5I59B

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx 007
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
279
structure length
275
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 275
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i59B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i59B02
4G68C 3MPKA 1QULA 3R26A 4IB2A 1N7XA 3FJGA 1EZ9A 4I1DA 3VE1B 1MY1A 1N3WA 3BFTA 4DXCA 1US4A 2PT2A 1M5EA 3T9UA 5F7VA 1N04A 4PFUA 1LAGE 4NF4B 4HW8A 1BP5A 2PMSA 4JWOA 4QFLA 2RCBA 2HZLA 3K01A 4RJZA 3FD3A 2FNCA 3PMXA 3G3GA 2I4CA 3Q26A 1LSTA 4NF6B 2XXYA 1TT1A 3USDA 2HAUA 4M4GA 3EPEA 3D4GA 5TPAB 3TCGA 4P0GA 4NF8B 2Q9TA 2DXYA 1A8EA 3S2VA 1DPEA 1MPCA 1D9VA 1ZJLA 2AL5A 1B9JA 2RC7A 1B58A 4FECA 4EF1A 2F8DA 2O6AA 1SVXB 3SDFA 3QAXA 1B0HA 4H0WA 5CM6A 2ONKE 3TFLA 1IXHA 3A09A 2PT1A 3PPQA 4GWOA 3DP4A 3FATA 3OXNA 4RY1A 3EN3A 3MVXA 2RC9A 1UIUA 3G3HA 3IB0A 2VP1A 4F1UA 1M5CA 2A5TB 1OLCA 4F3GA 4JB7A 4N6PA 5I58A 3CRBA 4YMBA 5KDTA 4FAJA 1USYH 4NF5B 3KJTA 3ILTB 3K4UA 3IJXB 4IO7A 4G2ZA 4NTLA 5AE4A 4Q5TA 3C31A 4BDMA 3IB2A 2REJA 1D9YA 1BIYA 1A99A 5B70A 5H8HA 2QS4A 3O6HA 4NMYA 1LAFE 4R75A 4LZ7A 2OWSA 2P2AA 4F22A 4KR5A 2XD2A 4N13A 4F3BA 1IXIA 1F9BA 3T66A 1Y3PA 1CE2A 1PB8A 2UYEA 4LZ8A 2DOJA 3M3FA 2VOZA 5M2VA 3O2AA 1LCTA 3H6TA 3S9LC 3IB1A 4AB6A 1MPDA 5CBRA 4H65A 1B05A 4H8IA 4GL8A 3FGSA 1Y1ZA 5JEIA 2O69A 1MPBA 1B3HA 4EQ9A 1MQHA 4G4PA 5F1QA 2X7PA 3MP6A 1O64A 3S9MC 4PP0A 5HPQA 1UTHA 1LFGA 3MQ9A 1MQDA 4LA9A 1FCKA 1B1XA 4OETA 1NL5A 3VLVA 2O51A 2R71A 4KQPA 1B3LA 1BKAA 2Y84A 5HBCA 2G29A 3EHUA 3VXBA 2ZYNA 1JEVA 1DMBA 3G3KA 4G77A 4F2QA 4OFJA 1B1HA 4YKKA 3K2DA 4GXAA 3TYHA 3DLNA 4FIMA 3GBBA 4R6KA 4MLQA 4GRKA 3LBSA 3R7XA 2F7BA 3K6WA 5H8SA 3U92A 3K6XA 3I6VA 4HTGA 3RT6B 4GF8A 3T9VA 4H1XA 3FIRA 1QKAA 2E1SA 3THIA 2HCAA 1SYIA 3KEIA 3OOAA 4U23A 1FQCA 3VXCA 3IO4A 3QXMA 4U1OA 5K2XA 1B6HA 3T22A 2UVIA 3LUYA 2H5YA 2IEEA 2XD3A 3U1OA 2F35A 5EHSA 1ZLQA 4DE8A 3DM0A 4RXLA 1P99A 1JW1A 1FQBA 4OQOA 2QPQA 3VVEA 2H9BA 3F11A 3K02A 4MH5A 3HPIA 1VR5A 1MXVA 1S9TA 4OFOA 1OQGA 1I69A 1D3KA 2DE4A 2V3QA 5I58B 1ZIUA 2HAVA 4DXBA 5KDTB 4F2OA 3O97A 1R9LA 3CFXA 5IKBA 4OMBA 1JETA 5L9MA 3B6WA 3RN8A 1QUKA 3MAMA 3QUJA 3K1PA 2I4BA 5CBSA 1N84A 2YLNA 3JYRA 4LUBA 1NNFA 4R9GA 2DWIA 4RK2A 5H8HB 1LLSA 3SEVA 5AA2D 2VGQA 2I0CA 3WAFA 2HEUA 4ZEKA 2DWAA 1SW5A 3CG1A 1XVYA 3SEXA 2ZNSA 3KG2A 1NNKA 3B6QA 2F78A 1I6AA 4OWDA 3EHSA 1Y3NA 1JNFA 3FJ7A 2QMWA 1FW0A 4YAHX 1N7WA 4YMAA 1N0TA 1P1UA 4KCCA 2I6EA 4XKNA 3OSRA 3FVGA 4U22A 3V83A 1B5HA 1MXZA 1URDA 1OIBA 3DP6A 3H06B 4YU0A 4ZEBA 3OEKA 3V89B 3QUFA 3E3KA 5L8DA 1FTOA 3GBAA 1MM7A 1YAEA 1OVTA 3OO9A 1B52A 1DOTA 1TXFA 5AA2A 4OZ9A 1B46A 1SW2A 4EQBA 3QYTA 1UTHB 2NWJA 4EQ7A 4G8MA 1H43A 3TEPA 2DWHA 1JW5A 1VE4A 3OSQA 5I2KA 1D4NA 2QMXA 4QFOA 1OQHA 3MZ1A 1B3EA 5I56A 2DS9A 2DVCA 2FYIA 1PDAA 2XXXA 4OEUA 4IY5A 4X1BA 5H8QA 3PPNA 3MVZA 2NXOA 4YKJA 3FVOA 1M5BA 4IO3A 5H8NA 3IOVA 1B4ZA 3UORA 3CSGA 1MQJA 1SW1A 1B7UA 1B5IA 1A55A 3TCFA 4AQ4A 2H98A 3RNNA 4ECFA 3PUWE 2F97A 3HHGA 5ITPA 2ZMBA 1N76A 2ZYOA 1AMFA 3GXAA 1Y3QA 2H25A 3RQTA 3FV2A 1QUJA 4QF9A 2E0SA 1AOVA 5DVJA 4F18A 3ONMA 4XIGQ 4R2BA 3H6VA 4F31B 4OTEA 4GD5A 3OO6A 3TODA 3IX1A 3PPPA 3TMGA 3ZKKA 2VD2A 4EXKA 1RYOA 1DSNA 3RUMA 2F6PA 4LQ5A 3W15C 3VVDA 1US5A 4UA8A 1Z7NE 1H3DA 1MXYA 4ELPA 4KFQA 3H03A 4F3SA 1AL3A 2G93A 1LBBA 3A3CA 5AA4A 2YPNA 3M8UA 2GHAA 1LB9A 2OJTA 1GGGA 1SQYA 2GHBA 1IUDA 1MS7A 5FTHA 1IXCA 2Z8DA 3E13X 1B4HA 3IOWA 3KN8A 3U94A 2I48A 4OYVA 1HSJA 3H3GA 3MUQA 3VDFA 4DLDA 5LOMA 5I59A 3MJNA 3S9EA 4DZ1A 4THIA 5AA2B 2OK2A 2F7AA 1FQEA 3BFUA 1B0LA 4IO2A 1M5DA 3DP8A 4Z0IA 4DIGA 5FHNA 3T93B 4MLVA 3U93A 2Z8EA 4G8HA 1N3XA 4OFLA 4YZZA 2X7QA 4FEDA 4R9FA 4BDOA 4QSEA 3VVFA 5I2KB 1JVYA 4ZE8A 2O7IA 4PETA 2Z22A 3PU5A 2OBGA 2XXIA 3PV0E 5I56B 1TFDA 2B65A 4KPTA 2AYSA 4WEDA 4F29A 5DYHA 3KSXA 5H8QB 3HV1A 5L9OA 1DTGA 2GH9A 3VLUA 1B40A 3MWBA 1YPNA 2AIXA 3TZAA 4E0XA 1IXGA 4JSDA 3TTLA 3S4UA 1WDNA 4Q0CA 5H8NB 5I84A 2VD3A 3SEUA 4HCWA 1WODA 4RPNA 2RINA 3O6GA 4IO6A 2Y7KA 1JEUA 4NE4A 4H8JA 1AH5A 2I0BA 3SERA 3T9HB 3O9PA 3KBRA 4ZZEA 1URGA 1T0KA 3T9XB 3A3UA 5DT6A 4C1UA 3L6GA 4QSDA 3IJOB 4EDPA 3W9WA 4M1VA 1IIWA 1PB7A 1B2HA 3G3JA 2DE3A 1B7HA 3PUXE 3O29A 2DXRA 2O1LA 4YB6A 2RKMA 1B3GA 4MBPA 3MZBA 2RCAA 3OENA 3H4ZA 2OCUA 4FE8A 3CI8A 4KHZE 4U4XA 1FTMA 2AL4A 3RPWA 3RTWB 3CVGA 3B6TA 2QSXA 5L9SA 4TQUQ 4ELQA 5AA3A 4GQOA 4YB5A 4ELOA 4LP2B 2M8CA 1R6ZA 2Y7PA 2F6GA 4H5FA 1EZOA 5DTBA 1Y1MA 4OESA 1XOCA 3VFJA 2NVUB 5AA4B 2XX9A 3D4CA 3O28A 3E4RA 1BTJA 2Z23A 2XXRA 3N5LA 3G3IA 4ZDMA 4X9TA 2XXWA 3TCHA 4ZEFA 1LFHA 1GR2A 1SD3A 4PFYA 2ESNA 2XX7A 1P1NA 4X48A 1ZMGA 3M3LA 1H76A 4L17A 1Z7ME 4BDQA 1URSA 1UTBA 5I59B 3JV9A 1NKXA 3E9XA 2DSFA 3C32A 3MPLA 3RT8A 1QW0A 1M5FA 5HM4B 4C0RA 1VFDA 3CR9A 4O3BA 4R6YA 1P1WA 2XXHA 4O3CA 3KOSA 2V3TA 3CFLA 3K1MA 1MDQA 3UN6A 3OD7A 2CZLA 3RTFB 1PBQA 3TUSA 1QJMA 1MY0A 3B7DA 2F5XA 1NFTA 4IGRA 1CB6A 4R2FA 4P11A 1QUIA 3N6UA 3PD9A 1AIVA 1P1QA 4KYEA 4ND9A 4I62A 3IOTA 3IAZA 1MY3A 3FVNA 4XTCQ 3FXQA 3KFMA 3C36A 3CG3A 3O6IA 3TKDA 1BLFA 4U2RA 2QL3A 3PUZE 5K2YA 2UXAA 2RF1A 1OLAA 3SEYA 4IO4A 3K00A 2NOOA 5AA1A 4QSCA 5DVFA 1GV8A 3OO8A 3I5OA 5H8FA 1MDP1 4QRZA 5FHOA 1Y4CA 3K0VA 4WKMA 4HS7A 2Q88A 3C35A 5TP9A 4EUOA 3V5AA 4KI0E 2D5WA 1LCFA 2DVZA 2RC8A 1SI1A 2A5SA 1IZ1A 3SETA 2XX8A 4R72A 4F3PA 2I3WA 4RA1A 1MXXA 3QSLA 4OHNA 4OXVA 5FTIA 3LSFB 1LAXA 1I6QA 5ISUA 1MG1A 4P0IA 1QKBA 2DYXA 4YB7A 4K3FA 4U21A 3TQWA 4UACA 1JW4A 4XKPA 4DDDA 2I58A 5EYFA 1Q1KA 4I8CA 2UVGA 1B3FA 5EHMA 4DXUA 3UA8A 2DWJA 2F7CA 3I3VA 3W9VA 3RLFE 2D3IA 3OO7A 3IL1B 3FVKA 3G7WA 2XXTA 3QK6A 1DPPA 1HSLA 5A5XA 1R1NA 4Z7EA 2ANJA 3TTNA 1UTBB 4F19A 3LSWA 5CMKA 2W7YA 4POWA 5ICQA 3BBRA 1OMPA 4OEVA 1H44A 1Y20A 4WEPA 3ZSFA 5JK4A 3C9HA 1NNPA 4JSOA 1PB9A 4OERA 1H45A 3EQ1A 4ZEIA 2V25A 4YKIA 4DCXA 4ISUA 3ODBA 1FTKA 5ITOA 1OVBA 1SW4A 2REGA 3K6UA 1B7ZA 1MXWA 3BKIB 3HHFA 4AB5A 4ONYA 4NWDA 4POXA 2YJPA 1Q35A 2Q2AA 3PMWA 4NEDA 3VV5A 3TAJA 4LVQA 1LFIA 3FASA 2P0SA 1ZKBA 2HZKA 4FATA 1MH3A 4HCYA 4OENA 1MQIA 4YKPA 5BWJA 1FQDA 2DP8A 1L5TA 3SEWA 2ZXTA 4TLLB 1UIVA 4O3AA 3OELA 3OEMA 4Q8RA 2XHDA 3UGWA 1NH8A 1MY2A 2O7UA 3FXUA 4ESXA 1NMUA 2I49A 1A8FA 4EF2A 2ZNTA 3PPOA 4BLAA 2Q89A 1Y9UA 4G68A 3H7MA 1P1OA 3FXRA 2ONSA 1DTZA 4JWYA 3FUZA 3HN0A 5H8FB 4X1DA 2GFEA 3FZVA 5CI5A 4BDRA 3MW0A 4RNSA 2Q8JA 5TP9B 4IY6A 3TTKA 1S50A 4FEBA 1SDXA 3Q25A 1RYXA 4PFTA 3KN3A 3T96B 3TDJA 1R9QA 2XXVA 2UYFA 3CFZA 4U4SA 2HXWA 3P7IA 3TPAA 1MRPA 2V93A 5KCJA 5ICTA 4LATA 1XS5A 3S9NC 2D21A 4TOZA 3ZKLA 1TFAA 3IO6A 5DVIA 3N6TA 3GZGA 4ZZAA 1ATGA 2O68A 2LAOA 2NUVA 3ECRA 1II5A 1UQWA 3VLWA 4I9DA 4GIZA 1FQAA 4GLIA 4Q30B 1PC3A 1YTVA 4OVJA 2Y7IA 3LR1A 5A5XB 2FA7A 5I57A 1ELJA 4NWCA 3WAEA 3HO7A 3L6HA 4QFNA 5DEXA 4XXUA 1J1NA 3CSBA 3MVYA 2V84A 2R9JA 2XXQA 3PPRA 3C34A 1GTKA 1LAHE 1ANFA 1MQGA 5CMBA 2OZZA 3UP9A 4R6HA 4ZE9A 2ZYMA 4U1ZA 4ELRA 4JWXA 5B7DA 2PYYA 2GRVA 2I3VA 4FORA 1JVXA 3PD8A 3U72A 3PMVA 4RPOA 1SI0A 2HQ0A 2Z8FA 3HCQA 4N07A 3MC2A 5JTYA 2UVJA 3K1NA 1MY4A 5FHMA 2QS3A 5IAIA 2OLBA 3R6UA 2B3BA 4DCYA 2B3FA 1RKMA 2PBWA 5TU0A 3KN7A 2R6GE 3KGCA 3RGYA 4EXLA 1IEJA 3H6WA 3PGFA 3FV1A 2X26A 1WVJA 5I2NA 2PVUA 3KZGA 2O84X 1S7YA 1A54A 1IITA 4LONB 3SKPA 4GVOA 4QFKA 4ZEDA 3Q29A 1QVSA 3HSTA 1XHYA 4G8NA 3N94A 1NH7A 3QIMA 4G68B 1Y4TA 1EZPA 4R74A 2DQVA 3IR1A 2THIA 4BDNA 3KOTA 2Y7WA 5CRYA 3FJMA 3U8QA 4GL0A 5J1DA 2PX1A 1ZU0A 5KZTA 4GOTA 1JQFA 2QS1A 4KCDA 4GFRA 4JBZA 4QHQA 2F34A 1GVCA 5CC2A 2ZNUA 1I6BA 3JZJA 2V3UA 3K6VA 3O66A 3G3FA 1HSEA 2WKYA 2QJEA 3IORA 2QRYA 1SBPA 3RY3A 1YCJA 3Q28A 2KLFA 2VHAA 3EF7A 1POTA 1PBPA 4MFIA 4RK9A 5BUUA 5KCJB 2H99A 3AXFA 4NF4A 4WXJA 3MBPA 3Q27A 1NNTA 2P1SA 2QS2A 3DELB 4ZS9A 3IOUA 2IA4A 3LSXA 3GLBA 1FTJA 3SESA 3MZ9A 4H6DA 1PEBA 4NF6A 2ABHA 3MP1A 5TPAA 1XC1A 3KJ7A 4GXSB 4NF8A 4RYAA 2ALUA 3LSLA 4IO5A 1KWHA 4PQJA 2DE2A 2XXPA 4JDFA 1LGBC 5CMMA 1MXUA 3CIJA 3TTRA 5I57B 4XKRA 4F1YA 5DEXB 2H4IA 5ELVA 4R73A 4JXIA 4KD5A 3TQLA 1POY1 4QFPA 3N26A 2Q2CA 1LBCA 4ESWA 4H5GA 1IQ7A 2OWTA 3MP8A 3OMBA 4IGTA 3PUYE 3V8XB 1TWYA 2A5TA 1MH4A 3C4MA 2HFBA 2XXUA 5JTYB 3UK4A 1B5JA 3IK6B 1A7LA 4LZ5A 4C1TA 1O7TA 3PUVE 4TLMB 2ZYKA 4NF5A 1VFEA 3UIFA 4H67A 1ZTYA 1VSOA 4BDLA 4E0WA 3H6UA 1O63A 1A40A 1EU8A 4YICA 2BJJX 1XT8A 2F36A 1SYHA 5I2NB 3TTMA 1B32A 2CMOA 3MVWA 4XKQA 4F39A 1XVXA 4ZECA 2UVHA 3EHTA 1EH3A 4LQ2A 4KYSA 4PFWA 5CMCA 3C33A 4F1VA 3TELA 1LB8A 1USYE 1B51A 1ZBMA 4MF3A 3KSJA 3M3KA 3ZS6A 1FQFA 2Y7RA 1MM6A 1FTLA 3ILUB 4PE5B 4FJPA 3LC8A 2O1MA 4KYDA 2ONRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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