5I84A

Structure of the xanthomonas citri phosphate-binding protein phox
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
DVTGAGASFIYPVMSKWSADYNAATKKQVNYQSIGSGGGIAQIKAASVDFGSSDAPLKPEELAAAGLAQFPSVIGGVVPVVNVPGIAAGTLKLDGKTLGDIFLGKVSTWNDPAIAALNPGVKLPEGKITVVHRSDGSGTSFNFTNYLSKVNPDWKGKVGEGTAVQWPTGIGGKGNEGVAAYVKQIKGGIGYVELSYALQNKMAYTAMKNAAGKFVQPSDETFAAAANSADWGTAKDFYLVMTNAAGDNAWPITATNFILVQKKPKNPAGLKNTLEFFRWVYTKGDAQAKQLDYVPLPDTLVTQIEAYWAKNLPH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Phosphate-binding protein PstS
publication title A gene duplication in phosphate-binding proteins from pho regulon of Xanthomonas citri: functional and structural studies
rcsb
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
total genus 81
structure length 314
sequence length 314
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i84A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i84A02
4EF1A 4HS7A 3C9HA 2THIA 5FTIA 3BFTA 3CFLA 2OCUA 1VFDA 1SW2A 1EZOA 2QMXA 3MP8A 1LFHA 1UIUA 1Y4CA 5F1QA 3TKDA 4JWOA 4H8JA 3RQTA 2RC9A 4ESXA 5I56A 2KLFA 2Z22A 4R72A 3I5OA 5KDTA 3DP4A 1IUDA 4F19A 4RK2A 1A8EA 2PVUA 1EZ9A 3I3VA 2DVZA 1AL3A 1B40A 5L8DA 1DTGA 5A5XA 2CZLA 3FXQA 1ZJLA 2V93A 1B3LA 4X48A 5CBRA 4U22A 2XX9A 2Q2CA 1YAEA 4POXA 1B7UA 3IOWA 1ZLQA 2GH9A 3LSLA 2DE4A 4H8IA 3O2AA 2W7YA 3TTRA 5IAIA 4F18A 1B3GA 4DCYA 4BDQA 5H8SA 1FTKA 3K1MA 4IO2A 2V3TA 1KWHA 1MY0A 1SYHA 3OEMA 2F8DA 3VLVA 3WAFA 3IO6A 3VVDA 1TT1A 3UK4A 1A8FA 4JWYA 4LQ5A 3E4RA 3MPKA 4JSOA 4R2FA 1BP5A 4ELPA 4YB5A 3KOTA 4PQJA 2I49A 3VFJA 1FTJA 5AA2A 3MZ9A 3K4UA 5TP9B 4ISUA 4QFKA 3TTLA 4H67A 4F2OA 4LATA 3A09A 5L9SA 3C36A 5I59A 4LZ8A 1XS5A 1VR5A 1OQHA 1BKAA 3PU5A 4IO4A 4ZEDA 4WEDA 1B0LA 3C35A 3PGFA 1N7XA 4R6HA 1LAFE 5H8HB 1MQHA 5DEXA 2QRYA 1B7ZA 2QS2A 3N94A 1Y9UA 1NL5A 3HCQA 1MXVA 4EDPA 4DIGA 2HQ0A 4I62A 1UTBA 3RUMA 4QRZA 1MPCA 4FAJA 1FTMA 5AA1A 2UYFA 3O9PA 1OLCA 2I6EA 1B52A 2VOZA 1N0TA 2VP1A 3G7WA 4G68B 3K6WA 4GVOA 1URDA 1Q1KA 1H3DA 1XVXA 4FEDA 3SEWA 4DXBA 3MVZA 3OXNA 5I2KB 1MM6A 2OJTA 3EPEA 3RT6B 2VHAA 3U8QA 1AH5A 5EHMA 4LUBA 1P1WA 3QSLA 2HAUA 1YTVA 3GBBA 1GGGA 1I6BA 4RY1A 4F3BA 3MP6A 3R7XA 1D9VA 4Q0CA 3O97A 3VLUA 1US5A 1WVJA 4G77A 4NF6B 3CG1A 4F39A 5FHOA 3UP9A 1OMPA 2XD2A 1T0KA 1MRPA 5K2XA 3IJOB 3QIMA 1MXUA 2Y7KA 1O63A 3S9LC 4PE5B 3DP6A 3H7MA 1RYOA 2RC7A 1NNTA 2H4IA 1SW1A 5K2YA 1VSOA 2P0SA 3H6VA 3B6TA 1NMUA 4KPTA 3OO7A 3T9UA 5I84A 1N3WA 2DWAA 4GL8A 3IB1A 1LLSA 4YKKA 4NF4A 4P0GA 1B6HA 4QFNA 1MDP1 5L9OA 2AYSA 2B65A 1EU8A 2DWIA 3Q25A 1ZBMA 3T93B 3UN6A 5B7DA 3C4MA 2CMOA 5HPQA 1D3KA 4GIZA 2F36A 3TQLA 4QFLA 2REJA 5EHSA 1B5IA 3E3KA 3K0VA 3SDFA 3RNNA 1P1OA 3ONMA 4ZEKA 2Y7RA 1OLAA 4OETA 4KYDA 3TTNA 2DYXA 3ZS6A 1B7HA 4X1DA 5JTYB 1MXXA 4NF8B 4KD5A 5ELVA 1B9JA 4JBZA 2NVUB 2A5TB 2YJPA 1XVYA 2E0SA 1AIVA 4IY5A 4YAHX 2B3FA 4OFOA 1I6AA 3VE1B 1NNPA 4AB5A 1LFIA 2O7IA 4ZE8A 4RYAA 1I6QA 1MY3A 2RKMA 3LSWA 2H99A 2UXAA 5J1DA 4QSEA 1PB9A 5H8NB 4E0WA 1M5CA 3T9XB 1DSNA 5B70A 4E0XA 5TPAB 4GLIA 4M4GA 1LCTA 3K6UA 1TFAA 3FVNA 3ECRA 3KEIA 3C32A 4BDOA 3FZVA 3DP8A 3IX1A 4HW8A 2DOJA 3PMVA 1MQGA 4C0RA 4DDDA 3OOAA 1FQAA 3IOTA 5CMCA 2XHDA 2I0CA 1Y4TA 2XX8A 4RNSA 3H4ZA 1B3EA 3FJ7A 3FJGA 3G3GA 3CFXA 4WEPA 3UORA 1MPDA 4FIMA 5HM4B 4OFJA 1M5BA 4GL0A 4EQ7A 1WDNA 3IL1B 3E9XA 2AL5A 2XXWA 3HN0A 4G8MA 3C34A 1H76A 1BLFA 4K3FA 2LAOA 1DPPA 2Q88A 3V8XB 4KR5A 1A40A 5DVJA 3TQWA 2F78A 3U72A 3IB0A 3AXFA 3SESA 4OXVA 4U21A 4U23A 3OEKA 1H44A 3BBRA 1M5DA 4HCWA 2Z8EA 3IOUA 2AL4A 4MBPA 4JSDA 3S2VA 5AE4A 3EHSA 4I9DA 3SEUA 4L17A 4OEUA 5AA2D 5AA4B 3FD3A 3MWBA 4TLLB 2I3WA 2I58A 1Y20A 2VD3A 3EHUA 3FUZA 4RA1A 2F6GA 4U1OA 4ZEBA 3ODBA 1MXZA 1FQFA 3QUJA 4EF2A 4AQ4A 5CBSA 1MY4A 1R9QA 1YCJA 3T9HB 3LC8A 1QULA 1O64A 2H9BA 4Q5TA 4QSCA 3G3FA 3QXMA 4Q8RA 5CI5A 3W15C 3OENA 4Z0IA 4NE4A 3K2DA 4JB7A 5CC2A 1QVSA 1JW1A 1SI1A 1LFGA 1AOVA 2X26A 3R6UA 1RYXA 1SW4A 2D3IA 5ICTA 4QSDA 3FVOA 1LAXA 5I58B 3ILTB 4N07A 3TFLA 1B05A 3IOVA 1B4HA 5IKBA 1POTA 1DOTA 1R1NA 3R26A 2ONRA 3PPNA 2UVIA 3O6HA 4R74A 1HSJA 1FW0A 4KYSA 2ALUA 2ESNA 3FVGA 2WKYA 3G3IA 3T96B 2DE2A 3RPWA 3D4CA 1SD3A 4ESWA 3F11A 5H8QA 1GR2A 1SDXA 2F35A 2HZLA 3CVGA 4MH5A 3CR9A 2PMSA 2Y84A 5KZTA 5I2NB 1MM7A 5H8FB 4UACA 1IEJA 3PMWA 3N6UA 4F1YA 3USDA 3MAMA 4U4XA 1ZMGA 2REGA 2QJEA 3FATA 3OO6A 3L6HA 4LP2B 3LSFB 2XXUA 1OVTA 5I56B 4YMAA 4TOZA 5KDTB 4IO5A 4YU0A 3V5AA 1B32A 1IXGA 4EXLA 3DM0A 5A5XB 5I57A 1SVXB 1FTLA 1LCFA 4R2BA 4I8CA 3Q28A 1IXHA 4P11A 5CMKA 2RF1A 1LBBA 1QUIA 1TWYA 1Y3QA 4KYEA 3OMBA 2QPQA 1IXIA 2XXVA 3TUSA 1JW4A 1NH8A 4ZZAA 2F7AA 2F5XA 4ZEFA 4O3CA 2DSFA 1QUKA 3CSGA 4XKQA 4IGRA 1MQIA 2H98A 4WKMA 5JEIA 5BWJA 4F1UA 2QS1A 2ZYMA 3GBAA 2V25A 1NFTA 5KCJA 2UVHA 3PPQA 2R9JA 2Z23A 2AIXA 3KJ7A 5AA2B 4JXIA 4O3AA 2HAVA 1EH3A 2I4BA 3OSRA 1SQYA 1B4ZA 3SERA 3V83A 1PEBA 3UIFA 5I59B 3K6XA 4XXUA 4POWA 1D4NA 2RC8A 1XHYA 1A55A 4G8NA 2I0BA 3THIA 1MXWA 2QS3A 2PT1A 2I48A 4GQOA 2RCAA 2QSXA 4YKIA 4H6DA 5DEXB 4EUOA 1IQ7A 3Q29A 2UYEA 3MBPA 2Q8JA 1UTBB 1Y3PA 3VXBA 4F31B 3CIJA 3ZKKA 2NOOA 2OLBA 2ZYKA 3L6GA 3V89B 5M2VA 2ONSA 4PFUA 1F9BA 3VVFA 4NF5A 2PX1A 4IB2A 4LZ5A 4H65A 4R73A 2GFEA 3TMGA 1GTKA 2ZNSA 4PFWA 1QUJA 1PB7A 3LBSA 3GXAA 3N6TA 3H03A 4RPNA 1NKXA 3TTMA 3W9VA 3T9VA 4NTLA 4IY6A 1S7YA 5F7VA 1PBQA 4ONYA 4AB6A 4Z7EA 3G3JA 2V3QA 1EZPA 1A54A 2G93A 5FHNA 1FTOA 2H5YA 3TTKA 2XXQA 2HZKA 3S9EA 2Z8FA 1XC1A 5BUUA 4XIGQ 2QS4A 3KN8A 3KG2A 4I1DA 5EYFA 1JNFA 4ZDMA 2XXTA 3HSTA 4OWDA 4R9GA 2DXYA 3KOSA 3MVXA 3PPOA 4OVJA 4LA9A 4O3BA 4XKRA 4LVQA 1JEVA 1SBPA 1UTHA 1WODA 3C31A 3IR1A 3IORA 2XXIA 2DWJA 3HPIA 4MFIA 3PPRA 4EQBA 3N26A 4MLVA 1LSTA 2O84X 3G3HA 1LAGE 3IAZA 4N13A 3U94A 3H06B 2F7CA 1AMFA 2ANJA 1LBCA 2FNCA 4FJPA 3N5LA 1YPNA 2F34A 3K1PA 1SYIA 2VD2A 4F3GA 4OYVA 4ELOA 4BLAA 3HHGA 1N3XA 1FQCA 3MUQA 3ILUB 3SETA 1IIWA 3PPPA 4ZECA 3IO4A 3LSXA 1Z7NE 4PP0A 3FASA 4U4SA 2B3BA 4R6YA 2IA4A 1FQEA 4NF4B 3PMXA 4OQOA 3B7DA 3VLWA 1ATGA 4TLMB 3T22A 4OTEA 1B51A 4ZS9A 3U92A 1P1UA 2NXOA 3TCHA 1DTZA 2X7QA 3EQ1A 2OWSA 3OO9A 3S4UA 3TEPA 4NWCA 4YMBA 3M3LA 1B46A 4F3PA 3FXUA 1L5TA 3VDFA 1H43A 3K1NA 1MH3A 5TP9A 3MVWA 2Q2AA 4KHZE 4QHQA 3K00A 2HXWA 1MQDA 3U93A 1QKBA 4R75A 4DXCA 4G2ZA 2OWTA 3KFMA 2ONKE 4DLDA 5ITOA 2ZNUA 1MDQA 4F2QA 1B5JA 2OBGA 3RN8A 3MVYA 2ZYOA 4R9FA 2ZMBA 3PV0E 4LQ2A 1M5EA 4JWXA 4G8HA 3T66A 4LZ7A 3DLNA 2ABHA 4UA8A 1FQDA 3MJNA 2Y7IA 3SKPA 1CE2A 1MG1A 4RJZA 4LONB 1II5A 4P0IA 1XT8A 2O69A 1Q35A 1P1QA 2R71A 4C1UA 1LB8A 2X7PA 3RTFB 4G68A 1MQJA 1MY2A 3A3UA 3M3FA 4YKJA 3MZ1A 3CG3A 3JZJA 4YZZA 1J1NA 4OHNA 4DZ1A 5I2KA 1RKMA 4EQ9A 2I4CA 5CMMA 2F7BA 2O7UA 1QKAA 1IXCA 4KQPA 3EN3A 3CFZA 3OO8A 4PFYA 1QJMA 1UQWA 2PT2A 4OMBA 3O6IA 2E1SA 2O68A 4DXUA 1A7LA 4M1VA 4R6KA 1USYH 3PUVE 2GHAA 2O6AA 1JQFA 2VGQA 3QK6A 1LB9A 1BTJA 3H6WA 4NF6A 3O66A 4U2RA 5AA3A 1B1HA 1CB6A 2Y7PA 3QUFA 1POY1 3GZGA 3TODA 4GF8A 3HV1A 2OZZA 1MH4A 2DS9A 4GXAA 3MW0A 3FGSA 5CRYA 2UVGA 2ZXTA 3H6UA 3FXRA 1JEUA 5ICQA 5TU0A 4QF9A 3KN7A 4H5GA 3BKIB 4F29A 3D4GA 3PUXE 3CRBA 3UA8A 2DQVA 1JVXA 1NH7A 4G4PA 4IO7A 3FVKA 3HHFA 1QW0A 1NNKA 3PD9A 3LUYA 1URGA 4F3SA 1B3FA 3EHTA 3S9MC 4XKNA 3QYTA 5L9MA 3OELA 1ELJA 1FCKA 2IEEA 4YB6A 1LGBC 3U1OA 1PC3A 1HSLA 4RXLA 3K6VA 3VXCA 1TXFA 2HFBA 4WXJA 3H6TA 3HO7A 3KN3A 1BIYA 3KGCA 1GVCA 2H25A 2D5WA 2YPNA 2NWJA 1N7WA 4KCCA 3G3KA 4OEVA 3RGYA 5CMBA 4OFLA 4ELQA 4GXSB 3S9NC 3DELB 4U1ZA 4KI0E 4X1BA 3TYHA 3PD8A 3OSQA 3CI8A 4ZEIA 5JTYA 4NF8A 1FQBA 4Q30B 2XD3A 4ZE9A 1P1NA 3B6QA 1N84A 3MZBA 4H0WA 2F97A 2P2AA 3B6WA 1B2HA 2A5TA 1US4A 3FIRA 3M8UA 2XXXA 3MC2A 2QL3A 3EF7A 4HTGA 4RK9A 3KBRA 3PUYE 2V84A 3KSXA 2DVCA 5JK4A 3O6GA 4NEDA 1B5HA 1NNFA 2O1MA 4IGTA 2HEUA 3H3GA 4OENA 4X9TA 2XXHA 4FATA 3FJMA 2XXRA 5CM6A 3O28A 1ZKBA 1P99A 3TCFA 4OZ9A 5H8NA 1IZ1A 4IO3A 3WAEA 2V3UA 4DCXA 4NMYA 4TQUQ 5DVIA 5H8QB 4XKPA 4C1TA 3SEYA 1M5FA 1JW5A 5TPAA 4JDFA 3Q26A 4OESA 2F6PA 1HSEA 4QFOA 5DT6A 1LAHE 1S50A 1R9LA 2FYIA 5DYHA 5FHMA 3OD7A 3CSBA 1ZU0A 1Y1MA 1R6ZA 2A5SA 3C33A 3IK6B 3VV5A 2D21A 2OK2A 1VFEA 1SW5A 1H45A 2BJJX 4FE8A 1ZIUA 3P7IA 2Z8DA 1OIBA 1S9TA 4G68C 2PYYA 4PETA 4EXKA 3GLBA 5I57B 1Y3NA 3JYRA 3VVEA 3MP1A 2ZYNA 3PUZE 1Y1ZA 4FORA 4OERA 4RPOA 4ECFA 3RY3A 5LOMA 3TDJA 1SI0A 3A3CA 1USYE 2R6GE 3M3KA 4BDMA 1JVYA 3TZAA 1PB8A 1A99A 2PBWA 2GHBA 2QMWA 3FV2A 4BDLA 4BDNA 4DE8A 3LR1A 2NUVA 4FEBA 5AA4A 3TPAA 3KJTA 5KCJB 2M8CA 3RTWB 3TCGA 1XOCA 1DPEA 3IJXB 3KZGA 1PBPA 3TAJA 3K01A 2Y7WA 4N6PA 2DP8A 3O29A 4GOTA 1PDAA 3MPLA 2O51A 1N04A 1D9YA 3KSJA 2Q9TA 1GV8A 2DWHA 4HCYA 3BFUA 4FECA 2XXYA 3ZSFA 3TELA 4MLQA 4H5FA 2YLNA 1MS7A 3UGWA 2G29A 2ZNTA 4GRKA 2HCAA 1N76A 3MQ9A 5DTBA 4KFQA 1JETA 3IB2A 4YKPA 3Q27A 2RINA 3SEVA 4PFTA 5ISUA 4F1VA 1TFDA 1MPBA 2GRVA 4ND9A 5I58A 3RT8A 5ITPA 3RLFE 1UIVA 1VE4A 1IITA 3PUWE 3JV9A 1DMBA 1O7TA 1B3HA 4THIA 3QAXA 4QFPA 4GWOA 4NF5B 4YB7A 2DXRA 5FTHA 4H1XA 3ZKLA 1URSA 1ZTYA 4GD5A 4BDRA 2FA7A 4KCDA 3E13X 4F22A 1Z7ME 1ANFA 4MF3A 4ZZEA 3FV1A 3W9WA 1MY1A 2Q89A 2DE3A 1I69A 1MXYA 2XXPA 4XTCQ 2UVJA 1B0HA 2I3VA 5HBCA 4ELRA 3I6VA 2RCBA 3SEXA 1B58A 3K02A 4NWDA 5H8HA 1B1XA 4YICA 4IO6A 1OVBA 2O1LA 5DVFA 4GFRA 5I2NA 5H8FA 1OQGA 2P1SA 1UTHB 2XX7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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