The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVADRQGFVPAAYVKKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1
|
| publication title |
Crystal Structure of the alpha spectrin SH3 domain mutant N47A
rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
12
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2AZV A; 1B3Q A; 1JO8 A; 1QWF A; 4J9G A; 1ZUY A; 4A63 B; 1WLP B; 2ROL A; 1BU1 A; 2HBW A; 2L2P A; 2RQT A; 3FJ5 A; 1A0N B; 3VRY A; 2HDA A; 2P4R A; 3EG3 A; 1KFZ A; 4JJC A; 3O5Z A; 3C0C A; 5I11 A; 3U23 A; 1M3C A; 5IHN A; 4AFQ C; 1KJW A; 4ORZ A; 2JM8 A; 1T3S A; 2SRC A; 4JZ4 A; 1MUZ A; 4D8D A; 2LMJ A; 2W0Z A; 2DF6 A; 1AOJ A; 2O88 A; 1GCQ A; 1AWJ A; 1KIK A; 3REA B; 1GRI A; 1GCP A; 2VKN A; 2RQW A; 2KRN A; 4FSS A; 2JS2 A; 2EGC A; 3VS0 A; 1NLP C; 1FMK A; 1X2Q A; 1TUC A; 5I22 A; 3VS4 A; 2FPE A; 2K2M A; 1M27 C; 2KBT A; 1YP5 A; 1JQQ A; 1BB9 A; 1UEC A; 2CDT A; 2ECZ A; 2HEQ A; 1UFF A; 2LJ0 A; 5IXB A; 1UE9 A; 2FRY A; 2A37 A; 3VS6 A; 2ROT A; 1T0J A; 2ED0 A; 2DJQ A; 4CC3 A; 1BK2 A; 2BZ8 A; 3NGP A; 5HCK A; 2ENM A; 2K9G A; 1E7O A; 1Z9Q A; 4QT7 A; 4E6R A; 2K7A A; 1AD5 A; 2KXD A; 3TSZ A; 2D8J A; 1ZUU A; 2DRK A; 2KT1 A; 1WIE A; 1WA7 A; 1GFC A; 2AZS A; 1JEG A; 2JT4 A; 2H8H A; 1U5S A; 1W70 A; 2A08 A; 4GBQ A; 3H0I A; 2J06 A; 4HCK A; 1NYF A; 4RTX A; 1CKB A; 2JTE A; 2DLP A; 5EC7 A; 2O9V A; 4AFZ C; 2KEA A; 1X27 A; 4OMO A; 3EHR A; 2PTK A; 2EYY A; 1UHC A; 5IHI A; 3TSW A; 1N5Z A; 4F14 A; 2JS0 A; 1UJY A; 2AKK A; 2X3W D; 2YUN A; 2DYB A; 1TG0 A; 4OMN A; 3GBQ A; 1ZBJ A; 4RTV A; 1YNZ A; 1VYU A; 2M0Y A; 2KYB A; 1NEG A; 2DL3 A; 1K0X A; 4ZNX A; 4HVU A; 2VVK A; 1NM7 A; 4LN2 A; 1CKA A; 2LQN A; 1JU5 C; 2FEI A; 2CSI A; 1OV3 A; 3UA6 A; 4AG2 C; 1QKX A; 1X6G A; 3I5R A; 1ARK A; 2MIO A; 3TVT A; 4J9C A; 3RBB B; 1AEY A; 5GJV B; 3I5S A; 2JM9 A; 2KRO A; 1WXT A; 2A28 A; 1PWT A; 1K4U S; 1UUE A; 1M3A A; 1WDX A; 2DMO A; 4K11 A; 1YWP A; 1X6B A; 2L3Q A; 2RF0 A; 2X3X D; 2KR3 A; 2D8H A; 3QWY A; 4RTY A; 1E6G A; 2D1X A; 4HXJ A; 3QWX X; 3I35 A; 1OPK A; 2O9S A; 1YWO A; 1WX6 A; 1IO6 A; 2E5K A; 4CC7 A; 1OOT A; 1Z9Z A; 2DX1 A; 1V1C A; 1K1Z A; 1NG2 A; 2JMC A; 2RN8 A; 1SHG A; 4Z8A A; 1SHF A; 2F2W A; 2G6F X; 3UAT A; 3H0F A; 4WCI A; 2K3B A; 1AZE A; 1U06 A; 2O2O A; 3RNJ A; 1RI9 A; 1UTI A; 1HSQ A; 4IIO A; 3M0U A; 4LUD A; 2A36 A; 2ED1 A; 1K9A A; 1PKT A; 2M51 A; 3SEM A; 1FYN A; 1SPK A; 1QLY A; 2GBQ A; 3M0Q A; 2YSQ A; 1ABQ A; 1RLQ C; 1M30 A; 2SEM A; 2JXB A; 2FG0 A; 2LQW A; 2DVJ A; 1UGV A; 2DBK A; 1H8K A; 2DIL A; 1QWE A; 2EKH A; 1X2K A; 1OPL A; 1I1J A; 5ECA A; 2BTT A; 1UG1 A; 3KFV A; 1ZLM A; 1T3L A; 2EQI A; 4JPB W; 1W6X A; 4JZ3 A; 1VA7 A; 3PVQ A; 1ZUK A; 2L0A A; 4LNP A; 3ZL7 C; 4OMM A; 4J9H A; 4R0K A; 2FPF A; 3H41 A; 2LJ3 A; 1XOV A; 1J3T A; 4LUE A; 2DE0 X; 1GBQ A; 1GCQ C; 1G83 A; 2CUD A; 4CC4 B; 2NUZ A; 2LCS A; 2KRS A; 2GGR A; 2LNH B; 1PKS A; 2LZ6 B; 4HVV A; 3REB B; 4DEY A; 2YUO A; 4IIM A; 4OMP A; 3ULR B; 2DBM A; 2KGT A; 1NEB A; 1VYT A; 2RNA A; 4RTZ A; 4Y92 A; 2EW3 A; 2KYM A; 3VS2 A; 1S1N A; 4J9D A; 2EVR A; 5GJW B; 4F17 A; 2J6O A; 1SSH A; 1YN8 A; 4OMQ A; 2CH4 W; 2YUQ A; 2B86 A; 3EHQ A; 3NPF A; 4X1V A; 3VS3 A; 2LP5 A; 3VS7 A; 3UA7 A; 2PZ1 A; 2F2X A; 2IIM A; 2EGA A; 4GLM A; 2MOX A; 1B07 A; 5L23 A; 2KT8 A; 2YUP A; 2KE9 A; 5IXF A; 1NYG A; 1SRL A; 3VS1 A; 2OAW A; 2OJ2 A; 1MV3 A; 4RTT A; 3VS5 A; 1TUD A; 3THK A; 4J9I A; 2C0O A; 3I9Q A; 3NHN A; 1OEB A; 1HD3 A; 1E6H A; 2KRM A; 4J9E A; 2NWM A; 1GBR A; 2J05 A; 3LH5 A; 3NMZ C; 2AKL A; 2BZY A; 1M3B A; 1PRM C; 2DRM A; 4OML A; 4EIK A; 1YCS B; 4J9B A; 2HSP A; 2V1R A; 4AFU C; 1PHT A; 2DL4 A; 1ABO A; 1AVZ C; 1WYX A; 1JXM A; 1AZG B; 2AK5 A; 1RUW A; 4AFS C; 3VRZ A; 2CT4 A; 3SHW A; 2DNU A; 2RQR A; 2I0N A; 2EPD A; 4Z88 A; 1WFW A; 4HVW A; 1PNJ A; 1SRM A; 2FPD A; 2DA9 A; 3PE0 A; 1MV0 B; 2RPN A; 2C0I A; 3EG2 A; 4KRT A; 1GFD A; 2QDL A; 2HCK A; 2XMF A; 2JMA A; 1NLO C; 2MCN A; 2KNB B; 3JV3 A; 3M0T A; 2GTJ A; 2LX7 A; 1K0S A; 4J9F A; 1I0C A; 1H92 A; 2K79 A; 2DL5 A; 1ZX6 A; 5IH2 A; 5FW9 A; 2EYZ A; 4D8K A; 1H3H A; 2J7I A; 1ZSG A; 2W10 A; 2ESW A; 2O31 A; 2ABL A; 2RQV A; 3A98 A; 1AWW A; 4JJD A; 4Z89 A; 4RUG A; 1HJD A; 1WXU A; 2YT6 A; 3UF4 A; 2K6D A; 2EYX A; 2RMO A; 2OI3 A; 1PRL C; 1WXB A; 1BBZ A; 2RQU A; 3H0H A; 1M8M A; 1GL5 A; 1UDL A; 2F2V A; 1EFN A; 5FWB A; 1X43 A; 2J6K A; 1LCK A; 1T0H A; 1WI7 A; 1Y0M A; 3IQL A; 1W1F A; 2BZX A; 1AWO A; 2EYW A; 4ESR A; 1VYV A; 3EG0 A; 2L3P A; 5IHK A; 2V1Q A; 2FO0 A; 2KXC A; 2L3S A; 2DM1 A; 4M4Z A; 3R6N A; 1SEM A; 2CH4 A; 2DL7 A; 1AWX A; 1KSW A; 4RTW A; 1Y57 A; 3PVL A; 2CT3 A; 1I07 A; 3EGU A; 3M0R A; 2JW4 A; 1QCF A; 2PNI A; 1UHF A; 4DEX A; 1U3O A; 1CSK A; 1JXO A; 1K76 A; 4RTU A; 2FRW A; 1UJ0 A; 3M0P A; 4F16 A; 2GQI A; 2EGE A; 2D0N A; 3CQT A; 3M0S A; 4JJB A; 5FWC A; 2GTO A; 1RLP C; 2EBP A; 2LJ1 A; 2VWF A; 2CSQ A; 2J6F A; 1X69 A; 2DL8 A; 4AG1 C; 1QKW A; 1G2B A; 2C0T A; 4LE9 A; 2YDL A; 4CC2 A; 2CUB A; 2GNC A; 3EG1 A; 2CRE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2AZV A; 1QWF A; 4J9G A; 5KCO A; 3CEY A; 2HBW A; 2RQT A; 4HCC A; 4NS5 A; 2X4W A; 2GFU A; 3NTI A; 2VGM A; 3EG3 A; 5CO7 A; 5I11 A; 2RHZ A; 1QVG P; 4JRQ A; 4A4F A; 2JM8 A; 2JZ2 A; 5GAO n; 1VOM A; 4L6V 5; 4HCB A; 4RG2 A; 4D8D A; 2WAC A; 2W0Z A; 3M57 A; 5CAI A; 1GCQ A; 1WJR A; 5KE2 A; 1K8A R; 2PVO B; 1GRI A; 2KRN A; 2EYQ A; 3J81 E; 2E4H A; 2DPP B; 3MPU B; 4OMF B; 1XTD A; 7AT1 B; 5LJ5 g; 2M0O A; 1FMK A; 3C4S A; 4CRI A; 1VQM Q; 1YP5 A; 1BB9 A; 5A2Q E; 2CDT A; 2IG0 A; 2LJ0 A; 4ZGD B; 5IXB A; 2FRY A; 2V26 A; 1NE8 A; 4QQD A; 2ROT A; 3JCM d; 1VQN A; 1BK2 A; 3CCR T; 4OP0 A; 5HKC A; 2F5K A; 3QUI A; 5HY6 A; 2K9G A; 1QVF A; 3OB9 A; 1Z9Q A; 4E6R A; 3I56 A; 1B34 B; 2EAY A; 9ATC B; 1AD5 A; 2D8J A; 1ZUU A; 1D0Y A; 2KT1 A; 1FX7 A; 2OX7 A; 2AZS A; 2JT4 A; 3OYH A; 2H8H A; 1YJN A; 3QDF A; 4QQ6 A; 2XDB A; 5KH6 A; 4HCK A; 1NYF A; 2JTE A; 1LJO A; 1IB8 A; 1NPP A; 1FMW A; 3PMI A; 5LJ3 j; 5LJ3 f; 1N9R A; 2EYY A; 1UHC A; 1VQN T; 2JS0 A; 2XI9 A; 2X3W D; 3A8L B; 3OQ5 A; 2X4X A; 4XK8 E; 1YNZ A; 4ZN3 A; 2M0Y A; 3I56 T; 2KYB A; 2CP3 A; 2DL3 A; 3OYJ A; 1RAC B; 5KYW A; 4N4I A; 4PJO D; 1NM7 A; 3JCM g; 3QXE B; 2M9U A; 1JU5 C; 4M7A E; 3EFO A; 1RL2 A; 1VQP A; 4AG2 C; 4QQG A; 3I5R A; 1Y7X A; 1ARK A; 2MIO A; 2P0K A; 4J9C A; 3RBB B; 1AEY A; 3I5S A; 1WXT A; 5J39 A; 5J3B A; 2JUF A; 1UUE A; 2K5F A; 1KQS A; 4ZTF A; 4PNO A; 2HZY A; 2NYS A; 2YWW A; 3S3N A; 3WVE B; 4M7D F; 2L3Q A; 2RF0 A; 4FYW B; 2VYT A; 4IUV A; 4RTY A; 1MMD A; 1E6G A; 2CP0 A; 3ZEH A; 3V7R A; 3S6W A; 2ZZD A; 1YWO A; 2FZK B; 1IO6 A; 4CC7 A; 1JB0 E; 2DX1 A; 3OYB A; 1NG2 A; 2MAM A; 4PLL A; 2V8J A; 2DKG A; 1K9M U; 1KQ1 A; 4E47 A; 3M56 A; 1PSF A; 2K3B A; 1AZE A; 4M77 D; 2O2O A; 3G1J A; 3SFM A; 1VQ8 A; 3FIF A; 1IRX A; 1HSQ A; 5GMK m; 4P5N A; 1KK7 A; 1BCM A; 2QQS A; 1G3Y A; 2FVU A; 1GXI E; 5GAO q; 4MZP A; 4Z02 A; 5GAN d; 3OYY A; 1VQ5 A; 2NLU A; 4C92 F; 1YIT Q; 2GBQ A; 3JCM Q; 1VQO Q; 3M0Q A; 4M75 G; 1S72 Q; 2YSQ A; 1ABQ A; 2SEM A; 4IUT A; 2LQW A; 3HTR A; 2XIC A; 2QQB A; 2OTJ Q; 1UB4 A; 2PU9 B; 1NJI U; 3RR6 A; 1I1J A; 5ECA A; 2BTT A; 1VQ4 T; 3KFV A; 1ZLM A; 2O4X B; 1T3L A; 4JPB W; 1UEB A; 3CCE Q; 1FXX A; 1W6X A; 4JZ3 A; 1YIJ Q; 2MI6 A; 4XQ3 A; 3H8Z A; 3GLX A; 4PL6 A; 3NTK A; 2K5I A; 3QG1 A; 5LJ3 g; 1YIT A; 1G3T A; 5GAM j; 1M9S A; 1GBQ A; 5A0L A; 1VQ8 T; 3QHS A; 2CUD A; 2NUZ A; 2OTJ A; 5CR2 A; 2LNH B; 2LZ6 B; 3G7Z A; 1Y96 B; 4DEY A; 2QAZ A; 2AHJ B; 2PVD B; 3SD4 A; 4OMP A; 1VQ5 T; 3ULR B; 2CP2 A; 2DBM A; 3OYC A; 2HBP A; 2CGH A; 1K73 U; 1M5Q 1; 3MEU A; 1ACM B; 2EQM A; 2EW3 A; 4Y92 A; 2M16 A; 2KYM A; 1JJ2 S; 3VS2 A; 4F17 A; 4OGE A; 4OMQ A; 4DBQ A; 3HRS A; 2QI2 A; 5GMK l; 3L2R A; 1Q7Y R; 2BUD A; 3EHQ A; 3FLG A; 1TXQ A; 2NUT B; 4X1V A; 3V8K A; 3VS7 A; 3CC4 Q; 2DXC A; 3UA7 A; 2RH2 A; 3L2Z A; 2F2X A; 4J6W A; 2IIM A; 3OW2 S; 1SG5 A; 2EQK A; 2A7Y A; 4QKU A; 4LDU A; 4QVZ A; 5IXF A; 3PTA A; 1SRL A; 1RI0 A; 1Q81 R; 3OYI A; 3EG9 A; 3RKW A; 2C0O A; 4UC4 A; 1W2B P; 1E6H A; 2KRM A; 3FEO A; 5GAN 8; 1XNI A; 3EGX A; 3O8V A; 4J9E A; 1G3S A; 1GBR A; 1BI3 A; 1OU9 A; 3MEA A; 1YCS B; 4PFZ A; 3BY7 A; 2V1R A; 3E9G A; 2DL4 A; 1ABO A; 4JDS A; 3V7C A; 1JXM A; 1AZG B; 4AFS C; 4EDU A; 3M55 A; 2COZ A; 2RQR A; 3CCQ Q; 4HVW A; 1SRM A; 2DA9 A; 2QEX T; 2CZ7 B; 1MV0 B; 2RPN A; 1YI2 A; 4KRT A; 3PIO A; 2QDL A; 2XMF A; 1RAD B; 4IUR A; 5J26 A; 5CKD A; 4IKF A; 1QCO A; 4HA8 A; 5C0M A; 1OI1 A; 4M78 A; 3X24 B; 1ZX6 A; 5IH2 A; 2VB6 A; 3Q1J A; 1ZSG A; 1Q95 G; 4FW2 A; 2X4J A; 5LL6 S; 2ESW A; 2ABL A; 3E19 A; 4XAX B; 3CPW P; 1WXU A; 4M7A D; 2K6D A; 4E7I A; 2G3R A; 4FT2 A; 3X28 B; 4M75 B; 3EFS A; 1PD1 A; 1PRL C; 1BBZ A; 1X75 C; 3H0H A; 3CD6 T; 1GL5 A; 2PUO B; 2F2V A; 2E6Z A; 1I5O B; 3CBM A; 3S3M A; 5GAM g; 2V8I A; 3MO8 A; 1WHL A; 3OYD A; 1Y0M A; 4F7U F; 4DOV A; 2RI3 A; 2DER A; 3JSC A; 5KYN A; 2ZPB B; 1X01 A; 2EQJ A; 3CC2 T; 1D1A A; 2HAX A; 2FO0 A; 1SEM A; 1D3B B; 1Q82 C; 5CKE A; 4M77 B; 1VQ9 A; 4Y91 A; 3LGF A; 3PVL A; 2CT3 A; 4J6X A; 1I07 A; 4ZGE B; 3M0R A; 4PFP A; 2JW4 A; 4KT0 E; 3JB9 D; 2PNI A; 1UHF A; 4DEX A; 2MWP A; 1KHC A; 3CCL Q; 3HFO A; 3QYG B; 2DO3 A; 2GQI A; 4M75 C; 2VGN A; 1RLP C; 4BB7 A; 4C0D C; 3L1A A; 2LT4 A; 3RER A; 1D09 B; 2DL8 A; 2C0T A; 5GAN 4; 1JO8 A; 1EIF A; 1M1K C; 3CBP A; 3P8D A; 3F70 A; 1A0N B; 1WJQ A; 2DJZ A; 4JRK A; 4C8Q A; 4RCC A; 3G4S Q; 3VRY A; 1KQS S; 3FC3 A; 4M77 C; 2D0Q B; 3JB9 G; 1UGS B; 2DFU A; 2LRQ A; 5DY9 A; 4WF2 A; 1QVG A; 4AFQ C; 3RIR A; 3MP1 A; 1AOJ A; 2F69 A; 3CBO A; 3CCS T; 1KIK A; 2JTF A; 2VKN A; 4FYX B; 4JLG A; 4WTO B; 1Q82 R; 3WXM B; 3G4S A; 1AT1 B; 3VS0 A; 4BI3 A; 2HKN A; 5I21 A; 5GMK j; 2ZAE A; 3VS4 A; 2ZPG B; 2KQW A; 1M27 C; 4A53 A; 2VXF A; 2HEQ A; 1UFF A; 1ZBX A; 1UE9 A; 4XU3 A; 4OB1 B; 1V29 B; 2DJQ A; 3L2U A; 1HXD A; 2DZ9 A; 3OYM A; 1TTH B; 2HNI A; 3OSV A; 1K8A U; 1VIF A; 4O6J A; 3NGP A; 5HCK A; 4OB0 B; 2ENM A; 3J7A F; 4M75 E; 2K7A A; 1ZA1 B; 1M1K R; 3L42 A; 4FIB A; 1TWB A; 1GFC A; 5D6W A; 4PJO F; 1XJW B; 1I4K 1; 2P0Q A; 2J06 A; 4RTX A; 1WPY A; 1YFN A; 2DLP A; 3OS1 A; 2R57 A; 2KEA A; 1Q86 R; 2JTM A; 2LVM A; 4OMO A; 5LJ5 d; 2PTK A; 1WJS A; 5IHI A; 4X34 A; 1N5Z A; 4LDY A; 4F14 A; 3JRZ A; 1M4Z A; 2AKK A; 4HKE A; 3RDV A; 2LCC A; 4IUU A; 1TG0 A; 4MDW A; 3TRE A; 3GBQ A; 1ZBJ A; 1P92 A; 5LJ5 e; 4J6Y A; 4BI4 A; 3KBG A; 3X25 B; 4ZNX A; 3CCM A; 4QW2 A; 2VVK A; 3MCA B; 2DYI A; 4LN2 A; 2LQN A; 4DA4 A; 1R0B G; 3LLR A; 2CSI A; 2YLB A; 1M2V A; 1OV3 A; 2RA2 A; 1YHQ T; 1X6G A; 4FYY B; 3JCM h; 3EFR A; 1KC8 C; 5GJV B; 3CCR A; 3HHT B; 4M77 F; 2KRO A; 2RO0 A; 2K57 A; 3EAE A; 1OYX A; 3JB9 H; 1WDX A; 4LXC A; 1VQK A; 3CXC P; 4K11 A; 4E7K A; 3UPU A; 3EFO B; 4C5G A; 4BDY A; 2LC4 A; 2K3Y A; 3A8O B; 1VQN Q; 3QWY A; 4XU2 A; 1YJ9 T; 2D1X A; 4MMK A; 4B6M A; 1QP3 A; 3I35 A; 1OPK A; 4BUG A; 4QVC A; 3RUX A; 2KSS A; 1WX6 A; 5I2S A; 4EMH A; 3CCM T; 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