5I58B

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-004
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 76
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i58B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i58B02
1OLAA 1Y4CA 4QHQA 2DXRA 3K02A 3IJXB 1IXHA 1MH3A 3R6UA 5H8FB 2Y7WA 1Q1KA 1AH5A 4EF1A 3OO7A 4H6DA 1MM7A 1P1WA 4ZEIA 3K01A 1MG1A 3TKDA 3SEWA 2F36A 4G8HA 1PB7A 2XHDA 5AA3A 2ZNSA 1B7ZA 2G29A 1S50A 2F5XA 1GGGA 1B2HA 2RCAA 1FQBA 1J1NA 1QJMA 1O64A 1OIBA 3SETA 3MVYA 5DEXA 3FVOA 1B3LA 4C1TA 4ONYA 5H8SA 4OERA 3FVNA 3HHFA 2THIA 1HSLA 4DIGA 4EXLA 2F78A 1VSOA 5AA1A 2OJTA 2XX7A 3RT6B 4ZZEA 3QSLA 1N04A 2YJPA 2O68A 3OSQA 3CFLA 3PUXE 4H0WA 1YAEA 2AL4A 3M3KA 4F19A 4ZZAA 3TTKA 4FE8A 1A8EA 2Q9TA 3RN8A 5I57A 2QRYA 2RKMA 4HW8A 4C1UA 4DE8A 1B3EA 3VXCA 4IGTA 3PPQA 1N3WA 2DVZA 2F7CA 3TTMA 4OFJA 1YTVA 1JVYA 4G68A 3EQ1A 3C32A 1Y1MA 5L9MA 4ND9A 3LSLA 2ZNUA 4ESXA 4F2QA 5CRYA 1FTJA 1USYH 3H06B 2D5WA 3KG2A 3K6VA 3ZKLA 2Z23A 1XS5A 4YB5A 3SERA 1ZMGA 3O6HA 5BWJA 4QFNA 3MJNA 1I6BA 2FA7A 2Q8JA 3H6WA 3PU5A 1VFDA 3TELA 2Z8FA 4FEBA 2XXQA 3V89B 3QXMA 4WXJA 1N0TA 2YLNA 5FHOA 4GF8A 2H4IA 1A8FA 3RQTA 3E9XA 4E0XA 3PPRA 1RYOA 4F3SA 1SD3A 4KCCA 2ESNA 3W15C 1A7LA 3VVDA 3I3VA 1OLCA 2ONRA 4MLQA 2ANJA 1DTGA 3EN3A 2P2AA 2O69A 3VV5A 1N7XA 2UVJA 5JTYA 4Q0CA 2RINA 3IL1B 3THIA 4NF6A 2X7QA 5TU0A 3B6WA 4I62A 4R9GA 2Z8EA 3PPPA 2I4BA 2O1LA 2I48A 1MQJA 4LP2B 5I58A 5CMCA 1JW5A 2IEEA 1SQYA 4U21A 4U4XA 5CBRA 3Q27A 4GQOA 4HCYA 3UORA 1QVSA 2B3BA 1EZPA 1B7HA 1RYXA 4O3BA 4DLDA 3KGCA 3H6UA 3DP4A 2RF1A 2DWJA 2AL5A 2PBWA 3T9UA 4F3BA 1ELJA 4GVOA 2GH9A 3H7MA 4EXKA 2DP8A 5H8NB 3W9VA 5H8QA 4GXAA 3E13X 4PQJA 4QF9A 3P7IA 3FGSA 5LOMA 3RUMA 4IY5A 4GLIA 4DXUA 3T96B 2PYYA 1R6ZA 5J1DA 2XD2A 3PUWE 3TPAA 3FV1A 4XXUA 5TP9B 5KCJB 1SYIA 3Q26A 1IQ7A 1CE2A 3A09A 3TUSA 3GLBA 5DT6A 2Q2CA 3MBPA 3IK6B 4EUOA 3O6IA 4XKNA 1UIVA 4U1OA 3PUYE 5DVJA 3HO7A 5AA4A 1N84A 1URSA 5I2KA 1BLFA 3TZAA 4F3PA 1ATGA 4QFKA 3TCHA 1XVXA 1Y3NA 3ZKKA 4JDFA 2VD2A 4TQUQ 1FQCA 3HHGA 3JZJA 3SEYA 1GV8A 2PT1A 2R71A 1UTBB 1AL3A 3JV9A 4RK9A 4P11A 2V3UA 5L9OA 3MP8A 3TTLA 4NF4A 3U94A 1FQDA 3SESA 3O28A 3T93B 3MPLA 3MZBA 2NVUB 1MPBA 1Z7ME 3K6XA 1LLSA 3W9WA 2O1MA 3N94A 1B05A 1NH7A 2IA4A 4OTEA 5FTIA 2DE4A 2DS9A 4MFIA 4NWDA 3OMBA 3IR1A 3TDJA 1Y3QA 5EHMA 1Y3PA 4RK2A 4ZE8A 2P0SA 1DTZA 4F1YA 5H8HB 4RY1A 2UYFA 1QW0A 5JK4A 2ZYOA 5K2YA 4YMBA 4KYDA 3H6TA 2PMSA 3KN7A 1A54A 1MQDA 3H3GA 3SKPA 2QS4A 2HAUA 3M3LA 5HBCA 3RPWA 5ICTA 4IO4A 2DOJA 3S4UA 2QS2A 1B51A 4R6KA 5HM4B 3MW0A 4OFOA 4OMBA 3FJMA 4YB7A 3LSFB 4KR5A 4YKIA 2R6GE 4NF5A 4OYVA 3ZSFA 5CMKA 4YAHX 4R6HA 2F35A 1B5HA 4P0GA 1EZOA 1NNFA 1NFTA 4IO6A 2UVIA 4BLAA 2Y7KA 3MZ1A 4DCYA 3VLUA 2Y84A 1MXXA 1B0HA 4G4PA 1ZKBA 1LGBC 1B6HA 2REJA 1PEBA 5DTBA 3V83A 3H4ZA 5I57B 1FTKA 2RC7A 3ONMA 2HAVA 4IO2A 2DWIA 2UVHA 1URDA 1AOVA 3BKIB 4G68B 5EHSA 3L6GA 2NXOA 1XHYA 1US5A 3UK4A 1D3KA 3CVGA 4PFWA 3O9PA 2F8DA 3C9HA 3MVXA 3TQWA 1FTMA 2X26A 3O2AA 2UXAA 2Y7IA 1ZIUA 1JW4A 1MXZA 1POTA 2Y7RA 2RC8A 1ZJLA 5F1QA 4MBPA 4RYAA 3E3KA 4H65A 3O29A 5ICQA 3FJGA 2KLFA 1T0KA 1JEVA 3FV2A 2ZYKA 4RNSA 1M5CA 3OSRA 1MDQA 3VLWA 3OXNA 3GBBA 5KDTB 4AQ4A 2NWJA 3KOSA 1XT8A 2OWSA 1WVJA 3S2VA 2I3WA 1OQGA 1YPNA 3M3FA 5AA2B 3ILTB 3O97A 5I59B 4LA9A 2BJJX 3RTFB 3UA8A 2VD3A 4R9FA 4X1DA 5I56B 2GHAA 5JTYB 3KN8A 2HZLA 3F11A 5ELVA 4BDOA 1MRPA 3T9XB 1LB8A 5A5XB 4RA1A 3UIFA 2DE3A 1RKMA 3FUZA 3V8XB 1PB8A 4QSEA 1MXYA 3PMVA 1LBBA 5I2NA 2YPNA 3PV0E 2XXHA 2O7UA 4FIMA 2XX9A 4WKMA 5I58B 4WEPA 2F7AA 2ZYNA 4OETA 1UTHB 2ZMBA 3OO6A 2HCAA 2A5TA 3KOTA 5CC2A 1B9JA 1IZ1A 2FYIA 1ANFA 4GL0A 4HTGA 1B1HA 2I49A 4GD5A 4G8MA 4QSCA 4MF3A 5CBSA 3MAMA 1OVTA 4H1XA 5HPQA 1EU8A 1LCFA 2E1SA 3FASA 2QL3A 4DCXA 3I6VA 4ISUA 4PFYA 4IGRA 4HCWA 5H8QB 3KZGA 3U72A 3U93A 4PFTA 4MLVA 5H8FA 3RY3A 3N5LA 1M5DA 3OOAA 1B7UA 4Q5TA 3OEKA 1B52A 4BDRA 1LSTA 4GL8A 1LAXA 1Y9UA 2W7YA 1NL5A 3G3GA 3IOTA 1IEJA 5AA4B 3C36A 3TTNA 3K0VA 5IAIA 2VHAA 4NWCA 4EDPA 1QUIA 3CSGA 4G77A 1SW4A 3LSXA 2REGA 1FCKA 1FQAA 3RT8A 2DWHA 3SEVA 3CR9A 2O84X 2OBGA 1LAGE 4U22A 3T9HB 2QS3A 4F2OA 3MQ9A 3LR1A 2I6EA 3DLNA 3BBRA 3N6TA 4F18A 3C35A 1SYHA 1FQEA 3FD3A 3Q28A 4PFUA 1JQFA 3QYTA 2QSXA 1LAFE 4JSDA 3BFUA 3K1PA 3ILUB 2G93A 1IXGA 2QJEA 4GRKA 3DELB 3VFJA 4OHNA 2XXIA 3B6TA 3MP1A 1PBPA 3K2DA 4F3GA 3U8QA 3CIJA 2Y7PA 4DZ1A 2O6AA 3CG1A 2DE2A 1SI0A 3VVEA 1EH3A 4KCDA 1MY1A 1S7YA 4K3FA 3CSBA 2M8CA 1JETA 1MS7A 4F22A 2GHBA 3Q25A 1JEUA 3Q29A 1NH8A 4F31B 4R74A 4JWXA 3OELA 2E0SA 4Z7EA 4NF5B 4PE5B 2FNCA 4KPTA 1UQWA 3B7DA 4NF8A 4OVJA 4N07A 4U23A 3ODBA 3RNNA 2ABHA 1VR5A 4FJPA 2ZNTA 1KWHA 4RJZA 3FZVA 4NEDA 1H45A 1GVCA 2ZYMA 1B3FA 1DSNA 2HEUA 4OZ9A 1B32A 4YKPA 1UIUA 3QUFA 3ECRA 4O3CA 1IUDA 3FJ7A 4M4GA 2PX1A 3UP9A 3TCFA 4JBZA 5FHMA 3FIRA 4EQ9A 4BDMA 4BDNA 1URGA 4X9TA 3M8UA 2OLBA 1MXWA 1CB6A 5K2XA 1POY1 4I1DA 4THIA 3DP6A 2AYSA 2ALUA 4POXA 4UA8A 1WODA 1QUKA 1LFHA 3G3IA 4H8IA 4BDQA 3TODA 2PVUA 2ONSA 3H6VA 4ZEKA 5ISUA 4ZEFA 2ZXTA 4F1UA 4QFLA 2OK2A 3A3CA 3K6WA 4PETA 4GWOA 3U1OA 3G3JA 4LZ7A 2GRVA 1B46A 1YCJA 2XXXA 3PPNA 1XVYA 2V25A 1PBQA 3JYRA 3GBAA 5F7VA 2RCBA 3CG3A 2F97A 2X7PA 1OVBA 1DPEA 4FAJA 3CRBA 1NNKA 5CI5A 3MVWA 1M5EA 4QFOA 4R2FA 4JWOA 3L6HA 1VFEA 3FATA 4YKKA 4Q30B 4RPOA 4N13A 3G7WA 1OQHA 1PDAA 3K00A 5H8NA 3PGFA 1P99A 5DEXB 1LCTA 4IO3A 4XKPA 5TPAA 3FVGA 4XIGQ 4AB6A 2NUVA 2CMOA 2XXUA 3OENA 4HS7A 1I6QA 4YB6A 5TP9A 5KCJA 4H8JA 3CFXA 1B3HA 3VXBA 1IXCA 3C31A 4R6YA 1B4HA 2XXPA 3KFMA 5ITPA 5KZTA 4U4SA 4QFPA 2WKYA 3S9LC 1XC1A 4G2ZA 3D4GA 1AIVA 1H43A 1MPDA 5I84A 3VE1B 1DPPA 2DYXA 5B70A 2QMXA 5I2NB 3V5AA 2A5SA 2VP1A 2LAOA 1ZTYA 1II5A 1QULA 1B5JA 3PUVE 1UTBA 3E4RA 2Q89A 3A3UA 1FTOA 3KBRA 4R75A 4R72A 4NMYA 4X1BA 2R9JA 1O63A 4YMAA 1M5FA 1GR2A 3QAXA 4MH5A 1ZLQA 2HXWA 3S9EA 4BDLA 4ESWA 1SW2A 1TWYA 1MDP1 2VGQA 4GOTA 4FORA 2RC9A 4EF2A 3IORA 1P1NA 1A99A 1FQFA 2DSFA 1SVXB 4ZEDA 4M1VA 1XOCA 3ZS6A 1DMBA 2F7BA 3FXRA 1MPCA 2XX8A 3N26A 3QUJA 4F39A 5H8HA 1DOTA 1IXIA 2Z8DA 1Z7NE 1SW5A 3KJTA 1B5IA 3G3KA 3SEUA 3AXFA 1N7WA 4IY6A 2HZKA 2V3QA 4OWDA 5L8DA 2XXVA 2OWTA 4YKJA 3HSTA 3TFLA 1NNTA 3WAFA 4R73A 1R9QA 1LBCA 3KN3A 1JW1A 2QS1A 4KD5A 3IJOB 2V84A 3R7XA 3TEPA 1HSJA 1Y4TA 1P1UA 3IOWA 1QUJA 3MZ9A 1MQGA 4YU0A 1LAHE 2V93A 3TCGA 2DVCA 3K6UA 3GZGA 4NF6B 3CI8A 4EQBA 1NNPA 3MP6A 4ELRA 1L5TA 4ELOA 4JSOA 5BUUA 3N6UA 4XTCQ 3VDFA 3HV1A 4OQOA 3T66A 4JWYA 2UVGA 1OMPA 4KYSA 3UGWA 4KI0E 1SW1A 1LFIA 4QRZA 4X48A 4LATA 4JB7A 1PC3A 2F6PA 1WDNA 4I8CA 4WEDA 2B65A 4ZEBA 4H5GA 2Z22A 2H99A 3R26A 4Q8RA 4LQ2A 3QK6A 4OXVA 1MM6A 2VOZA 3TTRA 2OCUA 3EPEA 5JEIA 1D9VA 2I0BA 3KJ7A 4GXSB 2F6GA 4RXLA 4ZDMA 4NF8B 3T9VA 3MPKA 3WAEA 3SDFA 4ZS9A 3IO6A 1NMUA 4DXBA 2I58A 1EZ9A 3EHSA 3RGYA 3MWBA 3PUZE 4LUBA 3IB2A 4N6PA 5FTHA 1BTJA 5I2KB 5CM6A 1SDXA 3TYHA 3MC2A 4L17A 5KDTA 3PMXA 5M2VA 2GFEA 2UYEA 2O7IA 1TFDA 4KHZE 1I69A 1R1NA 4RPNA 1B3GA 2NOOA 1S9TA 2Q88A 3LBSA 4QSDA 3SEXA 1BKAA 1D4NA 5AA2A 1JVXA 5I59A 1M5BA 4NF4B 2OZZA 1P1OA 4NE4A 3U92A 4E0WA 5I56A 3HPIA 1MQIA 4FEDA 3TQLA 1Y20A 1AMFA 3K1MA 5A5XA 1A40A 2DXYA 4F29A 4C0RA 1LFGA 2H5YA 3S9NC 3B6QA 3OEMA 1H3DA 3OO8A 1I6AA 1B58A 3TMGA 4ZECA 4IO7A 5AE4A 4OEVA 3VLVA 1P1QA 1UTHA 3UN6A 4OENA 1JNFA 1MY2A 4LONB 5CMMA 3FXUA 4GFRA 3PPOA 3T22A 1N3XA 3IAZA 4KQPA 4OESA 3EHTA 1IITA 1B40A 1MQHA 3MUQA 4ZE9A 2H98A 2HQ0A 3FVKA 4DDDA 4EQ7A 1H76A 2I4CA 5TPAB 2D3IA 4IB2A 3DP8A 3PMWA 3OO9A 3I5OA 5EYFA 3G3FA 1VE4A 4G68C 3MVZA 3O66A 3RLFE 4LVQA 2CZLA 4LQ5A 1USYE 3FXQA 1B1XA 4H67A 1US4A 3IOUA 2I3VA 3LUYA 4UACA 1ZBMA 2QMWA 4XKRA 1Y1ZA 1D9YA 2DWAA 5AA2D 2DQVA 2H9BA 3H03A 4NTLA 1MXVA 3CFZA 4LZ8A 4TOZA 1O7TA 2H25A 2HFBA 3BFTA 1HSEA 1H44A 4ECFA 1MXUA 4OFLA 1B4ZA 2XXTA 2B3FA 2PT2A 4R2BA 5L9SA 2I0CA 4AB5A 3HCQA 4TLLB 1Q35A 1NKXA 4OEUA 2XXRA 4POWA 1QKAA 1FTLA 5DVIA 4H5FA 4ELPA 1QKBA 3IB1A 1PB9A 3C33A 2ONKE 4YZZA 1A55A 1BIYA 3GXAA 3O6GA 1IIWA 3IOVA 3S9MC 3RTWB 3TAJA 3QIMA 2XXYA 2F34A 5B7DA 4ELQA 5FHNA 4IO5A 1R9LA 1ZU0A 2AIXA 3KSXA 4FATA 2XD3A 3C4MA 4DXCA 4XKQA 1TXFA 3IO4A 3K1NA 4F1VA 1MH4A 1SBPA 3LSWA 4PP0A 2XXWA 3OD7A 1N76A 4GIZA 4KYEA 3KEIA 2O51A 3VVFA 1TT1A 5IKBA 4U2RA 4I9DA 3D4CA 1BP5A 5DYHA 1SI1A 2P1SA 3IX1A 4Z0IA 1TFAA 4U1ZA 5ITOA 3K4UA 1MY3A 3EHUA 3PD8A 1B0LA 3G3HA 3PD9A 2D21A 2QPQA 3LC8A 2V3TA 2A5TB 1GTKA 4O3AA 3KSJA 1MY4A 5DVFA 3DM0A 4TLMB 1MY0A 3USDA 4KFQA 4LZ5A 3IB0A 5CMBA 1LB9A 4P0IA 2Q2AA 4YICA 3C34A 4JXIA 3EF7A 4FECA 3HN0A 4G8NA 1F9BA 1FW0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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