4K3FA 2UXAA 3T22A 2Y7IA 3USDA 1PBPA 1AH5A 3TAJA 3PPOA 2H4IA 1LBBA 2F7CA 3T96B 1N04A 4JWOA 3K1PA 1MY1A 3CG1A 3P7IA 5L9SA 4NWDA 2FA7A 1B7HA 5K2YA 4KQPA 3KN7A 4GIZA 2O1LA 2R9JA 3S9MC 1LAGE 3HV1A 5I58A 3SEUA 3O29A 2R6GE 1MXZA 3IX1A 4KHZE 5DVJA 4G68B 1I6BA 3IB2A 3C33A 1OLAA 5L9MA 5FTHA 2DSFA 1UIVA 4R72A 1WDNA 1NH8A 3W15C 1URSA 1XT8A 1LLSA 1LB8A 4BDRA 4NF8A 3GXAA 1MPBA 3TKDA 2XXWA 3TTKA 2O1MA 3WAFA 2R71A 5KZTA 2GH9A 3O66A 1QUJA 3Q26A 4OEUA 2DOJA 4U2RA 2GHAA 4U21A 4LP2B 4H65A 2QJEA 4R2BA 3H6VA 1UIUA 1LAHE 3CVGA 5B70A 3CRBA 3K1NA 1NKXA 1TWYA 3SESA 3RPWA 2XXRA 2WKYA 3S9NC 5FHNA 1MQIA 1FQAA 4UA8A 3TPAA 3FGSA 2XHDA 1B1XA 3H6TA 3IJOB 3TQWA 3U72A 1DPEA 3KGCA 5I2NA 1UQWA 5BUUA 3PPQA 4U22A 3SEXA 2Y7WA 3PMVA 3VVEA 4ZZEA 4QF9A 4BLAA 2F6GA 1M5DA 4NF6B 3H6WA 3FZVA 1PB9A 3A3CA 2QS4A 2AYSA 1DOTA 4DXUA 1JETA 3M3KA 3Q28A 3FVNA 4EQ7A 2VHAA 2IEEA 2XD3A 4P0IA 4H5GA 5H8HB 3B6QA 4LONB 1MS7A 4R6YA 2X7QA 3QUFA 1D9VA 1SW1A 2OWTA 1VSOA 3S9EA 1LCFA 3OO6A 3TTMA 2M8CA 4OETA 3IO4A 5EHSA 2XXTA 5AA1A 2QSXA 4JSOA 4HTGA 5I56A 5IKBA 4R2FA 3U8QA 1Y4TA 2V84A 3LSWA 4FEDA 5ISUA 4QRZA 2UVJA 2A5TB 3TDJA 5ICQA 3JV9A 3SEYA 3LSXA 2RKMA 3VFJA 3KJTA 2QPQA 1B0LA 2Y84A 3N94A 3EHSA 3OD7A 1XVYA 3FJMA 4Q0CA 5H8NB 4OHNA 1MQGA 4IO5A 5B7DA 3E9XA 4QFPA 1MXUA 3L6GA 3GLBA 1JW1A 3E4RA 1JEVA 1FCKA 2F7AA 1OIBA 3O28A 3ODBA 3Q25A 3C4MA 3G3FA 4ONYA 5FHOA 1LBCA 1NNPA 3ILTB 3CIJA 2A5SA 3SEVA 3QXMA 3N26A 1GGGA 2OCUA 4LVQA 4XTCQ 4OVJA 4JBZA 5FTIA 4MBPA 4C1UA 2F5XA 4BDLA 1Y1ZA 3IOUA 4IO2A 4MFIA 3MVXA 3EN3A 1URDA 3FATA 2F36A 5LOMA 1PBQA 3PUYE 3W9WA 2Q88A 1GV8A 2ZYOA 3IO6A 3RY3A 5AA2A 2V93A 1JNFA 3KJ7A 2DWAA 2PT2A 4JXIA 3U93A 1DTZA 4LQ5A 4NF5A 4OFLA 3U1OA 5AA2D 3HCQA 4HS7A 4IY6A 3K6WA 2GFEA 2ONKE 3V5AA 3KG2A 4BDNA 1WODA 3O2AA 2DXYA 1ZBMA 4H67A 2DQVA 4F1YA 5DVIA 1MG1A 5I59B 3RUMA 1B52A 4JWYA 2ZYKA 1MXWA 2ZNTA 5I2KA 3BFUA 2F8DA 2G93A 4THIA 5TP9A 1B05A 4G8MA 4KYEA 2ESNA 4QFNA 2OBGA 1PEBA 1EH3A 4ZS9A 1IXGA 1IUDA 3MAMA 3T93B 1M5FA 4P11A 3K4UA 5A5XA 3FJ7A 3FXRA 1MPCA 2NXOA 1QKBA 1TXFA 3OO8A 1HSLA 4POWA 3VE1B 4ZZAA 4WXJA 2V3QA 1IEJA 4IO4A 1B5HA 3K0VA 4F22A 3S9LC 3K02A 3T9HB 3FVKA 2ABHA 4JB7A 4HCYA 3T9UA 1FW0A 3ZSFA 4ZEDA 4R73A 1QVSA 1FQFA 1D3KA 3N5LA 4YKKA 1Y4CA 4YICA 5CM6A 5HM4B 4WEDA 2ALUA 1OLCA 1VFEA 1UTBB 3U94A 1MXVA 2REJA 3CG3A 4P0GA 3KEIA 1LFHA 3RT8A 4X1DA 4DLDA 2UVHA 1XOCA 4MLVA 1BTJA 1DSNA 2NVUB 3TTNA 4N13A 4UACA 2I58A 1XVXA 5DT6A 1OQHA 4MF3A 3OO7A 3MVZA 2DVCA 3IB1A 2DS9A 3TFLA 2XXXA 3SEWA 4O3CA 3E3KA 3PPPA 4NEDA 5KDTB 1ZKBA 1UTHA 5TPAB 3MUQA 4XKQA 4NTLA 1S50A 3UN6A 5J1DA 1R6ZA 5CMMA 5H8FA 2X26A 5ICTA 2ANJA 2XXQA 3FXUA 2AIXA 3A3UA 3TUSA 4G4PA 2PX1A 1GVCA 3G7WA 2I3WA 4BDMA 1Y9UA 2P2AA 1XC1A 4G2ZA 3KZGA 4X9TA 3TCGA 3T9VA 2B3BA 5DVFA 1IXHA 5I57A 3K01A 2RC9A 4GRKA 1MY3A 2QRYA 2CZLA 4F3PA 3OSRA 1Y1MA 4R9GA 1B5JA 3O97A 1FTJA 3PUVE 1QUKA 4FORA 3FUZA 4KYSA 4FAJA 2G29A 1JW5A 1ATGA 3I5OA 1B3GA 2ZMBA 2O7UA 1WVJA 2ZNSA 3TZAA 4IY5A 3KFMA 4KI0E 4JWXA 4YKPA 3MP6A 1US5A 5L8DA 3RQTA 3LC8A 2RF1A 3MVYA 1N0TA 3H3GA 2ZYNA 2XXPA 4XKNA 1P1NA 5HBCA 4G68C 3QK6A 3K1MA 2DYXA 4IGRA 4ND9A 2XX7A 4NF8B 4G68A 1TFAA 1P1QA 1JEUA 3OEKA 1ZLQA 3ONMA 5CBSA 2F6PA 1A8FA 4G8HA 4AQ4A 3R6UA 1SQYA 5DEXB 2GRVA 1B4HA 4QFOA 2QMXA 4NF4B 4Z0IA 3B6TA 1H76A 1A99A 1HSJA 2XX9A 1HSEA 1S9TA 2E0SA 2HQ0A 1MPDA 4QFLA 2PMSA 1BIYA 2LAOA 4M4GA 2IA4A 4XKRA 4GLIA 1RYOA 2O68A 1MQJA 2XD2A 1A40A 3VVDA 2ONSA 2PT1A 1N7XA 4ELRA 3TELA 2VD3A 1SI1A 3VVFA 1N76A 3U92A 4KYDA 4POXA 2DWIA 2YJPA 1DPPA 4KR5A 4NF6A 4GL8A 1JVYA 4YMAA 3G3IA 3MW0A 4U1OA 4TOZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MXXA 3OXNA 4YB5A 3QAXA 4TLLB 5H8HA 1B0HA 5CBRA 2YLNA 1IXCA 4N6PA 2PFZA 2UYEA 3H7MA 4F1UA 1FBHA 1RYXA 2L5VA 3UGWA 4GOTA 1TT1A 1FPGA 3CFXA 3K00A 1EZPA 1R9LA 1XI6A 5I7IA 5LDZA 3EQ1A 3KOSA 1LSTA 1LCTA 5H8QA 1H43A 4OFOA 4GX4A 4OWDA 5F1QA 2PFYA 5IGAA 3H06B 1NNFA 1YAEA 4GF8A 2A5TA 4PP0A 1B32A 1Y3QA 5F24A 3A09A 4FJPA 3RLFE 3KOTA 2O69A 4EQ9A 3EHTA 4HXVA 3DP8A 3VLVA 1P1UA 4ZECA 1IMDA 3MP8A 4PF6A 4MNCA 4NHBA 3VDFA 3B7DA 3FXQA 5H8NA 4LQ2A 3PUXE 3G3GA 3HPIA 4GWZA 3GBBA 1LGBC 3B50A 4E0XA 4OERA 1FTMA 2Q74A 1MM6A 4H1XA 5JK4A 2QL3A 4PFRA 4Q30B 3LBSA 2VD2A 4I8CA 1Z7NE 3CR9A 2Z8DA 4EXKA 4KXPA 2CMOA 4KPTA 2NOOA 2FIEA 1POTA 2ZYMA 5AA4B 4OTEA 4QHQA 3G3HA 2Q2AA 3PD8A 4PBQA 4F18A 1IMEA 2QS2A 1A54A 4FATA 2Y7RA 4PFBA 3RN8A 1FQDA 4EXLA 4EDPA 5AA2B 4IO7A 1NH7A 1IMFA 1NNTA 2XXYA 1MRPA 2HHMA 4EF2A 3IOVA 5AE4A 3FD3A 3LSLA 4ZE8A 3K6XA 3L6HA 4I3EA 1BLFA 2QS3A 2O6AA 5IAIA 3LR1A 4R75A 2REGA 1FQBA 1QGXA 1YTVA 3CSBA 3HHGA 1VR5A 3C34A 4F3GA 1SW5A 4FBPA 4PETA 4N07A 1R1NA 3S2VA 1LAXA 3BIGA 1YXIA 4QSCA 4IO6A 4KFQA 1FRPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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