5I58A

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-004
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
283
structure length
257
Chain Sequence
STRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCVKKVICTGPVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 71
structure length 257
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i58A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i58A02
5I57A 2XXIA 3FGSA 1FTMA 4H5GA 5HBCA 3OO6A 1GR2A 4OZ9A 5ICTA 4TLMB 3U1OA 2OWSA 5I2KB 3M3KA 2QS1A 4JWOA 2E1SA 1LB9A 1AIVA 3E4RA 2Q88A 3S9LC 4XXUA 3CSBA 1Q35A 3ECRA 1M5DA 3FV2A 3TPAA 2DXYA 3D4CA 1JW1A 3VLUA 5JTYA 2HEUA 1SQYA 4F18A 2O1MA 3TODA 1SW1A 3IR1A 1CB6A 1Y1ZA 5FTIA 1OVBA 2FA7A 2GRVA 4BDMA 1B4HA 1MPDA 5ITOA 3CG3A 3CVGA 4KQPA 1EZOA 1H76A 4MLVA 3PU5A 3S4UA 1B6HA 1ZU0A 2I58A 5H8QA 3IOWA 3I3VA 4G68B 4TLLB 3ODBA 1MQJA 3K2DA 1N76A 1TT1A 4ZE9A 4WEDA 3W9VA 1MQIA 3UA8A 4ZEFA 3EN3A 2ESNA 4C1TA 3JZJA 2O7UA 3G3FA 4UACA 5F7VA 4BLAA 1Y4CA 1FTKA 2Q8JA 1H43A 4YMBA 1FTOA 4KHZE 2UVIA 4M4GA 3FASA 2Y7KA 4XKPA 2W7YA 4YICA 1FQDA 3RTWB 5JEIA 3SEUA 1N3WA 4AB5A 2H9BA 1LSTA 4Z0IA 3U92A 1MY0A 5I2KA 3C36A 2AL4A 2R71A 2ZYNA 5ELVA 4IO4A 4JSDA 2XD3A 1YPNA 2R9JA 1HSLA 4P0GA 1NH7A 1Y4TA 4NF8B 5I2NB 4OVJA 5DVFA 3B6QA 4XTCQ 3EF7A 1Q1KA 1QVSA 5I59B 4ISUA 1US4A 2IA4A 3OENA 3PPOA 4QSEA 1PB8A 1J1NA 3L6GA 4YB6A 1B51A 3TTKA 3PUVE 3C35A 3HV1A 4RK2A 2ZYMA 4I1DA 3SESA 2QPQA 4FJPA 3TFLA 3UP9A 5H8HB 4G68A 4NMYA 2AL5A 3H3GA 3C34A 1FTJA 2F8DA 1ZIUA 2V3UA 3HPIA 1MXXA 3KN3A 5J1DA 3PUYE 4DCYA 4QSCA 3N6UA 2PVUA 4GXSB 2ZNSA 3IX1A 4WXJA 1DTZA 5AA2B 2F6PA 1O7TA 4ZEIA 3VVFA 3OEMA 3C4MA 1Z7ME 3IJOB 3KOSA 4JB7A 4EXKA 1NL5A 4R6YA 3G3GA 1RYOA 2DVCA 4MH5A 1IITA 4H8JA 1QUKA 1POTA 1ZBMA 4E0WA 3GBAA 3C31A 3H03A 1S9TA 1BP5A 1VR5A 1US5A 2QRYA 3T9VA 3DP6A 1M5FA 5CMBA 3L6HA 3C9HA 3FJGA 3WAFA 4H6DA 4H65A 1JEUA 2KLFA 4ECFA 1YCJA 4LA9A 3T66A 4N6PA 4U4SA 4FORA 1MH3A 2XXXA 4P0IA 3IOVA 1IXGA 4R9GA 3V83A 5I59A 3UGWA 4F3PA 4X1DA 1LAXA 2ONRA 2UYFA 3ZS6A 1MS7A 3LSWA 3PPPA 5EHMA 1SDXA 1T0KA 3B7DA 1CE2A 4OFOA 5DVIA 5KZTA 3K6XA 2ZYKA 5H8HA 4U1OA 5B7DA 4NF5B 3K1PA 1WODA 1LFIA 2Z8DA 1SW5A 4F3GA 1B0HA 2X26A 4PETA 1XT8A 1QUJA 1Y9UA 4EQ7A 2RCBA 4WKMA 3FJ7A 1B3EA 3OSQA 3VXCA 2WKYA 3OSRA 4EXLA 1XC1A 3U93A 3CSGA 5DTBA 4X48A 1AMFA 3QAXA 1YTVA 2Y84A 1B2HA 1QJMA 1B5JA 4MLQA 2QMWA 3OMBA 1Y3QA 4MF3A 5HM4B 1TFDA 2VOZA 3USDA 1Y1MA 1VSOA 2AIXA 3LSLA 1VFEA 4F1YA 1ELJA 4H67A 1LBBA 3TELA 2V3QA 2NOOA 3K00A 5I58B 4RA1A 4PQJA 1PEBA 3BFUA 3SERA 5AA3A 1B05A 1R1NA 4U1ZA 3VXBA 3PD8A 3R6UA 3O2AA 2XXTA 3ONMA 2QS3A 1LAFE 2XXUA 3PMWA 4ZZEA 2HAUA 3T9UA 4IGRA 1IEJA 1LAGE 1P1QA 1JQFA 3FATA 2DWHA 3SEWA 5L9SA 1ZKBA 4G8HA 3MZBA 4NF5A 1MXUA 4RPNA 3PPRA 4GXAA 3TQLA 1B5HA 2B3FA 1P99A 4ELOA 2THIA 3FXQA 3CFZA 1JW5A 1LFGA 2OJTA 4I8CA 4F1VA 4JWXA 1FTLA 4NTLA 4QFNA 5DT6A 1IXIA 2QL3A 3IB1A 3P7IA 3OO7A 4EDPA 2H5YA 2QJEA 4NE4A 1B4ZA 1Y20A 2XXQA 3O9PA 1UIVA 4Q0CA 4N13A 1NNFA 4JWYA 3H6TA 3O97A 3RUMA 3S9MC 2YJPA 1PDAA 2M8CA 4ELQA 1VE4A 4U4XA 5CMMA 2PYYA 4LQ2A 4UA8A 3UIFA 1NMUA 1EU8A 1JETA 2F36A 3OO9A 1A54A 1MY1A 1SD3A 2O6AA 3HN0A 3FD3A 1EZPA 4KCDA 1D9YA 2XX7A 4OFLA 3HHGA 4KFQA 3MP1A 4TOZA 1URGA 3BKIB 2O7IA 1B7HA 1B58A 1A99A 4DXBA 1N7WA 3S9EA 4LZ8A 3K4UA 3SEVA 4LZ7A 2ZNTA 4WEPA 1QUIA 1UTHB 3I5OA 5FHNA 4KYSA 4IY6A 2NWJA 2YPNA 1LCTA 2I4CA 4G8NA 4BDOA 4RPOA 5L8DA 1NNPA 1H3DA 2PX1A 3MJNA 4FIMA 1POY1 4Q5TA 4OQOA 3LR1A 2X7PA 4R2FA 1MQHA 1QW0A 3WAEA 4HCWA 3G3KA 3GZGA 4G2ZA 3IB0A 5B70A 2XD2A 3FVOA 4F31B 4DDDA 3VLWA 2ONSA 1XS5A 3O6GA 1RKMA 2DXRA 5K2YA 4GD5A 3CFXA 3PPQA 4DZ1A 5H8NB 2Y7WA 1MY4A 4IO7A 3THIA 3TTLA 3KJTA 3K6VA 2GHBA 4ZEBA 2XXPA 4GF8A 3MVXA 4F19A 4YAHX 1TFAA 3H6VA 3TMGA 3G7WA 4F1UA 3V5AA 1N0TA 2Y7RA 1DOTA 3SKPA 3QUJA 4GQOA 1QKBA 3E13X 3IB2A 4EQ9A 3MPKA 1GVCA 3PGFA 1GTKA 4NWDA 3TUSA 5DEXB 1BLFA 3KSJA 4DE8A 1AOVA 2F7CA 1OQHA 4E0XA 2Q2AA 1IUDA 2XX9A 5CBRA 4POXA 4QHQA 2FYIA 1B3FA 3C32A 4U21A 2F34A 2OZZA 1JEVA 3T93B 2REGA 3LC8A 3TDJA 3N94A 1SYIA 1UTHA 5I84A 4LATA 3SEXA 3N5LA 4R9FA 3U72A 3BFTA 4U23A 3H06B 5IKBA 3PV0E 1VFDA 2RC7A 4R72A 5BUUA 4RNSA 1N7XA 4OENA 2V25A 2UVJA 2ALUA 4TQUQ 4NF6B 4GIZA 2P0SA 3S2VA 4PFYA 3VLVA 2V3TA 4Z7EA 2XX8A 4MBPA 3PUZE 1MPCA 2PT1A 1B3LA 4H1XA 1LAHE 4OWDA 4QRZA 3PUWE 1NH8A 1LCFA 4NF4B 4Q30B 4EF2A 3QUFA 2LAOA 2V84A 3EHUA 3MVYA 2O51A 3MP8A 2XXHA 3RT8A 3RTFB 1MG1A 3QYTA 1ANFA 3C33A 4ZEDA 2QS4A 1P1WA 2QS2A 4H8IA 5AA2D 2Z23A 2DVZA 3K1NA 3DP4A 4PE5B 5HPQA 3GBBA 4EUOA 3QIMA 3VVDA 3RLFE 1FCKA 3MC2A 2I48A 2YLNA 5DEXA 3V8XB 2ZMBA 4RJZA 3ZKLA 1Y3NA 4POWA 3W9WA 1B7ZA 4F29A 3LSXA 1A8EA 1FW0A 3IOTA 2PT2A 5JK4A 3K1MA 4R6KA 3G3HA 2O69A 5AA4B 1SVXB 3QK6A 2OK2A 5TU0A 1SW4A 2OCUA 3FXRA 4NF8A 1IXCA 4PFTA 5I2NA 5FTHA 2DWIA 1XOCA 2GFEA 4F2OA 4KD5A 3PPNA 2DOJA 4LVQA 4G68C 3TCGA 2BJJX 4F39A 1B52A 3CR9A 4DCXA 4NF6A 3GXAA 2I0CA 4BDLA 3PUXE 3TKDA 2A5SA 5KDTB 1Z7NE 3KGCA 3MZ1A 3S9NC 2Z22A 1HSJA 2F5XA 4KR5A 4GWOA 1I6QA 3QSLA 1A40A 3O28A 4NF4A 4BDNA 3VE1B 2XXYA 3FZVA 2AYSA 3DM0A 1F9BA 1P1OA 2P2AA 1PBQA 3TTMA 4ZEKA 1BKAA 5AA2A 3KBRA 3R7XA 3H4ZA 3FVNA 2RC8A 3U8QA 3MUQA 2I6EA 4O3CA 3IOUA 5EYFA 2H98A 4DIGA 3UN6A 2CMOA 3MQ9A 4HW8A 3TCFA 4YKPA 2RINA 2Y7PA 2ZXTA 1O64A 3OOAA 3B6TA 1R9LA 1ZMGA 3HCQA 1DTGA 2GH9A 4PFUA 1OQGA 4QFOA 3DLNA 2OWTA 4QF9A 4NEDA 5AA4A 2B65A 4HS7A 4KI0E 1R6ZA 2D3IA 1WDNA 4LQ5A 5BWJA 4DLDA 2RKMA 2VGQA 3TCHA 1ATGA 1N3XA 2O68A 4YMAA 1S50A 2VHAA 3KG2A 4U2RA 2I4BA 2F35A 3VV5A 1NNKA 2H99A 1LLSA 2QSXA 1ZTYA 4LP2B 4OHNA 3IAZA 4GRKA 5KDTA 5AE4A 5L9OA 5TP9B 2I49A 3I6VA 5CC2A 3K02A 4AB6A 4DXUA 3KFMA 5H8FB 1B3HA 1H44A 1A55A 4FEBA 4QFLA 4M1VA 2RCAA 2F97A 3T9XB 5DYHA 2Q89A 3CI8A 1MM6A 1XHYA 2P1SA 3TAJA 1FQBA 2H4IA 1B7UA 1UIUA 1UTBB 1MXZA 4F22A 4O3AA 2Q9TA 3UORA 4U22A 4YB7A 2REJA 1FQFA 1LGBC 3DP8A 5CMCA 3EQ1A 1SI1A 1FQAA 4XKRA 2HAVA 4BDQA 3N26A 1I6BA 3ZKKA 2VP1A 1MY3A 4KCCA 3O6IA 1LFHA 1M5CA 2R6GE 1I6AA 2DWJA 5IAIA 4R6HA 3K6WA 3E3KA 3SEYA 2B3BA 1D9VA 3EPEA 5I58A 1D4NA 5CBSA 3M3LA 2Y7IA 1P1UA 1MXVA 1JVYA 4IO2A 1L5TA 4X9TA 1N04A 1OVTA 3R26A 1URDA 4G77A 3AXFA 5A5XB 4X1BA 3CIJA 2XXWA 3MP6A 2XXVA 5TP9A 1A7LA 5H8FA 4R75A 2UVHA 4IY5A 2QMXA 2I3VA 1BIYA 2E0SA 4ESXA 3QXMA 1H45A 4JXIA 3MPLA 1IIWA 3M8UA 2F6GA 1O63A 1MRPA 2F78A 5EHSA 2DYXA 1M5BA 4KYDA 5I56B 3OO8A 3SDFA 4RK9A 4OEVA 3FIRA 1NFTA 1UTBA 4P11A 2HCAA 4QFPA 1GGGA 2X7QA 1MPBA 1AH5A 4I62A 3RT6B 4C1UA 3A3CA 2DS9A 4ND9A 4I9DA 1N84A 2V93A 2GHAA 1KWHA 2OBGA 5ICQA 3HO7A 2DE4A 3F11A 2F7BA 3EHTA 4F2QA 3W15C 1HSEA 4LUBA 3MW0A 3JV9A 1SI0A 3TTNA 1AL3A 2O84X 1SBPA 4EQBA 5L9MA 1A8FA 4JSOA 4N07A 4NWCA 4R2BA 3V89B 3G3IA 3TTRA 3TYHA 4PFWA 5LOMA 1MQDA 3EHSA 3KZGA 4AQ4A 5ITPA 5A5XA 1JVXA 3Q29A 3OELA 3A3UA 4QSDA 3Q26A 3H7MA 4RY1A 5CM6A 4MFIA 4F3BA 2DQVA 1NNTA 2NXOA 3PD9A 4OTEA 4YZZA 3IK6B 3OXNA 3TEPA 4OYVA 5I56A 1TWYA 4ELRA 2Z8EA 4YB5A 3A09A 4OFJA 4FECA 3Q27A 3CFLA 3HHFA 3VFJA 4GL0A 4HCYA 5H8NA 4GLIA 2D5WA 1FQCA 1OIBA 4RXLA 3KJ7A 1DSNA 1B32A 2ONKE 2RC9A 2I3WA 3ILUB 3IO6A 2OLBA 4FAJA 4O3BA 1MH4A 5K2XA 4ZS9A 4XKNA 1RYXA 5CI5A 2RF1A 3K6UA 4ZECA 3FXUA 5ISUA 1EH3A 3OD7A 4QFKA 4OESA 2HQ0A 3FUZA 1IZ1A 1II5A 1PC3A 5F1QA 2ANJA 4BDRA 3Q25A 4ESWA 1B0LA 3KOTA 1MM7A 3B6WA 4OEUA 2G29A 5FHOA 4XKQA 1I69A 2HFBA 1SW2A 1PBPA 4R73A 2PMSA 3ILTB 5CMKA 3IJXB 5TPAB 1MDP1 3DELB 2VD2A 4OERA 2NVUB 1B3GA 1B5IA 5H8SA 3N6TA 4HTGA 3RQTA 4ZE8A 4LONB 1JNFA 3FVGA 3FV1A 4KPTA 1B9JA 1DMBA 4IB2A 1IQ7A 4KYEA 1R9QA 5KCJB 3PMVA 4K3FA 5M2VA 2D21A 3IORA 1ZJLA 3LUYA 4XIGQ 3D4GA 1ZLQA 3BBRA 3FVKA 1PB7A 4IO6A 3T9HB 2Q2CA 3SETA 1USYE 4FATA 4C0RA 4GFRA 4JBZA 3KN7A 3U94A 3KN8A 4PP0A 5FHMA 4IO3A 4IO5A 3OEKA 4JDFA 4ZDMA 2XXRA 3PMXA 2UYEA 1USYH 2VD3A 3K01A 4OMBA 1B1HA 1XVYA 1BTJA 3HSTA 1SYHA 4YKIA 4R74A 3RGYA 2XHDA 4OXVA 3IL1B 3RNNA 1FQEA 4DXCA 2H25A 4L17A 3MVZA 4H0WA 2HXWA 2NUVA 3CG1A 1QULA 2F7AA 2G93A 1B46A 3T96B 2Z8FA 3MWBA 3TZAA 2ABHA 1MDQA 1OLCA 1DPEA 3UK4A 4YKKA 2UVGA 1MY2A 1IXHA 2HZKA 2A5TB 5TPAA 4GOTA 4GVOA 5I57B 3G3JA 4ELPA 4OETA 4ZZAA 2PBWA 3JYRA 4ONYA 3MZ9A 1P1NA 1M5EA 1PB9A 2CZLA 1B40A 4G8MA 1LBCA 4FE8A 3VVEA 3M3FA 5KCJA 3TQWA 2HZLA 2DWAA 4YU0A 1GV8A 3LSFB 3LBSA 1D3KA 1WVJA 4THIA 3RPWA 1OLAA 5DVJA 2DSFA 3K0VA 1MXYA 3IO4A 3O6HA 4RYAA 2DE3A 5JTYB 4GL8A 3FJMA 1LB8A 2I0BA 3GLBA 1NKXA 1JW4A 4YKJA 3KEIA 3H6UA 3CRBA 3H6WA 3KSXA 5CRYA 5H8QB 2ZYOA 2FNCA 1URSA 3MVWA 5AA1A 3MAMA 1B1XA 4LZ5A 2UXAA 3T22A 3O29A 3RN8A 2IEEA 1Y3PA 1TXFA 3Q28A 1QKAA 1UQWA 4F3SA 4EF1A 1YAEA 4G4PA 3E9XA 4Q8RA 1DPPA 4H5FA 4IGTA 2DE2A 2DP8A 3MBPA 3O66A 4FEDA 1EZ9A 2A5TA 1MQGA 1MXWA 1XVXA 3ZSFA 3VDFA 1OMPA 2O1LA 1S7YA 3RY3A 2ZNUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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