5ID2B

Asymmetry in the active site of mycobacterium tuberculosis ahpe upon exposure to mycothiol
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
HPMVMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGICQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Putative peroxiredoxin Rv2238c
publication title Redox chemistry of Mycobacterium tuberculosis alkylhydroperoxide reductase E (AhpE): Structural and mechanistic insight into a mycoredoxin-1 independent reductive pathway of AhpE via mycothiol
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis h37rv
total genus 54
structure length 157
sequence length 157
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5id2B00
3VWVA 1XWKA 1XZOA 3NOFA 2E7PA 2IL3A 4HDEA 2F51A 1R5AA 3GN3A 4X43A 1V40A 3TB2A 5H5RA 2C3QA 3VLNA 5ECQB 4DSQA 4OD7A 3FEUA 1T1VA 5HFKA 2PBJA 3GIXA 2BJXA 3N5OA 4MH2A 3QMXA 5DALB 1UVZA 5CAXA 5ID2B 2K8SA 2HZEA 4OO4A 5GAND 4IW9A 1U88A 1XWCA 1K3LA 3O6TA 5GSTA 1T4YA 4N0ZA 5A4UA 5LD0A 3UVHA 1OE8A 3DGQA 4H86A 3ZMKA 4O92A 2ZNMA 3TJGA 2C0DA 4L0UA 5HR2A 3Q6OA 4GQFA 1SL1B 3P90A 4QL7A 1ACVA 3FRCA 4I2TA 3C8EA 2LQOA 5CO3A 2CAIA 2HLSA 2H30A 4F82A 4MCUA 3BCIA 3BOAA 5ELAA 2VLUA 4CDOA 1AXDA 4KDYA 4J2FA 5JCWA 2ON7A 2E0QA 3GV1A 3P8WA 2HE3A 1XVQA 1KBNA 1Z6MA 4JR6A 5HR3A 2L6DA 3VI7A 4KGIA 2YWOA 3KEBA 3TKSA 3IAS2 19GSA 4TVEA 4TR4A 5D9VA 17GSA 1ZOFA 5J3RA 4IGJA 2XBIA 1U87A 3V1WA 2ZCTA 5F8BA 3CBUA 5D73A 2V6OA 5GSSA 1B4PA 3WD6A 2YV9A 3PR8A 4PQHA 2IMDA 5L71A 2IMFA 3H93A 2X64A 4ZL8A 2WZ9A 1BYEA 2H6YA 1NM3A 3EE2A 2IMIA 5AN1A 2J23A 1AQWA 2O85A 1F3BA 20GSA 2MMAA 2HRNA 2EIOA 3E9JB 3HVSA 1EP7A 1TRWA 3EURA 2PGTA 3F6FA 4OFMA 1F9MA 4G19A 5DCHA 3U5RE 3UBKA 2PU9C 3TRPA 4NMUA 4LA1A 5D9XA 4TRXA 1T7PB 4GSTA 3GL3A 1M2AA 2WFCA 4NV5A 2C80A 3HVXA 5B6MA 4O5RA 1YY7A 1PA3A 1XIYA 4EE0A 4G10A 4MF6A 4IHUA 4IQ1A 4CW9A 4RQXA 3LYKA 2FUG2 5ECHB 3UVTA 10GSA 1A0RP 1OVNA 1TKDB 1VF1A 5HFIA 3SWLA 4LL4B 1TU8A 3J7Yk 2X8HA 1G7EA 1J0FA 5B7CA 4PXOA 4KDXA 2I3YA 2XPEA 1TK0B 2M72A 1LBKA 2JADA 4P3YB 2V1MA 1TRSA 1K3YA 1NHOA 2P5RA 3IE3A 4MJBA 2F3MA 4KSMA 2B1LA 4K2DA 5DAKA 3F4TA 1QUWA 5ECPB 4F2IA 1ILOA 5F07A 1Z9HA 2GTUA 3GKMA 1FHEA 1ERVA 2CAQA 3LGCA 2DJ3A 4GWRA 2MMOA 2PMTA 2O87A 1YKCA 1GNWA 4MZWA 5F0GA 3IPZA 2YPMA 1K3OA 3L4NA 2YANA 1M9BA 4G9HA 4KCAA 2GQMA 1B9XC 4ZILA 1BAYA 1GH2A 3CRTA 1GSYA 3HVVA 4WBJA 3CSHA 3BD2A 3C1SA 3K8NA 4WXTA 2WS2A 1SJ6A 3KMNA 2VO4A 3L9UA 3I43A 4KUNA 4XRAA 4YH2A 5D93A 1PMTA 2NVLA 2MYGA 4L5LA 4AGSA 2C0GA 2VCXA 1IYHA 1WJKA 2FA8A 2IMEA 1XW6A 4BVXA 3EU4A 2MBTA 4TR1B 1OYJA 3M9JA 5INYA 2A2SA 3F6DA 1GTBA 1R26A 2F8AA 2JSYA 3S9FA 1YDKA 3IK9A 1Y25A 3DIEA 1JHBA 1X5CA 2RUFA 4Q5RA 3D0ZA 2R3XA 2H1DA 1URMA 1RQMA 3KTBA 5J9BA 5H5SA 3EMPA 4NWYA 1V57A 1FO5A 5IOWA 5H5QA 1UA5A 1Z7PA 3IV4A 1E2YA 3DEXA 1XOAA 5JCUA 4O7HA 1SYRA 2Z9SA 1T00A 3ZYWA 3BBYA 5C04A 2IPAA 1EP8A 4J56E 4MF7A 3QFBC 2FNOA 2CX4A 1TK8B 5D9TA 1PX6A 3L9SA 5JWRB 6GSUA 1AIUA 3M0FA 4K8MA 3WT1A 5COHA 4JEDA 1MD3A 3C73A 4I8BA 3UAPA 3APOA 4PQ1A 1A2LA 1BG5A 2WB9A 3BJ5A 5KEJA 4PURA 2X99A 5B8AA 4TKYA 3TJFA 1U6TA 2XBQA 1K0CA 1T3BA 2GSQA 4YQUA 1O8XA 3TCOA 3LJRA 3MNGA 4KSOA 4D73B 2WGRA 1AAZA 1SD8A 1A0FA 3APSA 3GTUB 4POBA 4HJ2A 1M2BA 3GYKA 5IOXA 1AW9A 5D9WA 1CQGA 4F03A 5J9CA 5HFGA 4K0NA 1O8WA 2LKUA 3DMLA 4I2UA 1C72A 4ACSA 4EO3A 3ZMLA 2DIYA 3KH7A 2C0FA 3OR5A 5GZZB 1TU7A 1M99A 1NW2A 4DVCA 4TR1A 1K0DA 2OA7A 1TI1A 2HRFA 1FOVA 1R4WA 3WGEA 4PNGA 1HYUA 1WMJA 4GTUA 4KNDA 2E2GA 1WPIA 3RAZA 3GMFA 4DSSA 2P0GA 1B4QA 4ZBBA 5J41A 4IQAA 3RHBA 1NSWA 1QMVA 3UEMA 4ZB9A 1SL0B 18GSA 4JR4A 1DUGA 1EGRA 4L8EA 3QAGA 5G1KA 1K0AA 1PKWA 3ZVJA 2VM1A 2WDUA 3ZVJD 4KW6A 1MD4A 1YEPA 4YQVA 1N8JA 8GSSA 3UOMA 2B5EA 2RUEA 3QAVA 1GLQA 3C1RA 2KUCA 2ZUPA 1ST9A 2GT5A 3Q74A 5CRHA 1SKWB 3M3MA 3ZLPA 5A4WA 1XBSA 2G2QA 3CTFA 1PX7A 2AV4A 2VAFA 2H1BA 2TRCP 4HZ2A 1THOA 4KB3A 2I4AA 1JZDA 1GUHA 3UBLA 2PUKC 3HCZA 2GT6A 3ZIJA 4XTSA 1JLWA 5DVBA 1XPVA 2GLRA 4MMMA 3VPQA 4AJ6A 3US3A 4JRRA 3RHCA 4OWYA 1K0OA 2I9HA 3PGTA 4WKWA 2L59A 1O81A 1VRSD 4EC0A 3C7MA 3IRAA 2DMLA 4GRFA 1Z7RA 4FYUA 4GXZA 2C3TA 1QGVA 2I81A 1WRYA 1EV4A 3ERWA 2PVOC 3GTUA 2L6CA 3GFKA 4FO5A 2XHFA 3FZ5A 3G9BA 4TXOB 1X9MB 2C8UA 3GSTA 4HEA2 4EXJA 1THXA 3TJKA 2L57A 1M0UA 3IR4A 3U6VA 2K18A 2YV7A 5KN2A 3ME7A 2YJHA 3HA9A 1G6YA 2B7JA 4X0XA 5ECIB 3RBTA 2VOCA 3KXOA 1SJIA 3EWLA 4E8EA 1PL1A 1Z3EA 4HU7A 1O73A 3ZZXA 3KCMA 4Q5QA 3A2WA 3ISOA 1SD9A 1J9BA 2IFQB 4XS6A 5C00A 2AYTA 4K0GA 4XCSA 1Z5YE 4WF4A 1YQ1A 3DKSA 2VL3A 2CZ3A 4WEYA 1MTCA 14GSA 2CA8A 2V6KA 1G6WA 3IDVA 2WCIA 4GSSA 2O7KA 2AJQB 5LNKe 3HDCA 3FKFA 2J9HA 2N5FA 2MZCA 1K0MA 4GLTA 1JZOA 1R7HA 3HJMA 1F3AA 2NBSA 1USBA 2YZUA 3GL5A 1XWGA 2B5XA 1SK2A 4HQSA 2KHPA 5AGYA 1AUCA 5AIVA 2LV3A 3F3QA 4JU5A 4ECBA 2NTOA 6GSVA 1WWJA 2H6ZA 5ECSA 2I1UA 1DE2A 2CVDA 4QL9A 5G5FA 1GSQA 4TW5A 6GSXA 2K9FA 1GRXA 2HI7A 2V2GA 2VL9A 4I6XA 4K1FA 4NV2A 3UMAA 3LORA 4JE1A 3VWUA 5ELGA 1TRVA 2RIIA 5DALA 5CREA 4NAXA 4MJCA 3D4TA 5CRDA 1W89A 5ID2A 2FWGA 2H76A 3WGDA 3KD0A 4HOJA 3P7XA 5EVOA 7GSSA 2GZPA 1XWBA 2H73A 2GQLA 2L4QA 2YCDA 3TRXA 3Q18A 2H74A 1Q98A 2LUSA 4XRDA 1U3AA 1N2AA 3KP8A 2EIRA 5CYYA 3VK9A 2OE3A 4MPFA 1PD21 2CVBA 3RPPA 2CX3A 1XFLA 3HJOA 5DQYA 1G7OA 3FZ4A 1AQVA 3A5WA 1PGTA 1ABAA 1NHYA 2RM5A 3GURA 4ZIJA 2MMZA 3IHQA 3QAWA 3FY7A 4XS4B 3GH6A 2KP1A 3TKRA 3A3TA 4HI7A 2H19A 2GVPA 1B9YC 4ZL9A 5GAPD 3EC3A 5F05A 3LSZA 3E3EA 1OAZA 5HR1A 1FVJA 1YKAA 1X9WB 3C71A 4NPBA 2JL4A 1G0TA 3HD5A 2IFQA 1ERTA 2RLIA 2FLSA 2FY6A 4V1Ag 1ZMAA 1FB6A 2E2MA 1WIKA 1VGLA 3H79A 2GZZA 2FGXA 4KCEA 4Z7XA 3A2XA 2B5YA 4YAVA 9GSSA 2HYXA 1ZYQB 2N5BA 1O7UA 4PUFC 1EGOA 3GSSA 1FG4A 1YF1A 3AY8A 1YEXA 1KEBA 1K0NA 3H4KA 4KA0A 2LRNA 2AAWA 4N30A 3GKXA 1ERUA 2DBCA 2H0HA 1ON4A 2OADA 3TKPA 2HZFA 1SU9A 1V9WA 1I5GA 1K0BA 1ZYEA 3W8SA 4JZQA 3ZREA 5FWGA 1WE0A 2L5LA 2PWJA 3UARA 2QC7A 1SL2B 1FVKA 2GQKA 2QSIA 5LCZA 4OO5A 3MDKA 4NXIA 1DSBA 2GSRA 1QFNA 1CQHA 1FAAA 2OBIA 5A5KA 5JWOB 3IAM2 2P31A 3MSZA 3QCPA 2NPBA 5IO0A 4EVMA 5EPFA 2IWTA 1H4OA 2QKEA 1GUMA 3M9KA 5IMCA 2H0IA 3CMIA 5A4VA 2PPTA 4BL7A 4DEJA 1DBYA 4EKZA 4FYCA 3F8UA 2ES7A 4OMVA 3IC4A 2DLXA 3ME8A 1QQ2A 2PN8A 1OC8A 4JBBA 3DVWA 1ERWA 2C3NA 4MK3A 2H72A 3ERGA 3VFIA 3ZITA 4GCIA 1M2DA 4IP1A 4POKA 4FH8A 3KM6A 4J57E 2FWFA 5KN3A 1VF4A 1DE1A 2CZ2A 4RI7A 2HZEB 4TOPA 5G5EA 3VI5A 1B48A 4TR0A 3APQA 3ZRDA 2R37A 5B8BA 1ZGNA 4K7IA 13GSA 4XIHA 3PH9A 3O76A 1AC1A 3GKKA 3HZ8A 1YZXA 3DXBA 2B1KA 1ZCPA 5JCGA 2V32A 2F9SA 2PVQA 2AB6A 2A2RA 2YN1A 3GX8A 2VL2C 5CP1A 3HYPA 1TXXA 4PUAA 1OE7A 2GS3A 3LWAA 3D4MA 2YOIA 1A8LA 4HZ4A 2G0FA 3CYNA 4LMWA 4ULXA 4GF0A 6GSTA 1XWAA 1ZL9A 5CNWA 3D5JA 1BX9A 4LMVA 1MDKA 2FCHA 4AF2A 4OFTA 3M8NA 3F4RA 4ZB8A 5G1LA 3DVXA 3E0UA 2VIMA 3FR6A 4KAEA 2B7KA 3KTLA 3ZL5A 3HZ4A 1UC7A 1HNAA 2X8CA 3UL3A 4EDYA 2AUVA 3ZFBA 5ECRB 3FW2A 3EYTA 4MA9A 3IOSA 3SBCA 1WOUA 2P5QA 3TRQA 4WR5A 2MMNA 1SYXA 4N11A 2CV4A 4KX4A 3TJJA 3QR6A 4WBRD 3L78A 2VLTA 3WGXA 2VCQA 3HJPA 5IO2A 1F37A 4HUAA 5FHIA 2IIYA 2JZSA 2JZTA 1OKTA 5HQPA 4FIWA 3TOTA 2DIZA 1I9DA 2L4CA 2O89A 4IBPA 2IJYA 3P2AA 1OC9B 5ECOB 2H71A 3D22A 2BTOT 1TP9A 3LEFA 1T8EB 3KJYA 4EUYA 2DJ0A 1O85A 1S3DA 1Y6EA 3ZFLA 5IPHA 3GX0A 2LJKA 3LQ7A 6GSWA 4AJ7A 3W6GA 2H8LA 1ZZYA 2CVKA 2IMKA 5ABRA 3LG6A 2VCTA 4V1Ap 4MJAA 2GSTA 2JSZA 3I69A 5IMZA 2VUPA 3IBHA 2HSYA 5IMFA 2B6MA 1T4ZA 4YAPA 3DWVA 4D73A 1QXHA 2H1GA 4NHZA 1GULA 1WP0A 2GDRA 4RI6A 5EY6A 3TKQA 2JACA 2H6XA 4L5OA 3WYWA 5AISA 2FHEA 1TRUA 4KDUA 4V2LA 2GSSA 3FR3A 3FZ9A 4XHMA 5D8IA 2PERA 3HY2A 5IQYA 3DD3A 3GA4A 3TJBA 5DAKB 1Z6NA 1U3IA 4WR4A 1KTEA 2NDOA 4MZBA 3FK8A 3UIWA 2H70A 3G7JA 2DJJA 4HU9A 2LJRA 3TDGA 1GTUA 2F8FA 1V2AA 4ML1A 4RUVA 3M1GA 4HJMA 2OKAA 1R5PA 3VURA 1GSDA 1B8XA 4ILFA 2GGTA 2TRXA 2C0EA 1RW1A 1S3CA 4WETA 4IJ3A 5CRGA 5G31A 3LYPA 4MLYA 5DQSA 3ED3A 2L5OA 4Q5FA 1PRXA 2M46A 2LS5A 3F63A 4IP6A 3DRNA 2AHEA 1PSQA 3H8QA 3MAKA 3MWHA 1EZKA 3FHKA 2HXKA 1SJZA 3QDNA 5DDLA 2VD0A 2HNLA 1YF0A 3HHVA 4AJ8A 3I6AA 5G30A 4BPYA 2R5GA 3F9UA 1MEKA 4BWQA 4BVYA 3TKSE 3F0IA 3GHAA 1GTIA 16GSA 1OC9A 1TTZA 3G7IA 2LNTA 1GL8A 1XCCA 4ECIA 1A2MA 2OJLA 3KZQA 22GSA 1JFUA 2JU5A 4PNFA 1F6MC 4ZL7A 1VF2A 5ECKB 1EEMA 3LXZA 2C4JA 5JWQB 1M9AA 4TN8A 1BJXA 4TR3A 1GSFA 4N10A 3ERFA 5IMAA 4OFNA 3Q19A 3O3TA 4L0WA 5B6NA 4MH3A 3RDWA 4PX1A 5IIZA 3J7Yb 2LQQA 4I5QA 1FB0A 4E8HA 4LL1B 2VLVA 3TKSC 1GTAA 4ML6A 4POMA 2R6KA 2KOKA 1A23A 3W8JA 2DSAA 2D2ZA 1H75A 1V58A 2R4VA 4TXOA 1BEDA 2HT9A 2ON5A 3UJ1A 1GLPA 4ISDA 3HXSA 1HNCA 1A8YA 2GZYA 2FA4A 2WJUA 1TK5B 4HQZA 2A4VA 2M80A 5EL8A 5DCGA 4K7NA 3VPTA 11GSA 2DJ1A 2H75A 2H01A 1GSUA 1JLVA 4F0BA 3KP9A 4LLRA 4I97A 2CQ9A 3CRUA 1JZRA 3DYRA 5CRWA 1HQOA 1QK8A 3IXRA 4G2EA 3VWXA 4NHWA 5DJLA 4POLA 2VCZA 2LRCA 4Q5NA 1J08A 1LJRA 1SK0A 1LU4A 2YWMA 1AQXA 3IA1A 3EVIA 4QQ7A 3D21A 3N9JA 1E6BA 2VD1A 2LNSA 4MZCA 3F3RA 3GH9A 1SENA 5IMDA 2V41A 1JZWA 4IKHA 2DMMA 5IM9A 3KMOA 1KNGA 2OACA 3IK7A 4ZBAA 1YJ6A 1X0RA 6GSYA 5DJMA 2CT6A 5ECNB 1Q4JA 3A2VA 1TJDA 2YJ7A 2BMXA 2XC2A 3QOUA 1UN2A 1EOGA 2FWEA 3CXGA 3GKNA 1V98A 1GSSA 5FT3A 2N5AA 3D6IA 2RM6A 4XS1A 2H0GA 3ZIVA 1TI3A 3KH9A 2ALBA 2YZHA 3KGKA 4ECJA 1EOHA 3FR9A 2REMA 4EF0A 4DSSB 3WT2A 4MDCA 2LEGA 3EINA 1EV9A 1TW9A 5ECMB 5J4UA 4IELA 4IVFA 4PQIA 4V2NA 4MF5A 3GUSA 1HNBA 3R2QA 1S3AA 1FW1A 2VL2A 4YQMA 2LRTA 1XXUA 4ZBDA 3FYGA 4F0CA 1PL2A 2YNXA 2R2JA 4IN0A 2H1AA 2IN3A 3GRXA 4MABA 3F4SA 3KIJA 1M7TA 1GNEA 2LSTA 3PINA 4MJEA 3NZNA 5IMVA 2OE0A 2VCWA 4ECCA 5E4WA 1GSEA 1GWCA 1RK4A 3QFAC 5ECLB 4TXVA 3JCML 2WRTA 2DJKA 2FWHA 2JZRA 3FZAA 3RPNA 5J5NA 2YWNA 1TDIA 1TOFA 4O32A 4K9ZA 1GP1A 3HKRA 2YP6A 4XS4A 1A24A 4GQCA 2VCVA 12GSA 1XVWA 2H66A 4OCEA 2X8GA 3G7YA 1GUKA 1W4VA 3L9VA 1SK1A 4K7OA 4GSNA 5G2ZA 1PN9A 2DJ2A 2TIRA 5IPGA 2OBKA 4RQRA 1XOBA 5F06A 3TUEA 5AIXA 3I9V2 2DC5A 4ZB6A 2EC4A 3H1NA 4DSRA 1OC3A 1MDIA 3QD9A 2MBSA 4PGTA 4OCFA 4IJIA 2VM2A 4MPGA 2K8VA 4N0VA 2HFDA 1F2EA 1ML6A 3CSIA 1PQNA 4F9ZA 2FD3A 4HS1A 1O6JA 2K6VA 1MDJA 4KE3A 3VWWA 1IYIA 3NIVA 4MP4A 2YWIA 2WULA 2B3SA 2HSHA 5HR0A 3ZTLA 1XW5A 3CTGA 2OE1A 2LJAA 2C1YA 1A2JA 3GNJA 4ZXGA 1SKSB 3L0HA 4EDZA 4K6XA 5DBQA 3LXTA 4IS0A 4BA7A 3TOUA 2EIQA 4KH7A 1BQ7A 4ID0A 5KN1A 1X9SB 2XPDA 1HD2A 1EWXA 1X5EA 4FYBA 4V2MA 1EEJA 1PKZA 5KN0A 3CSJA 3QPMA 1OKDA 2KLXA 2KP2A 2O8VB 3LFLA 5ENUA 3TGZA 3BCKA 4CHSA 6GSSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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