5I59A

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx 007
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
282
structure length
262
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCVKKVICTGPHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 262
sequence length 282
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i59A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i59A02
5DEXB 1N3XA 4GLIA 3TAJA 2Q2AA 4ELQA 1JVYA 3PD8A 2QS3A 4R6HA 3HCQA 4UA8A 2DE2A 3C32A 1JEVA 4I62A 4ECFA 3VE1B 3VLVA 4P0IA 2ZMBA 3PUWE 3B6WA 2OZZA 3WAFA 1UQWA 1I69A 2Z8FA 3K1PA 3Q25A 3ZSFA 1VFEA 1DPEA 3S9EA 4JSOA 4G68B 4GL0A 1P1OA 2H25A 2ZNUA 4OFLA 4ELPA 1B40A 3N6UA 4KHZE 2Q2CA 2NOOA 2RCAA 2DE4A 3K2DA 1MXWA 1MPCA 1OVBA 3IR1A 4OEVA 4BDQA 3H06B 5B70A 1A40A 1VFDA 3T9XB 2QSXA 3CG3A 1MXVA 1R1NA 1IQ7A 2O1MA 2V3TA 3SEYA 1B7UA 3W15C 4IO2A 4U4SA 2QMWA 1QVSA 4TLLB 4KCDA 2W7YA 5L9SA 5AE4A 1N76A 3T9UA 3MVZA 3Q29A 1RYXA 3PMXA 4N07A 1GV8A 4FATA 2RCBA 3FV1A 4POWA 3HV1A 4Q5TA 3PPRA 3B6TA 3GBBA 5KCJA 1MPBA 3RUMA 5K2XA 3BFTA 4AB5A 2I6EA 2THIA 3TELA 1SI0A 1SW2A 4R9FA 1M5DA 1LAFE 1CE2A 2OK2A 4JWOA 2VHAA 5DVIA 4HS7A 3IOVA 1MM7A 4N6PA 3D4GA 1AL3A 2I3VA 4PFUA 2QJEA 1MPDA 3K0VA 1IXIA 5F1QA 3G3IA 4G2ZA 1B3EA 2I0BA 2REGA 5H8QA 3C4MA 4IB2A 1Y20A 4X1DA 2H4IA 3MVXA 2H9BA 2QPQA 1HSJA 4F3BA 1DMBA 3TMGA 2F35A 1LBCA 2PMSA 1YPNA 3OMBA 5TU0A 4DXUA 2X7QA 2QS2A 4JDFA 5I2KB 3TTKA 3OO9A 3U94A 4QFOA 3FASA 2YJPA 3FATA 3FVOA 1PBQA 1JW5A 1MQDA 4DLDA 5JEIA 3DP4A 3PV0E 2I4CA 3UN6A 1M5BA 4F2OA 3H6VA 1OVTA 1GR2A 2F7AA 3UIFA 4C1UA 3RY3A 5FHOA 5H8SA 4IGRA 2DYXA 4G77A 1TFDA 3TEPA 1MY3A 2HAUA 3U1OA 3QK6A 2RC8A 1B4HA 1FTLA 4HW8A 3SKPA 4U4XA 3FIRA 3L6GA 4F3GA 4QSCA 4QSEA 4M4GA 2Y84A 3S9MC 2XXTA 3IL1B 2WKYA 3OEMA 1SW4A 4GVOA 3IJXB 4FEDA 3HSTA 1NNFA 1QUIA 4C0RA 3IB1A 3Q28A 4E0XA 4ELOA 3OELA 5I57B 1HSEA 1XVYA 5BWJA 2RF1A 2I58A 1D9YA 1P1QA 2ABHA 3W9WA 3PUVE 4NWDA 1UTHA 1MXZA 1SW1A 1OQGA 2Y7WA 1D9VA 4LVQA 4KI0E 1XVXA 2DWAA 5I2NA 4PP0A 3KJ7A 3U93A 1B5IA 2F6GA 3VVFA 3VXCA 3KN8A 1IIWA 4K3FA 4IO4A 3LSXA 5M2VA 3THIA 1BLFA 3ILTB 4H6DA 1T0KA 4LZ5A 4H0WA 3K1NA 4DZ1A 3PMVA 4DCXA 3MPKA 4GOTA 3MJNA 3VDFA 1J1NA 2DQVA 3FVKA 1USYE 2REJA 5I59B 1SI1A 1MQHA 1TXFA 3S9NC 3FVNA 1R9QA 3CIJA 3UK4A 2XX8A 3IAZA 3CR9A 4GXSB 3FZVA 3C34A 4YKKA 3O66A 3PPQA 4NE4A 2DWJA 4G8HA 4RNSA 4RYAA 4LZ7A 1B1XA 2UVHA 3QUFA 3R26A 4F39A 2ZYOA 1VSOA 1JNFA 2QRYA 4L17A 1ZBMA 3CI8A 5JK4A 3EHUA 1PEBA 2Y7RA 4RXLA 2UVJA 3LC8A 3EQ1A 3PUYE 1Y1ZA 5TPAB 1UTBB 1POTA 3ZKLA 1SQYA 1DSNA 1RKMA 1USYH 3QXMA 1B5HA 4FIMA 3H03A 3IB2A 2XXRA 4THIA 5AA1A 1MH4A 3SETA 1MH3A 4F1YA 3MW0A 3RQTA 3IO6A 4LZ8A 1FQEA 3IX1A 1N3WA 5DYHA 1BP5A 1WVJA 3Q27A 1A7LA 2F8DA 3FD3A 2GFEA 5I56B 3U72A 2Q8JA 2A5TA 1EZ9A 5CRYA 2HEUA 4ZDMA 1P1UA 2I0CA 4ELRA 1NKXA 3FXRA 4IGTA 4BLAA 1LFGA 4OENA 3JZJA 2XXHA 3EHTA 1A99A 1B51A 3O28A 2OJTA 3FJGA 2ZNTA 4QF9A 3M8UA 3EHSA 4OESA 1I6BA 1NNTA 4YAHX 3PPPA 2V84A 3C35A 2D5WA 4ZE9A 3OO8A 1XC1A 2O7IA 2Q9TA 5K2YA 1ATGA 4XKQA 4BDMA 5ICTA 1POY1 5JTYB 4ZECA 4Q0CA 4EQ7A 4RK2A 3I6VA 4OERA 3S4UA 2HAVA 3G7WA 3RTWB 5BUUA 1LFIA 1TFAA 2XXPA 2XX7A 4NF6B 5B7DA 3C36A 1H3DA 3TCFA 2D21A 4FAJA 1GVCA 4X1BA 1BKAA 2V93A 4YKJA 4H5FA 1GGGA 5KDTB 2DS9A 1NH8A 4OVJA 4LONB 3OXNA 3USDA 5EYFA 3QSLA 5HM4B 3CFXA 3PD9A 5CMCA 3O6HA 4DIGA 1MM6A 2AIXA 1N04A 1MY0A 4R75A 3MP1A 2F6PA 3O6IA 4XIGQ 2Q88A 2F36A 2XXYA 4OWDA 5FTHA 3TUSA 4XKNA 4QSDA 4FECA 4DCYA 1Y1MA 1IITA 1B4ZA 3CFZA 1AH5A 2XX9A 5CBRA 2ALUA 3K01A 3BKIB 3RNNA 1DTGA 2X7PA 1A8EA 3E9XA 3VVEA 3H6UA 1LB9A 4R6KA 3I5OA 4OETA 2OWTA 3T9VA 3MZ9A 4MBPA 1JQFA 4FE8A 3M3KA 3SEWA 2RC9A 4F2QA 3FGSA 2A5SA 1LB8A 4C1TA 3K4UA 4MFIA 1KWHA 2I49A 2O6AA 3QIMA 2DXYA 5IAIA 2V3QA 3HO7A 3LSFB 3KSJA 1IXCA 1JW1A 4MH5A 2XXUA 4XXUA 4OFOA 3O9PA 2O69A 2VD2A 2PVUA 1YAEA 1FTJA 3B6QA 3RT8A 4LA9A 4X48A 4GF8A 1ZKBA 2ONKE 3KG2A 1S50A 1LAXA 2H99A 1MQIA 1Q35A 3DP6A 3TPAA 1LLSA 1OMPA 2E0SA 3IOUA 4OEUA 4XKRA 4ONYA 4F18A 4RA1A 4GL8A 3VLWA 3ZS6A 2FYIA 1R6ZA 4XTCQ 3MC2A 2VD3A 2PT1A 3T66A 3KOSA 3N6TA 1B1HA 2F78A 3BBRA 3CG1A 1PBPA 2O1LA 2XD3A 1NFTA 4H65A 3BFUA 3QUJA 5AA2B 3TQLA 4EDPA 4MLVA 2Z8EA 1N84A 4E0WA 2AYSA 1JW4A 3PGFA 5AA2D 4I1DA 1WDNA 4Z0IA 2DXRA 5ICQA 2XXVA 3M3LA 3OO6A 3OENA 5IKBA 4ZS9A 4P11A 2IA4A 1XOCA 1Y4TA 4LATA 2CMOA 1B3FA 4DE8A 2NVUB 1Y9UA 1PB8A 2B3BA 1Y3QA 3OSQA 3K6VA 4PFWA 2ZYKA 3FJMA 4RPOA 4M1VA 1B05A 4GRKA 4Z7EA 4JSDA 1UIUA 5FHMA 5FHNA 4OQOA 2BJJX 1B3HA 5H8FA 1B2HA 1JVXA 5AA4A 3RGYA 1D3KA 3PPNA 2XXQA 3O2AA 5DTBA 1I6QA 1FQFA 1P1NA 3DP8A 3MWBA 4NF4A 3TODA 3PUXE 1JEUA 4AQ4A 1QULA 1SBPA 5ISUA 3N94A 3GZGA 5H8HB 3UA8A 5A5XA 4DXCA 1B0HA 3AXFA 3KN7A 1PB9A 5DT6A 3ECRA 4IO5A 1O63A 1BTJA 4EF2A 3K1MA 3LBSA 4QFLA 4PFYA 1MG1A 3TDJA 5I58A 2X26A 3N5LA 3P7IA 3W9VA 1LCTA 3T9HB 1B52A 5TP9A 3KZGA 4O3BA 4YICA 2NWJA 1MXYA 5L8DA 1IXGA 1UTHB 4Q30B 4EXLA 4RPNA 3ILUB 2HXWA 4KR5A 4GWOA 1SDXA 3TCGA 5HBCA 4POXA 3VLUA 2DP8A 3PU5A 1SD3A 1FW0A 1YCJA 5TPAA 4LQ5A 4NF5A 4P0GA 3UP9A 1QJMA 3E13X 4OTEA 1O64A 3SEUA 2AL4A 4R72A 1II5A 3EPEA 3E4RA 4G8NA 4WKMA 3MPLA 1UIVA 4U22A 2QS4A 3IORA 1B7HA 2M8CA 4ZZAA 5CC2A 1M5EA 3MZ1A 4TOZA 2ZYMA 3GBAA 4WEDA 3PUZE 4F29A 2V25A 2D3IA 3G3HA 4F1UA 3VXBA 1EU8A 4UACA 1MDQA 1Q1KA 1B7ZA 2AL5A 1B3GA 3V8XB 3ZKKA 1MY4A 1VR5A 2ZNSA 4KCCA 2GHBA 4ZEKA 1TWYA 4ISUA 4ESWA 2PT2A 3PPOA 1TT1A 4G4PA 4OFJA 3HHGA 4F3SA 2GH9A 5DEXA 4ZEBA 4YZZA 1SW5A 1Y4CA 1IXHA 1A54A 3CSBA 3SEXA 4BDNA 3QAXA 5J1DA 1OQHA 3LR1A 3DLNA 1ZMGA 1D4NA 3IOTA 3K6WA 3C33A 5JTYA 4JBZA 2Z8DA 1H45A 4FORA 4KD5A 4U23A 4YMAA 4ZEDA 2F97A 5ITOA 3IB0A 1YTVA 3O97A 1RYOA 2FA7A 2YLNA 1NNPA 2F34A 4BDLA 1M5FA 3A09A 3KSXA 5KDTA 5DVFA 3MP8A 3EN3A 3U8QA 3O6GA 4G68A 1MQGA 3TZAA 2GRVA 3GLBA 4RY1A 3R7XA 4NMYA 2HFBA 3TKDA 1FCKA 2UYFA 4GQOA 2XHDA 2DWHA 3B7DA 4KFQA 4FEBA 4X9TA 1PDAA 4F22A 4LQ2A 4KYSA 2A5TB 3N26A 3OO7A 2Z22A 4OYVA 4R6YA 4JXIA 3JYRA 3KFMA 3WAEA 5H8NB 1I6AA 2PBWA 2G93A 1NL5A 5CI5A 2OBGA 4NF8B 1DTZA 4JB7A 1MXXA 4IY6A 4NEDA 4KPTA 4U1OA 2HZKA 2RINA 4IO3A 3TQWA 1CB6A 4JWXA 4EQBA 1IUDA 4LP2B 2UVGA 1B32A 1IZ1A 1MY1A 1R9LA 3RN8A 3KGCA 4ZZEA 4N13A 4GD5A 4QFNA 1OIBA 3IJOB 4DDDA 5LOMA 2P1SA 4YB5A 3U92A 2I3WA 4OXVA 4R74A 3HPIA 3ONMA 1FTMA 2ZYNA 5EHMA 1F9BA 2I48A 1BIYA 4I8CA 4ZE8A 3Q26A 3DELB 3K6XA 3DM0A 4H5GA 1EZPA 3K02A 2V3UA 4GXAA 1QW0A 2B65A 1A8FA 3CVGA 3KJTA 5CMBA 2UXAA 1MXUA 1NMUA 4U1ZA 2O51A 2R6GE 3FUZA 4MF3A 2O84X 2P0SA 4IO7A 1VE4A 3I3VA 3SESA 4F1VA 1M5CA 3CRBA 2LAOA 4NTLA 1QUJA 4QHQA 3T96B 1S9TA 3EF7A 1PB7A 1DPPA 3CSGA 3RLFE 2RKMA 4RK9A 3FV2A 3UGWA 2DOJA 1P1WA 2VOZA 2HQ0A 1LAGE 3JV9A 2XXXA 1AOVA 2DVZA 3CFLA 4YB6A 1A55A 4F19A 1LAHE 4R2FA 3OSRA 2Y7KA 1WODA 5DVJA 5I2KA 5AA3A 2H98A 3LUYA 2B3FA 2OCUA 5KCJB 4H8IA 4RJZA 3G3FA 3VV5A 1EZOA 2H5YA 1SVXB 1Y3NA 4MLQA 5AA2A 2CZLA 4H1XA 2ONSA 1B9JA 4R2BA 2OLBA 1N7WA 4YU0A 3V83A 4YKIA 2UVIA 1N0TA 2NXOA 2KLFA 2F7CA 3F11A 1AMFA 1MS7A 3T22A 2VGQA 3S2VA 3KEIA 1MQJA 3H6WA 4EXKA 3D4CA 4ND9A 4IY5A 5H8QB 5CBSA 3RT6B 2DSFA 3KBRA 1JETA 3MUQA 3GXAA 4BDOA 3L6HA 1B46A 1PC3A 1US5A 4HCWA 3SERA 3MQ9A 3MAMA 1H76A 3KOTA 3MVYA 3A3CA 1NH7A 1B5JA 1H44A 4QRZA 5I57A 4EUOA 2QMXA 4U2RA 1XT8A 4OHNA 1SYIA 1H43A 1XHYA 4PE5B 4DXBA 2HCAA 3G3KA 1LBBA 3VFJA 1XS5A 3IK6B 1FTOA 4ZEIA 3H6TA 3RTFB 3HN0A 4HTGA 5H8HA 3OEKA 2XD2A 4PQJA 3LSLA 4Q8RA 1N7XA 4TLMB 4WXJA 1L5TA 3T93B 3PMWA 4KYDA 3FXUA 3R6UA 2Z23A 4F3PA 4G68C 3G3JA 1GTKA 1O7TA 3UORA 4H67A 1Y3PA 3A3UA 4JWYA 1B0LA 4YB7A 2ONRA 4YKPA 3LSWA 3MZBA 3SEVA 1Z7NE 1MDP1 2HZLA 1DOTA 2GHAA 2R9JA 3TTNA 3IO4A 3MBPA 2PX1A 5I59A 4U21A 2ZXTA 2Y7IA 1ZLQA 1QKAA 3MP6A 2ANJA 1Z7ME 3HHFA 1FTKA 4ESXA 4G8MA 4PETA 4YMBA 2DWIA 2YPNA 4QFPA 5H8FB 1ELJA 1AIVA 2IEEA 3TCHA 1EH3A 3K00A 5AA4B 4H8JA 5FTIA 2VP1A 2E1SA 3H4ZA 1HSLA 4NF4B 5KZTA 1FQAA 4OMBA 1OLCA 3G3GA 2ESNA 5I2NB 4QFKA 3SDFA 5A5XB 2DE3A 3C31A 4HCYA 2Q89A 3O29A 4I9DA 1S7YA 1ANFA 3K6UA 4OZ9A 3FJ7A 1UTBA 3FVGA 1ZTYA 5L9OA 3V89B 5I58B 3IOWA 3H7MA 4R9GA 3M3FA 1LGBC 3MVWA 1MRPA 2RC7A 4F31B 1URDA 1QKBA 5TP9B 3RPWA 4FJPA 1NNKA 1US4A 1MY2A 1QUKA 2I4BA 5I84A 2XXWA 4R73A 2O7UA 2UYEA 5CM6A 2O68A 3FXQA 5F7VA 5I56A 5L9MA 5HPQA 4KQPA 3TTLA 1FQBA 5ELVA 1LFHA 4NF5B 4PFTA 3TTMA 1SYHA 2QL3A 4IO6A 2Y7PA 3H3GA 3TFLA 2G29A 3ODBA 4BDRA 2FNCA 1FQCA 2F5XA 3C9HA 1IEJA 3E3KA 4O3CA 1FQDA 3TTRA 1ZJLA 4KYEA 2DVCA 4AB6A 2F7BA 4O3AA 3TYHA 4EQ9A 3KN3A 3QYTA 1URGA 1URSA 1ZIUA 4EF1A 3S9LC 2PYYA 5CMMA 4TQUQ 5EHSA 5CMKA 2XXIA 4NF6A 1OLAA 4LUBA 4NWCA 3OD7A 3V5AA 2QS1A 4GIZA 2OWSA 2P2AA 1B3LA 2NUVA 4XKPA 5ITPA 1B58A 1B6HA 5H8NA 1LSTA 4GFRA 1ZU0A 1P99A 3VVDA 3OOAA 4NF8A 4WEPA 4ZEFA 1LCFA 2R71A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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