5I56B

Agonist-bound glun1/glun2a agonist binding domains with tcn201
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
280
structure length
280
Chain Sequence
DDNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 280
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i56B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i56B02
3MVZA 3GZGA 4G4PA 3IOUA 3RN8A 3IOVA 4K3FA 4F1UA 1B32A 1I6AA 4F2QA 3DP8A 4RXLA 2UVGA 3PGFA 1S7YA 3DELB 3VVEA 3LC8A 5FHOA 3JYRA 3MJNA 1NNFA 2Y7PA 2O6AA 5AA4A 3N94A 3G3HA 4H0WA 1N3XA 4XKNA 3T9UA 3C31A 3W9WA 1Y9UA 3FD3A 3TAJA 4BDNA 1ZBMA 3MVXA 5AE4A 3PU5A 1VR5A 2Z8DA 1MXWA 3M3FA 3SEVA 5KCJB 3K4UA 3S9NC 3QUJA 4BLAA 4HTGA 4U22A 2Q2CA 1S50A 2XX8A 1PB8A 3O97A 2XXPA 2DWJA 4FORA 1LSTA 4G68B 4U21A 3IL1B 4XKRA 3FVGA 4LP2B 1B5HA 4GIZA 3C32A 4IY6A 2H5YA 3QYTA 3O6GA 1SDXA 2I48A 3PD8A 5I58A 4MLQA 5I2KB 2F36A 3U94A 2ZXTA 1JW1A 3C36A 4DE8A 4PFWA 1PEBA 2F7AA 3ZKLA 4Q8RA 4AB5A 2DE3A 4F2OA 4QFLA 2WKYA 3M3LA 3UGWA 1XC1A 2QS3A 4H5FA 4RPOA 5K2XA 4F1YA 2DXRA 2VP1A 5FTIA 1OIBA 1OLAA 4QSEA 3FUZA 5H8HA 1MPDA 3O2AA 3MPLA 1OLCA 5ICTA 1LBBA 3H03A 4U4XA 2P2AA 4R74A 1DTZA 1H43A 3Q28A 3T96B 3W15C 3PUVE 2I6EA 4FAJA 3H6WA 2DE4A 1UTHA 4GWOA 2PVUA 2H9BA 4RA1A 1WODA 1MQIA 3M3KA 1FTKA 2W7YA 3FXUA 1FQCA 2F6GA 4GL0A 3TCGA 5J1DA 3VLVA 2V3TA 4NF8B 5HBCA 1NNKA 4U4SA 1IZ1A 1SW1A 4YKIA 1LB8A 2F97A 3TMGA 1USYH 1URSA 2HCAA 2RCAA 3TUSA 1B51A 1ANFA 4NF4A 4QHQA 1LAGE 3WAEA 4I9DA 1FTJA 3K02A 3QAXA 1RKMA 3T9XB 1I69A 3K1NA 5I59A 1BTJA 4FIMA 5CBSA 3CR9A 3L6GA 3LSXA 2QS2A 1J1NA 1AOVA 1JETA 3SETA 4H65A 1Y1ZA 1DSNA 5BWJA 4YB6A 3TCHA 2DXYA 4OHNA 3H6UA 4Q5TA 2O1LA 1BLFA 3BFUA 4YMBA 3EQ1A 4KYSA 1XT8A 3H3GA 4R6HA 1FTLA 4F29A 1B3GA 1QJMA 2HAVA 5AA3A 5FHMA 3U92A 4GQOA 1MXVA 2REGA 2R9JA 1VFDA 1FQDA 1SD3A 4JBZA 1B7ZA 1P1NA 2UXAA 3U93A 2A5TB 1MDQA 1RYOA 4XTCQ 3T9VA 3S9LC 3OSRA 4LONB 1GGGA 5CBRA 3S9MC 2XXRA 3IJXB 4KPTA 2F8DA 3TELA 3IK6B 1FW0A 2V3QA 4DXBA 1MM6A 2I0BA 4E0WA 2Q88A 4BDRA 2QMXA 4ND9A 3KN7A 3R26A 1NFTA 3PMWA 4ZEIA 3T9HB 2I3WA 5F7VA 1P1UA 3TODA 1US4A 3USDA 4YKKA 5KZTA 3KG2A 1DPPA 5I2NA 1UTBB 3OO8A 5B70A 2IEEA 2AYSA 3RUMA 2F34A 3N6UA 1LLSA 1Y1MA 1SI1A 1BIYA 1F9BA 2GH9A 1MXUA 2Z22A 3MP8A 3VV5A 3SEUA 5H8QB 1O64A 3PPOA 5EYFA 5TPAA 1R9QA 4F39A 3CG3A 2H4IA 4F22A 2CMOA 3FJ7A 1NKXA 1R1NA 2YJPA 4PP0A 1SBPA 3QSLA 4EF2A 1A8EA 3CRBA 4POWA 2XXXA 3IOTA 4YAHX 3EN3A 3TTMA 4P0IA 4ELOA 2V3UA 3TQLA 4O3AA 3KSXA 1KWHA 2DQVA 3HCQA 2ZYKA 5EHSA 4NWCA 5DEXB 4U2RA 5DYHA 4KI0E 4ZE8A 3KFMA 1EH3A 3I5OA 4HS7A 1OQHA 1B3HA 2OK2A 4G8MA 1H76A 4OFJA 3B6QA 1Y4CA 2QPQA 3RLFE 5H8FA 1USYE 2DVCA 2ZNTA 5B7DA 3GBAA 3RT6B 4OWDA 3T66A 1A99A 4JXIA 3CVGA 2Z8FA 1DPEA 4YKPA 1Q1KA 3PV0E 1IIWA 4U1OA 3HV1A 1LFIA 3TCFA 4JB7A 3UORA 1QKAA 4RJZA 5KDTB 3FIRA 4Z0IA 3HHFA 4DLDA 1I6QA 3C34A 4NF6A 1SQYA 1MXXA 2HZKA 3KOSA 3QIMA 1B52A 3KN3A 5AA2D 4FEBA 4F18A 1IXHA 3K01A 3O28A 5I57B 1IXCA 1OVTA 2Y7KA 4GXAA 1B40A 4THIA 3GBBA 1TFDA 3K2DA 2XXWA 5A5XA 3U72A 2OCUA 2F78A 4ZEBA 3F11A 2AL4A 1HSEA 4X1BA 1JEVA 1D9VA 1PDAA 1LB9A 2NOOA 1EZPA 2FNCA 3OXNA 4L17A 1B3EA 3AXFA 4R9GA 1LAHE 1CB6A 4BDLA 3EF7A 2PBWA 3I6VA 4FJPA 3LSWA 2IA4A 5AA1A 2O7UA 3IAZA 4KCCA 4KYEA 1AL3A 3FXRA 2HXWA 2HFBA 2ANJA 2HAUA 2AL5A 3D4GA 4IO4A 5H8NB 2RC7A 4ZEFA 1T0KA 2XXQA 1FCKA 1FQFA 3H06B 2R6GE 1B58A 3P7IA 1NNPA 1OMPA 4RY1A 4ZEKA 2ALUA 5KCJA 3OD7A 3O66A 3TQWA 3OENA 3GLBA 1ZU0A 4H67A 1FTMA 4F3GA 3OMBA 3FV2A 1LGBC 3MQ9A 2CZLA 4G68A 3FATA 1EZ9A 1P1OA 2B65A 1QUKA 2ZMBA 3A09A 1VFEA 4EXKA 2ZYMA 2BJJX 4YU0A 4F19A 3W9VA 2I4CA 2RC8A 3G3FA 5FHNA 3SEXA 3O6HA 4AB6A 5I2KA 4ZEDA 4H8IA 1SI0A 5L8DA 4GD5A 3FV1A 1XOCA 2O51A 4R6KA 1HSJA 1B3FA 4R2BA 4KHZE 1NNTA 4NWDA 4C1UA 1SW2A 3VVDA 4NF5A 3PD9A 5TU0A 3S2VA 3KJTA 1MY4A 2G93A 4YB7A 3SEWA 3LBSA 2O1MA 3RY3A 4WXJA 4LQ5A 3CFZA 3PPPA 3OO7A 3EHUA 3PUZE 1O7TA 3FJGA 1SVXB 2THIA 3K6XA 2E1SA 3Q27A 1IITA 3IOWA 1IUDA 5F1QA 4C0RA 3LSFB 2GRVA 2V93A 3SERA 4U23A 2R71A 4F3SA 3PUYE 3MC2A 4NE4A 1JQFA 1ELJA 1H45A 1QVSA 1LCTA 2D3IA 4QFKA 1SYHA 1XVYA 4OTEA 4WKMA 1I6BA 1Y20A 4C1TA 4JSDA 4NF8A 3MVYA 3OELA 2HEUA 4H1XA 5TP9A 2ONRA 4POXA 1B4ZA 3TEPA 2VD3A 3FVNA 2PMSA 1D3KA 1AMFA 1UTHB 3ZKKA 3S9EA 3E3KA 1B9JA 1P99A 5EHMA 2VHAA 3V5AA 3PPQA 1DTGA 3VXCA 3R6UA 1MQDA 4DXUA 3MVWA 5I84A 3FZVA 1RYXA 4LQ2A 4OEUA 1MH4A 3THIA 1ATGA 2UVIA 4OFLA 3TZAA 3FASA 1B7HA 1XVXA 1LAFE 4UACA 2E0SA 4PQJA 3KEIA 3C33A 3EPEA 5DT6A 4IO3A 4TOZA 1QKBA 3MPKA 2X7PA 2NVUB 4EF1A 1SW5A 3OEKA 4ECFA 2NUVA 2B3BA 2OWTA 1URDA 1Z7ME 2A5TA 4ELPA 4HW8A 3CSGA 5JTYB 4YICA 3S4UA 3IB0A 2O84X 1ZIUA 1PB9A 3PUWE 1N04A 1MG1A 5CMCA 4X9TA 4EUOA 4OEVA 5LOMA 2DWHA 1MY0A 2DYXA 1MY2A 4IO2A 2DE2A 2I58A 4XKQA 5I56B 1UTBA 4EQ7A 1QULA 3KZGA 3QK6A 4DCXA 4DCYA 4Q0CA 3IO4A 1TT1A 4FEDA 3PUXE 5CRYA 3QUFA 2DS9A 2Y84A 3CFXA 3MZ9A 3UK4A 4R72A 3TTKA 4DDDA 2OLBA 5H8QA 3ILTB 2FA7A 1DMBA 4TLLB 1B4HA 4M4GA 1LFGA 3MUQA 3IX1A 3JZJA 4HCYA 1MPCA 1UQWA 4FE8A 5CMMA 3DLNA 4WEPA 2XX7A 1Y3PA 3IR1A 4H8JA 1LFHA 2P1SA 2PX1A 2XXHA 4OXVA 3LSLA 3MZBA 3O6IA 3RT8A 3G3IA 5JK4A 1N7XA 2DWIA 1N0TA 1S9TA 3BKIB 5HPQA 4HCWA 4OETA 2ESNA 2QSXA 4KCDA 1B6HA 3CSBA 3RNNA 1B3LA 4WEDA 3E4RA 1PBQA 1WVJA 3UIFA 4ZS9A 1Y4TA 4LVQA 4R2FA 2ONSA 3TYHA 3Q29A 3BBRA 2Y7WA 5HM4B 3OO9A 2FYIA 1MH3A 5IAIA 2XHDA 1TFAA 4GVOA 3R7XA 1M5DA 4FECA 1UIVA 1YTVA 3RTFB 3OEMA 3FVOA 5DVJA 2RKMA 1TXFA 3WAFA 3EHTA 2VGQA 4QSCA 3H4ZA 5KDTA 1IQ7A 4OMBA 2ZYNA 4ONYA 3KGCA 1AH5A 3Q26A 4BDOA 5DVFA 2AIXA 4PFYA 4RPNA 4F31B 5AA2B 5I57A 1URGA 1MQGA 4KD5A 4ELRA 3SKPA 3VXBA 5JEIA 4ZE9A 1NMUA 3PMXA 1Y3NA 1M5BA 1N7WA 2Z8EA 2O7IA 4MH5A 2UYEA 3RGYA 1B0HA 3VDFA 2DWAA 2OWSA 2Q8JA 1MM7A 1A54A 4JDFA 3KOTA 3CI8A 3K0VA 3OOAA 2Q9TA 3N6TA 4G8NA 3TTNA 5CI5A 3B6WA 4I8CA 2NWJA 4GF8A 4QFOA 4G68C 2F35A 2OZZA 2QS4A 3MZ1A 1M5CA 4Q30B 5ITOA 1ZJLA 1XHYA 3CG1A 3KJ7A 5H8NA 4LA9A 2B3FA 2O68A 3K6WA 3HN0A 3I3VA 3N26A 5ELVA 3TTRA 1CE2A 3FGSA 2DOJA 3MAMA 2OJTA 4YZZA 3H7MA 3G3GA 1SW4A 2F5XA 4I1DA 5ISUA 1YCJA 2V84A 5FTHA 5L9OA 2OBGA 1XS5A 3TFLA 1JVXA 4KR5A 1N76A 4LZ7A 1DOTA 5AA4B 3HHGA 3C4MA 1OQGA 4GXSB 3ECRA 4KFQA 4ZECA 2HQ0A 2KLFA 4JWYA 1AIVA 5CC2A 3PPRA 4LATA 1HSLA 1M5FA 4UA8A 4PFUA 2DSFA 2G29A 4TLMB 3U1OA 4R73A 1B5IA 1B05A 1B5JA 3G3JA 1A55A 2RC9A 1PB7A 1BP5A 1US5A 1B1XA 3CFLA 1M5EA 3SESA 4MFIA 2NXOA 1JVYA 1WDNA 4LUBA 1ZMGA 4G8HA 2I49A 3TDJA 4DIGA 1POTA 5ICQA 4ESWA 3RPWA 2P0SA 1L5TA 3BFTA 2VOZA 2PT2A 2D21A 1P1WA 5I58B 3KN8A 1LBCA 3TPAA 4X1DA 3OSQA 4X48A 4JWOA 4NF5B 4JSOA 2XXTA 4XIGQ 4RYAA 4YMAA 2RINA 3DP6A 2F7CA 3D4CA 3C35A 1A7LA 4KQPA 1II5A 1ZTYA 3KBRA 2I3VA 2DVZA 4F3BA 4OESA 2UVHA 2ONKE 3B6TA 4N13A 3G7WA 5H8HB 5M2VA 4XKPA 3RQTA 1N84A 4RNSA 1JNFA 3MWBA 5H8SA 4QF9A 2DP8A 3TKDA 4Z7EA 4BDMA 1IXGA 1GV8A 1NH8A 2D5WA 3IO6A 3K1PA 4RK2A 4AQ4A 3K00A 4N07A 2ZNSA 3UN6A 1YPNA 2Q89A 4R9FA 1VSOA 3ZS6A 1QW0A 4RK9A 1JW4A 3JV9A 1QUJA 1FTOA 2XXVA 3EHSA 5TP9B 4N6PA 5IKBA 3VFJA 1N3WA 4PE5B 1H44A 3K6UA 1MQJA 2X26A 3IJOB 1B2HA 4IO5A 1A40A 1LAXA 2RCBA 1D9YA 4YB5A 4NF4B 3QXMA 3DP4A 2F7BA 1LCFA 1B7UA 3FVKA 1IEJA 4OYVA 4E0XA 2GFEA 4P0GA 4OERA 4OZ9A 2XD2A 3VLUA 4P11A 5I59B 3DM0A 1EU8A 4NMYA 4ZZAA 3H6TA 2ZYOA 5L9MA 2ZNUA 1MY3A 1A8FA 3VE1B 5JTYA 2XX9A 2F6PA 2H98A 5CMBA 3V83A 4MBPA 5L9SA 3RTWB 4ZDMA 5K2YA 1H3DA 4PFTA 2QJEA 5DVIA 4I62A 1MRPA 1MXYA 1FQEA 2YLNA 3HPIA 3M8UA 4DZ1A 2V25A 5I56A 3GXAA 4QSDA 3L6HA 2VD2A 2YPNA 1PC3A 3OO6A 2Z23A 1TWYA 4R75A 4IO7A 3LR1A 4QFPA 4H5GA 2Y7IA 2A5SA 3KSJA 1GTKA 3E9XA 3LUYA 3C9HA 3ZSFA 2GHAA 3UA8A 1PBPA 2Y7RA 4M1VA 4OENA 1IXIA 3ILUB 3PMVA 2XXUA 4YKJA 1ZLQA 4QRZA 1ZKBA 3A3UA 1BKAA 1VE4A 1MDP1 2M8CA 1MXZA 4IGRA 4JWXA 4LZ8A 1B46A 2GHBA 2UYFA 4TQUQ 1MY1A 4DXCA 5I2NB 1Z7NE 1MPBA 2XXIA 2H99A 2LAOA 1MS7A 4EXLA 1B1HA 4GRKA 1POY1 2QRYA 4ZZEA 3U8QA 1EZOA 2UVJA 2RF1A 3K1MA 1OVBA 4IB2A 2PT1A 1P1QA 1MQHA 4IO6A 4OQOA 4IGTA 4ISUA 5DEXA 5ITPA 3MP1A 4G2ZA 5TPAB 4XXUA 4G77A 5DTBA 3SEYA 3FXQA 1JW5A 2REJA 4EQ9A 4GL8A 4O3BA 4OVJA 2PYYA 4F3PA 4LZ5A 1FQBA 3SDFA 1NL5A 1Y3QA 4GLIA 4GFRA 3HSTA 2QMWA 2O69A 1UIUA 1D4NA 3MW0A 1Q35A 1R9LA 4QFNA 3VVFA 3T93B 3V89B 1B0LA 3E13X 3O9PA 4O3CA 4F1VA 4BDQA 4ESXA 3K6VA 4EQBA 4R6YA 3MP6A 3ONMA 2HZLA 5AA2A 3IORA 1JEUA 4GOTA 3O29A 2I0CA 5H8FB 3HO7A 1YAEA 1GR2A 5CMKA 3TTLA 3IB1A 1QUIA 2H25A 3H6VA 1SYIA 3PPNA 4OFOA 4U1ZA 3V8XB 2XXYA 4PETA 4NEDA 1GVCA 2QS1A 3Q25A 3ODBA 4IY5A 1R6ZA 3FJMA 3G3KA 3VLWA 3IB2A 4NF6B 5CM6A 2I4BA 3B7DA 3MBPA 4H6DA 1O63A 4MF3A 3T22A 4ELQA 3UP9A 4NTLA 4EDPA 2XD3A 1FQAA 2X7QA 4MLVA 2ABHA 1NH7A 5A5XB 2QL3A 2Q2AA 4KYDA 5BUUA 4FATA 3A3CA 3CIJA 3N5LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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