5IHGA

The x-ray structure of the adduct formed in the reaction between hen egg white lysozyme a compound i, a platin(ii) compound containing a o, s bidentate ligand
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Platinum(ii) O,S complexes as potential metallodrugs against Cisplatin resistance.
pubmed doi rcsb
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5ihgA00
4BS7A 1DKKA 5LAGA 1YANA 4FJRA 4B4IA 4GN4A 4NG1A 3IJUA 1AM7A 4H94A 1XEKA 1DI5A 1B2KA 4QEQA 5LYTA 5L3HA 1HEQA 1NKHA 1GDWA 4UWUA 1B5YA 4G9SA 4BAPA 4GLAA 3A94A 1LHHA 1LJKA 1F0WA 1XEIA 5I54A 207LA 4DDBA 5M1YA 4TUNA 1IO5A 1VDSA 4LYZA 1LSNA 2I26L 5FDJA 154LA 1QUTA 1IWWA 1LZCA 1XGTC 4DDCA 1GB2A 4NHQA 3F6ZA 1FKQA 4H9CA 2MEEA 5I4WA 2Z37A 4GCEA 1LSCA 1LZGA 1HMKA 1PZYA 1IC4Y 2LZTA 3LYOA 1TBYA 4XJBA 1IIZA 4HV1A 1GFUA 5APDA 1GE4A 4XENA 3T36A 4CFOA 4NHIA 2DQHY 1MELL 1IR7A 2IHLA 2MEFA 4NGOA 4H1PA 4R0FA 1REXA 4H9HA 1B7RA 4NHTA 3TMWA 1IOQA 4XYYA 1RE2A 2FYCA 2BQDA 3AZ7A 1BB7A 1ALCA 1HF4A 2MEBA 1HEMA 3G3BB 3ZEKA 1CJ6A 4GCCA 1YROA 4HTKA 1B9OA 1KIRC 2BQHA 2EIZC 5LVGA 2VB1A 3AZ6A 4J1AA 3D3DA 1B7NA 2Z2EA 5F9UA 1LZRA 5F14A 1XGPC 3OJPA 1IWUA 4NSGA 5HLLA 6LYZA 4G4HA 4NIJA 3QE8A 3N9EA 1C43A 1QIOA 1IWZA 1DPWA 1DI3A 1OUHA 5E4PA 4OOTA 1C45A 1IOCA 2CJLA 1OUBA 1VFBC 1YKXX 4NSHA 1XGUC 1BB3A 1CJ9A 4KT3A 4N1CC 3WVXA 4XJDA 1LHKA 4CHXA 5LYZA 1B5VA 1GFTA 1NDGC 1WTNA 3P68A 4G4BA 2HEAA 4KXIA 5KXZA 2CDSA 3AZ5A 5LIOA 3LZTA 5DN4A 1GE3A 4ZFPA 1HSXA 1JJ3A 5LA8A 4E3UA 2W1MA 2HEEA 1GBOA 1HEOA 2YVBA 1IP1A 3B6LA 1IVMA 2I6ZA 1VDQA 1H6MA 4A7DA 1IOSA 1EQ4A 1GF7A 4B4EA 2ZQ3A 2CGIA 5KKJA 1JJ1A 2G4NA 4OW1A 4PJ2C 5KXWA 1N4FA 1JSFA 5D5CA 134LA 1LPIA 2H9JA 4L41A 1I1ZA 2MECA 1LZDA 1XGQC 3P64A 4N8ZA 4XJIA 1JJ0A 1A4VA 2D91A 4NY5A 3AGGG 4H9IA 4TSBA 4OWCA 4I0CA 4NSIA 4OWHA 3B72A 1IP4A 1B0DA 4WLXA 1GF6A 1GBXA 1LYOA 1T6VL 3RZ4A 1OUIA 1UBZA 1HC0A 4YOPA 5E9RA 3GXKA 1NHEA 3AGHA 2YBNA 4MSTA 1AZFA 1HELA 3LHMA 1HERA 1QDTA 1LSGA 1GB3A 1AT5A 2HECA 4LGKA 1IX0A 4PPOA 3WUNA 4WM3A 3A90A 2MEIA 1UIDA 3WUMA 1IORA 1GB7A 5KXKA 1JKDA 2YBJA 4LFXA 4YEOA 1T3PA 2BQKA 1J1OY 4O34A 1IR8A 5FSTA 5KXXA 1JWRA 2IFFY 1HMLA 5II3A 1UIHA 5K7OA 3ZVQA 2BQGA 1IWVA 1INUA 1GFJA 3WUAA 3FE0A 4LT0A 2W1LA 4ML7A 1LTMA 4WLYA 5FEKA 3TXEA 5KXTA 4ET8A 1B7QA 1GEVA 3A3QA 3TXHA 1BGIA 2BPUA 2FYDA 3FI7A 5LAFA 1BWJA 2ZIJA 4MCKA 1H87A 3HBHA 2YDGA 1LZAA 2DQEY 1LMNA 3CT5A 1BVKC 4WG7A 1BHZA 1BB5A 4H8XA 4WG1A 1LJGA 1OUCA 1XSFA 1LZYA 1NF5A 1IC7Y 1B7PA 2F2NA 4P2EA 5LVIA 2XBSA 4YM8A 1OUDA 3TMVA 4CJ2A 1TCYA 3TXJA 5LVJA 1NMMA 4WO9A 1LSFA 2EPEA 1G7HC 2DQGY 4TTDA 1G7LC 4WLDA 1JIYA 1LSMA 1WQPA 4OWAA 4XJGA 4J7VA 3LZ2A 4IASA 1UC0A 5C6LA 4LYOA 2I25L 4H9BA 1LSEA 5KXLA 1UICA 1YAOA 194LA 3RNXA 1YL1X 4WL6A 1XGRC 2F4GA 4AXTA 1QTEA 5B05A 2Q0MX 1DQJC 1FN5A 1GF5A 1GFEA 1GFGA 2EQLA 3CT0A 1GFHA 1OUFA 4H90A 5C6IA 1GBSA 5A3ZA 1QDRA 1LMPA 1CNSA 1LJNA 3WU7A 1NDMC 1QTKA 1REYA 2LZ2A 1UIFA 3M3UA 4W94A 5FELA 4HV2A 4DC4A 1YAQA 3RW8A 5LINA 5HMJA 1JKAA 3B0IA 4WLTA 3WMKA 1LYSA 3J6KA 9LYZA 1FKVA 1B5ZA 2BQBA 4Z3MA 1REMA 4NGIA 3RT5X 5KXMA 4HP0A 5LXWA 4M6DA 1WQNA 5A3EA 4IATA 1EQEA 2GV0A 1GB5A 4FDYA 8LYZA 1LZSA 5B1FA 2AUBA 5KKIA 1J1PY 3W6CA 1ZVHL 5KXPA 1CJ8A 1GFAA 2XBRA 1OUJA 4WMGA 1W6ZA 1GBWA 1V7TA 5F9XA 1F6SA 4EMNA 2FBDA 4NWEA 1LHJA 153LA 1LJ4A 1LHMA 3WH1A 4B1AA 5B59A 4ZEEA 3AYQA 135LA 3WYHA 4M4OA 3A91A 3N9AA 1E8LA 1GPQC 3W6EA 1HSWA 3G3AB 1IWXA 3CSRA 4H91A 1GXV2 1LMAA 4XADA 5KXNA 3TXGA 1IP2A 4LYCA 4DD2A 3AZ4A 1BVXA 1GBZA 1DKJA 1GF9A 1HFZA 1A2YC 1FDLY 2CWIA 3CSQA 1I56A 1IP6A 5JENB 4WM5A 1BB6A 3M18B 1CKGA 4XJFA 5KY1A 4OOOA 1IR9A 1B7OA 1FBIX 1JPOA 3EO5A 4LYTA 2ZNWY 1C7PA 2MEGA 3AGIA 5KXSA 4WO6A 1YAPA 4OWBA 5KXOA 5ILFA 1JKCA 2BQFA 3WXTA 1RCMA 1IWTA 2H5ZA 4N0JA 4XJHA 4WM2A 5FHWA 1FLWA 193LA 1GF0A 2Z2FA 4G49A 2LYZA 4QDNA 1LHLA 1HEPA 1VAUA 2BQOA 6LYTA 1NQIA 4RDSA 1JEFA 4QY9A 1QSAA 3A92A 4BADA 1MLCE 1FLUA 5IELA 4EOFA 4HJVA 132LA 3AB6A 4YENA 4AGAA 2HU1A 1RJCB 3CT1A 2XTHA 2EKSC 3CSZA 1BWHA 3OK0A 2ZIKA 1LZBA 1VDPA 1XEJA 3A6BY 3WPLA 4H9EA 1D0KA 1UUZC 3T6UA 3B0OA 1F10A 2BLXA 1NWGA 4NFVA 4NGVA 1WVVA 1DZBX 2BLYA 2MEAA 1ZMYL 3E3DA 5T3FA 4HTQA 2HEBA 4GLVA 1IY3A 4DT3A 2BQEA 2D4JA 1LZ1A 2HU3A 3A34A 4ZIXA 1GAZA 1GFKA 1IOTA 1LZ8A 1WQOA 2DQCY 3A6CY 5HMVA 1QSWA 4GCDA 1UIAA 2WARA 2HTXA 4ETDA 1LYZA 5I5QA 4NEBA 1G7JC 1NBYC 3A93A 2BQLA 3AJNA 2C8OA 4NHPA 1AT6A 1IP3A 1UACY 3TXIA 1GWDA 1HFXA 1HENA 4LT3A 4TWSA 1GHLA 1JITA 1GF4A 1KIQC 1FLQA 1ZV5L 1LMCA 4HJZA 1GE2A 4YF2A 1IC5Y 4H9AA 4OWEA 1C10A 3W6FA 3LYZA 4KPMA 2BQAA 3QY4A 2C8PA 2F30A 1VATA 4ETEA 4ETBA 4LYMA 4QGZA 1LKSA 4NGYA 4IJ4A 4NGLA 3MGWA 1WQRA 4MR1A 4Z98A 1LSAA 4PGJB 5AMYA 4B0DA 2RSCA 2X0AA 3ATOA 3WPKA 5LVHA 1DI4A 1CKHA 1G7MC 1HEWA 3A67Y 2BQCA 2A7FA 3HBEX 4PRQA 2ZILA 5J7CA 1EQ5A 3BKVA 3WW5A 3BKHA 1LOZA 3LYMA 1LSBA 5D5FA 3WXUA 1D6QA 2HEFA 4RW2A 1LSPA 4WM4A 3RU5A 1UIEA 3WL2A 3W6DA 3EMSA 5F16A 4H8ZA 3TMXA 5DN5A 4DD7A 1LJFA 2HEDA 1WQMA 1LMOA 2DQAA 5LYMA 2LHMA 1DPXA 5IDDA 3CQLA 1W08A 4CGEA 4UWVA 5B06A 3W6BA 1WQQA 4H9FA 1LZ9A 4Z46A 1LMQA 2LYOA 4ETCA 3B0KA 3QNGA 1GEZA 4PHIA 5APEA 1LMTA 1B7LA 4HTNA 5C6JA 4HSFA 4LT1A 3P66A 4NGZA 1D0MA 5LVKA 1XFPL 1LZEA 5LA5A 5HNLA 4WL7A 1EL1A 2NWDX 4LYBA 4NGKA 4NSJA 1BWIA 1P2CC 2F4AA 3D9AC 4GCBA 4TSCA 2Z12A 4ET9A 1YIKA 3WU8A 4G4CA 2YBHA 2ZQ4A 5L9JA 2DKVA 3J4GA 4PRUA 4N1EI 2DQIY 1CKCA 2PC2A 1GD6A 5KJ9A 3A96A 2Z18A 4DD0A 1GB9A 1LJ3A 3LYTA 2YBLA 3W3EA 3IJVA 1OQMA 2D6BA 2MEDA 2XJWA 1NBZC 1VEDA 4NHSA 1HHLA 5APFA 3TXBA 1GFVA 1PS5A 4YEMA 1GB6A 2W1YA 4WM1A 1YILA 4WM6A 1CKDA 4ANRA 1TAYA 2D4IA 2HUBA 2G4PA 4X3BA 1OP9B 1Z55A 2BQMA 4ETAA 5DM9A 1OUGA 2BQJA 1DXJA 1ZVYB 2DQJY 3W6AA 1RFPA 1VDTA 1GF8A 4UWNA 1LJHA 5IHGA 1LZ6A 1LHIA 4RW1A 4NGWA 2D4KA 4H93A 1BB4A 1RI8B 1UA6Y 4TX7A 3WULA 5I4XA 4U3XB 1YKYX 3WU9A 1AKIA 3ZVQB 4CFPA 5HQ1A 1TDYA 5I4YA 4DD9A 1B7SA 2Z39A 2ZWBA 1LKRA 1GF3A 2Z38A 1JUGA 4NGJA 5KXYA 1YKZX 1LZ4A 1I20A 1O23A 2DBTA 4KL7A 1UIBA 1WTMA 4N9RA 3HBDA 1B5WA 1G7IC 3TXFA 2ZYPA 2FBBA 2YBIA 3IWRA 5ILCA 2G4QA 3ULRA 5APCA 4RLMA 4LFPA 1YQVY 1GDXA 1UIGA 3WW6A 4DYGA 1LZNA 3AW7A 1BQLY 1CJ7A 7LYZA 5I53A 3ATNA 2BQIA 1LCNA 5L3IA 1LSDA 3P65A 1F6RA 4J1BA 2DQFC 1HNLA 1B7MA 1UCOA 3KAMA 2ZYCA 1SQ2L 4RLNA 1B5XA 2ZNXY 1IP5A 1QUSA 5DLAA 5KXRA 1C08C 5B1GA 1OUAA 4C5FA 3N9CA 4DD1A 1GXXA 3P4ZA 3VWOA 4BAFA 4GCFA 3EXDA 1LZTA 1IWYA 1GE0A 1KIPC 4HPEA 2Z19A 1YAMA 1D0LA 3CB7A 4NG8A 2A7DA 1IEEA 3TMUA 1KXXA 3SP3A 2N5ZA 4B4JA 4I8SA 1B5UA 2W1XA 1D6PA 1JKBA 3WVYA 4N5RA 4W96A 3A8ZA 2BAAA 3HFMY 2YSSC 1JTPL 5F81A 1GB8A 1LJIA 1IP7A 1LSZA 4C3WA 2B5ZA 1LJEA 5HNCA 1LJJA 1GAYA 1C46A 4LZTA 1QQYA 5DL9A 4D9ZA 4NWHA 4B49A 4DDAA 4HPIA 4II8A 1KXWA 3WPJA 4WOAA 1JISA 4R6CA 2H9KA 1LZ5A 4XN6A 4H92A 3EBAB 2YBMA 4J0LA 208LA 4H8YA 4Z41A 1V7SA 1WVUA 5EBHA 4GN5C 3LN2A 1GB0A 1OUEA 4DD3A 2MEHA 1GE1A 1REZA 4HJYA 1TEWA 1KXYA 1YL0X 1J1XY 2Y8PA 4LT2A 1LAAA 1GBYA 1LSYA 133LA 1IY4A 1CKFA 1LYYA 3AW6A 3TXDA 1JTOL 2LYMA 4DWXA 1JSEA 2BQNA 1D9UA 3TXKA 1JTTL 1GFRA 3GXRA 1JHLA 3K3TA 1SLYA 2DQDY 4GN3A 1FLYA 3A3RX 3A95A 5FCPA 5B07A 1HFYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJRA 4B4IA 4NG1A 1AM7A 1L17A 2RB1X 1CU5A 4UWUA 1GDWA 1B5YA 4G9SA 4BAPA 211LA 156LA 3A94A 1L97A 4DDBA 5M1YA 5FDJA 1LSNA 2F47A 1GB2A 131LA 113LA 5I4WA 1HMKA 1EPYA 2LZTA 242LA 3LYOA 1GE4A 4XENA 1L37A 1IR7A 2OE4X 159LA 4R0FA 1B7RA 3TMWA 4XYYA 1OYUA 1BB7A 2MEBA 1HEMA 4GCCA 4HTKA 3AZ6A 1L72A 3D3DA 1KW7A 4NSGA 5HLLA 2RB0X 4NIJA 3QE8A 1JTMA 1C45A 1C6LA 1G0QA 3NYAA 3DMXA 1OUBA 4NSHA 1BB3A 1CJ9A 5LZMA 167LA 4KXIA 224LA 1QTVA 4ZFPA 251LA 1HSXA 2Z6BA 3GUNA 1C6TA 4A7DA 1IOSA 2ZQ3A 2CGIA 1L84A 4PJ2C 1N4FA 1L20A 2H9JA 1L14A 2MECA 1XGQC 4XJIA 3P64A 1A4VA 4NY5A 3AGGG 4H9IA 1L25A 4NSIA 1T6VL 1HC0A 4YOPA 1NHEA 2YBNA 3LHMA 1QDTA 1L12A 1AT5A 1QS9A 1IX0A 4WM3A 1UIDA 3CDOA 145LA 1JKDA 1T3PA 2BQKA 5KXXA 4O34A 1IR8A 2B72A 1IWVA 1GFJA 5KXTA 3A3QA 1GEVA 1BGIA 139LA 1P56A 1BWJA 128LA 2YDGA 1BVKC 3NY9A 1P6YA 1QUGA 4YM8A 1LZYA 1NF5A 1B7PA 2F2NA 2XBSA 1L0KA 1D2YA 1L23A 1G7HC 4TTDA 1LSMA 4J7VA 1UC0A 1L69A 4LYOA 4YXAC 1L41A 4WL6A 1QTEA 2Q0MX 1DQJC 1FN5A 1L63A 1LJNA 1NDMC 1QTKA 3M3UA 4W94A 140LA 5HMJA 182LA 2LZMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4BS7 A;  1DKK A;  5LAG A;  1YAN A;  4FJR A;  4B4I A;  4GN4 A;  4NG1 A;  3IJU A;  1AM7 A;  4H94 A;  1XEK A;  1DI5 A;  1B2K A;  4QEQ A;  5LYT A;  5L3H A;  1HEQ A;  1NKH A;  1GDW A;  4UWU A;  1B5Y A;  4G9S A;  4BAP A;  4GLA A;  3A94 A;  1LHH A;  1LJK A;  1F0W A;  1XEI A;  5I54 A;  207L A;  4DDB A;  5M1Y A;  4TUN A;  1IO5 A;  1VDS A;  4LYZ A;  1LSN A;  2I26 L;  5FDJ A;  154L A;  1QUT A;  1IWW A;  1LZC A;  1XGT C;  4DDC A;  1GB2 A;  4NHQ A;  3F6Z A;  1FKQ A;  4H9C A;  2MEE A;  5I4W A;  2Z37 A;  4GCE A;  1LSC A;  1LZG A;  1HMK A;  1PZY A;  1IC4 Y;  2LZT A;  3LYO A;  1TBY A;  4XJB A;  1IIZ A;  4HV1 A;  1GFU A;  5APD A;  1GE4 A;  4XEN A;  3T36 A;  4CFO A;  4NHI A;  2DQH Y;  1MEL L;  1IR7 A;  2IHL A;  2MEF A;  4NGO A;  4H1P A;  4R0F A;  1REX A;  4H9H A;  1B7R A;  4NHT A;  3TMW A;  1IOQ A;  4XYY A;  1RE2 A;  2FYC A;  2BQD A;  3AZ7 A;  1BB7 A;  1ALC A;  1HF4 A;  2MEB A;  1HEM A;  3G3B B;  3ZEK A;  1CJ6 A;  4GCC A;  1YRO A;  4HTK A;  1B9O A;  1KIR C;  2BQH A;  2EIZ C;  5LVG A;  2VB1 A;  3AZ6 A;  4J1A A; 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 3ATN A;  2BQI A;  1LCN A;  5L3I A;  1LSD A;  3P65 A;  1F6R A;  4J1B A;  2DQF C;  1HNL A;  1B7M A;  1UCO A;  3KAM A;  2ZYC A;  1SQ2 L;  4RLN A;  1B5X A;  2ZNX Y;  1IP5 A;  1QUS A;  5DLA A;  5KXR A;  1C08 C;  5B1G A;  1OUA A;  4C5F A;  3N9C A;  4DD1 A;  1GXX A;  3P4Z A;  3VWO A;  4BAF A;  4GCF A;  3EXD A;  1LZT A;  1IWY A;  1GE0 A;  1KIP C;  4HPE A;  2Z19 A;  1YAM A;  1D0L A;  3CB7 A;  4NG8 A;  2A7D A;  1IEE A;  3TMU A;  1KXX A;  3SP3 A;  2N5Z A;  4B4J A;  4I8S A;  1B5U A;  2W1X A;  1D6P A;  1JKB A;  3WVY A;  4N5R A;  4W96 A;  3A8Z A;  2BAA A;  3HFM Y;  2YSS C;  1JTP L;  5F81 A;  1GB8 A;  1LJI A;  1IP7 A;  1LSZ A;  4C3W A;  2B5Z A;  1LJE A;  5HNC A;  1LJJ A;  1GAY A;  1C46 A;  4LZT A;  1QQY A;  5DL9 A;  4D9Z A;  4NWH A;  4B49 A;  4DDA A;  4HPI A;  4II8 A;  1KXW A;  3WPJ A;  4WOA A;  1JIS A;  4R6C A;  2H9K A;  1LZ5 A;  4XN6 A;  4H92 A;  3EBA B;  2YBM A;  4J0L A;  208L A;  4H8Y A;  4Z41 A;  1V7S A;  1WVU A;  5EBH A;  4GN5 C;  3LN2 A;  1GB0 A;  1OUE A;  4DD3 A;  2MEH A;  1GE1 A;  1REZ A;  4HJY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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