5ID2A

Asymmetry in the active site of mycobacterium tuberculosis ahpe upon exposure to mycothiol
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
154
structure length
153
Chain Sequence
VMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGIQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Putative peroxiredoxin Rv2238c
publication title Redox chemistry of Mycobacterium tuberculosis alkylhydroperoxide reductase E (AhpE): Structural and mechanistic insight into a mycoredoxin-1 independent reductive pathway of AhpE via mycothiol
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis h37rv
total genus 49
structure length 153
sequence length 154
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5id2A00
5J5NA 1ZGNA 3TOTA 3MAKA 3LFLA 3DVXA 4XCSA 1M9AA 3P90A 4TXVA 5DQSA 1A2JA 3FR3A 3C71A 3I9V2 3E3EA 2IMIA 2GTUA 5GSTA 1I9DA 1B9YC 3TJGA 2HSHA 4ML6A 3QD9A 4NHWA 1GTBA 3D22A 3MWHA 4KA0A 2DJKA 2C8UA 3N9JA 4GWRA 4TN8A 2LRNA 5GAND 4FH8A 2C3QA 5B8AA 1K3LA 4HEA2 4GSSA 2DJ2A 3FY7A 1EZKA 1SL2B 1BX9A 1CQGA 1AIUA 1PN9A 2HLSA 2CVKA 4DVCA 3HDCA 3S9FA 2FNOA 4MF5A 2YZHA 2WULA 1XWAA 2H01A 2YWNA 2HXKA 2AHEA 3WGDA 4G19A 2H72A 2X8GA 1UVZA 2P5QA 4JBBA 4LLRA 2H74A 2TRCP 1YKAA 4TR1A 1C72A 3DVWA 1YEXA 1F6MC 2O89A 1JHBA 4POKA 1VF3A 2GT5A 1OYJA 3NZNA 4N30A 5ID2B 3O6TA 5F0GA 5CRWA 4N11A 1SYRA 4F82A 6GSUA 3KP9A 2BTOT 1YF1A 3CYNA 4POLA 5DBQA 4XS4A 1ZMAA 1O7UA 3W6GA 4K2DA 1HD2A 2H30A 4OMVA 3LG6A 3CBUA 5DDLA 5DAKA 1GH2A 4IP1A 3FHKA 1LBKA 3D4MA 3UBKA 1X5EA 5EVOA 3GX8A 6GSTA 2JZSA 2LNSA 1A2MA 1R5PA 2DJ3A 5DCGA 2JZTA 5AIVA 2GZPA 4O32A 2GLRA 5E4WA 2VM1A 3CSJA 5LD0A 4Q5QA 2VL9A 3NOFA 3PR8A 2OACA 2VL3A 4I2UA 5IO0A 5EPFA 3QFAC 1LU4A 5J9CA 3IC4A 2VIMA 4GCIA 1CQHA 1LJRA 1PA3A 5KN1A 4OCEA 5B7CA 3P2AA 2YJHA 3D5JA 3WGXA 1GSEA 1W89A 3GH9A 1JZDA 1WIKA 3L9VA 3Q18A 1KNGA 3FKFA 4NV5A 5G30A 4ZXGA 4MH3A 1V98A 3KXOA 2MMZA 3EVIA 2AV4A 3IK7A 2I9HA 2WB9A 5IOWA 2HYXA 3CMIA 3H1NA 4ZB6A 3M8NA 2H19A 4X1UA 5ECPB 2FWEA 1ZZYA 2IFQA 3UAPA 3H93A 4XS1A 4MLYA 2HRNA 3GKKA 2XHFA 1SD8A 2LJKA 2K18A 1M2AA 1UN2A 4PXOA 3CRTA 4TR3A 1F9MA 2LTKA 5ELGA 1QGVA 2H0IA 2GDRA 5CREA 1OC8A 2Z9SA 2YN1A 5IPGA 4Q5RA 2B1LA 1SK0A 4G10A 4F0CA 2AUVA 1G6WA 3P8WA 1B48A 2RLIA 1O8XA 4TR4A 2H1AA 2YZUA 3LORA 3FW2A 5H5QA 3G7YA 1SKRB 2HRFA 2J9HA 4ACSA 2CZ2A 2IN3A 4MJCA 5KN3A 2XBIA 4ZL8A 4EXJA 3HVXA 1TTZA 4FO5A 3VI7A 3KJYA 4ZILA 1K0OA 2B6MA 4RUVA 3HA9A 2LRTA 4KW6A 4V2NA 2PN8A 1XOBA 1YZXA 1MDKA 4K7OA 2GQKA 2OA7A 2P5RA 3ZYWA 1N8JA 2VCQA 3F4RA 10GSA 5ABRA 2YWIA 1ZL9A 3KM6A 5JCWA 3WD6A 5B8BA 1GSFA 2FGXA 5IOXA 3ZREA 4IHUA 2VCVA 2N5BA 2X8HA 5HFIA 4NPBA 3G7JA 3MNGA 2HI7A 1QMVA 2IMDA 3F9UA 2A2SA 4KUNA 4KSMA 1OE8A 3E0UA 5A4UA 3VPQA 4YQUA 5GZZB 1THXA 4L5OA 2NDOA 1Z7PA 3IA1A 3VURA 1J9BA 2H71A 3HVVA 2WFCA 2YV9A 2PBJA 4ULXA 3FZ5A 8GSSA 3CSHA 13GSA 1GUKA 2CX4A 4TXOA 4EDYA 4V2LA 1YJ6A 2RM6A 1JZOA 3VK9A 1KTEA 1GLQA 4K8MA 3HD5A 3UVTA 5DAKB 18GSA 1JZWA 5IO2A 1TI1A 1A23A 14GSA 1X9WB 2E2MA 1YQ1A 1U88A 2WZ9A 2N5FA 4YAVA 5AIXA 1ERVA 2G0FA 4Q5FA 2YWMA 1XVWA 3QPMA 1TI3A 1URMA 3M1GA 2NVLA 3VWWA 1K3YA 5JWQB 3U5RE 5ECKB 1UC7A 3IPZA 2LEGA 2ZNMA 22GSA 3GMFA 6GSYA 4I97A 5CRGA 4WEYA 2HZEB 3F63A 4BVYA 3F3QA 1XW6A 3EWLA 4KDUA 3Q6OA 1RK4A 1K0BA 2CT6A 3GV1A 1Y6EA 3ZZXA 3HYPA 5HR0A 5ECHB 2FD3A 4JRRA 5D9TA 2ALBA 2ZCTA 5ECIB 3DGQA 1F2EA 3WT1A 2DJ0A 1TXXA 3GNJA 1EP7A 1PX7A 1TU7A 3IE3A 2VL2A 1GTIA 1BAYA 2EIQA 4K6XA 4HZ2A 5KEJA 1OVNA 4OFMA 5F8BA 4I2TA 3GTUA 3KMOA 3PGTA 5H5RA 2IFQB 11GSA 1K0DA 2DJ1A 1XWKA 3KIJA 1YY7A 4OCFA 2QKEA 4PNFA 1UA5A 2X64A 2LS5A 3KCMA 1QQ2A 2N5AA 3U6VA 2YWOA 5IIZA 5DCHA 1KEBA 1RQMA 3KP8A 2MMAA 1SJZA 4MJBA 2OBKA 2BMXA 2H1DA 1Z7RA 2CQ9A 4KB3A 4MJAA 2JZRA 5JWOB 2MBSA 1ZOFA 3ERGA 2C0DA 3IXRA 1VRSD 3TJBA 1F37A 1U3AA 2FWFA 5KN2A 1Z6NA 2P0GA 2VO4A 2QGVA 3I43A 3P7XA 2JL4A 2HFDA 1OE7A 2CAIA 3QR6A 4YQVA 1E6BA 1EGRA 5A4WA 2IMKA 4ILFA 1V9WA 2DJJA 4MPGA 1N2AA 2L57A 4F0BA 2E7PA 2EIRA 2DLXA 1DE1A 2GSQA 5AN1A 2ES7A 4MCUA 2E2GA 2RUFA 3TKSA 3VWUA 3Q19A 2RIIA 3CXGA 2CZ3A 2CVBA 5IPHA 3EC3A 1JLVA 4PUFC 1U6TA 4MK3A 2GGTA 3TKQA 4KDXA 2M72A 1E2YA 1WP0A 1GSYA 3KEBA 3G9BA 1O81A 1KBNA 1QFNA 5ECQB 1XIYA 1GNEA 1O8WA 3D4TA 2GQLA 3TUEA 1BEDA 5IMCA 2YJ7A 1ON4A 4HDEA 1O6JA 5IMVA 2AYTA 2LV3A 2X8CA 1AW9A 3APQA 4MPFA 4K0GA 1EV9A 2VCXA 2DIZA 5CRHA 3BCKA 3QDNA 2KUCA 4IJIA 2H76A 4MMMA 1U87A 2B3SA 5D73A 4PQIA 1NSWA 4PX1A 5EY6A 2HNLA 1XWCA 3L9SA 1B4PA 17GSA 1FVKA 1PL2A 2HE3A 2V41A 3BBYA 2DIYA 1S3AA 2GVPA 4TXOB 3L78A 1JZRA 4IELA 2QC7A 4F2IA 4HU7A 2KP1A 4GF0A 1YDKA 5INYA 3ZMLA 3CTGA 2AAWA 3IHQA 2IMEA 3LEFA 2YANA 3QMXA 3GKXA 1YEPA 5GAPD 1HQOA 4GQFA 5AISA 2PPTA 5ECNB 5IMZA 5ECMB 4EC0A 2LJAA 4L0UA 2ZUPA 3A2VA 2GQMA 2E0QA 3IOSA 1FB6A 4I5QA 4I6XA 1K0MA 3ZMKA 2VD1A 4D73B 1V2AA 2PWJA 4LMVA 1PX6A 4QL7A 2DMMA 7GSSA 3GIXA 1XZOA 1MD3A 4PNGA 2FHEA 1OC9B 3F8UA 4PQ1A 4KX4A 4XTSA 1MDIA 3LQ7A 1HYUA 2CVDA 4HI7A 1S3DA 12GSA 3PH9A 1G0TA 2VUPA 1TP9A 3H79A 4NWYA 2K8VA 1M9BA 4KE3A 5F07A 3QCPA 1SU9A 3UBLA 3ZIVA 2HSYA 4AJ8A 4MZCA 4RI6A 2OE3A 5GSSA 1SJ6A 1XCCA 2C80A 4YAPA 2AJQB 1PKWA 5COHA 3IDVA 3A2XA 4MP4A 1Q4JA 3EU3A 1V57A 2R3XA 2VCZA 4E8EA 3DYRA 2F51A 2H0GA 4ZB9A 3ZL5A 3LYKA 2C0FA 4V2MA 3D21A 2VLUA 4Q5NA 4TOPA 1TK5B 1HNCA 1EOGA 3HJOA 1GNWA 1PGTA 3IBHA 4NAXA 1FB0A 2F3MA 2XBQA 4TW5A 2OADA 3LYPA 3DRNA 2V2GA 1TK8B 3W8SA 1GSUA 4GLTA 2X99A 6GSVA 1GP1A 4HQZA 2V1MA 1SKWB 4BA7A 1NM3A 3C8EA 4XRDA 3TGZA 3QFBC 1R7HA 2B5YA 5HR2A 2YCDA 2KOKA 2R4VA 3D6IA 1SL0B 1PQNA 1A8YA 4F03A 3I69A 4AGSA 2L6DA 3L9UA 5D96A 2EIOA 1HNBA 1XXUA 2GSSA 1EP8A 2I4AA 1XW9A 4NXIA 4HJ2A 2LNTA 1BYEA 2MMOA 3ERFA 1EOHA 4GRFA 3DIEA 2B5EA 2P31A 2PERA 5FHIA 3ZFLA 4HS1A 2WCIA 4IP6A 4KCEA 2YPMA 2YOIA 1R4WA 3WGEA 5H5SA 1TJDA 2XC2A 4IVFA 3TRPA 2BJXA 4E8HA 3A3TA 3HCZA 4JE1A 5J3RA 1ERWA 3HZ8A 3MSZA 4HQSA 2VM2A 1OC3A 3TKPA 4O5RA 1ERUA 1T1VA 3BOAA 1EEMA 3VFIA 2L5OA 1GLPA 2H70A 5HFKA 3KH7A 3QAVA 1YF0A 4MABA 1GRXA 2FLSA 2OJLA 4ISDA 3FR9A 1TU8A 2H75A 3FZ4A 2LSTA 1R5AA 2JSZA 1X0RA 1BJXA 2O8VB 2NPBA 5A4VA 2H6YA 5J9BA 1M7TA 1ST9A 3DWVA 5HR3A 3ISOA 5J41A 2KP2A 2YP6A 4LA1A 1TRUA 1Y25A 4O7HA 3KD0A 4TR1B 4GXZA 1T00A 1G7EA 5CRDA 1A24A 3N5OA 1A0FA 5JWRB 2DBCA 2L4CA 2MYGA 3GKMA 3GA4A 1K0AA 1TRWA 4H86A 2L4QA 1QK8A 5DJLA 1T8EB 1M2BA 2LQOA 3TKRA 4PQHA 2GT6A 4GQCA 1SD9A 5ECSA 4XS4B 4POBA 2GZYA 1TOFA 1XWGA 5D9VA 2REMA 1O85A 3FK8A 3TJKA 4WKWA 3RHCA 3BD2A 3GL3A 4OWYA 2I3YA 4BPYA 4RI7A 4AF2A 2JADA 1FG4A 2H6XA 2JU5A 4FYUA 4IKHA 3LGCA 1AQXA 4QL9A 1B4QA 4DSQA 1GTAA 2WGRA 4EVMA 4EE0A 4N0ZA 2WS2A 3V1WA 4X0XA 3ME7A 1DUGA 3O3TA 1XPVA 3F0IA 1GUMA 1J08A 1NHYA 4EKZA 3HJPA 1I5GA 5F06A 2VAFA 2M80A 5D93A 1YKCA 2OBIA 4J57E 1MEKA 1M99A 3J7Yk 4KSOA 3EYTA 3ME8A 1SK1A 1B8XA 2HZFA 5CO3A 3F4TA 3C73A 5IM9A 3O76A 4FIWA 4YQMA 3TRQA 4IGJA 4CW9A 2K8SA 1H75A 3TJJA 5ECRB 2MBTA 2LKUA 3UMAA 4POMA 4N0VA 3HKRA 1PD21 2I81A 3W8JA 4EO3A 4XS6A 4IQ1A 2PU9C 3EU4A 4L5LA 2AB6A 4ECIA 3C7MA 2VCTA 3TJFA 1A0RP 1GSQA 2H1GA 2TRXA 3L0HA 3EINA 4LL1B 2MZCA 3BJ5A 5IMFA 2VOCA 3SBCA 2WJUA 6GSWA 2HT9A 4LL4B 1ERTA 2L6CA 4JR6A 2PVQA 2F9SA 3VWVA 5G5FA 3QOUA 3ZFBA 4JEDA 2IIYA 5D9XA 2FWHA 4PUAA 1Z9HA 3IK9A 3GUSA 3GFKA 3LSZA 2LQQA 2GSTA 2WRTA 2LUSA 1XVQA 1V58A 4NV2A 4KH7A 1VF2A 1TDIA 2C0GA 5FWGA 4K7NA 2H0HA 3OR5A 1AQVA 1Q98A 1A2LA 1GSDA 3FZAA 4I8BA 4RQXA 4YH2A 1AC1A 1XOAA 1V40A 1PRXA 1MTCA 2LJRA 3GKNA 1X5CA 3G7IA 1EWXA 3F4SA 4TKYA 3FZ9A 5IMAA 5CP1A 2XPDA 1THOA 3DEXA 2RM5A 5J4UA 4K7IA 1FVJA 4KGIA 3ED3A 3ZTLA 4ZBAA 4AJ7A 3FYGA 2R5GA 5JCUA 3LJRA 3US3A 3FRCA 3GN3A 1SL1B 4GTUA 4G2EA 1BQ7A 4JR4A 3ERWA 2C3TA 1AAZA 4GSTA 1VF4A 4DSSA 3UIWA 1K3OA 4WR4A 4AJ6A 1SENA 3LWAA 1BG5A 2PVOC 3R2QA 1VGLA 1OKTA 5G5EA 4BWSA 2R2JA 3NIVA 2GZZA 5DALA 2IWTA 4G9HA 4Z7XA 3VLNA 6GSXA 5IMDA 3ZVJD 1GSSA 1OKDA 2VLVA 2C4JA 3H4KA 4ECCA 4ID0A 3C1SA 3RDWA 4WETA 5IQYA 3I6AA 2OE0A 2PUKC 3IRAA 1USBA 1QXHA 4HJMA 4L0WA 1SKSB 2LRCA 3Q74A 1GUHA 2YNXA 1F3AA 2D2ZA 3ZLPA 1HNAA 5ECLB 4BL7A 1XW5A 2WDUA 4MF7A 4XHMA 5JCGA 5B6NA 3QAGA 3M0FA 1XBSA 2A2RA 1JLWA 1GWCA 2G2QA 4MA9A 1X9MB 5F05A 2DMLA 2H1BA 3VI5A 1JFUA 3F3RA 3TKSE 20GSA 3WT2A 2FCHA 3RHBA 5G1KA 3GTUB 3APOA 4FYBA 1GTUA 1M0UA 2FWGA 4EDZA 4O92A 3CRUA 5CAXA 4EF0A 19GSA 3KTLA 3IR4A 3IAS2 2IL3A 3TRXA 2HZEA 5C00A 4QQ7A 2CV4A 1FHEA 2H66A 1TRSA 5A5KA 3AY8A 1WRYA 2M46A 3FR6A 3RBTA 2IJYA 5HFGA 4ZBDA 1GULA 1FW1A 3F6FA 4MH2A 5ECOB 2I1UA 2H8LA 2IPAA 2C3NA 5LNKe 5HR1A 4IS0A 2DC5A 5ENUA 1NW2A 2MMNA 1TK0B 1Z5YE 4HUAA 4V1Ap 2O7KA 1FO5A 3QAWA 3HXSA 3KZQA 1SK2A 2V6KA 2R6KA 3GH6A 4MDCA 2FA8A 2VD0A 1FOVA 2QSIA 4HOJA 3DKSA 2NTOA 2H6ZA 3A2WA 2XPEA 4K1FA 5B6MA 5HQPA 1H4OA 4OO5A 2B7JA 1X9SB 1G6YA 4WF5A 4WR5A 3M3MA 4ZBBA 3WYWA 1B9XC 3EMPA 2VCWA 1T7PB 4IW9A 3KH9A 2ON5A 2R37A 4OFTA 5D9WA 4P3YB 3LXZA 3TB2A 5G2ZA 1RW1A 9GSSA 3DMLA 4V1Ag 2CAQA 4HU9A 1ML6A 3UL3A 2GS3A 1O73A 3EMXA 4IBPA 3UOMA 4PGTA 1G7OA 1XWBA 2CX3A 1AUCA 1VF1A 3C1RA 3J7Yb 1ABAA 3VWXA 2B5XA 1A8LA 4DSSB 3DXBA 4WBJA 1X5DA 4BWQA 4MZWA 2FY6A 2PGTA 4OD7A 5ELAA 4BVXA 1IYHA 4WXTA 2L59A 2OE1A 3LXTA 4N10A 3GL5A 4X43A 3HVSA 3CTFA 1ZCPA 4WBRD 5DALB 1WMJA 3EURA 1DSBA 3M9JA 4MF6A 1OAZA 3H8QA 4DEJA 5G1LA 1TW9A 4ECBA 4KNDA 4EUYA 1ZYQB 2JSYA 5DJMA 1FAAA 2VL2C 1WPIA 4J2FA 2KLXA 2ON7A 3RPNA 3GX0A 2RUEA 3RAZA 5DQYA 4GSNA 4JZQA 3JCML 3DD3A 4PURA 3EE2A 5KN0A 5CYYA 2YV7A 4ZL9A 1PKZA 1PMTA 4ZIJA 2B7KA 2JACA 4OFNA 4TR0A 3ZRDA 4EL1A 1NHOA 4HZ4A 1EV4A 4IQAA 1ZYEA 2EC4A 4NMUA 2A4VA 5CNWA 3GHAA 5DVBA 5C04A 3ZIJA 2GSRA 4XRAA 5EL8A 1T3BA 2H73A 4KAEA 1PSQA 4K0NA 1T4ZA 1Z3EA 2V6OA 2C0EA 3BCIA 5E59A 4NHZA 5LCZA 2O87A 1K0CA 5ID2A 4J56E 3M9KA 3RPPA 4D73A 2F8AA 5FT3A 4LMWA 1K0NA 1ILOA 2FUG2 1WE0A 4XIHA 2OKAA 2CA8A 4FYCA 4ZL7A 1WOUA 1F3BA 4CHSA 3HY2A 4K9ZA 3VPTA 3TCOA 4OO4A 4IN0A 1OC9A 4TVEA 3TKSC 3SWLA 3APSA 4TRXA 1SJIA 2O85A 2VLTA 4MZBA 1U3IA 1MDJA 4MJEA 1S3CA 1T4YA 3ZVJA 3F6DA 3HHVA 2FA4A 4RQRA 3TDGA 1WJKA 1TRVA 3MDKA 3FEUA 1IYIA 3GSTA 4IJ3A 1ACVA 5G31A 3GRXA 2TIRA 3PINA 2K6VA 1J0FA 2K9FA 3TOUA 1MD4A 2B1KA 5AGYA 4ECJA 5L71A 3UJ1A 3D0ZA 2IMFA 16GSA 1R26A 5D8IA 2PMTA 2L5LA 1M2DA 1EEJA 3IV4A 4DSRA 3GURA 3HJMA 2J23A 3CSIA 3A5WA 1EGOA 3UEMA 1TKDB 2DSAA 1AXDA 1GL8A 4KCAA 4ZB8A 1Z6MA 4JU5A 1DE2A 1DBYA 3UARA 4CDOA 2NBSA 3GYKA 4L8EA 4WF4A 3KGKA 6GSSA 1QUWA 4KDYA 3L4NA 4F9ZA 1W4VA 2V32A 1WWJA 1SYXA 3KTBA 3IAM2 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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