5IKBA

Crystal structure of the kainate receptor gluk4 ligand binding domain in complex with kainate
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
TLVVTTILENPYLMLKGNHQDMEGNDRYEGFCVDMLKELAEILRFNYKIRLVGDGVYGVPEANGTWTGMVGELIARKADLAVAGLTITAEREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIESVDDLADQTAIEYGTIHGGSSMTFFQNSRYQTYQRMWNYMYSKQPSVFVKSTEEGIARVLNSNYAFLLESTMNEYYRQRNCNLTQIGGLLDTKGYGIGMPVGSVFRDEFDLAILQLQENNRLEILKRKWWEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 4,Glutamate receptor
publication title The Structure of a High-Affinity Kainate Receptor: GluK4 Ligand-Binding Domain Crystallized with Kainate.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 249
sequence length 249
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ikbA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ikbA02
1JVYA 3JYRA 5DVIA 1LAFE 5HBCA 1DTGA 3ODBA 4KD5A 4GLIA 1EH3A 2ZXTA 3G3IA 3MP8A 5DYHA 2ZNUA 3TTLA 3EHTA 1USYH 5K2XA 3WAEA 3PD9A 4XXUA 1SW1A 2OJTA 3DP4A 4KR5A 4M1VA 1NFTA 1SYHA 3G3KA 3T9HB 4YB6A 1BP5A 1MH3A 4DXCA 5A5XA 3TFLA 1SDXA 1OVTA 2DOJA 4OENA 1SW5A 1MM6A 1ATGA 2QPQA 2YLNA 2Z8FA 4H65A 4I8CA 1Y20A 2XXVA 3FXUA 4MLQA 3GLBA 1LBBA 1PBPA 3K0VA 2HQ0A 4TOZA 2IA4A 4LUBA 1P1QA 2NWJA 3MP6A 4KFQA 3UORA 1M5EA 2GH9A 1DPPA 1S9TA 2NOOA 2AL4A 4C0RA 4DCYA 5H8HA 4GL0A 4JSDA 3TELA 3I3VA 2O1MA 3PV0E 1XHYA 4MBPA 4R9FA 3K6UA 2Y7RA 2DQVA 4NE4A 3KJTA 3V5AA 4I1DA 4F2QA 3K6WA 3THIA 2Z23A 2GFEA 2XXIA 3M3LA 5CMCA 1MY0A 3ZSFA 3CG3A 2D5WA 3E9XA 5DEXB 1MG1A 4LP2B 4WXJA 4GL8A 4UACA 2I58A 1MQGA 1NNTA 2QRYA 1B5IA 2O7IA 4DLDA 1N3XA 4QF9A 4MFIA 4IO2A 4JB7A 5BWJA 4YZZA 2FYIA 4X1DA 4G8HA 4YMAA 4ZEBA 1LBCA 4G8NA 3SEUA 4X1BA 3LC8A 1PDAA 2I4BA 1H76A 4JSOA 1SBPA 1Y4TA 2P2AA 2DYXA 3FASA 1FCKA 1MY3A 5AA2B 3PD8A 5B70A 4GQOA 1RYOA 3A3CA 4U2RA 1A7LA 1OQHA 3FXRA 4U1ZA 3UK4A 3FJMA 1H45A 3I6VA 4G2ZA 1QUJA 1MM7A 3OD7A 4POXA 3OO9A 1PC3A 2X7QA 1AH5A 2XHDA 1MXUA 2VHAA 1F9BA 3G3JA 2OCUA 4EDPA 5FTIA 1ZJLA 4NF5A 4KHZE 5IAIA 1I6QA 4F19A 3IB2A 3VXBA 4PQJA 4JXIA 2CZLA 3S9LC 4F29A 2RC8A 2THIA 1MXVA 3QUFA 5ISUA 1WDNA 1XT8A 2Q9TA 4XKRA 5JEIA 4NF6A 3ZS6A 1URGA 3OSRA 4U1OA 1AOVA 3GBAA 2H99A 1VFEA 4FAJA 4R72A 3C31A 2ABHA 3F11A 3MAMA 3CR9A 1O7TA 4WEDA 3K1NA 3PMWA 5ITPA 3H6TA 3V89B 1N7XA 4OYVA 5A5XB 2Y7IA 2F6PA 3MC2A 4YB5A 3DM0A 3MZBA 2ESNA 3RY3A 4GIZA 4KYDA 4ELOA 2V25A 1LCTA 4OEVA 1B5HA 1TT1A 3LBSA 4XKQA 5JTYB 4R74A 2A5SA 2QS4A 3C4MA 4H1XA 4ZS9A 5FHNA 5CBSA 1OLCA 1MXXA 4RXLA 3TPAA 5HPQA 1QJMA 2G29A 5AA3A 3GZGA 4C1TA 1SVXB 3FJGA 4OFJA 4LZ7A 1AIVA 1GR2A 1NH8A 1Q1KA 3FD3A 3OELA 3OSQA 2H5YA 3E3KA 4RK9A 4FE8A 2IEEA 4POWA 3BFTA 1MPBA 2XD3A 3O6GA 3FATA 3GBBA 4HTGA 4F31B 4GXAA 2OK2A 4QSDA 1YAEA 3H6WA 4ELPA 3T66A 3TAJA 3CFXA 4F22A 4PFTA 2RCAA 3U94A 3IAZA 4R6HA 3RNNA 1B0HA 1WODA 1QW0A 2XD2A 1MH4A 4OHNA 1XVYA 3ILTB 1FQAA 3SESA 1A40A 3FIRA 3SEYA 3TKDA 4QHQA 1MY4A 1ZTYA 2Q2CA 3IJXB 3K6XA 3HN0A 2PX1A 3VLWA 1UTHA 1FTMA 3V83A 4FJPA 4N13A 4IO4A 1SI0A 3PGFA 4FIMA 4F3GA 4G8MA 1TXFA 4LA9A 2REJA 2NUVA 4YMBA 1FTLA 3HHFA 4U22A 3IOVA 3VLUA 2QS2A 4AQ4A 1EZPA 5DVFA 4EXLA 4R9GA 2REGA 3SEXA 2F8DA 3VLVA 1AMFA 5I58A 3T93B 3CSBA 3C32A 3ZKLA 4UA8A 4XIGQ 1B52A 3N94A 1QVSA 2O1LA 4NF5B 3IJOB 4O3CA 1VR5A 4R2FA 1A99A 4OXVA 1IXGA 4NF8B 1YCJA 1RYXA 3TMGA 4ELRA 5I57A 1JW5A 1L5TA 1I69A 1URDA 4NF6B 4OERA 2ONKE 4MLVA 2DS9A 3Q28A 2FA7A 2F5XA 5F7VA 3RN8A 4IO7A 1II5A 2OWTA 4EQ9A 1QKBA 1P1UA 1OLAA 4PFWA 1D9YA 4WEPA 4RJZA 1TFDA 3N6TA 1S50A 2DVZA 3O66A 3T9UA 3PUYE 4JWXA 1B2HA 1USYE 1MQHA 1JW1A 2DXRA 5ICQA 5FTHA 5KCJB 1IXHA 2ZYNA 2A5TB 1VE4A 3I5OA 2O7UA 3U93A 2HZLA 1UIVA 1LCFA 3K1PA 3ILUB 4KPTA 3IORA 4IGRA 2I49A 4QRZA 1SQYA 2XX9A 1ELJA 3VVFA 1I6AA 1MXZA 2Y7WA 3EHUA 3QUJA 2ZNTA 1NKXA 4IY6A 4DZ1A 1LAGE 4TLLB 1QULA 4LONB 1MY2A 2VP1A 2O84X 3SEWA 4QFKA 1P99A 3M8UA 1B3EA 5LOMA 3IX1A 1IUDA 4JWYA 4IY5A 2D3IA 3U1OA 4IO3A 1IEJA 3KGCA 1FQFA 1DOTA 1NH7A 3CVGA 2DE3A 3W9WA 4R75A 1IXIA 5CBRA 5BUUA 2PYYA 3QIMA 4RNSA 1KWHA 4NWDA 1UTBA 3PPRA 4OEUA 1Y1ZA 1FQCA 4H67A 4GF8A 2NXOA 1Q35A 4R73A 4FECA 4P11A 1OQGA 5L8DA 1Y3NA 2HZKA 1URSA 1D3KA 4Q5TA 3K01A 1J1NA 1MQIA 4BDOA 3LR1A 4PE5B 3ONMA 3G7WA 4OTEA 4NWCA 2V93A 1N84A 3OMBA 1MRPA 3VVDA 2DVCA 4ESXA 3H4ZA 1XS5A 3QSLA 4RPNA 2Q88A 3D4GA 3EHSA 3FVNA 3IOWA 3G3GA 4OVJA 4RYAA 4GOTA 2F36A 4Q30B 2HXWA 3FJ7A 2ALUA 1ANFA 1PBQA 2ONRA 3TQWA 3RQTA 1UIUA 3HSTA 4QFOA 2B3BA 4GWOA 1FW0A 1LGBC 3TTRA 4LZ8A 5I58B 1B4ZA 4U23A 4E0WA 1ZLQA 2XXYA 3TTNA 2GHBA 3HO7A 3PUXE 3O6IA 2Y7PA 4YAHX 1P1WA 3K02A 3O28A 4BDLA 4QSCA 1LB9A 2ANJA 2HFBA 5ITOA 2XXHA 1JNFA 4Z0IA 5KDTB 1VSOA 5AE4A 4FEDA 1LFGA 4OWDA 2Z8EA 2UYFA 4YB7A 2OBGA 3FV2A 3KOSA 4F3BA 3FGSA 2VOZA 3AXFA 4ZE8A 1MDQA 1D4NA 3DELB 1HSEA 1M5BA 4EUOA 5TP9B 5AA2D 2F6GA 2UXAA 4THIA 3C33A 4ZECA 4WKMA 5AA4A 4N6PA 4O3AA 1NNFA 1NMUA 3SERA 4TLMB 4JBZA 5TPAA 2M8CA 2DWAA 5DVJA 3L6GA 3LSLA 3W9VA 1OMPA 1JEVA 1B3GA 2R71A 1B0LA 2O69A 4QFNA 4X48A 2NVUB 1GGGA 4G68A 3ZKKA 1GVCA 1QUKA 1MY1A 3T96B 1RKMA 1SYIA 1AL3A 1MXWA 4U4SA 3JV9A 3PUZE 3RGYA 4FORA 2QS3A 3MWBA 4PFUA 2V84A 4Q0CA 3EF7A 4H5FA 3CG1A 3P7IA 1SW2A 1PB8A 2YJPA 5H8FA 4GVOA 1JETA 1LB8A 3O6HA 3A3UA 1N76A 2F7BA 1H44A 2QMXA 5I84A 3KSXA 1EZOA 4LQ5A 2H9BA 4H8IA 4Z7EA 3T9VA 1UTBB 5CMBA 2UYEA 1DSNA 3VVEA 4TQUQ 3SEVA 1ZBMA 2UVGA 3Q29A 2PT2A 2I0BA 4BDNA 4P0GA 3SDFA 4ONYA 4OFLA 5H8HB 3BKIB 3K1MA 2XXTA 3TDJA 3DP6A 2XXRA 2XXUA 3OO7A 3DLNA 2ONSA 3PPNA 4F1VA 4H5GA 3R7XA 1XC1A 1B7HA 3RUMA 3OEKA 5B7DA 3ECRA 3K4UA 4RA1A 3K2DA 5L9MA 3K6VA 2BJJX 1M5CA 2PMSA 1BIYA 1FQDA 2G93A 2QJEA 2DSFA 3OO8A 1H43A 3QK6A 3CFZA 4NF4A 4YKPA 4DXBA 2V3QA 5CMKA 1GV8A 1FTJA 3KG2A 5CMMA 4DDDA 2O6AA 1B58A 1B5JA 4C1UA 4HW8A 4NEDA 1WVJA 4KQPA 2DWIA 3CSGA 1R1NA 1HSJA 1N0TA 1JW4A 2QSXA 5HM4B 4ZDMA 1B4HA 3KJ7A 3KBRA 2UVIA 4IO5A 4GD5A 4H0WA 1QKAA 3RT6B 3G3FA 1O64A 4ECFA 3FVOA 4QFLA 4U21A 2DWHA 3Q26A 1B6HA 3PMXA 2HAVA 3IOUA 1S7YA 1ZIUA 2QMWA 1N04A 1MPCA 3B6TA 3HPIA 1IITA 3MVYA 1H3DA 3UA8A 4M4GA 2E0SA 3OOAA 3W15C 1EU8A 5CI5A 1LLSA 2WKYA 3G3HA 1DTZA 1ZKBA 3FVKA 2H4IA 4F2OA 2Y7KA 5L9SA 3TZAA 1IZ1A 1PB7A 1CB6A 4DCXA 4P0IA 4F1UA 3C36A 3K00A 2VD3A 5ICTA 4ZE9A 3QXMA 3IOTA 3MVWA 4X9TA 3RTWB 4OESA 3RPWA 3S9NC 2ZYOA 3OEMA 3GXAA 1JVXA 2OWSA 1GTKA 3HV1A 4YU0A 3TTMA 3USDA 2W7YA 1M5DA 3LSXA 2H25A 4QFPA 3N6UA 3MBPA 4GFRA 4LATA 4G77A 5FHMA 1B1XA 4KCCA 2QL3A 1LAHE 3M3KA 4BDMA 1LAXA 1I6BA 3CRBA 1R6ZA 4G4PA 2DXYA 1ZMGA 3Q27A 4ZEFA 3O2AA 4BDQA 2FNCA 2XXWA 5H8SA 1TWYA 3SETA 3U92A 3T9XB 5DT6A 5EHSA 3Q25A 2P1SA 3HHGA 5I59A 4LQ2A 1JEUA 1BTJA 1Y4CA 3RT8A 3MQ9A 4OZ9A 4YKKA 3LUYA 3U72A 3FVGA 2OLBA 1B51A 5CM6A 3QAXA 1TFAA 4NF4B 3UP9A 1P1NA 4ZZEA 1OVBA 2I4CA 2AYSA 3MVXA 1NNKA 1MPDA 1OIBA 2UVJA 2E1SA 2F78A 2XXQA 2YPNA 5JTYA 4L17A 1FTKA 1Y9UA 3H03A 3TQLA 4KYEA 4PFYA 4H6DA 1UTHB 3MW0A 3H7MA 5M2VA 1Y3QA 4U4XA 1UQWA 3WAFA 1D9VA 3MUQA 4GXSB 2Q89A 2X7PA 3IR1A 3TCGA 4FATA 4ZEIA 4F18A 1Z7NE 3N5LA 1FQEA 2ZNSA 4K3FA 2AL5A 3QYTA 3D4CA 4ESWA 3H6VA 4FEBA 3B6QA 5I2NA 4ZEDA 4BDRA 2RF1A 2RC9A 3UIFA 4DE8A 3KN8A 2F7AA 2XX8A 1N3WA 1IIWA 1PB9A 5CRYA 1HSLA 1M5FA 2HCAA 1MDP1 3O97A 1US4A 2XXXA 2PBWA 2UVHA 4HCYA 2KLFA 3R26A 2RC7A 3KN3A 5EYFA 1MQDA 3C9HA 2X26A 3PPPA 4EF2A 3RLFE 4LZ5A 5I2KA 3MPLA 1LFHA 5I57B 1YPNA 4HCWA 3S9EA 3N26A 4H8JA 3MP1A 4G68C 3KZGA 4ND9A 5EHMA 5CC2A 1R9LA 2HEUA 1EZ9A 1QUIA 3TTKA 2ZYMA 2Q8JA 3IB1A 1T0KA 2Q2AA 1B7UA 3E13X 4F3PA 1B1HA 4DIGA 2F34A 3R6UA 1SW4A 2GRVA 5H8QA 4NMYA 2F97A 4MF3A 5DTBA 1B7ZA 4OQOA 4I9DA 3O29A 1LSTA 1MQJA 4PP0A 4E0XA 3EPEA 4R2BA 3MZ9A 4YKIA 4EF1A 1B05A 2P0SA 2VGQA 4NF8A 2Z22A 4YICA 3BFUA 3MJNA 3JZJA 3OXNA 3SKPA 4LVQA 1A54A 4R6YA 4EXKA 1NL5A 3FUZA 2LAOA 3IB0A 4ZZAA 4RK2A 2XXPA 1CE2A 2DWJA 4JWOA 5JK4A 5H8NA 3MZ1A 3PPOA 1A8EA 3OO6A 4DXUA 5I59B 4GRKA 1ZU0A 3PMVA 3EQ1A 5I56A 4EQ7A 4R6KA 3H06B 2CMOA 1POY1 1XOCA 4HS7A 2D21A 4QSEA 3S2VA 2I3WA 3VXCA 5KCJA 4N07A 3H6UA 2A5TA 4KYSA 2PT1A 1A8FA 3B7DA 3EN3A 3TCHA 2DP8A 1Z7ME 1XVXA 3CIJA 4KI0E 3VE1B 3PPQA 4PETA 3L6HA 1MXYA 3MPKA 2B65A 3IO6A 3PUWE 4BLAA 1LFIA 3IL1B 3FXQA 4F3SA 3M3FA 3OENA 2DE4A 4ISUA 2Z8DA 2F35A 3KEIA 1IQ7A 3CI8A 3TODA 4XKNA 2V3UA 1B40A 3TCFA 3H3GA 4OMBA 3FZVA 2V3TA 1R9QA 3C35A 4I62A 5I2NB 1MS7A 4EQBA 3VFJA 3DP8A 4AB5A 3LSFB 5KZTA 3UN6A 2RINA 1B3FA 3O9PA 3VDFA 3LSWA 5L9OA 1JQFA 1US5A 1B46A 4F39A 1B3LA 4Q8RA 1NNPA 2AIXA 2ZMBA 4AB6A 1B3HA 3HCQA 1BKAA 3IK6B 3KSJA 1POTA 5I2KB 3MVZA 2RCBA 2ZYKA 5F1QA 1BLFA 2RKMA 3CFLA 3B6WA 2O51A 2O68A 1YTVA 2HAUA 4YKJA 2VD2A 2I6EA 4OETA 3A09A 4RY1A 3S9MC 3BBRA 2XX7A 2DE2A 4IGTA 5DEXA 4XKPA 4RPOA 3PU5A 4ELQA 3S4UA 4JDFA 1A55A 3FV1A 5H8QB 2QS1A 2I48A 5J1DA 1Y1MA 2I0CA 1Y3PA 3E4RA 1SD3A 3KN7A 2H98A 2F7CA 1B9JA 5AA4B 3TYHA 2R9JA 5TPAB 1N7WA 3T22A 1B32A 1FQBA 4KCDA 3PUVE 5ELVA 4NTLA 1P1OA 4ZEKA 5AA1A 5TU0A 4F1YA 4O3BA 3KOTA 3RTFB 3TUSA 5AA2A 4G68B 2GHAA 5IKBA 1DMBA 2PVUA 5KDTA 1IXCA 1FTOA 3KFMA 1SI1A 3TEPA 1DPEA 3U8QA 4OFOA 2OZZA 5FHOA 2Y84A 4IO6A 1O63A 3UGWA 3VV5A 5H8FB 2B3FA 4IB2A 3C34A 5H8NB 3IO4A 1PEBA 2R6GE 3V8XB 5TP9A 5K2YA 4MH5A 5I56B 1VFDA 2I3VA 4XTCQ
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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